3UBKA

Crystal structure of glutathione transferase (target efi-501770) from leptospira interrogans
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
214
structure length
209
Chain Sequence
VMIKLHGASISNYVNKVKLGILEKGLEYEQIRIAPSQEEDFLKISPMGKIPVLEMDGKFIFESGAILEFLDTIFPQTPKLIPEDPWEAARVREISTIIETYLDIPARRIYLSPEIVEEVHSTLVKGIKALQRVVRFSPYIAGNVFTLADCSGFAHLSVLDEELRPFYPNNHPLDLLNGWKEYFVFMKTKAGPALVEKDKQILKKILARA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glutathione S-Transferase from Leptospira Interrogans
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Leptospira interrogans serovar lai
molecule keywords Glutathione transferase
total genus 78
structure length 209
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3ubkA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ubkA01
1XZOA 6GSWA 5IOXA 3KMOA 1EV9A 4D73A 2KHPA 2GVPA 3DEXA 2MMZA 5JWQB 4KSMA 5G5FA 2FGXA 3GMFA 2H73A 1GSUA 2B5YA 3KMNA 3F4TA 1PX7A 4MK3A 2L59A 2X8GA 1K0DA 2QC7A 4BL7A 5DJMA 5C04A 2C0FA 5LD0A 3G7IA 1XVWA 1Y6EA 2J9HA 1FVKA 2HZFA 1ILOA 3QFAC 3UL3A 5HR0A 2JSZA 4V1Ag 1GLPA 2H74A 3MAKA 4LL1B 3G9BA 2FWFA 2GZZA 2GQLA 4G10A 2H01A 4AGSA 2WFCA 1EV4A 4EC0A 1VRSD 2HRAA 2HYXA 1JZWA 2GZPA 2R6KA 2NVLA 3UARA 6GSXA 3HZ4A 1U3IA 2OBKA 5D73A 3S9FA 3ZFBA 4EL1A 5G31A 1K0BA 4MJBA 2B1LA 3R2QA 2HSMA 1W4VA 1QUWA 2IMEA 4H86A 4HQZA 1TTZA 3NOFA 3LQ7A 2R37A 3CMIA 4GLTA 3G7YA 3H8QA 3F3QA 4TKYA 5CRHA 4MZWA 3TJGA 3E9JB 5DAKB 1EGOA 2R4VA 5ECHB 4K7NA 3W8JA 1AUCA 6GSSA 5ECSA 1GSSA 1S3DA 2HSYA 3IE3A 3KXOA 3LXTA 5A5KA 3GNJA 3L4NA 4HDEA 3PH9A 3G7JA 1G7EA 2K8SA 3HJPA 5L71A 5ECIB 17GSA 5F07A 2VM1A 3I43A 3I69A 2GT5A 5CRDA 3LSZA 1H4OA 1O8WA 1GSQA 4LA1A 4TVEA 2WDUA 3BCIA 1XWBA 2NBSA 1ZYQB 4O32A 1TJDA 2IFQB 2E7PA 4LMVA 4WEYA 3TDGA 3KTBA 2LKUA 1EOHA 16GSA 3Q6OA 2PWJA 1V58A 3H93A 3FY7A 1B8XA 4L5LA 1FW1A 3L9VA 3TJKA 2JZTA 3UVHA 4XRDA 4DSSA 3RDWA 6GSUA 4PXOA 1NM3A 5D9TA 5GSTA 1VF2A 3LG6A 4GTUA 3UIWA 4GQFA 1GLQA 2WRTA 3EURA 4BL7B 1SD9A 4IJ3A 3LWAA 5EVOA 4XIHA 3NIVA 3EC3A 5IM9A 5DCHA 2RIIA 3EWLA 3GV1A 2RM5A 1R5PA 2CVKA 2LJKA 4MJCA 2K9FA 2HRKA 4ACSA 3GKNA 4HZ4A 5KN1A 3KIJA 1M2DA 5CP1A 3ZZXA 3RBTA 1U6TA 1VGLA 5IMFA 4TR4A 2L6DA 4OD7A 2FCHA 1WJKA 3GX8A 2DSAA 4MABA 1TRUA 1GUHA 2LS5A 3GSSA 2V6KA 1ERWA 4ZILA 4ZB8A 4GF0A 3U6VA 3BD2A 2VCQA 4X1UA 4GSNA 2HSMB 4RQXA 4FO5A 3ZIVA 1PSQA 2OE1A 3EU3A 4ISDA 1XXUA 1YJ6A 1EGRA 4ZXGA 2FA8A 1PQNA 1TRSA 1PL1A 2FWHA 3PR8A 2YN1A 1ZOFA 4FYCA 2K18A 2VM2A 1MD3A 3QDNA 2IMFA 4JRRA 1YDKA 2HI7A 1MDKA 2GDRA 2P5RA 3HXSA 2DJKA 2VD0A 4V2LA 5HR1A 2V32A 2B7JA 2H0HA 2M46A 2OADA 1W89A 2TIRA 2H71A 3DIEA 3PPUA 1TRWA 2WULA 1M99A 3LGCA 3QPMA 2GQKA 2JZRA 2I3YA 5EL8A 3I6AA 4CHSA 4Z7XA 1OE7A 2YJ7A 5F8BA 4F0BA 4KA0A 2X99A 5AN1A 3WD6A 2CAIA 3EMXA 4LMWA 2OE0A 2VUPA 4WF4A 2H6XA 3IOSA 5LCZA 3TCOA 4DSSB 1TP9A 5ECMB 3DWVA 3ED3A 2AJQB 1A24A 3A5WA 3F4SA 1GTBA 2DMLA 4ECJA 1R7HA 4KGIA 2R3XA 2PGTA 1ZGNA 1S3CA 4AJ8A 3MNGA 3QOUA 3H4KA 2H30A 2FWEA 1U3AA 3RHBA 14GSA 22GSA 3BBYA 3BOAA 1G6YA 2PBJA 4MF6A 5H5SA 2EC4A 3GH9A 1R26A 4XCSA 4CW9A 4GQCA 4NV5A 4AJ6A 1F3BA 2KUCA 2H0GA 4G2EA 3UOMA 2VO4A 2IJYA 2HT9A 1M7TA 1JLVA 3IV4A 2C8UA 5HFKA 4IGJA 2F8FA 2VD1A 2L5OA 4LLRA 2VAFA 1SK0A 2CA8A 2I9HA 1Z6NA 1X5DA 3IC8A 3TKRA 3O3TA 1RQMA 1MEKA 4IP6A 5JWRB 2VOCA 1GTAA 3FR6A 1R4WA 1ZCPA 4WKWA 2XC2A 2HXKA 4PQHA 3GA4A 5ECLB 1OC9B 4DEJA 2XHFA 1ZMAA 5AISA 1M2AA 1T00A 2VCXA 3WT2A 3CRUA 2FLSA 1OC3A 5A4UA 3L0HA 2KOKA 1V98A 4MH3A 4J2FA 3I9V2 2R5GA 2O7KA 1K3OA 1X9WB 1YEPA 2B3SA 1KBNA 2WJUA 3IPZA 4WR5A 4K6XA 5J4UA 2LEGA 4BPYA 4KF9A 2H72A 4PQIA 4DVCA 2VLUA 3GKXA 3R3EA 2WGRA 4K7OA 5IMZA 2H6ZA 3TKSA 3CSJA 3M9KA 5F0GA 2HSHA 2M80A 3GYKA 4GRFA 1URMA 2CT6A 1XWCA 2IMKA 2DJ1A 3GURA 1K3LA 1F37A 3SWLA 1MDJA 3ZITA 2VLVA 4PUAA 4KDXA 3ZREA 4MZCA 3GIXA 2KP1A 3L78A 1X5EA 2X8HA 2E2MA 3GTUB 2TRXA 1C72A 3ME7A 2JZSA 3KP8A 4FQUA 2GLRA 4AJ7A 3FR9A 1WP0A 2AUVA 2FNOA 2HLSA 3LEFA 3TRPA 3H79A 4USSA 3UVTA 5J9CA 4GSSA 1O73A 3EINA 2UZ8A 1AQXA 1A2LA 1B48A 2TRCP 3FZ5A 3D6IA 1VF4A 1ACVA 1GWCA 1FHEA 3DVWA 9GSSA 1S3AA 2N5BA 5G1LA 2GQMA 1AQVA 2YCDA 1YY7A 2OE3A 4IN0A 2ZCTA 1OKTA 3TKPA 5ID2B 4KNDA 3TB2A 3UAPA 1AW9A 1F3AA 1Q4JA 1A23A 3GUSA 2YOIA 2DMMA 2YNXA 11GSA 3APQA 4I97A 1Z7RA 1K0NA 2VCWA 4NAXA 3TKSE 1YKAA 4HJ2A 2HNLA 2C1YA 4AF2A 1SENA 2VIMA 4P3YB 1PX6A 3US3A 1SL2B 5B6NA 1TK5B 4O92A 2A2RA 5HFGA 2LV3A 1NW2A 3J7Yb 4JE1A 1FVJA 4YQVA 2C0DA 3OR5A 3ZFLA 2O87A 2MZCA 4MJAA 3GKKA 4YAVA 2LQOA 4RI7A 1GP1A 5IMAA 1DUGA 1OVNA 5GSSA 4J57E 4KB3A 3C8EA 3GX0A 1OE8A 1FB0A 4Q5RA 3RAZA 3H1NA 1YZXA 4HI7A 2LTKA 1GL8A 1XW6A 4XS4B 2L6CA 2YANA 1OYJA 1IYHA 19GSA 1G6WA 1YQ1A 3KEBA 3TRXA 1XWKA 4K8MA 4N0ZA 4YH2A 3AY8A 5GZZB 3IBHA 1MD4A 1B4PA 4K7IA 3HVVA 3APSA 3F4RA 1GSEA 4KCEA 20GSA 3P7XA 3APOA 2O85A 4K1FA 3W6GA 2H0IA 4F2IA 1BEDA 2MMOA 2GZYA 1T4YA 3EU4A 3D0ZA 2WB9A 3CSIA 2JL4A 4BVXA 3VI7A 4FYBA 3M0FA 2KP2A 3VFIA 4GXZA 4Q5NA 1M9BA 5F05A 2H1GA 4BVYA 3TJBA 1BG5A 3D21A 1X0RA 3NZNA 1O81A 3PGTA 5CREA 5KN2A 5IMVA 3D4MA 5KN0A 1JZRA 1ERTA 4MA9A 2BTOT 4ML1A 4HJMA 3ZVJD 4KAEA 4K0GA 4D73B 2VLTA 2I1UA 1CQHA 4PX1A 4OWYA 3DVXA 4TW5A 5CRWA 3F0IA 2V6OA 2FD3A 1HQOA 1K0CA 4EDZA 3C71A 4L0UA 13GSA 2IMIA 6GSTA 2EIRA 1A8LA 3TOTA 4WXTA 1JFUA 4YQMA 3VK9A 4L5OA 4OFNA 2RLIA 1PL2A 4TXOA 1K0AA 3ZMLA 5CO3A 5IMCA 1K3YA 2IPAA 3QMXA 3K8NA 4POBA 1T8EB 5E59A 1LBKA 4QQ7A 2LRTA 3Q18A 3VPQA 1MDIA 3J7Yk 3HVXA 2BMXA 2EIQA 4DSRA 1EEMA 4FIWA 5FT3A 5DALA 2ALBA 5IO0A 2EIOA 5GAPD 4OO5A 1M2BA 1SKSB 1AQWA 5IMDA 4HU9A 3GN3A 1J0FA 4ZBAA 5ELGA 2DIYA 2IMDA 4FH8A 4K0NA 3UBLA 1YF1A 2JU5A 3VWXA 3ZRDA 1FG4A 2DJJA 3IR4A 5J41A 3HJOA 3D4TA 3FK8A 2ZNMA 1WOUA 2MMAA 1V40A 4G0LA 1E6BA 3TKSC 2DJ0A 5D9VA 4KUNA 3MDKA 1PKZA 2GSQA 3O76A 5GAND 3Q19A 6GSVA 5INYA 4GCIA 1DSBA 2IWTA 5ECRB 1SK1A 3M9JA 3M1GA 2H70A 4HU7A 1B4QA 3KZQA 3EE2A 5J9BA 5JCGA 2YWNA 3WGDA 2NTOA 4EXJA 5ECKB 1XWAA 1BQ7A 2H76A 1N2AA 4ZL7A 1ST9A 1YF0A 2H1DA 3ZVJA 2C3TA 18GSA 3ZIJA 2KLXA 4EVMA 2OBIA 4N11A 3TJFA 1GNEA 4OO4A 4IBPA 3D5JA 2IL3A 1Z7PA 4TR1A 5F06A 4OCEA 1QFNA 1BAYA 4WBJA 3TUEA 4KH7A 2H1BA 5FHIA 4PNGA 4QL7A 3Q74A 1KNGA 1ZYEA 4EE0A 1HD2A 5C00A 4OFMA 5B8BA 1TXXA 3UBKA 4EKZA 3HCZA 1SL0B 2LNSA 2FA4A 2A4VA 2XPDA 1K0OA 1A2JA 4MPFA 4K2DA 4PGTA 4MMMA 1RK4A 2HRKB 1A2MA 1HYUA 4PURA 2FWGA 2CVDA 5CAXA 4ZL9A 5D96A 2YJHA 5EPFA 5AGYA 3BJ5A 2GTUA 2PU9C 1T1VA 1XIYA 2YP6A 4XS6A 5DQYA 1JHBA 1QMVA 4I6XA 2D2ZA 1YEXA 4TR0A 4KX4A 1CQGA 1U87A 1HNAA 2H75A 3A2XA 4PUFC 3TOUA 2HFDA 1T7PB 2CX4A 3QAGA 5JCUA 4YQUA 4IVFA 3ERGA 2QGVA 1EWXA 2RM6A 3N5OA 2JACA 3M3MA 4Q5FA 1Q98A 5D9WA 5A4VA 3IAS2 3KGKA 4BWSA 3WGXA 3P8WA 4FYUA 3VI5A 5D93A 3CTGA 1ZZYA 1QXHA 1FOVA 1OAZA 1YKCA 1DBYA 3WGEA 4LL4B 2RUEA 5KEJA 2F51A 4TRXA 1V2AA 1SU9A 2AV4A 4G9HA 1VF3A 1ERVA 2CAQA 5JWOB 1ERUA 3VWVA 2MBSA 4MDCA 5B8AA 3DXBA 3EMPA 3ERFA 4IKHA 3F9UA 2HSNB 4WBRD 5DVBA 4V2MA 1SL1B 2WCIA 3QAVA 4Q5QA 3UEMA 1XOAA 4TOPA 2H1AA 2VCZA 3TJJA 3ERWA 4KDYA 3TKQA 3C1SA 1BX9A 5D8IA 1GUMA 1LU4A 3FRCA 4V2NA 1UN2A 1GSDA 1EP7A 2N5AA 3W8SA 3QR6A 1A0FA 2B7KA 2GSRA 4BWQA 1X9SB 5G5EA 3GHAA 2YWMA 1F2EA 3HDCA 2JADA 5H5RA 1PKWA 4PTSA 1WPIA 2CX3A 1HNCA 1XWGA 4V1Ap 2WZ9A 2K6VA 1THOA 1OKDA 4MCUA 5DAKA 4HOJA 2PERA 3VLNA 1ABAA 1GRXA 4ULXA 2N5FA 4N30A 4MPGA 2YZHA 3E0UA 4F0CA 1FAAA 1ML6A 3FEUA 1N8JA 5B6MA 1U88A 2QSIA 3FW2A 3QD9A 5HR3A 3WYWA 2DJ3A 5ABRA 4IS0A 3F3RA 4NWYA 2XBIA 4RUVA 2IN3A 1X9MB 2I4AA 4NHWA 5D9XA 2LNTA 3GRXA 2L4CA 4ZL8A 4PQ1A 3FZ4A 4XTSA 3RPNA 3DGQA 1GTUA 1ON4A 2CVBA 5CRGA 2AB6A 3FR3A 4O7HA 1UC7A 3GL5A 3HYPA 4KDUA 1SJZA 2YWIA 4E8HA 4F82A 3GSTA 2OKAA 4F03A 5HR2A 2NPBA 3CXGA 4JZQA 2J23A 1WMJA 3ISOA 3CYNA 5G2ZA 1TU7A 1H75A 5ECNB 4OFTA 1XW9A 3BCKA 4MP4A 10GSA 4EF0A 1XFLA 4IELA 2XPEA 1A0RP 2F8AA 3L9UA 2ES7A 3GKMA 5IPHA 4WETA 4IQ1A 3M8NA 1LJRA 1B9YC 4X43A 4KSOA 1SYRA 5A4WA 2MBTA 4KW6A 4GSTA 4TN8A 5DDLA 2LUSA 5COHA 1V9WA 3LFLA 1XBSA 2V41A 2AHEA 3IK7A 2FY6A 1USBA 2PPTA 2H8LA 2B5XA 4CDOA 1TRVA 4I2UA 2MMNA 2P5QA 2NDOA 2P31A 2RUFA 3MWHA 3VWWA 4ZIJA 4RI6A 5KN3A 1PD21 1XCCA 4DSQA 4HUAA 4YAPA 2QKEA 3UJ1A 2VL2A 3KD0A 1XVQA 2B1KA 3ZLPA 1I9DA 5FWGA 3A2VA 3HJMA 1GSFA 1WWJA 4G19A 1G7OA 5HFIA 4E8EA 4L0WA 4G0IA 4MF5A 3KCMA 2CZ2A 1PA3A 5ELAA 1AXDA 1BYEA 2C3NA 1TU8A 5CNWA 3HKRA 1JLWA 1SK2A 4HQSA 1TK8B 1FO5A 2B5EA 2V2GA 1UVZA 2LJAA 7GSSA 3LORA 2G0FA 2O8VB 1QK8A 1I5GA 1JZOA 3KJYA 4ID0A 2B6MA 4OMVA 2HZEA 2YPMA 1A8YA 1E2YA 4I2TA 4OCFA 4POKA 3IA1A 5JCWA 3FKFA 5B7CA 4GWRA 2YWOA 1JZDA 3QAWA 2OJLA 4ECIA 3VPTA 3ZTLA 1GUKA 4MLYA 2CQ9A 3F6FA 1Z6MA 1NHYA 2L4QA 4IQAA 1OC8A 3U5RE 2VCTA 2ZUPA 2C4JA 3IAM2 6GSYA 2HE3A 3CSHA 4JR4A 2L57A 2REMA 4NHZA 2Z9SA 4F9ZA 4O5RA 3P2AA 4HS1A 2GS3A 2IIYA 4MZBA 1GSYA 1IYIA 2O89A 3QCPA 1O7UA 4NXIA 3TRQA 4ILFA 3A3TA 2YZUA 4HZ2A 3IC4A 3KTLA 4K9ZA 1SJIA 5DJLA 2M72A 4NMUA 3LYKA 5AIXA 1HNBA 2FUG2 2C80A 1F6MC 1BJXA 4XS1A 1J9BA 2L5LA 3HHVA 3HD5A 5IO2A 1AC1A 2GGTA 1SD8A 1F9MA 4ML6A 2LRCA 4BVXB 5DCGA 2AAWA 3EYTA 3KH7A 2DIZA 5EY6A 1OC9A 1DE2A 2E2GA 2OACA 12GSA 1XOBA 4N0VA 4BVYB 3VURA 1EZKA 4ZB6A 3C73A 4WR4A 4WF5A 2HRFA 4G0KA 2E0QA 1SKWB 3A2WA 2WS2A 5CYYA 3ZL5A 5LNKe 1O6JA 2FHEA 1TDIA 3P90A 1SJ6A 3JCML 3HZ8A 2F3MA 3UMAA 2VL3A 3F8UA 3ZMKA 2X8CA 5IOWA 3IDVA 3LXZA 4XRAA 5E4WA 2PUKC 2JSYA 1Y25A 4I8BA 2PVOC 2YV9A 4JBBA 1SYXA 4L8EA 1PGTA 5DQSA 1GNWA 4POMA 2HZEB 3PINA 1TI3A 1GULA 3F6DA 3DMLA 3KP9A 4NPBA 1GH2A 1XPVA 4TXOB 2DBCA 2BJXA 5BMUA 3DRNA 3TGZA 4MJEA 4EDYA 3EVIA 3GTUA 1GTIA 2MYGA 3RHCA 3IHQA 4BA7A 1FB6A 1T3BA 2DJ2A 2CV4A 2K8VA 3ZYWA 4IJIA 3DYRA 5DALB 1AIUA 1K0MA 1NSWA 8GSSA 1TK0B 1O8XA 3MSZA 2A2SA 1QQ2A 3C1RA 4PNFA 1EOGA 1T4ZA 5J5NA 1X5CA 1TOFA 2LJRA 3D22A 4RQRA 4EO3A 4JR6A 1G0TA 4XHMA 3CRTA 3RPPA 2V1MA 5ID2A 1ZL9A 1R5AA 1M0UA 2R2JA 2P0GA 3O6TA 3WT1A 2OA7A 2H6YA 2DLXA 2VL9A 4IHUA 4I5QA 5G30A 1XW5A 1KEBA 4X0XA 3FZAA 1KTEA 4QL9A 3HVSA 1O85A 1AAZA 3IXRA 1THXA 2LRNA 4NV2A 2AYTA 1VF1A 5ECPB 4MF7A 4JEDA 4JU5A 2GSSA 2G2QA 1NHOA 3GH6A 1TI1A 4EUYA 5H5QA 2GT6A 2X64A 1SKRB 4N10A 3C7MA 1DE1A 2HRNA 1V57A 3IK9A 5ENUA 1TKDB 2VCVA 2C0EA 1Z5YE 4MH2A 3L9SA 2LSTA 2ON5A 4ECCA 2PMTA 4KCAA 2CZ3A 1UA5A 4TR1B 2VL2C 2GSTA 5ECOB 1TW9A 3QFBC 1MTCA 2H66A 4TR3A 1WE0A 2HQTA 1WRYA 5HQPA 5IPGA 3F63A 2I81A 4XS4A 5G1KA 4IP1A 4ECBA 5IQYA 1EP8A 5IIZA 3CBUA 3LJRA 1PN9A 3CTFA 4IW9A 2C0GA 1Z9HA 3N9JA 3GFKA 4TXVA 1PRXA 2DC5A 3GL3A 5J3RA 5AIVA 3E3EA 4KE3A 3DKSA 3FHKA 3FZ9A 1PMTA 2PN8A 4POLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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