3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
2AKKA 1AOTF 4FSSA 4AG1C 1UDLA 3BUXB 2MIOA 3ZL7C 2FCIA 2RQUA 3T04A 1M8MA 2L2PA 2CH4A 5IH2A 2CS0A 1O49A 2VVKA 5AULA 2K9GA 1A1CA 3S8LA 3M0SA 3GXXA 1SPSA 4GPLB 2O9SA 1SHFA 1LUNA 1SHAA 3BUOB 1O42A 1PWTA 3LH5A 1ARKA 5FWCA 2CDTA 1SKJA 1TUDA 3PFVA 1O4CA 2RNAA 1LCKA 2MC1A 1TCEA 1T3LA 1GBRA 2MRKA 2GQIA 2F2WA 3TL0A 2DMOA 2PNIA 2K79A 3VRYA 1YNZA 1WDXA 2BBUA 2SRCA 1ZLMA 1RUWA 2DA9A 4RTWA 4J9HA 5IXFA 1LKLA 4U1PA 2L3SA 2ROTA 5HCKA 1GCPA 1YWPA 2KNBB 3QWXX 3UA7A 1SHBA 1ZFPE 2IUHA 1CWDL 4RTUA 1MW4A 2KXDA 1NEBA 1JU5C 3C0CA 3UATA 1UE9A 1AD5A 3M0TA 2M51A 2DLZA 1F2FA 4IIOA 1T3SA 2HMHA 2QDLA 1BK2A 1M27C 1X69A 2KRNA 3I9QA 1H92A 2EOBA 3SEMA 2K7AA 1SHDA 3US4A 2CR4A 2KROA 2W10A 1HJDA 4HVWA 2YT6A 4OMLA 3PE0A 5GJVB 2LJ3A 1NYGA 1ZUUA 3VS7A 2DLYA 2MQIA 2GTJA 2BZXA 4E68A 3K2MA 1X27A 4X1VA 1HD3A 1W1FA 1A08A 1WFWA 1FU5A 2J06A 1H8KA 1GFDA 3UA6A 1B3QA 1BFIA 1NEGA 1PHTA 2L3QA 2GE9A 4OHIA 2K3BA 3KFVA 5DC9A 4TZIA 4RUGA 2GSBA 3EG1A 2OI3A 2LCTA 4R0KA 3OB1B 4OMPA 2DBMA 4RTYA 1QG1E 2PZ1A 3UF4A 4HVUA 1O4FA 2L3PA 2FRYA 2VKNA 1ABOA 1B07A 1TUCA 2O88A 3NPFA 1KA7A 2PNAA 1O47A 1JEGA 4H34A 3H0FA 4XZ0A 1A81A 4KRTA 1J3TA 2O31A 2JM9A 2DCRA 4K11A 2EL8A 1ZSGA 2IUIA 3N8MA 1JWOA 1Y1UA 4F5AA 1K1ZA 2O9VA 2RORA 2FPDA 5EC7A 3MXCA 3CQTA 1A09A 1A1BA 5IXBA 4L1BB 1O48A 4AFZC 4WCIA 2CUBA 2A08A 1D4WA 1O4OA 4JGHA 1E6HA 4NWGA 1NRVA 4GBQA 1AOJA 4FL2A 2G6FX 3OP0A 2BZYA 2KYBA 3I5SA 3H0HA 1TZEE 2GTOA 5FWBA 4F14A 1XOVA 4OHHA 4K44A 3EHQA 4OMMA 1UFFA 1IS0A 1U06A 3VS5A 3IQLA 2PLDA 3PJPA 2YDLA 3KFJA 2LNHB 3M0RA 1LUKA 2CSQA 3PVLA 5IBMA 1WA7A 2P4RA 1G83A 5GJWB 1SPKA 1AYBA 3RNJA 1QADA 3EG2A 3TVTA 2ENMA 3NHNA 2LZ6B 1NM7A 1O46A 1GL5A 1FBVA 1HSQA 2AOBA 2CI8A 1X6CA 3EAZA 2K6DA 2EO6A 1R1SA 4J9FA 4Z88A 1U5SA 4OMQA 1FMKA 4P9VA 2DE0X 5I11A 2J6OA 1YCSB 1AZGB 2JS0A 4Y92A 4CC3A 2EW3A 1HCTB 1OPLA 3H0IA 1R1QA 1GCQC 2O2OA 2AKLA 2LCSA 2LQNA 2C0OA 1GFCA 2DBKA 2JMAA 2DJQA 1Y57A 4RTXA 3C7IA 3VS2A 4DGPA 4EY0A 1AB2A 3PVQA 1RPYA 1T0HA 1AEYA 3CXLA 2GBQA 2YSQA 2CT3A 3THKA 4AFSC 4U17A 2FEIA 2LMJA 4FBNA 1LUMA 1ZBJA 1IO6A 5EEQA 2HEQA 5GJIA 1O4HA 4J9BA 3WA4A 1OEBA 1O44A 2M0YA 1R1PA 3BUWB 1QCFA 1MUZA 2KNOA 1UJYA 1U3OA 3VRPA 3I35A 1OPKA 1BBZA 2DL4A 3U23A 1UTIA 2CIAA 5DC0B 2D8HA 1GRIA 2H5KA 4JJCA 1O4MA 1BB9A 4LUDA 1O4NA 5DC4A 4D8KA 1UHCA 1JXOA 4F16A 1XA6A 2OQ1A 4DGXA 1PRLC 1WXTA 2HDAA 3GXWA 1VYVA 1M3CA 2V1RA 4OMNA 2EYWA 2RQTA 4FL3A 1OO3A 1SRMA 3M0PA 1KA6A 1NLOC 3VRQA 3VS0A 1TG0A 3EGUA 1RQQC 3PS5A 3M0UA 1H9OA 1O4JA 1AYDA 2DRMA 2LNXA 1GBQA 1OO4A 2X3XD 1UUSA 1JQQA 3NMZC 2RSYA 3CWGA 2OAWA 1Z9ZA 2EO3A 2YSXA 1NLPC 2F2VA 4AFQC 2EU0A 3BUNB 3HIZB 1ZUYA 3OVEA 3VS3A 1QLYA 1UECA 1AWXA 5EHPA 4EIKA 4J9IA 4H1OA 1QKWA 1FYNA 1G2BA 1VYTA 2JM8A 2SHPA 2JTEA 4HVVA 2V1QA 3CBLA 1CWEA 2KYMA 3QWYA 1O4BA 3S8NA 2YUOA 2J6FA 2YUPA 3PSJA 3TKZA 2A36A 1SSHA 4HXJA 1BM2A 2H46E 2HUWA 1WIEA 4JJDA 4JPBW 2L3TA 2YU7A 1WI7A 2DVJA 2GGRA 3MAZA 1PRMC 4F17A 5BO4A 2GNCA 1YN8A 3ZNIA 1RLQC 4EIHA 3PLFB 5HKYA 1CSYA 4JJBA 2KRSA 2NUZA 1JYUA 1JXMA 4J9EA 4JZ4A 3NGPA 4QSYA 2DNUA 2ESWA 4E6RA 1O4AA 2J7IA 4JZ3A 2RMOA 4Z8AA 2C0IA 2VIFA 1O45A 3O5ZA 2KT1A 3CD3A 1CJ1A 2MCNA 4OHEA 1AWOA 4ORZA 1I0CA 4OHLA 2CSIA 2ED1A 2FRWA 1N5ZA 3EG0A 2D0NA 2KXCA 2KGTA 2XMFA 4LUEA 2B3OA 1K9AA 3TSWA 3N84A 1H3HA 1Y0MA 1JO8A 3BKBA 2HBWA 2DLPA 3IN8A 4X6SA 1AWJA 4GLMA 3GQIB 4F59A 1UURA 2H8HA 3VRZA 2CREA 2EKXA 2KEAA 1RLPC 2KBTA 1YVHA 2JYQA 4JEGA 5EELA 1K76A 5IHIA 2SEMA 3PSKA 2ROLA 1NG2A 1BF5A 2A37A 4GL9E 2LP5A 2CH4W 1I3ZA 2FG0A 1SPRA 2A28A 3VRNA 2LJ1A 2DX0A 2CT4A 1M3AA 1WXBA 1NZLA 1LKKA 5AXIA 2VWFA 2KRMA 2EBPA 4CC4B 1K0SA 5EHRA 1MV3A 1CKAA 2DL8A 1BFJA 4OMOA 4QT7A 1CKBA 1MV0B 1KSWA 2LJ0A 2K79B 1O4EA 2ETZA 5ECAA 3HCKA 2DL3A 1QWEA 5D0JA 5I22A 3I5RA 2EYVA 1NYFA 1BG1A 2EYXA 2JW4A 1Z9QA 1I1JA 1W6XA 1ZX6A 2I0NA 1BU1A 1B47A 5GJHA 1PNJA 2CI9A 3SHWA 1K4US 2HSPA 1O4LA 2DRKA 1SHGA 2F2XA 1UUEA 2RPNA 4GWFA 4A63B 1AVZC 1IJRA 2QMSA 1M61A 1EFNA 1YP5A 1SRLA 2FPEA 4RTTA 5IHKA 1ABQA 1HCSB 1UJ0A 2K2MA 2JXBA 4JE4A 2DL5A 3R6NA 1CSZA 1M27A 3S8OA 1PKSA 4WWQA 5I6VA 1BHFA 4LNPA 1Z3KA 3GBQA 1QKXA 4J9CA 1KC2A 5IBSA 3VROA 2EGEA 5DF6A 1WXUA 5CDWA 2IIMA 1E6GA 2ED0A 5IHNA 1S1NA 3HHMB 4K45A 1ZUKA 4IIMA 4D8DA 1A0NB 2OZOA 2LQWA 1O43A 1RI9A 1UHFA 2AZSA 3VS1A 3MXYA 4OHDA 1FU6A 2DX1A 3EHRA 3TSZA 5HKWA 2DF6A 2ECZA 1JU5A 2AZVA 1X6GA 2CBLA 1T0JA 3VGOA 2EYZA 2CRHA 1JYQA 1CSKA 4ESRA 1NZVA 2Y1NA 3JV3A 2LX7A 3UYOA 2L4KA 2JMCA 2EYYA 1M30A 1KJWA 2BZ8A 2HCKA 2D1XA 3VS6A 1BKLA 2RQVA 4ZNXA 2MOXA 2NWMA 1YWOA 1UGVA 4A4CA 1BLJA 2JS2A 2KK6A 2KT8A 3VRRA 4F5BA 2B86A 1YVLA 1X43A 2XP1A 1W70A 2RQWA 1A1AA 2EVRA 2HDXA 4CC7A 1BMBA 3OV1A 1BKMA 2RMXA 3M7FA 2YUNA 2BTTA 2ABLA 1AWWA 1LCJA 5HKZA 2DYBA 5FW9A 1AYCA 2MRJA 2EQIA 1O41A 2IUGA 2RN8A 1WX6A 4CC2A 1A1EA 2E5KA 2FO0A 2AOAA 2EKHA 1O4DA 5L23A 1AOUF 3EG3A 1OOTA 1FHSA 3A98A 2EGAA 3VS4A 2C0TA 3ULRB 1VYUA 4K2RA 1D1ZA 2W0ZA 2RF0A 2AK5A 4NWFA 4DEXA 4RTZA 3PQZA 2MK2A 3BUMB 2DILA 2AUGA 1JYRA 5J3XA 4Z89A 3N7YA 3H41A 4J9GA 3OB2B 1RJAA 3IN7A 2J6KA 1AZEA 2X3WD 1QWFA 2FPFA 4RTVA 1PKTA 2J05A 1X0NA 2JT4A 1O4IA 1O4RA 3S9KA 2DL7A 1KFZA 4P9ZA 2C9WA 4HCKA 3FJ5A 4M4ZA 2RQRA 2L0AA 2HDVA 2KE9A 2OJ2A 3EACA 1UG1A 5KAZA 2YUQA 4AG2C 1GHUA 1O4QA 1VA7A 4XZ1A 1LUIA 3RBBB 1SEMA 4AFUC 2IZVA 5EG3B 1WLPB 1BHHB 1D4TA 4ROJA 4A4BA 1FYRA 2L6KA 1A07A 1O4PA 2Y1MA 1FBZA 1PICA 2DM0A 1AYAA 1BLKA 2DM1A 2K7AB 1K0XA 4J9DA 1E7OA 4DEYA 1O4GA 3IMJA 3M0QA 1KIKA 2PNBA 2EGCA 1X6BA 4LE9A 1F1WA 1X2KA 2PTKA 2RVFA 1O4KA 2CUDA 1M3BA 2ECDA 1WYXA 2PLEA 1GCQA 1OV3A 2KR3A 1WQUA 2LNWA 4E93A 1P13A 4LN2A 2EPDA 3REAB 1BHHA 1MILA 2Y3AB 3IMDA 1I07A 3REBB 1X2QA 2D8JA 1V1CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WJRA 1AOTF 4DBQA 4AG1C 1UDLA 2MIOA 3ZL7C 2V26A 1VQ9T 1JB0E 1QCOA 5IH2A 3J81E 4M7DA 2CS0A 2K3YA 2KQWA 1OX8A 3MEWA 1A1CA 1BI0A 3LW5E 2O9SA 1SHFA 4M7DD 2CDTA 1SKJA 2HL3A 4JRKA 5GAOp 4RG8A 4JLGA 5GMKh 3V8LA 1N6AA 3TL0A 3M9QA 5GANd 3RDVA 1WDXA 2MK5A 2BBUA 3RIRA 5GANg 3H6ZA 1RUWA 4RTWA 1KQ2A 2L3SA 4JS4A 5FU6B 3PNWC 2KNBB 1EX4A 3UA7A 3J7AF 2IUHA 2YHTA 4C92A 2KXDA 3I55A 1NEBA 3LWIA 2ZPHB 3CMAQ 1AD5A 4C8QG 2DLZA 1YJWA 1T3SA 5GAOr 1QVGS 1X69A 4C5IA 1VQOA 1VQNT 1MGQA 2CR4A 2W10A 1VQ8T 3HSBA 3S6WA 1KQSP 2YT6A 4OMLA 3ZBDA 4ZGEB 3UDCA 3QBYA 3VS7A 4E68A 2GTJA 2HL5C 1VQ7Q 1A08A 4M7AA 2J06A 1H8KA 1GFDA 3UA6A 1B3QA 2X51A 1BFIA 5D6XA 3KUFA 4M75G 5DC9A 4RUGA 2DEUA 1QVFA 2GSBA 4M7AD 4OMFB 2PZ1A 3OSVA 4J7IA 1K9MC 1ABOA 2O88A 3R6OA 3S3NA 4H34A 3H0FA 2A3LA 4XZ0A 1A81A 4FYWB 2O31A 2JM9A 1D09B 2EL8A 2E3HA 3MXCA 2FPDA 4L59A 5EC7A 2D9TA 3CQTA 1A09A 1A1BA 4L1BB 3PT9A 2DTOA 1VQ8A 4AFZC 2A08A 2K3XA 1HYOA 3T9NA 1YITQ 1AOJA 4BI4A 3GF5A 3OP0A 2BZYA 2KYBA 3H0HA 4JRQA 1TZEE 2GTOA 1XOVA 3OYFA 1U06A 4L5GA 3IQLA 2DJZA 3PJPA 2LNHB 4OF1A 4C5HA 1VQ6A 4FW1A 5IBMA 5C0MA 3HL8A 5GJWB 3I56Q 3CCVT 2DZCA 4Z02A 3SD4A 2ENMA 3HRSA 3JRZA 1NM7A 3CC4A 4MDXA 2BE7D 1WJQA 1YIJT 5CO7A 1GL5A 2GF7A 3EAZA 1MMDA 2EO6A 4EMGA 1U5SA 2P84A 5I11A 1Q95G 2EW3A 1VQ5A 4Y91A 2NUPB 3FB9A 2DXUA 1Q7YR 5DM7R 2AKLA 2LCSA 1W2BS 2C0OA 1GFCA 2DBKA 2JMAA 4E2FB 1SSFA 3JB9I 2DJQA 2XHCA 3CCLT 1WQWA 1QP2A 3CPFA 1V29B 3PVQA 5LJ5j 2CT3A 4U17A 1BCOA 3EFOA 4C92F 4M7DC 3TQ7P 2F1LA 1ZBJA 2LQKA 5GJIA 2LX9A 2AIRB 3BUWB 2JZ2A 4OVAA 3P8BB 1MUZA 1IXDA 1G3YA 2DXCA 3I35A 5KE2A 1FWZA 1OPKA 1YI2T 2R57A 4KGVB 3I56A 5DLOA 1O4MA 1VQKA 1WHLA 3OBYA 2V1RA 3M0PA 3VS0A 2PU9B 1O4JA 4EMKC 2COWA 4LXCA 1VQLT 1GBQA 1UUSA 3NMZC 1BCMA 3CWGA 4BY6C 1MMAA 3BUNB 3VS3A 1QLYA 3SWNB 4M75E 5EHPA 4WTOB 4J9IA 1KD1C 1UGPB 1FYNA 1G2BA 3BDLA 1KC8R 2NLUA 3RR6A 3CBLA 4MMLA 4LDVA 3LYVA 1CWEA 2KYMA 3QWYA 2J6FA 3PSJA 3TKZA 2EJGA 1BM2A 2YLBA 3CXCP 4JJDA 2L3TA 2YU7A 4BB7A 4A4HA 2DVJA 2GGRA 2GNCA 3ZNIA 1RLQC 1QVGA 1WPYA 1BYMA 2LT1A 3JCMc 4E6RA 4C5EA 4HA8A 1O45A 3TEEA 5M9OA 2EQMA 4PLIA 1CJ1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2AKK A;  1AOT F;  4FSS A;  4AG1 C;  1UDL A;  3BUX B;  2MIO A;  3ZL7 C;  2FCI A;  2RQU A;  3T04 A;  1M8M A;  2L2P A;  2CH4 A;  5IH2 A;  2CS0 A;  1O49 A;  2VVK A;  5AUL A;  2K9G A;  1A1C A;  3S8L A;  3M0S A;  3GXX A;  1SPS A;  4GPL B;  2O9S A;  1SHF A;  1LUN A;  1SHA A;  3BUO B;  1O42 A;  1PWT A;  3LH5 A;  1ARK A;  5FWC A;  2CDT A;  1SKJ A;  1TUD A;  3PFV A;  1O4C A;  2RNA A;  1LCK A;  2MC1 A;  1TCE A;  1T3L A;  1GBR A;  2MRK A;  2GQI A;  2F2W A;  3TL0 A;  2DMO A;  2PNI A;  2K79 A;  3VRY A;  1YNZ A;  1WDX A;  2BBU A;  2SRC A;  1ZLM A;  1RUW A;  2DA9 A;  4RTW A;  4J9H A;  5IXF A;  1LKL A;  4U1P A;  2L3S A;  2ROT A;  5HCK A;  1GCP A;  1YWP A;  2KNB B;  3QWX X;  3UA7 A;  1SHB A;  1ZFP E;  2IUH A;  1CWD L;  4RTU A;  1MW4 A;  2KXD A;  1NEB A;  1JU5 C;  3C0C A;  3UAT A;  1UE9 A;  1AD5 A;  3M0T A;  2M51 A;  2DLZ A;  1F2F A;  4IIO A;  1T3S A;  2HMH A;  2QDL A;  1BK2 A;  1M27 C;  1X69 A;  2KRN A;  3I9Q A;  1H92 A;  2EOB A;  3SEM A;  2K7A A;  1SHD A;  3US4 A;  2CR4 A;  2KRO A;  2W10 A;  1HJD A;  4HVW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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