3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
2K6DA 2X3WD 2QMSA 1UECA 2G6FX 4E68A 2OQ1A 2YSXA 4RUGA 3PVQA 3FJ5A 2EO3A 4JZ4A 2DLZA 1TCEA 1BBZA 2MCNA 1UDLA 2DX0A 3GQIB 2JS0A 1SRMA 5IXFA 2XMFA 3PVLA 2H5KA 3OVEA 2FCIA 1E7OA 2RQUA 2L4KA 2LNWA 1IO6A 3TKZA 1WQUA 2LCTA 2Y3AB 4Y92A 1UURA 3TL0A 4EY0A 2PLEA 3OB2B 2L0AA 1BF5A 2AUGA 1BHHB 1BHFA 2KRSA 2EGCA 1OPLA 1O4DA 1CJ1A 1BHHA 2HBWA 3K2MA 2K7AA 5IHIA 4JGHA 4F59A 2GE9A 4GLMA 5FWBA 3BKBA 1B3QA 1QWFA 1CSZA 5BO4A 2KXCA 2DYBA 4OHIA 2RORA 2KBTA 2MK2A 2Y1MA 4R0KA 1WI7A 2DBMA 2EKXA 2DL5A 1D4TA 2V1QA 5IHNA 1SEMA 4HCKA 1ZLMA 1QKXA 4JJDA 3N7YA 1KC2A 1X6BA 2EGEA 2RVFA 1ZSGA 4J9HA 4IIOA 3VS6A 2JW4A 1UG1A 5HCKA 4QSYA 1K76A 4DGXA 1ZUKA 4AFUC 2JXBA 2ENMA 4J9BA 4NWFA 2L3TA 1RJAA 3IMJA 3M0PA 2KXDA 1JYQA 1YVLA 2MRKA 2CRHA 5HKYA 4HVVA 4GWFA 1GFCA 2JMCA 4DEYA 4Z88A 2PZ1A 2RMOA 1LCJA 2I0NA 2Y1NA 5DC9A 2J06A 1JEGA 1O49A 1O4KA 3IMDA 5AULA 1PRLC 1M8MA 2YT6A 1LUKA 5EEQA 2DRKA 1W1FA 2DL7A 2OI3A 2RQTA 3ZL7C 1NRVA 2A36A 2FRWA 1M27A 2AKKA 2FRYA 1NZVA 1RI9A 3VRNA 1WYXA 2LJ0A 1UJ0A 1RPYA 1FU5A 2KNOA 4F14A 1NLOC 1U3OA 2AK5A 4D8DA 2YUNA 2DL3A 1M30A 3GXXA 2IUGA 1FBZA 2CH4W 2RPNA 3S9KA 3MXYA 3UA6A 1YVHA 1UHCA 3S8NA 1FHSA 2O31A 5I11A 1O4IA 2DE0X 1BMBA 3EGUA 3BUOB 2CS0A 2FO0A 3PLFB 1JU5C 2LJ1A 3THKA 1M3AA 2DCRA 1LUIA 3A98A 1O47A 1PNJA 1PKSA 3PSKA 4E6RA 2VIFA 5AXIA 4EIHA 3NPFA 4L1BB 2B86A 1MV0B 1O46A 2O2OA 4H34A 1AD5A 1O4FA 1YNZA 3C7IA 1TG0A 4HVUA 1Z9ZA 3VRQA 1BK2A 1O48A 5D0JA 1AYCA 1UUSA 1YCSB 2DX1A 1O4CA 3VS0A 1A1EA 4OMQA 4OHDA 2AKLA 1JQQA 3VRPA 5EHRA 1QKWA 2D0NA 1UUEA 5HKWA 2HDAA 5CDWA 4TZIA 1I1JA 2IIMA 1T0HA 4CC3A 2DMOA 1SPKA 4RTUA 1UFFA 2C0TA 2RQRA 1LCKA 2CSQA 2J6OA 2KT8A 4JJBA 5EG3B 4AFZC 1OV3A 1NYFA 1AWOA 1OO4A 1KSWA 2KYBA 2PNIA 1X0NA 3IN7A 3IN8A 2EPDA 1CWEA 3S8OA 5IH2A 3VRYA 1K1ZA 3UF4A 1O4BA 2L3PA 2EO6A 1FBVA 1O41A 4P9VA 3H0IA 2RN8A 3ULRB 2JMAA 1G83A 2CUBA 5IXBA 2NUZA 2BBUA 2FG0A 1KA6A 1SHBA 1WXBA 4LUDA 1HSQA 1O4QA 3OB1B 2O88A 4FBNA 3UYOA 1LKKA 4LE9A 2J6FA 1A81A 5IBMA 2CR4A 1O4LA 1UHFA 1A1BA 3EG2A 2CDTA 2MQIA 1Y57A 2OJ2A 1WA7A 1GBRA 2LQWA 5GJHA 1AYAA 4DGPA 4E93A 1WFWA 2A08A 2HMHA 3SHWA 4GBQA 2YDLA 3LH5A 5FWCA 1HJDA 2O9SA 1PKTA 1VYVA 3VS1A 3N8MA 3OV1A 1AYBA 2IUIA 2L2PA 1H8KA 1FMKA 1M3BA 2YU7A 1K4US 4OHLA 3KFJA 4H1OA 1W70A 4RTXA 2CBLA 3M7FA 4XZ0A 1BB9A 1CKBA 2DNUA 2J05A 3M0QA 1UGVA 4JJCA 4CC2A 3QWYA 4ESRA 1O4GA 2HUWA 3U23A 1O42A 1VYUA 1LKLA 4F17A 1RLPC 4U1PA 4F5BA 3EAZA 1Y0MA 4OMPA 4WCIA 4HXJA 4FSSA 1HCSB 1ZUYA 1M27C 2EYVA 5GJIA 1X27A 4F5AA 1KFZA 1ZFPE 2EYXA 2IZVA 2KYMA 2KRMA 1O4AA 3C0CA 3BUMB 1Z3KA 4OMOA 1F2FA 3I5RA 2B3OA 3VS2A 4RTVA 1BG1A 1OOTA 1MUZA 2CH4A 1JO8A 2RNAA 3EG0A 1BFJA 3EHRA 3M0TA 2KR3A 1LUMA 1SHFA 2ECDA 3CWGA 1A1AA 1X43A 3BUXB 5J3XA 1TUCA 1KA7A 1N5ZA 2DVJA 1T3LA 4ROJA 2AZSA 4A4CA 2SEMA 3T04A 1ARKA 2LMJA 2M0YA 1PICA 2HDVA 1U06A 3CXLA 1ZX6A 2JS2A 4J9CA 2X3XD 1ABQA 4K2RA 2DBKA 2J7IA 4D8KA 1D4WA 4GPLB 2K2MA 5IHKA 4JEGA 2W10A 4AFQC 3VROA 2NWMA 2CI9A 1AB2A 3UA7A 3GBQA 1W6XA 3PS5A 2KRNA 2YSQA 4RTZA 1AZGB 1SHGA 2A28A 1I07A 1WLPB 1QCFA 2CUDA 2LNHB 3WA4A 2EKHA 4RTTA 3REBB 2KGTA 2O9VA 1OPKA 1SHDA 2AOAA 4EIKA 1YP5A 1H3HA 1O4NA 2J6KA 3CD3A 2ED0A 2DF6A 2DILA 3HIZB 2EYZA 3EG1A 3IQLA 2GGRA 2HEQA 2KE9A 4CC7A 1R1SA 2PNBA 1BLJA 1SPSA 4X6SA 1GRIA 1HCTB 3TVTA 5I6VA 1O43A 2CREA 1RUWA 1GCQA 2EYYA 1SPRA 4IIMA 2K3BA 1R1QA 3PQZA 2PTKA 4LUEA 4AG2C 4K44A 5IBSA 1JYUA 4XZ1A 1QG1E 2BZXA 2D1XA 2DRMA 2DM1A 3VS5A 1NEBA 2EBPA 1FU6A 3I35A 2MRJA 2LQNA 2BTTA 1K9AA 5I22A 2DA9A 3US4A 3BUNB 2MC1A 1NEGA 1SRLA 3QWXX 4Z89A 1H92A 4FL2A 3PJPA 3CQTA 1CSKA 1GBQA 3SEMA 1Y1UA 3CBLA 1CKAA 3TSWA 2BZYA 2LX7A 1GFDA 2JYQA 4QT7A 3S8LA 2P4RA 1AEYA 1D1ZA 1UE9A 1CWDL 2H46E 4OMLA 5DF6A 3PSJA 4KRTA 1Z9QA 3VGOA 1AVZC 3I5SA 3NHNA 1XOVA 1ZBJA 2OZOA 2EW3A 2M51A 2AOBA 1PHTA 3NMZC 3M0UA 3PFVA 5EELA 1JWOA 1SKJA 2L3SA 2EYWA 3VRZA 2DLPA 2EGAA 1AYDA 1R1PA 1AOUF 2ESWA 1X2KA 2VVKA 1AWJA 4U17A 1O45A 2JTEA 2QDLA 4P9ZA 1WX6A 2MIOA 2BZ8A 1NZLA 2FPEA 2H8HA 2LNXA 2EOBA 1I0CA 3MAZA 4LNPA 4J9EA 3RNJA 4J9IA 1BKLA 1M61A 1UJYA 2YUOA 3EG3A 1AOTF 1J3TA 2GNCA 2YUPA 2K7AB 1BKMA 4FL3A 4OMMA 1O44A 2HSPA 1A07A 1O4MA 3UATA 2PLDA 4K45A 1A1CA 5EC7A 1AWWA 1AZEA 1U5SA 4AG1C 2EL8A 2ECZA 2KEAA 3VS4A 3TSZA 2DM0A 1IS0A 2A37A 4DEXA 1K0SA 4OHEA 1F1WA 1MW4A 4RTWA 2EQIA 2GQIA 2V1RA 1O4JA 1CSYA 1O4PA 2GTJA 2MOXA 4Z8AA 1M3CA 1AOJA 3JV3A 1KJWA 4ZNXA 4JZ3A 1X69A 2RMXA 5HKZA 1HD3A 2JM8A 1NLPC 2F2XA 2CIAA 2C0OA 3N84A 1X6CA 1PRMC 3H41A 5L23A 1EFNA 5KAZA 2PNAA 3I9QA 5ECAA 2AZVA 1NYGA 4A63B 1BU1A 2RQVA 2EU0A 2K79B 2XP1A 4JE4A 4NWGA 5FW9A 1GHUA 3RBBB 1T0JA 1G2BA 4X1VA 1YN8A 2K79A 2L3QA 2ED1A 1TUDA 3HHMB 1O4EA 1VA7A 2RSYA 5GJWB 1QLYA 2RF0A 1JXOA 1NG2A 5GJVB 2KK6A 3VS7A 2L6KA 1QADA 3OP0A 4J9GA 1X2QA 1IJRA 1SSHA 1A0NB 4J9DA 2KROA 4WWQA 3R6NA 2RQWA 2DJQA 1A09A 2IUHA 1T3SA 4HVWA 2F2VA 2LJ3A 1VYTA 2VKNA 4J9FA 1FYNA 2FPFA 2FPDA 4AFSC 1FYRA 2LZ6B 1XA6A 1NM7A 2SRCA 1E6HA 1B07A 2DL8A 2F2WA 1GCPA 3M0SA 4A4BA 3ZNIA 2CSIA 2GSBA 2HCKA 1SHAA 1PWTA 4RTYA 1S1NA 5DC4A 4CC4B 3PE0A 1GCQC 1BM2A 2DL4A 2YUQA 2K9GA 4F16A 3EHQA 4K11A 5DC0B 1QWEA 2ROLA 2KNBB 3H0HA 1RQQC 1H9OA 3HCKA 4OHHA 4OMNA 2E5KA 1JYRA 5EHPA 1AWXA 1MV3A 1YWPA 2SHPA 1ZUUA 1JXMA 1WXTA 1LUNA 3M0RA 3BUWB 1P13A 1O4OA 1OEBA 1E6GA 2D8HA 1O4HA 3MXCA 3KFVA 3VS3A 2DLYA 2VWFA 2CT3A 4LN2A 2C9WA 1BFIA 2FEIA 2GTOA 1JU5A 3VRRA 2LP5A 1GL5A 2GBQA 2ETZA 2C0IA 2ABLA 2OAWA 3REAB 1UTIA 1MILA 2CI8A 3EACA 1V1CA 2ROTA 1YWOA 1KIKA 1WDXA 1A08A 2EVRA 2JM9A 1I3ZA 3O5ZA 4ORZA 3GXWA 2D8JA 1TZEE 2LCSA 1WXUA 4JPBW 1X6GA 2W0ZA 1O4RA 1OO3A 2KT1A 4M4ZA 1BLKA 2CT4A 2JT4A 3H0FA 2HDXA 1ABOA 3NGPA 1B47A 1WIEA 1K0XA 1RLQC 4GL9E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DERA 2K6DA 3L2RA 1UECA 2G6FX 2RD1A 3I55Q 5FRNA 2YSXA 3PVQA 2E1HA 5I21A 4BY6B 3EFSA 5IXFA 5J3BA 2H5KA 3OVEA 2L4KA 2LNWA 3TKZA 1KD1C 2LCTA 4C5EA 1UURA 2KY9A 1VQMT 1ZSZB 1QCNA 1BF5A 5FU7C 4OVAA 3OS5A 1YIJA 1MHNA 2GFAA 4EPCA 2X4XA 1OPLA 1RAFB 3PT9A 1QCOA 1Q7YC 1BHHA 1M1FA 3OW2A 1R77A 2CP0A 5GAMg 3MJXA 5FWBA 3BKBA 4M7AA 2FVUA 4OHIA 2RORA 2Y1MA 2VGNA 3CCLA 3L2ZA 3DKMA 1VQNA 3N7YA 4ME7A 3CCQT 1KC2A 1X6BA 2RVFA 1ZSGA 5FU7B 2JW4A 4QSYA 1K76A 5CKBA 4DGXA 4AFUC 2JXBA 2ENMA 4NWFA 3JB9H 3M0PA 3QIIA 1G3WA 2MRKA 2Z0WA 4GWFA 3CCST 1X75C 5FLXE 4IUQA 4KUDK 5LJ3e 2PZ1A 2RMOA 3G71A 2I0NA 4M7DG 1LCJA 3C4SA 5DC9A 1N8RU 1O49A 3QYHB 1JEGA 5AULA 4PK4A 1OQKA 1PRLC 2RI5A 2DRKA 5CKHA 1LJOA 2I2LA 1M27A 2FRYA 1NE8A 1QP3A 2LJ0A 1RPYA 5FRMA 3GOXA 1FBZA 2EQJA 3UA6A 1YVHA 1UHCA 1FHSA 3CCUT 4A4HA 1S72A 3MP8A 4ELYC 2XK0A 2GF7A 2DE0X 2V8IA 2OTJT 2LJ1A 3ASKA 2DCRA 1K8AR 1O47A 3L42A 3SB2A 3EFOA 3OSSC 4N4HA 1VQOT 1MV0B 1AD5A 4UC4A 5CR2A 3C7IA 4FL6A 2L3RA 4ANJA 3CMAA 5D0JA 1M2OA 3TEEA 2EJ9A 3CC4A 2WACA 2AKLA 3RKYA 2D0NA 5HKWA 5DM7R 2E5QA 3UDCA 5CQYA 1B34B 1SPKA 2RQRA 2ZGWA 3PIOA 4JJBA 1MNEA 2Y4XA 4NL2A 1OO4A 2KYBA 2PNIA 1X0NA 3IN8A 1CWEA 2VV5A 2BIVA 5LJ3f 2GCXA 1JJ2S 5IH2A 1K1ZA 1O4BA 2L3PA 1WHKA 3OYDA 3ULRB 1WHMA 1W2BP 4QQDA 4B9XA 2NUZA 5IXBA 2BBUA 2FG0A 2FL7A 1V29B 4XQ3A 1NJIC 3CC7A 5L8RE 1A1BA 3VKIA 3BDLA 2MK5A 4PJLA 2OJ2A 1SKUB 2LQWA 4M75D 4C8QD 1GBRA 1I81A 3CBOA 5GMKj 2YDLA 4O5VA 2E10A 3E9FA 1SF9A 1IHVA 1UGSB 5KYXB 1D1CA 2O9SA 1PKTA 3VS1A 4PJOD 2L2PA 5DY9A 2DIQA 4M75F 5KH6A 3CEYA 2L89A 4OHLA 2F1LA 3PNWC 2MI6A 2J05A 4RKUE 3QWYA 1O42A 1AHJB 3A8OB 4R55A 4N4GA 3OW2S 3OS1A 1LKLA 5D6XA 3EAZA 4OMPA 4HXJA 1ZUYA 3BDUA 4IUTA 3I56Q 4J83A 2EWNA 1AT1B 1MGQA 2A3LA 4EMKB 1VQKQ 3VS2A 2LCLA 1OOTA 3CCQA 2X4JA 1JO8A 4M7DA 3EHRA 1YHQA 3V8LA 3VUBA 1Q81C 4RG8A 1A1AA 1N5ZA 5A0DA 4C92B 3JCMf 1PC0A 1YFNA 2LMJA 3CCSA 3CCMA 4FW2A 3QDFA 3P8DA 2J7IA 4GPLB 4HT8A 1VQ5Q 2K2MA 3VROA 4AFQC 1UGQB 1BI2A 2NWMA 1AB2A 1W6XA 2KRNA 1I07A 1WLPB 4F7UE 1VQ6Q 4TVRA 2EIFA 3EGDA 3CMET 4L5GA 4M77B 2MYSA 2KGTA 4FT2A 3LGFA 5HY6A 4CRIA 2DILA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2K6D A;  2X3W D;  2QMS A;  1UEC A;  2G6F X;  4E68 A;  2OQ1 A;  2YSX A;  4RUG A;  3PVQ A;  3FJ5 A;  2EO3 A;  4JZ4 A;  2DLZ A;  1TCE A;  1BBZ A;  2MCN A;  1UDL A;  2DX0 A;  3GQI B;  2JS0 A;  1SRM A;  5IXF A;  2XMF A;  3PVL A;  2H5K A;  3OVE A;  2FCI A;  1E7O A;  2RQU A;  2L4K A;  2LNW A;  1IO6 A;  3TKZ A;  1WQU A;  2LCT A;  2Y3A B;  4Y92 A;  1UUR A;  3TL0 A;  4EY0 A;  2PLE A;  3OB2 B;  2L0A A;  1BF5 A;  2AUG A;  1BHH B;  1BHF A;  2KRS A;  2EGC A;  1OPL A;  1O4D A;  1CJ1 A;  1BHH A;  2HBW A;  3K2M A;  2K7A A;  5IHI A;  4JGH A;  4F59 A;  2GE9 A;  4GLM A;  5FWB A;  3BKB A;  1B3Q A;  1QWF A;  1CSZ A;  5BO4 A;  2KXC A;  2DYB A;  4OHI A;  2ROR A;  2KBT A;  2MK2 A;  2Y1M A;  4R0K A;  1WI7 A;  2DBM A;  2EKX A;  2DL5 A;  1D4T A;  2V1Q A;  5IHN A;  1SEM A;  4HCK A;  1ZLM A;  1QKX A;  4JJD A;  3N7Y A;  1KC2 A;  1X6B A;  2EGE A;  2RVF A;  1ZSG A;  4J9H A;  4IIO A;  3VS6 A;  2JW4 A;  1UG1 A;  5HCK A;  4QSY A;  1K76 A;  4DGX A;  1ZUK A;  4AFU C;  2JXB A;  2ENM A;  4J9B A;  4NWF A;  2L3T A;  1RJA A;  3IMJ A; 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