3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
1GL5A 2P4RA 4RTYA 2RQRA 2CI8A 3I5RA 1SHGA 1O46A 1UUSA 3OV1A 4X1VA 2C0IA 5I11A 1QKXA 4FBNA 2SHPA 2A36A 2RORA 2B86A 3EG3A 1QWEA 2OAWA 2KRSA 4Z88A 1SKJA 2L0AA 1YVLA 2MQIA 4J9CA 4IIOA 3K2MA 2ECZA 4WCIA 1MV3A 2D1XA 4NWGA 4DEXA 3IN8A 3S8OA 2YU7A 4RTZA 2EQIA 2K3BA 1JU5A 2EU0A 1O4DA 2F2WA 1D1ZA 4P9ZA 2AK5A 3N84A 1UURA 2DL3A 3BUOB 2DL8A 1A1BA 4RTVA 3VROA 3FJ5A 5DC4A 1BK2A 1PKTA 4K11A 4JJDA 1O43A 3TSZA 1O4EA 1RLPC 1BU1A 2LQNA 4L1BB 4J9FA 3ZL7C 2D8JA 2CRHA 1X6CA 2FCIA 2PNAA 1QCFA 2VWFA 2CREA 4LUDA 1UFFA 3BKBA 1T0HA 1NLOC 2EBPA 4HCKA 5IHNA 2W10A 1FYNA 3VRNA 1WA7A 4A63B 2JYQA 1JU5C 5IHIA 2C9WA 3A98A 2C0OA 4QT7A 4CC7A 2KT8A 3RNJA 4OHEA 5DC9A 1AOUF 1MW4A 2KGTA 1T3LA 4XZ0A 1BBZA 1PWTA 3M0RA 1SHFA 1O4IA 1IJRA 2K2MA 5GJIA 5EELA 4AFQC 1U06A 3GBQA 1KA7A 2KE9A 2DNUA 1H3HA 1I3ZA 2IUGA 1AWJA 1A0NB 3WA4A 1U5SA 1YP5A 5D0JA 2CUDA 1UUEA 4HXJA 3GXWA 1X27A 2G6FX 1K1ZA 2LCTA 1NRVA 2AZVA 1O4AA 3OB1B 3IMDA 1ZX6A 4Z8AA 3CXLA 4K2RA 1LKKA 4F17A 1TUDA 2O2OA 1LUNA 1OO4A 1X43A 2OQ1A 2VIFA 3VRQA 1M27C 1OPLA 1ABOA 1SSHA 1HJDA 2EO3A 1EFNA 2EVRA 1QKWA 1G2BA 2DRKA 3EGUA 1O4CA 3BUNB 2V1QA 3NHNA 1CJ1A 3C0CA 2K6DA 2DMOA 2BZYA 2EPDA 3KFJA 2DE0X 2OI3A 4RTWA 3CQTA 1CWDL 1PNJA 5KAZA 1UGVA 2RPNA 3EACA 4OHIA 4JJBA 1NZLA 1PICA 1YNZA 1ZUYA 2DYBA 1AYDA 2RSYA 1CSKA 1F2FA 2DCRA 3EG2A 3QWYA 1K76A 3LH5A 5EG3B 1AWXA 1UTIA 4XZ1A 2EYWA 2JMAA 2Y1NA 1GBRA 4A4BA 4FSSA 2GGRA 1IO6A 2AUGA 2YSXA 2DLZA 1GCQC 4EIHA 4RTUA 2DX0A 2HMHA 3PJPA 1BFJA 1T0JA 2KXDA 2KRNA 2IIMA 1GFDA 1NZVA 2KBTA 2DM0A 2GSBA 4ROJA 1ZBJA 2RQWA 1O49A 2C0TA 1B07A 2F2XA 1GRIA 2HBWA 1D4WA 1RJAA 4WWQA 1BFIA 4JZ4A 4NWFA 3VGOA 3ZNIA 2LNWA 2OJ2A 1UHFA 2J7IA 1NLPC 3VRZA 1O4JA 5IBSA 1WX6A 2XP1A 2HCKA 2DLPA 4E68A 4F14A 5HCKA 2LJ1A 3ULRB 1WIEA 4OHDA 2AZSA 4P9VA 2KEAA 2EOBA 4DEYA 4LNPA 2GTOA 1M8MA 2RVFA 5FW9A 2IUIA 1JYRA 3UATA 3EAZA 1UECA 5BO4A 3N7YA 3UYOA 1AYCA 2RF0A 3THKA 4CC3A 2HDXA 5EHPA 2DM1A 2L3QA 1Y57A 1O4HA 1O41A 2LCSA 1LCKA 1KIKA 4JZ3A 1WYXA 4OMOA 1VYTA 1UG1A 1O44A 2H5KA 2RMOA 1YVHA 3S9KA 2SRCA 1OPKA 1O4KA 1CSYA 3VS0A 2L3SA 3QWXX 2FO0A 4OMQA 5IBMA 2K7AB 1SRMA 1M61A 4H34A 1AVZC 2JTEA 2O31A 2PLEA 3S8NA 1D4TA 1O4GA 1K0XA 1O4MA 3VRRA 1MUZA 2MRJA 3GXXA 2AKKA 1WXTA 1ZSGA 1CKBA 3S8LA 1R1QA 1JYQA 1X6BA 3RBBB 2Y1MA 3EHRA 2DL4A 3M0UA 1O4QA 2LX7A 3PS5A 4ZNXA 1A08A 1R1PA 2JW4A 2PTKA 2H46E 4K44A 1LUIA 2RMXA 1BG1A 5IH2A 2DF6A 3OB2B 2MK2A 4Z89A 1WXUA 4JE4A 2M0YA 1SHAA 4HVUA 1AWWA 2A37A 1CWEA 2JMCA 2Y3AB 5FWCA 1JXOA 2PLDA 2ED0A 1FYRA 2SEMA 1SHDA 2BTTA 3TL0A 1UHCA 2BZXA 2CH4W 2KYMA 4EIKA 1BM2A 4RUGA 3I9QA 1SPSA 2VVKA 2CS0A 4JGHA 3M0TA 3PVLA 4RTXA 1X69A 1CSZA 4F5BA 2EGEA 1YWOA 2MC1A 3UA7A 1KSWA 1W1FA 1XOVA 3BUMB 4JEGA 1K4US 4X6SA 2KR3A 2DL5A 3IMJA 3NPFA 1U3OA 3C7IA 2JT4A 4AFSC 1OV3A 2KK6A 1VYVA 1WI7A 1RPYA 2DLYA 2D8HA 1JO8A 1O48A 1NEGA 2CT4A 1FBVA 1GBQA 4Y92A 3VS3A 2CUBA 5L23A 2ETZA 3IN7A 4GL9E 1HCSB 1FU5A 1UE9A 1SHBA 2K79B 2DRMA 1AOJA 1W70A 2YUNA 1JQQA 3VS6A 2X3WD 2LJ3A 2O9VA 1WDXA 2CH4A 2CSIA 1JWOA 1NM7A 1VA7A 1J3TA 2GTJA 2ABLA 2AOAA 2ROLA 1X2KA 1YCSB 2EW3A 4ESRA 5AULA 1NYGA 2LJ0A 4EY0A 3M0PA 2AOBA 4CC4B 3U23A 2RN8A 2MRKA 4GLMA 1W6XA 4F59A 3I5SA 1HCTB 2KNBB 2MIOA 3N8MA 1T3SA 1O4LA 3SEMA 3VS1A 2GE9A 4F5AA 2DL7A 1M27A 5DF6A 2ROTA 1I1JA 1AZGB 2FEIA 5IHKA 3GQIB 2FPFA 4J9IA 3UF4A 1O4BA 1WXBA 2O9SA 3OP0A 2EGAA 2FPDA 2EYXA 3TKZA 2W0ZA 2B3OA 3KFVA 4ORZA 1LUKA 2EKHA 2J6FA 3REAB 5EEQA 5HKYA 2O88A 1A1AA 1X0NA 2CSQA 4LN2A 5I6VA 1H8KA 4LE9A 1NEBA 1UDLA 1O4NA 2HDVA 5HKZA 3HCKA 2LQWA 2YUPA 2VKNA 1I0CA 3M0QA 2KYBA 1JYUA 1GCQA 1KC2A 4HVWA 1BLKA 1RLQC 2CI9A 3PSKA 1AB2A 2RQUA 1QG1E 1PHTA 1MILA 2HSPA 2V1RA 1KJWA 2LP5A 4R0KA 1Y0MA 4D8DA 4JPBW 2LMJA 4K45A 1XA6A 4AFUC 2RNAA 1PRMC 4OMLA 4IIMA 1HD3A 2IUHA 1O4PA 2ED1A 2PZ1A 1IS0A 3CBLA 1RQQC 1AZEA 3O5ZA 3JV3A 4F16A 5EHRA 2JXBA 2DX1A 4HVVA 3US4A 3H0IA 2LZ6B 3PVQA 2QDLA 5ECAA 1K0SA 2YSQA 2YT6A 1O47A 1A1CA 4U1PA 4J9DA 4J9EA 2RQTA 4J9GA 1R1SA 2IZVA 2D0NA 2FRWA 1GCPA 4FL3A 2K9GA 1PRLC 1A81A 1O4OA 2JS2A 5CDWA 2K7AA 3REBB 2EYZA 1SPRA 2EL8A 2DBMA 1TUCA 5GJHA 1KFZA 3VS4A 2L3PA 1G83A 1OEBA 1FU6A 2L4KA 1E7OA 4GWFA 2JM8A 2J6KA 2J05A 1ZLMA 2DA9A 1AWOA 1MV0B 2E5KA 2YUQA 1H9OA 4GBQA 1LKLA 1A09A 5DC0B 2DJQA 1NYFA 1WLPB 2DVJA 2KXCA 3TSWA 1TZEE 3PLFB 3BUWB 2EYYA 3MAZA 5IXFA 3R6NA 2I0NA 2K79A 1O42A 1X2QA 3BUXB 1AEYA 3M0SA 3CD3A 1GFCA 1K9AA 2HDAA 4OMPA 2XMFA 4J9HA 5GJWB 2L3TA 1BHHB 1BB9A 2YUOA 1LCJA 4AG2C 2CT3A 1S1NA 3PE0A 5GJVB 1M3CA 4GPLB 1O4RA 3H0FA 1BF5A 3EG1A 2GQIA 3H41A 1P13A 3VS5A 2PNIA 1SPKA 2PNBA 5IXBA 3NGPA 3PFVA 4AG1C 1BKLA 4DGXA 1ZFPE 2KT1A 1TCEA 2L2PA 2A28A 1SEMA 2M51A 4D8KA 1RI9A 3SHWA 4OHLA 5I22A 3UA6A 1F1WA 1BLJA 2LNHB 2OZOA 4H1OA 1UJ0A 3OVEA 1AD5A 1ZUUA 1Z9QA 3EHQA 4QSYA 4CC2A 2EKXA 4FL2A 4LUEA 3M7FA 4J9BA 1RUWA 1WQUA 2FPEA 2X3XD 3H0HA 2EO6A 1BKMA 2JS0A 3VRYA 2J06A 3NMZC 5HKWA 2L6KA 1FHSA 1OO3A 1Z3KA 1X6GA 3VS7A 1FMKA 2BBUA 3VRPA 1JEGA 1A07A 1ARKA 1E6GA 3IQLA 1BHFA 2HUWA 4E93A 1N5ZA 2H8HA 1UJYA 2A08A 3MXYA 2CR4A 2BZ8A 1H92A 2FG0A 1LUMA 2MCNA 2AKLA 3PSJA 5FWBA 1AOTF 2MOXA 3TVTA 1A1EA 3EG0A 3HIZB 2ESWA 1YN8A 3VS2A 2LNXA 1HSQA 1VYUA 1M3BA 1YWPA 2KRMA 3MXCA 1JXMA 1B47A 1ZUKA 2FRYA 1QWFA 4OMNA 1OOTA 4KRTA 2F2VA 2GNCA 1GHUA 4OMMA 1FBZA 2QMSA 3CWGA 4U17A 4A4CA 2J6OA 4E6RA 1SRLA 2ECDA 5AXIA 1I07A 5J3XA 3T04A 1PKSA 1BHHA 2GBQA 1E6HA 1TG0A 1AYBA 2EYVA 3HHMB 1BMBA 2YDLA 2EGCA 1ABQA 1M3AA 2CDTA 2NWMA 5EC7A 1CKAA 1Y1UA 4AFZC 2JM9A 2RQVA 2NUZA 4RTTA 3PQZA 4DGPA 1O45A 1AYAA 4TZIA 1QLYA 1Z9ZA 1O4FA 1NG2A 1QADA 1V1CA 2DILA 2CBLA 1KA6A 2CIAA 4OHHA 2KROA 1B3QA 2HEQA 2ENMA 4JJCA 1WFWA 4M4ZA 1M30A 3I35A 2KNOA 2DBKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RQRA 4XTYA 3I5RA 2M9UA 4FBNA 4PJOB 4VUBA 2QTXA 1VQ5Q 2RORA 1SKJA 3HRSA 4IIOA 3A8OB 2LQ8A 2D1XA 2QA4A 4PLIA 4NWGA 1M90U 3IN8A 1TS9A 4B9WA 1M1KR 2KAFA 5KYUB 2EU0A 1N8RU 1D1ZA 3T9NA 3CCLQ 1UURA 5I21A 1A1BA 4RTVA 1Q86R 5DC4A 2QA4T 3F70A 1G3SA 1O4EA 1RLPC 1YIJA 4XTVA 1BU1A 5J26A 2VGNA 5HKCA 4C8QB 1B34B 4JLGA 1QCFA 1UFFA 1NLOC 1WA7A 3JRZA 4F7UA 2KT8A 4OHEA 4M7DA 2KGTA 1TXQA 1R0BG 1O4IA 1M1GA 1KA7A 2IUGA 1H3HA 4MDWA 5CKFA 1Q82R 2KK4A 5D0JA 1UUEA 3ASKA 2QEXA 3JCMf 3P8DA 1KHIA 3IMDA 3CXLA 4NL3A 4K2RA 5KYXA 3FEOA 2E6ZA 1HJDA 3TU4K 1G2BA 1O4CA 3NHNA 1CJ1A 2K6DA 2DMOA 5KAZA 4JJBA 3WVEB 1YNZA 1ZUYA 2DYBA 2V8IA 1K76A 3LH5A 1M2VA 2JMAA 2Y1NA 1VQ6Q 4E7LA 2E12A 4KUDK 4EMKA 5GANf 4RTUA 2HMHA 3SB2A 2IIMA 2GF7A 5GAMj 2KBTA 1G3YA 1W2BS 3JB9H 4RKUE 1MGQA 1RJAA 3TEEA 4R56A 1Q86U 5D6WA 1ZBXA 1O4JA 1VQLQ 3QDFA 1RL2A 4F14A 1MNEA 2LJ1A 4OHDA 2AZSA 1OU8A 2QEXQ 3FRNA 1JJ2P 3MEAA 1VQNA 3I55T 3JB9G 3UATA 5GANh 3UYOA 1AYCA 3BFMA 3THKA 1O41A 2LCSA 4D6WA 1ACMB 3CCRT 1LCKA 2KQWA 1KIKA 1D0YA 4JZ3A 1VQ4A 1HK9A 1VYTA 3S9KA 2ZGWA 4MMKA 1O4KA 1OPKA 4A4KA 3VS0A 1MMDA 1VQ6T 5IBMA 2RJEA 5CR2A 4NOYA 2JTEA 4RMOA 3MEVA 1BCOA 3X28B 2MRJA 4ZTFA 4PJLA 2XDPA 3CCVQ 3LX7A 1CKBA 2A7YA 2QI2A 2Y1MA 2NUTA 1PCXA 2OAUA 2FZCB 2KVQG 1RAFB 4ZNXA 1A08A 2JW4A 3JB9J 2RMXA 1QW1A 1BG1A 4X9DA 3OB2B 2DFUA 8AT1B 4QQDA 2K5FA 4KBMB 4N0AA 4QVZA 5LJ3f 1SHDA 3BW1A 2CH4W 4C8QC 3CCLT 4RUGA 1OI1A 1SPSA 3EGXB 4JGHA 4RTXA 3L1AA 1LVKA 3PVLA 3EH1A 1CSZA 4F5BA 4E7KA 3J80E 4KGXB 2LRQA 2X9HA 2FHDA 4MZMA 2DIGA 1K4US 2KR3A 3A8GB 3IMJA 4J6WA 2CZ1B 3C7IA 2D6FA 1RPYA 2R5MA 1WHLA 1GBQA 3CCQT 4BDYA 4C92E 4M78C 2CUBA 1HCSB 2K79B 3MP1A 2DRMA 2YUNA 1JQQA 3PNWC 4M77A 4PJOC 1YJWQ 2CH4A 2CSIA 3VYHB 1JWOA 4DBRA 3SD4A 4ZGJB 1X2KA 1YCSB 2ZPBB 5I2MA 4FYYB 4ESRA 5GAN4 3M54A 4EY0A 5FROA 2RN8A 2KDSA 2ZPFB 4EMHA 3FDRA 5GAN8 1W6XA 2XHCA 5FU6B 2JNGA 2KNBB 2DO3A 3LH0A 3SEMA 1K8AC 2GE9A 2CP7A 4GLKA 2DL7A 3CMAA 2M1HA 1YJNT 4FCYA 3OYKA 1I1JA 2FEIA 1B7TA 2FPFA 1O4BA 1WXBA 1S72A 4V2SA 4C8QA 3OP0A 1F1BB 1WQWA 3CPWS 3QUIA 2J6FA 5CQXA 5EEQA 5HKYA 2O88A 1A1AA 1PG5B 3LWHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2BZ8 A;  1H92 A;  2FG0 A;  1LUM A;  2MCN A;  2AKL A;  3PSJ A;  5FWB A;  1AOT F;  2MOX A;  3TVT A;  1A1E A;  3EG0 A;  3HIZ B;  2ESW A;  1YN8 A;  3VS2 A;  2LNX A;  1HSQ A;  1VYU A;  1M3B A;  1YWP A;  2KRM A;  3MXC A;  1JXM A;  1B47 A;  1ZUK A;  2FRY A;  1QWF A;  4OMN A;  1OOT A;  4KRT A;  2F2V A;  2GNC A;  1GHU A;  4OMM A;  1FBZ A;  2QMS A;  3CWG A;  4U17 A;  4A4C A;  2J6O A;  4E6R A;  1SRL A;  2ECD A;  5AXI A;  1I07 A;  5J3X A;  3T04 A;  1PKS A;  1BHH A;  2GBQ A;  1E6H A;  1TG0 A;  1AYB A;  2EYV A;  3HHM B;  1BMB A;  2YDL A;  2EGC A;  1ABQ A;  1M3A A;  2CDT A;  2NWM A;  5EC7 A;  1CKA A;  1Y1U A;  4AFZ C;  2JM9 A;  2RQV A;  2NUZ A;  4RTT A;  3PQZ A;  4DGP A;  1O45 A;  1AYA A;  4TZI A;  1QLY A;  1Z9Z A;  1O4F A;  1NG2 A;  1QAD A;  1V1C A;  2DIL A;  2CBL A;  1KA6 A;  2CIA A;  4OHH A;  2KRO A;  1B3Q A;  2HEQ A;  2ENM A;  4JJC A;  1WFW A;  4M4Z A;  1M30 A;  3I35 A;  2KNO A;  2DBK A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1GL5 A;  2P4R A;  4RTY A;  2RQR A;  2CI8 A;  3I5R A;  1SHG A;  1O46 A;  1UUS A;  3OV1 A;  4X1V A;  2C0I A;  5I11 A;  1QKX A;  4FBN A;  2SHP A;  2A36 A;  2ROR A;  2B86 A;  3EG3 A;  1QWE A;  2OAW A;  2KRS A;  4Z88 A;  1SKJ A;  2L0A A;  1YVL A;  2MQI A;  4J9C A;  4IIO A;  3K2M A;  2ECZ A;  4WCI A;  1MV3 A;  2D1X A;  4NWG A;  4DEX A;  3IN8 A;  3S8O A;  2YU7 A;  4RTZ A;  2EQI A;  2K3B A;  1JU5 A;  2EU0 A;  1O4D A;  2F2W A;  1D1Z A;  4P9Z A;  2AK5 A;  3N84 A;  1UUR A;  2DL3 A;  3BUO B;  2DL8 A;  1A1B A;  4RTV A;  3VRO A;  3FJ5 A;  5DC4 A;  1BK2 A;  1PKT A;  4K11 A;  4JJD A;  1O43 A;  3TSZ A;  1O4E A;  1RLP C;  1BU1 A;  2LQN A;  4L1B B;  4J9F A;  3ZL7 C;  2D8J A;  2CRH A;  1X6C A;  2FCI A;  2PNA A;  1QCF A;  2VWF A;  2CRE A;  4LUD A;  1UFF A;  3BKB A;  1T0H A;  1NLO C;  2EBP A;  4HCK A;  5IHN A;  2W10 A;  1FYN A;  3VRN A;  1WA7 A;  4A63 B;  2JYQ A;  1JU5 C;  5IHI A;  2C9W A;  3A98 A;  2C0O A;  4QT7 A;  4CC7 A;  2KT8 A;  3RNJ A;  4OHE A;  5DC9 A;  1AOU F;  1MW4 A;  2KGT A;  1T3L A;  4XZ0 A;  1BBZ A; 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