3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
b'TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Transferase
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
1ZBJA 2GBQA 4RTVA 2AZSA 1SPRA 2X3XD 4HVVA 2KYBA 2MOXA 1O4NA 3A98A 1AOTF 4EIHA 1GFCA 1BB9A 1PRMC 1HJDA 3RNJA 2JMCA 4AFQC 2ROLA 2K7AB 1BHFA 3CQTA 2FRWA 4QT7A 3M0TA 2FPEA 1X69A 3VRNA 1SSHA 1LUKA 1PICA 5IHIA 4KRTA 3M0RA 1OOTA 4RTTA 4A4CA 1MV0B 5I22A 1W6XA 1D4TA 1O4RA 3IN8A 1KC2A 1O4IA 1MV3A 1WYXA 3BUMB 2A08A 1BLJA 2EO3A 2DF6A 3ZL7C 2YUNA 1X27A 3PSKA 2GE9A 3M0SA 2OQ1A 1Z9QA 1LKLA 3WA4A 2ETZA 4F16A 2DX1A 4WWQA 2YDLA 1BHHA 1BF5A 2J06A 4FBNA 2RQUA 2MRKA 1JXOA 1B3QA 4ORZA 2CR4A 4DEXA 1UDLA 1SHBA 1YWPA 2IUIA 2K79B 4X1VA 1YVLA 1TZEE 2L6KA 1OEBA 1X6BA 2GNCA 1K4US 1IJRA 1M27A 4F17A 1AYCA 1RI9A 2CUBA 2B86A 1JU5C 2LX7A 5HKZA 5EC7A 2C9WA 2AOAA 1OPKA 4RUGA 2Y1NA 2KK6A 1QWEA 1BFIA 2V1QA 2GQIA 1CKBA 1A81A 1NG2A 2YUOA 1FYNA 4J9CA 2CI9A 2XMFA 3VGOA 4JJDA 1BBZA 1O4HA 2Y1MA 5FW9A 4GWFA 2L3PA 5KAZA 1SKJA 4U1PA 3TL0A 2CT4A 2RSYA 1T0HA 3EAZA 2ROTA 1Y0MA 1MUZA 1UUEA 1QLYA 1BKLA 1WLPB 3REAB 1F1WA 2RPNA 2LNWA 3BUNB 2JT4A 2YSQA 2W0ZA 2D8JA 2KR3A 2HMHA 2DVJA 1AD5A 2L0AA 2M0YA 4JEGA 2EBPA 4D8KA 3NHNA 2CUDA 3VS0A 1HCTB 4HCKA 2CH4W 3EG1A 2HSPA 3BUWB 1VYVA 1A08A 4L1BB 2F2VA 4OMOA 1P13A 1GRIA 2DA9A 2F2XA 4CC3A 3OP0A 1VA7A 1WXTA 1ZUYA 2JW4A 1ABOA 2NWMA 1KA6A 3OB1B 1M3BA 1JO8A 1X2KA 2J6FA 1O4CA 5FWBA 1ZLMA 3GXWA 1WQUA 1CSYA 4JPBW 1GBQA 1GCPA 2BZXA 4EIKA 4FSSA 4AFUC 2AUGA 1YCSB 4RTZA 1BFJA 2M51A 3HCKA 4OHEA 2DL7A 1X43A 2LJ1A 1M27C 2GSBA 2CDTA 3SHWA 2CSQA 5GJVB 2DRMA 3I9QA 3VS7A 1O46A 2DNUA 2DL3A 1UURA 2H5KA 2MQIA 2LJ0A 2L3QA 4LE9A 3M0QA 5CDWA 2DJQA 2JS2A 1A1BA 1LKKA 1R1PA 1OO4A 1BU1A 1I1JA 2LNHB 2HBWA 3GBQA 3VRRA 1PHTA 1O4KA 1BHHB 1SHGA 4XZ0A 1LUIA 1R1QA 2KRNA 1ZUKA 1O44A 2IUGA 2CSIA 3O5ZA 2JYQA 2AOBA 2FCIA 1KSWA 1A09A 2FRYA 2HEQA 3VS3A 2CREA 1CSKA 2FEIA 4OHLA 5GJHA 4JE4A 1A1CA 4Y92A 2H8HA 4OMPA 3HIZB 1AWWA 3VS6A 2EYVA 5HKYA 4OMQA 2AKLA 3EG2A 2EL8A 2EYZA 1UTIA 2A28A 1O4PA 3ZNIA 2FG0A 2L3TA 1GL5A 4J9HA 3OVEA 3I35A 2K3BA 2HDAA 2QDLA 2DCRA 1UFFA 2DX0A 1UECA 1O49A 1QCFA 1WX6A 2BZYA 2JTEA 1O4FA 1RQQC 4H1OA 4GLMA 3US4A 1BLKA 3U23A 4LUDA 3S8LA 4XZ1A 1K9AA 2DBMA 3GXXA 2JM8A 2RN8A 3SEMA 2L3SA 3NMZC 3UF4A 1GFDA 3R6NA 5D0JA 4E6RA 1UG1A 4AFZC 4ESRA 1OV3A 4RTWA 2HDXA 3JV3A 1AOJA 1F2FA 1I3ZA 2YSXA 1BM2A 1AWJA 1AYDA 4K44A 1NZLA 2ECZA 1RJAA 3CBLA 2O9VA 2EO6A 3BUXB 1SHFA 3MXYA 3VRZA 4ROJA 2AKKA 2PLDA 4OMNA 5GJWB 2J6OA 2W10A 5DF6A 1AWOA 3H0FA 3I5RA 2C0OA 1M61A 2IZVA 1SPSA 1WI7A 1SPKA 1AEYA 2KT8A 2EVRA 2KROA 3H0HA 4M4ZA 1G83A 1JEGA 3UATA 4R0KA 2CBLA 1AZEA 2LP5A 4X6SA 1FMKA 2OAWA 1D4WA 1GCQA 3M0PA 4OHHA 1NRVA 1PRLC 3UA6A 1KFZA 2ED1A 1YVHA 4RTYA 1D1ZA 2EYXA 2KRSA 4K45A 5IHKA 3LH5A 1JYQA 2RNAA 2KE9A 1NYFA 2EKHA 4AFSC 2D8HA 5DC9A 4F59A 3THKA 1BKMA 3OB2B 2EU0A 4JGHA 1CWEA 2KXDA 1O42A 4EY0A 4J9EA 2YUPA 3I5SA 1NEBA 1U06A 3PVLA 1O45A 4GBQA 1UHFA 1OO3A 1LUNA 1PNJA 1WA7A 2CIAA 1RLQC 2RQVA 1O4QA 5FWCA 1JQQA 1AYAA 2DBKA 2L4KA 4A4BA 2EW3A 3VROA 3PVQA 1XA6A 2VKNA 2FO0A 2Y3AB 3EG0A 1H9OA 1MW4A 3MXCA 1FHSA 2RMXA 1NLPC 1JXMA 3QWXX 2EQIA 2LQNA 1NLOC 2YT6A 1ZFPE 2PNAA 1LCJA 5I6VA 1U3OA 4JJCA 5DC4A 3N7YA 1UUSA 4NWFA 4GL9E 2V1RA 2CI8A 1AWXA 1X2QA 1Z9ZA 1NZVA 2O31A 3IQLA 3TSWA 1TCEA 1X0NA 2HCKA 1T3LA 1ZUUA 1M8MA 1O43A 1CJ1A 4U17A 3UYOA 2O9SA 2IIMA 2KRMA 2MIOA 4JZ4A 4F5AA 4LUEA 1CSZA 3N84A 4J9DA 4P9VA 1SRLA 4CC4B 5L23A 2K6DA 1MILA 1FU6A 2KXCA 4RTUA 3C7IA 4OHIA 2VVKA 1QKXA 1SRMA 1GCQC 2J6KA 1AVZC 2SEMA 5J3XA 2PNBA 1OPLA 4H34A 1PKSA 2JXBA 2DE0X 1ARKA 3ULRB 2YU7A 1YWOA 2KGTA 1UJYA 2C0IA 1I0CA 3QWYA 4J9IA 1K0SA 1O41A 2OI3A 2JM9A 2KT1A 4F5BA 2GTJA 5IXFA 1H92A 2ECDA 1UJ0A 2RVFA 3H0IA 2DLZA 3T04A 2RORA 1K1ZA 2FPDA 2D1XA 4Z89A 3GQIB 2PLEA 2JMAA 1A1AA 1Y1UA 1M3CA 2DL8A 2ESWA 2YUQA 4WCIA 1B47A 3RBBB 3M7FA 3OV1A 3KFJA 2PZ1A 1E7OA 5BO4A 2ENMA 1E6GA 2MRJA 4K11A 4LNPA 4E93A 1WFWA 3H41A 1A07A 2KYMA 2A37A 4HVUA 1WXUA 1LUMA 3BUOB 2LNXA 3VS5A 4ZNXA 1B07A 4TZIA 2EPDA 4OHDA 2O88A 1CKAA 1AYBA 4AG1C 1JYRA 2GTOA 1O4OA 2MK2A 3CD3A 1W70A 4IIOA 1N5ZA 2BBUA 1FYRA 3IMJA 3VRQA 2CT3A 1RLPC 2DM1A 1O4EA 3UA7A 2E5KA 1IS0A 1RPYA 2DMOA 1YN8A 1UHCA 1AOUF 1WXBA 1ZSGA 1QG1E 3VS2A 2K2MA 2D0NA 1X6GA 1H8KA 2LJ3A 4DGXA 1O4BA 3VS1A 2RQWA 1GBRA 3EACA 2J7IA 2EGAA 2KNBB 5GJIA 3IMDA 2OZOA 2EOBA 2EGCA 1UE9A 1W1FA 5IH2A 1BK2A 1G2BA 2LCTA 1Y57A 3PLFB 2DRKA 1O4DA 2KNOA 4FL2A 2OJ2A 1ZX6A 3PQZA 2C0TA 1HD3A 2K9GA 1QKWA 2RF0A 4AG2C 3S8NA 2JS0A 3TVTA 1YNZA 2CH4A 3NPFA 1NYGA 3S9KA 1JYUA 3C0CA 2F2WA 3EG3A 1H3HA 1NEGA 2AK5A 2CS0A 1ABQA 4E68A 2DM0A 1T3SA 2LQWA 1LCKA 2DL4A 3FJ5A 1FBVA 3EHQA 1O4JA 2RMOA 1TG0A 2J05A 2P4RA 4Z8AA 4K2RA 3EGUA 5EELA 5IXBA 1QWFA 2RQRA 4OMLA 2IUHA 2I0NA 2LZ6B 3K2MA 5IBSA 3TSZA 4CC2A 1O48A 3S8OA 2CRHA 2XP1A 4D8DA 2VWFA 1O4AA 1IO6A 2X3WD 1Z3KA 2K7AA 1AZGB 4OMMA 2BZ8A 3VS4A 3PS5A 1R1SA 2SRCA 2SHPA 3PE0A 5IBMA 1E6HA 4HVWA 5EG3B 1HCSB 2ED0A 2HDVA 1FU5A 3M0UA 5AXIA 5HKWA 1JWOA 1SEMA 3PJPA 2EYWA 4J9GA 2ABLA 1O4GA 1TUCA 2H46E 2B3OA 1UGVA 1BMBA 1M30A 1SHAA 1X6CA 2G6FX 1VYTA 2AZVA 3CWGA 2DLPA 1I07A 4RTXA 1GHUA 1TUDA 1HSQA 2DL5A 1U5SA 1KJWA 1KIKA 5DC0B 4Z88A 3MAZA 1BG1A 2L2PA 4F14A 1PWTA 5AULA 1S1NA 2EKXA 1XOVA 1M3AA 1SHDA 1A0NB 2MCNA 2DYBA 4J9FA 3TKZA 1O4LA 2PTKA 4IIMA 1PKTA 1WIEA 2K79A 2BTTA 2O2OA 1QADA 2EYYA 2LCSA 2GGRA 1YP5A 2KBTA 4DEYA 1K76A 1O47A 4A63B 2HUWA 2RQTA 4HXJA 2QMSA 3VRYA 1RUWA 1WDXA 4FL3A 4JJBA 3NGPA 2FPFA 3KFVA 1FBZA 4P9ZA 4QSYA 4DGPA 5EHPA 2DLYA 3EHRA 3HHMB 3REBB 1AB2A 2NUZA 2PNIA 5ECAA 3CXLA 3PFVA 2KEAA 1EFNA 5HCKA 3PSJA 1T0JA 5I11A 4LN2A 1O4MA 1NM7A 1KA7A 4CC7A 3IN7A 3N8MA 3BKBA 2MC1A 4J9BA 1K0XA 1J3TA 2LMJA 2A36A 4NWGA 1CWDL 5EHRA 1V1CA 1JU5A 3VRPA 1VYUA 2EGEA 4JZ3A 1A1EA 2DILA 2VIFA 5EEQA 5IHNA 4GPLB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZBJA 3C4SA 5J3BA 2X3XD 3GP8A 3A98A 1ZSZB 1YBYA 4FIBA 4AFQC 2COZA 4M7AG 1NPPA 2L3RA 3CCLT 1BHFA 5GAMe 3JB9G 3OMCA 4NOYA 5IHIA 4KRTA 3LGFA 1MV0B 1VQ4Q 1O4IA 3BUMB 1VQ4A 3X20B 2EO3A 2DF6A 3PSKA 4M7AB 1Q81U 4M78F 3M0SA 1OYXA 3CMET 3WA4A 1Y96A 3INZA 2DX1A 3CC7Q 4QVCA 1QCNA 1B3QA 4ORZA 3CC7A 4DEXA 1RAFB 3E2UA 4X1VA 1YVLA 2DYIA 3JCMV 2GNCA 1K4US 1FMWA 5CKBA 1AYCA 2WACA 4F7UF 3PTAA 5EC7A 2BKDN 2CZ7B 4RUGA 4J7IA 4MZPA 2KK6A 3PMTA 2V8IA 1NG2A 4X9CA 1FYNA 2DKGA 4C0ZA 1BBZA 3OSSC 1KD1U 3V7RA 5KAZA 2RSYA 1WHGA 3MP6A 1MUZA 1QLYA 1BKLA 2KK4A 8AT1B 3BUNB 1K73C 1G3YA 3CXCA 2HMHA 1AD5A 4JEGA 2V8JA 1D0YA 1HCTB 3RIRA 3EG1A 2HSPA 3OS0A 2GF7A 4C92G 3JCMd 3VUZA 3EFSA 1VA7A 4QQGA 1Q82U 1ZUYA 4A4GA 4M75G 1Y07A 1X2KA 5FWBA 3G4ST 3G6EQ 2FZGB 4BI3A 3G6EA 2VGNA 2E64A 1VQMQ 3VJPA 1X43A 2KMTA 4O5VA 1VQMA 2AIRB 2K2VA 5GJVB 2DRMA 1O46A 3EGXB 4E7LA 2MK5A 4C92B 2CP6A 2MQIA 3C12A 3M0QA 4E7IA 4M75B 1A1BA 1LKKA 1O75A 2LNHB 1D0ZA 2E5QA 3QYGB 4XU2A 1O4KA 1BHHB 1SHGA 2KY9A 3MEVA 1R1QA 1PD1A 2CSIA 4E7KA 2AOBA 2FCIA 2LVMA 4C8QC 1A09A 1M4ZA 1IREB 3CCQT 3VS3A 1LPLA 2COYA 4MZTA 3BE3A 4JE4A 1A1CA 3JSCA 4OMPA 2EYVA 4J7FA 4OMQA 5GANh 2GCXA 1UTIA 3ZNIA 2JUFA 2XICA 2FG0A 3CCUQ 4PK4A 1GL5A 2CP0A 3CCUA 2DX0A 2E10A 1D3BB 4A4EA 4ZGEB 2R58A 1RQQC 3U23A 1K9AA 2ZCFB 4AT1B 4RMOA 1JBMA 2X4XA 1VQ4T 3SWNB 3X26B 3PGGA 3L2UA 2HDXA 4PJNA 1BYMA 2YSXA 3OYBA 4BE2A 1AYDA 1SKUB 3CBLA 4ROJA 2O9VA 5HK0A 4C8QD 1VQ5T 3OW2A 4OMNA 1KHIA 4PJLA 2IZVA 3NTHA 2DAQA 1K73R 1ZA1B 4OVAA 3META 2ED1A 2CKKA 3HTRA 1YVHA 4K45A 3HSBA 1X6OA 3LLRA 3EG9A 3LH5A 1JYQA 4IUUA 4C5EA 3MEAA 4PFPA 3CXCP 1VQNT 2KXDA 4J83A 1KC8U 3I5SA 1RACB 1WJSA 1LUNA 1B34B 1PNJA 4A53A 1RLQC 5LJ3f 1O4QA 1X75C 2E6NA 3M9QA 3OYIA 2DBKA 4X9DA 2PVGB 5LJ5f 4A4BA 4BUGA 2Y3AB 5LJ3j 2RMXA 1NLPC 1YJWT 4PJOG 4PNOA 2ZPBB 1N9SA 3OMGA 1QW1A 1HYOA 1ZFPE 1U3OA 4FT2A 5IAYA 4B9WA 2QQAA 4M7DA 1Z9ZA 1KQSA 1M8MA 1CJ1A 2O9SA 2IIMA 3G71Q 3OYCA 4P9VA 4J9DA 3EGDB 2E1HA 4FSXA 4CC4B 3G71A 5GANe 2KXCA 1I4K1 3G6ET 3L2RA 3CD6Q 1GCQC 1AVZC 1NJIC 1PKSA 2CP5A 4C5GA 3CD6A 1ARKA 5GAMj 1I5OB 2BIVA 3BW1A 1Q7YR 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1ZBJ A;  2GBQ A;  4RTV A;  2AZS A;  1SPR A;  2X3X D;  4HVV A;  2KYB A;  2MOX A;  1O4N A;  3A98 A;  1AOT F;  4EIH A;  1GFC A;  1BB9 A;  1PRM C;  1HJD A;  3RNJ A;  2JMC A;  4AFQ C;  2ROL A;  2K7A B;  1BHF A;  3CQT A;  2FRW A;  4QT7 A;  3M0T A;  2FPE A;  1X69 A;  3VRN A;  1SSH A;  1LUK A;  1PIC A;  5IHI A;  4KRT A;  3M0R A;  1OOT A;  4RTT A;  4A4C A;  1MV0 B;  5I22 A;  1W6X A;  1D4T A;  1O4R A;  3IN8 A;  1KC2 A;  1O4I A;  1MV3 A;  1WYX A;  3BUM B;  2A08 A;  1BLJ A;  2EO3 A;  2DF6 A;  3ZL7 C;  2YUN A;  1X27 A;  3PSK A;  2GE9 A;  3M0S A;  2OQ1 A;  1Z9Q A;  1LKL A;  3WA4 A;  2ETZ A;  4F16 A;  2DX1 A;  4WWQ A;  2YDL A;  1BHH A;  1BF5 A;  2J06 A;  4FBN A;  2RQU A;  2MRK A;  1JXO A;  1B3Q A;  4ORZ A;  2CR4 A;  4DEX A;  1UDL A;  1SHB A;  1YWP A;  2IUI A;  2K79 B;  4X1V A;  1YVL A;  1TZE E;  2L6K A;  1OEB A;  1X6B A;  2GNC A;  1K4U S;  1IJR A;  1M27 A;  4F17 A;  1AYC A;  1RI9 A;  2CUB A;  2B86 A;  1JU5 C;  2LX7 A;  5HKZ A;  5EC7 A;  2C9W A;  2AOA A;  1OPK A;  4RUG A;  2Y1N A;  2KK6 A;  1QWE A;  1BFI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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