3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
source organism Mus musculus
molecule tags Transferase
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
1NZVA 4DGXA 2EYXA 1U3OA 5AXIA 3FJ5A 1CJ1A 1KJWA 2RQTA 1LCKA 1A1BA 2HMHA 2K9GA 4K11A 1CKAA 2HEQA 2HSPA 2LJ0A 2RF0A 4OMMA 1CSZA 1FYRA 2IZVA 3EAZA 1WXUA 4XZ0A 1AWXA 3GBQA 4U17A 4DEYA 1SHAA 1E7OA 3PVQA 1O4KA 1JO8A 2LP5A 2YSQA 4OMQA 1A1EA 1A81A 3WA4A 2GQIA 1FBVA 1O4NA 1JXOA 4F17A 1IO6A 4RUGA 1O4EA 1O4CA 2L3SA 3HCKA 2FPFA 3NMZC 1NEBA 3VRYA 1AZEA 3TL0A 2CDTA 2JS0A 2KRNA 4F59A 1KSWA 2DLPA 3ULRB 2FO0A 2DE0X 2H46E 3VRNA 2DL4A 2EO6A 2G6FX 3IN8A 2L6KA 2DJQA 1MV0B 2ETZA 1ZX6A 2AK5A 1YWPA 1SRLA 1R1PA 1A1AA 1NYGA 2P4RA 2CS0A 4QSYA 1R1QA 4ROJA 2DL7A 3M7FA 2EOBA 4AFUC 1NYFA 1TG0A 3ZL7C 1FU5A 5DC4A 1UFFA 2JMCA 1UURA 2KBTA 3H0FA 1W6XA 3EG0A 1AWWA 4P9VA 2DVJA 1XA6A 4F5BA 2LNXA 1J3TA 1BU1A 3BUOB 4IIOA 4F16A 3EG2A 1ZUYA 2IUIA 1RQQC 3UA7A 1O41A 2RQWA 4RTYA 4JE4A 2K6DA 4GPLB 3IMJA 1HJDA 1FMKA 1A08A 5KAZA 1VYVA 2F2VA 2J6FA 1O43A 1Z9QA 1I07A 1U06A 1SPSA 2EO3A 2GSBA 1H9OA 3M0SA 2O9VA 2JS2A 2MQIA 2CSIA 3M0TA 1YCSB 1ABOA 1B07A 2KR3A 4Z88A 2DBKA 2EQIA 4AG2C 1PRLC 2FPDA 1K0SA 4LE9A 1B3QA 2KK6A 1M8MA 3REAB 1JQQA 3EG1A 2IUHA 5DF6A 2DBMA 1NLOC 1M27A 5FWCA 1O4DA 1YVHA 2CH4W 2XP1A 3CXLA 4D8KA 2Y1MA 3PS5A 2CT3A 2AUGA 2YUPA 4J9HA 2JT4A 1WYXA 2MRJA 4OHIA 1ZUUA 2DX1A 3US4A 3VRQA 2JM8A 1H8KA 2CUBA 5GJHA 3OVEA 1WA7A 4OHEA 2D8HA 4L1BB 1SHBA 2RN8A 1PICA 4D8DA 1X2KA 3PQZA 4K2RA 1HCTB 4JJBA 1O4OA 2PZ1A 1GFCA 1SSHA 2KT1A 4K45A 1UHFA 2KXCA 5IHKA 2SRCA 1JU5A 2JYQA 4OMPA 2KXDA 2L3QA 3NGPA 1AB2A 4CC2A 3R6NA 5GJVB 3PLFB 5IXFA 2DYBA 1BM2A 2FRYA 2BTTA 3VRRA 1CSKA 3H0HA 2W0ZA 4EIKA 4P9ZA 3OB2B 1G2BA 3VS1A 1YWOA 1BHHB 2L3PA 3I5SA 1D1ZA 2CI9A 4AFSC 2SHPA 4A4CA 3TSWA 2NUZA 1OEBA 2CUDA 1FYNA 2C0TA 2BBUA 1O4JA 1OV3A 5GJIA 2EL8A 2L0AA 2K2MA 1S1NA 1RLPC 1O4HA 3ZNIA 1X27A 2LJ3A 1RLQC 4WWQA 1UJ0A 3LH5A 3PFVA 3I9QA 1BBZA 1E6GA 1GFDA 1QLYA 2O31A 2J06A 2EYYA 2DRMA 4HXJA 2RSYA 4XZ1A 3M0QA 2DL8A 2ECZA 2CRHA 2DLZA 2C0OA 1O42A 2EKXA 5EHPA 1BHHA 2MOXA 3BUXB 1RI9A 1SPKA 4K44A 2DL5A 5FWBA 5IXBA 2B86A 2PNBA 3HIZB 2AZSA 1QKWA 1UJYA 2JTEA 4HVUA 4TZIA 1OO3A 1YN8A 4E6RA 4OHHA 4Z8AA 3VS4A 2HDAA 1O47A 2QMSA 2JM9A 3KFJA 5GJWB 2ENMA 1JXMA 2EBPA 1RUWA 2GNCA 2KYBA 4QT7A 5AULA 1WLPB 1R1SA 1X43A 1IJRA 1M3AA 2O2OA 1H3HA 4JEGA 3UA6A 2VVKA 1Y57A 4J9EA 1A0NB 2RMXA 3GQIB 2D8JA 4OMOA 2CBLA 1AYBA 4EY0A 4KRTA 2KROA 5J3XA 1KA6A 5I22A 1O4RA 1ABQA 3EHQA 2AKLA 1WFWA 3VS3A 1QG1E 5DC0B 2EGEA 1Z9ZA 2IIMA 4X1VA 2LNWA 1O4FA 2GTOA 3C0CA 1VYTA 4F5AA 2J05A 1VYUA 2F2WA 2YDLA 4R0KA 5EHRA 1UGVA 1BHFA 2VIFA 1GL5A 4FBNA 2HBWA 1O4AA 1BK2A 2GBQA 2RPNA 2YUQA 2SEMA 3SHWA 4J9CA 2MK2A 2OQ1A 2EGAA 3CBLA 3RBBB 1AD5A 5EC7A 2KYMA 4E93A 4RTXA 2OI3A 1I3ZA 1EFNA 4RTTA 3SEMA 1PRMC 2DMOA 2KNBB 3U23A 2EPDA 1UE9A 1X6GA 1AYDA 3MXCA 3TKZA 1NM7A 1A1CA 1FHSA 2KNOA 2GE9A 1JYQA 1AOUF 1K9AA 2KEAA 1SRMA 2L2PA 3JV3A 1SHGA 2HCKA 1K4US 2RQVA 2DRKA 2KT8A 2RMOA 5HKWA 3IN7A 2PTKA 2EYZA 3UYOA 1YVLA 2DM0A 1I0CA 2AKKA 3EGUA 2ECDA 1PWTA 3KFVA 4JJDA 1KC2A 2HDVA 3EACA 3BUNB 1MUZA 1SHDA 1SKJA 2LCSA 2H5KA 1WX6A 4OMLA 1D4WA 2LMJA 2CSQA 2VKNA 2IUGA 1LUMA 1AOTF 2DCRA 2Y3AB 2O88A 2YUNA 3OB1B 4GWFA 1O4QA 3VS2A 2ROLA 1UHCA 1O4MA 2RORA 4X6SA 1OOTA 2LJ1A 4RTWA 4WCIA 4HVWA 2K79B 4JZ3A 1KFZA 1LUIA 3VS0A 3N7YA 2EVRA 1ZSGA 1N5ZA 2X3WD 1LUNA 1WI7A 4JJCA 1NLPC 2K3BA 1M27C 3VS5A 2KRSA 1OO4A 1YNZA 1KIKA 4OHLA 1Z3KA 4LUEA 2RQRA 4NWGA 2DL3A 2ED1A 3EHRA 4AFZC 4HCKA 1PKTA 3PVLA 4M4ZA 4RTUA 3M0RA 2EW3A 1GCQA 2HDXA 2MCNA 3REBB 1K1ZA 1PHTA 2AZVA 3PE0A 2K79A 3CD3A 4GBQA 2B3OA 3H0IA 3MAZA 3PJPA 4Z89A 3GXXA 1O4LA 3VGOA 2Y1NA 1GCPA 2V1QA 4Y92A 1JU5C 2A08A 2CH4A 4LNPA 1SPRA 2EKHA 2ED0A 2FEIA 2D1XA 1WQUA 2LCTA 1AVZC 1X2QA 2EU0A 3A98A 3GXWA 2ABLA 5CDWA 1NZLA 4DGPA 1ZUKA 1W70A 2DF6A 1O4BA 1HSQA 1H92A 1P13A 2OJ2A 4J9GA 1BF5A 1BKMA 1BLKA 4AFQC 5I6VA 2KGTA 3BKBA 1CWDL 1PKSA 2OAWA 4RTVA 2YU7A 3PSJA 4OHDA 2VWFA 1CKBA 1O44A 4H34A 2A28A 1O4PA 3UF4A 3VRZA 2FPEA 4CC7A 2MIOA 1ARKA 1HD3A 2RNAA 3I5RA 1T3SA 3M0PA 2AOBA 1UUSA 1U5SA 4A63B 3N84A 2CREA 1M3BA 1F1WA 3K2MA 1O4GA 1UTIA 1BLJA 2CT4A 3S8OA 1G83A 4LUDA 2X3XD 3N8MA 4RTZA 1CWEA 2YUOA 2LQNA 2C0IA 1JYUA 1D4TA 1TCEA 1BFJA 1M61A 5IHIA 1O4IA 1X0NA 5EELA 1I1JA 2NWMA 3IQLA 1O48A 1X6CA 2EYWA 1SHFA 1ZLMA 4AG1C 1T3LA 1RPYA 2EYVA 1T0JA 1Y0MA 2BZ8A 3IMDA 5D0JA 5IHNA 3M0UA 1MW4A 2CR4A 4J9DA 3O5ZA 1O45A 4GL9E 1E6HA 1BG1A 2AOAA 1QKXA 4CC3A 1X69A 2DX0A 2MRKA 2GTJA 2EGCA 2PNAA 2LZ6B 1M30A 1MILA 5DC9A 3THKA 1ZFPE 1W1FA 2DLYA 5HKZA 4J9FA 4JPBW 2O9SA 4GLMA 2DILA 1OPLA 2JXBA 3NHNA 3VS7A 2C9WA 1GBRA 2FCIA 1K0XA 3S8NA 1AZGB 1ZBJA 4JZ4A 5HKYA 2H8HA 1NRVA 1NEGA 2V1RA 3QWYA 2DM1A 3TVTA 2DNUA 1HCSB 1TUCA 2ROTA 1JWOA 1TUDA 1LKKA 4IIMA 1WXBA 3NPFA 4CC4B 3BUMB 2JMAA 3QWXX 1QWFA 2K7AB 2PLDA 3VRPA 4FSSA 3MXYA 3EG3A 1KA7A 1RJAA 2FRWA 3UATA 2L3TA 4DEXA 3VROA 3OV1A 1A09A 1UECA 1UG1A 1VA7A 1LKLA 5I11A 2CI8A 3BUWB 4A4BA 1UDLA 2I0NA 2PNIA 3TSZA 1B47A 1OPKA 1BKLA 5HCKA 2YSXA 2J6KA 2JW4A 1X6BA 4ESRA 2XMFA 2GGRA 2L4KA 3T04A 1GHUA 1SEMA 4J9IA 2K7AA 1GBQA 5FW9A 2RVFA 2CIAA 3HHMB 1YP5A 2LQWA 2OZOA 4ORZA 2HUWA 5EG3B 1A07A 3CQTA 1TZEE 4H1OA 4JGHA 1MV3A 2KRMA 3RNJA 1IS0A 1BFIA 2LNHB 3CWGA 2PLEA 1WIEA 2A37A 1QCFA 2BZXA 1WDXA 2DA9A 1PNJA 4FL3A 4FL2A 2M0YA 1T0HA 1LUKA 4J9BA 2W10A 4LN2A 5IH2A 1FU6A 1QADA 3S8LA 4E68A 1GCQC 4HVVA 1CSYA 2YT6A 4U1PA 1M3CA 2M51A 1BB9A 1FBZA 2MC1A 1AWJA 3H41A 1BMBA 1NG2A 1XOVA 2J7IA 1GRIA 4EIHA 1QWEA 5EEQA 5ECAA 1O46A 2QDLA 5IBMA 5L23A 1UUEA 5IBSA 1WXTA 1AEYA 2ESWA 2D0NA 2F2XA 1LCJA 2J6OA 2RQUA 4NWFA 1AYAA 3I35A 4ZNXA 1K76A 4OMNA 1AWOA 1O49A 2KE9A 1AYCA 3PSKA 2FG0A 1JYRA 3S9KA 1JEGA 1Y1UA 2A36A 5BO4A 1AOJA 2E5KA 4F14A 1F2FA 3VS6A 3C7IA 3OP0A 1V1CA 2LX7A 2BZYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M7AF 1NZVA 4DGXA 2QDYB 1KJWA 2RQTA 4M7AD 2GF7A 1A1BA 5KYUA 1IREB 3OYNA 4M77D 3LWHA 1CKAA 2HEQA 2RF0A 4OMMA 8ATCB 2DIQA 3EAZA 2KGYA 4XZ0A 4II1A 5J26A 2QAZA 3PVQA 3WA4A 2LP5A 2GQIA 1FBVA 2MWPA 3HRSA 4L6V5 4RUGA 2L3SA 2K4YA 4LDWA 2XDBA 3QSUA 3BW1A 1RABB 4C8QF 4M75F 1WJQA 4M7AA 4PJOE 2NYSA 3ULRB 3VRNA 1IHWA 2DD4A 2DL4A 3QYHB 2M9UA 2L6KA 2HSEB 2FB7A 2QXFA 1SRLA 4EPCA 1A1AA 4KGVB 3CC4A 4QSYA 1RL2A 2EJFA 2QTXA 3ZL7C 1YI2A 2OTJA 2G3RA 2JTMA 4C0ZA 4M75A 1M2OA 1MMGA 3GNGA 1SF9A 2DVJA 1XA6A 4F5BA 4J7IA 3BUOB 1BU1A 1ZUYA 5DLQE 2VV5A 2VASA 1U1TA 4RTYA 1UGRB 2K6DA 5KAZA 2F2VA 4XTWA 3SD4A 4J7FA 9ATCB 2EO3A 3CCEQ 1G3SA 2BIVA 1YIJT 2QI2A 3M0SA 5M9OA 3SWNC 1JJ2A 1UGQB 2HQXA 1ABOA 2KR3A 4Z88A 2EQIA 4QQGA 2Y90A 3HSBA 2PUOB 2FPDA 3E1SA 2MK5A 2KK6A 1B3QA 2JNGA 1WQWA 1JQQA 3ER0A 2KK4A 5GMKm 2EWNA 5LJ5g 2XP1A 2E6NA 2Y1MA 1VQNQ 2YUPA 2HKQB 4OHIA 3VRQA 1H8KA 4KULA 1WA7A 4OHEA 3Q1JA 3KUFA 2RN8A 2DXBA 1YJNQ 1N6AA 1HCTB 1K8AC 1X75C 1GFCA 1SSHA 4K45A 3A8HB 1IZ6A 2L3QA 2JTFA 1AB2A 3FIFA 3HFNA 3PLFB 1BM2A 1VQ6A 3HPWA 2OAUA 3OW2A 4OP0A 4RCCA 4P9ZA 3OB2B 1G2BA 1YWOA 1BHHB 2DXTA 5KYXA 4F7UG 4A4CA 3PFSA 2QK0A 2BBUA 1OV3A 2JUFA 2EL8A 2L0AA 1ZA2B 1O4HA 5D6XA 2R5MA 3ZNIA 1X27A 2LJ3A 2ZPBB 4OF1A 4ZTJA 1VQ9Q 2DRMA 2RSYA 1QW1A 5EHPA 2DLZA 1O42A 1NZ9A 5CKEA 3G71Q 1ACMB 2PNBA 3LLRA 3HIZB 4M78G 4BDYA 4HVUA 4TZIA 2NUPB 3L2VA 4E6RA 4OHHA 4Z8AA 3F70A 3VS4A 2HDAA 1O47A 1UB4A 1RUWA 2KYBA 1X43A 2XHCA 1H3HA 1Y57A 4J9EA 2EJ9A 2D8JA 4OMOA 1G3TA 4EY0A 1QP3A 4KRTA 5J3XA 1ABQA 5DC0B 2EGEA 1K73R 2GTOA 1VYUA 3QZ5B 5KYWA 4N4HA 4IUUA 2FYKA 4C5IA 3GPLA 2MK2A 3N5BB 4J9CA 3CBLA 3CC4T 4JDSA 3CC7Q 3V7SA 5EC7A 2OI3A 1YI2T 2EQKA 2OTJT 2HMAA 4RTTA 2A0FB 5LJ5e 1VQ4Q 3QPHA 4C92F 3MXCA 1UE9A 2RI5A 1NM7A 4EMKB 1A1CA 3JAME 1X01A 5IT9E 1K4US 2DJZA 2DRKA 3IN7A 5LJ5h 3EGUA 4M7DB 2COWA 5GANg 1SKJA 4M78C 4J83A 1WX6A 2PVDB 5AYFA 1MNDA 2IUGA 2DCRA 1X6OA 2DXUA 2CGHA 4PJJA 4RCBA 1OQKA 1VQLA 4C5EA 2DAQA 3UDCA 1OU8A 1PG5B 1LUIA 3VS0A 3N7YA 1VQPQ 1BKBA 2I2LA 4A53A 1Y96A 5GMKj 1KIKA 2IPOB 1K73U 2NLUA 1LJOA 3G7ZA 3OBWA 2LRAA 4HCKA 3PVLA 3RKYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1NZV A;  4DGX A;  2EYX A;  1U3O A;  5AXI A;  3FJ5 A;  1CJ1 A;  1KJW A;  2RQT A;  1LCK A;  1A1B A;  2HMH A;  2K9G A;  4K11 A;  1CKA A;  2HEQ A;  2HSP A;  2LJ0 A;  2RF0 A;  4OMM A;  1CSZ A;  1FYR A;  2IZV A;  3EAZ A;  1WXU A;  4XZ0 A;  1AWX A;  3GBQ A;  4U17 A;  4DEY A;  1SHA A;  1E7O A;  3PVQ A;  1O4K A;  1JO8 A;  2LP5 A;  2YSQ A;  4OMQ A;  1A1E A;  1A81 A;  3WA4 A;  2GQI A;  1FBV A;  1O4N A;  1JXO A;  4F17 A;  1IO6 A;  4RUG A;  1O4E A;  1O4C A;  2L3S A;  3HCK A;  2FPF A;  3NMZ C;  1NEB A;  3VRY A;  1AZE A;  3TL0 A;  2CDT A;  2JS0 A;  2KRN A;  4F59 A;  1KSW A;  2DLP A;  3ULR B;  2FO0 A;  2DE0 X;  2H46 E;  3VRN A;  2DL4 A;  2EO6 A;  2G6F X;  3IN8 A;  2L6K A;  2DJQ A;  1MV0 B;  2ETZ A;  1ZX6 A;  2AK5 A;  1YWP A;  1SRL A;  1R1P A;  1A1A A;  1NYG A;  2P4R A;  2CS0 A;  4QSY A;  1R1Q A;  4ROJ A;  2DL7 A;  3M7F A;  2EOB A;  4AFU C;  1NYF A;  1TG0 A;  3ZL7 C;  1FU5 A;  5DC4 A;  1UFF A;  2JMC A;  1UUR A;  2KBT A;  3H0F A;  1W6X A;  3EG0 A;  1AWW A;  4P9V A;  2DVJ A;  1XA6 A;  4F5B A;  2LNX A;  1J3T A; 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