3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Transferase
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
2DE0X 1WXUA 2B86A 1SHDA 2PNAA 4LUDA 4J9HA 3ZL7C 1U3OA 1LUKA 2A28A 1P13A 1YVHA 2C0TA 1W70A 2J6FA 3UA6A 3HHMB 1MW4A 1PRMC 4RUGA 3VRQA 2CUBA 4ESRA 2MK2A 3PSKA 2L3SA 1XOVA 1Z9QA 2RNAA 4LNPA 1SKJA 3PLFB 1QLYA 2DA9A 1SSHA 3EG1A 2CIAA 1PNJA 2VVKA 2YDLA 2KR3A 4F16A 1BFJA 3CXLA 4CC4B 2CT4A 1SHBA 1O4BA 4OMOA 1RUWA 4RTZA 2EPDA 1T0HA 2A08A 3N8MA 2RQVA 3PVQA 1NLPC 5FW9A 4KRTA 1K0SA 1I1JA 5EEQA 5GJWB 4JJDA 2BBUA 3PS5A 2HEQA 3RNJA 2M51A 4JJCA 1NEGA 1NRVA 5DC9A 3MXCA 2KRMA 2HSPA 2V1QA 2MRJA 1NYGA 2FRYA 3NPFA 3THKA 2K2MA 1EFNA 1N5ZA 1J3TA 5I6VA 4H1OA 1RJAA 3GBQA 2JS0A 1RI9A 2OJ2A 5GJIA 1O4KA 2IUGA 2F2VA 3VS3A 1UJYA 1QKXA 2KXDA 1BM2A 1LCJA 1X27A 2EBPA 4JGHA 2LQNA 3A98A 5I22A 1KJWA 5AXIA 1LUIA 3IMJA 1BU1A 3TSWA 1A1AA 3PFVA 2GNCA 1TUCA 1HD3A 1PRLC 2EYWA 3SHWA 3NMZC 1I07A 4AFUC 1A1CA 4DGXA 4GPLB 1KIKA 2O88A 3REAB 1WQUA 4K44A 4E93A 1K76A 2MIOA 1UFFA 4GBQA 2DL4A 3BUWB 1JQQA 2IUIA 1XA6A 1WFWA 3OV1A 2GTOA 5I11A 4F14A 1IJRA 2FO0A 1KC2A 1HCTB 4Y92A 4X1VA 1M27A 4AG1C 5J3XA 3UF4A 5EELA 3EAZA 1AZEA 4U1PA 1HCSB 1BFIA 1JYQA 2DL5A 1BHHB 1LUNA 2O2OA 3S8NA 4DGPA 5IXFA 4Z8AA 1E7OA 1H92A 2PNIA 5EG3B 4JZ3A 2K79B 4X6SA 2L6KA 1U06A 1WX6A 1YVLA 5D0JA 2YUQA 1WIEA 3JV3A 5CDWA 3S8LA 4H34A 2GSBA 2M0YA 3M0SA 3EACA 1AWJA 2YU7A 2L3QA 3LH5A 1F2FA 3GXXA 3K2MA 2FPFA 3M0QA 2ROLA 3QWXX 1O4IA 5BO4A 1B3QA 1NZLA 1H3HA 3VRPA 1A0NB 3VGOA 2CI8A 1NM7A 3UATA 3VROA 4WCIA 2ED1A 1WI7A 2DL3A 4FBNA 5HKYA 1MV3A 1D4TA 2CT3A 2QDLA 2YT6A 2KGTA 3EG2A 4L1BB 3O5ZA 1LCKA 2EYVA 1AEYA 1VA7A 2CUDA 1OV3A 1SRMA 3TKZA 1R1PA 2DRKA 1O46A 2EKHA 1PWTA 1ARKA 1OO4A 2KNOA 3IN7A 2DBKA 2XMFA 1Y0MA 1AWOA 3PJPA 4JE4A 1R1SA 1OEBA 3HIZB 1VYUA 1UJ0A 3U23A 1A81A 4RTVA 1WA7A 1O48A 1AZGB 1JEGA 2LNHB 1JO8A 3PSJA 2AK5A 4HCKA 2EGCA 1O4JA 3OVEA 2J06A 3C7IA 4HVVA 2J6OA 1LUMA 3N7YA 1Z3KA 1ZLMA 2JTEA 1SEMA 4QT7A 5EC7A 2EO3A 2F2XA 2RMXA 2LCTA 2EYZA 2DF6A 2YUNA 2KRNA 1FBVA 5IH2A 2HDXA 2KEAA 4D8DA 1BLJA 1FU6A 4JJBA 2RQUA 2XP1A 2ROTA 2RQWA 2LCSA 1O49A 4OMMA 1UTIA 4NWFA 2IIMA 1LKLA 2X3XD 2JMCA 2CR4A 1O42A 4OHHA 4A63B 3VRYA 1GBRA 1TCEA 1M61A 4M4ZA 2C0OA 1O47A 2H8HA 1YWOA 2KT8A 3S8OA 1ZFPE 1R1QA 1WXTA 1M3CA 1MILA 2Y1MA 1M8MA 1UDLA 1O43A 2AOAA 1O4LA 2HBWA 3MXYA 2L2PA 2SRCA 1M30A 1HJDA 1JYUA 4XZ0A 2CREA 1SPRA 1ABOA 4CC2A 3PQZA 1M3BA 1X69A 2FRWA 1BG1A 4EIKA 1X2KA 1UGVA 2GTJA 2F2WA 2DCRA 1WYXA 2EU0A 1ZUKA 1G83A 3TVTA 1G2BA 1AOUF 4OHEA 1AYDA 2RQRA 1AOJA 2EKXA 2JT4A 4RTYA 5L23A 2DVJA 2DL7A 1QWEA 2NWMA 1M27C 5GJVB 2JYQA 1O4QA 4JZ4A 1S1NA 3US4A 1AYCA 1FBZA 1BBZA 1O4NA 4P9ZA 2A36A 1GL5A 1D1ZA 1QKWA 2VIFA 1B07A 1JU5A 3FJ5A 1M3AA 4J9EA 4OMNA 2MCNA 1KA7A 1O44A 3KFVA 1RQQC 2HMHA 5DC4A 1VYVA 3VS6A 2FPDA 4EIHA 1CJ1A 2DMOA 2K3BA 2ESWA 1IS0A 2LX7A 1AB2A 2GGRA 1FU5A 2HDVA 1NG2A 1BLKA 1A1BA 1E6HA 2K7AB 3IQLA 3I5SA 1X6GA 5IXBA 2PTKA 3EG0A 4RTWA 3C0CA 4HVUA 2DJQA 3GXWA 2DL8A 1O4HA 4AFSC 1QG1E 2C9WA 5FWBA 2L0AA 2MOXA 1Y1UA 4U17A 3PE0A 1O4CA 3IN8A 1O45A 1CSZA 2D1XA 3VS7A 2KT1A 1TG0A 2SEMA 2X3WD 5FWCA 1OPKA 1O4EA 3BUOB 2J6KA 2EYYA 2C0IA 2AUGA 4F59A 2DYBA 4CC3A 1B47A 2BTTA 1LKKA 5GJHA 1GCPA 2RORA 4RTTA 4GWFA 2YSQA 1BHFA 2LP5A 1W6XA 1A08A 4NWGA 1RLPC 1UECA 2RN8A 1FYRA 1JYRA 1A1EA 2RPNA 3EG3A 3CBLA 2G6FX 3M0PA 1A09A 1MUZA 1K1ZA 2EQIA 4XZ1A 2EYXA 2W10A 3SEMA 4DEYA 1V1CA 1BMBA 1OO3A 2CSIA 2YUOA 2LNXA 2AZSA 2CI9A 2OZOA 2DILA 4J9IA 2V1RA 1K9AA 2BZ8A 2YSXA 2GBQA 4J9GA 5ECAA 1O41A 1FMKA 1X43A 1UUEA 2RMOA 2JW4A 4OHDA 4JEGA 4OHIA 1YWPA 4OMQA 1SPSA 2D8HA 1UUSA 3VS1A 1YCSB 4R0KA 1CWEA 1AWWA 2AOBA 2CBLA 3IMDA 1ABQA 1Z9ZA 2D8JA 4AFZC 2AKLA 3GQIB 5DF6A 1O4DA 1T0JA 5EHRA 3KFJA 1SHGA 1X2QA 2EVRA 1RLQC 2PZ1A 3ULRB 2ECZA 1YN8A 3REBB 2H5KA 1O4RA 2HDAA 3VRRA 2CH4W 3H0FA 1KA6A 5EHPA 1AYAA 2FEIA 2J7IA 1AOTF 2O9VA 1QADA 1UHFA 2DLZA 2H46E 4TZIA 3BKBA 1ZUUA 4A4BA 1UURA 1FYNA 1GFCA 3BUXB 4CC7A 2CRHA 3HCKA 4OHLA 1WDXA 4WWQA 2ABLA 1AVZC 1NEBA 1IO6A 1MV0B 2O31A 1AWXA 5HCKA 1GCQA 3RBBB 1JXOA 2GE9A 1BKLA 2BZXA 3H0IA 1NZVA 2K7AA 4QSYA 1T3LA 2DNUA 2EGEA 4J9CA 4LE9A 4P9VA 2EW3A 4IIMA 1TZEE 3UYOA 1GRIA 1H8KA 2QMSA 2KYBA 1W1FA 4E6RA 1O4FA 2CDTA 1GBQA 1JU5C 4RTUA 3OP0A 4JPBW 1E6GA 3EHQA 1BHHA 1VYTA 2L3TA 2MQIA 2PNBA 2LJ1A 2LZ6B 2KRSA 2LJ3A 2EL8A 2L3PA 2K79A 2DLPA 2DRMA 3R6NA 3VS2A 3TL0A 4E68A 2EOBA 2KNBB 1CSKA 2FCIA 3T04A 1PHTA 3EHRA 3VS0A 1NYFA 3CWGA 3OB1B 1HSQA 2RQTA 1BF5A 2ED0A 1GHUA 4Z89A 1U5SA 3N84A 1SHFA 1O4OA 2EO6A 5KAZA 4FSSA 1O4AA 2IUHA 2EGAA 1JXMA 2JMAA 1KFZA 3H41A 4IIOA 4LN2A 3BUMB 1D4WA 1OOTA 1JWOA 5HKWA 3WA4A 1BK2A 2KBTA 2LJ0A 2ECDA 1OPLA 1KSWA 2VKNA 1BB9A 3CD3A 2OAWA 4HVWA 2K9GA 1X0NA 2RF0A 3S9KA 4F17A 1O4GA 3I9QA 4ROJA 3BUNB 5DC0B 2NUZA 2LNWA 2LQWA 1CKAA 1Y57A 1SPKA 4J9DA 3CQTA 1CWDL 2DBMA 3NHNA 1O4PA 1A07A 3MAZA 2DM1A 3QWYA 3M0UA 2KK6A 2P4RA 2JM8A 1I0CA 1ZSGA 4DEXA 1UG1A 1YP5A 4RTXA 2B3OA 1X6CA 1WXBA 3I5RA 2DX1A 2I0NA 1FHSA 2HUWA 2PLEA 2Y1NA 3M0RA 1AD5A 1WLPB 4J9FA 2YUPA 1PKSA 1I3ZA 4FL2A 4F5BA 1UE9A 1ZUYA 2HCKA 4OMLA 4ORZA 4K2RA 1RPYA 2Y3AB 4EY0A 1TUDA 2K6DA 4ZNXA 2IZVA 2JM9A 5IHKA 3M7FA 4J9BA 4GLMA 4AG2C 1GFDA 5IBMA 2JXBA 4HXJA 1BKMA 1CKBA 1YNZA 2E5KA 3VS5A 1T3SA 2KYMA 2BZYA 4FL3A 2D0NA 2KROA 1PKTA 4Z88A 4A4CA 2KE9A 2SHPA 2L4KA 1ZX6A 2OI3A 2J05A 1K4US 4F5AA 2W0ZA 2FPEA 1X6BA 2ETZA 2KXCA 3VRZA 2MC1A 2O9SA 3ZNIA 4K45A 1PICA 1SRLA 3UA7A 2CS0A 2DX0A 2ENMA 1UHCA 2FG0A 1AYBA 5IHNA 2PLDA 1F1WA 3VRNA 2JS2A 3M0TA 2CH4A 3H0HA 2A37A 3OB2B 2GQIA 4D8KA 3NGPA 1GCQC 1NLOC 1O4MA 1CSYA 2RSYA 2DLYA 2MRKA 2RVFA 4LUEA 1SHAA 3TSZA 3VS4A 5IHIA 2VWFA 5AULA 2LMJA 3EGUA 1H9OA 1QCFA 2CSQA 5HKZA 4AFQC 1QWFA 3I35A 3PVLA 5IBSA 4OMPA 1ZBJA 2AZVA 1K0XA 2OQ1A 2AKKA 4GL9E 2DM0A 4K11A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B86A 2OTLT 2DZ9A 4LUDA 4J9HA 3ZL7C 3HRUA 3E2UA 3JRZA 2M0OA 3TCJA 1VQ5Q 3C94A 1MW4A 3ER0A 3CCEQ 3VRQA 1G3YA 5J39A 2K3XA 2XU8A 3PSKA 1RACB 1XOVA 1OULA 2OTJQ 3S3NA 3MP6A 5CIUA 4C0FA 4BB7A 3PMTA 2KR3A 2RK1A 1Q81C 1BI3A 3OW2P 2CT4A 4OB1B 1M5Q1 3RUXA 1MNDA 4RTZA 4M7DG 2A08A 1MHNA 2QTVA 3X26B 4F04B 1N9RA 4OGCA 1AHJB 4J6WA 4M77E 5FU6C 1M9SA 3TEEA 3PS5A 5C6SA 1LNXA 2M51A 4JJCA 3CCQA 2C06A 5DC9A 1K9MR 1R77A 4E7SA 1M8VA 5CK9A 5D6WA 1NYGA 3NPFA 1VQ8Q 5I6VA 1Q81U 2COWA 3H6ZA 4BE1A 2F2VA 4M7DA 2RHXA 2NUPB 4GLKA 5CKFA 2EBPA 3EGDA 1D1CA 4PJLA 3IMJA 4FIBA 3PFVA 1PRLC 3M54A 1KIKA 2O88A 4K44A 1K76A 2DL4A 4M78B 3OSSC 1MMGA 2IUIA 4L5GA 1IJRA 2FO0A 4Y92A 4PLIA 4DQ2A 2CYZB 1M27A 5LJ3d 4U1PA 1BFIA 1Q7YC 2JNGA 1Q86R 2O2OA 3S8NA 2FZKB 4JJNK 2PNIA 5EG3B 4JZ3A 4X6SA 1KC8R 3OYCA 1YI2Q 3EACA 3CCUQ 2YU7A 2L3QA 1F2FA 3OSVA 3VRPA 2CI8A 1NM7A 3UATA 4FYYB 1D09B 1C6VX 2RHYA 3V8JA 2XHCA 3FIFA 2DL3A 2CZ7B 2KGTA 3O5ZA 1FWZA 1Q7YU 1VA7A 4VUBA 2BE7D 3VUBA 1R1PA 3OMCA 2DERA 2EKHA 1PWTA 1OO4A 2XMFA 3D7SB 4JE4A 1AWOA 2IPOB 1VYUA 1A81A 1WA7A 1AZGB 2AK5A 3HRSA 2COYA 1O4JA 4HVVA 2QYZA 2J6OA 4M75A 3UWNA 1LUMA 2JTEA 8AT1B 2EO3A 1TTHB 4FCYA 3G6EQ 2EYZA 2KRNA 5IH2A 1B7TA 4M7AE 2KEAA 3WXMB 1BLJA 1U1SA 3QBYA 4HT8A 7AT1B 2V8KA 2PU9B 1WGSA 3M56A 3RKYA 3VYGA 2E65A 4A63B 4C8QD 4OHHA 1TCEA 4C0ZA 3GP8A 1M3CA 1M8MA 1O43A 3HTRA 2AOAA 3MXYA 3T9NA 1M30A 4XZ0A 3AT1B 2L5QA 4CC2A 4N0AA 5D6YA 2E5QA 2AHJB 3TU4K 2FRWA 1X2KA 1UGVA 2ZPGB 2ZPEB 2XIDA 1YITQ 2DCRA 1WYXA 2A3LA 1ZUKA 1G83A 2CZ6B 1G2BA 3SB2A 1AOUF 2YRCA 4XQ3A 1BKBA 4RTYA 5L23A 1D1AA 2BUDA 2JUFA 3PT9A 5GJVB 3CCLT 4JZ4A 4C8QC 1UEBA 3MP1A 4P9ZA 3L42A 2A36A 2DVEA 1JU5A 3EAEA 5I21A 2XG8D 2HMHA 1VYVA 2L89A 1VQ7A 2FPDA 1CJ1A 2K3BA 2ESWA 5LL6S 4HCZA 1QVFA 1VQ7T 1E6HA 5IXBA 3ZFJA 4OB3B 3NTIA 1HYOA 2XDPA 3OYEA 2HL5C 2DJQA 1UB4A 4PJMA 4AFSC 1QG1E 2C9WA 3L2WA 3CD6Q 5GAMh 4U17A 2R58A 2DXCA 2KT1A 2X3WD 2AT1B 1O4EA 3BUOB 2J6KA 2EYYA 4M77G 3RDVA 2AUGA 2DYBA 2ZCFB 1XQHA 3P8BB 5GJHA 4ZGDB 3PGGA 2RORA 3CCQQ 2V26A 4GWFA 1VQ4Q 3WVDB 2YSQA 1BHFA 2LP5A 5CKDA 1A08A 2LNVA 1BIBA 1A1EA 3CBLA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DE0 X;  1WXU A;  2B86 A;  1SHD A;  2PNA A;  4LUD A;  4J9H A;  3ZL7 C;  1U3O A;  1LUK A;  2A28 A;  1P13 A;  1YVH A;  2C0T A;  1W70 A;  2J6F A;  3UA6 A;  3HHM B;  1MW4 A;  1PRM C;  4RUG A;  3VRQ A;  2CUB A;  4ESR A;  2MK2 A;  3PSK A;  2L3S A;  1XOV A;  1Z9Q A;  2RNA A;  4LNP A;  1SKJ A;  3PLF B;  1QLY A;  2DA9 A;  1SSH A;  3EG1 A;  2CIA A;  1PNJ A;  2VVK A;  2YDL A;  2KR3 A;  4F16 A;  1BFJ A;  3CXL A;  4CC4 B;  2CT4 A;  1SHB A;  1O4B A;  4OMO A;  1RUW A;  4RTZ A;  2EPD A;  1T0H A;  2A08 A;  3N8M A;  2RQV A;  3PVQ A;  1NLP C;  5FW9 A;  4KRT A;  1K0S A;  1I1J A;  5EEQ A;  5GJW B;  4JJD A;  2BBU A;  3PS5 A;  2HEQ A;  3RNJ A;  2M51 A;  4JJC A;  1NEG A;  1NRV A;  5DC9 A;  3MXC A;  2KRM A;  2HSP A;  2V1Q A;  2MRJ A;  1NYG A;  2FRY A;  3NPF A;  3THK A;  2K2M A;  1EFN A;  1N5Z A;  1J3T A;  5I6V A;  4H1O A;  1RJA A;  3GBQ A;  2JS0 A;  1RI9 A;  2OJ2 A;  5GJI A;  1O4K A;  2IUG A;  2F2V A;  3VS3 A;  1UJY A;  1QKX A;  2KXD A;  1BM2 A;  1LCJ A;  1X27 A;  2EBP A;  4JGH A;  2LQN A;  3A98 A;  5I22 A;  1KJW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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