3ULEA

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869 and atp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
415
structure length
400
Chain Sequence
b'AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP
rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 400
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3uleA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3uleA04
5I9EB 4MO4A 4EHTA 2PBDA 2ZGYA 4H0PA 4BRIA 3F9MA 1ZC6A 5AZIA 4FSVA 3HZ6A 3CJ7A 2YJEA 3W3DA 1R59O 2YCHA 4WQ5A 3G25A 1NGHA 2GUPA 5EY4A 4CZMA 1KAZA 5FPNA 5AQOA 2CGKA 3A8YA 4CZHA 3GE1A 3CJ1A 3R6MA 1MWKA 4BR7A 3VENA 3FZFA 2ASPA 4HWIA 5AR0A 3IDHA 4JD2B 4BG8A 2ZGZA 1BA0A 1E4GT 2ZF5O 5AQVA 3ENOA 5EOYA 1NGDA 4K42A 4M7YA 4BC5A 3CJ9A 3MN7A 4JD2A 3WQUA 2AP1A 4K41A 3WXKA 1MA9B 2FSKA 4RCHA 5AQZA 1ESVA 3UE5A 4BRLA 5BR9A 2Q31A 3W0LA 3VESA 1HX1A 3SMSA 2FLOA 3DXMB 4BG9A 2IIRA 3I8BA 3KZBA 4H0TB 5AFUA 3GOIA 4QS8A 3VEZA 4H5TA 3VOVA 4DQ8A 1HJOA 4IXCA 4JHDA 4JN4A 4BR0A 1NGFA 3DXMA 3KVGA 1BWFO 4BC4A 4H0YB 2CH5A 4BRHA 2F9WA 2IVPA 4ISEA 5AQNA 1GLAG 1ZXOA 1NGJA 5ELZA 3ENHA 1C0FA 3VPZA 3VGLA 2P9NB 4H5NA 4NB4A 4I6MB 2D0PA 1EQYA 3DWLA 3HTVA 2YI1A 1OKJA 1QQOA 1YXQA 2HOEA 4BRFA 3QDKA 2QWNA 4I6MA 1T44A 3D2FA 3SK3A 1U6ZA 2IVNA 4EHUA 3H45C 1XQSC 2Q36A 3CQXA 1NM1A 4CI6A 2V52B 5BN8A 2P9UB 2W40A 3IFRA 3UKRB 3O8MA 2QWOA 5EXWA 2P9SB 3O1WA 1LCUA 2P9UA 3UKRA 3O80A 1E4FT 2E8AA 2H3GX 4BVOA 2CGLA 1IG8A 1NGAA 3ZX2A 4BRDA 1GLEG 1K8KB 3SLCA 5AQQA 3ATUA 4YDUA 4B1YB 4ISGA 2V7YA 2P9LB 2P9PB 2QXLA 3O1BA 1XC3A 3U8XA 2FXUA 1DGKN 1GLJO 4JNEA 4CZGA 1Q18A 3VEOA 2P9PA 4WQ5C 4FWOA 3CERA 4FPAA 4BRNA 3TPQA 4CD1A 4M63C 4CZIA 3FZKA 1RFQA 1KXPA 2E20A 3CJAA 5AFUH 2NRHA 5KQDA 3B8AX 4F9OA 4FWPA 3CJBA 1NGGA 4BGBA 4BRAA 1SZ2A 1Y64A 4H5WA 1WUAA 3M1FA 4CZKA 4IO8A 2GTDA 3MCPA 5AZIB 5AZJA 3CJCA 4BREA 2D0OA 1HKCA 3JS6A 4XH1A 2V51B 3LDPA 3D2EB 2YJFA 4IJNA 4FO0A 4AM7A 4BRGA 4CZFA 5LY3A 5AQJA 1ZBSA 1GLCG 4H5VA 4IWVA 4BGAA 3VEYA 3D2EA 4O5FA 5AQUA 2QWPA 1GLFO 4BC2A 4C23A 4MLEA 3MK6A 3ZETB 1BUPA 5BPMA 3D7EO 5JLFA 3CETA 1T6CA 3ZX3A 3ZETA 5AQXA 5BRDA 2NLXA 3H46O 2E1YA 1BOTO 4A2BA 1GLDG 2ASOA 4BRPA 1SQKA 1QZ5A 3QBWA 1X3NA 2D4WA 4K43A 5AQSA 3WXLA 3A5OC 3EKUA 1QQMA 4JHDB 2BTFA 2A5XA 5AQIA 3HM8A 2KHOA 3IUCA 1H1VA 2F9TA 3U9ZA 1QQNA 3FZMA 4BRKA 5KPRA 2UYTA 3M3ZA 2E1ZA 5JMVA 3DAWA 4WYBA 2A6AA 5LJWA 5EX5A 1GLBG 3QB0A 1NGCA 2FF6A 4L3QA 4FOIA 5KPTA 5AQYA 1J6ZA 3SJHA 4WQ4A 1BG3A 3SMPA 4FWQA 4O8KA 2ZWHA 3D2FB 3FR0A 4BR4A 5ADXA 3EZWA 3TU5A 4M7XA 5AQTA 5F2RA 4YDUC 5E26A 1NLVA 1YUWA 2CH6A 2WUSA 4FWKA 3RSEB 3VF6A 3VEVA 2HMPA 1Z05A 5BN9A 4EIAA 3MN5A 2PAVA 3P4IA 3C0BA 1TUUA 3RSEA 4B9QA 5EVZA 4BROA 5BPLA 4Y0WA 2BUPA 4PKGA 2Q1NA 1JCGA 3VGKA 2QWLA 3M6GA 5LJVA 3VETA 3QFUA 1ATRA 3GL1A 5AQGA 4FWNA 2YHYA 4Z94A 4PL7A 2YHXA 2NZTA 3BF3A 1MDUB 1JCFA 4GY2B 3I33A 3FE1A 4BR9A 4MLHA 3A0IX 3HBTA 3LDQA 2GELA 2J4RA 5JICA 3CQYA 1ATSA 1Z6RA 3EL2A 4XH4A 4CD3A 5JLHA 3U4LA 4A62A 1DKGD 4KBOA 3H3OB 4PL8A 5KPZA 1T6DA 1V4SA 1U2VA 3QICA 4HTLA 5AQFA 1BA1A 1SAZA 1HKBA 2CGJA 4PKHA 3LDLA 4RWTA 2VCPA 2GEMA 3CI5A 3FFKB 3O6WA 1D4XA 3GDQA 1QZ6A 1G99A 3EO3A 4B1ZA 3O5BA 4GNIA 1S22A 2A40A 3MN6A 3S41A 5AZJB 2QWRA 4J8FA 3QFPA 1HLUA 4FPBA 1BDGA 2W41A 2A42A 4CZJA 1HPMA 4MO5A 5FPEA 1ATNA 4B1UB 3BF1A 5BPNA 3WUHA 3FZHA 1MWMA 4FOEA 1S3XA 3BP8A 4B1XB 2QW9A 5FPDA 1GLLO 3WXJA 1X3MA 2IVOA 2D1KA 5E84A 1CZAN 3LDNA 2FF3B 2ITMA 1RGIA 3H1QA 1XUPO 2FSNA 5ADXH 2QWMA 3HI0A 2EWSA 1BO5O 3AY9A 3ID8A 4BR5A 1TYQB 5F0XA 2I7PA 3WEEA 4CZLA 3BEXA 1NGIA 5BREA 3FZLA 3L4IA 3FGUA 3VF4A 3VEXA 2AA4A 1TYQA 4A2AA 4B1WB 3MDQA 4IJAA 5F1XA 3R8EA 2E2NA 1LOTB 5TKYA 4WQ4C 2VYPA 3CHWA 2GWKA 2Q2RA 1KAYA 5AQLA 3WXIA 3U9DA 1BU6O 4JAXA 4BC3A 3R9PA 4BR2A 3ZX0A 2QWQA 3AAQA 3UKUB 3HSCA 2A41A 4E1JA 5CE3A 3VEWA 1IJJA 3LM2A 3UKUA 4XH5A 2I7NA 2P9KB 3MMVA 1V4TA 5BRHA 4FWMA 4H5RA 5AQPA 5AQRA 2FSJA 3J8AA 2P9KA 3WT0A 3C7NB 4FL9A 4EAHD 4LC9B 4H03B 4ISFA 4BRQA 1X9JA 4FWLA 3LDOA 3KHYA 2VWBA 2E2OA 3C7NA 4CBWA 3H1VX 2A3ZA 3LL3A 1RDWX 3MN9A 4A61A 2QM1A 1YAGA 4AM6A 3O08A 4BRMA 2E88A 2V7ZA 3VERA 3VF2A 3JXUA 5FPMA 4BRCA 2E2QA 1C0GA 1TUYA 2GWJA 2P9IB 2HF4A 1WOQA 2HF3A 3A5NC 3ULEB 1HKGA 3GG4A 1NWKA 2P9NA 1HUXA 2OANA 2P9IA 2DPNA 4NO7A 3FLCO 3VGMA 3ULEA 4CBXA 4H0OA 5AQWA 4XEIA 4H0VB 5BRFA 3ZEUB 3DJCA 1U2VB 3L6QA 3L0QA 3AAPA 4BQLA 3ZEUA 1NGBA 3OHRA 3H6EA 3QBXA 4FWRA 1QHAA 3AARA 4IZ9A 3EN9A 3QMLA 2P9SA 3GBTA 3EKSA 1KAXA 2Q0RA 3DXKB 2ASMA 5AQHA 3UB5A 3A5LC 1YVNA 4CZEA 1K8KA 4EFHA 3DXKA 1JCEA 3O4WA 3IMXA 4CBUA 4QS7A 3LM9A 4CJ7A 1NBWA 2E2PA 1DEJA 2Q0UA 2P9LA 2Q97A 5KQ8A 4RTFD 4B1VA 4DHYA 4BQZA 4QS9A 3CIPA 5AQMA 3BUZB 1NMDA 4DB3A 4PKIA 4K25A 1NGEA 5B8HA 3WEEB 2YHWA 3A5MC 3ATVA 5AQKA 4BVPA 4FWSA 3H3NO 4DCHA 4H0XB 3WQTA 1P8ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I9EB 4MO4A 1L3TA 1NG9A 1YHQN 2ZGYA 4LFCK 2NRZA 2OPPA 3HZ6A 2O8CB 4HTUA 2YJEA 3J80O 3L2RA 4IKFA 1QS4A 3O3FA 4C8OA 4BE2A 3NGIA 2DTUA 3KTQA 1SL0A 4LF4K 2IAJA 1BIUA 2XY5A 1N32K 4Z4HA 2OPSA 2XY8A 5AR0A 4W5QA 3HK2A 3CQ8A 2IDOA 4ILHA 3SAGA 5AQVA 4BC5A 3CJ9A 3C95A 4DSKA 3MN7A 3WQUA 4LF8K 1TAUA 4GKKK 1ASWA 3WXKA 2X6NA 3CPEA 4BRLA 1ASVA 3D45A 1EETA 3HPHA 2R7YA 1KD1O 5K14A 5AFUA 3GOIA 4DTSA 1KCFA 5HRNA 4UQGA 2QA4N 4IXCA 4EZ9A 3K5LA 1RTJA 3DXMA 3KVGA 4OX9K 4BC4A 2O4GA 5HRSA 3VA3A 2NRVA 5FROA 3RWUA 1GLAG 3AVBA 5ELZA 5HL7L 2DY4A 4OGEA 3ENHA 1VSEA 1REVA 3VGLA 4IDHA 4NB4A 3BY5A 2D0PA 3HTVA 2IS3A 2YI1A 4DU3A 4GV3A 2HVHA 4IOAL 5C10A 3RRGA 1RTHA 3SK3A 4BDPA 4CFCA 3OYGA 3CCMN 3H45C 1JLAA 4M41A 3V6DA 2V52B 1RBVA 4FJ9A 1S1TA 4FJ8A 4CJVA 4CJ4A 4GW6A 1M1KO 1LCUA 1RBUA 1B92A 3PX0A 2H3GX 2CGLA 1NGAA 1GLEG 3V1OA 3KLIA 4KI4A 4RG8A 2UXDK 4E7LA 4LF6K 4DQIA 2V7YA 2P9LB 2QXLA 3O1BA 3HXMA 1KVBA 3U8XA 2FXUA 2RE2A 4WF9L 1GLJO 2GBZA 4BE0A 4CZGA 1Q18A 3CERA 4CK3A 4BRNA 5JS2A 5JENA 3CJAA 3V81A 1IKYA 1NGGA 5I42A 3CYMA 1Y64A 3NGZA 2OA8A 1TKZA 2ZQBA 3CJCA 1HKCA 4KHSA 3N4PA 4XH1A 2KTQA 3LDPA 4IJNA 4IEEA 3HP9A 4CZFA 1ZBSA 2VQFK 4CF1A 4KI6A 4FLYA 1TVRA 3VEYA 4O5FA 2Q3SA 2QWPA 1Z26A 3TAFA 3OYAA 2YHBA 3I55N 3G6EN 1GLFO 2X74A 1YIJN 3ZETB 1BUPA 5C25A 1BCOA 4ELUA 1NMNA 3D7EO 4ILGB 1YITN 4FLZA 3L8BA 2JGUA 3HVTA 3P5JA 1T6CA 4CJ3A 4YOTA 1HQUA 3RR7A 4C8NA 4A2BA 1GLDG 3THXB 4BRPA 1VAZA 4JKHA 4DUYK 4HVJA 1LWCA 3CCSN 1X3NA 1KLMA 3A5OC 3OYBA 1IBMK 1QQMA 3AVJA 3G71N 4C8KA 4CJSA 2RPIA 3C6UA 2HMIA 4DTPA 4B3SK 3UIQA 4DQQA 1K73O 1H1VA 2KW4A 5KPRA 3M3ZA 5JMVA 3J7AP 2WFBA 2A6AA 3BZCA 5LJWA 1WSEA 3TSUA 2HVIA 4L3QA 4FOIA 4DKWA 3AA2A 4X64K 4E7JA 3THWA 1J6ZA 1KFDA 4R5PA 4WQ4A 1OH6A 1BG3A 2F7TA 1IH7A 3D2FB 4FJXA 2IOCA 4LF7K 4JKBA 2GUIA 3TAMA 3EZWA 1KLNA 3DLRA 1NLVA 4C1NI 1WSHA 3KK3A 4FLVA 1RT3A 5BN9A 1O13A 3DRSA 3RSEA 4PKGA 3VGKA 2QWLA 4DFMA 1C1CA 1S9GA 4RW8A 3SQ0A 3QFUA 4BWMA 2Z1HA 2UUBK 4FWNA 4I9LA 2YHYA 3L3UA 2YHXA 3AVGA 3FE1A 5KRTA 3A0IX 1T8EA 3HBTA 3RMAA 2F4VK 3LDQA 3CQYA 1ATSA 4AILC 1Z6RA 4CD3A 4BDYA 3U4LA 4GV6A 4KBOA 1T6DA 1U2VA 2C1GA 3QNNA 4A5AA 3QICA 1BA1A 5M1KA 1HKBA 2CGJA 2O8BA 3FFKB 1SL2A 1OH7A 3O6WA 3LDSA 3NVKA 1SUQA 4NXMK 3O5BA 4HHTA 2HHVA 5AZJB 2QWRA 4J8FA 4AHTA 4OPKA 3Q7CA 1N8RO 3K5OA 3FFIA 2A42A 1HPMA 1RBRA 2O8EB 2FBVA 3SI6A 1ATNA 1Q8IA 3HT3A 3BF1A 3FZHA 3BP8A 1ZBLA 1F21A 4B1XB 2QW9A 5FPDA 1VQ8N 4CEZA 3O9UA 3OYEA 2IVOA 3CCLN 5E84A 3LDNA 4IEIA 5CHIA 4FLXA 1RGIA 4CIGA 4DV0K 4E3SA 4ELTA 4CCHA 4BE7B 2EWSA 2PYJA 1TYQB 1CXUA 5CYMA 3DOLA 4O55A 3VEXA 1FW6A 2VWKA 3L2WA 5F1XA 1WAFA 1KRPA 4CJWA 5TKYA 3AVMA 4WQ4C 3CHWA 1NOZA 3U9DA 4Y1DA 3SNNA 4Z4GA 4JAXA 3S9HA 4CJFA 1HNXK 1I94K 3U6FA 2ITGA 1FKPA 3O9SA 3ZSZA 3S3MA 2O8CA 1RDUA 4DQPA 4FW2A 4CE9A 2HBLA 3VEWA 4NXNK 5FDLA 3C94A 4KFBA 4FM1A 3MMVA 3DLGA 3J7YP 1V4TA 5BRHA 3IKMA 1ZBIA 5AQRA 5MLCQ 3J8AA 2NRRA 3U3GA 3OYIA 4WCEL 2BH1A 4EAHD 3KKRA 5CR4A 4BRQA 1NKBA 3OW2M 2VWBA 3C7NA 4NYNA 4JI0K 1YTUA 3H1VX 1UA0A 3SZ2A 2A3ZA 4N5SA 2QM1A 4JI8K 2O8DB 1YAGA 3O08A 4BRMA 1XC9A 3S3NA 2HBKA 1VRTA 4IOXA 4CJQA 2XY6A 3A5NC 3JSMA 1HKGA 4KH4A 3SJJA 1JLGA 1NWKA 4FXDA 4Z4FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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