3ULEA

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869 and atp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
415
structure length
400
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP
rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 400
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3uleA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3uleA04
3HM8A 3VEVA 3U8XA 3D2EB 1RDWX 4BRNA 3GBTA 4IO8A 2IVPA 2QWNA 3WXIA 4DB3A 3FE1A 4H0PA 2W41A 4B1XB 4CD1A 3VEWA 3ZETA 2GELA 5ELZA 1GLEG 4NB4A 2D4WA 1GLAG 1SZ2A 2QWMA 3QB0A 2GWJA 2E20A 2VYPA 3LDPA 3CERA 1T44A 3W3DA 2V7ZA 1HLUA 4JAXA 2NRHA 2HF3A 1BA0A 3LDQA 4K25A 3AARA 3BF1A 4BVPA 3CJ7A 3MCPA 4XH4A 2YHWA 3EKSA 2KHOA 1BDGA 4PKGA 3C0BA 2IVNA 4H5VA 1MWMA 1T6DA 3A5LC 2GTDA 4BG9A 3CI5A 2QWPA 4H0XB 1TYQB 2FSKA 3ATVA 2F9WA 3C7NA 1NLVA 3R6MA 4FWNA 4H0YB 4A61A 5ADXH 2HF4A 4CZEA 4JHDA 4WQ5C 1C0GA 3BUZB 4GNIA 2NLXA 1QQMA 5AQTA 4YDUC 2V7YA 4BC5A 4WYBA 3MN7A 4B1WB 3VEZA 4KBOA 2FF6A 4BR2A 1V4SA 4FPBA 1NGJA 3EN9A 3VF6A 2Q36A 3GOIA 3VGMA 2E2PA 4PKIA 4CZKA 3O1BA 1BA1A 1YAGA 2VCPA 1SQKA 1GLFO 3QICA 4CZMA 3BEXA 1HKGA 3O08A 2VWBA 3FZLA 5KQDA 3FZKA 5AQFA 3CJBA 1BU6O 2E2QA 3TU5A 3CJ1A 4LC9B 4BRAA 1HPMA 3ATUA 4L3QA 4BR0A 3WXJA 1XC3A 2P9PB 4BRPA 4RTFD 3SLCA 3I8BA 2A6AA 3MN6A 4GY2B 2P9NB 4BRFA 3HSCA 4FSVA 4BRDA 4DCHA 4MO5A 3FR0A 4CBWA 5EOYA 3WQTA 1U6ZA 2E8AA 4I6MB 4H5RA 5AQSA 3M1FA 3AAPA 3VGKA 3WXLA 4BRQA 1BG3A 5AQQA 2QXLA 4B9QA 1R59O 3H6EA 3L0QA 3A8YA 2YHYA 1MA9B 3ZETB 5FPDA 5AQJA 2YHXA 2YCHA 4JN4A 4CBUA 5AQRA 4JNEA 3GDQA 3HBTA 3U9DA 2YJEA 4FWLA 5JMVA 3EKUA 3GL1A 1GLBG 3AY9A 3VEYA 4BRLA 4DHYA 3QDKA 2P9SB 1IJJA 1OKJA 2CGJA 1U2VA 5CE3A 5KQ8A 3CQXA 5LJWA 2P9KA 2H3GX 2P9UA 4CI6A 1K8KB 1J6ZA 1HKBA 3JXUA 2V52B 3AAQA 3LDNA 4BRKA 3W0LA 2ASPA 3VF2A 1GLDG 1NGEA 1ZC6A 1X9JA 3VEOA 1ATNA 3WXKA 4BQLA 4CZGA 2ASOA 5BPLA 5AZIA 3ID8A 1E4GT 5BRFA 1DGKN 3FZFA 3LM9A 3O80A 4A2AA 2QW9A 3SJHA 3LDOA 3VEXA 4FWPA 1GLJO 4IJNA 2QWLA 2P9IB 3EZWA 4K42A 1QZ5A 4XEIA 5AR0A 4H0TB 5F1XA 3ENHA 2FSJA 2BUPA 3B8AX 3ZX3A 1NMDA 4H5NA 1NWKA 4K41A 5AZJB 4H0OA 3J8AA 4F9OA 4XH1A 3KZBA 4EAHD 3BP8A 3HI0A 5AFUA 4BC3A 3DAWA 2Q0UA 3H3NO 2E88A 3CETA 4Z94A 2AP1A 2QWQA 3OHRA 4JD2A 4FWKA 5BRHA 4FWRA 3CJ9A 1JCFA 4B1VA 3QFPA 2A40A 4XH5A 2E1ZA 1BWFO 5AQHA 4PL7A 4EFHA 3UB5A 4RWTA 5AQYA 4MLEA 2GWKA 1NGFA 2FLOA 3CJCA 4QS7A 1ZXOA 3ULEB 2D0PA 2GUPA 3FZMA 3O5BA 2BTFA 4IZ9A 2E2NA 4FWSA 1QHAA 3SMPA 5AQLA 4BR5A 1MDUB 1DEJA 2EWSA 4BGAA 3LL3A 3D7EO 2HMPA 2YJFA 4FWOA 3ENOA 4FO0A 5EVZA 1U2VB 4BRCA 1TUYA 2A41A 4FWQA 1QQOA 2P9UB 3VETA 4BGBA 1S22A 2OANA 4B1UB 2E2OA 3UE5A 4WQ4C 1JCEA 1NGIA 5AQWA 2FXUA 1KXPA 4CZFA 5B8HA 2I7NA 3A5NC 3CHWA 5KPZA 5AZIB 3DXKA 3QBWA 3WUHA 1C0FA 1XUPO 3VGLA 5AQUA 3DXMA 3DJCA 4B1YB 5JICA 1GLLO 3QMLA 3D2FA 2CGLA 3GG4A 3HZ6A 2FF3B 4M63C 1IG8A 5BR9A 1BOTO 2P9LA 2A3ZA 3A5OC 1RGIA 1HX1A 2QWOA 1NGHA 4FPAA 4IJAA 5AQIA 2A5XA 4PKHA 3U4LA 2ZWHA 4BC2A 2Q31A 3M3ZA 1Z6RA 3O1WA 3UKRA 4O5FA 4EHUA 1NGAA 1Y64A 5AQNA 5AFUH 1H1VA 2ZGZA 5AQPA 5JLFA 3VPZA 3MN5A 3S41A 4HTLA 4CZHA 3ZX2A 5BRDA 3C7NB 3ZEUA 2Q0RA 2UYTA 3VF4A 2YI1A 4JHDB 3WT0A 1ATRA 3P4IA 1S3XA 5EX5A 2D1KA 1NGBA 3MK6A 3H1QA 3I33A 4BVOA 1SAZA 3IUCA 1NGGA 5AQVA 4CZJA 1T6CA 1Z05A 3ZX0A 2J4RA 2FSNA 3VENA 1LOTB 5KPTA 4AM6A 3O8MA 4I6MA 1DKGD 4A2BA 1ZBSA 3SK3A 4IXCA 3VOVA 3IFRA 2CH5A 2PAVA 2W40A 3R8EA 3LM2A 1YVNA 5LJVA 3GE1A 5F0XA 3VESA 3UKUA 1LCUA 4FL9A 1Q18A 2ASMA 5FPMA 1P8ZA 3FLCO 3WEEA 1NM1A 3A5MC 5I9EB 4H0VB 1X3MA 3DXKB 5BPNA 5BREA 4J8FA 3DXMB 2P9SA 2DPNA 2Q2RA 2E1YA 1G99A 3D2FB 3RSEA 4QS8A 4DQ8A 3MMVA 3L6QA 3CQYA 5AQKA 3A0IX 1K8KA 4BQZA 2WUSA 5EXWA 3CIPA 3HTVA 1NGDA 5AQZA 2P9LB 4BRHA 1QZ6A 3D2EA 1TUUA 2Q1NA 5LY3A 1X3NA 3O6WA 4MO4A 3UKRB 1ATSA 5E26A 1XQSC 4WQ5A 2P9KB 2HOEA 2QM1A 4BRMA 4EIAA 4IWVA 1WUAA 3LDLA 4E1JA 4YDUA 4CZLA 2P9IA 4CD3A 1BUPA 3IMXA 3H3OB 1JCGA 4ISGA 3FZHA 3TPQA 3ZEUB 2I7PA 3O4WA 3JS6A 5E84A 3QBXA 2ZF5O 3IDHA 4O8KA 5AZJA 1KAXA 2CGKA 2IIRA 5AQMA 4NO7A 4B1ZA 5F2RA 3EO3A 3DWLA 4BC4A 4BR9A 5JLHA 3MN9A 3G25A 4H5TA 2GEMA 1HJOA 3U9ZA 4BROA 2CH6A 3KHYA 1BO5O 1MWKA 1HKCA 4HWIA 3H45C 1EQYA 3R9PA 4BG8A 3FFKB 3CJAA 4H5WA 4CJ7A 5AQXA 2AA4A 1WOQA 5ADXA 5TKYA 1CZAN 1NBWA 5BN8A 1TYQA 1V4TA 4QS9A 3FGUA 1ESVA 1QQNA 4BR4A 4WQ4A 5EY4A 5BN9A 4CBXA 1YUWA 3EL2A 4BRIA 1GLCG 4EHTA 1KAYA 1YXQA 4PL8A 5FPNA 4K43A 3WQUA 3ULEA 3UKUB 2QWRA 4JD2B 2ITMA 2V51B 2PBDA 2D0OA 4BRGA 4M7YA 4MLHA 3WEEB 2NZTA 4FOIA 3L4IA 1KAZA 1RFQA 2ZGYA 4CZIA 2IVOA 3KVGA 4H03B 4BR7A 1D4XA 4ISEA 4FWMA 4C23A 5FPEA 5BPMA 4M7XA 3H1VX 3M6GA 3RSEB 2Q97A 1HUXA 2P9PA 4Y0WA 3VERA 4RCHA 2F9TA 3BF3A 5AQOA 4BREA 4FOEA 4ISFA 5AQGA 3QFUA 2P9NA 1NGCA 3MDQA 5KPRA 3H46O 4A62A 4AM7A 1E4FT 2A42A 3F9MA 3SMSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CEBA 1WN7A 3GBTA 3Q7CA 4JI4K 1TKZA 3WXIA 2QWNA 2OZMA 1BI4A 3FE1A 5TKWA 1NJIO 2W41A 5HLFA 4JKFA 1A5WA 1GLEG 2VWKA 2QWMA 4IG0A 4CF9A 3L8BA 1UAXA 2E20A 3SYZA 1VSJA 3LDPA 3W3DA 2Y1IA 3CPWM 1NK9A 2NRHA 2HHIA 3BF1A 4BVPA 2HHHK 2P1JA 4DTMA 4XH4A 2YHWA 2KHOA 1BDGA 3TI0A 4WCEL 3LP0A 1T6DA 4LFCK 3A5LC 2XHBA 3CCUN 4BG9A 3ATVA 4JEPA 3R6MA 2A1SA 4A61A 4CZEA 4JHDA 2HW3A 2UUCK 3J7ZO 5GIPA 4CGHA 4LFBK 3VA0A 3D45A 3MN7A 3TAGA 4BR2A 2G8HA 1V4SA 1C0TA 3LDSA 3VF6A 3EE8A 3VGMA 3ULDA 4RW7A 2KKZA 1KC8O 1K9MO 4B3MK 4ELTA 2F4VK 4E89A 4NXNK 3FZLA 5KQDA 2QEXN 4ZTJA 4BRAA 3BZCA 5LL6Z 4L3QA 4E7IA 3DRPA 3SLCA 1TVRA 3CD6N 4FSVA 4IEEA 1IKWA 4CBWA 3DLHA 4QOZB 3SV4A 1U6ZA 2E8AA 1ZBUA 4H5RA 1YVUA 3AO1A 1WBDA 1BI4B 1BG3A 3CM6A 4B9SA 2VG6A 5AQQA 4JV5K 2PFUA 4AILC 4LF7K 1R59O 3H6EA 1HYVA 4FLTA 4E7HA 1HRHA 3DLLL 3KJVA 4OJRA 1K6YA 1BISA 4NYNA 2VQEK 3QERA 1VQ7N 2O8BB 1TAQA 2BDPA 4OKEA 3QEWA 4FWLA 3OYCA 1HQEA 3VEYA 4BRLA 1N8RO 2BANA 1OKJA 4OVLA 3E01A 2D0AA 5LJWA 5CE3A 2KQ2A 4Z4FA 1U48A 1HNIA 1HKBA 4LD0A 3J81O 3AAQA 3W0LA 3NHGA 2ASPA 3VF2A 1UWBA 2YNFA 1X9JA 2WBNA 3CC7N 4BQLA 4CZGA 5BPLA 5BRFA 1DGKN 4DV3K 2HVHA 3LM9A 4A2AA 2YKMA 2QW9A 1QQCA 4FK4A 3LDOA 2IGIA 3K5NA 2O8DA 1J5OA 2ZJQL 2P9IB 1ITGA 4FW1A 1J53A 4K42A 2A1RA 5AR0A 4H0TB 5F1XA 1K73O 4CF0A 1IH7A 3ZX3A 1FKPA 3AA4A 1OVYA 3NF7A 5AZJB 3I56N 4H0OA 3J8AA 4FZZA 1ZBLA 1XHZA 3NF9A 2IS3A 3BP8A 5AFUA 3NAEA 1XI1A 4NCAA 2NRRA 3DAWA 2Q0UA 3CETA 3P38A 2PYJA 2XY7A 4HUEA 3LZJA 3OHRA 4B9TA 2ZJPL 4CEZA 5JENA 3VQ7A 3LALA 4A5BA 3DYAA 4W5NA 3L2UA 3EY1A 2A40A 4XH5A 3QIPA 1Z25A 3T1YK 1Q7YO 5AQHA 4EFHA 3G4SN 4O4GA 4RWTA 4CFDA 1WSHA 1VQNN 2GWKA 2FLOA 2IAJA 1ZXOA 4DFMA 3THWA 4KI4A 3LPUA 2BTFA 4IOAL 2E2NA 3PX4A 1ZBFA 4KO0A 5JS2A 3ZSRA 4BR5A 2W42A 4BGAA 3LL3A 5CYMA 4CHZA 5HOOA 3IAYA 2HMPA 4OGCA 3PX6A 5EVZA 1TUYA 3O9SA 1WBBA 1M1KO 3KK1A 3HJFA 1JCEA 5KRTA 3C65A 3RMCA 1S1XA 4HUGA 3M8QA 1JJ2M 5I3UA 3QINA 4HHTA 3QIOA 5KPZA 3QETA 3ASMA 3HVTA 1C0FA 4OKKA 4XIUA 2KW4A 1LWFA 3DJCA 4CFAA 4CJPA 3O9UA 2B6AA 3T1HK 4G9ZA 3NF6A 2HBMA 4I2QA 3A5OC 3AVJA 1CZBA 4O55A 4PKHA 1VSDA 4WFNL 3E1YA 3LZIA 1QTMA 3O1WA 1L3UA 3F5TA 3TABA 4EHUA 5AQNA 5AFUH 3VPZA 3A2FA 4CF1A 4JK9A 5CZ1A 3DM2A 4CJSA 2HHWA 3V9XA 4HCBA 1EKEA 3P4IA 1S3XA 5EX5A 2D1KA 3HPGA 3V9SA 3OYMA 4X66K 3I33A 4WF9L 1NGGA 3M8PA 4CZJA 1VQKN 4WFAL 3ZX0A 3PV8A 1LOTB 4GV6A 4CHQA 1Q82O 5C2DA 4I6MA 1KD1O 4QAGA 3TTFA 1QE1A 4W5QA 1LW0A 3R3LA 4FLXA 1NK5A 2OTLN 1WAJA 2CH5A 4Y1CA 1YVNA 1TKDA 1BQMA 2HNYA 3GE1A 4DSEA 2QI2A 1Q18A 5FPMA 1P8ZA 3WEEA 1C1CA 4ID5A 1NM1A 2RHKA 3MEGA 1O13A 4E7JA 4CHPA 3L2QA 5BPNA 4DR6K 5K14A 3EZ5A 3SQ0A 5BREA 2P9SA 1JLFA 2E1YA 2VWJA 2KFZA 3MMVA 4NLCA 1Z26A 3PO4A 5AQKA 3A0IX 3SUPA 4YNQA 4A59A 3PLAA 3MWPA 4CJQA 4KB0A 3LP2A 3D2EA 1TUUA 1NK7A 1FJGK 4LFAK 1UOCA 3NDKA 3K5MA 3O6WA 1ATSA 2FC0A 5M1QA 3MXJA 1OH5A 2P5GA 1IG9A 1KFDA 4CJTA 3T69A 1KFSA 3H3OB 3DLEA 1IKVA 4B8CA 4RW4A 3JS6A 5FRNA 1OH7A 4CIGA 4YOWA 1KAXA 2JWLA 1CLQA 3ZT3A 4B1ZA 3DWLA 3MN9A 3G25A 4H5TA 3PX0A 1C0MA 1P90A 1EQYA 4M3RA 2G8KA 3CJAA 3VQ4A 4H5WA 4CJ7A 3OA9A 1WOQA 3T7ZA 3K9KA 1Q86O 1LWCA 5TKYA 4BE7B 1NBWA 3ALYA 5BN8A 4X64K 4QS9A 3FGUA 3QESA 3OW2M 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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