3ULEB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869 and atp
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
351
structure length
236
Chain Sequence
CDNGTGFVLLTEPPMAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRHMVFLGGAVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP
rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 65
structure length 236
sequence length 351
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3uleB02
1J6ZA 5AQSA 3LL3A 5AQTA 5F2RA 3SK3A 1HPMA 3DXMA 2Q36A 2P9KB 4A61A 1Q18A 4CZJA 5BPMA 2GTDA 5EVZA 1BDGA 2FXUA 3B8AX 1GLJO 4JN4A 4AM6A 4BR0A 3AAPA 3AY9A 2A6AA 5B8HA 3UE5A 3FZHA 5AZJA 2FLOA 3GBTA 2YI1A 4BRQA 4BRPA 4IJAA 1HUXA 5KPRA 1EQYA 4JNEA 5AQZA 1NGEA 4XH4A 4H5WA 5BN9A 3ID8A 4IZ9A 5EOYA 2CGKA 4HTLA 2E8AA 3WT0A 4EAHD 2VWBA 4EFHA 3H45C 1NMDA 4CBWA 4FO0A 1ZBSA 1NGDA 2P9NA 4B1ZA 3FZLA 4RCHA 2BTFA 2GWJA 3RSEA 3WQUA 5F1XA 4Z94A 4B1UB 5BR9A 3MCPA 1C0GA 4IWVA 1T6CA 2DPNA 3HZ6A 1YXQA 5JLFA 4BC5A 3BP8A 3H1VX 3HTVA 2WUSA 3ULEB 2ASPA 4F9OA 1RFQA 3DXKA 3VPZA 2KHOA 3L4IA 3QBXA 4CZHA 4C23A 3CQXA 1NM1A 2HOEA 3MK6A 5AZIB 2IVPA 4H5VA 3U9ZA 4QS9A 3MN9A 3VEWA 1MA9B 5I9EB 3FZKA 2E88A 5AQOA 5JICA 3I33A 4K43A 2ASOA 5KQ8A 4DHYA 2F9WA 3UKUA 4BRKA 2PBDA 4PKGA 4MLEA 2QWNA 4QS7A 1R59O 3CI5A 1OKJA 4EHTA 2QWOA 1ZC6A 4I6MA 4GY2B 3DWLA 2Q1NA 5BRHA 3AARA 3C0BA 3J8AA 1XC3A 3AAQA 2QWLA 4B1YB 1X3MA 4FOEA 1Z6RA 4H0XB 3VEYA 2ZGYA 1NGCA 4FPAA 5BPLA 5JMVA 3SMSA 5AZJB 2D1KA 3GG4A 4FSVA 4EIAA 2PAVA 3S41A 2CH5A 5AQRA 2GEMA 5AQPA 4H03B 3GDQA 3VEVA 2F9TA 4O8KA 1BU6O 2ITMA 5FPMA 3QFPA 3CQYA 4FWKA 2UYTA 1YAGA 4FPBA 3R9PA 1LCUA 2YHWA 5ADXA 1G99A 5AQYA 4BVPA 3CJCA 1HX1A 2HMPA 4CD1A 1ATSA 2A40A 2QM1A 3WXKA 1GLLO 3H3NO 4B9QA 1SAZA 5EX5A 4IJNA 2E2PA 3LM2A 3L6QA 3CJBA 2FF3B 3FGUA 3EKSA 1C0FA 4ISGA 3G25A 3QBWA 3WXJA 4QS8A 5AQVA 3IFRA 5FPEA 4BG9A 3IMXA 3U9DA 1HKCA 3VGLA 2J4RA 3OHRA 4ISEA 4NB4A 4BG8A 2I7NA 3BEXA 1SZ2A 3LDPA 4CI6A 4BREA 3O80A 4M7XA 3WUHA 2A3ZA 3LDNA 3LDQA 3QFUA 4CBUA 1LOTB 3ENOA 4H0TB 2OANA 3GOIA 3QICA 4BGBA 2P9PB 5E84A 1NGJA 4JD2A 2A42A 3R6MA 4BRFA 2GUPA 4FWRA 3A5LC 3A5OC 3ULEA 2ASMA 3FE1A 4B1XB 1DKGD 1NGFA 2CGLA 3IDHA 4CJ7A 3WXLA 4AM7A 1BO5O 1RGIA 3ZX3A 1V4TA 2P9LB 1IG8A 2Q2RA 1IJJA 4RWTA 2P9UB 1V4SA 3I8BA 5AZIA 5BRFA 4BRLA 3M6GA 1WOQA 1U6ZA 3GE1A 2A5XA 4BRGA 4MO4A 5AR0A 3HM8A 4WQ4C 5AQWA 4BRMA 1QQNA 2IVOA 2NLXA 3DAWA 3A0IX 3W0LA 1NGGA 1U2VB 5BREA 5LY3A 3TPQA 1GLAG 2Q0RA 3JXUA 5AQMA 3O1WA 4E1JA 1S3XA 5FPDA 3H3OB 5JLHA 1S22A 4M7YA 5AQNA 2FSKA 1ATNA 3VENA 2P9IA 4CZGA 5EXWA 4CZEA 3WEEA 1MDUB 3JS6A 1GLCG 3MN5A 2EWSA 2P9KA 3VESA 2W40A 4DQ8A 4JAXA 1HKBA 4BC2A 3DXMB 1BWFO 4CZFA 4XEIA 4CBXA 3C7NB 2IIRA 1HJOA 3M3ZA 4WQ5A 2QWPA 1K8KA 2D0PA 3C7NA 4PL8A 3DJCA 3F9MA 3ATUA 2E20A 1K8KB 4H0OA 3VEZA 5AQJA 1ESVA 4Y0WA 1JCFA 2VYPA 2QWRA 1NGBA 2V7ZA 1JCGA 5AQUA 5AQKA 4O5FA 2CGJA 5AQLA 5FPNA 3ZETB 1GLDG 4BRCA 3O08A 3U4LA 1YVNA 4JHDB 1WUAA 2E2OA 4FWQA 3RSEB 3KZBA 4YDUA 4BR4A 4JHDA 5EY4A 4XH1A 4CZKA 5F0XA 1BOTO 2P9NB 2W41A 3GL1A 4H0VB 3BUZB 2Q31A 3ZEUB 4DB3A 5ELZA 4PKHA 4M63C 3CETA 3M1FA 1KAZA 2YHXA 3D2FA 1SQKA 1X9JA 3UB5A 4BC4A 1GLEG 4BRNA 1YUWA 3H6EA 3MMVA 3FR0A 3D2FB 1T6DA 5BN8A 4I6MB 3EL2A 1BA0A 3ZEUA 4BGAA 2E1YA 2QXLA 3SJHA 1KXPA 1Y64A 2CH6A 2Q0UA 4FWSA 4B1WB 4K41A 2GELA 4BR7A 3QDKA 4K25A 4HWIA 1NLVA 3CIPA 4EHUA 2HF3A 5CE3A 1ZXOA 5ADXH 3KVGA 5KQDA 3ZX2A 1E4GT 1MWMA 4BRDA 5BPNA 2P9SB 2E1ZA 2FSJA 3MN6A 5AFUH 3P4IA 4BR2A 1BG3A 3O6WA 2ZWHA 3D7EO 3DXKB 2D0OA 5AQIA 3SLCA 2YJEA 1GLFO 4BVOA 4BRIA 5LJVA 2VCPA 1HKGA 1NGAA 5AQFA 5AQQA 4A2AA 3EN9A 3WEEB 3D2EA 1TUUA 2P9UA 2D4WA 1XQSC 3ENHA 1NGHA 1QHAA 5KPZA 3EKUA 4KBOA 2AA4A 4L3QA 1T44A 1HLUA 4WQ4A 2P9IB 1KAXA 5AQXA 1P8ZA 2ZGZA 1CZAN 4H5TA 4BRAA 1U2VA 4H5RA 3WXIA 3CHWA 1TUYA 4K42A 4PKIA 3EZWA 2HF4A 1KAYA 3H1QA 5AQGA 4H0PA 3ZETA 4YDUC 3R8EA 3VERA 4FWMA 3VF4A 2Q97A 4BRHA 3O5BA 1RDWX 4BQZA 2AP1A 4NO7A 3BF1A 3FZMA 2YJFA 3VEOA 4FL9A 2P9LA 1QQOA 3EO3A 4BR9A 1XUPO 1E4FT 1BUPA 2YCHA 4WQ5C 4A2BA 3HBTA 3O4WA 2E2NA 2IVNA 4BC3A 5BRDA 2QW9A 3VGMA 2H3GX 2BUPA 4CD3A 3HSCA 1H1VA 3A5NC 1DEJA 2QWQA 1Z05A 1MWKA 2FSNA 2NRHA 2A41A 4WYBA 3MN7A 2GWKA 1X3NA 4CZMA 3FZFA 3SMPA 3CJ7A 4H0YB 3O8MA 3VEXA 3CERA 3FFKB 2ZF5O 2V51B 4GNIA 1JCEA 4FOIA 3KHYA 1NGIA 3WQTA 2V52B 4FWNA 1NWKA 3O1BA 3L0QA 1GLBG 4BROA 5LJWA 3LDOA 4BQLA 3W3DA 3LM9A 3VGKA 4XH5A 3TU5A 1DGKN 2QWMA 4MLHA 3VF2A 1TYQB 4A62A 2V7YA 4FWLA 4DCHA 3CJ9A 4RTFD 4J8FA 3UKRB 1ATRA 4JD2B 4MO5A 2E2QA 3H46O 2P9PA 3LDLA 3UKRA 2P9SA 3FLCO 5KPTA 2NZTA 1TYQA 4BR5A 4B1VA 3U8XA 3VOVA 3BF3A 3HI0A 3CJAA 5AQHA 5AFUA 4CZLA 1QZ6A 3VF6A 1NBWA 2I7PA 3A8YA 3MDQA 5E26A 3CJ1A 4ISFA 3IUCA 3D2EB 3UKUB 1QZ5A 4FWOA 5TKYA 3QMLA 3ATVA 4PL7A 1QQMA 4IXCA 2FF6A 3ZX0A 3QB0A 3VETA 2YHYA 1D4XA 4CZIA 3A5MC 4FWPA 4IO8A 4H5NA 4LC9B 1BA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK0A 4B9TA 2HHTA 2Z1JA 2BDPA 5F2RA 3SK3A 1XNQK 4KTZA 2Q36A 1B92A 4DTOA 3EYZA 5KGWA 2GTDA 4JI7K 3B8AX 5GADP 3DLRA 5B8HA 3AAPA 3AY9A 5HBMA 1EETA 4I7FA 3J81O 5JS1A 3FFIA 5AZJA 3DLLL 2YI1A 3OJSA 3TTCA 4IJAA 4IDHA 4JNEA 1G15A 2HSTA 1NGEA 4B9NA 2Y1JA 3KKRA 3AVKA 1XWLA 5GAEP 5EOYA 2O8EB 1TVRA 3AO3A 3R3LA 3WT0A 4EFHA 4ELTA 3SQ2A 1NK8A 3HPOA 3ZLJA 3TSUA 1NGDA 2ZE2A 1KLNA 3V6DA 1NKCA 2NNWA 1VAZA 1KTQA 4XJXA 4CFBA 3MCPA 3CXCM 4DR1K 3OW2M 3V1RA 4A5AA 3EY1A 2Q3SA 3U3GA 1YXQA 4JKEA 3H1VX 3I8DA 3ULEB 3BZKA 3L4QA 2F8TA 1RFQA 4CZHA 2HBLA 4QCLA 1NM1A 4XIUA 1SV5A 4CEQA 5AZIB 3SPZA 1IBKK 4H5VA 3U9ZA 4FW1A 3VEWA 4BWMA 1RT2A 1QHTA 4HTUA 1KLMA 3PIOL 3I33A 3QLHA 4M3ZA 3OYMA 2PBDA 3AO2A 4IG0A 4LH5A 4MLEA 2QWNA 3QINA 4BY9C 3E9OA 1R59O 4W5OA 5HRNA 4DFPA 2QWOA 1ZC6A 1GOAA 3OYDA 5BRHA 1UAXA 4FZZA 3SUQA 1REVA 2O8DB 3J8AA 1XC3A 3AAQA 1X3MA 4FOEA 3TABA 3C6HA 3U6FA 4JKGB 2YX6A 2F4VK 1S6PA 2O8FB 3GG4A 2PAVA 5AQRA 4AQYK 4BACA 3GDQA 2F9TA 3J7AP 4DG1A 4OKJA 3NF7A 5FPMA 4GKKK 1S9EA 4CJKA 3CC4N 1Z25A 2ZD1A 3QFPA 3V9ZA 2UYTA 4FPBA 3BGRA 2WC9A 1LCUA 1RTHA 3L3VA 1G99A 5AQYA 2G8WA 2W00A 3LAMA 1O1WA 2HMPA 2QM1A 2FC0A 3DYAA 3WXKA 3H3NO 1JL1A 4DS4A 1Q9YA 1T7PA 2QA4N 3FGUA 3NFAA 1T05A 4ISGA 3G25A 4B8CA 2Z1IA 1J53A 2HHHK 3QBWA 3HRGA 4HUEA 4QS8A 1QSYA 3IMXA 1HKCA 3VGLA 3SPYA 4BE2A 1HPZA 4ZTJA 2JWKA 3RRHA 2I7NA 3TSQA 3OY9A 4CI6A 4FK4A 2E4LA 2IDOA 3M5RA 3T3FA 3SQ4A 4CBUA 2P9PB 1GOCA 1RDAA 2A42A 4BRFA 1VHXA 3THXA 1DKGD 3T19A 2ATQA 4DR7K 5C25A 1FJGK 5GIPA 4KHNA 4CK1A 2JWLA 4AM7A 5D3GA 4I2PA 2UXCK 1QE1A 1V4TA 1IG8A 2G8HA 1V4SA 3CCQN 1WOQA 4JK7A 4OPKA 1U6ZA 4FJ5A 2NRTA 4MO4A 3THYA 4WQ4C 3O9SA 5AQWA 2NLXA 1X9WA 4DSLA 4YY3K 3A0IX 1NGGA 4CF2A 4J2EA 3VTHA 3TPQA 1X1PA 5AQMA 4KI6A 1W2BM 1Q82O 3PLAA 5FPDA 3H3OB 5AQNA 1RBRA 1NK4A 4CZGA 1M1KO 3B6OA 4CZEA 3WEEA 4FM1A 1RBUA 4FCYA 1MDUB 3JS6A 2EWSA 3VESA 3SBGA 4EZ6A 4BC2A 1BWFO 3AVFA 1B9DA 2YHBA 4O0JA 3OYIA 4CGHA 1BCMA 1VQON 2O8CB 2YNIA 4WQ5A 2DFEA 2DFHA 5SZTA 4F4KA 3C7NA 4DV6K 3ATUA 4M3XA 2OPSA 3QEVA 2XY7A 1BIZA 3LP0A 3H08A 3HP9A 4ILJA 4B3TK 1TKZA 5AQUA 4O5FA 1YTAA 1HNIA 4EP4A 3U4LA 4DU1A 4RW6A 1YVNA 1WUAA 3VQEA 4B3MK 4FLYA 4JKBA 1L5UA 1YIJN 3SZ2A 4OKKA 3RSEB 4C8OA 4JHDA 3AVNA 1LWEA 3KWIA 4M3TA 5BR8K 2W41A 2Q31A 4GVMA 1RT4A 4UQGA 5HOOA 1X9JA 4BC4A 1JJ2M 4B9UA 4OX9K 3THWB 1FW6A 1GOBA 2RE2A 5DM7L 3D2FB 1RT7A 3DRSA 1SL2A 1BA0A 2B6AA 4PUOA 1BGXT 2X6SA 4FWSA 4B1WB 4E1MA 1D5AA 2GELA 4BR7A 4K25A 4HWIA 3CIPA 4CESA 3MEGA 3DLGA 1C1AA 4CEAA 3ZX2A 3S3OA 1MWMA 5MLCQ 4CIGA 2E1ZA 5AFUH 4CJPA 4CEEA 3P4IA 4X62K 1NMNA 2XRIA 4JV5K 1WAFA 3CFPA 5FLXO 4YOWA 3SLCA 1SKRA 1HKGA 3C6TA 1LAVA 3RTVA 2ITGA 1NJXA 3EKUA 4L3QA 3K9KA 3KJVA 3OYNA 1P8ZA 3V4IA 1HQUA 3MX2A 2WTUA 3EZWA 4JRPA 3HJFA 3L3UA 1C0UA 3L8BA 1KQSM 3VERA 4M41A 4FWMA 2UXDK 2DY4A 1Z26A 1NOZA 3O5BA 4BQZA 2AP1A 3MX5A 1KSPA 3VEOA 3KIOA 1RBSA 3PSIA 4KHWA 1J9AA 1NKEA 3K2PA 1RT1A 4ILGB 4PA1A 4B8AB 4BDYA 1U49A 3HBTA 2JGUA 3O4WA 4O8UA 3KD1E 4LSNA 3ZT2A 4CD3A 3HSCA 4JK9A 1HNXK 4K0KK 3A5NC 3G71N 4X66K 1A5VA 4WYBA 3MN7A 3CCVN 4IEEA 1JLEA 1X3NA 3J7YP 3M8RA 3CJ7A 2QI2A 1R0AA 3O8MA 3CERA 3QESA 2ZF5O 1SKWA 2V51B 5KRSA 4GNIA 1SL0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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