3ULEB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869 and atp
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
351
structure length
236
Chain Sequence
CDNGTGFVLLTEPPMAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRHMVFLGGAVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP
rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 65
structure length 236
sequence length 351
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3uleB02
4XH4A 4QS8A 3WQUA 1S22A 3C7NB 3I8BA 3QB0A 2AP1A 3CHWA 1K8KA 5LJVA 5AQFA 4DCHA 4I6MA 3AAPA 3M3ZA 3A0IX 2NZTA 1BOTO 3C7NA 3GE1A 3VERA 3FZMA 3IDHA 3LDOA 3FE1A 3H1VX 2QM1A 1NMDA 5AQLA 4CZJA 3SMSA 4CD3A 4L3QA 1JCGA 1TYQA 2A40A 4CZKA 4Y0WA 4MLHA 4IWVA 5EY4A 5AQWA 3P4IA 4H5RA 2Q0UA 2ASOA 1XQSC 4B1UB 1V4TA 5AZIB 1KXPA 3FZFA 3U4LA 5BRFA 2DPNA 4JD2A 1T44A 5EOYA 4BC4A 4K25A 4CD1A 5AQPA 3VEVA 4AM6A 4YDUC 3VETA 2F9TA 3H46O 4H5TA 3MCPA 3ID8A 1NGDA 3QBWA 2E8AA 3ENOA 2NRHA 3M1FA 1BA1A 3H3OB 1WOQA 5EVZA 3BUZB 3A5NC 2YHWA 2FSJA 2GTDA 5AZJA 5KPRA 3KVGA 5AQXA 1GLDG 3DAWA 5E84A 4BR5A 5AQRA 2V52B 3CJ1A 3QICA 1Z6RA 2ASMA 2YCHA 2YHYA 4H03B 4B1YB 3VEYA 3O1WA 5LY3A 1MDUB 2CH6A 1NGCA 1X3MA 2CGJA 4KBOA 5CE3A 2F9WA 2PBDA 4CZLA 1SQKA 3J8AA 3GG4A 4LC9B 4BR2A 3SK3A 1GLJO 2E2NA 1GLEG 2VCPA 3MDQA 4CI6A 3MMVA 4EHTA 3O80A 2P9UB 2CH5A 3EO3A 5F1XA 3RSEA 1GLFO 1DEJA 3BF1A 1NGFA 4BC5A 4CZHA 4BRLA 5BR9A 4DQ8A 4AM7A 4NO7A 2WUSA 3R6MA 3L4IA 3QBXA 5FPEA 4FOEA 4BGBA 3HBTA 3C0BA 5F2RA 5FPDA 2QWQA 1YVNA 4PKHA 3VF6A 3SMPA 3GDQA 4ISEA 3VF2A 4M7XA 3VEWA 3VF4A 3VPZA 4WQ4C 3FLCO 3HI0A 2Q36A 3CQYA 4DB3A 1T6CA 2UYTA 3U9DA 4K42A 4CBXA 4XH5A 5TKYA 5AQMA 2D1KA 3LL3A 5JLFA 4BRFA 2QWOA 2Q97A 1GLLO 2ITMA 3AY9A 3HTVA 2GWKA 5FPNA 2CGKA 5LJWA 3HSCA 1QQOA 3D2EB 5AQOA 4BRHA 1NGAA 2P9SB 2HMPA 2V7YA 4BQLA 5BN8A 5BRHA 4BRNA 3KHYA 3ULEA 2A5XA 3GBTA 2Q31A 4CZEA 3CQXA 2FSNA 5AQQA 4EIAA 3MN9A 3DJCA 1K8KB 4CZFA 3O1BA 3CJAA 2QXLA 5KPTA 3ZEUA 4XH1A 1NGBA 4FWMA 4I6MB 1NGHA 5AQTA 4H0OA 3VESA 2FSKA 3ATVA 1NWKA 3LDNA 1ATRA 4BVPA 1SAZA 1TYQB 2ZF5O 1H1VA 1CZAN 3JXUA 1JCEA 5AQJA 4A2AA 3IFRA 5AQVA 3ZX3A 5ADXH 5AFUA 3BF3A 4JD2B 4RWTA 4M7YA 3EL2A 2GWJA 4IXCA 2D0PA 1DKGD 3CJCA 2ZGYA 3I33A 4O8KA 1QZ6A 2P9IA 3CJBA 4WQ5A 1KAZA 1ZXOA 3JS6A 3H45C 1X3NA 3VGMA 2H3GX 5AZJB 2HF3A 3BP8A 3ZX0A 4FWLA 3FZLA 2E20A 4BROA 1GLCG 4FOIA 3UKUA 1RFQA 2EWSA 4FO0A 1U2VA 4PL7A 4JAXA 4NB4A 2YI1A 3ATUA 2A3ZA 1GLAG 2P9LB 1JCFA 2A42A 5BPLA 1C0FA 3QMLA 4WYBA 2P9NA 3R9PA 2P9LA 1IG8A 2IVPA 2QWRA 1BO5O 1NGGA 4C23A 2YJFA 2QWPA 4FWKA 4MO5A 4H0YB 1ATNA 3ENHA 4QS7A 4H5VA 3RSEB 2E2OA 2FLOA 1Q18A 5AQUA 4ISGA 3W0LA 5B8HA 1XUPO 4XEIA 4BRAA 3A8YA 2I7PA 4IZ9A 5JICA 1QHAA 3OHRA 1S3XA 2P9PA 3QFUA 5AR0A 4BC3A 3O6WA 5KQ8A 3CERA 3M6GA 1NGIA 4H0XB 3BEXA 3EN9A 4YDUA 3MN6A 4FWSA 4H0TB 3MN7A 3QDKA 2E88A 1BWFO 3DXMA 4FWRA 1X9JA 4MO4A 2PAVA 3IUCA 3FFKB 2E1ZA 2VWBA 5KQDA 1ESVA 3FR0A 3B8AX 3CJ9A 2KHOA 3FZHA 2IVOA 4H0VB 5E26A 3ZETB 5AQNA 3LDLA 1YUWA 4FWQA 5AQYA 3ULEB 1E4GT 3A5LC 5AQIA 4RTFD 5EXWA 1C0GA 4A61A 4FSVA 3ZETA 2FF6A 1BG3A 2QWNA 1NLVA 4RCHA 3WQTA 3LM2A 3SJHA 2D4WA 3UKRA 3VENA 3ZEUB 4BRGA 4Z94A 1WUAA 1T6DA 3ZX2A 2Q1NA 1NGJA 4BR9A 3EKSA 3EKUA 4JN4A 1HKBA 3WXJA 3VGKA 4BG8A 3DWLA 2A6AA 2QW9A 4BQZA 2YHXA 3CJ7A 5AQHA 4BRIA 3FGUA 1YAGA 4J8FA 4JNEA 4BR0A 1GLBG 3U9ZA 4H5WA 3WUHA 1HLUA 4HTLA 2J4RA 3O5BA 1ATSA 3W3DA 4MLEA 4B1VA 1BDGA 4BRCA 4B1ZA 1DGKN 2P9IB 2OANA 1MA9B 1ZC6A 1P8ZA 4PL8A 2GUPA 2VYPA 2V51B 4WQ4A 3H3NO 1Z05A 4EHUA 5AQKA 4IJAA 4EAHD 1HPMA 1IJJA 2V7ZA 3IMXA 3KZBA 3VEXA 3UKUB 3D7EO 4FWOA 3WXLA 1U2VB 1NM1A 1R59O 4DHYA 2I7NA 4BRDA 3L0QA 3L6QA 4CJ7A 1BUPA 1KAXA 1XC3A 2P9KB 5ADXA 4QS9A 4JHDB 2IIRA 2CGLA 4FPBA 2P9NB 4BVOA 1NGEA 3UB5A 3UE5A 2QWLA 2GEMA 1BU6O 1J6ZA 3LM9A 1HKGA 5BPMA 4B9QA 2P9KA 4M63C 3VOVA 1ZBSA 4GY2B 4JHDA 3H1QA 5AQGA 2BTFA 2W41A 1OKJA 3HM8A 1YXQA 4BC2A 2IVNA 1HUXA 1LCUA 2HOEA 2E2PA 4H5NA 5AZIA 3H6EA 4F9OA 1BA0A 3VGLA 4IJNA 4ISFA 3MK6A 2W40A 1NBWA 1V4SA 3U8XA 3O4WA 1Y64A 1QQMA 3A5MC 3D2FB 2P9PB 3DXKB 3QFPA 3WXKA 3F9MA 1HX1A 4PKGA 1RGIA 3O8MA 4CBWA 4BREA 3D2FA 3WEEB 2E1YA 3DXKA 4E1JA 5AQZA 3AARA 1LOTB 4BR7A 1E4FT 3DXMB 3FZKA 4BRMA 4CZIA 3EZWA 5AQSA 4FWPA 2BUPA 3AAQA 3S41A 4HWIA 2FXUA 4BRPA 4FWNA 4A2BA 1TUYA 3WEEA 4H0PA 4BRKA 2AA4A 3WT0A 5I9EB 2YJEA 1MWKA 4B1WB 5JMVA 4CZMA 5KPZA 1EQYA 1HJOA 2Q2RA 2QWMA 5BN9A 4CZGA 3CETA 5JLHA 1KAYA 2D0OA 5BRDA 2P9UA 2Q0RA 4B1XB 3UKRB 1HKCA 3G25A 4BG9A 3WXIA 5BREA 4A62A 2FF3B 4BGAA 1QQNA 5ELZA 5FPMA 5EX5A 3CIPA 1SZ2A 1TUUA 1U6ZA 3HZ6A 4IO8A 1RDWX 4K43A 4FPAA 4FL9A 4PKIA 1QZ5A 2ZGZA 4WQ5C 2NLXA 3TPQA 2A41A 3CI5A 3GOIA 5BPNA 4EFHA 4BRQA 4O5FA 5F0XA 1MWMA 2ZWHA 3A5OC 3TU5A 3R8EA 3VEZA 3GL1A 2HF4A 2GELA 4CBUA 4K41A 2E2QA 3D2EA 3LDQA 3O08A 1D4XA 3LDPA 5AFUH 2P9SA 3VEOA 1G99A 4GNIA 3MN5A 3SLCA 2ASPA 4BR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLWA 4CJKA 3B6OA 3AVNA 1NK5A 2NRZA 4CJLA 3E9LA 2WOMA 4EP4A 5AQFA 4DV3K 1Q8IA 3RMBA 4I6MA 3M3ZA 3KK2A 2NZTA 3GE1A 3NCIA 1RBRA 3PY8A 3IDHA 3FE1A 1NMDA 1UAXA 1IBMK 1JCGA 4BY9C 1A5WA 4MLHA 4IWVA 5AQWA 4M41A 2Q0UA 1XQSC 3C6TA 4FYDA 5IT9O 3MXJA 4JI7K 1KXPA 4KHSA 5BRFA 1OH7A 1T44A 5EOYA 3C65A 4KV8A 4MQ3A 4KTQA 3VEVA 4AM6A 4FW1A 1EWQA 2E8AA 3SAHA 4HTUA 4G9ZA 2YX6A 1BL3A 3LP0A 4W5NA 3OS2A 1B9DA 3A5NC 3HL8A 1U4BA 4CHOA 5AQXA 1QHTA 3DAWA 4LF5K 4TSXA 5AQRA 2V52B 3CJ1A 1UA0A 3QICA 4M3UA 3PX4A 4CK1A 2YCHA 2HBMA 2HHWA 2NUBA 1EWRA 1KVAA 3VEYA 1X3MA 2C1GA 2ZD1A 5AJ3K 4A5BA 4CZLA 1FKOA 3GG4A 2E2NA 1GLEG 4IDKA 2VCPA 3MDQA 3VQDA 3E1YA 4CI6A 3K59A 4EHTA 1QTMA 2O8BA 2P9UB 3RMAA 3EO3A 4DR1K 1GLFO 3BF1A 4E72A 4BRLA 3RR7A 1TKDA 3D0PA 1BHLA 1LWCA 2ZE2A 3R6MA 3WXMB 3L2UA 4B9SA 2DTUA 4DFKA 4HHTA 3C6AA 4CEEA 1HNVA 3LANA 5F2RA 4CE9A 3CMEN 4NXNK 2KW4A 4UQGA 2EX3A 4YOTA 4LY7A 1KVBA 4WQ4C 3AA3A 3CQYA 5C0YA 1T6CA 4K42A 3AA2A 3HPGA 5FLXO 1I39A 3NF7A 5AQMA 3ITHA 5J2PA 4AHSA 3K5MA 4JKDA 1GLLO 2ITMA 1VQMN 4YFUA 5HRPA 4JI5K 4CJ5A 1BCOA 4BRHA 3O9TA 4DU3A 3C6HA 2RE2A 4DQQA 1YIJN 3A2FA 4EZ9A 4EIAA 4KH6A 3DJCA 3TSQA 3NF8A 2JGUA 2BANA 5KPTA 3ZEUA 4UY8O 4I6MB 4BACA 1WSEA 1HNZK 4Q0BA 3LDNA 5CHIA 3CFRA 1H1VA 3JXUA 4IG0A 4CFDA 3TAPA 4FXDA 1BI4B 4WCEL 3KLHA 4AILC 1HNIA 4JI1K 1VQ5N 3KD1E 4OKKA 2GWJA 4LH4A 1R0AA 4W5TA 1TL1A 2PZSA 1TKTA 2E6LA 4IOAL 1KAZA 2XHBA 1ZXOA 3JS6A 1X3NA 2XO7A 3AVBA 4HUGA 4DF8A 4BEBA 4CGHA 2W6KA 4BROA 1GLCG 1W0HA 1VSKA 2P5GA 2EWSA 4FO0A 4PL7A 3CCJN 4JAXA 3ATUA 1KD1O 2A3ZA 1JCFA 3SAFA 2KTQA 1LAWA 2RPIA 1WB9A 3F73A 3PX0A 4IOXA 1IKXA 1XNQK 3T69A 1TKZA 2VG5A 4CF9A 2QWRA 5GIOA 4NYFA 4C23A 1HRHA 4OJRA 4FWKA 2O8BB 1FK9A 1YTAA 2P1JA 1VHXA 3ENHA 3I56N 4HUEA 2YKMA 3KWIA 4OGCA 3ASMA 1P90A 3I8DA 3M8SA 3OYBA 5GAHP 4BRAA 3A8YA 1WSGA 4CF2A 3AVAA 4JI0K 4BC3A 2P9PA 3QFUA 4IEEA 4WF9L 5KQ8A 3AO5A 1EKEA 3DLLL 1S1TA 2KFNA 4FLTA 3EN9A 3DLHA 4KHUA 1XHZA 1VQ4N 3MN7A 2E88A 4B9NA 4B9UA 5HBMA 1C0TA 1J54A 4DTXA 4ZTJA 4KHNA 5I3UA 3FFKB 3P31A 2E1ZA 1NK4A 2VWBA 5KQDA 4JKBA 3FR0A 4C8MA 1VQ9N 4FJMA 1GOBA 3LPTA 4U7BA 3CCQN 5M1KA 1YUWA 1RNHA 2QKBA 4DV6K 2NRRA 2HB5A 4H8KA 3HP6A 3NAEA 3HJFA 5EXWA 1C0GA 1NLVA 4CHYA 3LM2A 1LW0A 3C94A 3SJHA 2C1IA 4CCHA 3ZEUB 1D5AA 1X1PA 2OCEA 3ZX2A 2Q1NA 1NGJA 3NF9A 4JN4A 2RHKA 3OYMA 4OPAA 3PUFA 4JNEA 1O1WA 4J8FA 3WNFA 4BR0A 4BDYA 3WUHA 4ILGB 1I94K 1N34K 1HLUA 4DSEA 5CZ2A 2G8VA 4B1VA 1BDGA 4BRCA 1DGKN 3TAMA 2HW3A 1RBSA 4KTWA 4XJXA 1ZC6A 4PL8A 2V51B 1BGXT 1YHQN 2HHUA 4EHUA 3KK3A 2IOCA 1HPMA 1IJJA 3CFPA 3IMXA 2XY7A 3VEXA 3D7EO 4FLYA 4FWOA 3WXLA 4DHYA 1NM1A 3PIPL 3CCVN 4CEOA 1BUPA 4OO1J 2YNFA 1JLFA 4QS9A 1N5YA 2B5JA 5HRNA 1NGEA 4GV6A 1J6ZA 1ZBLA 1HKGA 1D9DA 5BPMA 1YJWN 3F5TA 4FLUA 4M63C 3EZ5A 3QEIA 2GBZA 5HLFA 5AQGA 4AH9A 3SUPA 2W41A 3SCXA 4XIUA 4JI3K 1HUXA 4WFNL 1VQPN 1NOYA 3DM2A 5CYQA 3TANA 1BA0A 3VGLA 1TV6A 4ISFA 2W40A 2W42A 3G10A 4KH4A 2P9PB 3QFPA 3K5LA 4ELTA 3F9MA 1HX1A 3AVIA 3TSPA 3PO4A 4BREA 1ZBUA 1BQMA 2DFEA 4GVMA 2X6NA 3D2FA 3AARA 3S5TA 1E4FT 4FJLA 2ITGA 4GKKK 3NVKA 5I42A 2BUPA 3AAQA 1YJNN 2FXUA 3THWA 1T7PA 2AA4A 3WT0A 5I9EB 2YJEA 1E3MA 5JMVA 4IFEA 1HNWK 4GW6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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