3ULEB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869 and atp
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
351
structure length
236
Chain Sequence
b'CDNGTGFVLLTEPPMAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRHMVFLGGAVL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP
rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 65
structure length 236
sequence length 351
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3uleB02
3VGMA 3O5BA 5KPTA 4K25A 4KBOA 3WQUA 3C7NA 3L4IA 2E8AA 4FWNA 4BR4A 4CBUA 2IVOA 3ENHA 3WEEB 2FSKA 1S22A 5LJVA 3IDHA 1KAXA 4XEIA 4ISGA 2GUPA 5AFUA 1QHAA 4BC2A 5TKYA 1RFQA 3KVGA 3GE1A 3EN9A 3VOVA 3LM2A 3ZEUA 3O4WA 3D2EB 3UE5A 1QZ5A 1SQKA 5BRHA 3RSEB 4WQ5C 3VETA 3UKRA 1K8KA 3VGKA 5LY3A 2FSNA 2E2NA 1P8ZA 2GWKA 3VEVA 3H45C 3G25A 3SMPA 1CZAN 1ZBSA 3WXJA 2UYTA 2I7NA 2YJEA 2QWRA 3ATUA 2ASPA 3O1WA 5AQHA 4BRFA 4MO4A 5AQQA 3L0QA 2F9WA 3R6MA 2Q2RA 5FPDA 4H0XB 3WUHA 3EZWA 2D0OA 2V7YA 3U8XA 4IWVA 4QS8A 2E2OA 4FWLA 4LC9B 4BC3A 1NGAA 3CJBA 2A5XA 1QQMA 4H0TB 1MA9B 2KHOA 2QWMA 3S41A 3JS6A 4BRMA 3SK3A 4CZJA 3O1BA 4EFHA 2QM1A 2DPNA 1NGHA 4BQLA 3H1VX 4FWSA 5AQKA 5I9EB 5AZIA 5AQYA 2QWLA 3LL3A 2Q1NA 2P9NB 1TUYA 2A3ZA 4XH4A 1TYQA 4E1JA 3U4LA 3SLCA 4RCHA 3I8BA 4QS9A 2E2QA 2FF6A 3MK6A 3ZX2A 2Q31A 2V52B 4F9OA 4FWKA 5AQJA 1BO5O 2QWPA 5BN9A 3VGLA 3VEXA 3CJ1A 1X3MA 4A62A 4BRPA 4O5FA 4CI6A 2P9LB 3EKSA 3EO3A 1QQNA 2QWNA 3ID8A 2CGJA 4BC5A 4YDUC 1LOTB 3DXKB 1BWFO 2YCHA 3GL1A 3ENOA 1BDGA 4H5WA 3H1QA 4B9QA 5ADXA 1NMDA 3WQTA 1YAGA 3MCPA 4AM7A 4A61A 3AY9A 4CZIA 3FZMA 4YDUA 2F9TA 2P9PA 3ZETB 1YVNA 4H5RA 5AQLA 3VEWA 1D4XA 3CJ9A 1NLVA 3QBXA 2P9PB 3H3OB 4H5TA 4JHDB 3GBTA 4BROA 5JLHA 3O6WA 2ASMA 2Q0RA 2V51B 3SMSA 3VEOA 4WYBA 3WXLA 5JMVA 4I6MB 2A42A 2CH6A 1H1VA 5KPZA 3MDQA 1C0FA 1DEJA 2IVPA 3CJAA 4H5VA 1ATRA 4BR2A 1GLCG 3MN7A 1XC3A 2AA4A 4JN4A 1U2VB 5EXWA 3WEEA 3M1FA 4M7XA 5JLFA 2E20A 3O08A 3UKUB 5KQDA 4FWPA 4JAXA 4K42A 2P9SB 3C0BA 3WXIA 2J4RA 3BP8A 1R59O 4L3QA 3IUCA 4BVPA 3VF4A 3CETA 4J8FA 3SJHA 4A2AA 3WXKA 4BR5A 1JCFA 3D2EA 1XQSC 2HF3A 3RSEA 1WOQA 2YHXA 5E84A 5E26A 3HI0A 5AFUH 5JICA 4B1VA 1BUPA 2P9KB 4IXCA 5BN8A 2H3GX 4BC4A 3A5LC 3MMVA 3DAWA 2BUPA 3W3DA 4PKHA 3CQXA 3FLCO 3H6EA 4WQ5A 4H5NA 4QS7A 4CZGA 5FPMA 4BRAA 4XH5A 4PKIA 4BR0A 4H0OA 3QFUA 3AARA 4MO5A 1HKBA 3CQYA 2GEMA 3O8MA 5AQMA 5BR9A 3D2FB 4BRNA 1ZXOA 3A8YA 4PL8A 1V4SA 4BRKA 2I7PA 3WT0A 3FZHA 4BVOA 5AQOA 4MLHA 3GOIA 1SZ2A 2D0PA 5AQGA 3BF3A 5AZJB 3U9ZA 4WQ4C 5AQVA 4BRDA 3HBTA 2P9NA 3LDLA 4Y0WA 5AQIA 1JCEA 3ZX0A 3M3ZA 5BPNA 2E1ZA 1BA1A 4WQ4A 4CZLA 2GELA 1BOTO 3VEYA 3F9MA 1HPMA 1NGFA 1HUXA 4FOEA 4JD2B 3TPQA 1J6ZA 5KQ8A 4DB3A 5EOYA 2NRHA 1BG3A 1RGIA 4FWOA 3FE1A 2Q0UA 3M6GA 1MWKA 1T44A 2QXLA 2AP1A 3DXMB 3CERA 3QICA 2P9LA 1KAZA 1DKGD 4FWMA 2Q97A 5EVZA 5AQUA 2FF3B 3H3NO 3DXKA 1EQYA 4CZFA 2HOEA 3R9PA 5AQTA 4JNEA 4BRIA 4FPAA 2ZWHA 5AR0A 1Q18A 1Z6RA 2EWSA 4HTLA 3EKUA 2FSJA 5KPRA 1HJOA 1G99A 3ZETA 2HF4A 2VWBA 1GLLO 4CZHA 3QB0A 2D4WA 4K41A 4DCHA 4IJNA 3TU5A 4RWTA 4B1YB 1NGCA 2A40A 2NZTA 4FSVA 5EX5A 4BGBA 4JHDA 1Z05A 4BRLA 2PBDA 2WUSA 3A0IX 5AQXA 5ADXH 3LDQA 2E2PA 1NGDA 1QZ6A 4FWRA 4I6MA 3VF2A 3LDPA 3OHRA 2ZGZA 5BRFA 1C0GA 3HSCA 2ZF5O 2P9UB 3VERA 5BPMA 2CH5A 3AAQA 1KXPA 2A6AA 1NGJA 1U2VA 3ULEB 3B8AX 3HTVA 4AM6A 1LCUA 1U6ZA 3UKUA 1OKJA 2P9SA 4GNIA 4IJAA 1JCGA 1MWMA 3VENA 3P4IA 2D1KA 4DHYA 4H0VB 4CZEA 3BEXA 4IO8A 3FR0A 3L6QA 4K43A 1NWKA 2YHYA 5ELZA 4GY2B 4CZMA 1XUPO 3O80A 4FOIA 2P9KA 4H03B 2CGLA 4BRHA 5BREA 4CZKA 1YUWA 4EHTA 2P9IA 4B1UB 4PL7A 2GWJA 3LDOA 4O8KA 5AQPA 3C7NB 5AQFA 3J8AA 2P9IB 4BGAA 3FZLA 5F2RA 4ISEA 1GLFO 3JXUA 4H0PA 4H0YB 3CI5A 4MLEA 3D2FA 4ISFA 5F1XA 4IZ9A 1NBWA 1S3XA 4CD1A 4CJ7A 4Z94A 4CBXA 1GLDG 3VPZA 3MN5A 3ZEUB 4EHUA 2IVNA 3AAPA 3QFPA 5BPLA 5FPEA 2W40A 4NO7A 4PKGA 3ATVA 5FPNA 2FLOA 3UKRB 1K8KB 5AZJA 1NGEA 1HKGA 2QWQA 2GTDA 3FGUA 4BG8A 3CJ7A 4BG9A 3MN9A 2QW9A 1NGGA 5AQNA 2CGKA 5AQRA 1GLBG 2PAVA 3VF6A 3I33A 4JD2A 4BRGA 1X9JA 3HM8A 3MN6A 3H46O 2E1YA 1E4GT 3KHYA 4BQZA 4B1WB 3BUZB 1GLEG 1GLAG 1Y64A 3DXMA 2E88A 3U9DA 4BR7A 2HMPA 4M63C 4RTFD 3LM9A 1BU6O 1ATSA 4M7YA 4EAHD 2Q36A 4FWQA 4BREA 3A5OC 1HLUA 1E4FT 1NGBA 3IFRA 5B8HA 1ESVA 4BRQA 3W0LA 3CIPA 5BRDA 3FZKA 3A5NC 2BTFA 5LJWA 1HKCA 2ASOA 5CE3A 3A5MC 1MDUB 5AZIB 3CJCA 3FZFA 4FO0A 2VYPA 2YJFA 4C23A 3EL2A 3GG4A 3KZBA 3FFKB 3QBWA 5EY4A 2A41A 2OANA 2YHWA 3VESA 1TYQB 3ZX3A 3GDQA 3VEZA 2W41A 4FPBA 2FXUA 4HWIA 1QQOA 1TUUA 1T6DA 1IG8A 1X3NA 4BR9A 2ITMA 2V7ZA 2P9UA 1ZC6A 2YI1A 1IJJA 2IIRA 3HZ6A 5AQSA 3ULEA 1HX1A 1YXQA 3DWLA 3LDNA 4CD3A 3IMXA 1NGIA 4B1XB 3DJCA 1WUAA 4B1ZA 5F0XA 1SAZA 4NB4A 3CHWA 1NM1A 3UB5A 1GLJO 4DQ8A 2VCPA 4EIAA 2NLXA 1RDWX 4A2BA 1BA0A 3D7EO 5AQWA 3R8EA 1KAYA 2QWOA 4FL9A 4BRCA 3QMLA 4XH1A 4CBWA 1ATNA 3QDKA 1DGKN 5AQZA 3BF1A 1T6CA 1V4TA 2ZGYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3J81O 3RMDA 3O5BA 2XRIA 1LW2A 4O55A 2E8AA 3AO3A 3OYDA 4DWIA 1KLNA 4DU3A 4KHPK 4JRQA 1KCFA 4PQUA 4XEIA 1U45A 4OLAA 3L3VA 3CQ8A 4CFDA 4NYFA 4AHRA 3CCQN 2HMIA 3VQPA 1MU2A 5HLFA 3C6AA 3KVGA 3F2KA 3ZEUA 1A5WA 3O4WA 3D2EB 2XY5A 4CIGA 1TK5A 2VQEK 1TK8A 1EETA 1P8ZA 3SYZA 5HRRA 3G25A 1KC8O 3MECA 3NH2A 1FKOA 2D0AA 1B9DA 2I7NA 2OTJN 2ASPA 1VQPN 2F9WA 3S5TA 3DYAA 3THYA 2IAJA 1VQLN 3ZSVA 4FVMA 4JI5K 3KLEA 4BDZA 3QEVA 4QS8A 3CCMN 4LC9B 4BC3A 1C1CA 3CJBA 1J54A 2A5XA 1SKWA 1WSJA 1KVAA 1NJIO 3O1BA 1VSFA 2QM1A 3TSPA 2DPNA 1N33K 5I9EB 4FM2A 3LL3A 2P9NB 4L8RB 1C1AA 3O3GA 4IG0A 1DTQA 3U4LA 4RCHA 2FF6A 1JXBA 3CXCM 3OYEA 4CFAA 2PY5A 2V52B 5BN9A 4BRPA 4C8OA 3V4IA 3H08A 3MWTA 5KRTA 4O5FA 1KVCA 4CI6A 4FLXA 4RW6A 3ID8A 2E4LA 4DV1K 2KZMA 4BC5A 4GW6A 4DF8A 4DV0K 4GKJK 3O9RA 3ENOA 3MEDA 4YOVA 5ADXA 2IDOA 3WQTA 2GV9A 4A61A 1HQEA 5C15A 4DSIA 4DTJA 3SPZA 4CEAA 1ZBLA 1IBKK 2R7YA 1OVYA 1U04A 2YNFA 1QVGM 3SQ1A 4IDKA 3HL8A 4BROA 5JLHA 1WSIA 3V9ZA 2HNZA 2KFZA 2Q0RA 4DV2K 3CCVN 3SMSA 4WYBA 2D0BA 3LP3A 4AHCA 3O9SA 1H1VA 4M3UA 3QEIA 4PWDA 1CZBA 4H4MA 1XC3A 4JN4A 3WEEA 3P39A 3VQ4A 3CCRN 1LAWA 5JLFA 4GKKK 3O08A 4B8AB 1L3TA 4LH4A 4K42A 3NFAA 2A1RA 3PO4A 5HBMA 5C24A 3WXIA 2NRWA 1D8YA 3SJHA 1FK9A 4EP4A 4MDAA 1K73O 5C0YA 2YNIA 4E0DA 5KI6A 1XQSC 1WSHA 4A57A 4DV6K 4KH5A 2X6SA 2YHXA 2IS3A 4AILC 4B08A 1M1KO 4CGIA 5M1OA 3PY8A 1BUPA 4DFPA 3LAMA 4WFBL 2H3GX 3A5LC 3DAWA 3ZSYA 2NRXA 3FLCO 4WQ5A 4ELVA 2OYQA 5FPMA 1SKRA 3S3OA 3QFUA 1LV5A 4E7JA 4MO5A 1NKBA 4ID5A 5JVHL 1T3VA 3C94A 4BRNA 3QETA 1IKYA 3T1HK 4WE1A 3TTDA 4PL8A 4J2AA 4A5AA 4WCEL 1U47A 3WT0A 3M5RA 3TSQA 3TR8A 3NAEA 1QVFM 2KTQA 3EE8A 3K9JA 2NRRA 5AQGA 3VQCA 3OYJA 4CF1A 1S1WA 4BRDA 3O4NA 5AQIA 4TSXA 4Z4IA 2KLAA 3ZX0A 1JLAA 4WQ4A 4HHTA 1NMNA 4FOEA 3TPQA 4E7IA 1T05A 4DMNA 4DB3A 1WAFA 4DSLA 4FWOA 3NF7A 2AJQA 3CERA 3K5LA 1KAZA 4DV4K 1X9MA 3PIOL 3CCEN 1UA1A 3HJFA 4JYAK 3DXKA 1IG9A 3PIPL 1TAQA 4FPAA 4BRIA 1C0MA 2ZWHA 4M3TA 1Q18A 3SQ0A 4PA1A 2HF4A 1NGCA 5JS1A 5EX5A 4CHQA 4IOAL 2PBDA 1BL3A 5AQXA 4CHYA 1NKCA 2O8DA 1QZ6A 2ZGZA 1I3AA 5KGWA 2YX6A 5BPMA 3SUQA 3AAQA 3L2VA 2QI2A 2A6AA 1YI2N 1NGJA 1U2VA 4BDYA 1RILA 4AM6A 3CC4N 3IKMA 5GADP 1JL1A 1SUQA 3OW2M 3NGYA 3AA5X 2OPPA 3NVKA 4Y1DA 4OPHA 2WC9A 2XO7A 3G0ZA 4Z4GA 4DHYA 4CZEA 4KHNA 1N5YA 1XMQK 4IEEA 1FXXA 5ELZA 4CFBA 2BGGA 4CZMA 4RW7A 4YOWA 4AF1A 3TABA 5BREA 5J2PA 4N5SA 5I3UA 4KI6A 3THWA 4M42A 4KHWA 4DSJA 3VQ9A 4EHTA 3PX4A 3EE9A 4PL7A 4DSFA 2G8IA 3G71N 2OPSA 5F2RA 4XJXA 3OYMA 2HHUA 2FC0A 4DV3K 4WFNL 4ISFA 4GV9A 2RHKA 3M8QA 3AGKA 4Z94A 1ZBFA 1XMOK 1ASVA 3VPZA 4NYNA 3V9SA 4IFVA 2IVNA 2BANA 1HR0K 1Q8IA 5FPEA 3T3FA 4CJ4A 4FJGA 1NGEA 2QWQA 4W5NA 3CJ7A 1VRTA 1KQSM 1VQKN 2CGKA 4AHVA 5JVGL 4DTUA 2PAVA 4DLEA 3MN6A 2E1YA 1DT9A 1VRUA 2UUAK 3SUPA 3KHYA 3AO4A 1GLAG 3DXMA 4KRFA 3IS9A 4BEBA 1JLFA 2HMPA 2IOCA 1T8EA 3SAFA 2O4IA 1BU6O 3CPEA 3LZJA 2ITGA 4F2SA 5HRNA 3NDKA 1NGBA 3LP0A 3W0LA 3D6RA 2O4GA 3A5NC 3ZLJA 4I2QA 4DR6K 5LJWA 1HKCA 5CE3A 3QNOA 1S9GA 4M3RA 3C95A 3FZFA 2HB5A 3EL2A 3KZBA 4BWMA 4EZ6A 3DM2A 1TYQB 3C6UA 3VEZA 4FJIA 1SKSA 3MEEA 1T6DA 2ZQBA 5M1NA 2ITMA 3L4QA 2V7ZA 1ZC6A 1U48A 3OYFA 3LP1A 3THXA 3V6DA 3G10A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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