The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
PLGSSDLGITAIALYDYQAAGDDEISFDPDDIITNIEMIDDGWWRGVCKGRYGLFPANYVELRQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Lysozyme C
|
| publication title |
Lysozyme contamination facilitates crystallization of a heterotrimeric cortactin-Arg-lysozyme complex.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Hydrolase, protein binding
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| total genus |
13
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-11-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K2M A; 4OMM A; 1SHG A; 1U3O A; 2DRK A; 2K9G A; 2KRM A; 5GJW B; 4Z8A A; 4FSS A; 1CKA A; 1IO6 A; 4LUE A; 1S1N A; 1E6H A; 1NLP C; 4R0K A; 3EG0 A; 2AK5 A; 2GNC A; 2LJ1 A; 3VRZ A; 3EG1 A; 2YUP A; 2J6F A; 1UTI A; 3VS4 A; 2CUB A; 2LZ6 B; 1XOV A; 2DL4 A; 2LQW A; 2D1X A; 1WXT A; 2AZV A; 1W70 A; 2DX1 A; 4ZNX A; 1PRM C; 5HCK A; 2IIM A; 3H0H A; 3SHW A; 2CT3 A; 1UFF A; 1ABO A; 1OPK A; 1ZUK A; 3NHN A; 3REB B; 3U23 A; 1M3C A; 2KYB A; 1UE9 A; 1PRL C; 2FRW A; 2K3B A; 2K6D A; 1WLP B; 1W6X A; 2KNB B; 4JJD A; 4J9C A; 4WCI A; 4DEY A; 3VS6 A; 2YT6 A; 2FPE A; 2HDA A; 1H92 A; 2CSI A; 2KBT A; 4RTY A; 1JXM A; 1SRL A; 1FMK A; 2CT4 A; 4J9D A; 1VYU A; 5FW9 A; 3EGU A; 2JS2 A; 3VRY A; 4RTX A; 4RTW A; 1PWT A; 2RN8 A; 1NEB A; 5I11 A; 3KFV A; 2FO0 A; 1AWJ A; 2RQW A; 4RTT A; 1JQQ A; 1U5S A; 1AZG B; 1YCS B; 2QDL A; 4J9B A; 4AG2 C; 3RBB B; 1X27 A; 2YSQ A; 2ROL A; 2VVK A; 3M0T A; 1ZUU A; 1Z9Z A; 1UHF A; 1MV0 B; 4CC7 A; 1OV3 A; 1LCK A; 2CSQ A; 2F2V A; 3VS0 A; 1Z9Q A; 3VS3 A; 3PVL A; 1YWP A; 2BZX A; 5GJV B; 1UJY A; 2JM8 A; 2OJ2 A; 2GGR A; 3CQT A; 2JXB A; 1HJD A; 1K0S A; 2ROT A; 4IIO A; 1TUD A; 1UEC A; 3LH5 A; 3UF4 A; 3VS5 A; 1SPK A; 1B3Q A; 2YUO A; 4LN2 A; 1GRI A; 4HVW A; 1QKW A; 2EYX A; 1QLY A; 1Y0M A; 2MOX A; 3GBQ A; 4AG1 C; 1K1Z A; 1X69 A; 1UJ0 A; 1H8K A; 2VKN A; 1HD3 A; 1E6G A; 2RQV A; 2AKL A; 1WI7 A; 4OMO A; 2B86 A; 4JZ3 A; 3NMZ C; 4RTZ A; 2A37 A; 2SRC A; 2MCN A; 3A98 A; 2I0N A; 1ZX6 A; 1I0C A; 3M0Q A; 4GBQ A; 1ZSG A; 4F16 A; 2X3X D; 2KR3 A; 1V1C A; 1NM7 A; 1GL5 A; 2ED0 A; 2D8H A; 2F2W A; 1KIK A; 1NEG A; 1WFW A; 1M30 A; 2FPD A; 3M0P A; 2KE9 A; 2DVJ A; 4HXJ A; 2G6F X; 2CRE A; 2JW4 A; 2X3W D; 2DA9 A; 2O9S A; 2RMO A; 4LNP A; 1X2K A; 3EHQ A; 2BZY A; 1VYT A; 2D8J A; 2D0N A; 2DNU A; 1RUW A; 1B07 A; 4KRT A; 1GFD A; 2YUN A; 2KRS A; 1KFZ A; 1BU1 A; 1WXU A; 2HSP A; 2KT8 A; 2O31 A; 2J7I A; 2KRO A; 1OOT A; 1GBR A; 2ABL A; 1UUE A; 1GCQ C; 3TSZ A; 1OPL A; 2J6O A; 2EYW A; 1YNZ A; 4HVV A; 1SHF A; 4J9E A; 5EC7 A; 1CKB A; 4JJB A; 2A28 A; 1K4U S; 1TUC A; 2E5K A; 1ARK A; 2KXC A; 3H41 A; 4JZ4 A; 2A08 A; 4HVU A; 1ZBJ A; 2J06 A; 1GBQ A; 2LP5 A; 1X6B A; 2L3Q A; 1PKT A; 4RTU A; 2LQN A; 1UDL A; 1BK2 A; 2LMJ A; 2RQR A; 2RNA A; 3M0S A; 3C0C A; 2L0A A; 5ECA A; 1YN8 A; 4AFS C; 1SSH A; 1QWE A; 1GFC A; 2JTE A; 1MV3 A; 3EHR A; 1T3L A; 4OML A; 2BTT A; 1JO8 A; 2FG0 A; 2DIL A; 2J6K A; 5L23 A; 1PNJ A; 5IXF A; 3UA6 A; 1K0X A; 1JXO A; 2YUQ A; 1RI9 A; 1X43 A; 2FEI A; 3JV3 A; 3UA7 A; 2GTO A; 2CH4 A; 3M0R A; 5FWC A; 4D8D A; 2C0O A; 1T0J A; 1H3H A; 2FRY A; 3O5Z A; 1AWX A; 2J05 A; 1AOJ A; 2JS0 A; 3IQL A; 2P4R A; 4DEX A; 4ESR A; 2YDL A; 2DL5 A; 2EW3 A; 2OAW A; 2C0I A; 2XMF A; 2H8H A; 4K11 A; 1WDX A; 3RNJ A; 1PHT A; 4AFQ C; 4CC3 A; 2W10 A; 4J9F A; 2KT1 A; 3EG2 A; 2EYY A; 2JT4 A; 3VS2 A; 2KGT A; 2CUD A; 3TVT A; 4F14 A; 1GCP A; 2EVR A; 2A36 A; 1BB9 A; 1M8M A; 1EFN A; 2DLP A; 2ECZ A; 2HCK A; 1QKX A; 3NPF A; 3I9Q A; 2EKH A; 4J9H A; 2V1Q A; 1Y57 A; 2C0T A; 4J9I A; 4A63 B; 1AD5 A; 1YP5 A; 1I07 A; 1K76 A; 3I5S A; 4J9G A; 1AEY A; 1FYN A; 1T3S A; 1GCQ A; 1AZE A; 5IHN A; 4JPB W; 2PTK A; 3PVQ A; 1SRM A; 4OMP A; 2K7A A; 5I22 A; 1AWW A; 2DE0 X; 2EPD A; 2RPN A; 1M3B A; 1TG0 A; 1J3T A; 3PE0 A; 2DF6 A; 4JJC A; 3NGP A; 1KSW A; 2LCS A; 1HSQ A; 1U06 A; 2DMO A; 2LJ3 A; 1AVZ C; 3VS7 A; 2K79 A; 2KRN A; 1E7O A; 1UG1 A; 1WIE A; 1OEB A; 1VA7 A; 3ZL7 C; 5IHK A; 4Z89 A; 2KXD A; 1X6G A; 1JU5 C; 1WA7 A; 1ABQ A; 2V1R A; 2DRM A; 3TSW A; 2PNI A; 1KJW A; 1QCF A; 2DL8 A; 2DL3 A; 2L3P A; 4Y92 A; 2HBW A; 1JEG A; 4AFZ C; 2OI3 A; 1M27 C; 2L3S A; 1I1J A; 2O9V A; 4LUD A; 2M51 A; 2KYM A; 1NYF A; 3H0I A; 2LNH B; 2RQU A; 3QWY A; 2O2O A; 2EQI A; 4OMQ A; 2M0Y A; 1RLQ C; 3ULR B; 4HCK A; 1X2Q A; 3I5R A; 2DBK A; 2DJQ A; 2GBQ A; 2JM9 A; 1UHC A; 1RLP C; 2ENM A; 2RQT A; 2DM1 A; 1WYX A; 3FJ5 A; 1ZUY A; 4QT7 A; 1M3A A; 4E6R A; 4D8K A; 4GLM A; 2EGA A; 5IH2 A; 1ZLM A; 3EG3 A; 4RTV A; 3VS1 A; 2DL7 A; 1A0N B; 2KEA A; 4F17 A; 4ORZ A; 1QWF A; 4CC4 B; 2CH4 W; 2O88 A; 1WX6 A; 1NYG A; 4CC2 A; 2EGE A; 1K9A A; 2HEQ A; 4OMN A; 2DBM A; 2DYB A; 3H0F A; 2JMA A; 4EIK A; 3THK A; 2RF0 A; 1G83 A; 1NG2 A; 2EYZ A; 5IXB A; 3SEM A; 2LJ0 A; 1YWO A; 2AZS A; 4AFU C; 3QWX X; 1AWO A; 3R6N A; 4Z88 A; 2SEM A; 2NUZ A; 4M4Z A; 1UGV A; 5FWB A; 4LE9 A; 2F2X A; 2LX7 A; 2GQI A; 2JMC A; 2EBP A; 2MIO A; 4X1V A; 3I35 A; 2EGC A; 1SEM A; 2GTJ A; 2CDT A; 1G2B A; 3REA B; 4RUG A; 1N5Z A; 1CSK A; 1WXB A; 2W0Z A; 4IIM A; 1T0H A; 1VYV A; 2BZ8 A; 2ED1 A; 2FPF A; 2NWM A; 1NLO C; 1W1F A; 2AKK A; 3M0U A; 1MUZ A; 2PZ1 A; 1BBZ A; 2L2P A; 2VWF A; 1PKS A; 3UAT A; 5IHI A; 2ESW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DXC A; 5GAN 4; 2R57 A; 4FSS A; 4EMK C; 1IO6 A; 1E6H A; 1NLP C; 1R8O B; 1C0M A; 3EG0 A; 2K5L A; 2RK1 A; 2LJ1 A; 4A4K A; 3EG1 A; 3BE3 A; 1VQ5 A; 2RA2 A; 2YUP A; 3CCU Q; 5DLO A; 4MDW A; 1UTI A; 3PNW C; 3VS4 A; 5FLX E; 2CUB A; 2LZ6 B; 1M1K C; 2AZV A; 4OGE A; 2LTO A; 3CCQ A; 1PRM C; 4XTU A; 3SHW A; 5CKB A; 5D6Y A; 2CT3 A; 3WXM B; 3M55 A; 4MZT A; 3EFR A; 1UE9 A; 2FRW A; 2XHC A; 1WLP B; 2KNB B; 4WCI A; 4DEY A; 4B9X A; 1YIJ A; 5GAO n; 2HDA A; 1H92 A; 3RDV A; 2KBT A; 8ATC B; 5M9O A; 5GAN 3; 2RI2 A; 1Q86 C; 2QXF A; 3CBP A; 2QQB A; 3JB9 F; 4M77 E; 1OX8 A; 3ZEH A; 5KYU B; 1NEB A; 1WPY A; 4M78 E; 4BE2 A; 3C12 A; 4PJM A; 3V7R A; 1U5S A; 1RI0 A; 1ZBX A; 1AZG B; 2RHX A; 2LQ8 A; 1O75 A; 2DER A; 4II1 A; 5D7U A; 5LJ5 g; 3HP9 A; 3QDF A; 1R0C B; 1ZUU A; 2PU9 B; 2PVD B; 4D6W A; 1G5V A; 1D09 B; 3VS3 A; 2QA4 Q; 4M7A F; 1UJY A; 2JM8 A; 3S3M A; 1VQP A; 3CQT A; 3JB9 D; 3CCS Q; 1X75 C; 2VB6 A; 5KYY A; 1WZO A; 2FZC B; 2QEX A; 3DB4 A; 4FT4 A; 4IIO A; 2XDP A; 4LD6 A; 1IRX A; 1QLY A; 2RI3 A; 2VAS A; 4PJN A; 1WHL A; 2RO0 A; 3GBQ A; 4AG1 C; 1VQ9 Q; 1MGQ A; 1VQ7 Q; 1H8K A; 1VOM A; 2GCX A; 3RUX A; 3PIO A; 2AKL A; 4JZ3 A; 1RAB B; 3NMZ C; 2A37 A; 4J5Y A; 5GAO m; 2MCN A; 1G3T A; 4J6Y A; 3CXC S; 1ZX6 A; 1I0C A; 2CP3 A; 1YJ9 Q; 1ZSG A; 1I8F A; 2KR3 A; 1V1C A; 1NM7 A; 2ED0 A; 3MP1 A; 3EFS A; 2XI9 A; 1WFW A; 3M0P A; 4M77 D; 2EWN A; 4O5V A; 5GAN j; 4C92 F; 1YHQ T; 4E7L A; 3NTI A; 1UGP B; 5GMK m; 2CRE A; 4M78 D; 2XU8 A; 2DA9 A; 2QAZ A; 1VIF A; 3KUF A; 1N8R C; 4M75 F; 4HCB A; 1TUG B; 1X2K A; 2D0N A; 4BI8 B; 1YJW T; 3I56 T; 4LDW A; 2MWP A; 2WSC E; 1GFD A; 2YUN A; 1X6O A; 2HSP A; 1RAC B; 2KRO A; 4NL2 A; 1IHV A; 2DIG A; 1WHM A; 3OYN A; 4EMH A; 3AT1 B; 1OPL A; 2EYW A; 2ATC B; 1SHF A; 1VQ4 A; 3AHU A; 3CCQ Q; 3CCV A; 4J6X A; 1EIF A; 4IUR A; 2V8K A; 4BE0 A; 2X9H A; 1K4U S; 4V2S A; 2AIR B; 4PFZ A; 3HKS A; 3MKD A; 1NZ9 A; 1ZBJ A; 1OZ3 A; 3JCM W; 5GAO q; 1GBQ A; 1LOJ A; 4RMO A; 1YIJ Q; 4RTU A; 4LDX A; 1AT1 B; 1OU8 A; 3O8V A; 2RK2 A; 2RQR A; 3C0C A; 2NUT B; 3A8H B; 4YTL A; 1QVF A; 2B8A A; 3VV0 A; 2RJC A; 1VQN A; 2CP0 A; 1QWE A; 1GFC A; 4E7K A; 2HSE B; 1T3L A; 2BTT A; 1FMW A; 1PNJ A; 4X9C A; 5IXF A; 3CMA T; 4RCC A; 1N9R A; 2FEI A; 3UA7 A; 3SD4 A; 1M4Z A; 2GTO A; 2QDY B; 2DAQ A; 4E7S A; 4D8D A; 1T0J A; 2E4H A; 4IKF A; 3FC3 A; 1BIB A; 4N0A A; 2JS0 A; 3IQL A; 4KT0 E; 2P4R A; 3RER A; 2HL5 C; 5CQY A; 4PJL A; 1VQP Q; 2DL5 A; 5IAY A; 4K11 A; 2VGN A; 2EJG A; 3J7A F; 5GAM d; 2NYS A; 1D0Y A; 1N9S A; 2QEX Q; 4M7D A; 4CC3 A; 2CZ6 B; 2W10 A; 3EG2 A; 2FZK B; 1VQL A; 2KGT A; 2CUD A; 3QPH A; 5GAM f; 2EJ9 A; 4F14 A; 1V76 A; 3CCR T; 2EVR A; 3V7C A; 1BI2 A; 3HL8 A; 2QQ9 A; 1LPL A; 3MJX A; 1EFN A; 1KC8 U; 3I9Q A; 2E10 A; 2XDD A; 1AD5 A; 2V26 A; 2A0F B; 1T3S A; 4M7D C; 1SRM A; 2E64 A; 1AWW A; 2LDM A; 3V7S A; 1M3B A; 1J3T A; 3PE0 A; 3NGP A; 4IUV A; 4OF1 A; 2EFI A; 3CC4 T; 3ZFJ A; 5GAO r; 3V8L A; 2KRN A; 3M9Q A; 4FSX A; 5IHK A; 4Z89 A; 4J6W A; 2KXD A; 3G71 T; 1RAD B; 2V1R A; 4XU1 A; 1KJW A; 2DL8 A; 2BE9 B; 4AFZ C; 2OI3 A; 3BFM A; 2L5Q A; 3JB9 J; 2KYM A; 1NYF A; 4KBM B; 1KQS P; 2RQU A; 2QTV A; 4B6M A; 2KI7 A; 4PJO G; 5GAM h; 1H64 1; 1IB8 A; 3VKI A; 3G7Z A; 4OB3 B; 1VQ4 Q; 3CCV Q; 2RQT A; 2DPP B; 3G4S A; 5GAM e; 5KYW B; 4DOV A; 3FJ5 A; 1M3A A; 3UT1 A; 4C5H A; 5IH2 A; 3EG3 A; 1YI2 A; 1D3B A; 2EIF A; 4F17 A; 4ME7 A; 2OTL T; 1I4K 1; 2CH4 W; 2DXT A; 1WX6 A; 5GAO p; 1BI0 A; 2OTJ A; 3R6O A; 1Y07 A; 1BI3 A; 1ZSZ A; 2JMA A; 3SB2 A; 4C8Q G; 3M54 A; 3THK A; 1Q95 G; 1NG2 A; 2RF0 A; 3OSV A; 5IXB A; 2PVO B; 1VQN Q; 4KUI A; 4E7Z A; 3FRN A; 2SEM A; 3EGX B; 3CCU T; 2JZ2 A; 2OTL A; 2KVQ G; 2QG9 B; 3OYH A; 2LX7 A; 3OQ5 A; 3OYA A; 5FRM A; 3VUZ A; 4FCY A; 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3CEY A; 4DBH A; 2O4X A; 4F7U G; 1Q86 U; 2DXB A; 4FU6 A; 2HMA A; 1X27 A; 1UB4 A; 2YSQ A; 2EAY A; 2ROL A; 4MDX A; 3M0T A; 5LJ3 j; 1UHF A; 1MV0 B; 1YJ9 T; 3CCM A; 1OV3 A; 3Q1J A; 1YI2 Q; 1LCK A; 3P8H A; 2F2V A; 1Z9Q A; 4J7I A; 3CPW S; 2MI6 A; 1D1C A; 1YWP A; 2BZX A; 2PUO B; 1XTD A; 5KYX B; 2OJ2 A; 2Y90 A; 2JXB A; 1HJD A; 1K0S A; 2OTJ Q; 2XK0 A; 4VUB A; 2RHU A; 1TUD A; 5D6W A; 3OS0 A; 3QII A; 3TQ7 P; 1K73 R; 2RJF A; 2YUO A; 2DD4 A; 4EMK A; 1GRI A; 2RD1 A; 1QVG A; 1Y0M A; 1VQ5 T; 1X69 A; 2OTL Q; 1UJ0 A; 4M7D D; 2DTO A; 1HD3 A; 2RHI A; 1PD0 A; 1E6G A; 2RQV A; 4KUD K; 1BCO A; 1VQO A; 2JUF A; 2DFU A; 2B86 A; 2DZ9 A; 3CCQ T; 1XNI A; 1BKB A; 2L3R A; 2RHZ A; 1EZZ B; 2LCC A; 2X3X D; 4ANJ A; 3UDC A; 1GL5 A; 3ER0 A; 2D8H A; 3A8O B; 4HKE A; 5LJ5 d; 1M30 A; 2HBP A; 2DVJ A; 2LT4 A; 3CCE A; 2Z0W A; 3MP6 A; 5LJ5 f; 2JW4 A; 1V29 B; 1YIJ T; 2GQV A; 1LVK A; 2CYZ B; 2BZY A; 2K2V A; 1VYT A; 3JCM f; 3LWH A; 1IHW A; 2M1H A; 1RUW A; 4F7U B; 1RAA B; 3M4Y A; 3OB9 A; 1QVP A; 1KFZ A; 1WXU A; 1GXI E; 1G3Y A; 2KT8 A; 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