The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
PLGSSDLGITAIALYDYQAAGDDEISFDPDDIITNIEMIDDGWWRGVCKGRYGLFPANYVELRQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase, protein binding
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| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Lysozyme contamination facilitates crystallization of a heterotrimeric cortactin-Arg-lysozyme complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Lysozyme C
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| total genus |
13
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-11-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MV3 A; 2KNB B; 5EC7 A; 1AWJ A; 3RNJ A; 2EVR A; 1K0X A; 2EBP A; 2ESW A; 4JJB A; 2J7I A; 1T3S A; 1TG0 A; 4J9H A; 4RTV A; 3REB B; 2FPF A; 4LNP A; 4OML A; 1BBZ A; 2GBQ A; 1YCS B; 1QKX A; 2DIL A; 3PVL A; 2DL5 A; 1KJW A; 3M0P A; 1NEB A; 1HJD A; 1OPL A; 2KR3 A; 2DJQ A; 2V1R A; 1SSH A; 3NGP A; 1X69 A; 2KXD A; 1SHF A; 1G2B A; 2AKK A; 4HXJ A; 1NG2 A; 3ZL7 C; 1UTI A; 1ZLM A; 1ZUY A; 2YT6 A; 3VRZ A; 4AFQ C; 4RUG A; 2HDA A; 1WX6 A; 1M30 A; 2KBT A; 4M4Z A; 1YWO A; 1UHF A; 1MUZ A; 2DM1 A; 2JS0 A; 1UJ0 A; 2ECZ A; 4RTW A; 1YWP A; 2C0O A; 1QCF A; 3H41 A; 4ZNX A; 2EQI A; 1WXB A; 2K79 A; 2PNI A; 3U23 A; 3KFV A; 1RLQ C; 1PRL C; 4GLM A; 2JMC A; 4GBQ A; 4J9B A; 1S1N A; 1W1F A; 2RQU A; 4JZ3 A; 1JXM A; 2CRE A; 2G6F X; 1AEY A; 1FMK A; 1ZUU A; 3M0R A; 1BK2 A; 2LJ3 A; 5FW9 A; 3PVQ A; 4LUE A; 1ABQ A; 3JV3 A; 2K2M A; 1K1Z A; 4AFS C; 1SPK A; 3UA6 A; 4X1V A; 1A0N B; 3EG2 A; 1PKS A; 1AVZ C; 3ULR B; 4AFZ C; 3O5Z A; 2ED1 A; 2D0N A; 2FPD A; 2KRN A; 2LQW A; 2YUN A; 5ECA A; 2J6O A; 5FWB A; 1UUE A; 2JMA A; 1MV0 B; 3EG1 A; 3I5S A; 4LN2 A; 2FRW A; 2DA9 A; 1AD5 A; 2DL7 A; 2W10 A; 2I0N A; 2KXC A; 1GCQ A; 1QWF A; 2CT4 A; 4J9G A; 2CT3 A; 3THK A; 1K76 A; 1VYT A; 4OMM A; 2K9G A; 2A08 A; 5FWC A; 2KEA A; 1K4U S; 2DE0 X; 1WFW A; 4Z89 A; 1X6B A; 2D8H A; 2DVJ A; 2O31 A; 5I11 A; 2RMO A; 2CUB A; 1K0S A; 2M51 A; 1VYV A; 2CUD A; 2FPE A; 4CC3 A; 1E6H A; 3H0I A; 1BB9 A; 4WCI A; 3LH5 A; 2HEQ A; 4JPB W; 2ROT A; 2NUZ A; 1BU1 A; 4J9C A; 1B3Q A; 1SRL A; 2DNU A; 1NYG A; 2EYW A; 2EKH A; 4CC2 A; 1WXT A; 4HCK A; 2H8H A; 4AG1 C; 2YUQ A; 1KFZ A; 1N5Z A; 1M3A A; 4Z8A A; 2E5K A; 2GNC A; 4DEY A; 1WDX A; 2FRY A; 2JM9 A; 3VS5 A; 2CH4 W; 5GJW B; 3M0U A; 2A28 A; 4RTU A; 5HCK A; 1X6G A; 1X2Q A; 4OMQ A; 3TVT A; 1UJY A; 2F2W A; 2J6F A; 5I22 A; 1WXU A; 1X2K A; 1AWW A; 2KYB A; 2LP5 A; 4JJD A; 1GRI A; 2KYM A; 1TUD A; 2EYZ A; 2O9V A; 1H8K A; 3QWX X; 4J9I A; 3PE0 A; 4ESR A; 2KT8 A; 1OV3 A; 5IHN A; 1GBQ A; 3R6N A; 3UAT A; 2O2O A; 2KGT A; 3TSZ A; 2DRK A; 1U5S A; 2OAW A; 3UA7 A; 1M8M A; 2CDT A; 2JTE A; 2ABL A; 2RNA A; 1SHG A; 1QKW A; 4D8K A; 2A36 A; 2DL4 A; 5IHK A; 1U3O A; 4CC7 A; 1NM7 A; 2J6K A; 2JM8 A; 1ZUK A; 2GQI A; 4LUD A; 4E6R A; 4FSS A; 2DX1 A; 1VA7 A; 4HVV A; 1RI9 A; 2JW4 A; 2X3X D; 3H0F A; 3M0T A; 2DRM A; 3I35 A; 1G83 A; 2AK5 A; 2RPN A; 4J9D A; 2FEI A; 4RTY A; 1NLO C; 2DMO A; 2F2X A; 1WIE A; 3VS0 A; 2RF0 A; 2LCS A; 3RBB B; 2L3Q A; 1AOJ A; 2L3S A; 2ENM A; 5IHI A; 4DEX A; 5IXB A; 1I0C A; 2DLP A; 1PWT A; 1ARK A; 1ZSG A; 1NEG A; 1QWE A; 2DL8 A; 2YSQ A; 3M0Q A; 4HVU A; 1JXO A; 2EPD A; 2SRC A; 1AZG B; 2J06 A; 1GCQ C; 1U06 A; 4QT7 A; 1OEB A; 2LJ1 A; 4KRT A; 2QDL A; 3IQL A; 2OJ2 A; 2O9S A; 3EHR A; 2K7A A; 4J9E A; 3VS6 A; 1I07 A; 4OMN A; 1WA7 A; 1M3B A; 4JJC A; 1ZX6 A; 1AWX A; 1GFD A; 1ABO A; 2KRS A; 2RQW A; 1PHT A; 1WLP B; 2MCN A; 1E6G A; 1UG1 A; 3VS2 A; 4AG2 C; 1SRM A; 3I5R A; 4F16 A; 2L3P A; 2VWF A; 3CQT A; 2EGE A; 2BZ8 A; 3NHN A; 2RQR A; 1JU5 C; 4IIO A; 3EGU A; 3EHQ A; 1T0J A; 2HBW A; 2V1Q A; 2KRM A; 4Y92 A; 2KRO A; 1EFN A; 1V1C A; 2BZX A; 2IIM A; 1I1J A; 2MIO A; 1W70 A; 2KE9 A; 4RTT A; 2M0Y A; 4CC4 B; 1LCK A; 1WI7 A; 1CKA A; 3NPF A; 2KT1 A; 3VS1 A; 4OMP A; 1NLP C; 2PTK A; 2B86 A; 2YDL A; 2LNH B; 2JXB A; 1NYF A; 2YUO A; 3VRY A; 2NWM A; 1Z9Z A; 3H0H A; 1HD3 A; 3QWY A; 5GJV B; 3TSW A; 2EYX A; 2D1X A; 2W0Z A; 4K11 A; 1ZBJ A; 1UHC A; 2A37 A; 1T0H A; 4A63 B; 1JEG A; 3VS7 A; 4LE9 A; 2O88 A; 1X27 A; 2GGR A; 5IXF A; 2D8J A; 2LMJ A; 2CSQ A; 2EGA A; 1VYU A; 2LJ0 A; 2XMF A; 3M0S A; 2AKL A; 1TUC A; 2VVK A; 2RN8 A; 1M27 C; 2EGC A; 4J9F A; 1GL5 A; 1HSQ A; 1UEC A; 2DL3 A; 1JO8 A; 1YN8 A; 2LZ6 B; 5L23 A; 4RTX A; 3NMZ C; 1CSK A; 2BZY A; 1RLP C; 1Y57 A; 2AZS A; 2CH4 A; 1PRM C; 1Z9Q A; 4AFU C; 1H92 A; 2RQV A; 1AZE A; 2ROL A; 4D8D A; 2RQT A; 4R0K A; 2P4R A; 1AWO A; 2YUP A; 1UFF A; 1K9A A; 2HSP A; 2LX7 A; 4RTZ A; 4ORZ A; 2LQN A; 1OOT A; 1IO6 A; 2AZV A; 1PKT A; 2K3B A; 2BTT A; 1H3H A; 2JS2 A; 1E7O A; 2C0I A; 1UGV A; 2OI3 A; 1KIK A; 2JT4 A; 2CSI A; 1X43 A; 3I9Q A; 1W6X A; 2EYY A; 2DF6 A; 2EW3 A; 1RUW A; 5IH2 A; 4EIK A; 3SEM A; 2L2P A; 1FYN A; 1B07 A; 4F17 A; 4OMO A; 1J3T A; 1JQQ A; 1OPK A; 2DYB A; 2K6D A; 1WYX A; 2L0A A; 2C0T A; 2SEM A; 2DBK A; 1T3L A; 2FO0 A; 4IIM A; 3C0C A; 1CKB A; 1Y0M A; 1SEM A; 3UF4 A; 2PZ1 A; 3VS3 A; 1UE9 A; 1GBR A; 1GFC A; 1M3C A; 2FG0 A; 2HCK A; 2X3W D; 1GCP A; 3EG3 A; 1QLY A; 2VKN A; 3A98 A; 3FJ5 A; 1XOV A; 4HVW A; 1KSW A; 3REA B; 2GTO A; 2ED0 A; 2J05 A; 3SHW A; 1YP5 A; 1PNJ A; 4F14 A; 1UDL A; 2GTJ A; 1YNZ A; 2F2V A; 2MOX A; 4JZ4 A; 4Z88 A; 3VS4 A; 3GBQ A; 3EG0 A; 2DBM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1MV3 A; 4F7U E; 5EG2 A; 3RNJ A; 4DBQ A; 2RJC A; 2EBP A; 2ESW A; 2GQV A; 2RI3 A; 3CCS T; 2J7I A; 3CCV T; 4PLL A; 4J9H A; 5GMK j; 4LNP A; 4OML A; 1QVG P; 4XTV A; 2E10 A; 2GBQ A; 1PM3 A; 2HNI A; 3JCM g; 4M77 B; 2P0P A; 3OW2 P; 1VQ4 A; 3A1P A; 2DL5 A; 5LJ3 j; 4RG2 A; 1K73 U; 1OPL A; 4M77 F; 4QQD A; 4LXC A; 2AKK A; 2HZY A; 3RKY A; 1JJ2 A; 2DD4 A; 8ATC B; 3OYM A; 3ZEH A; 4HXJ A; 1OUL A; 1RAI B; 1NG2 A; 3ZL7 C; 5CAI A; 1UTI A; 2E41 A; 2X51 A; 3J80 E; 1M30 A; 3MP6 A; 1NE8 A; 2ATC B; 3OB9 A; 5IAY A; 1YWO A; 2JN0 A; 4M75 C; 4EMK A; 2CP5 A; 4RKU E; 1BCM A; 2ECZ A; 4RTW A; 3CMA T; 4X9D A; 3CCV A; 2C0O A; 1QCF A; 3H41 A; 3P8B B; 1VQO T; 2PVO B; 1WXB A; 2K79 A; 1IRX A; 3KFV A; 1RLQ C; 4GLM A; 4QW2 A; 3MP1 A; 1Q81 R; 4PK4 A; 1TOV A; 2QQS A; 2RI5 A; 3CEY A; 3EGD B; 5GMK m; 3CCJ T; 4M7D G; 1X75 C; 1AEY A; 3OYB A; 1BK2 A; 4J6X A; 2OTJ A; 1KHC A; 4M7A C; 5D6Y A; 5LJ5 e; 2KK4 A; 4J7F A; 1C0M A; 3JV3 A; 2QTX A; 3HRT A; 1SPK A; 4KUI A; 3FC3 A; 1EIF A; 2MAM A; 5FU6 B; 4WTO B; 4C5H A; 1AVZ C; 2ZGW A; 2D0N A; 2YUN A; 2J6O A; 2RHY A; 1N8R U; 1RAD B; 1D3B B; 3JCM h; 5LJ3 d; 1VQO A; 2LQ8 A; 2DA9 A; 1AD5 A; 3L2W A; 1Q86 R; 2BKD N; 1KC8 R; 2JTF A; 1YJ9 Q; 3THK A; 2QA4 T; 3UWN A; 4OMM A; 3ASK A; 5FWC A; 2KEA A; 4M78 A; 5CKE A; 2H3E B; 1K4U S; 2JTM A; 4ZGD B; 4Z89 A; 4XTZ A; 4LDX A; 4RCC A; 1K8A U; 3I56 Q; 4NS5 A; 1HXD A; 2M51 A; 1VYV A; 3PMT A; 1LPL A; 5IN1 A; 3LH5 A; 2EKO A; 4JPB W; 2ROT A; 2NUZ A; 3CCU T; 1QVF A; 4KUD K; 1VQ9 T; 3FIF A; 4KH0 B; 2EKH A; 1OU8 A; 4PJO A; 2M02 A; 2OTL A; 2VGN A; 1G8X A; 4DQ2 A; 2FL7 A; 5GAN 4; 4Z02 A; 3VS5 A; 3M0U A; 5HCK A; 3OA6 A; 1YJW A; 1JJ2 S; 2RK1 A; 1GXI E; 1UJY A; 1S72 T; 2KYB A; 2KYM A; 3OYG A; 1TU0 B; 2QQA A; 1AT1 B; 3TSZ A; 2DRK A; 3HRU A; 4EMK C; 4BI4 A; 1VQ9 A; 4PJO F; 3CPW S; 3OBW A; 3CBM A; 5A0D A; 2L3R A; 2LRQ A; 1SHG A; 1QKW A; 5J39 A; 2HKQ B; 1U3O A; 3QJY A; 4CC7 A; 2DX1 A; 1IHW A; 4C0F A; 1VA7 A; 4HCZ A; 2JW4 A; 3ZFJ A; 1YIT T; 4KH1 B; 3M0T A; 1OU9 A; 2DRM A; 1Q82 R; 3I35 A; 4E7H A; 2LCC A; 4J9D A; 2DER A; 2DMO A; 3MJX A; 2L3Q A; 1QVP A; 1NJI R; 3OYK A; 2LX9 A; 4J6W A; 2ENM A; 2WSC E; 1M4Z A; 3L2R A; 3EAE A; 1PWT A; 3VJP A; 2K4Y A; 5GAO q; 3CCS Q; 3CD6 T; 1NEG A; 4J6Y A; 3CCE T; 4E7Z A; 2DL8 A; 2YSQ A; 5KYY A; 1FX7 A; 4JRQ A; 5GAN e; 1OEB A; 1HYO A; 2RM4 A; 2O9S A; 1DJ7 B; 4M7D A; 4M78 C; 2EFI A; 1M1K C; 2VUB A; 1ZX6 A; 3DLM A; 1ABO A; 1W2B P; 1VQM T; 5GAN f; 1E6G A; 2XD0 A; 3VS2 A; 1SRM A; 3CQT A; 2EGE A; 2DEU A; 2E70 A; 4IIO A; 2K5L A; 1TUG B; 2R5M A; 4PJN A; 2HD0 A; 2V1Q A; 2XHC A; 1V1C A; 1I81 A; 2MIO A; 3CD6 A; 1VQN T; 2KE9 A; 3VU3 C; 1N9S A; 4CC4 B; 4R56 A; 3NTK A; 1B7T A; 1CKA A; 5D6W A; 3NPF A; 2KT1 A; 4M7D F; 1YHQ T; 4OMP A; 2PTK A; 2LNV A; 3S6W A; 3CCJ Q; 4PJO C; 1K73 R; 2NWM A; 1Z9Z A; 3GF5 A; 1HD3 A; 2L5Q A; 3G4S Q; 2JUF A; 2DKG A; 1N27 A; 2X4J A; 1KD1 U; 3S3O A; 3UPU A; 3GLX A; 1U1S A; 4A63 B; 2D9T A; 3VS7 A; 3OYY A; 2EYQ A; 5A0L A; 4Q5W A; 2LMJ A; 4C8Q C; 2EGA A; 3M0S A; 2DTI A; 2XK0 A; 4IUQ A; 1YHQ A; 3OMG A; 3CC7 A; 4OGC A; 1JO8 A; 5HY6 A; 4KBM B; 2LZ6 B; 4MML A; 2BZY A; 1RLP C; 1Y57 A; 2AZS A; 2M16 A; 4C92 E; 4XU0 A; 4NL2 A; 3LW5 E; 3MKD A; 4KGX B; 1MND A; 1NZ9 A; 2LDM A; 3RES A; 2LQK A; 3BDU A; 3EFO A; 2HSP A; 2LX7 A; 4RTZ A; 2OX7 A; 2BIV A; 2YRV A; 4R55 A; 3URG A; 1OOT A; 1OZ3 A; 3BW1 A; 2AZV A; 1N8R R; 5KYN A; 1OX9 A; 1PKT A; 2COZ A; 3CCU Q; 1VQK A; 2JS2 A; 3PT9 A; 1B34 B; 5GAN j; 2IG0 A; 2COW A; 2CSI A; 3HSB A; 1SKU B; 3I9Q A; 2DF6 A; 3J81 E; 1D0Z A; 2DXT A; 2D0Q B; 2X4Y A; 1JB0 E; 1ZA1 B; 3H9N A; 1D09 B; 3MO8 A; 4EPC A; 3MEU A; 2L2P A; 4M7D C; 3OYL A; 2ZPH B; 4N4G A; 4BE1 A; 1LJO A; 2HL5 C; 5GAM e; 3WVE B; 2CYZ B; 2K6D A; 3GP8 A; 4C92 B; 2C0T A; 1K8A R; 2FO0 A; 5J3B A; 3E1S A; 1CKB A; 3BY7 A; 2JJ9 A; 3CPF A; 4BB7 A; 2DK3 A; 2CP0 A; 1GBR A; 4HKE A; 5GAM f; 1WGS A; 4Y28 E; 2FG0 A; 2LCL A; 2PUO B; 3EG3 A; 3HFN A; 1QLY A; 2VKN A; 1XOV A; 4HVW A; 4A4H A; 3MEW A; 4BY6 C; 2XDB A; 1AHJ B; 2HKN A; 2J05 A; 1Q7Y C; 3SHW A; 1YP5 A; 4E7J A; 1UDL A; 1M90 U; 3VS4 A; 2DBM A; 1NBE B; 2KNB B; 4QQ6 A; 4F7U G; 1IHV A; 2HQH A; 1BCO A; 3M55 A; 2EVR A; 2MMP A; 3X25 B; 3D7S B; 4FT4 A; 1YCS B; 3SD4 A; 4M75 E; 3ER0 A; 1YJ9 T; 3M0P A; 2HAX A; 1IGU A; 2DTO A; 2KR3 A; 4O5V A; 5GAN d; 3FEO A; 1SHF A; 1G2B A; 5I2S A; 3TU4 K; 3OQ5 A; 5GAO m; 3CCE Q; 7AT1 B; 5A0G A; 5KYW B; 3QYG B; 1UGP B; 1ZUY A; 2V8I A; 4RCB A; 3FB9 A; 2HDA A; 2KQW A; 5GAN 8; 3M9Q A; 4M4Z A; 4M7A E; 4KGZ B; 3V8L A; 1UHF A; 1MUZ A; 1G3T A; 1FMW A; 1QP3 A; 4MMK A; 2YLB A; 2AT1 B; 1Y96 B; 2EQI A; 4JS4 A; 1YJ9 A; 3FDR A; 2V26 A; 4J83 A; 1KQ2 A; 3GNF B; 4GBQ A; 1S1N A; 2X9H A; 1V29 B; 4JZ3 A; 3EGX A; 3M0R A; 1M2V A; 1VQN Q; 4LUE A; 1RI0 A; 1PD0 A; 1O9S A; 4M75 B; 1ABQ A; 3I56 A; 3UA6 A; 2O4X B; 4AFZ C; 2FPD A; 2LQW A; 5ECA A; 2VXF A; 3JCM e; 4QKU A; 3C95 A; 2A3L A; 1D0X A; 2F69 A; 2JMA A; 5GAM j; 3M4G A; 3G6E Q; 4M77 E; 2MK5 A; 3I5S A; 4OF1 A; 3PGG A; 1H64 1; 2DL7 A; 1WHM A; 2KXC A; 3E9F A; 3ME9 A; 4M7A B; 1MMD A; 2RHU A; 2EJ9 A; 2CT4 A; 4J9G A; 5LJ3 g; 2A0F B; 5KE3 A; 1XTD A; 3JCM X; 4A4F A; 2CKK A; 1N9R A; 2RHX A; 4MZT A; 1W2B S; 1WFW A; 1Q95 G; 2DVJ A; 5I11 A; 2M9U A; 1UGQ B; 2EQK A; 1RAF B; 3EH1 A; 4C8Q G; 3CME Q; 3C94 A; 3H0I A; 1BB9 A; 4WCI A; 2YRD A; 3PFS A; 1WJQ A; 5GMK i; 4ATO A; 1QVF P; 1SRL A; 2DNU A; 1NYG A; 5AYF A; 3NTH A; 5HK0 A; 1KD1 R; 1WXT A; 3SWN A; 3JB9 G; 2ZZD A; 1KFZ A; 3QG1 A; 3OYF A; 4OB1 B; 2NUT B; 2GNC A; 4DEY A; 2FRY A; 2CH4 W; 5GJW B; 4RTU A; 3QII A; 4FCY A; 1X6G A; 2YHT A; 3VKI A; 2F2W A; 1OI1 A; 5I22 A; 1WXU A; 4ELZ C; 4C92 D; 1AWW A; 2LP5 A; 4JJD A; 5FRN A; 3JCM J; 4D6W A; 5GAM d; 2O9V A; 1BI3 A; 4J8O A; 3R6N A; 4E7I A; 3UAT A; 2KGT A; 1U5S A; 1M8V A; 3CCS A; 4F7U A; 2BE9 B; 2CDT A; 2MF2 A; 3CPW A; 2JTE A; 5LJ3 h; 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