3UOMA

Ca2+ complex of human skeletal calsequestrin
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
352
structure length
352
Chain Sequence
b'GLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEVDSMYVFKGDEVIEYDGEFSADTIVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKSKDSEHYKAFEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGFEFLETLKAVAQDNTENPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINTE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-capacity Ca2+ Binding of Human Skeletal Calsequestrin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calsequestrin-1
source organism Homo sapiens
molecule tags Calcium-binding protein
total genus 103
structure length 352
sequence length 352
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uomA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uomA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uomA02
3PR8A 3L9VA 4ZBAA 5EVOA 1YF0A 1SJZA 2OBIA 5KN3A 4IQ1A 2FLSA 4G9HA 1YY7A 5HFGA 2N5FA 3O3TA 1K0NA 3ZYWA 3BJ5A 5J3RA 3LSZA 4PNGA 3RBTA 4N30A 3A2WA 2EIQA 3EWLA 3IAS2 4K7OA 3G7IA 1GTAA 5JCWA 4KB3A 1PGTA 4PUFC 4ECCA 2CX3A 1QGVA 2YWMA 1K3OA 2IMDA 2LTKA 1KTEA 1Z6NA 3LQ7A 4N11A 1A0RP 4N10A 1PKWA 2DJ3A 4FYUA 4TKYA 3KD0A 3TJBA 3Q74A 3LJRA 2FWFA 3A3TA 1UA5A 4GTUA 4JZQA 3MWHA 1R7HA 6GSWA 3KXOA 1XWCA 1NHYA 1JZOA 2C4JA 1IYIA 1GNWA 4NV2A 4IBPA 4WETA 5ECOB 1ERTA 3J7Yb 4JR4A 3TCOA 4KGIA 2C80A 5G30A 1EEJA 1G6WA 4HZ2A 4KSMA 2C8UA 2H74A 2JL4A 5E4WA 2GZPA 4MPFA 3EYTA 3MSZA 1OE7A 5IIZA 1HNBA 4XCSA 1AAZA 3L9SA 1ZMAA 3M0FA 2VD0A 1MTCA 3D0ZA 3CYNA 3IAM2 1SU9A 1WMJA 4DSRA 1ST9A 5CNWA 2CX4A 1FB6A 5AN1A 17GSA 4K8MA 5LCZA 4JR6A 2R6KA 2C3QA 4HOJA 2VAFA 3WGDA 1GTUA 1PN9A 2WRTA 4NV5A 4OCEA 2FNOA 4FYCA 4RI6A 4GLTA 4KAEA 1SENA 5DALA 9GSSA 4POLA 1LJRA 1T4ZA 1X9MB 2R4VA 1A24A 1YF1A 3GA4A 3A2VA 4AJ8A 2QSIA 1EV9A 4D73A 3APOA 4GSTA 5JCGA 4OFNA 5IOXA 1XWGA 3WD6A 2YP6A 2AV4A 1XWBA 1M9AA 2X8GA 3D5JA 1GSYA 2VL2A 2IMKA 3U6VA 3C73A 3C8EA 1EOHA 1DBYA 3PH9A 1URMA 2H1GA 4ZB6A 1AC1A 2CA8A 1M2BA 3GUSA 5GAND 2X8HA 4XIHA 1KEBA 2OACA 1KBNA 2AYTA 3APQA 1Z7PA 2C0DA 4HZ4A 3ZVJA 1K0MA 1A2LA 3IR4A 1FW1A 3VPTA 3HJPA 3KP9A 2M46A 3U5RE 3HY2A 4XRDA 4KE3A 1NHOA 1SJ6A 1NSWA 1V58A 2MZCA 2HYXA 4MF5A 2V2GA 2B5XA 1OVNA 1PKZA 3TOTA 1PRXA 5HR1A 4PX1A 1O8WA 2GQLA 3GIXA 4I97A 2NPBA 18GSA 4IN0A 4HI7A 3GH6A 4Q5NA 2DIZA 3DMLA 2C1YA 2HSYA 2LJAA 3DXBA 1X0RA 3EINA 1Z9HA 1V98A 4L5LA 2QC7A 2H66A 4TR3A 1GRXA 1SYXA 2QKEA 4CHSA 2R2JA 4K6XA 1QXHA 4WEYA 2FHEA 4ML1A 4K1FA 1TKDB 4QL9A 3D22A 5ECHB 2P0GA 1CQHA 1FB0A 16GSA 1TOFA 3A2XA 3IPZA 1R5PA 1EOGA 3L78A 4ILFA 2WZ9A 4WF4A 5GSSA 4TXOB 2BTOT 2TRXA 3HXSA 1B4QA 2DIYA 1WIKA 3FZ9A 1T1VA 3DYRA 3KMNA 2HNLA 12GSA 1S3AA 3DVWA 1EGOA 1O6JA 3E0UA 5DJMA 1PMTA 4KX4A 3D6IA 3JCML 2J23A 2E2GA 2VCVA 3QOUA 1WOUA 2HXKA 5D9XA 4BPYA 3ZVJD 3F6FA 1VF4A 2GQKA 4KDYA 3FHKA 4TR1B 2L5OA 3GURA 3EC3A 1UC7A 5D96A 5A4WA 2AAWA 2FA8A 4YQUA 1QQ2A 6GSUA 4V1Ap 5DCGA 3QFAC 2GZZA 1LBKA 3P2AA 2VOCA 2JSZA 1O8XA 4BA7A 4N0ZA 3TB2A 4F0CA 1ZOFA 3GHAA 2K8SA 4O92A 3CSIA 5J41A 4ISDA 5FWGA 5E59A 5J4UA 4POBA 2WS2A 3IHQA 3NIVA 3GRXA 3QAWA 1O7UA 1ON4A 1J9BA 5H5RA 5B8AA 3HDCA 1VF1A 1OC3A 2O8VB 4WR4A 4I6XA 5LD0A 2LJKA 3NZNA 2CAIA 3HCZA 2C0FA 1GSFA 2WGRA 2H1AA 4GQCA 2CZ3A 3WT2A 4EC0A 2KHPA 1F3AA 6GSTA 1TI1A 1X9WB 2GSRA 1TTZA 1ZYEA 3CRUA 1YEPA 1GSEA 4FIWA 4ZB9A 4HQZA 5F07A 4PQHA 1T3BA 1W89A 1FO5A 2VLTA 1G7EA 2OJLA 1S3DA 2XC2A 5KN0A 6GSSA 1GTIA 3HD5A 2K9FA 3ZTLA 4TOPA 4EUYA 5IMFA 1A8YA 1V9WA 2I4AA 1FOVA 4HEA2 1AIUA 7GSSA 2H8LA 5ELGA 4XRAA 8GSSA 2LUSA 1SD9A 1V57A 5G5FA 2YNXA 2ZCTA 2EC4A 3RHCA 3GN3A 2H73A 4MZWA 2ES7A 2CQ9A 2RM5A 1JZRA 2PVOC 2P5RA 2OBKA 3KCMA 1B9XC 4H86A 4ZL7A 5B6NA 4X43A 5IMVA 1YEXA 2JACA 3Q18A 3KGKA 3FR9A 2CV4A 2YN1A 3TKRA 2I1UA 4JU5A 5DAKB 1TK0B 3VWVA 5IOWA 4WF5A 2XPEA 3RAZA 3KH7A 2IFQB 1JLVA 4F2IA 4XHMA 5DQYA 2L6DA 1VF3A 3EMPA 1YQ1A 3UARA 1EGRA 4L0WA 4CW9A 1OC9B 2F3MA 1X9SB 3H79A 1BX9A 2H1DA 3DVXA 1R4WA 2RUFA 1Y25A 4Z7XA 1NW2A 3DKSA 4HUAA 3ZFBA 1K0DA 5HR2A 5C04A 3TOUA 3ZIVA 1YKAA 4XS1A 14GSA 4NMUA 3L4NA 1GP1A 3F4TA 2VLUA 4V1Ag 2FWHA 1ZGNA 5C00A 3ERFA 2F9SA 5JCUA 4BVXA 1V2AA 2KUCA 4EO3A 1XOBA 3HYPA 3D4TA 3FZ4A 4ZBBA 1R26A 3RDWA 3FY7A 1XW9A 3M8NA 5IPHA 3ZLPA 3EURA 2KP1A 3M9JA 2FGXA 2H6XA 4HDEA 3IRAA 3GSTA 4MMMA 1WWJA 1T7PB 5J9CA 1QUWA 1Y6EA 3ZL5A 3CBUA 3N5OA 4ID0A 4J56E 2OE0A 3VI7A 4JBBA 2X8CA 4FO5A 2HE3A 4YQVA 2B1KA 1OC8A 2ON7A 5JWOB 1ZCPA 4XS4A 1O85A 1TRUA 3KTBA 1F37A 3MAKA 2GSQA 5EY6A 4WBRD 1ERVA 3L9UA 5B7CA 2PBJA 2LRCA 4IP6A 2GGTA 2WULA 1GSUA 2YWOA 2LRTA 3F3RA 3QDNA 3PGTA 1VF2A 5ID2A 2IWTA 1T00A 2DLXA 2O85A 1JZWA 1GWCA 4KW6A 1Z7RA 1SK1A 2H70A 2JZTA 1QMVA 3TJFA 3MNGA 2WDUA 2FY6A 3N9JA 4LLRA 2F8FA 2HZEA 1THXA 4N0VA 2C3TA 4MJEA 4E8EA 4LL4B 5GAPD 4YH2A 4MJCA 5G1LA 1A2JA 3RHBA 5CREA 3RPNA 4LMVA 2B3SA 2PVQA 2LJRA 3VURA 2MMZA 3C1RA 2O89A 1G0TA 2N5AA 2XHFA 3IXRA 3GTUA 3F4SA 2PGTA 2VL3A 3QPMA 5D93A 5H5SA 2WFCA 1XW5A 3GX8A 1MD4A 2C3NA 3W8JA 4IW9A 3GKNA 1EP7A 2FWEA 3UIWA 19GSA 3C71A 2YWIA 5ECIB 4TR0A 4J57E 3UBLA 4EVMA 3IBHA 2A2RA 2K18A 2V41A 3K8NA 2B7JA 2O87A 2IJYA 1EZKA 5IM9A 4LL1B 2H19A 2VUPA 4K2DA 5DVBA 2JSYA 3I69A 1PX6A 2AB6A 4E8HA 4RQRA 3UOMA 2DSAA 4MPGA 2F8AA 2HRFA 4MP4A 3M1GA 5ECPB 2VL2C 2IPAA 2RLIA 3ZMKA 5F05A 4ZL8A 3FW2A 1N2AA 2MMOA 3GH9A 2MBSA 1MEKA 1HD2A 4KCEA 2L59A 4XTSA 3IOSA 4KCAA 1M0UA 5DALB 3QD9A 4GXZA 5DQSA 5CRDA 4MH2A 4IJ3A 1U3AA 1M7TA 4IKHA 4DEJA 3SBCA 5CYYA 6GSVA 2LQQA 1Z5YE 3O6TA 4D73B 3F6DA 4KUNA 2ZNMA 2OADA 1U6TA 3Q19A 4MJAA 1YJ6A 4BL7A 2H6YA 4JRRA 4IP1A 5CP1A 4I8BA 2LEGA 1RW1A 2K6VA 3BOAA 3FR6A 1V40A 2R5GA 2E2MA 3ED3A 5AISA 1AUCA 2Z9SA 4EDZA 2IMFA 4EL1A 3V1WA 2AHEA 3PINA 2ON5A 4KSOA 2EIOA 3LEFA 3L0HA 2XBIA 1GLQA 2IIYA 1DUGA 1FVKA 2DJJA 3FZAA 3US3A 1SKSB 2NDOA 1OKTA 3FKFA 5D8IA 2VCZA 3UAPA 1B4PA 2FA4A 4EXJA 3ME7A 4MF6A 1BG5A 1PL2A 1WJKA 1Z6MA 3LYPA 1G7OA 3HZ8A 4PGTA 1B9YC 2M72A 2H76A 5A5KA 2P5QA 4G10A 3TKSA 2YV7A 3WGEA 1TK8B 1AW9A 4EE0A 4KDUA 4O7HA 2HLSA 4AGSA 4GRFA 2H71A 2GDRA 5FT3A 3BD2A 5D9TA 1N8JA 3ZFLA 4HQSA 4F0BA 2RUEA 2BMXA 3QFBC 3KJYA 2R3XA 1U87A 5IMAA 5KEJA 3VLNA 3CRTA 3WT1A 2YCDA 1QK8A 4P3YB 3CTFA 3HJMA 3KP8A 3HJOA 3MDKA 4POMA 4F9ZA 3TKQA 1LU4A 2KOKA 3IK7A 2GSSA 3TRXA 2WB9A 3J7Yk 3W6GA 3E9JB 3HVXA 1K0BA 4TRXA 4NPBA 2YWNA 3I6AA 3UMAA 5JWQB 1PQNA 2GT6A 4KA0A 4JE1A 5D9WA 4J2FA 1M99A 3H93A 5CRHA 1XOAA 4GSSA 3CXGA 5A4UA 5ECLB 1BAYA 1A23A 4IVFA 2IMEA 22GSA 2CT6A 2JZRA 2HFDA 4AF2A 3P8WA 3F0IA 3HKRA 2EIRA 4Q5FA 4YAPA 1M9BA 1GLPA 2L5LA 2YJ7A 2PERA 1WE0A 5H5QA 3VI5A 1TXXA 1F9MA 1VRSD 3IV4A 4G19A 3IDVA 1K0OA 2L4QA 4I2UA 2C0EA 3KTLA 2C0GA 1X5DA 5DDLA 1WRYA 4HJMA 3KM6A 2BJXA 2LKUA 6GSXA 2I9HA 3DGQA 3QAVA 3P7XA 1G6YA 1PSQA 3FR3A 4HS1A 2L57A 3E3EA 3DD3A 2GLRA 1FAAA 1HQOA 1I5GA 4DSSA 1F3BA 1OC9A 1MDIA 1SJIA 2N5BA 4OO4A 1JLWA 2NTOA 1AQVA 4MDCA 2PPTA 1SK0A 2X99A 5IMCA 3KEBA 5L71A 1EP8A 4MH3A 1S3CA 4F82A 5ELAA 2MMAA 2PMTA 3WYWA 1GUMA 4XS6A 3APSA 4PURA 4OMVA 5IPGA 4OFMA 5D73A 4I2TA 2GVPA 1BJXA 3VWUA 5ENUA 3TJJA 3W8SA 4RUVA 1WPIA 3HVSA 1YKCA 5DBQA 1A8LA 1X5EA 4WBJA 1XWKA 2KP2A 2RM6A 4Q5QA 3FZ5A 2LNSA 1NM3A 3TKSE 3WGXA 4OFTA 3EU3A 3EVIA 4X0XA 3FRCA 3ERWA 2AJQB 2DJ1A 4MK3A 4OD7A 4ZBDA 2CZ2A 2D2ZA 4ZIJA 2LNTA 1H75A 5HR0A 3F4RA 1GULA 1K0CA 2J9HA 4BWSA 2CVKA 3TJKA 3TGZA 3HHVA 1I9DA 1TW9A 1BYEA 2E0QA 2CVDA 3VWXA 4IGJA 1WP0A 3UEMA 1XBSA 4K0NA 4IS0A 2PN8A 4ECBA 1TJDA 3GFKA 3TJGA 4PQ1A 4JEDA 4TN8A 1XXUA 2VL9A 1ZZYA 4MZCA 4NHWA 5G1KA 1GL8A 4GSNA 4IHUA 1CQGA 1XIYA 1USBA 3GL5A 5ABRA 4IJIA 1XCCA 1B48A 3LG6A 2H0GA 3CMIA 3OR5A 4LA1A 3VK9A 3IK9A 4WXTA 4EF0A 5IO0A 2YV9A 3ZZXA 5INYA 3GYKA 2GZYA 1K3YA 3IA1A 2TIRA 3LXZA 2M80A 4MCUA 5G31A 4MLYA 3GKKA 2F51A 2LS5A 3LFLA 5AIXA 1EV4A 1PX7A 5HQPA 2P31A 1F2EA 2L4CA 2FWGA 2PWJA 1KNGA 3FK8A 2REMA 5ECMB 2TRCP 3ISOA 4EKZA 2L6CA 5DJLA 3UL3A 3ZMLA 1ML6A 4XS4B 4WKWA 2DC5A 1TK5B 3C7MA 3G9BA 5F0GA 2H75A 2VCWA 1ERWA 2CVBA 3UBKA 4ECJA 3RPPA 5ECQB 1SYRA 2IL3A 1MD3A 4YQMA 2MMNA 3FEUA 3DEXA 3LORA 2VO4A 2H1BA 3ME8A 2JZSA 4EDYA 4TW5A 2JU5A 4NHZA 2HT9A 3UVTA 5ID2B 2H30A 3G7YA 2V6OA 4NXIA 2GS3A 2LRNA 4ML6A 4K7IA 4I5QA 2B1LA 3F8UA 4L0UA 2XBQA 3GL3A 2PUKC 4V2MA 1HNCA 1OKDA 3BCKA 1MDKA 2VCQA 2WCIA 3SWLA 3EU4A 3LYKA 2HRNA 4L8EA 2B7KA 1JHBA 5CRGA 3I43A 1JFUA 1B8XA 2HZEB 1GNEA 6GSYA 5ECSA 5HFKA 3F9UA 4F03A 2FCHA 2V1MA 2VD1A 2X64A 3O76A 1SKRB 1F6MC 4HJ2A 2YZUA 3TRPA 3H8QA 1ABAA 1HYUA 4BWQA 3QR6A 4KH7A 4NWYA 3GTUB 2A2SA 2WJUA 1JZDA 1R5AA 2H0HA 1SL2B 4FYBA 5D9VA 2RIIA 3QCPA 2CAQA 3CTGA 2B5YA 1GUKA 2B5EA 4FH8A 3GKMA 3CSHA 1RK4A 5IMDA 1PA3A 2V6KA 5G5EA 1SL1B 1U3IA 1XVQA 2OKAA 3LXTA 3TKPA 3ZIJA 1A0FA 1O81A 2H0IA 5J9BA 4ZL9A 1GSDA 4ZXGA 3DWVA 2OE1A 5KN1A 1T4YA 4GCIA 2HSHA 5GSTA 3NOFA 1UVZA 3DRNA 1XW6A 1X5CA 2KLXA 2HZFA 2LV3A 4TXOA 2VCXA 2QGVA 2AUVA 1Z3EA 5F06A 5JWRB 1ZL9A 1PL1A 4PUAA 5F8BA 5J5NA 1K3LA 2PU9C 3A5WA 4OO5A 1J0FA 13GSA 1TI3A 1RQMA 2YJHA 4K9ZA 1E6BA 5GZZB 4G2EA 4PNFA 3QMXA 2OA7A 1DE1A 1K0AA 2G2QA 3VWWA 4ECIA 4HU7A 3ZREA 5CO3A 4TR1A 3VFIA 3EE2A 3HA9A 1AQWA 1QFNA 5KN2A 1FG4A 4L5OA 1VGLA 3TKSC 4X1UA 1Q4JA 2FD3A 3GV1A 3QAGA 3HZ4A 1O73A 3GNJA 4RI7A 5ECRB 2IN3A 2NVLA 3Q6OA 3UJ1A 4GQFA 1OAZA 2VM1A 4KNDA 2HI7A 4GF0A 3F3QA 2A4VA 3ZRDA 1AQXA 2DJ2A 3KIJA 1YDKA 3UVHA 5ECNB 3FYGA 1GUHA 4LMWA 2FUG2 1BEDA 4O32A 5DCHA 3D21A 4TVEA 3AY8A 1XWAA 4WR5A 4ZILA 1OYJA 4ACSA 4IELA 4V2LA 3LWAA 4MF7A 4PXOA 2VIMA 3TUEA 4MA9A 1PD21 3S9FA 3BCIA 3H1NA 5HFIA 1TP9A 3KH9A 3GKXA 3HVVA 5CAXA 2YPMA 2I81A 1M2AA 1YZXA 4ULXA 2B6MA 4PQIA 5B6MA 4DVCA 1ERUA 1SK2A 3IE3A 1SKWB 1EEMA 4BVYA 1GSQA 3F63A 1ACVA 1TDIA 4QL7A 2E7PA 5A4VA 1UN2A 1XPVA 4DSQA 2DMLA 1GSSA 2GQMA 1C72A 4MJBA 5COHA 2R37A 5AIVA 2LSTA 3M9KA 1HNAA 2K8VA 1ILOA 4Q5RA 2H01A 2GTUA 1E2YA 1TRVA 1SD8A 2G0FA 2ZUPA 1GTBA 1XZOA 2H6ZA 3I9V2 2H72A 11GSA 2GT5A 3IC4A 3TRQA 5ECKB 2YOIA 3H4KA 2V32A 1FVJA 4K0GA 5DAKA 2GSTA 2VLVA 5HR3A 3KMOA 4OWYA 1GH2A 5EL8A 1M2DA 1Q98A 2IFQA 2DJKA 3C1SA 2VCTA 3KZQA 1ZYQB 2DBCA 4OCFA 1T8EB 2IMIA 4RQXA 2YZHA 3GX0A 4KDXA 5AGYA 3BBYA 1TRSA 1DSBA 1TU8A 1H4OA 2ALBA 4YAVA 1FHEA 1OE8A 4V2NA 3P90A 2XPDA 1XVWA 3ZITA 4GWRA 3VPQA 5IO2A 4IQAA 2I3YA 4K7NA 2VM2A 3DIEA 3EMXA 20GSA 2OE3A 2NBSA 5EPFA 1XFLA 5LNKe 4MABA 5G2ZA 3G7JA 2MYGA 1DE2A 3TDGA 4QQ7A 1THOA 2O7KA 3M3MA 2DJ0A 1EWXA 4CDOA 3LGCA 4AJ7A 1MDJA 4AJ6A 4TXVA 1SL0B 4MZBA 1BQ7A 1U88A 2YANA 1IYHA 2MBTA 1J08A 1TU7A 3ERGA 4DSSB 1A2MA 4NAXA 10GSA 1TRWA 2LQOA 3R2QA 4HU9A 2JADA 4O5RA 3CSJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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