3UONA

Structure of the human m2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
TFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVEDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRINIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/antagonist
molecule keywords Human M2 muscarinic acetylcholine, receptor T4 lysozyme fusi
publication title Structure of the human M2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 159
structure length 438
sequence length 438
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3uonA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3uonA01
1P2RA 1P2LA 1FBKA 5G2CA 3S3BB 3OE8A 235LA 1UCQA 1T8FA 3QJRB 170LA 172LA 1LYEA 1LI6A 2HUKA 147LA 228LA 2Q9EA 1M0LA 4XTLA 1JV6A 141LA 2B6XA 3HUAA 3QJQB 1IW9A 4OO9A 2J4YA 5H2JA 182LA 226LA 180LA 1L52A 3DN3A 4KLYA 1L33A 5H2PA 1S52A 3EH4B 1L60A 1KY1A 199LA 3C80A 115LA 2B6YA 1L27A 1C6HA 1QT5A 3PWHA 1NHBA 4EIYA 2RH1A 4PXKA 4EPFA 1L66A 1LYJA 5ITEA 5B6YA 1T97A 1L17A 1L70A 1XEPA 206LA 3QBIA 4N6HA 1C6BA 5J7AA 231LA 222LA 3V2YA 2I21A 241LA 2AT9A 1C6GA 5G2DA 1CU5A 3KJ6A 3QBLA 1L41A 4N4YB 4BEZA 1JQUA 1QUOA 1C6PA 3F8VA 3SB9A 1P8HA 1VJMA 4XT1A 3HUQA 2Z6BA 5DHHA 1G0LA 107LA 1L34A 1ZURA 4BEYA 1L38A 5AX0A 1L18A 5ITCA 3G3WA 152LA 1LYHA 3SB6A 3CDOA 4YXCA 1P7SA 2RBPA 3ZPRA 4XXJA 1P3NA 4GP4B 4BWBA 3C9LA 1QTHA 205LA 1L59A 1L26A 4MD2A 2YCZA 2L6XA 1P36A 3QJSB 4WW3A 4L35A 2O4WA 1C66A 1QS5A 1H68A 1L73A 247LA 1CX6A 1D3JA 2OEAX 1C6DA 1LI2A 1QUDA 1P64A 1L90A 2I20A 1CUPA 4I7QA 1LGUA 2WJLA 1L19A 1C6TA 218LA 1L64A 1AP9A 1G0MA 3S3CB 3ZEVA 4X32A 201LA 2KSAA 143LA 123LA 211LA 3C9MA 1C6AA 1JTNA 110LA 1LN6A 3NSBA 1BM1A 161LA 227LA 3X3BA 3GUPA 1L36A 3FADA 4LDEA 1XJUA 3NS0A 1SWZA 5B35A 1O0AA 5H2IA 3BVDB 1DZEA 3HAPA 1L30A 1S53A 1D2WA 1L86A 1TLAA 1XIOA 5H2LA 262LA 4IB4A 1LYDA 1L91A 253LA 1VGOA 209LA 5B6VA 1L21A 3SBAA 2F2QA 4G7QB 3HTBA 1EPYA 198LA 1CX7A 1PQIA 4EKRA 1KG8A 1C6KA 1QTZA 2KS9A 2YDVA 2R4SA 2OE7X 1TN0A 2Y02A 1DYBA 4ARQA 3HT6A 1D3NA 2PEDA 1F50A 4HYJA 1QT3A 214LA 1QUGA 4NC3A 1LWGA 5H2NA 1L56A 173LA 1CV5A 3PDSA 2Q9DA 1C60A 187LA 5B6ZA 1L71A 4PJZA 168LA 165LA 1CTWA 1L00A 1OVKA 1L14A 3A7KA 2B75A 3HWLA 2OU0X 3G3VA 4GYCA 257LA 2ZIYA 3DN8A 2VT4A 4HYXA 145LA 1L10A 1L97A 4IARA 127LA 3CDQA 3HH3A 171LA 4EXMA 5DYSA 4EA3A 2B7XA 148LE 4L6RA 1L49A 1D9WA 167LA 4HWLA 1F88A 1L23A 2Y01A 5A44A 4DAJA 1K28A 3NY8A 4X1HA 4G71B 1M0KA 1QT4A 3QAKA 2RBOA 3DMXA 1XMEB 1C3WA 3V2WA 220LA 233LA 1CU0A 2RBSA 3SN6R 4W58A 1PQMA 4BUOA 3DKEX 219LA 1X0K1 4QRYA 3UONA 2X72A 1LI3A 3C82A 1PXRA 1QS9A 3HAQA 1L81A 4JR8A 4I7LA 2RAYX 1L79A 4UG2A 5AZDA 4AMJA 1L95A 1SX2A 230LA 225LA 4ARPA 1L80A 178LA 261LA 1QTDA 1DYEA 1OV5A 3DMVA 192LA 1X0SA 158LA 2YCWA 160LA 3ODUA 3WQJA 1L54A 1L06A 229LA 245LA 3ZPQA 2RBRA 1L55A 1L20A 5G36A 2I35A 3GUKA 1L74A 2RB1X 3EH5B 5AX1A 4EKQA 1L69A 4GP5B 1L63A 5FJGA 3S8GB 2WJKA 200LA 4A4MA 4W56A 1L65A 1L16A 1C8SA 1GUEA 1P8IA 237LA 196LA 2L78A 2KSYA 4WAVA 3L2XA 5F8UA 1L35A 3T45A 1L58A 2OTYX 3CDVA 5B2NA 1PQKA 1E0PA 1L07A 5DHGA 3HTDA 1L39A 4MQTA 1LLHA 1C6QA 4YXAC 4I7NA 111LA 1DYCA 129LA 1L88A 3HT9A 3VVKA 252LA 1L51A 103LA 1QT6A 243LA 3HDFA 2RBQA 1ZYTA 4QI1A 4DJHA 249LA 1C67A 4E97A 4AQNA 3QBGA 2ANXA 1ZWNA 4S0WA 3DN1A 1LPYA 1L05A 223LA 1DYGA 2Z55A 4GBRB 4G72B 142LA 197LA 2BRDA 126LA 5AHYA 2LCBA 5B34A 191LA 1L29A 195LA 1L11A 212LA 3MBVA 4I7OA 3RZEA 1L76A 3HANA 1U19A 5AWZA 1QSQA 3PBLA 3QDCA 3X3CA 1QKPA 1L46A 248LA 3HT7A 1KW5A 1L89A 2M3GA 260LA 162LA 1SSYA 3CDTA 3FA0A 1C6JA 4IAQA 251LA 1DYFA 3OAXA 1UAZA 4LZMA 1CU3A 1M0MA 2QB0B 4AMIA 164LA 2JAFA 1L94A 3S8FB 3EH3B 216LA 2O79A 2RB0X 246LA 5G54A 1DYAA 4FAAB 234LA 2QARC 1KMEA 4MD1A 1L99A 3C8QA 1C68A 4LDLA 4G70B 3OE9A 1G0QA 3G3XA 5C1MA 3PXOA 3HTGA 244LA 4XT3A 1D3FA 1L04A 1IXFA 3HASA 3GUOA 3OE6A 3AYNA 150LA 1TN5A 1LGXA 2HPYA 144LA 4I7TA 4BV0A 138LA 175LA 4JKVA 102LA 1QSBA 185LA 3RUNA 3SB7A 1HZXA 5H2MA 3UTVA 1QT7A 1CV3A 2G87A 4MBSA 1KY0A 3QAPA 3UTXA 1L03A 2LZMA 146LA 1L01A 4GRVA 4ARMA 1S51A 1L24A 155LA 2OE4X 1QKOA 1L96A 4G7RB 1OVJA 1BRXA 1DYDA 3DMZA 2Z73A 259LA 1T6HA 1L62A 1MGYA 3AM6A 4X31A 4FA7B 3CODA 5G28A 5G53A 3QJUB 3D4SA 1L09A 1L22A 3UTWA 3C81A 157LA 3DNAA 215LA 3VGAA 4JQ6A 236LA 4I7MA 3SBBC 5BR2A 1P6YA 4YX7C 4K5YA 1L0MA 139LA 217LA 1D2YA 1L44A 1CV0A 3UTYA 2OU8A 122LA 1G0PA 3EMLA 1CWQA 2OU9A 1S54A 166LA 113LA 1SWYA 1CV1A 1LW9A 1L67A 213LA 4GP8B 2NTHA 4I7JA 4W53A 177LA 1EHKB 1L98A 1OV7A 3SB5A 1L77A 1R84A 4FPDA 1JFPA 169LA 1CUQA 1G0GA 2JAGA 3GULA 1XJIA 1SX7A 2KSBA 159LA 1H2SA 3REYA 1I6SA 3AYMA 5H2OA 1D3MA 4PXFA 1C63A 1GZMA 108LA 1L83A 5JJEA 1LGWA 4IAPA 3DN6A 4W55A 2QPDB 5LWEA 4I7PA 1L72A 2EI4A 4W51A 4ZPUA 1PQOA 176LA 1P46A 3P0GA 1OWYA 5LZMA 1KW7A 3C7YA 2CUUA 2F95A 186LA 1C69A 1C61A 1L31A 4XTOA 4UHRA 2NTUA 1LYIA 1KNIA 3HH6A 128LA 4I7RA 5AHZA 1X0I1 3CDRA 5G2AA 1OWZA 4BVNA 5B6WA 3VI0A 1CU2A 130LA 189LA 1L93A 1JTMA 2NTGA 4N4WA 1CV4A 238LA 4LDOA 5EN0A 120LA 1L85A 2O7AA 3UZCA 125LA 1C8RA 151LA 1G0JA 1C64A 3DN4A 4OV0A 188LA 3QJVB 3C8RA 5JJJA 1L47A 224LA 1PY6A 1T8AA 1L02A 1L9HA 2B70A 4EKSA 1L0JA 1L45A 109LA 1G1VA 4W59A 2LNLA 5A8EA 184LA 3HDEA 5TGZA 3RFMA 1C62A 3C7ZA 1CU6A 1L32A 3HU9A 1G06A 1E12A 1C6IA 1P8UA 1L25A 1S8LA 1Q5JA 1C65A 258LA 1C6FA 1C6LA 1KG9A 3HT8A 1BRDA 174LA 4Y9HA 1L42A 1C6NA 1P37A 1Q5IA 114LA 3HH5A 1LYFA 137LA 2R4RA 3JR6A 5BR5A 2IGCA 1L92A 2B6ZA 3L64A 1PQJA 4QIDA 3HARA 232LA 2RBNA 6LZMA 1B6IA 4GBRA 250LA 3VW7A 3QJTB 256LA 4FBZA 4KNFA 1QHJA 119LA 2ANVA 1R2NA 3GUIA 1LYGA 1XJTA 3F9LA 5H2HA 2YCYA 2QPEB 104LA 1QTCA 4EJ4A 1T8GA 140LA 1L84A 2Y00A 3LZMA 4ARQB 3K2RA 1L87A 240LA 2OE9X 3ABWA 156LA 1GU8A 1P5CA 4GPOA 2B74A 3HU8A 3DDLA 3DQBA 3QBKA 7LZMA 4XTNA 1LWKA 2A4TA 2Y04A 131LA 4G7SB 1FBBA 3SB8A 221LA 1L37A 4DKLA 2F32A 3OE0A 3VHZA 1QUHA 4ARMB 2RB2X 1F4ZA 1PQDA 1SSWA 1KGBA 4J4QA 2HULA 3S3DB 3C83A 181LA 1CV6A 3HTFA 1AT9A 1L08A 1KS3A 254LA 1JV7A 3UZAA 1L53A 1L75A 242LA 1OVHA 2LC9A 1OYUA 3HAOA 1WTHA 3PQRA 210LA 5H2KA 5A45A 4ARJA 4EKPA 5KKHA 3FI5A 163LA 3C8SA 3GUJA 1QTBA 1L40A 2OTZX 118LA 1L12A 5I14A 1L28A 3NY9A 1IW6A 5ETZA 183LA 1L50A 3DN2A 1L15A 5B0WA 2B6TA 1L57A 4EPIA 1L61A 1JGJA 3C7WA 1PXSA 1C6CA 1QM8A 4W57A 2Y03A 3NYAA 2F47A 3COCA 4PK0A 2YCXA 1G1WA 4TL3A 3HUKA 1C6EA 1L43A 3GUNA 1G07A 5B6XA 112LA 1L0KA 3DN0A 1L48A 1CVKA 3GUMA 3CAPA 2ZZLA 5JJNA 1L13A 1L82A 1QT8A 2B72A 1BRRA 3HH4A 2F93A 2NTWA 2ZFEA 1P56A 2HUMA 255LA 1S8JA 4W52A 4I7KA 3UG9A 4MQSA 2YDOA 2B6WA 2B73A 149LA 1QTVA 239LA 190LA 1C6MA 2RAZX 1L68A 4W54A 4ARLA 3VG9A 2I1XA 4I7SA 1G0KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HFMY 235LA 1UCQA 4B1AA 4ETDA 1M0LA 3WXTA 141LA 4WM3A 2MEIA 5FELA 4OO9A 5H2JA 1RJCB 4LT0A 1L52A 2C8OA 1L60A 1KY1A 1DPWA 4YENA 4NHIA 2B6YA 1LSDA 4HPIA 4EIYA 1DZBX 1L66A 1GF5A 4N6HA 3QBIA 241LA 1GHLA 3ATNA 3LYMA 1YAPA 5F81A 3LYTA 1NMMA 4HV1A 1PS5A 4N4YB 1VJMA 4BEYA 4CFPA 1L18A 1C7PA 1IEEA 152LA 4HTQA 3CDOA 1DQJC 1P7SA 1WQOA 2RBPA 5I53A 3C9LA 205LA 2YCZA 4C3WA 1P36A 2O4WA 1JUGA 1LI2A 1QUDA 3W3EA 3S3CB 1G0MA 2XBSA 3ZEVA 143LA 5EBHA 4RW1A 4UWNA 1OUCA 3C9MA 1JTNA 1B5XA 2BQOA 4NHQA 227LA 3X3BA 3GUPA 1JJ1A 4LDEA 1F10A 1HELA 1B5UA 1L86A 1TLAA 1XIOA 253LA 1VGOA 1L21A 2F2QA 4XJFA 2DQIY 1KG8A 1C6KA 1DI5A 1QTZA 2YDVA 2R4SA 2OE7X 1CJ9A 1F50A 4HYJA 5DN5A 1LWGA 1L56A 4QDNA 7LYZA 1HSWA 1RE2A 4TWSA 1UACY 5B6ZA 1L71A 1GWDA 1LZTA 5KXYA 3HWLA 2OU0X 3W6BA 257LA 2ZIYA 3DN8A 1FKQA 3CDQA 1LSYA 3HH3A 2HU3A 4EXMA 1JTPL 4EA3A 3TXBA 3A3QA 5DL9A 167LA 3WPJA 1F88A 4DDCA 4DAJA 2AUBA 1K28A 2RBOA 3GXKA 1XMEB 233LA 4BUOA 3DKEX 4QRYA 5F14A 4B4EA 1PXRA 1ZVYB 2RAYX 2FYDA 1L95A 5LA5A 178LA 4OW1A 5B07A 158LA 5LIOA 1BB6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3DN0 A;  1L48 A;  1CVK A;  3GUM A;  3CAP A;  2ZZL A;  5JJN A;  1L13 A;  1L82 A;  1QT8 A;  2B72 A;  1BRR A;  3HH4 A;  2F93 A;  2NTW A;  2ZFE A;  1P56 A;  2HUM A;  255L A;  1S8J A;  4W52 A;  4I7K A;  3UG9 A;  4MQS A;  2YDO A;  2B6W A;  2B73 A;  149L A;  1QTV A;  239L A;  190L A;  1C6M A;  2RAZ X;  1L68 A;  4W54 A;  4ARL A;  3VG9 A;  2I1X A;  4I7S A;  1G0K A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1HSW A;  1RE2 A;  4TWS A;  1UAC Y;  5B6Z A;  1L71 A;  1GWD A;  1LZT A;  5KXY A;  3HWL A;  2OU0 X;  3W6B A;  257L A;  2ZIY A;  3DN8 A;  1FKQ A;  3CDQ A;  1LSY A;  3HH3 A;  2HU3 A;  4EXM A;  1JTP L;  4EA3 A;  3TXB A;  3A3Q A;  5DL9 A;  167L A;  3WPJ A;  1F88 A;  4DDC A;  4DAJ A;  2AUB A;  1K28 A;  2RBO A;  3GXK A;  1XME B;  233L A;  4BUO A;  3DKE X;  4QRY A;  5F14 A;  4B4E A;  1PXR A;  1ZVY B;  2RAY X;  2FYD A;  1L95 A;  5LA5 A;  178L A;  4OW1 A;  5B07 A;  158L A;  5LIO A;  1BB6 A;  1L06 A;  5IEL A;  4TTD A;  5B59 A;  3B0O A;  4WL7 A;  1L69 A;  4WM5 A;  2DQG Y;  1JTO L;  3S8G B;  200L A;  1L65 A;  1QSA A;  2D91 A;  5T3F A;  3L2X A;  3ZVQ A;  4WAV A;  1GFE A;  2OTY X;  2ZIK A;  3A90 A;  4H9F A;  1PQK A;  1L07 A;  4MQT A;  5B06 A;  4N0J A;  4I7N A;  4HPE A;  5LIN A;  4LYC A;  5ILF A;  1ZYT A;  1GFV A;  2ANX A;  1B7P A;  1ZWN A;  4HV2 A;  1CKH A;  3DN1 A;  134L A;  1L05 A;  1LJF A;  3TMV A;  1IP6 A;  2LCB A;  1CKC A;  195L A;  212L A;  3HAN A;  5KXW A;  1GXX A;  3X3C A;  4TUN A;  1KW5 A;  1L89 A; 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