3UONA

Structure of the human m2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
TFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVEDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRINIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/antagonist
source organism Homo sapiens
publication title Structure of the human M2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Human M2 muscarinic acetylcholine, receptor T4 lysozyme fusi
total genus 159
structure length 438
sequence length 438
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3uonA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3uonA01
1L08A 1L58A 1T6HA 1L44A 3FI5A 2LC9A 3GUJA 1L59A 1L64A 1L88A 4N6HA 1GU8A 2ZFEA 241LA 1L15A 1OWZA 1P37A 2I35A 1L0MA 5ITEA 1C6DA 1IW9A 4GYCA 1QTZA 1L26A 1G06A 5B6WA 1G0JA 4IB4A 120LA 1C6TA 175LA 1XJTA 4PK0A 4W54A 1QSBA 1P2LA 1PY6A 3G3VA 3ABWA 190LA 3DN8A 1QT4A 4JKVA 4X31A 2F47A 4IAPA 1OWYA 260LA 205LA 150LA 247LA 3C8QA 238LA 3EH5B 1SSYA 126LA 3VI0A 141LA 1L52A 5AZDA 3HUAA 2B6WA 243LA 1P56A 4EXMA 103LA 1CV0A 5G53A 1CV4A 1G1VA 257LA 3NS0A 227LA 189LA 1C6JA 1L81A 1BRXA 1L29A 3RZEA 5B0WA 1L42A 2NTGA 2HUKA 4BWBA 182LA 3T45A 1L19A 212LA 1R2NA 4UG2A 3HDEA 4HYXA 180LA 2KS9A 2RB1X 197LA 4KNFA 1SSWA 2Y00A 4AMIA 2KSYA 1D3MA 1L24A 1L16A 4X1HA 2F93A 3C7YA 1L45A 1PQIA 3LZMA 169LA 4MBSA 2OU8A 4BUOA 1L25A 1D2YA 1L67A 1L0JA 3NY8A 1O0AA 5DHHA 3SB9A 1CVKA 4IARA 3UTWA 4G70B 146LA 2OU9A 3UTVA 3VHZA 1L99A 3HU9A 1CX6A 1G0LA 4EPIA 2YCWA 1S51A 1L07A 3SBAA 4W57A 3ZEVA 1P7SA 2O79A 3FA0A 1WTHA 5H2LA 254LA 3SB7A 4N4YB 3C82A 1L56A 1QT5A 1L57A 1F50A 1C6QA 2OTYX 3HT9A 5I14A 2YDOA 5ITCA 3VG9A 3HANA 5AWZA 1CUQA 2X72A 1M0LA 1P6YA 3AYNA 3QBLA 5ETZA 165LA 198LA 1LWKA 4LDLA 1LYDA 1L0KA 3SB6A 1L06A 1VGOA 5H2JA 7LZMA 4I7QA 1G0MA 1L83A 1LYIA 3GUNA 2B6YA 1C69A 2NTHA 1L89A 1C6LA 220LA 192LA 2B6ZA 5KKHA 216LA 3CAPA 3BVDB 1XJIA 1C8SA 2RAYX 4XT3A 1C6AA 3C81A 3UZAA 166LA 1L03A 3QJUB 3GUPA 4I7KA 1M0KA 196LA 4Y9HA 4XTNA 4XXJA 3ZPRA 3DN2A 3G3WA 1C66A 1C6HA 255LA 235LA 1F4ZA 2B73A 3HARA 1C6BA 1QKPA 155LA 201LA 236LA 4I7OA 2B74A 188LA 4G72B 1L18A 1L93A 3DMXA 6LZMA 1CTWA 232LA 4I7PA 2I1XA 2O7AA 228LA 177LA 152LA 1L61A 5AHYA 1L91A 2B75A 4GRVA 1G0KA 4EIYA 125LA 1L30A 2BRDA 3S3CB 3UTYA 1S52A 2OE7X 4PJZA 5A8EA 2KSBA 4N4WA 3F8VA 3S8GB 3HAOA 4KLYA 5B6YA 3DN1A 1CU0A 3QJSB 251LA 1C68A 3C7WA 1U19A 1C67A 2EI4A 2YCZA 3C83A 1LYEA 3MBVA 261LA 186LA 3UTXA 3K2RA 195LA 3UONA 1L54A 3DN4A 1C64A 176LA 3G3XA 187LA 163LA 3QJRB 1L11A 5EN0A 3ODUA 1KY0A 219LA 1S53A 1XIOA 1S54A 1CU6A 1XEPA 2OTZX 1L41A 1P3NA 2I20A 3HTBA 2L78A 3CDQA 1L79A 109LA 156LA 1C62A 4ARMB 250LA 3QDCA 104LA 4DAJA 1QTVA 5FJGA 3S3BB 5LZMA 4I7JA 1L09A 1ZWNA 1L05A 1L97A 129LA 144LA 3AM6A 127LA 1PXSA 3V2WA 3COCA 4HYJA 167LA 3C8RA 4YX7C 1JFPA 3AYMA 1L17A 1LYJA 1T8AA 1L47A 1L62A 3V2YA 4EJ4A 1NHBA 1L21A 1TN0A 140LA 2QB0B 1JV7A 5G2CA 4XT1A 4ARJA 3HDFA 1L36A 151LA 1G0GA 1QSQA 2B6TA 3X3CA 3ZPQA 2RBPA 218LA 4E97A 137LA 1L10A 5B2NA 2QARC 2F32A 4YXAC 1DYBA 5DHGA 1G07A 1T8FA 1L80A 1P36A 1P46A 1QUOA 1LN6A 3UZCA 1C6EA 4TL3A 5H2IA 4W53A 3PDSA 2YDVA 1KW5A 4XTLA 170LA 3KJ6A 1L02A 2NTUA 3HUQA 1L04A 4QIDA 1GZMA 1KG9A 2ANXA 1PQDA 3S8FB 1L86A 1L32A 1OVHA 209LA 2IGCA 1T97A 1C6NA 1OV5A 5B6VA 1X0I1 2OE4X 3QBGA 1X0K1 1L00A 4GBRB 213LA 1QTBA 1FBBA 1LYFA 3L64A 3NSBA 157LA 128LA 1HZXA 5A44A 1SWYA 1L60A 3RUNA 2LNLA 5JJEA 3OE0A 3P0GA 206LA 1L98A 1BRRA 4MD1A 3QAKA 1D3JA 159LA 1L39A 4YXCA 1C6CA 3CDTA 1L76A 3UG9A 1D3FA 226LA 1L94A 2B70A 1OV7A 3HU8A 1MGYA 4J4QA 5H2KA 1LW9A 3HAPA 1P5CA 1D9WA 3JR6A 2QPEB 1L85A 3HUKA 5JJNA 1DZEA 1L43A 1L74A 2HULA 1DYCA 2R4RA 1CWQA 2J4YA 1DYAA 172LA 113LA 3FADA 4EKSA 1M0MA 2O4WA 2M3GA 2Y03A 1C8RA 1E12A 224LA 5AX0A 1QT7A 173LA 1JV6A 1LI3A 1SWZA 4BVNA 1OVKA 1FBKA 3DN6A 178LA 1C61A 242LA 1DYEA 1KG8A 1L69A 2QPDB 4MD2A 1L50A 1GUEA 2R4SA 2ANVA 2Y04A 3QAPA 1L63A 1L72A 3HT7A 1C3WA 1AP9A 1DYDA 4PXKA 1DYGA 4ARPA 4QI1A 1L35A 1PQMA 4ARMA 239LA 3SB8A 3PWHA 244LA 1EHKB 1L22A 2RH1A 3C9MA 1D2WA 1IXFA 4WW3A 2YCYA 1L01A 1L31A 2CUUA 4W55A 3SN6R 4ARQB 1BRDA 1L51A 1L77A 4PXFA 5B35A 1B6IA 4XTOA 5G54A 3OAXA 3VVKA 1C65A 161LA 1L27A 1S8LA 262LA 1KY1A 1TN5A 1LPYA 139LA 222LA 2KSAA 2B7XA 3OE6A 1Q5JA 5LWEA 3GUMA 3CDVA 246LA 2Y02A 3PXOA 3GUIA 1QM8A 4W51A 4GP8B 4JQ6A 2OU0X 174LA 4I7RA 256LA 4W59A 1P8IA 1VJMA 5A45A 3DNAA 1LI6A 4I7NA 184LA 3QBIA 4A4MA 1L92A 1L71A 5G36A 2Z55A 5H2PA 114LA 1LGUA 4EKPA 1XMEB 1D3NA 1JTNA 3QJTB 1H68A 5G2AA 5BR2A 3A7KA 2LZMA 1BM1A 149LA 1L23A 1X0SA 3D4SA 2JAGA 4FPDA 3QJVB 1QTHA 3HH6A 1L53A 1CX7A 2YCXA 3EH4B 1L65A 2RB2X 4UHRA 142LA 5H2MA 3WQJA 111LA 4EA3A 248LA 123LA 3CODA 1CV5A 2ZZLA 4GBRA 1L55A 1L46A 2Z73A 4X32A 1L33A 1G0QA 1LYHA 1OYUA 245LA 3C8SA 138LA 3DN0A 2Z6BA 4MQSA 3DDLA 4LZMA 1CU5A 2F95A 191LA 3CDRA 5AHZA 3DN3A 225LA 4EKRA 171LA 1CUPA 1JTMA 1QTDA 3QBKA 1PQKA 1QUDA 214LA 131LA 4LDEA 4GP5B 2OE9X 1EPYA 110LA 5TGZA 1L40A 1L87A 1L75A 2HUMA 1UAZA 5F8UA 2RAZX 158LA 1PQOA 211LA 1P64A 1QUGA 3DMVA 122LA 3SB5A 119LA 1C60A 3PQRA 2JAFA 1L70A 252LA 1LYGA 1L68A 2RB0X 2NTWA 5JJJA 1QT6A 217LA 3GULA 2ZIYA 221LA 1AT9A 1E0PA 2AT9A 1L13A 2RBNA 1L28A 2RBQA 168LA 2RBSA 1SX7A 4L35A 5B34A 3SBBC 1L34A 1OVJA 2G87A 200LA 230LA 2Y01A 3F9LA 3OE8A 229LA 3PBLA 4MQTA 1L14A 1H2SA 223LA 258LA 3REYA 4DJHA 1QS5A 102LA 3RFMA 1LI2A 1JQUA 3GUKA 1KW7A 2Q9EA 1QTCA 4AQNA 1C6MA 4GP4B 1QS9A 3DMZA 1CV6A 4S0WA 1QHJA 4HWLA 5H2HA 4FAAB 143LA 1QKOA 4EPFA 1F88A 5C1MA 4AMJA 4FA7B 4OO9A 3HH5A 1P8HA 2RBRA 3C80A 249LA 1L48A 4G7RB 237LA 3L2XA 145LA 4BEYA 1LLHA 1C6KA 1L12A 4I7SA 3C7ZA 4ARQA 2VT4A 4IAQA 2B72A 3HT8A 2B6XA 3S3DB 4K5YA 3X3BA 215LA 4BEZA 1L84A 231LA 1SX2A 1PQJA 4ZPUA 1UCQA 4G71B 1KMEA 1L82A 183LA 5H2NA 4I7LA 185LA 1G0PA 1R84A 112LA 1CV1A 1KNIA 3HTFA 181LA 130LA 240LA 253LA 3HH4A 1L73A 1L95A 233LA 4I7TA 1I6SA 1L20A 1C6GA 1C6FA 162LA 2RBOA 2Q9DA 3GUOA 4LDOA 4QRYA 1DYFA 1T8GA 4I7MA 4ARLA 1PXRA 1G1WA 1ZURA 1L37A 4G7SB 148LE 3OE9A 3HASA 2PEDA 5DYSA 1CU3A 4W52A 5BR5A 1LGWA 3HTDA 1QUHA 1L96A 2I21A 4BV0A 5G2DA 3HH3A 3HAQA 1LGXA 3NY9A 1L90A 4W56A 2WJLA 199LA 234LA 118LA 1CV3A 147LA 3VGAA 3QJQB 3C9LA 1C63A 3HT6A 1S8JA 1IW6A 4W58A 1QT3A 164LA 1C6PA 2LCBA 3DQBA 108LA 3CDOA 3NYAA 1P8UA 4EKQA 2WJKA 210LA 5G28A 2F2QA 5J7AA 5B6XA 5AX1A 1L9HA 4JR8A 5H2OA 1QT8A 2A4TA 4GPOA 4FBZA 3HWLA 3DKEX 259LA 1CU2A 1JGJA 3HTGA 2OEAX 1L38A 1LWGA 4DKLA 160LA 1KGBA 115LA 1L49A 1L66A 1XJUA 4OV0A 1P2RA 2L6XA 4G7QB 1KS3A 5B6ZA 3EH3B 1C6IA 1K28A 4WAVA 107LA 2HPYA 1ZYTA 3EMLA 3VW7A 4NC3A 1Q5IA 4L6RA 1TLAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GUJA 2BQGA 2ZFEA 154LA 3P65A 1P37A 3AZ6A 2I35A 1C6DA 132LA 5FEKA 1G0JA 1HEQA 4W54A 1B7SA 3B6LA 1RCMA 3EBAB 1XGUC 5AMYA 1QT4A 4X31A 4IAPA 3VI0A 1B5ZA 1L52A 3HUAA 2B6WA 5KXMA 4UWVA 1UA6Y 1FN5A 2HUBA 4HJYA 2D6BA 1GB0A 3QNGA 5B0WA 4BWBA 2BQNA 4XENA 3RW8A 1LKSA 4UG2A 2HEFA 3QE8A 2BQFA 197LA 1LMAA 5J7CA 1GFKA 4X1HA 1L45A 3LZMA 169LA 4H9IA 1L0JA 3NY8A 1HMLA 5LVGA 2MEAA 6LYZA 3UTVA 1L99A 1CX6A 3W6EA 1IC7Y 2DQGY 1G7IC 4W57A 3ZEVA 3J4GA 1P7SA 3FA0A 3ZVQA 1QT5A 1VATA 4G49A 3HANA 2ZNXY 4WL7A 6LYTA 2Y8PA 1XGQC 1M0LA 3AYNA 1WQOA 2D4JA 1LWKA 198LA 4LDLA 1L06A 3LYMA 3GUNA 1OP9B 3HBHA 4NHSA 1YIKA 1C6LA 4XT3A 1C6AA 3C81A 1BVXA 1OUGA 1L03A 1IX0A 4DDAA 4LGKA 4H92A 1HNLA 4Y9HA 1NDMC 1LZCA 2FBDA 1BB4A 3G3WA 1C66A 1C6HA 235LA 3AB6A 4ET9A 3HARA 1GB2A 1QKPA 1D0MA 201LA 1UUZC 4CJ2A 2C8OA 188LA 4G72B 3DMXA 1REYA 1CTWA 5F16A 2HECA 2O7AA 5C6JA 177LA 4NGKA 2BQLA 5AHYA 1VDQA 2BQBA 2B75A 4NGLA 1G0KA 4B0DA 4Z46A 1L30A 2BRDA 3UTYA 1REZA 2OE7X 5I54A 4N4WA 3WL2A 3HAOA 3DN1A 2BLYA 3QJSB 251LA 3C7WA 1BB5A 2EI4A 5KXWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 262L A;  1KY1 A;  1TN5 A;  1LPY A;  139L A;  222L A;  2KSA A;  2B7X A;  3OE6 A;  1Q5J A;  5LWE A;  3GUM A;  3CDV A;  246L A;  2Y02 A;  3PXO A;  3GUI A;  1QM8 A;  4W51 A;  4GP8 B;  4JQ6 A;  2OU0 X;  174L A;  4I7R A;  256L A;  4W59 A;  1P8I A;  1VJM A;  5A45 A;  3DNA A;  1LI6 A;  4I7N A;  184L A;  3QBI A;  4A4M A;  1L92 A;  1L71 A;  5G36 A;  2Z55 A;  5H2P A;  114L A;  1LGU A;  4EKP A;  1XME B;  1D3N A;  1JTN A;  3QJT B;  1H68 A;  5G2A A;  5BR2 A;  3A7K A;  2LZM A;  1BM1 A;  149L A;  1L23 A;  1X0S A;  3D4S A;  2JAG A;  4FPD A;  3QJV B;  1QTH A;  3HH6 A;  1L53 A;  1CX7 A;  2YCX A;  3EH4 B;  1L65 A;  2RB2 X;  4UHR A;  142L A;  5H2M A;  3WQJ A;  111L A;  4EA3 A;  248L A;  123L A;  3COD A;  1CV5 A;  2ZZL A;  4GBR A;  1L55 A;  1L46 A;  2Z73 A;  4X32 A;  1L33 A;  1G0Q A;  1LYH A;  1OYU A;  245L A;  3C8S A;  138L A;  3DN0 A;  2Z6B A;  4MQS A;  3DDL A;  4LZM A;  1CU5 A;  2F95 A;  191L A;  3CDR A;  5AHZ A;  3DN3 A;  225L A;  4EKR A;  171L A;  1CUP A;  1JTM A;  1QTD A;  3QBK A;  1PQK A;  1QUD A;  214L A; 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 4ARQ A;  2VT4 A;  4IAQ A;  2B72 A;  3HT8 A;  2B6X A;  3S3D B;  4K5Y A;  3X3B A;  215L A;  4BEZ A;  1L84 A;  231L A;  1SX2 A;  1PQJ A;  4ZPU A;  1UCQ A;  4G71 B;  1KME A;  1L82 A;  183L A;  5H2N A;  4I7L A;  185L A;  1G0P A;  1R84 A;  112L A;  1CV1 A;  1KNI A;  3HTF A;  181L A;  130L A;  240L A;  253L A;  3HH4 A;  1L73 A;  1L95 A;  233L A;  4I7T A;  1I6S A;  1L20 A;  1C6G A;  1C6F A;  162L A;  2RBO A;  2Q9D A;  3GUO A;  4LDO A;  4QRY A;  1DYF A;  1T8G A;  4I7M A;  4ARL A;  1PXR A;  1G1W A;  1ZUR A;  1L37 A;  4G7S B;  148L E;  3OE9 A;  3HAS A;  2PED A;  5DYS A;  1CU3 A;  4W52 A;  5BR5 A;  1LGW A;  3HTD A;  1QUH A;  1L96 A;  2I21 A;  4BV0 A;  5G2D A;  3HH3 A;  3HAQ A;  1LGX A;  3NY9 A;  1L90 A;  4W56 A;  2WJL A;  199L A;  234L A;  118L A;  1CV3 A;  147L A;  3VGA A;  3QJQ B;  3C9L A;  1C63 A;  3HT6 A;  1S8J A;  1IW6 A;  4W58 A;  1QT3 A;  164L A;  1C6P A;  2LCB A;  3DQB A;  108L A;  3CDO A;  3NYA A;  1P8U A;  4EKQ A;  2WJK A;  210L A;  5G28 A;  2F2Q A;  5J7A A;  5B6X A;  5AX1 A;  1L9H A;  4JR8 A;  5H2O A;  1QT8 A;  2A4T A;  4GPO A;  4FBZ A;  3HWL A;  3DKE X;  259L A;  1CU2 A;  1JGJ A;  3HTG A;  2OEA X;  1L38 A;  1LWG A;  4DKL A;  160L A;  1KGB A;  115L A;  1L49 A;  1L66 A;  1XJU A;  4OV0 A;  1P2R A;  2L6X A;  4G7Q B;  1KS3 A;  5B6Z A;  3EH3 B;  1C6I A;  1K28 A;  4WAV A;  107L A;  2HPY A;  1ZYT A;  3EML A;  3VW7 A;  4NC3 A;  1Q5I A;  4L6R A;  1TLA A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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