3UORA

The structure of the sugar-binding protein male from the phytopathogen xanthomonas citri
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
397
structure length
397
Chain Sequence
KTTVRFWAMGKEAEVVAELVADFEKQNPTIHVDVQNIPMTAAHEKLLTAFAADGLPDVCQLGNTWLPEFALLDTLEPMQPYVARSKIVDPADYFPGVWDTNLVDGTLYGVPWYVDTRLLFYRKDLLREAGYSQMPKTWAEMEQVMAAIKRKVGPDRYAILMPLNEFEQQLSFALQQDDRLLRDHDNYGNFRGAGFRKALGFYDNMYQQGWAPKVSETQVSNVWYEFFNGYYAFYLSGPWNVREFKLRQPPGMEGNWGTAPLPGPNGLGAGIAGGSSLVIFKSSQHKDASWKLIEYLSQPQVQARFHAIIGDLPPRRSTWKLPSLANDALAHAFGDQLERVKATPKVLEWERIVQEMRLVTERVVRGGQSHDAAVQELDQRVDEILAKRRWIFEQEGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ABC transporter sugar binding protein
publication title Structure determination of a sugar-binding protein from the phytopathogenic bacterium Xanthomonas citri.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
molecule tags Sugar binding protein
total genus 142
structure length 397
sequence length 397
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3uorA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3uorA02
3RQTA 1US4A 3UORA 1B46A 5L9MA 1QW0A 2O6AA 3QK6A 3Q26A 2PT2A 3K1PA 2A5TB 3KN8A 4RY1A 3D4GA 3S9NC 3OEKA 1LAGE 4ZEKA 4F1VA 3SEYA 3H3GA 4RYAA 3M3FA 4G77A 4F31B 5A5XB 5H8HB 4Q30B 1A7LA 3B6WA 4G68B 2D3IA 4XKNA 3FVKA 4TLMB 4HCYA 3LSXA 4WEPA 3TTLA 1MPDA 2H25A 1MXWA 1Y9UA 1FQBA 1B5HA 4QFOA 4ZEBA 1B7HA 1JVXA 4EF2A 1LCFA 1IITA 2UVGA 3TQLA 4BDNA 3PV0E 2P0SA 1NH7A 2ESNA 4RPOA 3K01A 5DTBA 4YKKA 1B3LA 4FJPA 3SETA 3C34A 4NF4B 1MQDA 1MXUA 4IY5A 1TT1A 4ND9A 1JEUA 4QSCA 1FCKA 2GHBA 3WAFA 3I6VA 1IIWA 2HAVA 4JSOA 3P7IA 4EDPA 2Z8FA 5ICQA 3LC8A 3QUJA 1LAHE 3IOWA 2Q2CA 4OQOA 3N94A 1A54A 2OJTA 2I58A 1IXHA 4LA9A 4IY6A 4GLIA 1Y4TA 5L8DA 4R9GA 2ABHA 3PUVE 5H8FA 1CE2A 5ISUA 1RYOA 1FTOA 3CR9A 1SVXB 4ESWA 4DXCA 4YKJA 2QS3A 1SW5A 5KZTA 1SDXA 2DSFA 1OVBA 1AL3A 2I3WA 3H6VA 4LONB 4OESA 3TEPA 3TZAA 4EQBA 1B51A 2NWJA 2XXRA 4R2BA 4NMYA 4ECFA 1B5JA 1XVXA 3QXMA 5K2YA 2OBGA 3LSLA 3TCHA 5DVFA 4YU0A 2Q88A 5JTYA 2ANJA 3EHUA 1OIBA 3K4UA 4HS7A 1D9VA 4NF6B 1M5DA 4OFOA 3PU5A 4WEDA 1L5TA 2B3FA 3TCFA 2AYSA 4KFQA 1IZ1A 1VFDA 2FA7A 2LAOA 3C32A 4F3GA 2PMSA 3CG1A 2YJPA 3KZGA 1O63A 1Q35A 4R2FA 2GFEA 4BDRA 2Y7PA 3KFMA 1FTKA 2AL4A 3K2DA 1MQGA 2O7IA 1QJMA 3EPEA 2Y7IA 1IXCA 1H76A 3T22A 2XXVA 2KLFA 4EUOA 3TUSA 2V93A 1P1UA 1QUIA 4NWDA 2ONSA 1HSLA 2NXOA 4DIGA 4M1VA 1LB9A 4K3FA 2REJA 1JW5A 3FXQA 2XX9A 3OMBA 1S9TA 4X1BA 3LSFB 1B4HA 1B4ZA 3RTFB 1LGBC 3QIMA 5FHMA 2HXWA 3OXNA 4YMAA 5ELVA 4EF1A 1FTMA 4NWCA 1SW4A 1MM6A 1LBBA 2QL3A 2I6EA 1B1HA 5FTIA 1IUDA 2F6PA 2Y7RA 4I62A 3K1MA 3QAXA 3O97A 3Q29A 2WKYA 2O51A 2XXXA 3FVNA 1R1NA 3A3UA 1XHYA 3FASA 4YICA 4GL8A 5AA2A 4YKIA 1LFIA 4F3BA 4R75A 4KCCA 3IOVA 1B58A 4E0WA 2Q8JA 2XHDA 1OLAA 4H8IA 4ELPA 3MZ1A 1QULA 1LCTA 2XXPA 1RYXA 3K6UA 1B1XA 2ZYNA 2F97A 1MM7A 3MP6A 4ZE8A 2DWJA 1B6HA 2QPQA 4R74A 2QS1A 2P1SA 1B9JA 4ELRA 4TLLB 3O66A 1GVCA 3SERA 2H9BA 1PBPA 4U23A 2XXTA 1BP5A 4P0IA 4YAHX 1MPCA 4ZDMA 1IXGA 2YPNA 2ZYKA 3EHSA 4I8CA 4LQ5A 4H0WA 4KYDA 1B7UA 5L9OA 2M8CA 2XD2A 1H3DA 1N7XA 4DDDA 4QFPA 4PQJA 3H6UA 4IO7A 3FD3A 2DVCA 1MG1A 3VLWA 2CZLA 2Y7KA 2F35A 1O7TA 5EYFA 2GH9A 5FHNA 2ZMBA 2VOZA 4Q0CA 1LFGA 4LP2B 4KYSA 3DP8A 1MY3A 1EZ9A 1GTKA 3L6HA 1GV8A 2BJJX 2E1SA 4H6DA 2DWIA 1I69A 3O28A 3GZGA 2OCUA 3QSLA 1NNTA 4ZEDA 2QMWA 4HTGA 4ISUA 1USYE 4BDQA 1WODA 4FECA 5I84A 3L6GA 4ELOA 2O84X 5H8FB 2V25A 4NF5A 3TAJA 5DVJA 3K02A 4R9FA 2QS2A 4RNSA 2B65A 4PETA 5AA2D 4C1TA 5CBRA 1B52A 5IAIA 3OO9A 1B40A 3G3GA 1PB7A 2XXQA 4IGTA 1JVYA 3C31A 1I6QA 2AL5A 1Q1KA 5CBSA 4ZZAA 1OMPA 5KDTA 1NNFA 1DOTA 1POY1 2RC9A 5AE4A 1Z7ME 5BWJA 1BKAA 5JTYB 1ZBMA 1ANFA 2PVUA 1YPNA 2OZZA 3RTWB 1F9BA 4OTEA 4R6YA 5H8NA 1M5FA 2ONKE 3IO6A 1URDA 2XD3A 4M4GA 4P11A 4JSDA 2QRYA 3FIRA 4U22A 1Z7NE 2H5YA 2VD3A 3CVGA 3TKDA 1SBPA 1LAFE 1A8EA 3RNNA 4OYVA 1KWHA 3TFLA 2THIA 3OO6A 3T66A 3U93A 4G68C 1XT8A 2DQVA 2F8DA 1R9QA 3VLUA 4DXBA 3T9XB 2AIXA 1DMBA 1NL5A 3VE1B 1N04A 1B3EA 1S7YA 5DVIA 2I0BA 1P1WA 2XXIA 4XKRA 5I57B 3VDFA 4NF8A 3K0VA 2Z23A 5I59B 4R72A 3LBSA 3OEMA 2UVIA 3H6WA 2I4BA 1N7WA 1UTBA 4KHZE 4HCWA 1LB8A 1YAEA 3BFUA 3ODBA 3S9MC 2G29A 4PFUA 1MH3A 4OERA 2HEUA 4MBPA 3C4MA 2DE3A 1QKAA 1Y1ZA 3D4CA 2RC7A 1N0TA 3HV1A 4F3PA 3A3CA 4GD5A 1S50A 2ALUA 2V3QA 3MQ9A 3CIJA 3K6XA 4AB5A 3FUZA 1Y4CA 5AA2B 4AB6A 2QJEA 4RPNA 1IXIA 3PPQA 4GVOA 1ZIUA 1B32A 4MFIA 3BKIB 1A40A 3CSBA 2VGQA 3IB0A 1PEBA 3DLNA 3PPNA 3O6IA 3KEIA 4KD5A 4JWYA 4GL0A 3LR1A 4XIGQ 4JWOA 2PYYA 4LZ7A 1TWYA 2DP8A 3VVEA 2GRVA 3H4ZA 3PUZE 1LSTA 4G2ZA 3JYRA 2UYEA 1ZMGA 3FV1A 2O69A 4IB2A 5H8SA 4ZS9A 3FXUA 2I48A 3FJMA 3RT8A 1SQYA 3Q28A 2X7PA 3CRBA 3K00A 3KOSA 3E4RA 2HZKA 3PUXE 1SI0A 4N6PA 3ZS6A 4ZEIA 2YLNA 1WDNA 3IAZA 3N6TA 4UA8A 4ZZEA 4IO3A 5H8QA 1VE4A 3W15C 4ONYA 1URGA 3MZ9A 4OFLA 2XXHA 3MVXA 3MUQA 3ZKLA 1BIYA 2Z22A 1IEJA 5IKBA 1M5EA 4YB5A 2R6GE 2Q2AA 4DCXA 2DVZA 4UACA 1IQ7A 3FJGA 1NNKA 3SEVA 1MH4A 1VR5A 4KCDA 3SKPA 1I6AA 3TTMA 1H44A 4JDFA 4O3CA 3RY3A 5L9SA 5CRYA 3MVYA 1Y20A 2FNCA 2F5XA 4H67A 4DXUA 3IOTA 3KN3A 3KGCA 2R71A 1O64A 3B7DA 3H06B 5CMCA 2UXAA 3MZBA 3THIA 3HHGA 4NF5B 4X9TA 5A5XA 3PPOA 5H8HA 3EQ1A 3PMWA 3OSQA 3KBRA 4Q5TA 5M2VA 5F7VA 1BLFA 1EU8A 3GBAA 4LVQA 3TQWA 5TPAA 3OO7A 3IO4A 3VXCA 3CFLA 3H6TA 3UK4A 1D9YA 3FGSA 2FYIA 5CMMA 5KDTB 1ATGA 4OXVA 4N13A 2RKMA 2RCAA 2Z8EA 5CI5A 3O6HA 4JB7A 3LSWA 5DYHA 2F6GA 3ZSFA 4KI0E 3FXRA 3N5LA 2CMOA 3OD7A 3V89B 1Y3NA 5H8NB 1UTHA 2D5WA 2OWSA 3TODA 5JK4A 5I56A 2Y84A 4LZ5A 3DELB 1B3FA 2DWAA 5TP9A 3RLFE 4OVJA 4FORA 3IB2A 1MY4A 3W9WA 5B7DA 4R6HA 1FW0A 1N84A 4OETA 4BLAA 3S9LC 4LQ2A 3U92A 2HQ0A 1LAXA 4RJZA 4U21A 3OOAA 2RC8A 3ILUB 4N07A 3FVGA 4H8JA 4NF8B 4I1DA 4YB6A 4QF9A 2B3BA 1MXYA 3O29A 1PDAA 3N6UA 3PD8A 3RUMA 2G93A 3R7XA 1DTGA 1EH3A 1I6BA 4POXA 4BDOA 4RXLA 2HAUA 4GFRA 4XTCQ 4DZ1A 4YKPA 3HCQA 4OMBA 2ZYMA 4POWA 1MDQA 2XX7A 4OHNA 2DWHA 3CFZA 3TTNA 4F2QA 1US5A 3GXAA 3ILTB 3MWBA 1JETA 3VV5A 3UGWA 1JW1A 3MJNA 4F2OA 4G4PA 4AQ4A 1WVJA 1Y3PA 3ECRA 4O3BA 2RF1A 3VVFA 3E9XA 2H98A 3K6WA 1FQAA 1PC3A 4F1YA 3TPAA 3IB1A 3TTKA 1MS7A 1YTVA 3OO8A 4H5FA 4R73A 4EXKA 2H99A 4U2RA 4RK2A 2QS4A 3BFTA 5KCJA 2F34A 4G8NA 1B0HA 3MBPA 4GQOA 5AA1A 3PMVA 1QVSA 1HSJA 3O2AA 3Q27A 3G3HA 1PB8A 4GXSB 5LOMA 1XS5A 3SEXA 4EXLA 3K6VA 4Z0IA 1JW4A 1VSOA 3B6TA 1LFHA 4H1XA 2GHAA 3T93B 1GGGA 1B0LA 1DTZA 4GWOA 3V5AA 1N3XA 3DM0A 2HZLA 2F7AA 4BDLA 4F22A 2RCBA 2OWTA 3U1OA 1NFTA 4QFNA 3W9VA 3KJ7A 3KSXA 3PPPA 4OWDA 1UQWA 2ZNTA 4XXUA 3OELA 4QHQA 1D3KA 2PBWA 2VD2A 2Q89A 2UVHA 1DSNA 3KOTA 3KSJA 3IORA 4IO2A 3MW0A 3HO7A 1P99A 5AA4A 4U4XA 5DEXA 3IJOB 2A5SA 3S4UA 1SD3A 4FAJA 5CMBA 2UYFA 4IO6A 4F1UA 3U72A 4LZ8A 3N26A 5I58A 1ZKBA 1FTLA 3VFJA 1VFEA 4L17A 3EHTA 3JZJA 3RPWA 1ELJA 1NKXA 1JNFA 2QMXA 4MF3A 3UN6A 1NMUA 3G3IA 3ONMA 4JXIA 3S2VA 1MY0A 3FV2A 1M5BA 1Y3QA 4O3AA 3KN7A 3U94A 2DE4A 3RT6B 2DXYA 3RGYA 1RKMA 1PBQA 1II5A 5F1QA 4NEDA 5TPAB 4PFYA 4TOZA 3MC2A 1XOCA 5I2NA 3VXBA 2D21A 2P2AA 1B3GA 1D4NA 5EHSA 3FZVA 4OENA 1MQJA 5I2KA 4TQUQ 3SEUA 1FQCA 4C1UA 4X48A 3PUYE 3C33A 1LBCA 1XC1A 4ZE9A 1UTHB 3EF7A 3IJXB 2Y7WA 2Q9TA 3MPKA 5I56B 4ESXA 3C35A 3O6GA 5ITPA 1GR2A 3O9PA 4FIMA 5TP9B 1FQFA 1JQFA 4U1OA 4DLDA 4XKPA 1AMFA 1OLCA 1ZJLA 3IL1B 1OQGA 4G8MA 3CFXA 2DE2A 3H03A 1NH8A 1POTA 2ONRA 3MVWA 4DCYA 4X1DA 2I3VA 3SDFA 4PP0A 3IR1A 4F3SA 3TTRA 3G3JA 3OSRA 3HN0A 1TFDA 3B6QA 4U1ZA 2I4CA 3M8UA 2Z8DA 1FQDA 1T0KA 5CC2A 1XVYA 1MY2A 3T9VA 4H65A 1H43A 1SW2A 1A99A 3USDA 4RA1A 4PE5B 4P0GA 2ZNSA 5FTHA 2DXRA 2HFBA 1ZLQA 1HSEA 3CG3A 3G3KA 2UVJA 1J1NA 5JEIA 4IGRA 3S9EA 1MXVA 3IX1A 5ICTA 3AXFA 3T9HB 2OK2A 3K1NA 2PT1A 1H45A 1MRPA 4PFTA 2O68A 2I49A 1QUJA 4OEUA 3QUFA 4H5GA 2ZYOA 3HHFA 3BBRA 2DS9A 3IOUA 2NUVA 2V3UA 4GIZA 1BTJA 2A5TA 4LATA 3IK6B 2XXUA 1SYIA 2REGA 2IEEA 5BUUA 4MH5A 4WXJA 4HW8A 1SYHA 3T9UA 3I5OA 4QRZA 4ZEFA 3OENA 1AH5A 2VHAA 3DP4A 5I57A 4G68A 2I0CA 1EZPA 1P1NA 3PD9A 1OVTA 5I59A 1M5CA 3CSGA 3A09A 1A55A 5KCJB 2ZNUA 1QUKA 1TFAA 2O1MA 1N76A 4F39A 1MDP1 3QYTA 3FATA 2DOJA 4E0XA 3MVZA 2O1LA 1B05A 3V83A 1B5IA 3H7MA 3E3KA 2NVUB 3M3LA 4NTLA 4G8HA 4NF4A 3TCGA 2X26A 3RN8A 4GXAA 2QSXA 2NOOA 4LUBA 1CB6A 1PB9A 3G7WA 4MLVA 3V8XB 1ZTYA 1QKBA 4QFKA 2R9JA 3TELA 1MPBA 4GOTA 5AA4B 2RINA 5HPQA 4KQPA 2IA4A 5DEXB 3HSTA 4GF8A 3I3VA 1P1QA 3FVOA 1B2HA 4JWXA 5ITOA 2HCAA 5I58B 2F78A 2XX8A 1DPEA 1EZOA 5B70A 5AA3A 4OEVA 3MP1A 4KPTA 2V3TA 3UA8A 1UTBB 2OLBA 4IO4A 3PPRA 1R6ZA 3VLVA 4NE4A 3R26A 4THIA 4F18A 5FHOA 2XXWA 2E0SA 4NF6A 3C9HA 1MXZA 3UIFA 1MXXA 4EQ9A 2W7YA 1JEVA 4GRKA 1SW1A 1MQHA 1AIVA 5I2NB 4Z7EA 3C36A 4BDMA 1UIVA 3R6UA 4FEBA 4JBZA 1TXFA 4OZ9A 1SI1A 4OFJA 4ELQA 5I2KB 1UIUA 3GLBA 1ZU0A 2X7QA 2H4IA 4ZECA 2V84A 1P1OA 3KJTA 4F19A 4RK9A 5HM4B 3Q25A 1N3WA 4YB7A 1URSA 4WKMA 2PX1A 3MPLA 3PGFA 1A8FA 1MQIA 3WAEA 4IO5A 2O7UA 4QSEA 3TDJA 3F11A 3VVDA 1MY1A 1Y1MA 4FATA 3SEWA 3DP6A 3CI8A 1NNPA 1USYH 4U4SA 3GBBA 2ZXTA 3HPIA 5CM6A 1LLSA 1FQEA 3MAMA 2DYXA 5DT6A 3FJ7A 5CMKA 3G3FA 4QSDA 3JV9A 3EN3A 5EHMA 1B7ZA 2XXYA 5HBCA 5H8QB 1YCJA 3T96B 3LUYA 4PFWA 2F36A 4Q8RA 1OQHA 3U8QA 4MLQA 5K2XA 3ZKKA 5TU0A 4YZZA 4FE8A 1DPPA 4KYEA 4DE8A 1FTJA 1R9LA 3PMXA 3UP9A 1AOVA 2F7CA 4XKQA 4I9DA 3E13X 1B3HA 3TYHA 3TMGA 3SESA 3M3KA 5J1DA 4FEDA 2F7BA 3KG2A 4C0RA 4YMBA 4F29A 4KR5A 4EQ7A 4R6KA 3MP8A 3PUWE 2VP1A 4QFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PBHA 4QXDA 3RQTA 1US4A 3UORA 1B46A 5L9MA 4LN5A 1QW0A 2O6AA 3QK6A 3KBZA 1LBVA 2Q74A 3Q26A 5IZ1A 1FPBA 2PT2A 3K1PA 2A5TB 3T1BA 3KN8A 4RY1A 3D4GA 3S9NC 3OEKA 1LAGE 4ZEKA 2L5VA 4F1VA 3SEYA 3H3GA 4RYAA 3M3FA 4G77A 4F31B 5A5XB 5H8HB 4Q30B 1A7LA 3B6WA 4G68B 3BIHA 2D3IA 4XKNA 3FVKA 4TLMB 4HCYA 3LSXA 4WEPA 3TTLA 4FBPA 1MPDA 2H25A 1MXWA 1Y9UA 1FQBA 1FPJA 1B5HA 4QFOA 3IFCA 4PAIA 4ZEBA 1B7HA 1JVXA 4EF2A 1LCFA 4N8GA 1IITA 2UVGA 3TQLA 4BDNA 2DDKA 3PV0E 2P0SA 1NH7A 2ESNA 4RPOA 3K01A 5DTBA 4YKKA 1B3LA 4FJPA 3SETA 3C34A 4IR8A 4NF4B 1MQDA 1MXUA 4IY5A 1TT1A 4ND9A 1JEUA 4QSCA 1FCKA 2GHBA 3WAFA 3I6VA 1IIWA 2HAVA 4JSOA 4GWZA 3P7IA 4EDPA 2P3NA 2Z8FA 5ICQA 3LC8A 3QUJA 1LAHE 3IOWA 2Q2CA 4OQOA 3N94A 1A54A 1LBYA 2OJTA 2I58A 1IXHA 4LA9A 4IY6A 4GLIA 1Y4TA 4N8YA 5L8DA 4R9GA 2ABHA 3PUVE 5H8FA 1CE2A 5ISUA 4MNCA 4JVDA 1YXIA 1RYOA 1FTOA 1YZ0A 3CR9A 1SVXB 4ESWA 4DXCA 4DI4B 4YKJA 2QS3A 1SW5A 5KZTA 4P56A 1SDXA 2DSFA 1OVBA 1AL3A 2I3WA 3H6VA 4LONB 4OESA 3TEPA 3TZAA 4PGPA 4EQBA 1B51A 2NWJA 2XXRA 4GX4A 4R2BA 4PFRA 4NMYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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