3UORA

The structure of the sugar-binding protein male from the phytopathogen xanthomonas citri
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
397
structure length
397
Chain Sequence
KTTVRFWAMGKEAEVVAELVADFEKQNPTIHVDVQNIPMTAAHEKLLTAFAADGLPDVCQLGNTWLPEFALLDTLEPMQPYVARSKIVDPADYFPGVWDTNLVDGTLYGVPWYVDTRLLFYRKDLLREAGYSQMPKTWAEMEQVMAAIKRKVGPDRYAILMPLNEFEQQLSFALQQDDRLLRDHDNYGNFRGAGFRKALGFYDNMYQQGWAPKVSETQVSNVWYEFFNGYYAFYLSGPWNVREFKLRQPPGMEGNWGTAPLPGPNGLGAGIAGGSSLVIFKSSQHKDASWKLIEYLSQPQVQARFHAIIGDLPPRRSTWKLPSLANDALAHAFGDQLERVKATPKVLEWERIVQEMRLVTERVVRGGQSHDAAVQELDQRVDEILAKRRWIFEQEGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
publication title Structure determination of a sugar-binding protein from the phytopathogenic bacterium Xanthomonas citri.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABC transporter sugar binding protein
total genus 142
structure length 397
sequence length 397
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3uorA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3uorA02
3UP9A 2YPNA 5CMKA 1SDXA 4M4GA 3TMGA 1B5IA 3MQ9A 5H8HB 2GHAA 2CMOA 4GFRA 1IQ7A 2HFBA 3V5AA 2A5TB 2ONSA 4FIMA 4RK9A 1AIVA 4F2OA 2F6PA 4F3PA 3PUXE 3GBBA 1DPPA 3WAEA 3TQLA 4ZDMA 1B5JA 5CMMA 3RY3A 5CMCA 3FXUA 5TP9A 4KYDA 4ELOA 1XT8A 3C34A 2I58A 3EF7A 3TTNA 4NE4A 4THIA 4I62A 4NF4B 2RKMA 1MY2A 1JEVA 3CR9A 4KCDA 5FHMA 4YU0A 4F1UA 1FQEA 2ZYKA 5I84A 2XXRA 4Q5TA 1ZMGA 3KOSA 3LUYA 3TDJA 3LSLA 3FJMA 4ND9A 1GR2A 2D21A 5EHSA 1I6BA 1Y3PA 1ATGA 1B3HA 3T9XB 1D9YA 2REGA 5CI5A 3O2AA 4U1OA 5DTBA 1N7XA 5AA2D 4UA8A 3ECRA 3HHGA 4JBZA 4OYVA 4N6PA 3H3GA 1B7HA 4IGRA 1SQYA 1Q35A 2P1SA 2RINA 3TELA 2I3VA 3A3CA 3T9UA 3PMVA 3N6UA 4LQ5A 3HPIA 3MVYA 5TP9B 3PUVE 3K6XA 4JWXA 4LQ2A 1PBPA 4NF6A 1I6AA 1MH4A 3MBPA 1BLFA 1B2HA 1HSEA 2XXTA 3IOTA 3TCFA 2AL5A 1IEJA 3MJNA 3TAJA 1MM6A 2F36A 4QRZA 3UIFA 1GVCA 4OETA 4U21A 1HSLA 2Z22A 4QFNA 3K6WA 3U93A 3V8XB 3HV1A 3HHFA 2NVUB 3QSLA 4F19A 4IO4A 2X26A 2YLNA 2O84X 2H5YA 4ZEIA 1US5A 5TU0A 4GRKA 4IO3A 1S50A 2XX7A 4XKPA 5DVJA 4HW8A 1SI0A 3FV1A 3PMWA 4ECFA 2F6GA 4I8CA 5CMBA 3RQTA 3EHTA 5TPAA 2DP8A 5I59A 1PB7A 2Y84A 2UYFA 1P1WA 3VXCA 2D5WA 4NMYA 1B46A 2H98A 3TCGA 1UTBA 1DMBA 3OENA 4NF6B 1O7TA 2ZNSA 5M2VA 4Z0IA 1DTGA 3CIJA 4DXCA 4U2RA 3QAXA 3G3KA 5HBCA 5DT6A 3TKDA 1SYIA 4F1VA 3TUSA 3VLWA 3ILTB 3SETA 1QUKA 1NNKA 2PX1A 3VVDA 4X48A 5FHOA 1FTJA 4EXKA 4P0IA 1MDP1 3KN3A 3G3HA 4ISUA 3TZAA 1R9QA 2H99A 1Y9UA 4ZS9A 1LLSA 2PT1A 5H8NA 2O7UA 3R26A 1N0TA 4GWOA 4X1BA 1H44A 2NXOA 1QJMA 3E13X 4FEBA 1MRPA 1RKMA 1B3GA 3TYHA 5CBSA 4HTGA 1Z7ME 3U94A 2Q2CA 1M5CA 3FD3A 4YB5A 3C9HA 1B4ZA 3DELB 4O3AA 3VLVA 2B65A 3OMBA 2R6GE 3VDFA 2P2AA 3PGFA 5L9OA 5KDTA 4U1ZA 3C32A 2O68A 2RC9A 4WEDA 2UXAA 1TT1A 1USYE 3UA8A 1OIBA 2AIXA 4PFYA 1LFGA 3IB0A 3K4UA 3PUZE 4ESXA 4F22A 2P0SA 3M3KA 3VVEA 4HCWA 3E4RA 4GD5A 4POXA 3KBRA 1YTVA 1MY4A 2ZNTA 2IEEA 4JB7A 5FTIA 1AMFA 3G3JA 3MVWA 1MS7A 4RXLA 3QYTA 5H8SA 1A55A 5H8NB 3BKIB 3QXMA 5BWJA 2RC7A 4KPTA 1Z7NE 4YB7A 4ZE8A 1LAGE 3OD7A 3U8QA 4H8IA 1BP5A 1IXGA 2HCAA 3HSTA 3JYRA 4GXAA 1ZBMA 4LA9A 5L8DA 3H6UA 2DS9A 4MBPA 1IUDA 3K02A 1JNFA 2XXHA 3HN0A 3PPOA 3OEKA 2I6EA 3O6HA 1B05A 2Y7WA 3CSBA 1PB8A 2QJEA 4WKMA 2Z23A 3FV2A 1A8EA 2VOZA 4JDFA 4MF3A 4EF2A 1EZOA 5I58A 4R75A 4XKNA 5DEXA 2GFEA 4F39A 1WVJA 5K2XA 3B6WA 2O6AA 4DE8A 3FIRA 1D3KA 4E0WA 5L9MA 2ONRA 2QPQA 2REJA 1RYXA 3B6QA 2OCUA 1OQHA 4NEDA 1POTA 4H65A 4RPNA 2F7CA 4TQUQ 3OELA 3AXFA 1P1QA 4RY1A 4YB6A 5H8QB 4YZZA 1A54A 4ZEDA 4GVOA 1AL3A 4JSDA 5FTHA 4N07A 3S9EA 5F7VA 1WODA 1LFHA 3TCHA 3L6HA 5DYHA 1NNFA 4P11A 3LSXA 3FVNA 3G3IA 4R74A 3TTLA 2QMXA 3KSXA 3RLFE 5CBRA 1PB9A 4PFWA 1B1HA 5AE4A 1IXCA 4QFLA 4FAJA 4R6YA 4IO7A 1JVYA 3FZVA 1MQGA 4H8JA 5CRYA 2NUVA 3K2DA 4HCYA 3SEWA 4C1TA 4R2BA 3KFMA 4YKKA 3TODA 4RK2A 3TTRA 4XKQA 3MW0A 1SVXB 3D4GA 2ZYOA 3ONMA 1QUIA 2XXXA 4O3CA 3IO6A 2GHBA 3OXNA 1NH7A 4JXIA 1ZKBA 5AA2B 2H9BA 2UVJA 2DE4A 1M5DA 1D4NA 2DQVA 1B7ZA 1ELJA 4LUBA 2HAVA 2XXPA 2RCBA 4P0GA 4I9DA 3IB1A 4G68C 3PMXA 2Q9TA 2XD2A 1OLAA 5A5XB 3HCQA 2Z8FA 1SW1A 3SEUA 2DWHA 1GV8A 3TFLA 2PYYA 2HXWA 3E3KA 3LBSA 1ZTYA 2I49A 5ICTA 1H43A 1VE4A 3IL1B 3R7XA 1JW5A 1MM7A 3IAZA 2NOOA 4O3BA 5J1DA 4KI0E 2ALUA 1OVBA 4RNSA 4QFPA 2B3FA 4PFTA 4G77A 1L5TA 1QKAA 2I0CA 4KCCA 4GXSB 1IXHA 3O28A 3QUFA 4G8MA 3U92A 4ZEKA 4R9GA 1VSOA 2D3IA 4FJPA 1YAEA 2V3TA 1H45A 4HS7A 1MQDA 1SI1A 3W15C 3B6TA 4OFOA 3SERA 4U23A 1MXXA 2Q2AA 3VFJA 3SDFA 4YMAA 4G2ZA 3TQWA 1B1XA 1QKBA 2QRYA 4R9FA 1MPDA 3MP6A 3FJ7A 3VLUA 2ZNUA 2LAOA 3KG2A 4DCXA 4PQJA 2V84A 3EHUA 3PUWE 3U1OA 1LB9A 3IJOB 1S9TA 4GF8A 3VVFA 4GIZA 3OO8A 2H25A 1MY1A 1XOCA 1MQHA 3T9HB 3A3UA 3CG3A 2DWIA 4AB5A 1A8FA 2OJTA 4KHZE 1TFAA 4NWDA 1ZIUA 4XXUA 5DVFA 3CI8A 3MC2A 2R71A 1VFEA 3IO4A 3S2VA 3E9XA 4RPOA 2XXVA 3T93B 3C31A 1JEUA 3Q25A 4Q30B 4KD5A 1IIWA 5CC2A 3KGCA 2PMSA 3OSRA 1EZ9A 5F1QA 1TFDA 3O9PA 4GQOA 1LAXA 4XKRA 1Y3QA 1B0HA 5JEIA 3OO9A 1FCKA 1Y3NA 3BFTA 1MXWA 3EHSA 3Q26A 2Q8JA 4LP2B 1ZLQA 2PBWA 2Z8EA 4RYAA 4ESWA 3ILUB 1MPBA 2QL3A 3N6TA 1BIYA 2V3UA 3FVOA 1B40A 5B70A 4KQPA 2W7YA 1PC3A 1VR5A 3T9VA 3N5LA 3SEYA 4BDRA 2V25A 5L9SA 3IJXB 1LCTA 1HSJA 1R9LA 2HAUA 4YKIA 2HQ0A 3Q27A 4ONYA 3MVXA 4NF5A 3ZSFA 1M5EA 3MVZA 1UTHA 2OWSA 1B5HA 3T22A 4DXBA 3KJTA 4EDPA 3M3LA 4WEPA 2F8DA 4QFOA 5TPAB 3OO6A 3MUQA 5I59B 3O97A 3W9VA 4H1XA 2AYSA 4FECA 1FQDA 2GH9A 3KOTA 3A09A 3JZJA 3KN7A 5ICQA 3KZGA 1DSNA 4F3SA 5CM6A 1ZU0A 3FATA 4QSEA 1UTBB 2F7BA 4BDNA 2DOJA 3PD9A 3TTMA 4IY5A 3KJ7A 1OLCA 1B0LA 3UGWA 3O66A 1BTJA 4IY6A 2VD2A 3MAMA 4F3BA 5AA4A 1B58A 5ITPA 3PUYE 2HZKA 3MZBA 2O1LA 3H6TA 2NWJA 4DCYA 1B51A 1Y4CA 3G7WA 3MWBA 2ONKE 2RC8A 5I2KA 3K6VA 1Y4TA 4FORA 3DLNA 2XD3A 2XHDA 2Y7RA 4DLDA 4JWYA 1DPEA 1NMUA 1IZ1A 3PPPA 3HO7A 3N94A 3IORA 4EQBA 1CB6A 4JWOA 3OEMA 3CVGA 5BUUA 4LZ7A 2HZLA 4LZ5A 4GL0A 4YKJA 1R6ZA 1D9VA 1Y1ZA 1FQCA 1MXYA 5KDTB 5JTYA 1MXUA 4X1DA 1P1UA 4RJZA 1N7WA 1MY0A 4XTCQ 1TXFA 2WKYA 3FJGA 1AH5A 2RCAA 3VE1B 1POY1 3MZ1A 4F31B 1SBPA 3R6UA 2ZYMA 4H6DA 1FTKA 4IO2A 1SW5A 5B7DA 2AL4A 2UYEA 3IK6B 3EN3A 2RF1A 3H7MA 1N84A 2DE3A 1A40A 4ZE9A 4LONB 1O64A 2E1SA 1NH8A 1WDNA 1LAFE 5H8HA 1LBCA 4ZZAA 4OERA 1GTKA 4G68A 2O69A 1UIVA 2G93A 1LCFA 2DE2A 2XXQA 1H76A 3OSQA 3QUJA 1II5A 3PPQA 3EQ1A 1EU8A 5AA3A 4IB2A 4ZEBA 1PEBA 2QS2A 3IOUA 4OEUA 3RGYA 3RTWB 1B7UA 5AA1A 3F11A 4BDQA 2DSFA 3PU5A 2B3BA 1XVYA 5JTYB 1XS5A 1OMPA 3T96B 5H8FA 2DXYA 4UACA 4F1YA 3K6UA 4OESA 5I58B 3IB2A 1H3DA 4OMBA 5DEXB 3V83A 2F5XA 3OOAA 1LBBA 3M8UA 3H6WA 2GRVA 5LOMA 3KEIA 3C36A 3W9WA 3SKPA 2R9JA 4BDLA 1AOVA 3DP8A 5HPQA 1N3XA 4EQ9A 2ESNA 4G68B 4PFUA 1DTZA 3LSFB 4R6HA 4AQ4A 3C35A 3THIA 2I48A 2O51A 3U72A 2UVIA 3UORA 3Q29A 4OEVA 2PVUA 4DXUA 4C1UA 3TTKA 3T66A 1FTLA 1EH3A 2V3QA 3PV0E 3GBAA 4BDOA 3ZS6A 1FQFA 1B3LA 1I69A 3M3FA 4N13A 2FYIA 5H8FB 5KZTA 2DWAA 3GXAA 1MDQA 3OO7A 1MXVA 1TWYA 2KLFA 3P7IA 1URGA 3RNNA 1LGBC 4I1DA 2THIA 2DVZA 3IX1A 4OTEA 4R2FA 1B9JA 4EF1A 2XXWA 2ANJA 3RPWA 2ZMBA 1MPCA 4FE8A 4XIGQ 4YAHX 1JW1A 3MZ9A 5ELVA 4ELRA 2QS1A 3FUZA 4BLAA 4DZ1A 1FQBA 3CFLA 3FXQA 1B3FA 3N26A 3G3GA 4U4XA 1NNTA 3USDA 4ELPA 3GZGA 4KYSA 4Q8RA 2F7AA 3DP6A 3RT6B 1A99A 3CSGA 1A7LA 2ABHA 2VP1A 3PPRA 4H5GA 3CG1A 4EXLA 3K01A 2H4IA 3I5OA 2XX8A 2XXIA 1YCJA 2Q88A 2Y7IA 1UQWA 3RUMA 4NWCA 4DIGA 3VV5A 4LATA 1B3EA 5KCJA 2YJPA 1PBQA 1NKXA 1QULA 2I4CA 1GGGA 3O6GA 5I57A 3CFXA 1M5BA 1MH3A 3DM0A 4LZ8A 4TOZA 2VD3A 1ANFA 5JK4A 3UN6A 4KFQA 4F3GA 4KR5A 4OFJA 4YKPA 3PPNA 1M5FA 2DVCA 2OZZA 3FXRA 4L17A 4MH5A 3K1NA 2QS4A 1F9BA 1YPNA 2QMWA 1NNPA 3KN8A 2F35A 4TLMB 4G8HA 5I2NA 1R1NA 3QK6A 4QHQA 3C4MA 2UVHA 2QS3A 2I3WA 1FQAA 3K1MA 1LSTA 1QUJA 4GOTA 3L6GA 3UK4A 3JV9A 1B32A 1T0KA 3ZKKA 2DWJA 1N3WA 2OBGA 5HM4B 2M8CA 4OQOA 3RTFB 1PDAA 2DXRA 1O63A 1Y20A 2PT2A 5KCJB 1KWHA 4U22A 3MPKA 3TEPA 2QSXA 5I57B 2FNCA 2F97A 2A5SA 1XVXA 4NTLA 4E0XA 1SYHA 1MY3A 2BJJX 4PE5B 3TPAA 2OWTA 2OLBA 4Q0CA 2Y7KA 4F29A 1ZJLA 2XXUA 4PETA 1N04A 1NFTA 3O6IA 1JQFA 2XXYA 1EZPA 3S9NC 1DOTA 4KYEA 1QVSA 4K3FA 1UIUA 4MFIA 1MG1A 1P1OA 4OHNA 4IO5A 5DVIA 5I2NB 3MP8A 4X9TA 4ELQA 1I6QA 2VHAA 3CFZA 2X7PA 1XHYA 3S9MC 1RYOA 2G29A 3IR1A 3RN8A 1MQIA 4IO6A 3SESA 3ODBA 1FTMA 3LC8A 1URDA 3CRBA 3I3VA 2XX9A 1USYH 4F18A 3C33A 2I4BA 4R73A 4OVJA 4AB6A 4ZEFA 1P1NA 3K0VA 2O7IA 2F34A 4TLLB 3LSWA 3G3FA 4NF5B 3FGSA 3GLBA 1SW2A 1UTHB 5EYFA 2F78A 2Z8DA 1XC1A 4NF8A 4R72A 1LAHE 4H5FA 4R6KA 1NL5A 1S7YA 1SW4A 3B7DA 4QSCA 3H6VA 4OENA 3BBRA 3H03A 4G4PA 4QSDA 4WXJA 5H8QA 4QF9A 5FHNA 4ZZEA 2HEUA 4U4SA 2FA7A 4QFKA 3S4UA 4Z7EA 1FTOA 4OXVA 2Q89A 5I56A 2E0SA 4JSOA 3H4ZA 4EUOA 3ZKLA 1OQGA 2UVGA 3S9LC 4YICA 5K2YA 1BKAA 4PP0A 3MP1A 4BDMA 4DDDA 3Q28A 1LFIA 4MLQA 5AA4B 2VGQA 5ITOA 2OK2A 3DP4A 3FVKA 3IOVA 1MQJA 1J1NA 4OZ9A 3MPLA 4POWA 3VXBA 3H06B 1Q1KA 5I2KB 4F2QA 1JW4A 4ZECA 2V93A 4H0WA 1B4HA 4FEDA 5AA2A 3V89B 3QIMA 4C0RA 1SD3A 3SEVA 3K00A 5EHMA 3PD8A 2A5TA 5IKBA 3RT8A 1LB8A 1B6HA 4NF8B 1QW0A 4GL8A 2X7QA 4OFLA 1FW0A 3I6VA 1P99A 3FASA 4RA1A 4IGTA 4FATA 3SEXA 5A5XA 1JETA 1OVTA 4LVQA 4YMBA 3WAFA 3IOWA 4H67A 2O1MA 1US4A 1CE2A 2DYXA 4M1VA 1N76A 4NF4A 1IITA 2IA4A 4EQ7A 3EPEA 2ZYNA 2I0BA 3O29A 4OWDA 1URSA 5I56B 1Y1MA 2ZXTA 2CZLA 3FVGA 5IAIA 4GLIA 1MXZA 1JVXA 1IXIA 4G8NA 1B52A 5ISUA 3K1PA 3LR1A 3D4CA 3BFUA 3KSJA 2Y7PA 1VFDA 4MLVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UP9A 2YPNA 5CMKA 4HXVA 1SDXA 4M4GA 3TMGA 1B5IA 3MQ9A 5H8HB 1DBZA 2GHAA 4OANA 2CMOA 4GFRA 1IQ7A 2HFBA 4N8YA 3V5AA 2A5TB 1AWBA 3PTYA 2ONSA 4FIMA 4RK9A 1AIVA 4F2OA 2F6PA 4F3PA 3PUXE 3GBBA 1DPPA 3WAEA 3TQLA 4ZDMA 1B5JA 5CMMA 3RY3A 5CMCA 3FXUA 5TP9A 4KYDA 4ELOA 1XT8A 1NV0A 3C34A 2I58A 3FBPA 3EF7A 4GBVA 3TTNA 1BK4A 4NE4A 4THIA 4I62A 4NF4B 2RKMA 4P8BA 1MY2A 1JEVA 3CR9A 4JVCA 4KCDA 5FHMA 1FPGA 4JVIA 4YU0A 4PBHA 4F1UA 5FBPA 1FQEA 2ZYKA 5I84A 2XXRA 4Q5TA 4X04A 2OX3A 1ZMGA 3KOSA 3LUYA 3TDJA 3LSLA 3FJMA 4ND9A 1GR2A 2D21A 5EHSA 1I6BA 1Y3PA 1ATGA 1B3HA 3T9XB 1D9YA 2REGA 5CI5A 3O2AA 4PFBA 4U1OA 5DTBA 1IMBA 1N7XA 5AA2D 4UA8A 2FHYA 3ECRA 3HHGA 4JBZA 4OYVA 4N6PA 1NI9A 3H3GA 1B7HA 5IZ3A 4IGRA 1NV6A 1SQYA 1Q35A 2P1SA 2RINA 3TELA 2I3VA 3A3CA 3T9UA 3PMVA 3N6UA 4LQ5A 3HPIA 4NG7A 3MVYA 2FBPA 5TP9B 3PUVE 3K6XA 4JWXA 4I3YA 4LQ2A 1PBPA 4NF6A 1I6AA 1MH4A 3MBPA 1BLFA 1B2HA 1HSEA 2XXTA 3IOTA 1NV1A 3TCFA 2AL5A 1IEJA 3MJNA 3TAJA 1MM6A 4MNCA 2F36A 4QRZA 3UIFA 1GVCA 4OETA 4U21A 1HSLA 4N81A 2Z22A 2PCRA 1Q9DA 4QFNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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