3US3A

Recombinant rabbit skeletal calsequestrin-mpd complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
EEGLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSIYVFKEDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKNKDSEHYKAFKEAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGYEFLEILKSVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Glycosylation of skeletal calsequestrin: implications for its function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calsequestrin-1
molecule tags Calcium-binding protein
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 103
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3us3A03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3us3A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3us3A02
3C71A 4TRXA 4CHSA 2C8UA 3M1GA 2X64A 4HQSA 3CMIA 4PQ1A 3F4RA 1XW5A 1Z5YE 1ILOA 1ZCPA 1VRSD 4J2FA 4L0UA 1TU7A 9GSSA 2HLSA 1R5AA 3ERGA 3HJMA 4TXOA 2TIRA 1FB0A 5B8AA 3ME7A 4MH3A 3EMXA 2VCVA 1GTIA 2QGVA 4G2EA 5ECMB 6GSTA 3APSA 3IR4A 3ZVJA 1YQ1A 1QUWA 1XWGA 3G7JA 2GQLA 1Z7RA 4F2IA 2B5EA 2IMKA 2IJYA 3IXRA 2CQ9A 5F06A 4WF4A 1TW9A 2VLVA 1B4QA 2I1UA 2CVDA 1KBNA 1GTUA 4IKHA 4NV2A 3S9FA 5INYA 3TGZA 3E0UA 1T7PB 2HFDA 2V32A 3HY2A 4AJ7A 4ACSA 1TK0B 4O5RA 3LYPA 4OCEA 13GSA 4ECCA 16GSA 2P31A 1GP1A 2IIYA 1AXDA 4EVMA 2LRCA 3UVTA 2DJ3A 2H19A 2LQQA 2HRFA 4X43A 4O92A 4IQ1A 2IFQB 1I5GA 1A23A 2A4VA 3GL5A 1SKWB 1GH2A 20GSA 3EURA 1U3AA 3DVWA 1FVJA 5KN3A 2QC7A 3F6DA 2B1LA 3EINA 2YV7A 1JHBA 4WR5A 4BWSA 1TRWA 1C72A 4K7OA 3NIVA 5J3RA 5ID2A 2P5RA 4ZXGA 1EZKA 3LJRA 2VL9A 1SL1B 2LSTA 2MMZA 4XS6A 5IMAA 4MJCA 1OKDA 1XWBA 3O3TA 4MLYA 1PX6A 7GSSA 2PERA 1HNCA 4FH8A 2P5QA 2K8VA 3F4TA 2H8LA 3DXBA 5F05A 3C8EA 2DIYA 2OE0A 1SK0A 1W89A 4N10A 1GSQA 1EWXA 2FD3A 3CTFA 3HZ8A 1TRUA 4ECIA 4Q5RA 3IA1A 3KIJA 3ZFLA 1JZRA 4K0GA 4RI6A 5D9XA 4ECBA 2ON7A 3P90A 1SL2B 5IMCA 4GSNA 4F0CA 3D5JA 4KGIA 5DALA 2XC2A 2EC4A 3J7Yb 1YEXA 2H0IA 1JFUA 3GURA 2DJKA 2YN1A 2AYTA 1E2YA 2L59A 3KTLA 1Y6EA 4V1Ap 5ECRB 3KD0A 1ERTA 4N0ZA 2CX3A 2R3XA 3G9BA 1M2DA 3RHCA 3ISOA 4YH2A 1TRSA 2VL2C 1X0RA 4KB3A 2JZSA 3RAZA 2YJHA 2GDRA 5CRWA 1BG5A 1FHEA 1GNEA 1YZXA 3TKQA 3L9SA 1F9MA 2HYXA 1K0BA 5ECQB 1GNWA 3TRXA 1XXUA 1KNGA 12GSA 4MZBA 1U6TA 1H4OA 8GSSA 4TVEA 4WKWA 1O85A 3CYNA 1EOGA 1Z7PA 3H93A 3C7MA 1A8YA 5IPGA 3TKSA 1ACVA 1VF1A 1YEPA 1TK8B 2E2GA 3SBCA 1USBA 4IBPA 2PN8A 4NMUA 3US3A 1CQGA 1YKCA 1XPVA 1A0RP 2C0EA 3M9KA 3RBTA 4XHMA 4YQMA 4IHUA 1CQHA 1K0MA 1HYUA 1X5CA 3ERWA 1F3AA 2QKEA 2YNXA 1ERWA 2H1BA 4WBJA 3VPTA 3GIXA 4LLRA 2F51A 3LWAA 1S3CA 2NDOA 1GTBA 1ZGNA 1QMVA 2C4JA 4I2UA 2VLTA 4MK3A 4YQUA 2H73A 2H72A 3UIWA 1K0OA 1EOHA 3QDNA 4TR3A 5ECHB 2L5OA 2AHEA 2M46A 2IWTA 2X8GA 2CZ3A 3TJFA 4DSQA 3C73A 4NPBA 2VO4A 2O87A 2RUEA 5JWRB 1TTZA 3IDVA 3GN3A 4G9HA 1EGOA 2L57A 1FB6A 1TI3A 2C0GA 5ABRA 1UC7A 1M2BA 4TW5A 5HFKA 2K18A 4MPFA 1VF3A 3IV4A 3KTBA 2OACA 5G2ZA 2GGTA 1ZL9A 4Q5FA 1MD4A 1WE0A 3GA4A 2GLRA 1FAAA 3GTUB 2GSTA 4GLTA 3HDCA 3O76A 2KUCA 5LNKe 1DE1A 3MNGA 2R4VA 3VI5A 2YCDA 2B5XA 4AGSA 4EF0A 5H5RA 2FHEA 4F82A 2H6YA 1A2LA 2WB9A 2MZCA 2REMA 4K8MA 1GSSA 2WGRA 3KEBA 3F3QA 2NBSA 1J08A 2MBTA 5DJMA 22GSA 3F4SA 1FG4A 3QR6A 1ZYEA 4K9ZA 1J0FA 3Q19A 5D93A 2MMAA 4G10A 1V2AA 1RK4A 4N30A 2AJQB 4ZB6A 5GAND 2N5FA 1S3AA 3PH9A 1K0DA 2HZEB 3CRUA 3W6GA 3WGDA 4EKZA 2VCTA 1V58A 1XW6A 1Z6NA 1A0FA 4RQRA 1YF1A 5C04A 4XS4B 1MTCA 4PUFC 2N5AA 2N5BA 5FT3A 3A2VA 5G1LA 3C1RA 5D96A 6GSXA 5FHIA 4HZ2A 1JZDA 1PN9A 1U87A 2PVOC 4G19A 1W4VA 4GXZA 2HSHA 5J4UA 3LFLA 4IJ3A 3QAVA 3TUEA 5F0GA 3KXOA 1K0NA 3FK8A 5H5QA 1F37A 5ELGA 4EXJA 3L78A 3CRTA 1OE8A 2IMEA 3R2QA 3DMLA 3FKFA 2H66A 2J9HA 2LKUA 3LQ7A 2R5GA 2O85A 1OE7A 4GWRA 3A2XA 1F6MC 1TU8A 10GSA 2GTUA 1E6BA 5ECKB 2HRNA 5FWGA 11GSA 3QFBC 3D22A 2XPEA 1O6JA 2GSRA 2K9FA 1NM3A 1K3YA 4JU5A 5LCZA 1OC3A 4K7IA 4HU7A 2LV3A 4IQAA 4K6XA 3IHQA 4EC0A 4AF2A 1YF0A 5ECPB 2YWMA 4V2MA 4BA7A 2IFQA 5D9TA 1R7HA 3N5OA 4EE0A 1K0CA 4PNFA 2XPDA 4MJBA 3GFKA 2K6VA 5LD0A 5IMFA 1FVKA 2GZZA 5KN0A 1G6YA 5IOWA 2I9HA 1EGRA 2B6MA 3GX8A 2DIZA 1TI1A 1EEJA 1HNAA 5IPHA 4OFNA 19GSA 3FZ5A 4PXOA 5DCHA 2FGXA 2AV4A 2VL3A 1BQ7A 2LRNA 3EU3A 1WJKA 2WULA 3TKSC 1PRXA 4HJMA 1N8JA 2FWEA 5L71A 3TKSE 1KTEA 4BVYA 2M80A 1IYHA 2LJRA 3TCOA 2C80A 4IN0A 3DEXA 1SKSB 3W8SA 3ZRDA 3H4KA 1O8XA 4POLA 4X1UA 1T4YA 4KE3A 2YP6A 3I6AA 1Z9HA 1GLPA 1MDIA 1PX7A 1JZOA 1FOVA 2H0HA 1UN2A 1JLVA 4YQVA 14GSA 2WS2A 4N0VA 1XFLA 1AQWA 4JR4A 3TDGA 2O89A 1ZMAA 2NVLA 3ERFA 4RI7A 1SK2A 3ZLPA 3H8QA 1M9BA 1EP7A 4LL4B 3P7XA 3QCPA 1N2AA 1O73A 1R4WA 4I97A 3APOA 4JEDA 4V2NA 2ZNMA 3FHKA 4JBBA 5CO3A 2B3SA 4N11A 1PKWA 1U3IA 3IAS2 4PNGA 4WBRD 3N9JA 3TJBA 2YWIA 2WJUA 4MCUA 1NHOA 2FLSA 2IMIA 1AC1A 1V57A 4PQHA 4P3YB 2IMFA 3BJ5A 1GWCA 1PGTA 3K8NA 4E8HA 5HFIA 2H01A 2WFCA 2IL3A 4ZL8A 4HDEA 2DJJA 2HZFA 2L6DA 2FNOA 4E8EA 1TDIA 1SL0B 2H71A 1HNBA 5KEJA 3LG6A 1SJ6A 3DVXA 4JZQA 4ZBBA 5G30A 5J41A 3EE2A 5J5NA 2GS3A 2XBIA 4J56E 2TRXA 5AGYA 4L5LA 2B5YA 4OO4A 5CRHA 3VWWA 3EU4A 4ZL9A 5B7CA 2DC5A 3KJYA 4KA0A 2R2JA 3UL3A 2VD1A 2PGTA 2KOKA 3IK7A 4ZBAA 2CAIA 2LEGA 3LEFA 3KM6A 1QK8A 4RQXA 1THOA 3GKKA 2PMTA 2LJKA 3F3RA 2JSYA 3M8NA 3VLNA 3ZL5A 2H0GA 4YAPA 2RIIA 3GKNA 1AAZA 1BYEA 1YY7A 18GSA 3ZVJD 4IGJA 3GKXA 2LTKA 2GQKA 3OR5A 3VFIA 1SYRA 2OBIA 2GQMA 1SD8A 2OA7A 5D8IA 3IAM2 2VD0A 1T4ZA 1MEKA 4NAXA 2OJLA 2H6XA 3UBLA 3EYTA 3FZ9A 5IM9A 1T00A 5A4UA 1EV9A 2VCWA 4TOPA 3GH6A 1B4PA 3QMXA 4CDOA 4ISDA 4BPYA 4KDYA 2P0GA 5ECNB 4GCIA 3TOUA 4MABA 4OO5A 1BX9A 1YDKA 3EWLA 3TKPA 1T3BA 1JLWA 2J23A 3DKSA 1X5EA 3LSZA 3VK9A 2YV9A 2VM1A 4MP4A 2CX4A 3GX0A 4GTUA 5CRGA 2MMNA 2PWJA 5G5FA 1EV4A 4ML6A 17GSA 4I2TA 3GV1A 3GMFA 3UJ1A 4EUYA 4ML1A 2H1DA 3GTUA 3GRXA 5DBQA 4RUVA 2H75A 3F0IA 2BTOT 3TRQA 3CBUA 2VLUA 3A5WA 4OWYA 2R6KA 2GT6A 1LJRA 1X9MB 1MD3A 2GZYA 3CSJA 3QAWA 3DYRA 2HT9A 3KH9A 4FIWA 3VURA 1LBKA 3DD3A 3VWVA 1ABAA 5DDLA 2DJ0A 1M99A 1R5PA 3LXTA 1K0AA 2CVKA 1GUMA 2GVPA 3HYPA 2FCHA 5IOXA 5GZZB 4XIHA 4KX4A 3QOUA 4FYCA 1XWKA 3VWXA 2CA8A 2HZEA 5EPFA 1XVWA 2JZRA 3DIEA 4F9ZA 3F9UA 3DWVA 1G0TA 4XS4A 2DSAA 4ZL7A 5ECOB 3FW2A 2PVQA 5CAXA 4I6XA 5EVOA 5IMVA 3IPZA 4AJ6A 1O8WA 3GNJA 2FWFA 3P8WA 3PR8A 4DEJA 3F6FA 4PGTA 1Q4JA 4XCSA 2JACA 3MDKA 3I43A 4TR1B 3WYWA 3Q6OA 3C1SA 2H1GA 1XWAA 4KUNA 4MZWA 1IYIA 1AQXA 1F2EA 1BEDA 2ALBA 4MZCA 3GUSA 3IBHA 2F9SA 3GH9A 4OCFA 1QXHA 1V9WA 5CRDA 1VF2A 4TXVA 1T1VA 3U6VA 2EIQA 3HVVA 4NV5A 1AQVA 2LRTA 1PQNA 3KMNA 1TXXA 3TJJA 3TJGA 2PBJA 3CSHA 5ELAA 5GSSA 1NSWA 4JR6A 3I9V2 1SKRB 4KCEA 1SU9A 1GL8A 2JADA 2RLIA 2NPBA 2PPTA 2WCIA 2YWOA 3TJKA 2CZ2A 4F0BA 5D9WA 1ML6A 3GYKA 1TK5B 2IPAA 2CV4A 3QFAC 1WWJA 3HA9A 4I5QA 4DSSB 3LORA 1G7OA 1A24A 4L5OA 1RQMA 6GSWA 3D4TA 4K1FA 1OC9B 1YKAA 3F8UA 4KCAA 1A8LA 2CAQA 2VCXA 1GSEA 2LUSA 4GSTA 3ZMLA 3FY7A 4TKYA 2FWHA 2KLXA 2X8CA 1B9YC 1WMJA 2C3TA 1ON4A 1ZZYA 1HD2A 2F8FA 5EY6A 4POMA 1AIUA 5AIXA 1F3BA 1Y25A 3EVIA 5DJLA 2C3QA 4WR4A 4IS0A 2EIRA 1WRYA 2RM5A 4O7HA 4HJ2A 4Q5NA 3NOFA 2O7KA 2VCQA 2YANA 4XRAA 4NHZA 3VI7A 3A2WA 5KN2A 2IN3A 3A3TA 4IW9A 3CSIA 1EEMA 2B1KA 3L4NA 1FW1A 3IC4A 2OE1A 5IO2A 5ECLB 1THXA 1GSDA 4LMWA 3FR9A 2I3YA 5DQYA 2VAFA 2JZTA 5IMZA 3UVHA 4IELA 4L0WA 4OD7A 4LMVA 3QAGA 4Q5QA 3UBKA 2LQOA 2H70A 3FZAA 2FUG2 5HR2A 2E2MA 3TB2A 3HJOA 4ILFA 5CNWA 2LNTA 3FR3A 4KDXA 5JWQB 1TKDB 5KN1A 3HZ4A 4LL1B 2AAWA 4XRDA 1PA3A 4GRFA 5D9VA 4OFTA 3WT2A 4K2DA 1M2AA 4POBA 4ULXA 4KSOA 4O32A 1QQ2A 2H74A 4AJ8A 4HI7A 4IP1A 2C1YA 3IE3A 3PINA 1Q98A 1VGLA 5HQPA 1J9BA 4HEA2 4MF5A 5J9BA 3ZFBA 5DCGA 2FA8A 1T8EB 4WF5A 1YJ6A 4EDYA 2MYGA 4EDZA 1WPIA 2PUKC 2WDUA 3ZZXA 4PX1A 2WRTA 2A2SA 1WOUA 2AUVA 3KP8A 2H30A 4LA1A 1JZWA 1QGVA 3MSZA 2YZUA 4Z7XA 3E9JB 1AW9A 1PD21 5AISA 2VIMA 3BD2A 1GLQA 5COHA 6GSSA 3LYKA 1U88A 1XWCA 4D73B 2DJ2A 3RPNA 2BJXA 5DVBA 2I4AA 4OFMA 1XOAA 3FZ4A 4GSSA 3D6IA 1ERVA 3NZNA 5JWOB 5IO0A 3VPQA 2H6ZA 4GF0A 1XIYA 4H86A 5IMDA 3WGEA 3VWUA 1NW2A 5F07A 2GZPA 2G2QA 1DBYA 4HS1A 3ED3A 2VCZA 2AB6A 1SD9A 4ID0A 4ZB8A 1URMA 4FYUA 1OYJA 2HE3A 4HQZA 2ZUPA 3HVSA 3M0FA 2L5LA 3HKRA 4NWYA 1B9XC 5DQSA 2NTOA 5DAKB 5HR1A 2RM6A 1DUGA 2G0FA 2MMOA 4F03A 2GSQA 5E4WA 3H79A 4FYBA 3APQA 1B48A 3L9VA 3O6TA 5HFGA 1V98A 3QPMA 1Z3EA 2H1AA 1VF4A 1PKZA 4I8BA 1GULA 3BBYA 3ZYWA 3FRCA 5B6NA 3M9JA 3ZTLA 5G5EA 3H1NA 3HCZA 1NHYA 4TXOB 3GSTA 2YOIA 4V1Ag 1BAYA 4HOJA 3ZIJA 3L0HA 3RDWA 3UEMA 4KH7A 4BL7A 2XHFA 5JCWA 3D0ZA 2V6KA 4POKA 4MPGA 2KP2A 5CYYA 4EO3A 1MDKA 3F63A 5B8BA 1S3DA 4J57E 3KGKA 5IIZA 3EMPA 2V2GA 2ES7A 1X9SB 1XOBA 2Z9SA 4KNDA 4HUAA 5GSTA 2LNSA 5B6MA 1AUCA 3CTGA 3J7Yk 3TOTA 4TN8A 2GT5A 2HSYA 1K3LA 4L8EA 4TR1A 4OMVA 3LGCA 4MF7A 2TRCP 3G7YA 4NXIA 3WGXA 4ECJA 2BMXA 2PU9C 4PUAA 2DJ1A 1UVZA 1H75A 2DMMA 2KP1A 3EC3A 3M3MA 3IRAA 5ID2B 6GSUA 2EIOA 3IK9A 5JCGA 1GSYA 4MF6A 2ON5A 3ZMKA 3FR6A 1LU4A 2CVBA 4MJEA 3D21A 4IP6A 4XS1A 1TOFA 5D73A 2C3NA 2HI7A 3ZIVA 5HR0A 3CXGA 4QQ7A 5AN1A 2YPMA 2IMDA 1OAZA 4KAEA 4ZILA 1GSFA 1R26A 4HU9A 2HXKA 4GQFA 1ST9A 4JRRA 4V2LA 1OVNA 2F3MA 2JSZA 6GSYA 3WT1A 1A2JA 5A4VA 3UAPA 5JCUA 4IVFA 4XTSA 4KDUA 5DALB 4CW9A 3D4MA 4DSSA 5C00A 2E0QA 4KW6A 1O81A 1OC9A 4WXTA 5HR3A 4MDCA 3I69A 2D2ZA 2GSSA 3MAKA 1DE2A 2X99A 4WEYA 1SK1A 2C0FA 3RHBA 3PGTA 2FA4A 1WP0A 2YZHA 2MBSA 1DSBA 2DLXA 2JL4A 5F8BA 3Q18A 3GKMA 5EL8A 4ZB9A 2LS5A 3KCMA 3UARA 1ERUA 2KHPA 2VUPA 3BCIA 4MH2A 3HHVA 1WIKA 3Q74A 1FO5A 2E7PA 1OKTA 1EP8A 5H5SA 5G1KA 4TR0A 2X8HA 5G31A 1PL1A 2M72A 4FO5A 1ZOFA 3ME8A 1RW1A 1O7UA 1TP9A 4QL9A 1M0UA 3KP9A 4JE1A 5ENUA 1A2MA 1OC8A 2JU5A 2R37A 3ZITA 2L4QA 4BWQA 4NHWA 4MMMA 2L6CA 4EL1A 1TRVA 3V1WA 2L4CA 3JCML 1UA5A 1XVQA 2LJAA 5CP1A 3RPPA 5GAPD 3HD5A 3L9UA 6GSVA 2B7JA 2OE3A 3E3EA 5A5KA 3MWHA 3HXSA 5AIVA 4DVCA 1Z6MA 3FYGA 3BCKA 3TRPA 3P2AA 1SENA 1XZOA 4GQCA 3ZREA 1XCCA 1SJZA 1BJXA 3KZQA 5CREA 1G6WA 3W8JA 2WZ9A 1M7TA 2VM2A 4PQIA 3DRNA 1SYXA 4IJIA 2VL2A 2VOCA 5A4WA 1PSQA 5ECSA 5IQYA 4K0NA 4X0XA 4WETA 1GUKA 1PMTA 4DSRA 1XBSA 4HZ4A 4PURA 2ZCTA 3GSSA 3TKRA 3U5RE 1X9WB 2H76A 3QD9A 2XBQA 1GRXA 2OBKA 5J9CA 1HQOA 2F8AA 3UOMA 3AY8A 1K3OA 2B7KA 1PL2A 1QFNA 3KMOA 1GSUA 3FEUA 1V40A 2DBCA 4BVXA 1ZYQB 4D73A 3LXZA 1M9AA 2V41A 2RUFA 2I81A 2K8SA 1B8XA 2V1MA 4TR4A 3GHAA 3GL3A 1GUHA 3WD6A 3UMAA 4ZIJA 4K7NA 3IOSA 1X5DA 2QSIA 5E59A 1MDJA 2FY6A 3HJPA 2FWGA 2HNLA 4MA9A 2O8VB 1TJDA 4QL7A 1SJIA 4YAVA 3KH7A 2OKAA 3BOAA 2A2RA 4ZBDA 2DMLA 1XW9A 3G7IA 2C0DA 4KSMA 2OADA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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