3UW9A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k8ack12ac)
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
124
structure length
124
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding
total genus 38
structure length 124
sequence length 124
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uw9A00
2YDWA 4YYIA 5I88A 4IR3A 4IR5A 4Q0OA 4UYGA 5EGUA 4HXNA 4PTBA 3AQAA 5C8GA 5FFWA 5L97A 5DYUA 2DVSA 5IGKA 4A9LA 4CL9A 2LSPB 4QYDA 4O7EA 5I1QA 5H1VA 4Z6IA 4ALHA 4BW3A 5EVAA 4Z1QA 5FE6A 3U5OA 4Z6HA 5I29A 4MEPA 5IIDA 1E6IA 4NRBA 5CRMA 4TQNA 4WHWA 4BW2A 3UVXA 2DATA 4IOQA 4NS5A 4YYNA 4NUCA 5HCLA 5E9KA 4CUUA 5LJ2A 5E9MA 5DYCA 5EM3A 4BW1A 5LKZA 5A5OA 1X0JA 3MQMA 5D3TA 5E9IA 4Z93A 4QR4A 4HXKA 5CUDA 5DLXA 4HXLA 5EWHA 4QUTA 3K2JA 5TCMA 1EQFA 2DWWA 3IU6A 4TU4A 5H1TA 4LDFA 4QSRA 5IG6A 1WUMA 4TU6A 4XYAA 4NXJA 4YADA 5DFDA 4NR9A 5FBXA 5FE3A 4CUPA 4QSXA 5D3RA 5F62A 4ZW1A 4GPJA 4CUTA 5BT5A 4NR6A 3G0LA 4OUFA 5CS8A 4NUDA 5I80A 5F1HA 5CQ7A 4WIVA 2H60A 2I7KA 4QSWA 4UYFB 5F63A 4CLBA 5KTWA 5F36A 4NR7A 5ETBA 3HMHA 4J0SA 5KTXA 4O70A 4N4FA 5EWCA 5LKTA 4NYWA 5E3DA 5FB1A 5FG4A 4QSTA 4QB3A 4NR5A 5KO4A 1WUGA 2RNXA 4YH4A 5EWDA 5A82A 4YYJA 2RFJA 5CQAA 5FE1A 5A5SA 5TB6A 2OO1A 4A9HA 5DYXA 2GRCA 3UW9A 2WP1A 4NQMA 3SVFA 5C87A 5CUCA 4QYLA 4QY4A 2YEKA 4LZSA 4TZ2A 4YABA 5F1LA 4O7FA 5DLZA 3UVWA 2YELA 5CUBA 3G0JA 5CUAA 3IU5A 5D7XA 4O77A 2R0YA 4LYSA 3U5LA 5DKHA 5ETDA 5CQTA 4LYWA 5DKCA 2R0VA 4XUAA 3DAIA 4YK0A 4PCEA 4J0RA 5CGPA 4UIVA 4A9MA 5HRWA 5D3HA 4FLPA 4N3WA 4Y03A 5A5NA 5CZGA 5EU1A 2G4AA 4O78A 5IGLA 4E96A 4WHUA 3JVKA 5E3GA 2YW5A 5HEMA 4X2IA 4LC2A 5DW1A 5HJCA 4ALGA 5I86A 5BT3A 4QSQA 5G4RA 4YY4A 4HBXA 4QR5A 5FDZA 4N4HA 4BW4A 1ZS5A 2RS9B 3MULA 5EA1A 4YYGA 3HMFA 5A85A 5A5PA 3QZSA 5AD3A 4XUBA 4NR8A 4HBWA 5L96A 5DW2A 3MB4A 3ONIA 3LJWA 5ENJA 5E9YA 4UIXA 5II1A 5CRZA 5CUEA 5L99A 5COIA 4QZSA 4UIYA 5HQ7A 5IGMA 5FFVA 4TT6A 5CPEA 4NYVA 5C89A 5C4QA 5A5QA 4QEWA 5K29A 4Z1SA 4UYEA 5EWWA 5FH6A 4YBTA 5CQ3A 5JI8A 2DVRA 2I8NA 4MEQA 4O7BA 3HMEA 5F60A 4PY6A 4QR3A 5I83A 4HXRA 5HFQA 4YC9A 4NRAA 4PCIA 4YYDA 5HELA 4TYLA 4CUSA 4O72A 4TZ8A 4TTEA 5JWMA 5D3JA 5A83A 4N4GA 3NXBA 3FKMX 3O37A 5EPRA 5A81A 5FE2A 5EISA 4ZC9A 5LVQA 5H85A 5D3NA 4UIWA 4XY8A 4KV1A 3TLPA 1N72A 5AMFA 4YATA 5CUGA 5LJ0A 5CFWA 3MUKA 5E0RA 5KTUA 4QSUA 2OUOA 5LKXA 5F3AA 4QSSA 5E74A 5FG5A 4CFLA 5AMEA 5CTLA 3JVMA 5CQ4A 4UYDA 4QUUA 3U5NA 2RNYA 2D82A 4YYHA 3Q2FA 5DX4A 5EQ1A 4A9FA 5BT4A 5A5RA 5L8UA 5KHMA 5I7XA 5C85A 5ENFA 5FH8A 4IORA 4TT2A 4HXMA 5D0CA 3UVYA 4A9IA 5HRXA 5I89A 3GG3A 5FE9A 5IBNA 5HQ5A 4QSPA 3UVDA 4NUEA 5E7DA 3S92A 3SVHA 2R0SA 5L98A 5EWVA 5DYAA 4UYFA 2RO1A 3U5MA 2L85A 3LQIA 4NQNA 5FE7A 4CFKA 4HBVA 2L5EA 4ZQLA 3Q2EA 3D7CA 5D3SA 4PKLA 5F61A 4AKNA 4LR6A 4O71A 5EK9A 5KU3A 4XY9A 2F6NA 2N9GA 2E3KA 5D26A 5CY9A 5EPSA 4J1PA 5DFCA 5DFBA 4KV4A 4YBSA 2E7NA 2D9EA 4MR6A 2FSAA 3ZYUA 4CURA 5J0DA 3UV4A 4YAXA 2OSSA 5HM0A 5EI4A 4IOOA 5A7CA 3LQJA 5CQ8A 4QC3A 3LQHA 4UIUA 4IR4A 5LVRA 4A9NA 3U5KA 5DY7A 3QZTA 4HXPA 5CQ6A 3U5JA 5ENEA 3MB3A 5EPBA 3P1FA 4O76A 4LYIA 5FH7A 4A9EA 4UITA 3RCWA 3LXJA 5ENBA 2R10A 5F5ZA 3P1DA 5II2A 5DKDA 5HFRA 5E9LA 3AADA 4HBYA 5I40A 5ENHA 4MENA 4O7AA 5I7YA 5EV9A 2MJVB 4YYMA 5F25A 4BJXA 3I3JA 2KTBB 5CP5A 1F68A 5FG6A 5ENIA 5H1UA 4QC1A 4J3IA 4MR5A 2DVVA 4PS5A 5HENA 2E7OA 5EP7A 5ACYA 4QBMA 4QSVA 3P5OA 3S91A 3DWYA 4KCXA 2YEMA 4OGIA 4QNSA 5FE5A 5FE4A 4CUQA 3JVLA 3P1CA 2YQDA 2NXBA 2RNWA 4C66A 2YYNA 5CQ5A 3UV2A 5D3PA 5D3LA 5DBMA 4O75A 4QEUA 4YYKA 4HXOA 5FE8A 5LJ1A 5C7NA 2F6JA 5ENCA 4NYXA 5EICA 4LRGA 4TT4A 4F3IA 5L8TA 4YH3A 5FE0A 4O74A 4OGJA 5E9VA 3SVGA 5FFYA 5ENGA 4BHWA 2WP2A 5G4SA 4RVRA 4UIZA 4N4IA 5HQ6A 4YBMA 3U5PA 5LUUA 4LZ2A 5HRVA 5AD2A 5E73A 4MR4A 5FB0A 4A9OA 3MXFA 5F2PA 1JM4B 5D25A 3JVJA 4LZRA 3O34A 4HXSA 3P1EA 4MEOA 4NR4A 2L84A 5HLSA 3QZVA 4A9JA 4IR6A 2DVQA 2RI7A 5IGNA 4C67A 4MR3A 4YY6A 3O35A 4DONA 4A9KA 4UYHA 5CU8A 4O7CA 4Q0NA 5D24A 2DKWA 5LKUA 3O36A 4TS8A 1JSPB 4QEVA 3UV5A 3O33A 4NRCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YDWA 4YYIA 5I88A 4IR3A 4IR5A 4Q0OA 4UYGA 5EGUA 4HXNA 1PUOA 4PTBA 3AQAA 5C8GA 5FFWA 5L97A 5DYUA 2DVSA 5IGKA 4A9LA 4CL9A 2LSPB 4QYDA 4O7EA 5I1QA 5H1VA 4Z6IA 4ALHA 4BW3A 5EVAA 4Z1QA 5FE6A 3U5OA 4Z6HA 5I29A 4MEPA 5IIDA 1E6IA 4NRBA 5CRMA 4TQNA 4WHWA 4BW2A 3UVXA 2DATA 4IOQA 4NS5A 4YYNA 4NUCA 5HCLA 5E9KA 4CUUA 5LJ2A 5E9MA 5DYCA 5EM3A 4BW1A 5LKZA 5A5OA 1X0JA 3MQMA 5D3TA 5E9IA 4Z93A 4QR4A 4HXKA 5CUDA 5DLXA 4HXLA 5EWHA 4QUTA 3K2JA 5TCMA 1EQFA 2DWWA 3IU6A 4TU4A 5H1TA 4LDFA 4QSRA 5IG6A 1WUMA 4AKHA 4TU6A 4XYAA 4NXJA 4YADA 5DFDA 4NR9A 5FBXA 5FE3A 4CUPA 4QSXA 5D3RA 5F62A 4ZW1A 4GPJA 4CUTA 5BT5A 4NR6A 3G0LA 4OUFA 5CS8A 4NUDA 5I80A 5F1HA 5CQ7A 4WIVA 2H60A 2I7KA 4QSWA 4UYFB 5F63A 4CLBA 5KTWA 5F36A 4NR7A 5ETBA 3HMHA 4J0SA 5KTXA 4O70A 4N4FA 5EWCA 5LKTA 4NYWA 5E3DA 5FB1A 5FG4A 4QSTA 4QB3A 4NR5A 5KO4A 1WUGA 2RNXA 3VKGA 4YH4A 5EWDA 5A82A 4YYJA 2RFJA 5CQAA 5FE1A 5A5SA 5TB6A 2OO1A 4A9HA 5DYXA 2GRCA 3UW9A 2WP1A 4NQMA 3SVFA 5C87A 5CUCA 4QYLA 4QY4A 2YEKA 4LZSA 4TZ2A 4YABA 5F1LA 4O7FA 5DLZA 3UVWA 2YELA 5CUBA 3G0JA 5CUAA 3IU5A 5D7XA 4O77A 2R0YA 4LYSA 3U5LA 5DKHA 5ETDA 5CQTA 4LYWA 5DKCA 2R0VA 4XUAA 3DAIA 4YK0A 4PCEA 4J0RA 5CGPA 4UIVA 4A9MA 5HRWA 5D3HA 4FLPA 4N3WA 4Y03A 5A5NA 5CZGA 5EU1A 2G4AA 4O78A 5IGLA 4E96A 4WHUA 3JVKA 5E3GA 2YW5A 5HEMA 4X2IA 4LC2A 5DW1A 5HJCA 4ALGA 5I86A 5BT3A 4QSQA 5G4RA 4YY4A 4HBXA 4QR5A 5FDZA 4N4HA 4BW4A 1ZS5A 2RS9B 3MULA 5EA1A 4YYGA 3HMFA 5A85A 5A5PA 3QZSA 5AD3A 4XUBA 4NR8A 4HBWA 5L96A 5DW2A 3MB4A 4AKGA 3ONIA 3LJWA 5ENJA 5E9YA 4UIXA 5II1A 5CRZA 5CUEA 5L99A 5COIA 4QZSA 4UIYA 5HQ7A 5IGMA 5FFVA 4TT6A 5CPEA 4NYVA 5C89A 5C4QA 5A5QA 4QEWA 5K29A 4Z1SA 4UYEA 5EWWA 5FH6A 4YBTA 5CQ3A 5JI8A 2DVRA 2I8NA 4MEQA 4O7BA 3HMEA 5F60A 4PY6A 4QR3A 5I83A 4HXRA 5HFQA 4YC9A 4NRAA 4PCIA 4YYDA 5HELA 4TYLA 4CUSA 4O72A 4TZ8A 4TTEA 5JWMA 5D3JA 5A83A 4N4GA 3NXBA 3FKMX 3O37A 5EPRA 5A81A 5FE2A 5EISA 4ZC9A 5LVQA 5H85A 5D3NA 4UIWA 4XY8A 4KV1A 3TLPA 1N72A 5AMFA 4YATA 5CUGA 2EJNA 5LJ0A 5CFWA 3MUKA 5E0RA 5KTUA 4QSUA 2OUOA 5LKXA 5F3AA 4QSSA 5E74A 5FG5A 4CFLA 5AMEA 5CTLA 3JVMA 5CQ4A 4UYDA 4QUUA 3U5NA 2RNYA 2D82A 4YYHA 3Q2FA 5DX4A 5EQ1A 4A9FA 5BT4A 5A5RA 5L8UA 5KHMA 5I7XA 5C85A 5ENFA 5FH8A 4IORA 4TT2A 4HXMA 5D0CA 3UVYA 4A9IA 5HRXA 5I89A 3GG3A 5FE9A 5IBNA 5HQ5A 4QSPA 3UVDA 4NUEA 5E7DA 3S92A 3SVHA 2R0SA 5L98A 5EWVA 5DYAA 4UYFA 2RO1A 3U5MA 2L85A 3LQIA 4NQNA 5FE7A 4CFKA 4HBVA 2L5EA 4ZQLA 3Q2EA 3D7CA 5D3SA 4PKLA 5F61A 4AKNA 4LR6A 4O71A 5EK9A 5KU3A 4XY9A 2F6NA 2N9GA 2E3KA 5D26A 5CY9A 5EPSA 4J1PA 5DFCA 5DFBA 4KV4A 4YBSA 2D9EA 2E7NA 4MR6A 2FSAA 3ZYUA 4CURA 5J0DA 3UV4A 4YAXA 2OSSA 5HM0A 5EI4A 4IOOA 5A7CA 3LQJA 5CQ8A 4QC3A 3LQHA 4UIUA 4IR4A 5LVRA 4A9NA 3U5KA 5DY7A 3QZTA 4HXPA 5CQ6A 3U5JA 5ENEA 3MB3A 5EPBA 3P1FA 4O76A 4LYIA 5FH7A 4A9EA 4UITA 3RCWA 3LXJA 5ENBA 2R10A 5F5ZA 3P1DA 5II2A 5DKDA 5HFRA 5E9LA 3AADA 4HBYA 5I40A 5ENHA 4MENA 4O7AA 5I7YA 5EV9A 2MJVB 4YYMA 5F25A 4BJXA 3I3JA 2KTBB 5CP5A 1F68A 5FG6A 5ENIA 5H1UA 4QC1A 4J3IA 4MR5A 2DVVA 4PS5A 5HENA 2E7OA 5EP7A 5ACYA 4QBMA 4QSVA 3P5OA 3S91A 3DWYA 4KCXA 2YEMA 4OGIA 4QNSA 5FE5A 5FE4A 4CUQA 3JVLA 3P1CA 2YQDA 2NXBA 2RNWA 4C66A 2YYNA 5CQ5A 3UV2A 3D1DA 5D3PA 4AI6A 5D3LA 5DBMA 4O75A 3VKHA 4QEUA 4YYKA 4HXOA 5FE8A 5LJ1A 5C7NA 2F6JA 5ENCA 4NYXA 5EICA 4LRGA 4TT4A 4F3IA 5L8TA 4YH3A 5FE0A 4O74A 4OGJA 5E9VA 3SVGA 5FFYA 5ENGA 4BHWA 2WP2A 5G4SA 4RVRA 4UIZA 4N4IA 5HQ6A 4YBMA 4AKIA 3U5PA 5LUUA 4LZ2A 5HRVA 5AD2A 5E73A 4MR4A 3D1BA 5FB0A 4A9OA 3MXFA 5F2PA 1JM4B 5D25A 3JVJA 4LZRA 3O34A 4HXSA 3P1EA 3ERRA 4MEOA 4NR4A 2L84A 5HLSA 3QZVA 4A9JA 4IR6A 2DVQA 2RI7A 5IGNA 1ZKRA 4C67A 4MR3A 4YY6A 3O35A 4DONA 4A9KA 4UYHA 5CU8A 4O7CA 4Q0NA 5D24A 2DKWA 5LKUA 3O36A 4TS8A 1JSPB 4QEVA 3UV5A 3O33A 4NRCA
chains in the Genus database with same CATH topology
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