3V2JA

Effect of sucrose and glycerol as cryoprotectans, on the inhibition of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Effect of Sucrose and Glycerol as Cryoprotectans, on the Inhibition of Human Carbonic Anhydrase II
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3v2jA00
1V9IC 4WL4A 1TH9A 4L5VA 1G54A 2FW4A 2QP6A 5DOHA 4CNVA 2FOUA 1RZAA 9CA2A 1ZSBA 4RUXA 3V5GA 1AM6A 5DSQA 4FRCA 4Q09A 3FE4A 5CA2A 3M67A 3F4XA 4XE1A 3W6IA 5FL4A 5FNLA 4ZWYA 2WD3A 4BF1A 4QTLA 5SZ0A 4JS6A 4UOVA 1CRMA 3D93A 3MHIA 4Q7WA 4RFCA 1AZMA 4Q9YA 5E2KA 5FDIA 1BNVA 1JCZA 1THKA 3BL1A 1EOUA 4ETQC 2QOAA 4R5AA 4FPTA 4LHIA 5AMDA 2NNOA 4ZWZA 1CVCA 2FMGA 4Q8XA 4FVOA 3DD0A 3S78B 2O4ZA 4YGKA 5DSMA 3KIGA 1LUGA 2FOQA 1ZSCA 4K0SA 1DMYA 3T84A 4PQ7A 4QJPA 1CAZA 1G48A 1ZGFA 1FQMA 4CNWA 1ZNCA 2NNGA 1CNXA 4ITPA 5SZ2A 4BF6A 1BZMA 3W6HA 5DVXA 4Q0LA 2GEHA 1G0EA 1CAJA 4KP8A 3RJ7A 3BETA 1I8ZA 1HCAA 1YDAA 1CVHA 1HCBA 1G53A 1CNKA 4IWZA 4CACA 1G46A 4Q78A 1OQ5A 5CJFA 1CAIA 3QYKA 4X5SA 3SAXA 1HEDA 5EH5A 1RZCA 4M2UA 3HKUA 1TB0X 4CQ0A 1HVAA 1HUHA 4E3GA 3MHLA 3NB5A 5FL5A 3V7XA 3TVOX 1I9NA 5EZTX 1RZDA 5EHEA 4PZHA 4HEZA 3M1QA 5C8IA 5EOIA 1V9EA 3M04A 4Q49A 4E9OX 1TTMA 1OKNA 5FDCA 3RZ8A 3KWAA 4YXIA 2HD6A 1KEQA 4JSSA 4GL1X 2VVBX 1I9QA 5SZ6A 1CILA 3OIMA 4M2VA 3OKUA 1MUAA 2Q1QA 3IBNA 1CNCA 3HKNA 8CA2A 4G7AA 4Q87A 4Q90A 1I9OA 2EU3A 1CNHA 3MHCA 5JEPB 2CBAA 3MNKA 2X7SA 3T5ZA 5JEHB 4R5BA 5FNMA 4QJWA 5BYIA 1ZE8A 4XFWA 3S71B 4KUVA 5EKJA 1G1DA 4WW8A 1CIMA 3S76A 5FLPA 1RZEA 1IF6A 4ZX1A 5BRVA 3MYQA 2POVA 4QJMA 1CNGA 2NXTA 5A6HA 3RYYA 3U47A 1UGAA 3F7BA 4KNJA 2HNCA 1XPZA 4ZWIA 3PO6A 1CVAA 4YVYA 2WEHA 2FNKA 4COQA 2F14A 4KUWA 4Q6DA 4RIUA 3BL0A 1CZMA 4ZWXA 4MLXA 4KNIA 4QSJA 2CA2A 4HU1A 1LGDA 1HEAA 3S9TA 3TMJA 3V3IB 5IPZA 1Z93A 4E4AA 4L5WA 4MDMA 3FFPX 3K7KA 5SZ4A 1URTA 1ZFQA 2EU2A 4ZX0A 5DOGA 4Q81A 3SBHA 1UGEA 1BN1A 3V2MA 3MNJA 3RGEA 2WEGA 2Q1BA 3M1JA 5FLSA 2FOSA 4CNRA 2NNVA 3V3HB 4Q83A 1TG3A 5E5RA 3V3JA 5JQTA 3RG3A 2ILIA 4YXOA 1CNBA 3OYQA 3P4VA 4KNNA 1ZFKA 5A25A 5EHVA 3B4FA 3S72B 1CA3A 2FOVA 1BN4A 3KKXA 5JGTB 2H15A 1HECA 5JDVB 1H4NA 3MHOA 1G4JA 5BRUA 3MNAA 2FNMA 3HLJA 5LMDA 1H9NA 5FNIA 1CNIA 1LG5A 4KAPA 1RAYA 1BCDA 1CVFA 5DSIA 4LU3A 4K0TA 4QK3A 3IBLA 5AMLA 3RZ7A 2WD2A 4PXXA 2W2JA 3N2PA 4FU5A 5JESB 1HUGA 2HKKA 4M2RA 2NXRA 4YYTA 3IBIA 1IF7A 3OIKA 3M1WA 3U7CA 1H9QA 3V2JA 5SZ5A 1BNNA 1FSQA 3HFPA 3EFTA 3DCCA 1FLJA 4K13A 5G0BA 1HEBA 5E2NA 5JG5B 1CVEA 4Z1JA 4Z1NA 3DV7A 4YGFA 5FNGA 1BNUA 3FW3A 1IF5A 4ZAOA 4E49A 3ZP9A 1IF8A 4Z0QA 2Q38A 5FNKA 1LG6A 4QJXA 1I91A 3T85A 4KUYA 3ML2A 4WR7A 3MZCA 1CAOA 3CYUA 1CINA 1LZVA 4RUYA 2NWOA 3RZ0B 3RYJB 1CNWA 4JSZA 2AX2A 5JGSB 4N16A 4QIZA 1OKLA 2IT4A 4Q07A 3K34A 4Q7VA 3T5UA 1FQRA 4E3FA 1BV3A 3NI5A 5EH7A 4QSAA 4K1QA 3SBIA 2NWZA 5E2RA 4E3DA 4YWPA 3DCSA 3P5LA 2NN7A 4HBAA 4DZ9A 4QSIA 1YO2A 1CVDA 1CANA 4QIYA 4QK1A 3P44A 4MTYA 4QJ0A 3HKQA 3GZ0A 1CAMA 1J9WA 1JV0A 3M1KA 1JD0A 1ZH9A 4JSAA 4LP6A 1RZBA 1Y7WA 2NNSA 4MO8A 4R59A 4YHAA 1XQ0A 3IBUA 3DBUA 1FQNA 2OSFA 1UGGA 4JSWA 4Q6EA 3C7PA 4PYYA 1CA2A 1G0FA 1Z9YA 4HT2A 3S8XA 3DAZA 2FMZA 3DVDA 1F2WA 2POWA 3UYQA 1I9MA 3MDZA 2QO8A 2HL4A 3RYVB 3M5SA 5JEGB 1BNQA 4CNXA 3EFIA 3KONA 2NN1A 5E2MA 3KNEA 1DCAA 3VBDA 4YGLA 4WUQA 2NWPA 1YDBA 1YO1A 1CCUA 2X7TA 4XIXA 12CAA 3M2ZA 4YX4A 1YDDA 3KOKA 3S74B 4BCWA 1G45A 1UGCA 1CVBA 4RUZA 3MNUA 5FL6A 5SZ1A 4KP5A 3P58A 5FLRA 4RFDA 2H4NA 2NWYA 1AVNA 5BNLA 4Q8ZA 5DSPA 3Q31A 3R16A 5CACA 1FSRA 3RYZA 5DSOA 2CABA 4Q99A 4Z1KA 1KOQA 2CBCA 1BNTA 4Y0JA 1G4OA 4Q7SA 4E3HA 4L5UA 1RJ6A 3OY0A 3R17B 3PJJA 4IDRX 3CAJA 5DSRA 3N0NA 5G01A 1BICA 1CRAA 1RJ5A 4PYXA 2CBEA 2HFWA 1UGFA 1CALA 4YGNA 4RH2A 2ZNCA 3MNHA 3DC9A 4Q7PA 3T83A 1MOOA 1FR7A 3IGPA 3N3JA 2CBDA 3DVCA 3RG4A 5L6KA 4KNMA 3JXGA 4XZ5A 5DSKA 2POUA 3M2XA 3HS4A 4CA2A 4TWLA 3M96A 5FNJA 3N4BA 3JXHC 4M2WA 1BN3A 3V3GB 4Q8YA 1XEGA 3D9ZA 3U45X 1CCTA 2CBBA 1KOPA 2EZ7A 2WEJA 2ABEA 3DC3A 4HF3A 4K0ZA 5SZ3A 2GD8A 5FLOA 3P3JA 3DA2A 4C3TA 3D8WA 1BNWA 4ILXA 5FNHA 3ML5A 3OILA 7CA2A 1IF4A 3P3HA 3DCWA 4WW6A 4MLTA 1TEQX 4ITOA 1A42A 4MDLA 3UYNA 1CNYA 5E5UA 1DCBA 1KWRA 3HKTA 1FQLA 3OKVA 1TG9A 3T82A 3TVNX 4QSBA 1TE3X 1T9NA 3RYXB 3V3FA 4Q06A 3NJ9A 5CLUA 4WUPA 5G03A 5EHWA 3ZNCA 4E5QA 5DSJA 1I9LA 2AW1A 2FNNA 1DMXA 2VVAX 4RN4A 4QY3A 3LXEA 3M40A 3MMFA 2NXSA 1G52A 3D92A 4HEWA 5EH8A 3IEOA 3S73B 3KLDB 4FL7A 1CCSA 4FVNA 1KWQA 3S75B 4Z1EA 4DZ7A 1ZSAA 4KV0A 1XEVA 3F8EA 4HEYA 1UGDA 2X7UA 3MWOA 3M5TA 5DRSA 3SAPA 1BNMA 3M2NA 5EIJA 3M98A 5DSNA 1IF9A 5DSLA 2WEOA 4N0XB 1CAHA 1CAKA 3U3AX 5G0CA 4TWMA 4RIVA 6CA2A 5BRWA 5FLTA 4YXUA 2HOCA 3DVBA 3KOIA 1ZGEA 4FIKA 4QEFA 3MNIA 3RZ5A 1Z97A 3CA2A 5JG3B 2FOYA 1G6VA 1UGBA 1FR4A 3PYKA 5J8ZA 1TEUX 1I9PA 5EKMA 3L14A 3P5AA 2NMXA 3MHMA 1I90A 3S77B 1FSNA 4G0CA 5SZ7A 3KS3A 3M14A 4MDGA 1OKMA 5E2SA 3DD8A 5JQ0A 5E28A 3CZVA 3M5EA 4QJOA 3F7UA 1TBTX 4YGJA 1G3ZA 1YDCA 1CAYA 4Q08A 1RAZA 3IAIA 4HT0A 5AMGA 5HPJA 4XIWA 3M3XA 3RZ1B 1CNJA 4QK2A 2OSMA 3JXFA 3OYSA 3D0NA 5EKHA 5FLQA 3S97A 1YO0A 3P55A 3B1BA 3RLDA 5L3OA 3K2FA 3M2YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1V9I C;  4WL4 A;  1TH9 A;  4L5V A;  1G54 A;  2FW4 A;  2QP6 A;  5DOH A;  4CNV A;  2FOU A;  1RZA A;  9CA2 A;  1ZSB A;  4RUX A;  3V5G A;  1AM6 A;  5DSQ A;  4FRC A;  4Q09 A;  3FE4 A;  5CA2 A;  3M67 A;  3F4X A;  4XE1 A;  3W6I A;  5FL4 A;  5FNL A;  4ZWY A;  2WD3 A;  4BF1 A;  4QTL A;  5SZ0 A;  4JS6 A;  4UOV A;  1CRM A;  3D93 A;  3MHI A;  4Q7W A;  4RFC A;  1AZM A;  4Q9Y A;  5E2K A;  5FDI A;  1BNV A;  1JCZ A;  1THK A;  3BL1 A;  1EOU A;  4ETQ C;  2QOA A;  4R5A A;  4FPT A;  4LHI A;  5AMD A;  2NNO A;  4ZWZ A;  1CVC A;  2FMG A;  4Q8X A;  4FVO A;  3DD0 A;  3S78 B;  2O4Z A;  4YGK A;  5DSM A;  3KIG A;  1LUG A;  2FOQ A;  1ZSC A;  4K0S A;  1DMY A;  3T84 A;  4PQ7 A;  4QJP A;  1CAZ A;  1G48 A;  1ZGF A;  1FQM A;  4CNW A;  1ZNC A;  2NNG A;  1CNX A;  4ITP A;  5SZ2 A;  4BF6 A;  1BZM A;  3W6H A;  5DVX A;  4Q0L A;  2GEH A;  1G0E A;  1CAJ A;  4KP8 A;  3RJ7 A;  3BET A;  1I8Z A;  1HCA A;  1YDA A;  1CVH A;  1HCB A;  1G53 A;  1CNK A;  4IWZ A;  4CAC A;  1G46 A;  4Q78 A;  1OQ5 A;  5CJF A;  1CAI A;  3QYK A;  4X5S A;  3SAX A; 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