The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILCGKTLKGETTTEAVDAATAECVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-resolution structure of a protein spin-label in a solvent-exposed beta-sheet and comparison with DEER spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| total genus |
8
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-12-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3V3X A; 1FCC C; 2ZW1 A; 1K50 A; 2PLP A; 1HZ5 A; 2QSD A; 1GB4 A; 1IBX B; 2PTL A; 2N7J A; 2IGD A; 2I38 A; 5BMI A; 1JML A; 2KWD A; 2N9K A; 4KGS A; 1FCL A; 2ONQ A; 2NMQ A; 4OZB A; 2LHD A; 2IGH A; 1IBX A; 4OZA A; 2RMM A; 1UWX A; 5BMG A; 2GI9 A; 1XCT L; 4IKG A; 2ZW0 A; 3GB1 A; 2KN4 A; 2QMT A; 2LGI A; 1P7F A; 2LHE A; 2GB1 A; 1K52 A; 2JXT A; 1YMH E; 2JSV X; 1EM7 A; 4D2K A; 4GLS C; 4WH4 A; 2J52 A; 2OED A; 3UI3 A; 1XCQ L; 2EEL A; 2KDM A; 5BMH A; 4KGT A; 4IOI E; 1ZXH A; 2K0P A; 1PGX A; 1HEZ E; 4HKZ E; 2JU6 X; 2JWU A; 1D4B A; 1F2R I; 4HJG E; 4OZC A; 1KH0 A; 2I2Y A; 5JXV A; 1P7E A; 1MPE A; 3MP9 A; 4MAC A; 1IGC A; 5HG2 A; 2J53 A; 1PGB A; 5HHD G; 1MHX A; 1F2R C; 1MHH E; 5HFY A; 1C9F A; 2ON8 A; 1PGA A; 2IGG A; 2RPV A; 2PW9 A; 3FIL B; 2KAC A; 1MVK A; 2KQ4 X; 2N9L A; 1HZ6 A; 1K51 A; 2JZP A; 1FD6 A; 1XF5 L; 1QKZ A; 1MI0 A; 2LUM A; 1Q10 A; 1GB1 A; 3FIL A; 4KGR A; 1K53 A; 1IGD A; 5HI1 A; 1YNT E; #chains in the Genus database with same CATH topology 3LB8 C; 2KXJ A; 5J2R A; 2AEH A; 1YQ4 B; 2XEW A; 2DNF A; 1WX8 A; 2DZJ A; 2R61 A; 5CX3 A; 3EHV A; 1WR6 E; 2KYW A; 2JYT A; 2L8J A; 3DVG X; 3RNA C; 1SXT A; 1OFF A; 1WH3 A; 3Q3O C; 1CQV A; 1TZO A; 2L00 B; 4C56 C; 4RF1 A; 5BMG A; 2K22 A; 3A4R A; 4WUR A; 1AW7 A; 2ZW0 A; 5EDS A; 5CTR C; 1PUT A; 3KUC B; 1RM6 C; 4AWJ A; 4WAF A; 2G45 B; 3PSE B; 2KMA A; 2WXO A; 3QAR A; 4GLS C; 2K25 A; 3EFU A; 2BGF A; 4ASW C; 1H8C A; 1EU3 A; 4JGH B; 2C7M B; 3AH7 A; 1ESF A; 1SEB D; 4LJP B; 1WWT A; 2JU6 X; 3NY5 A; 1E6E B; 4AJW A; 3ABV B; 4EZJ A; 5E6P A; 4WIP A; 4E74 A; 3ZNG C; 4PYU A; 3Q8E A; 3HIZ A; 1ET6 A; 1QIL A; 3S2A A; 1SGH A; 2IO3 B; 3PRP B; 3M3J A; 4GIV A; 1WF9 A; 3BK1 A; 1PFD A; 3N1Y C; 2N9E B; 2KDE B; 1ZDV A; 4W9H A; 2JRH A; 4FUL A; 3WAP A; 2WXQ A; 3DVN U; 3IXS A; 1MI0 A; 2KDI A; 1E5W A; 5DPS A; 4DHZ E; 5GMV A; 3A1Q B; 5FKA C; 2FE8 A; 2JX5 A; 3AE4 B; 2ZEQ A; 5E6J A; 1WZ0 A; 3U7Z A; 2D3C A; 2BYT A; 4WWO A; 2QHO A; 1WXS A; 4GDL A; 3L08 A; 1N60 A; 4II3 B; 4NJ6 A; 4YSX B; 1QOB A; 4OVV A; 1YD8 U; 1V49 A; 1FCL A; 4IM0 A; 5E6O A; 1I4P A; 3Q3M C; 5CHW A; 1TIF A; 1R4M B; 3V6E B; 1XXG A; 2SEB D; 3KUZ A; 4GN1 A; 4I6L B; 3SFE B; 1SE9 A; 4IKG A; 2HJ8 A; 1SF0 A; 1VD2 A; 4NJC A; 4XGA B; 3R8B A; 1YMH E; 1TGZ B; 1WYG A; 5JHB A; 1MG8 A; 1B1Z A; 3ONS A; 4BOS C; 4IWO A; 4MJS B; 4I6N B; 3Q3F A; 1STE A; 3AEC B; 5G5G A; 3U30 A; 2K8B A; 1WM2 A; 3KYC D; 1TKG A; 4RGT A; 3OLM D; 1BT0 A; 1Q5W B; 1JRP A; 1F2R C; 3KYD D; 2WWZ A; 1N63 A; 3DBR I; 2RPV A; 3N20 C; 3VUX A; 4AP4 C; 3FIL B; 2LGS A; 2BS4 B; 3VRA B; 2KJ6 A; 1XLP A; 3L13 A; 4N9F 4; 1J7A A; 3AV8 A; 2PVO D; 4MJS A; 4YL8 A; 1NVI D; 1QOG A; 1IGD A; 4S0R A; 3VFK A; 2RPQ A; 4LDT B; 1SBB B; 3NRZ A; 2H88 B; 1YOV B; 1HZ5 A; 2LRU A; 1GB4 A; 3EGR A; 3M62 B; 2KLG A; 1TT5 B; 3MFG A; 4DK5 A; 4KKJ A; 1A5R A; 2MBH A; 1EF5 A; 3VR9 B; 1TS5 A; 3NVV A; 2HJ1 A; 1F52 A; 2LGX A; 1JAL A; 2LHD A; 5DPW A; 4H2A A; 3TEX A; 1KOT A; 1V81 A; 1ENF A; 2PJH A; 1KRH A; 3P2B A; 1YX6 B; 1VCB A; 1C4A A; 2BVC A; 1TS2 A; 2MW5 A; 3BY4 B; 2LAS A; 2DEN B; 1P7F A; 2D3A A; 2KDB A; 1K52 A; 2JT4 B; 1I42 A; 1L7Y A; 4NAW B; 2OJW A; 3DBL I; 3VXW A; 1ZUD 2; 2OED A; 3ZIM A; 3KW5 B; 4WJQ A; 4KZC A; 1WGR A; 3LYY A; 4KSL C; 4PYZ A; 5BMH A; 2KJR A; 2V9H A; 3PZD A; 4CQN A; 2G4S A; 2KQ7 A; 4DWF A; 3HM3 A; 1ZXH A; 2MLB A; 2WS3 B; 4IOI E; 2A5U A; 2VZK B; 2KX0 A; 1VZ7 A; 4ANW A; 4AQ7 A; 1FNW A; 1S1Q B; 2QIL A; 2QDF A; 3QK0 A; 4LDT D; 3I5J C; 2MBB B; 2OJR A; 2NTT A; 5HG2 A; 4US8 A; 3AMZ A; 3VTV A; 1EWY C; 2WDV B; 2XK5 A; 2AYO B; 4HK2 A; 3R2I A; 1J19 A; 2W9N A; 3L54 A; 2L05 A; 1CMX B; 1L6U A; 5IKC M; 3CIR B; 4NAW A; 2CR5 A; 3BYY B; 3V05 A; 1XD3 B; 4L1B A; 1Y8R C; 3SHQ A; 4DXF A; 3DHH C; 5MPO A; 1PYW D; 2NPT B; 4ZOH C; 3HUI A; 5HI1 A; 2L1A A; 4KIK B; 2MH7 A; 3ENE A; 2WXP A; 3C19 A; 2ZW1 A; 4GU2 A; 2OHF A; 1FFV A; 3AE3 B; 3UGB B; 1T0R C; 5LXI B; 3ZJV A; 3IBE A; 4FN2 A; 3I9V 1; 2XN9 C; 2O6V B; 5D3D A; 5JHA A; 4FJV B; 1P9D U; 3ZJT A; 2KWC A; 3IAM 1; 2N7E A; 2VZK D; 2KTF A; 3VUW A; 4CO7 A; 3PRZ A; 4N59 A; 3Q8B A; 4BZA A; 2MCN B; 4KVG B; 2K8C A; 2WDT B; 1FM0 D; 2EMT A; 2FBW B; 2MBQ A; 1TY0 A; 2FCQ A; 3ECI A; 2LVO A; 1WX7 A; 4A3P A; 4M01 A; 1H4R A; 2BWE S; 4ICU A; 3QQ8 B; 4TQ0 A; 4KIK A; 2GRI A; 4ZHO A; 3KUD B; 3V6C B; 3GZN B; 4C7Y A; 2DZI A; 1T3Q A; 4E71 A; 2JZZ A; 2WXN A; 3L0W B; 1WGH A; 4YXD B; 5HKH A; 2IBI B; 3RNF C; 3NS8 A; 1UD7 A; 2JPH A; 4ANV A; 1WXM A; 2KN5 A; 2CHW A; 1YN5 A; 4IWP A; 2PPH A; 1HTQ A; 1OEY A; 3N1Z C; 1MJD A; 4HDO A; 3QX1 A; 5EE9 A; 3U7D A; 2O6V D; 2ZCB A; 4MSQ B; 1UBQ A; 2C7N B; 2PW9 A; 1F9J A; 1FPY A; 3V62 A; 3QCA A; 1V1P A; 2BT6 A; 2K39 A; 2L3Z A; 4NY0 A; 4E3C A; 1FO4 A; 1FEH A; 3RN9 C; 2K5P A; 2Z0D B; 4F1S A; 3P63 A; 2J0J A; 4FJZ A; 4RM8 A; 3DOW A; 2LXC A; 3DVN V; 1Z5S B; 2ZVO A; 4YTN B; 2J0M A; 4M0W A; 1L0X B; 4ACF A; 2PE9 A; 3W2D A; 3BVZ A; 2N7J A; 1TZ1 A; 3SU8 X; 1TBE A; 1WM3 A; 1SE3 A; 5D94 A; 4OZB A; 2IGH A; 1YN4 A; 2N1W A; 3U52 E; 4TKN A; 1JWM D; 2GI9 A; 4G0N B; 4OVZ A; 2C60 A; 2K1F A; 3TCA A; 3ZO5 B; 4A3O A; 3CMM B; 3AU4 A; 4C4V A; 3NOB A; 2BS2 B; 2JXT A; 4W9J A; 1VLB A; 4C00 A; 2D3B A; 2LMC A; 3EC8 A; 4D2K A; 3P4S B; 2FCN A; 2WDQ B; 3VTW A; 4HRO A; 4MM3 B; 2WXF A; 4AOF A; 5FR6 A; 3ETR A; 1E8X A; 3W5V B; 2GBJ A; 5CHV C; 2NR2 A; 4IWQ A; 1F77 A; 3O13 A; 4BVU C; 1PGB A; 5HHD G; 3IVF A; 3U2S C; 2C7H A; 2KDF B; 2WGS A; 4EZL A; 1SE2 A; 1PGA A; 3B2G A; 1DOX A; 1N62 A; 2KFJ A; 1FRR A; 3AEA B; 1RWS A; 1WRD B; 1T0Y A; 2LGY A; 4UDU C; 2KD0 A; 2FCS A; 3B0A A; 4HVB A; 3AE5 B; 1WXQ A; 3DCG A; 4FHJ A; 3EUB 2; 3X23 A; 1KLU D; 4W9D A; 4MGK E; 2MBO A; 1NDD A; 1J0G A; 2ZNV C; 2BPS A; 3OAW A; 4F8C B; 4YSZ B; 2MP2 A; 1GOZ A; 2REX A; 2PE6 B; 2PLP A; 2QSD A; 2QJL A; 1C1Y B; 4EE2 A; 2I38 A; 2K6D B; 3PLU A; 4B0E A; 1TS3 A; 1E10 A; 1JWU D; 3AEF B; 3DWG C; 2LEK A; 1IBX A; 1QQR A; 3AN1 A; 3ML8 A; 2CU1 A; 3MC8 A; 3N30 A; 3NUH B; 2KNB A; 2KTR A; 5AZG A; 3ZKJ C; 4TMA B; 3GB1 A; 1F1H A; 1ET9 A; 2WXL A; 5C3J B; 3TBL D; 2WXI A; 2AQ3 B; 4MGZ E; 3DHI C; 1YJI A; 1XCQ L; 1E8Y A; 3NVW A; 1WE6 A; 2RR9 A; 1C77 A; 4BOZ B; 3U4E G; 2ICI A; 2AX5 A; 1XEE A; 2CU3 A; 2EKI A; 2MHJ A; 2KFK A; 1P7E A; 3OWE B; 1MPE A; 3RMK C; 3DBR B; 3N3K B; 4MGI E; 3KH0 A; 4RGO S; 5IN7 A; 2JVC A; 3RD2 A; 2MX2 A; 2FAZ A; 1WJ4 A; 4IC7 B; 1OGW A; 1WJU A; 3EEC A; 3W1S C; 4MEL A; 3CST A; 1WXV A; 3W1Y A; 4GGQ A; 3LXF A; 4MEM A; 1WE7 A; 3RNE C; 3FKY A; 1NEN B; 2WDR B; 1P3Q U; 4GDL B; 4G50 A; 1CZP A; 1JRO A; 1NYQ A; 4KGR A; 2R2O A; 3AB5 A; 4B6W A; 5TSS A; 4HCN B; 3HVZ A; 4KDL B; 4LNN A; 1K50 A; 1ZOY B; 5TR5 A; 3AED B; 1E8Z A; 4P16 A; 4ZRK A; 4NAM A; 2KT7 A; 4GB9 A; 3A4S C; 1PQS A; 3Q6B A; 3C8Y A; 3TEZ A; 3QWZ B; 5IAA C; 2L7R A; 3H7P A; 1QLB B; 2AQ2 B; 1KTK A; 1FMA D; 2JZ3 B; 4GDK A; 3DVG Y; 4K3B A; 4KZ0 A; 3RFZ B; 2LJI A; 3AE7 B; 3LDZ E; 3P4R B; 3V60 A; 2NCN A; 2QCZ A; 2AL3 A; 4K7S A; 4B0M A; 2IYD B; 1D6E C; 3WAM A; 1EU4 A; 2M4N A; 2KDM A; 1UNS A; 4ZYS A; 2Q5W D; 2R2Q A; 3RCZ A; 4XZ4 A; 4HDQ A; 1JWA D; 1L0V B; 3KWV A; 3MJ5 A; 2DAJ A; 3SR6 A; 4FLH A; 4PS7 A; 2UYZ B; 5KHO A; 2I2Y A; 1OEY J; 3AE1 B; 4DDI D; 5HFY A; 2J42 A; 1C3T A; 2IGG A; 5I4D A; 3E9S A; 3X0W A; 3APF A; 4MT5 A; 2YEP B; 1D5X C; 2YEP F; 3MC0 B; 4ANU A; 2DZK A; 3RT3 B; 2WXJ A; 2KVR A; 1RRB A; 2W3S A; 4ITK A; 1C78 A; 5IO9 A; 1V5T A; 4C7Z A; 3PZ7 A; 3B2F A; 2KMM A; 1C4P A; 3UIP B; 2KLC A; 3ZUN A; 4EZK A; 4LCD E; 1WR1 A; 3NVY A; 3FC4 A; 2LFI A; 4I6P A; 3B08 A; 3I3T B; 4P1B C; 2LVP A; 2N0S B; 5EE1 A; 3NJT A; 1JRU A; 1XLQ A; 1U4A A; 2BKR B; 1WMH B; 3RI7 C; 2CHZ A; 4J3O D; 4MH0 E; 1SJH D; 1R7S A; 1ZE3 D; 3OJ3 A; 3Q3J A; 1HXY D; 3ZW3 A; 3P4P B; 2KK8 A; 3BII D; 1BXT A; 4NZL B; 1C79 A; 5AUI A; 3IT6 B; 5LLI A; 4BFR A; 1WZ3 A; 3AE6 B; 1E0Z A; 4LNI A; 1WGG A; 5BYS A; 3W5U B; 2WXK A; 4WH4 A; 2W55 A; 4LK0 M; 3N32 A; 1SB3 C; 2M0A A; 4HLE A; 1Q0W B; 1LM8 B; 1D5Z C; 1V1O A; 1T0S C; 2XK5 B; 4WAA A; 3PO0 A; 1KFY B; 2D07 B; 4IUM B; 2VRR B; 3URY A; 4W9G A; 1KH0 A; 2V3S A; 3WAN A; 2INC C; 1L4D B; 1WMH A; 3TUO A; 4GMV A; 1L5P A; 2DAF A; 4JPS A; 1D5M C; 3CWI A; 3T3O A; 1C9F A; 5AZH A; 1RAX A; 4JIO U; 1MVK A; 3P4Q B; 2J0K A; 4HPP A; 3L17 A; 2IZV B; 2CS4 A; 1FD6 A; 4BKG A; 5AZF A; 1N61 A; 2AWT A; 3TJP A; 1EWC A; 2KOX A; 3ZXR A; 1GB1 A; 2KC2 A; 2WLB A; 2VH2 A; 1HQR D; 1I4G A; 3V3X A; 1T6B X; 1AN8 A; 1YQB A; 2PTL A; 4A8X C; 3VH4 B; 2WHI A; 3NZS A; 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4MH8 A; 4PK1 A; 3JYU A; 2V4I B; 1AYF A; 3ZXV A; 4XDD A; 4ZYN A; 3HVD A; 3HM6 X; 3NHE B; 1EM7 A; 3PZ8 A; 1RLF A; 3LJ3 A; 1GC6 A; 4FA6 A; 3K9O B; 4KGT A; 4BKT A; 2BYF A; 3PS6 A; 1PGX A; 4XYC A; 4R3D A; 3AEE B; 2W54 A; 4OZC A; 1EO6 A; 3M63 B; 3VAW A; 2KWU B; 3MP9 A; 4M8M A; 4NQL B; 4YSY B; 3ZNI D; 5IA7 A; 1MHX A; 4EUT A; 4RM9 A; 3W9C B; 1C76 A; 1DOY A; 1TYG B; 4ZRP A; 2DZM A; 2KAC A; 3AE8 B; 1N5W A; 1GC7 A; 4CYE A; 1I7H A; 2H89 B; 2WX1 A; 1UGM A; 2JZP A; 4TQ1 A; 1OQY A; 1XF5 L; 4RMA A; 2MP2 B; 3L10 B; 2Y3A A; 5DPT A; 3Q8F A; 4HJK A; 1SSN A; 3HHM A; 4EKU A; 4P6V F; 1FNV A; 2N9X A; 2GMI C; 2J4X A; 3UIN B; 4WQO B; 3DBH I; 3IFW B; 1IBX B; 3MTN B; 1YQ3 B; 2IGD A; 2HTM E; 4XWW A; 4L2Y A; 2WU2 B; 2KTR B; 2LWP A; 3A33 B; 3PRM B; 2N9K A; 1SIJ A; 4WJO A; 2GBR A; 4GOC A; 1RFK A; 1VZ8 A; 1JCK B; 3GZN I; 5EE0 A; 1EF1 A; 2L32 A; 4AJY B; 1WY8 A; 1ZXI A; 3BVM A; 3PV1 A; 3QC8 B; 4AS1 A; 1N6Z A; 4HEA 1; 2XNA C; 2K9X A; 3BK2 A; 2GB1 A; 1WGK A; 4DHJ B; 5D2M B; 3IT4 B; 3SDL C; 5H8Y E; 4EEW A; 4K7U A; 2L83 A; 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