3V83A

The 2.1 angstrom crystal structure of diferric human transferrin
Total Genus 216
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
216
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Serotransferrin
publication title Structural basis for iron piracy by pathogenic Neisseria.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
total genus 216
structure length 674
sequence length 674
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A03
1N84A 1P1UA 3E3KA 1EZ9A 3O97A 4OFJA 1LCTA 1ANFA 1PBPA 3KGCA 2I0BA 4Q5TA 2A5SA 5FTHA 2QL3A 4TLLB 2I4CA 3OMBA 1FQBA 5AE4A 1URDA 2NWJA 4GRKA 2HXWA 3MVWA 4U21A 3H6WA 5JEIA 4F22A 3R26A 3BFTA 2IEEA 1NMUA 5CMCA 4IO3A 4GXAA 1N0TA 1PB7A 4M4GA 1D4NA 4KYSA 4G8HA 1B05A 1B40A 1LAXA 2F78A 2G93A 3SEUA 4OENA 3FJMA 3M3FA 2XX9A 2ONKE 4ZZAA 4KYEA 4NF4A 3KFMA 2GHBA 1YTVA 3PPNA 3T9XB 1TWYA 1XC1A 3K4UA 2OZZA 3FVKA 2I4BA 1SW1A 3TODA 3TKDA 4DCXA 4OZ9A 1ZIUA 3PMWA 5KCJB 5KZTA 1N04A 4ONYA 3EQ1A 2GHAA 4C1TA 2XXWA 4YKIA 3IOUA 4OETA 3EHSA 3B6WA 1NKXA 4X1BA 1WODA 1QULA 2ZNTA 3K6XA 3KBRA 2OJTA 4ESWA 4ELOA 1R6ZA 4LP2B 1B52A 4HCYA 3L6GA 1UIUA 4QFKA 3PMXA 4ZECA 3H6VA 3CI8A 3ZSFA 1BP5A 4BDRA 1O7TA 3DP4A 3P7IA 1OLAA 4OFOA 1US5A 1MQDA 1AOVA 3RY3A 4M1VA 3MVYA 1AL3A 5H8SA 3PGFA 3S9NC 2Z8DA 1MXVA 4Q30B 3T66A 3TTMA 2I6EA 1ZMGA 4DDDA 3CSGA 5I2NB 1JW4A 4P0GA 3H6UA 1Q1KA 2THIA 1Z7ME 3KJ7A 4RXLA 1IXHA 2PYYA 3U72A 4U22A 4JDFA 1EH3A 1MM6A 1FTMA 1QJMA 1B0LA 1OQHA 3USDA 4G4PA 1XHYA 3CSBA 4I9DA 2HFBA 3RLFE 2DQVA 2ZNUA 3A09A 1KWHA 2XXHA 2E0SA 3W15C 3SDFA 4U2RA 1GR2A 4GL0A 4BDQA 1Y4TA 3TTLA 4R6HA 2HAVA 5FTIA 3VVFA 3SESA 4RK9A 3VVDA 1FW0A 1QUIA 2OCUA 2OBGA 4F3BA 4JBZA 2ZYNA 3T22A 3MBPA 4EF1A 4HTGA 3IK6B 2UYEA 1Q35A 3VLVA 1MQHA 3TCFA 2Z22A 3PD9A 5H8HB 4I1DA 4ESXA 5AA3A 4F1YA 3QXMA 3PMVA 2F6GA 1FTOA 3TTNA 4E0WA 4BLAA 1BLFA 1MXXA 1NL5A 5H8FA 1DTGA 2DSFA 3DP8A 4U1OA 2X7PA 2V93A 3TFLA 5JTYA 5HM4B 2RC8A 3L6HA 1WVJA 2XHDA 3SEYA 3TYHA 5H8NB 4DXCA 2PX1A 1B7UA 3Q27A 4FIMA 2DOJA 2DE2A 2F7BA 5I56B 3OEMA 4RY1A 4LZ5A 1LSTA 3H6TA 3IOTA 4DIGA 1M5CA 4U4XA 2DXRA 2F97A 4P11A 5K2XA 1N3WA 1EZPA 2QRYA 3V5AA 5TU0A 1HSJA 3FASA 3K2DA 2O7UA 4GFRA 3G7WA 4XKNA 3O2AA 3C32A 2AL4A 1GTKA 3HHFA 2QSXA 5I59B 4MLQA 1B1XA 4X48A 2VHAA 4GVOA 3FZVA 3UP9A 2RF1A 4RJZA 3C9HA 3RT6B 1IITA 3PPQA 3H7MA 4MH5A 2I3WA 2O6AA 3M3KA 1MY3A 3OEKA 1B3EA 2XXPA 1GV8A 2IA4A 3Q29A 1H3DA 3MP1A 1A99A 1F9BA 3ODBA 3IORA 3PUWE 4PFYA 1PEBA 4MF3A 1QVSA 3FXUA 3O6HA 4R73A 3LUYA 3QYTA 2ZXTA 2XXXA 2H98A 3PPRA 3TDJA 1N76A 3Q25A 2O69A 3C34A 1SI1A 1I69A 1VFDA 2HCAA 1XVYA 2HEUA 3U93A 1R9LA 2DWHA 1B5HA 1NNTA 3CFXA 5J1DA 5DVIA 1VSOA 1UQWA 1QKAA 2D5WA 4OFLA 1AMFA 4Z7EA 4NF6A 5BWJA 4NF5A 4F2QA 3E4RA 4IGTA 1Y1ZA 1MH4A 4UA8A 1S50A 5I58A 2X26A 4QFNA 4JSDA 3VE1B 2QMWA 3R7XA 4ELPA 4GQOA 3K01A 5H8QB 4OMBA 1H44A 3KN3A 5EHSA 3LC8A 3K6WA 5F7VA 1H45A 3VLWA 3UGWA 3AXFA 3TZAA 4LVQA 1SVXB 1OLCA 1HSEA 3MWBA 1SDXA 3GXAA 4H6DA 4EQBA 2Z23A 2XD2A 5TP9B 2I48A 4X1DA 4R9FA 1B3FA 4IB2A 2PVUA 2O7IA 2HZKA 1POTA 4MBPA 3KN7A 3S9MC 1II5A 4F3PA 4FORA 4XXUA 2WKYA 2XXTA 3RTFB 5EHMA 2XXVA 4GF8A 2UXAA 4IY6A 4YICA 3LSXA 4ZZEA 1Y3QA 1L5TA 3ZKLA 4H0WA 3RN8A 3HCQA 4YB7A 3TAJA 2V3UA 4RPNA 1Y4CA 4YKPA 1A8FA 4TLMB 2ANJA 2UVIA 2DVCA 1B46A 1RYXA 5DTBA 2ABHA 5CMKA 3F11A 1JEVA 3I6VA 3MP6A 1MXWA 3FV1A 4QRZA 4R72A 2KLFA 3KSXA 2P0SA 1NNKA 1XVXA 3K1PA 4LQ5A 4HCWA 3O6IA 4KHZE 3H4ZA 1MXYA 1AH5A 4YMBA 5BUUA 3U1OA 2I3VA 4F31B 3TELA 1M5BA 3RTWB 5KDTB 2H4IA 3O28A 1MY1A 3Q28A 2Q8JA 4BDOA 3OSQA 1B58A 1UTBB 1UTHA 2QMXA 4OHNA 3TTRA 2R71A 3IAZA 2F6PA 4O3CA 1B5IA 1LAGE 3D4GA 4OWDA 4FE8A 3GLBA 1MRPA 3LR1A 4PFWA 4TQUQ 2F7AA 4DCYA 4NMYA 4R6YA 2PBWA 2I0CA 4ZEBA 1ATGA 1B51A 2I49A 1B4HA 3SEXA 3KOSA 3PUXE 2F5XA 4F2OA 1P1QA 4G8MA 3FUZA 1B2HA 4LQ2A 4WKMA 4YU0A 1A40A 3CR9A 3HPIA 2YPNA 1T0KA 3MUQA 5IKBA 3OENA 1A8EA 3TUSA 3G3HA 4YAHX 4BDMA 3U94A 2O51A 5EYFA 3T9HB 4UACA 3FVNA 3C31A 1P1OA 4YKJA 1LFGA 5ITOA 2H99A 4FECA 4R75A 1ZKBA 4XKPA 1P1NA 3SKPA 4C1UA 1O64A 4RYAA 3PUYE 1I6BA 4OEUA 5M2VA 1NH7A 4YB5A 3PV0E 4XKRA 2O1MA 2XX7A 2I58A 4EDPA 3PU5A 5DEXA 3T9VA 3GBBA 4GOTA 2XXYA 1VE4A 5TPAA 3MP8A 2CMOA 1OIBA 3LSLA 4YKKA 4IY5A 4PE5B 3MZ1A 2OK2A 3D4CA 3QUFA 4QHQA 4EQ7A 4KFQA 3O29A 3DM0A 1Y3NA 1JETA 1DTZA 2XD3A 2V25A 1QUKA 2F7CA 3MPKA 5JTYB 1MDP1 4POXA 3FVOA 5I84A 4O3AA 3FGSA 2Q89A 1FQAA 4Q0CA 1MDQA 1CB6A 2NVUB 4R74A 5AA2A 2NUVA 2NOOA 4H5GA 1RYOA 4OEVA 4ZEDA 2H5YA 2DE4A 2D21A 2HAUA 3U8QA 5CMMA 2RKMA 1M5FA 5AA4A 1B1HA 1DOTA 3MZBA 2QPQA 3RQTA 4EUOA 3CG3A 4H1XA 1MG1A 1TFAA 3MW0A 2BJJX 3G3JA 1SI0A 1CE2A 3C33A 4R6KA 3PUZE 5ICTA 2UVJA 3IO4A 3CIJA 4G68B 3GBAA 1YCJA 2DWAA 3T96B 2AYSA 4ND9A 2O1LA 3QK6A 1SYHA 3K1MA 1D9VA 1LB8A 2P2AA 2XXUA 3KZGA 3UIFA 4KI0E 2A5TB 4KYDA 3TQLA 4OXVA 3SEVA 2XXRA 1XT8A 4XIGQ 1FQEA 5I56A 2ZNSA 4AB5A 3HHGA 3JZJA 3FD3A 3IX1A 4MLVA 1IUDA 4ISUA 1UIVA 2G29A 4Z0IA 4OYVA 3K6UA 1NNFA 2CZLA 2P1SA 3LSWA 4F1VA 3O6GA 2XXIA 4NF8A 3TPAA 4NEDA 1S9TA 3C36A 2Z8FA 3V8XB 1WDNA 4JSOA 1ZTYA 2VGQA 2F8DA 4F29A 4WEPA 4KR5A 4RNSA 4NF5B 2PT1A 2GFEA 3B6TA 4QFOA 4PETA 3THIA 3E13X 3M8UA 1B3HA 1IEJA 2QS1A 3KSJA 1MH3A 4HW8A 3MAMA 2Y7WA 2F34A 3PPPA 4U23A 1QW0A 4XTCQ 5K2YA 3HN0A 4THIA 2DS9A 4ZE9A 4L17A 1Y20A 1ZU0A 3M3LA 1B3GA 4QSDA 3TCHA 3IB2A 2DXYA 3KOTA 3UA8A 4IO6A 1IZ1A 2R6GE 1B9JA 1P1WA 3K0VA 4F18A 3OELA 2V3TA 4FAJA 3FXRA 3RNNA 1VFEA 2NXOA 2ZYKA 4F3GA 4H65A 1MPCA 3UORA 3R6UA 2UVHA 2W7YA 1I6AA 2YLNA 2QS3A 2OLBA 1LBCA 3B6QA 3EPEA 4H67A 2FA7A 4DLDA 4N07A 1LAFE 2UYFA 3RGYA 4F3SA 2RINA 5A5XA 5AA2D 3FJ7A 1DPPA 1SYIA 1PB8A 5ICQA 1A7LA 4IGRA 1IIWA 3N6UA 5L9MA 1TT1A 3T9UA 1MXUA 4NWCA 2VP1A 4ELRA 2HQ0A 3VDFA 3MQ9A 4LZ7A 5I2KA 2RCBA 4PFTA 1Y1MA 4MFIA 1MQIA 4R9GA 4N13A 3V83A 2Y7PA 3QUJA 4KCDA 4ZEIA 3JV9A 4F1UA 2YJPA 3TMGA 2OWSA 3S9LC 3MJNA 3K02A 4NF4B 2E1SA 1SQYA 3E9XA 5TP9A 2REGA 4F19A 5I57A 1JQFA 4DZ1A 4FATA 4ZEKA 3I3VA 3OOAA 4EXLA 4PP0A 1UTHB 3FVGA 3DLNA 4H8JA 4JWXA 4F39A 5CM6A 2DP8A 1NFTA 4XKQA 3FJGA 4LUBA 2Q88A 4OESA 3KG2A 4OVJA 3ILUB 1SW5A 1QUJA 3MPLA 3G3IA 2QS4A 1PB9A 1SD3A 2GH9A 3V89B 2O68A 2ZMBA 4YB6A 4JB7A 4GXSB 1JW1A 1FTJA 1H43A 4RPOA 4WXJA 4GD5A 1POY1 1N7XA 4KCCA 3K00A 3OXNA 4QSCA 5DYHA 3B7DA 3DELB 1JW5A 3G3FA 4R2BA 1JEUA 4QFPA 1FCKA 2Q2CA 1OQGA 2R9JA 4NE4A 4KPTA 1USYH 3VXBA 3JYRA 1FQDA 1URSA 3A3CA 4FEBA 3Q26A 1SW2A 3CRBA 1TXFA 5B70A 3ILTB 4OERA 5KDTA 1Z7NE 1MY0A 2V3QA 3EHUA 5DVJA 2QJEA 2Q9TA 3CG1A 4GWOA 2Y84A 1UTBA 4JXIA 1Y3PA 1B0HA 4K3FA 4GIZA 3ZKKA 3TQWA 3OSRA 5CBSA 1S7YA 3K6VA 3IOWA 3G3GA 3UK4A 4JWYA 1ELJA 3N6TA 5KCJA 5DEXB 3I5OA 1A54A 4AB6A 3BBRA 1D9YA 5B7DA 1FQFA 1SW4A 3MC2A 3VV5A 1LCFA 3KJTA 5TPAB 1O63A 5CI5A 3VXCA 5L9SA 3KEIA 4NTLA 4R2FA 2QS2A 1B5JA 3EHTA 5L8DA 4EXKA 3IR1A 1BTJA 2DWJA 3MVXA 2UVGA 3VLUA 3KN8A 1XOCA 2LAOA 1VR5A 1GGGA 1QKBA 4GL8A 2HZLA 3OD7A 1AIVA 1B7ZA 1PBQA 4OQOA 4QFLA 4IO7A 4YZZA 5FHNA 5F1QA 2AL5A 4KD5A 2Y7KA 3IL1B 5I2NA 3PUVE 5ELVA 5AA2B 1N7WA 4KQPA 3CFZA 3PPOA 2ZYMA 1IQ7A 2ZYOA 4RK2A 5H8FB 5ITPA 5L9OA 1DSNA 1MPDA 5AA4B 1MM7A 2V84A 1ZLQA 3ECRA 4ZS9A 1BKAA 4WEDA 5FHMA 2B65A 3IB0A 3SEWA 4JWOA 1LB9A 1XS5A 1LFIA 3N94A 3VFJA 1FTKA 3OO7A 1J1NA 1N3XA 1R1NA 1OVTA 3H03A 2VD2A 1MXZA 4I8CA 5CBRA 2PMSA 1B4ZA 4PFUA 4ZE8A 1HSLA 3VVEA 1ZJLA 2REJA 1MY4A 4DXBA 4EF2A 3O66A 3C4MA 1P99A 3BKIB 3RUMA 1M5DA 1TFDA 4H5FA 1US4A 3LSFB 1MY2A 1MS7A 1YPNA 2DYXA 3UN6A 3HSTA 4DE8A 2Q2AA 4QF9A 4ZDMA 1M5EA 2M8CA 2GRVA 3FATA 1JVYA 5H8HA 2ONRA 2PT2A 3K1NA 3WAEA 3EN3A 4ZEFA 1MQGA 1YAEA 5LOMA 2DE3A 5ISUA 1NH8A 1B32A 1I6QA 3U92A 2O84X 1FTLA 5IAIA 2XX8A 3CFLA 5CRYA 4YMAA 1Y9UA 4G68C 3FXQA 3GZGA 1BIYA 3HO7A 1GVCA 5DVFA 3ONMA 4X9TA 5H8NA 3IO6A 4G8NA 1D3KA 4G2ZA 3FV2A 1LLSA 3SETA 4NF8B 3HV1A 1NNPA 1FQCA 2OWTA 2RC7A 4Q8RA 2X7QA 3LBSA 1LAHE 1USYE 2D3IA 5HBCA 4TOZA 4GLIA 2DWIA 1URGA 2Z8EA 1LBBA 2F35A 3W9VA 3IJOB 1DMBA 4G68A 5AA1A 3QAXA 2F36A 2AIXA 4LONB 1DPEA 2H9BA 3TTKA 1JNFA 4FJPA 1IXCA 3C35A 2FYIA 4BDNA 4LA9A 3T93B 1B3LA 3WAFA 3W9WA 1IXIA 2A5TA 3QSLA 2B3FA 2ESNA 3N26A 3IJXB 4E0XA 5I59A 5CC2A 4G77A 2RCAA 4NF6B 4POWA 3O9PA 5HPQA 3OO6A 4IO4A 1MPBA 2Y7IA 5I58B 2VOZA 3H3GA 4C0RA 3CVGA 1A55A 3OO8A 2ONSA 4RA1A 3DP6A 3PD8A 4QSEA 3N5LA 5DT6A 3A3UA 3OO9A 5FHOA 2H25A 3IB1A 4I62A 2RC9A 3EF7A 1SBPA 3S4UA 3QIMA 2XXQA 1EZOA 3RPWA 5A5XB 3ZS6A 3TEPA 4U4SA 4BDLA 1R9QA 1LFHA 2DVZA 4IO5A 4U1ZA 4DXUA 3FIRA 1PC3A 3SERA 5JK4A 4FEDA 1PDAA 4LATA 4ECFA 4IO2A 3MVZA 2Y7RA 1B7HA 3IOVA 5I2KB 1OVBA 1OMPA 4LZ8A 4HS7A 4ELQA 1B6HA 3TCGA 1LGBC 2ALUA 4OTEA 3S9EA 1MQJA 4O3BA 4N6PA 4AQ4A 3S2VA 2FNCA 3MZ9A 4EQ9A 1H76A 1RKMA 1ZBMA 3H06B 4H8IA 4NWDA 3RT8A 5H8QA 1EU8A 1JVXA 5I57B 5CMBA 4P0IA 4PQJA 1IXGA 2B3BA 3G3KA 3BFUA 2VD3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N84A 1P1UA 3E3KA 1EZ9A 5ET7A 3O97A 4OFJA 1LCTA 1ANFA 1PBPA 3KGCA 2I0BA 4PDHA 4Q5TA 2A5SA 4XEQA 5FTHA 4PTKA 2QL3A 4TLLB 2I4CA 3OMBA 1AWBA 1FQBA 5AE4A 1URDA 2NWJA 2CZHA 4GRKA 3PTYA 2HXWA 3MVWA 4U21A 1NV4A 3H6WA 5JEIA 4F22A 3R26A 3BFTA 1FBGA 2IEEA 1NMUA 5CMCA 4IO3A 1FBEA 4GXAA 1N0TA 4MJOA 1PB7A 4M4GA 1D4NA 4KYSA 4G8HA 1NUWA 1B05A 1B40A 1LAXA 2F78A 2G93A 3SEUA 4OENA 3FJMA 3M3FA 2XX9A 4P1EA 2ONKE 4ZZAA 4KYEA 4NF4A 3KFMA 2GHBA 1NUXA 1YTVA 3PPNA 4H45A 3T9XB 1TWYA 1XC1A 3K4UA 1IMBA 2OZZA 3FVKA 1FPFA 2I4BA 1SW1A 3TODA 3TKDA 3KBZA 4DCXA 4OZ9A 2WYKA 1ZIUA 3PMWA 5KCJB 5KZTA 1N04A 1FJ6A 4ONYA 3EQ1A 2GHAA 4C1TA 2CZIA 2XXWA 4YKIA 3IOUA 4OETA 3EHSA 3B6WA 1NKXA 4X1BA 1WODA 1QULA 2ZNTA 3K6XA 4HE0A 3KBRA 2OJTA 4ESWA 4PBQA 4ELOA 1R6ZA 4LP2B 1B52A 4HCYA 3L6GA 1UIUA 4QFKA 3PMXA 4ZECA 3H6VA 1YYZA 3CI8A 3ZSFA 1BP5A 1Q9DA 4BDRA 1O7TA 3DP4A 4DI3D 3P7IA 1OLAA 4OFOA 1US5A 1MQDA 1AOVA 3RY3A 4M1VA 3MVYA 1AL3A 5H8SA 3PGFA 3S9NC 2Z8DA 1MXVA 4Q30B 3T66A 3TTMA 2I6EA 1ZMGA 4DDDA 3CSGA 1FPKA 5I2NB 1JW4A 4P0GA 3H6UA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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