3V83A

The 2.1 angstrom crystal structure of diferric human transferrin
Total Genus 216
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
216
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for iron piracy by pathogenic Neisseria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 216
structure length 674
sequence length 674
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A03
2HFBA 4YAHX 2VD3A 2I0CA 4X9TA 1B0HA 3FATA 1FQAA 2I3WA 4XKQA 4FIMA 3ECRA 1QULA 3T9VA 2QS3A 3EF7A 2Y7IA 2F36A 3K02A 1SI1A 3TCHA 1LBBA 4OERA 1ANFA 3OENA 5K2XA 2PBWA 4OHNA 3V89B 1R6ZA 4UA8A 3LUYA 1B46A 4H5FA 1XVYA 3CRBA 3TDJA 3Q27A 1B3EA 4FATA 3IOUA 2H25A 4FAJA 1MPDA 4O3BA 3T9UA 3IR1A 4KFQA 1URSA 4RXLA 1JNFA 1M5DA 1POY1 2RKMA 4I1DA 3KSXA 3MVXA 4LZ7A 1USYE 1N3WA 4ZEFA 3I3VA 3VV5A 3VXCA 4G68A 2V93A 4R73A 1YTVA 4U2RA 4N07A 3VVEA 1B3LA 3H6TA 4ZECA 3FJGA 3A09A 3EHTA 4IO7A 3CSBA 1IUDA 2ZYMA 3OO9A 2DS9A 2ZNUA 5CRYA 2DE3A 5LOMA 2UVIA 5I2KA 1A55A 4DCXA 4NF4A 3O6HA 5TP9B 4LZ8A 4PE5B 1VR5A 4RNSA 2F6GA 4BDOA 3MVYA 1I6AA 4G68B 3KN7A 2V3UA 1B4ZA 3HHFA 2D21A 3CFLA 3PGFA 2XXYA 4E0WA 2O1LA 4YB6A 3HSTA 3O2AA 3CR9A 3EHSA 3ILUB 4HCYA 4RPOA 1MY3A 5L9MA 1SBPA 4U1ZA 1H76A 1GTKA 5I2KB 1T0KA 1UIVA 1XVXA 3MVZA 3L6GA 1B1XA 4DXCA 3OO7A 3RGYA 2ONSA 4F39A 1WDNA 3MP8A 3K1NA 4N6PA 1OQGA 4R9GA 3UN6A 1EZPA 2H4IA 3IO4A 1B5JA 4R6HA 3I5OA 1AIVA 1FTMA 5EHMA 2ZYOA 3DP4A 5IAIA 2ZNSA 4GQOA 2PVUA 2HCAA 3IOVA 3H3GA 2F78A 2DWIA 2QMWA 1MXXA 4U23A 4HS7A 4OWDA 3FXRA 2OBGA 4F2OA 3VLUA 5F1QA 4P0GA 4QRZA 2Z8FA 1IXIA 1MQHA 2CZLA 1B58A 2RCBA 5CI5A 5L8DA 4OFLA 1A8FA 3HCQA 3K1MA 4LUBA 4TOZA 1D9VA 1H3DA 1PBPA 4HTGA 3HV1A 3WAFA 1XC1A 1M5EA 4GL8A 3UK4A 2I4BA 1Y3NA 2O84X 5DVFA 4DXUA 3EPEA 1II5A 1FW0A 3LC8A 1UIUA 5H8QA 3RTWB 2XX9A 4I62A 4NMYA 4NWCA 2FA7A 1QKBA 2QS4A 4GFRA 3OD7A 5EYFA 4QFLA 1MPBA 4WEPA 4YU0A 4OENA 3TTRA 1O63A 3FVNA 2RC9A 4OMBA 2H99A 5I84A 3CG1A 2X26A 4H5GA 2O7IA 1LFHA 3M3FA 4NEDA 5H8QB 4ELOA 1OVBA 2ZYKA 2YLNA 4OTEA 2ESNA 2UXAA 1MY4A 2UYEA 1HSEA 5ICTA 2REGA 3C34A 4RJZA 3SEYA 1JW1A 2DXYA 2E0SA 3VE1B 4DZ1A 3HPIA 4R74A 3JV9A 3TPAA 5ITPA 3KFMA 2OLBA 4LP2B 2OZZA 4TQUQ 4NF8B 4FORA 4Q8RA 2WKYA 2OWSA 4OEUA 2QPQA 4EQBA 3M3KA 5AE4A 4ZEBA 2O1MA 1ZTYA 4PP0A 1TFDA 1VE4A 1LB9A 4BDQA 3QIMA 5FHNA 3FGSA 3EHUA 3G3GA 1YAEA 1A7LA 1FTOA 2VP1A 2OK2A 1QUJA 4U22A 2ALUA 5FHMA 2ABHA 2IEEA 1PBQA 3SEUA 2YPNA 2A5TA 3ZKKA 1IXGA 2NOOA 3KG2A 3K6UA 3M8UA 3PD8A 1POTA 4G8NA 1D9YA 2O68A 2I4CA 3UP9A 4EXLA 4YKJA 2XXTA 2DP8A 3GBBA 2AL5A 4Z7EA 4ELPA 3P7IA 1GGGA 1S50A 3LSWA 2Q88A 4H1XA 3MP1A 5H8FA 4IB2A 4FE8A 4RK9A 3FJMA 4KI0E 2A5TB 1A99A 3OXNA 4QFPA 5KDTB 3K6WA 2HZKA 4YZZA 2M8CA 3CSGA 2G29A 1TWYA 1B7UA 3UORA 2F7AA 4YMAA 2YJPA 3QUJA 4TLMB 5H8NA 4JWYA 3W9VA 5JTYB 1NH7A 3KJ7A 4ZDMA 4PFUA 5H8FB 4E0XA 3PPOA 4NE4A 4PQJA 3LSFB 1XS5A 2ANJA 3PUYE 3KJTA 1IITA 3PD9A 5ITOA 4LATA 4GL0A 1FTJA 2XX7A 3TODA 3KOTA 1LCFA 1JW5A 1IEJA 3OO6A 4JDFA 3I6VA 3F11A 1P99A 3H06B 1Y1MA 2GRVA 5JK4A 1P1NA 1GR2A 4JSDA 3ZS6A 4KPTA 4I9DA 4EXKA 4MLVA 2Q2CA 3OSRA 3MVWA 1P1OA 3DLNA 1NMUA 1NKXA 2O7UA 3LR1A 2UVHA 2DWAA 1Y20A 4ELRA 2UVJA 2DVZA 4GIZA 2DWHA 1SI0A 4KYEA 4MFIA 5KCJB 3T93B 3N6TA 1B6HA 3CI8A 3H6VA 5H8SA 1L5TA 3G7WA 5AA4A 1O64A 3SDFA 3TQWA 1UQWA 3OSQA 5AA3A 4F18A 1OMPA 4F22A 3C31A 1B0LA 3O29A 3IB2A 2RF1A 2ONRA 4XKPA 2Y84A 1URDA 5TP9A 3Q25A 1B9JA 4ELQA 3IB1A 4OVJA 1B3FA 2VD2A 4IGRA 1QW0A 2Y7RA 3W15C 5AA4B 3ODBA 1VSOA 2H98A 2P1SA 4LA9A 5ELVA 1H45A 4C1UA 4ZE9A 1OLCA 4EQ7A 5BUUA 2W7YA 1H43A 4HW8A 2XXVA 3JYRA 1XT8A 4IO5A 5TU0A 3RN8A 1FQBA 3U1OA 3MW0A 2PT2A 3O6GA 1N76A 3HN0A 2HAUA 5FTIA 4C0RA 4G68C 3V5AA 3IAZA 3S4UA 4KHZE 5I58B 2FYIA 4R72A 4GWOA 4QSCA 1GVCA 1WODA 2XHDA 1TXFA 3QAXA 4G4PA 3IOTA 3N26A 2QL3A 2ZXTA 2Z8EA 2ZMBA 3PPRA 1SW5A 5DVJA 2B65A 2DQVA 1N3XA 2F97A 4IO3A 3TELA 1BKAA 3MWBA 3S9MC 4KQPA 1LAFE 3KEIA 3RY3A 1MM7A 2DVCA 2H9BA 2E1SA 1JQFA 3D4GA 4OXVA 5A5XB 3KN3A 3TAJA 1FTKA 4U21A 1MY0A 3ZKLA 4P0IA 4OEVA 2QSXA 3ILTB 1FQFA 4BDMA 1S7YA 4F1YA 2PX1A 1M5FA 3PUWE 1VFEA 5DVIA 3TQLA 1LAHE 1AOVA 4OYVA 1FQEA 3O97A 4R75A 4R6KA 1JETA 2X7PA 1RKMA 2LAOA 3E4RA 5CMBA 4U4XA 3TCFA 1US5A 4MF3A 3SEWA 3BKIB 3V8XB 4IY6A 1QVSA 3K4UA 4F3SA 3PMXA 1B51A 4JWXA 4LQ2A 4WKMA 2Y7PA 1FQDA 2B3BA 1S9TA 2O69A 3PPPA 1FQCA 3A3UA 3HO7A 1LFIA 2X7QA 3VXBA 1B3GA 2V3QA 4GVOA 1ATGA 4QHQA 3LSLA 2I3VA 1JW4A 3TTMA 1RYXA 3KGCA 4OETA 1VFDA 1A40A 2GFEA 3DM0A 4KR5A 3B6QA 3MZ1A 3O9PA 2DOJA 3IX1A 2NWJA 4L17A 2DE4A 3TTNA 5IKBA 1SVXB 5B70A 4ESXA 3IJOB 1IIWA 3LSXA 4NF8A 2Y7KA 3FVGA 4OESA 3H6WA 3T9XB 3EQ1A 4ZEKA 1ZU0A 5EHSA 2DYXA 2A5SA 1SW2A 4JWOA 3KBRA 2QMXA 2Y7WA 3RTFB 3T66A 4I8CA 3O66A 3PPQA 1IZ1A 3FXUA 5AA2A 3Q28A 1MG1A 2XD3A 5I57B 4ECFA 3MZ9A 3QUFA 4AQ4A 4M1VA 2HQ0A 4ZS9A 3B7DA 1SQYA 1MM6A 1DMBA 5DT6A 4JSOA 1JVYA 3B6TA 5ISUA 1N84A 2F34A 3FASA 2QS2A 2Q2AA 1UTHA 3OEKA 4X1DA 3K6VA 3RT6B 4PETA 1PEBA 1NH8A 3R26A 5AA2B 2AL4A 3ONMA 2I58A 1MY2A 4QF9A 4X48A 2OJTA 4ZEIA 3T96B 4F31B 1F9BA 3OOAA 4LZ5A 3PUVE 1EZ9A 1B52A 3G3JA 5BWJA 1MXUA 4LONB 1MXVA 3IL1B 3MPLA 2NUVA 3SEXA 1OQHA 2GHAA 4OQOA 1I6QA 4WXJA 3TMGA 1QUIA 1US4A 2R71A 2UVGA 1UTHB 4QFNA 1PB9A 3JZJA 5KDTA 2XXHA 4KYDA 1MPCA 3PMVA 2B3FA 1B5HA 1JEVA 5DYHA 3QSLA 2XXWA 3QK6A 1MQDA 1NNTA 5JTYA 1NNPA 1TT1A 3VLVA 5K2YA 1ZKBA 2DXRA 3FXQA 4EUOA 2ZYNA 3PMWA 1MS7A 4EDPA 2O6AA 1BLFA 4BDRA 3C32A 4P11A 4QFOA 5CMMA 4R9FA 3RLFE 4IO4A 5HPQA 3TUSA 5F7VA 4EQ9A 5CBSA 1MXWA 5CBRA 2Z23A 4AB5A 5I2NB 2REJA 1P1QA 5AA1A 3Q26A 3TTKA 3IORA 5CC2A 3GLBA 5DEXB 2Q89A 4R2FA 5AA2D 1B4HA 3C36A 2RC7A 2RCAA 2DSFA 2PYYA 3GBAA 3UA8A 3R7XA 4RYAA 4JB7A 4EF1A 3Q29A 3UIFA 3CIJA 3SERA 1HSJA 1H44A 3DP8A 1Y3PA 3H7MA 1BIYA 3SESA 1OLAA 1MXYA 1ZBMA 5KCJA 2R9JA 1BP5A 3MPKA 2CMOA 4IY5A 1OIBA 4LQ5A 1LSTA 4ZE8A 4F29A 4RA1A 1JVXA 4XXUA 4F3GA 1LGBC 1TFAA 2VOZA 1DSNA 3RQTA 3QYTA 1Y9UA 3IJXB 2ZNTA 2QRYA 2D3IA 1OVTA 1QUKA 1WVJA 3IB0A 2OWTA 1A54A 3U93A 2I48A 5L9OA 4ISUA 1LAGE 1N7WA 3MQ9A 3FVKA 1SW1A 3SEVA 4GLIA 4R2BA 3G3KA 2HXWA 2I6EA 2F7BA 1EZOA 4YB7A 3TZAA 2GHBA 3A3CA 1USYH 3MAMA 1NFTA 2QJEA 2UYFA 4EF2A 3TFLA 1MDP1 4Z0IA 4F19A 3VLWA 4WEDA 4KCCA 3E3KA 2RINA 3FVOA 1MH3A 3MJNA 3T22A 4R6YA 1LLSA 4X1BA 5TPAA 5ICQA 3KOSA 4JBZA 5HBCA 2G93A 3WAEA 5CMCA 1I6BA 3N94A 4NWDA 2DE2A 4BLAA 1Y4TA 5I58A 2XXQA 3HHGA 1GV8A 5CM6A 4O3CA 1IQ7A 4H6DA 3ZSFA 4POWA 1B5IA 4G8HA 4IGTA 3MZBA 2PMSA 4YKIA 3OEMA 2NVUB 1EH3A 1LB8A 4YICA 5CMKA 3S2VA 1Z7NE 5I59A 2PT1A 1AH5A 1B3HA 5TPAB 3PV0E 5J1DA 4BDNA 3MP6A 3C35A 1MRPA 1B2HA 5A5XA 4GD5A 3U8QA 5KZTA 3T9HB 4HCWA 1ZJLA 5M2VA 1O7TA 2HAVA 3G3IA 3DELB 1ZMGA 4DE8A 2H5YA 2FNCA 3OMBA 4MH5A 3GXAA 1J1NA 5DTBA 5L9SA 3H6UA 4UACA 4IO2A 2AIXA 3VFJA 1PB7A 5I59B 3G3HA 4ZZEA 4IO6A 1AMFA 3S9NC 3RPWA 3L6HA 1KWHA 4GF8A 1N0TA 2XXRA 2R6GE 4ZEDA 4KYSA 4NF4B 2GH9A 4MBPA 2P0SA 3N6UA 2XX8A 4GXSB 3FJ7A 1A8EA 4PFWA 2AYSA 3FUZA 3PUXE 1NNKA 3QXMA 2I49A 1AL3A 4H0WA 4DXBA 3LBSA 4RPNA 3D4CA 3E13X 2O51A 4OZ9A 2QS1A 1N04A 1PC3A 1SYIA 3EN3A 3BBRA 1B7ZA 3CG3A 3TYHA 3B6WA 3MUQA 2XXXA 4KD5A 2Z22A 1FCKA 1P1UA 4DIGA 3K6XA 4POXA 1DOTA 3BFTA 4XKRA 3RUMA 2VHAA 1DPPA 3C9HA 1MY1A 3KSJA 1I69A 4XTCQ 3FV1A 3IO6A 3S9EA 1Q35A 1DTGA 4RY1A 4U1OA 3CFXA 4F2QA 4H67A 4YKPA 3PUZE 4FEBA 1D3KA 4DDDA 1LAXA 2Q9TA 5I57A 2OCUA 4XKNA 4Q0CA 4Q5TA 4AB6A 4GOTA 2V84A 1N7XA 4LVQA 1QJMA 2ONKE 2Q8JA 3M3LA 3KN8A 4QFKA 1BTJA 2XXIA 3FIRA 2P2AA 1LFGA 1Y3QA 3IOWA 4OFOA 1SW4A 5FTHA 4Q30B 1JEUA 1Z7ME 2V3TA 1ZIUA 1MQIA 2D5WA 1MXZA 2F35A 1LBCA 1Q1KA 3PU5A 3K1PA 4G77A 3O28A 3K01A 3MBPA 2KLFA 3FD3A 1SD3A 3UGWA 1LCTA 3S9LC 1D4NA 4JXIA 3H03A 3K00A 3OO8A 1ZLQA 3SKPA 3SETA 3TEPA 2XXUA 3W9WA 4M4GA 3K2DA 4TLLB 3AXFA 2F8DA 2HZLA 4PFYA 3TKDA 3FV2A 1RYOA 4NTLA 4RK2A 4YB5A 3KZGA 4GRKA 2I0BA 4G8MA 1B40A 3OELA 3CVGA 4U4SA 4QSEA 4O3AA 1IXHA 4C1TA 4F3PA 5HM4B 3MC2A 5JEIA 2NXOA 1DPEA 3PPNA 4F1UA 2RC8A 1URGA 3RNNA 3U72A 4GXAA 3R6UA 1MH4A 3C33A 3O6IA 4THIA 4KCDA 5I2NA 4PFTA 3VVDA 4ONYA 3TTLA 1MDQA 4OFJA 1PDAA 3BFUA 4NF5A 1Y1ZA 3IK6B 1DTZA 4BDLA 3E9XA 3GZGA 1P1WA 4H8IA 1Y4CA 5I56A 1UTBA 2F5XA 5DEXA 2BJJX 4ND9A 5H8HA 1SYHA 4H8JA 5FHOA 2F7CA 4FEDA 4F1VA 2VGQA 4N13A 2DWJA 1XOCA 2F6PA 1SDXA 1R1NA 4YKKA 1M5BA 1PB8A 4K3FA 4NF5B 5B7DA 3VVFA 1B32A 1CB6A 4H65A 1ELJA 5I56B 1UTBB 3VDFA 4ESWA 1YCJA 5H8HB 1NNFA 1B1HA 3RT8A 4DCYA 4QSDA 3USDA 3N5LA 3CFZA 1HSLA 4F3BA 4YMBA 2V25A 4NF6A 2THIA 3U94A 1CE2A 1MQJA 2XD2A 1R9QA 1FTLA 3FZVA 3H4ZA 1YPNA 4MLQA 1B05A 3G3FA 3K0VA 1R9LA 1NL5A 4G2ZA 3U92A 4XIGQ 1XHYA 4DLDA 1EU8A 3C4MA 5H8NB 1QKAA 2IA4A 3THIA 3TCGA 1M5CA 4FJPA 2HEUA 4NF6B 3V83A 3DP6A 1MQGA 1B7HA 2Z8DA 1IXCA 4ZZAA 4FECA 2XXPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HFBA 4YAHX 2VD3A 2I0CA 4X9TA 1B0HA 3FATA 1FQAA 2I3WA 4XKQA 4PF8A 4FIMA 4P8BA 3FXBA 3ECRA 1QULA 4MHFA 3T9VA 2QS3A 3EF7A 1YXIA 2Y7IA 2F36A 3K02A 1FPDA 1SI1A 3TCHA 1LBBA 3B8BA 4OERA 1ANFA 3OENA 5K2XA 2PBWA 4OHNA 3V89B 1R6ZA 4UA8A 3LUYA 1B46A 4H5FA 1XVYA 3CRBA 3TDJA 3Q27A 1B3EA 4FATA 3IOUA 1NV0A 2H25A 4FAJA 1MPDA 4O3BA 3T9UA 3E78A 3IR1A 4KFQA 1DBZA 1URSA 4RXLA 1JNFA 1M5DA 1POY1 2RKMA 4I1DA 3KSXA 3MVXA 4LZ7A 1USYE 1N3WA 1FBPA 4ZEFA 4N4UA 3I3VA 3VV5A 3VXCA 4G68A 2V93A 4R73A 1YTVA 4U2RA 4N07A 3VVEA 1B3LA 2P3NA 3H6TA 4ZECA 4DI3D 3FJGA 3A09A 3EHTA 4IO7A 3CSBA 1IUDA 2ZYMA 1BK4A 2KR0A 3OO9A 2DS9A 2ZNUA 5CRYA 4PDHA 2DE3A 5LOMA 2UVIA 5I2KA 5ET5A 1A55A 4DCXA 4NF4A 3O6HA 5TP9B 4LZ8A 4PE5B 1LEVA 1VR5A 4RNSA 2F6GA 4BDOA 3MVYA 1I6AA 4G68B 3KN7A 2V3UA 1B4ZA 3HHFA 1NUXA 5IGAA 2D21A 3CFLA 3PGFA 2XXYA 4E0WA 4O94A 4O8MA 2O1LA 3KC1A 4YB6A 2B4LA 3HSTA 3CR9A 3O2AA 3EHSA 2XWIA 3ILUB 4HCYA 4RPOA 5EYGA 1MY3A 2OWZA 5L9MA 1SBPA 4U1ZA 1H76A 1GTKA 5I2KB 1T0KA 2HPGA 4X8RA 1UIVA 1XVXA 3MVZA 3L6GA 1B1XA 4DXCA 3OO7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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