3VESA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz in complex with ampcpp and carbamoyl phosphate
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
567
structure length
567
Chain Sequence
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 190
structure length 567
sequence length 567
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vesA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vesA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vesA03
4WQ4A 1V4SA 3ENOA 4CBXA 4BREA 3D2EB 3GL1A 4IJNA 4M63C 4HTLA 4FWPA 3EL2A 3U9ZA 5AQTA 3O08A 5E26A 4BRNA 5JMVA 4FOEA 3CJ1A 2CGJA 1NGAA 5AQHA 2AP1A 4IJAA 3VEZA 5FPMA 2I7NA 1MA9B 4FWNA 3RSEB 2ZGZA 1H1VA 1NGDA 4JNEA 3W0LA 2GELA 3FZKA 1GLAG 3GG4A 2NRHA 2VCPA 3P4IA 3C7NA 3H45C 4CZJA 1EQYA 3S41A 2Q2RA 1YUWA 5KQDA 1V4TA 4JN4A 5KPRA 4BQLA 1XUPO 4DQ8A 4CJ7A 1KAXA 4IXCA 3M6GA 5AQFA 3JXUA 3AY9A 3W3DA 5JICA 2QWRA 3LL3A 1WOQA 2P9KA 1ATSA 1KAYA 3O4WA 2E2QA 1X3MA 2GUPA 2QWOA 3O8MA 4FO0A 4FPBA 3VENA 2P9UB 1E4GT 1GLFO 4JD2B 3WUHA 4K41A 5BRHA 2P9PB 2ASPA 1SZ2A 1KAZA 3CJ7A 5AQKA 5B8HA 2W40A 2D1KA 2A41A 2E20A 3BF1A 1J6ZA 1CZAN 3ATVA 4BRKA 1NGEA 2V51B 1NGHA 4B9QA 2BTFA 4EHUA 5AQLA 4JHDA 3KHYA 1IJJA 2P9SB 4NB4A 2Q97A 3JS6A 5AR0A 3MN5A 1YVNA 3A8YA 4Z94A 2IIRA 4A61A 5KQ8A 3ZX2A 1OKJA 1TYQB 2YHWA 3IDHA 4L3QA 1YAGA 4BR2A 4CD3A 3HM8A 3BUZB 3MDQA 1ZBSA 3CI5A 4CZEA 2I7PA 3U4LA 5AQQA 2QW9A 1U2VA 3ZEUA 3ATUA 1ZXOA 4A2AA 1MDUB 3FZFA 2ASOA 3A5LC 1P8ZA 1RGIA 3MMVA 4H0XB 4IZ9A 4K43A 5I9EB 4BRIA 4PL7A 4GNIA 4BR7A 3LDQA 3TU5A 2GWJA 4NO7A 3C7NB 1JCGA 5AQYA 1DEJA 4H5TA 3GBTA 4F9OA 1NGGA 4FWQA 4BRHA 3IMXA 1DKGD 1XC3A 1TUYA 3LM2A 2NLXA 1C0GA 1U6ZA 4CBUA 3QBXA 3DXKB 4YDUA 5FPNA 4ISEA 2ZGYA 1BA1A 4BRMA 3FZHA 5FPEA 5AQSA 4BRCA 3QB0A 2PBDA 2FF6A 3UKUA 2ZF5O 2FLOA 4XEIA 3TTCA 2CGKA 4PKGA 3VF4A 5BR9A 2YCHA 2E8AA 4CZFA 4PL8A 3DXMA 4FWOA 1BDGA 2FSNA 3HTVA 2J4RA 5CE3A 3SMPA 4B1VA 1NM1A 2P9NB 3BP8A 5AQIA 3CHWA 3R6MA 2IVNA 4I6MA 3R8EA 1BU6O 3TSUA 3WEEA 4HWIA 2FSJA 1BUPA 5BN9A 2ITMA 3B8AX 3HSCA 1QHAA 2ZWHA 1HKGA 4JAXA 5AQRA 2HOEA 3ULEA 2F9WA 3IUCA 3VEWA 4CD1A 4BC4A 4ISGA 1IG8A 3O6WA 2IVOA 3WXLA 4H0OA 3DAWA 4H0YB 2Q0UA 1BG3A 2YJFA 3UKRB 2VYPA 4H0TB 1D4XA 4DCHA 1U2VB 3ZEUB 3GDQA 1QQOA 2YHXA 2PAVA 3A0IX 4XH4A 4FSVA 5BN8A 5LJVA 2F9TA 3H3OB 3UE5A 4MLHA 3O5BA 3FZMA 4BC5A 4CZGA 3VTHA 1K8KA 3BF3A 3R9PA 1T44A 5E84A 3MK6A 3TSQA 2CGLA 5AQVA 1RFQA 3TSPA 3FFKB 4H5VA 2E2PA 4XH5A 1ESVA 4KBOA 4K25A 3FR0A 3ZX3A 2D4WA 4PKHA 3VERA 2KHOA 4XH1A 3ZETA 4J8FA 1SAZA 3ZX0A 2E1YA 3H46O 5LJWA 3J8AA 3EKUA 4AM7A 5BRFA 5AZJA 2UYTA 1G99A 4H0PA 4CZIA 3FGUA 4BROA 1NGCA 4BR0A 1MWMA 3DJCA 3MN7A 1LOTB 1NGBA 4BG9A 2OANA 3ENHA 3CQXA 3O1WA 3TTFA 1NGJA 1C0FA 1TUUA 1MWKA 1HLUA 4IWVA 5EOYA 1HKCA 3EO3A 2NZTA 3RSEA 1HJOA 3VF6A 2A6AA 3I33A 4M7YA 4BR4A 2P9LA 3QDKA 2EWSA 2D0OA 1HX1A 4WYBA 3WXIA 3OHRA 4B1WB 1Z05A 5EX5A 3VGLA 1HUXA 4BRAA 4FWMA 5EXWA 4C23A 3L6QA 4BRGA 5JLFA 1YXQA 4H5WA 4O5FA 4BRLA 4QS8A 3IFRA 4B1XB 3CJ9A 3GOIA 2P9IA 5AFUA 3ID8A 4CZMA 3ULEB 4B1UB 5ADXA 3CJCA 3TPQA 4CZHA 3VEOA 3VGKA 3FE1A 4EIAA 3I8BA 2Q31A 4O8KA 2Q0RA 4QS9A 2P9KB 2P9UA 3TTDA 2GTDA 3VGMA 4CBWA 4MLEA 4RWTA 1LCUA 5KPTA 1QQMA 1T6DA 2P9PA 1ATRA 3H6EA 5F1XA 4H5NA 3AAPA 1NMDA 4IO8A 3MN9A 4BVOA 1K8KB 1QZ5A 3M1FA 3VESA 2FF3B 5BPMA 2H3GX 5AQPA 2QWMA 4BGAA 5ELZA 5EVZA 3GE1A 3LDLA 3A5NC 1BOTO 5AQUA 3EZWA 3QICA 1X9JA 1SQKA 5AQGA 3CERA 3DWLA 3AARA 5KPZA 3MCPA 4FWRA 2CH6A 4CZLA 1BO5O 2YJEA 3ZETB 3L0QA 4WQ5C 3VEVA 5EY4A 3SMSA 4JHDB 4BR9A 4FWSA 5AZJB 2E1ZA 4BC3A 3WXJA 5F0XA 3FZLA 1ZC6A 2YHYA 5AFUH 3CIPA 2GWKA 5AZIA 5ADXH 3KZBA 1X3NA 3L4IA 4RTFD 1WUAA 5BREA 2QM1A 1JCEA 3EN9A 5AQJA 2HF4A 2A40A 2IVPA 2A42A 5AQMA 2P9LB 2DPNA 1NWKA 2E2OA 1GLCG 3QFPA 1GLDG 4BC2A 3O1BA 4DB3A 4YDUC 4BRFA 5JLHA 4EAHD 1GLBG 3SLCA 3QFUA 1QQNA 3D7EO 1XQSC 3U9DA 2P9IB 3VPZA 4CI6A 1T6CA 3A5OC 3DXKA 4H5RA 1S3XA 3SK3A 3VEXA 2YI1A 2QWLA 4WQ4C 3D2FA 1RDWX 4B1YB 5LY3A 4FWLA 4M7XA 3BEXA 4RCHA 1QZ6A 5AQWA 4PKIA 4H03B 1S22A 4BQZA 2W41A 2WUSA 4Y0WA 2BUPA 2V7ZA 2VWBA 3D2EA 2QXLA 1Q18A 4MO5A 1DGKN 5AQXA 4BR5A 1HPMA 5BPLA 4DHYA 3H1VX 3UKUB 4QS7A 1NBWA 4LC9B 5BRDA 3H3NO 3A5MC 4GY2B 2A3ZA 2CH5A 4B1ZA 5FPDA 3CETA 1Z6RA 3HI0A 3WXKA 2P9NA 2A5XA 4H0VB 4FWKA 3DXMB 1BWFO 3WQTA 2QWPA 3LDPA 3WT0A 2QWQA 4K42A 2E88A 2AA4A 2QWNA 4FPAA 5TKYA 3U8XA 4I6MB 1KXPA 3HBTA 3WEEB 1GLLO 3AAQA 3LDNA 2Q1NA 3VETA 1Y64A 4EFHA 4WQ5A 1R59O 5AZIB 3UKRA 1ATNA 1GLEG 3M3ZA 5BPNA 2V7YA 4BG8A 4BRQA 3CQYA 3WQUA 3QMLA 3G25A 2HMPA 3FLCO 3VOVA 4FOIA 1JCFA 3CJBA 3C0BA 2V52B 1HKBA 3HZ6A 4JD2A 3CJAA 2D0PA 2ASMA 1NGIA 5AQNA 5F2RA 3LDOA 4E1JA 3QBWA 1NLVA 3EKSA 4ISFA 3UB5A 2E2NA 3VF2A 2GEMA 4FL9A 4BGBA 1BA0A 3MN6A 5AQOA 3F9MA 1NGFA 4A62A 3SJHA 4AM6A 1GLJO 2P9SA 3LM9A 4BRDA 2Q36A 2HF3A 2FSKA 3H1QA 4BRPA 3O80A 4CZKA 2FXUA 4EHTA 1E4FT 3D2FB 4BVPA 1TYQA 5AQZA 3VEYA 4A2BA 4MO4A 3KVGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DOLA 2HSTA 1RDCA 5GINA 3GL1A 1QSYA 4FJ5A 2YV0X 1RBTA 4FWPA 3EL2A 3SQ0A 3U9ZA 3O08A 4BRNA 2YNIA 2W42A 1ZBFA 5FROA 3V9SA 2AP1A 4IJAA 1NJWA 5FPMA 4RW6A 3LQUA 3RSEB 4JNEA 3O9SA 3P4IA 4KKOA 3C7NA 4CFDA 4CZJA 3U6FA 1EQYA 3DRRA 3S41A 4J2EA 5KQDA 4BQLA 4DF8A 3J7AP 3M6GA 4DV0K 3K9JA 3AY9A 4FJ8A 2HMIA 5JICA 1ATSA 1X1PA 1NK5A 1IG9A 1BI4A 3K5MA 3O8MA 4BE2A 3RMAA 4B8CA 1KTQA 1GLFO 3WUHA 3VQEA 4FFJA 1L5UA 2VWJA 3DLLL 1SZ2A 3TAMA 1FKPA 3VQ6A 3L2RA 3BF1A 3Q7BA 2NUBA 4CIGA 4GVEA 2VQFK 4EHUA 4J2BA 4DSFA 1NK4A 1CXQA 3KHYA 4JI0K 2P9SB 1WLJA 1XC9A 4FW1A 4ZTFA 5HRRA 3T69A 4CGGA 2IIRA 1W7AA 4E1BA 1TYQB 1LV5A 4O5BA 3HM8A 1IV0A 1ZBLA 1YJ9N 2W6KA 2X74A 3KLEA 3PY8A 4JS5A 3AVFA 2QW9A 3VN5A 1KSPA 3HM9A 1KVAA 5TKWA 3AVIA 3SLCA 3FZFA 5LMNK 3MX2A 4OVLA 3MMVA 3MXJA 4H0XB 4K43A 4FJIA 1TKZA 3TARA 3AVGA 3QEPA 2HHTA 4P8JA 2EX3A 5JS2A 5I9EB 4BR7A 2GWJA 4NO7A 1YHQN 1VRUA 1Z26A 4B9TA 1S6QA 3IMXA 1DKGD 3O4QA 3NVKA 2NLXA 1U6ZA 4IOAL 3KK7A 1YI2N 3EE8A 2ITGA 3RMDA 3WNFA 1J5OA 4ISEA 4FW2A 1F21A 2ZGYA 4CJWA 4BRMA 1JCUA 3SQ1A 1O1WA 3KJVA 2FF6A 4CW7B 1UWBA 2ZF5O 1T05A 5BR8K 4FK4A 3TTCA 4PKGA 4OJRA 3K57A 5BR9A 4CK3A 4CEDA 2E8AA 4HUFA 2J4RA 4CJ4A 3SPYA 3DLEA 5DMRA 3CHWA 1QE1A 4P8EA 3R8EA 3SUPA 4HWIA 3HVRA 1RBRA 4LF5K 3HVTA 1WSJA 4BC4A 3V9XA 4ISGA 2RHKA 1IG8A 3O6WA 4Y1DA 4CEQA 5AJ3K 2JLEA 4CJKA 3OYIA 2YJFA 3UKRB 1DT9A 3K5OA 3PIOL 2VYPA 3KWIA 1D4XA 3N4PA 1U2VB 2PYLA 2YHXA 2PAVA 4KH5A 2OA8A 4FLWA 5LJVA 1JLEA 3FZMA 4FCYA 3I55N 3OW2M 4RW9A 4N5SA 3OTOK 4DR4K 3TSQA 1IKVA 2CGLA 5AQVA 2Z1JA 4DSKA 4YOVA 5J2PA 2IDOA 3FR0A 4PKHA 3AO4A 2KHOA 4J8FA 1SAZA 4B3RK 2E1YA 1VQ7N 5LJWA 3J8AA 4J2DA 3K9KA 3L2WA 2PYJA 1C1CA 2KW4A 4LD0A 3WNEA 1N8RO 2YHBA 4WFBL 1J5EK 3THYB 1HMVA 2AJQA 4JK7A 4BG9A 3JAMO 1FK9A 3AV9A 1K7JA 3DRSA 3TTFA 3O1WA 5GADP 4IFVA 3AVCA 1TUUA 1HLUA 3CYMA 1HKCA 5C10A 4N76A 1HJOA 2P9LA 2X6NA 1YTAA 2D0OA 4CJEA 2UUBK 1JL1A 3OHRA 2OTJN 5EX5A 1WSFA 3VGLA 4C23A 3RR7A 3VQDA 3L6QA 4BRGA 1XNQK 4OPHA 4O5FA 3OYKA 1ZBUA 2MX1A 5C0YA 3VQBA 2OTLN 3NF6A 3GOIA 1WSGA 4CZMA 5ADXA 1TK0A 3TPQA 1K4IA 3LS6A 3SZ2A 1JXEA 4ELVA 3VGKA 2HB5A 1YIJN 3Q7CA 2Q0RA 1LAVA 2QKKA 3VGMA 4DKWA 4MLEA 1LCUA 1HRUA 5KPTA 1QQMA 1ATRA 3H6EA 4H5NA 4CGHA 3OYLA 3NE6A 3OYMA 1RTDA 2UU9K 1EETA 5AQPA 1VSEA 1NKBA 5EVZA 3GE1A 4X65K 1BOTO 5AQUA 1VQ6N 1WBBA 3CERA 2CH6A 3TI0A 2YJEA 3ZETB 1BCOA 4CJSA 4DWIA 4FWSA 5AZJB 2E1ZA 3WXJA 3OYJA 1ZC6A 2YHYA 1RT4A 3CIPA 5AZIA 1NOZA 5ADXH 3HT3A 3KZBA 3NGIA 3BGRA 3L4IA 4IDHA 2QI2A 2ZJRL 2ZE2A 1JCEA 2HF4A 4JI8K 3NCIA 4HCBA 3PSFA 4PA1A 4QOZB 3D45A 2ZJQL 4FVMA 2E2OA 3PLAA 3PO5A 3QFPA 1BQNA 2JWKA 3C6TA 1B9FA 4DB3A 3QEIA 1N36K 3D6RA 4FLUA 2BGGA 3SUOA 1N33K 3MEDA 1SKSA 3VPZA 2IGIA 3PX6A 2FBVA 1D9DA 1S72N 4W5QA 3QINA 4KTWA 3HOTA 2W6LA 4JKBA 2RISA 5FRMA 3D2FA 1RDWX 1HQEA 5JS1A 5AQWA 1QZ6A 1OH5A 2JGUA 2KFZA 4PKIA 1VQ8N 1SS6A 1VSMA 1S22A 4BQZA 3VA3A 4BWJA 1Q82O 1Q9YA 2V7ZA 3AVNA 4HUEA 4MO5A 1DGKN 3J81O 4DMNA 4DHYA 4UQGA 1NBWA 3I0RA 4JRPA 4LC9B 3LAMA 3H3NO 3A5MC 3EZ5A 3HI0A 1L3VA 3WXKA 4BDPA 1L3SA 3V9ZA 4JI3K 4Z4FA 2X78A 4IOXA 4NYNA 1BWFO 4KTQA 4DS5A 3KD5E 3LDPA 4H8KA 3WT0A 2QWNA 5GIPA 3F2KA 4NYFA 2XHBA 3ZT1A 2Q1NA 3VETA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3VQ9 A;  4CJP A;  1BIZ A;  1VQL N;  4NCA A;  2P5O A;  4JD2 A;  3CJA A;  2ASM A;  3NAE A;  1NGI A;  1HYV A;  2XY5 A;  4IEE A;  1Q86 O;  3EKS A;  4ISF A;  3TAB A;  1SNN A;  4FJG A;  2E2N A;  4DFJ A;  1ITG A;  2GEM A;  4FL9 A;  4BGB A;  4JI5 K;  2HBK A;  4DTO A;  4P77 A;  3QEV A;  4YOY A;  3RMB A;  3ZYY X;  3MN6 A;  3T19 A;  4A62 A;  1VSI A;  4AM6 A;  4BRD A;  4LF7 K;  4KHN A;  2QA4 N;  2HF3 A;  2FSK A;  3H1Q A;  4BRP A;  3LP2 A;  4E7J A;  2HHS A;  1W9H A;  4LF4 K;  3LWL A;  4MO4 A;  3KVG A;  4CBX A;  2RIU A;  4PWD A;  2RE2 A;  1TKU A;  2ATQ A;  2CGJ A;  4FM0 A;  1SKR A;  4KHS A;  4B08 A;  4NLB A;  3LP3 A;  3ASM A;  4FWN A;  1H1V A;  1HQU A;  3TR8 A;  1NJX A;  2GEL A;  4FJX A;  1GLA G;  1NG9 A;  3GG4 A;  3C94 A;  3H45 C;  3VA0 A;  4MDB A;  5GAH P;  4CK2 A;  5C15 A;  4RW7 A;  4IXC A;  1YTU A;  1B9D A;  1X9M A;  3KWG A;  2QWR A;  3LL3 A;  2ZJP L;  2P9K A;  4A57 A;  5CYQ A;  4O0I A;  4CJV A;  3CCJ N;  2FC0 A;  4ZHR A;  2UXC K;  2P9U B;  2GV9 A;  1QVF M;  1NJZ A;  1Z25 A;  2P9P B;  4EZ6 A;  3AVA A; 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 4BR4 A;  4DTP A;  4WYB A;  1TGO A;  4CJF A;  5EXW A;  2HHQ A;  1IKY A;  1BIU A;  3E66 A;  3OS2 A;  1NJI O;  1KK9 A;  1DTT A;  4B3T K;  3G4S N;  3CJ9 A;  2P9I A;  5HP1 A;  3ID8 A;  4B1U B;  4JS4 A;  3CCV N;  3CJC A;  4IO9 L;  4JI6 K;  3IS9 A;  3VEO A;  3T7Z A;  4M3W A;  1SUQ A;  1P90 A;  4EIA A;  3I8B A;  3VQ5 A;  4KHU A;  4QS9 A;  2P9K B;  1TKX A;  3OYA A;  1Q9X A;  2XY7 A;  1WBD A;  5F1X A;  3CXC M;  3AAP A;  1NMD A;  3VQA A;  2XRI A;  2VG7 A;  4CHZ A;  1QZ5 A;  2FF3 B;  1YVU A;  4DR5 K;  4FZY A;  5ELZ A;  3OYB A;  4DFP A;  1HNV A;  3LDL A;  4KRF A;  3OA9 A;  3EZW A;  3SQ2 A;  4I2Q A;  3PX0 A;  1JLG A;  3L0Q A;  4WQ5 C;  3VEV A;  3SMS A;  4AF1 A;  3U3G A;  3OYN A;  4CJL A;  3M5R A;  1JL2 A;  5GAE P;  4FVU A;  5J2N A;  3KK2 A;  1X3N A;  1WUA A;  3R1X A;  3D0P A;  1U4B A;  4M41 A;  1VRT A;  4FK2 A;  4B3O A;  3ZT4 A;  3LPU A;  5HOO A;  2P9L B;  3N4Q A;  1C1A A;  3DM2 A;  1GLD G;  4BC2 A;  4N56 A;  4DR3 K;  2G8V A;  4BRF A;  4JKE A;  4EAH D;  2KLA A;  2WOM A;  1GLB G;  3QFU A;  4B9S A;  1T03 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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