3VEVA

Glucokinase in complex with an activator and glucose
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
455
structure length
450
Chain Sequence
b'ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 180
structure length 450
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vevA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vevA01
1HKBA 3U9DA 2QWLA 4CD3A 2P9UA 3LDNA 4DCHA 1LOTB 5BRFA 1E4FT 3QB0A 1NLVA 3VEWA 1Z6RA 1TYQA 3GDQA 4BRFA 5FPMA 4H03B 2Q1NA 3CIPA 3A5NC 3H1VX 4QS9A 2A40A 2VCPA 3ZX0A 1BWFO 3UKRA 3A5OC 5AQOA 2ZGYA 3BF3A 5EXWA 2ZF5O 2P9UB 3HI0A 2W40A 4YDUC 5AQUA 1BU6O 1JCFA 5AFUA 4BRCA 3SK3A 3QFPA 1TYQB 1JCGA 3WXKA 1NMDA 4A2BA 4FO0A 3DXMA 2YHXA 2P9LA 2WUSA 3P4IA 2E20A 5KQ8A 1ATSA 1EQYA 1QQNA 1HKCA 1MWKA 4BRIA 4CBUA 3GG4A 1U2VA 3ATUA 5AQNA 4FWPA 4FL9A 3UE5A 2QM1A 4BGBA 2E1YA 2D0PA 4A62A 4BC2A 3DXMB 3ENHA 2P9SA 3MK6A 3G25A 3GBTA 3M3ZA 1HLUA 3HM8A 1U2VB 3BP8A 4CZKA 5AQWA 3VF4A 2I7NA 4IJNA 3GOIA 5E84A 5ELZA 1NGEA 1C0FA 4H0VB 3CI5A 4O5FA 3F9MA 3U8XA 1QZ5A 1BUPA 4BC5A 1KAZA 4CZGA 5KQDA 2ZWHA 4QS8A 3ATVA 3BEXA 4IWVA 2P9SB 1BA0A 1Z05A 1U6ZA 4CZHA 4BG8A 3MCPA 3DAWA 3H6EA 2QWOA 2Q36A 5AR0A 3CJ9A 4HWIA 2GTDA 4J8FA 4AM6A 2E2QA 2NLXA 3WXLA 2AA4A 3GE1A 1DGKN 4BR2A 2E2OA 5AZIA 1X9JA 1G99A 3WXJA 5EX5A 3L4IA 1MA9B 1GLBG 2Q0UA 5AQXA 3CJAA 4AM7A 1SQKA 3CJ7A 4I6MB 3M6GA 3WT0A 1NGBA 3J8AA 1E4GT 1ZBSA 1C0GA 2I7PA 2GWJA 4BRNA 1KAYA 3EO3A 3H3OB 4ISGA 3LL3A 4H0YB 5AZIB 1QQMA 4FPAA 2GWKA 3ZX2A 3A5LC 3QMLA 3MDQA 4GNIA 4XEIA 3RSEA 5BPNA 2VYPA 4HTLA 4CZEA 1BA1A 4B9QA 2FSNA 3A0IX 3O80A 3FFKB 4PKHA 3VERA 5EOYA 4BQLA 4JD2A 4XH1A 2E8AA 4FPBA 4EHUA 2OANA 4H0PA 4BRLA 4XH5A 4H5WA 4DQ8A 5BN8A 5LJWA 3W0LA 1CZAN 3VOVA 3R9PA 3R8EA 1T6CA 3B8AX 4BRPA 4FWLA 3CQXA 1IG8A 2D4WA 1XUPO 4BVPA 1TUYA 2YJFA 1J6ZA 1ATRA 5AZJA 4BVOA 3FLCO 4YDUA 4EFHA 2V52B 3ENOA 1KXPA 2CGLA 2FSJA 1NGFA 1BDGA 1NM1A 4CD1A 4JD2B 4BC4A 1NWKA 2FSKA 4XH4A 1S3XA 5BPLA 3LM9A 1NGCA 4BRMA 1X3MA 2ASMA 1K8KA 3C7NA 5AQGA 4DHYA 2A6AA 4CZMA 4L3QA 2Q2RA 2HOEA 1SZ2A 5AQIA 4H5NA 2CGKA 3UKRB 5AZJB 4PKGA 4DB3A 4B1VA 3VF2A 3EKSA 4BR7A 1ATNA 2CH6A 3WEEA 5F1XA 4CJ7A 4BG9A 1YAGA 5CE3A 4CI6A 4K25A 3MN5A 3CQYA 1HKGA 1S22A 2P9LB 4JAXA 2GEMA 1K8KB 2VWBA 3C7NB 4BRQA 4RTFD 2NRHA 3IDHA 5KPZA 4RWTA 3D2FA 3VF6A 3UKUA 4B1WB 5TKYA 3QBXA 3H45C 2ZGZA 4E1JA 4MO4A 3GL1A 4BC3A 3VGLA 1GLEG 1HUXA 4EHTA 4WQ5A 3I8BA 2HMPA 2BTFA 3WEEB 3CJCA 4H5RA 4WQ5C 3LDPA 1YUWA 2YJEA 3MN7A 3HSCA 2NZTA 3EKUA 5AQQA 4A2AA 2PBDA 4WYBA 4LC9B 2QWQA 1YXQA 3D2FB 1GLLO 2J4RA 3UKUB 3A8YA 3QFUA 4JN4A 1Y64A 2E1ZA 4GY2B 5EVZA 5AQVA 4BR0A 1GLJO 4BRKA 4JHDA 3CHWA 5AQMA 4BRGA 2KHOA 3O8MA 4IJAA 4Z94A 3CERA 4B1YB 3AAQA 1WUAA 1IJJA 2P9NA 4FWNA 5BREA 2Q0RA 4CZJA 1HX1A 1R59O 2GUPA 3FZHA 5AQRA 1V4TA 3BF1A 1D4XA 2P9KA 3CJBA 3KVGA 3WXIA 1QHAA 4QS7A 1ESVA 2A5XA 5AQTA 1P8ZA 2CGJA 3ZX3A 4BREA 4CZIA 2IIRA 3C0BA 5JMVA 4JHDB 2AP1A 4FWKA 2V7YA 5FPEA 3ZETA 4IO8A 4BRHA 2D1KA 2GELA 2YI1A 2Q31A 3IFRA 3QDKA 2FLOA 3MN6A 3TPQA 3WQUA 2UYTA 1XC3A 5E26A 3SLCA 2P9KB 2QWRA 4NB4A 1NBWA 4MO5A 3O1WA 3AARA 4C23A 3H46O 3A5MC 1DKGD 4ISFA 4ISEA 3M1FA 3VEYA 4M63C 3FGUA 4KBOA 3DXKA 3ZETB 3JS6A 3LDQA 4FOEA 3EN9A 3DWLA 5AQJA 3FZMA 4H0XB 4WQ4A 3AY9A 1RDWX 2YHWA 2P9PA 4A61A 4WQ4C 4M7YA 1V4SA 3RSEB 3SJHA 1NGJA 2HF4A 3HTVA 3D7EO 1ZXOA 3SMSA 1GLDG 4JNEA 3VEXA 4CBWA 5ADXH 5JLFA 2A3ZA 3UB5A 1H1VA 3DXKB 1GLCG 4PL7A 3I33A 2F9WA 2E2PA 5AFUH 3BUZB 2HF3A 1T6DA 2FF3B 3FZLA 5BRHA 3D2EA 4H5VA 3SMPA 3WUHA 2P9PB 5I9EB 5ADXA 4FOIA 2QWPA 4BR9A 3HBTA 2YCHA 4FWMA 3QBWA 2P9IA 2H3GX 4IZ9A 5BR9A 2W41A 3QICA 1TUUA 5AQZA 3O6WA 2ASOA 2E88A 3DJCA 4BGAA 5F0XA 1SAZA 3O08A 1QQOA 4CZLA 4FSVA 4BR5A 4NO7A 3FZFA 5FPNA 2IVPA 3D2EB 3VGMA 5JICA 4H0TB 4K41A 1RGIA 1YVNA 3H1QA 5F2RA 3FZKA 5JLHA 5AQYA 2P9IB 1ZC6A 4BQZA 1DEJA 3WQTA 3EL2A 2A41A 2CH5A 4BR4A 3LDLA 5KPRA 2QWMA 3FE1A 2E2NA 3TU5A 2F9TA 4O8KA 1NGGA 3OHRA 5AQKA 4MLEA 5BN9A 1NGHA 2FF6A 4RCHA 2Q97A 1BO5O 1NGIA 3KZBA 4CZFA 1GLFO 3VESA 3HZ6A 3O1BA 2D0OA 1RFQA 5AQHA 3O4WA 3MN9A 4H0OA 4EIAA 3VETA 2V51B 4FWQA 3LM2A 1JCEA 3VGKA 1WOQA 3L6QA 1NGDA 1HJOA 5AQLA 5AQPA 3ZEUA 3U9ZA 2A42A 4Y0WA 3U4LA 3VEOA 4FWRA 2PAVA 4I6MA 3EZWA 4H5TA 3AAPA 1QZ6A 3IUCA 4B1XB 4PKIA 3O5BA 3FR0A 1MWMA 4MLHA 3L0QA 1XQSC 3LDOA 2IVNA 2ITMA 1X3NA 2YHYA 5EY4A 3JXUA 5BRDA 2IVOA 3ULEA 3VENA 2QXLA 2P9NB 2DPNA 3R6MA 2BUPA 1BOTO 1T44A 3IMXA 4IXCA 1MDUB 3ZEUB 4EAHD 4F9OA 4BRAA 4B1UB 5FPDA 1HPMA 2FXUA 2QW9A 5BPMA 4FWOA 3S41A 4FWSA 3ID8A 1Q18A 4B1ZA 1BG3A 3VEZA 2QWNA 3KHYA 5KPTA 5LY3A 3CETA 4BROA 4K42A 1LCUA 4M7XA 3H3NO 3MMVA 4K43A 2EWSA 1OKJA 3CJ1A 1NGAA 3VPZA 5LJVA 2V7ZA 3ULEB 3VEVA 4BRDA 2ASPA 5AQSA 1GLAG 4PL8A 5AQFA 5B8HA 4CBXA 1KAXA 3W3DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QWLA 4CFBA 5SZTA 3ZT2A 2O8DB 4DV3K 5CZ1A 5BRFA 3NH2A 3QB0A 3DRRA 1NLVA 3NH1A 1Z6RA 2KZMA 4MFBA 4NXNK 4E89A 1IKYA 4KAZA 3V9XA 4GV9A 4OKKA 1ZYQA 1NNEA 4FJKA 4YOXA 3UKRA 1RNHA 1QE1A 1RTJA 1ZBHA 3SAGA 4O44A 3QEIA 5EXWA 4C8MA 3KD1E 1TKTA 3SK3A 1JL1A 3QFPA 4IBNA 3VQAA 4CGIA 3V4IA 4A2BA 1JLFA 3SI6A 3SNNA 1KSPA 2P9LA 3O9RA 1BCMA 1TKZA 3TABA 3VQPA 2E20A 3LP0A 3TSUA 5KQ8A 3NVKA 1HKCA 5GAHP 1FXXA 1IBMK 4CBUA 4BWMA 3B6OA 4CEQA 5HP1A 5AQNA 3TWHA 4FL9A 1ZBFA 3UE5A 3AGKA 2QM1A 2XRIA 4ILGB 1X9WA 1X9MA 4CEZA 3E1YA 2E1YA 2KLAA 3MCAB 2YNIA 2YHBA 1KVBA 2BANA 4JK9A 4JKHA 2P9SA 2HVHA 1JJ2M 2X74A 3G25A 3VQ4A 4UY8O 2ITGA 2EX3A 3BZCA 3HM8A 3E9PA 4CF0A 3L2RA 3VF4A 4IJNA 4E7LA 1EXQA 3GOIA 2OTLN 2PFUA 1NK8A 4E7JA 1BUPA 4M45A 3OYDA 3TTFA 1KAZA 3OYFA 1G15A 3BEXA 4IWVA 1BA0A 2VG6A 4CZHA 3SUNA 2WONA 3OYBA 3MAQA 2Q36A 3ZSRA 3ITHA 4NLCA 4HWIA 4O5BA 2D5RA 1NK0A 3KKSA 4W5OA 4JI8K 4CK3A 3CG7A 1X9JA 3S3OA 3L4IA 1MA9B 2A1RA 1VK0A 3IAYA 2HHVA 1WLJA 3LP1A 1JXBA 3M6GA 3KLGA 4KREA 4NLBA 3T1AA 3TANA 3CM6A 1EX4A 4ISGA 5AZIB 3NGZA 1LAVA 3DLGA 4KH5A 1TKDA 4GKJK 2O8CA 3QEPA 3G10A 3MDQA 4BDZA 4GNIA 4H4MA 3RSEA 5BPNA 4HTLA 2RPIA 2KFZA 3LWLA 5KRTA 4B9QA 4ELVA 2FSNA 2O8FB 3FFKB 4IG3A 4BQLA 2OANA 4H0PA 5BN8A 3S3MA 2QKKA 3R9PA 3SZ2A 1T6CA 3SPYA 4FWLA 1VSIA 3ZSWA 5I42A 4HUEA 4I9LA 1R0AA 5LL6Z 4YDUA 2F8TA 5K14A 4CEBA 3AVIA 1VQNN 2G8UA 1BDGA 5MLCQ 1T7PA 1YF5L 2FSKA 2VGMA 5C10A 2ASMA 3C7NA 4DHYA 5AQGA 5AQIA 4JI4K 2X6SA 4YY3K 4M3UA 1SL0A 1EETA 3AVBA 2HHXA 4B1VA 4A5BA 3WEEA 4YHHK 1O1WA 5F1XA 4JLHA 4CJ7A 2PY5A 1EWQA 3RMDA 1HNVA 4FJMA 4K25A 3MN5A 4CHQA 3SCXA 4E7KA 4JAXA 1K8KB 2VWBA 4BRQA 4Y1CA 4RWTA 3N4QA 3VF6A 3KLHA 3CCJN 4NXMK 5TKYA 1VQ4N 2D0BA 3DLEA 4E1JA 2HBKA 4E7HA 4BC3A 3KIOA 2ZM6K 4B3RK 3ZT0A 5C24A 4WQ5C 3O4NA 4WFNL 4FJNA 3I0SA 4HCBA 4OLBA 1YXQA 1X1PA 3UKUB 2UUAK 3CD6N 1HMVA 3THYA 2E1ZA 3OYMA 4BR0A 4CJQA 4BRKA 4JHDA 3LDSA 1NKBA 4BRGA 2KHOA 3MECA 3TSPA 4B1YB 3I8DA 1CZBA 1K73O 3P38A 2G8WA 4DF8A 3FZHA 4B9LA 4Z4CA 5AQRA 3CJBA 3KVGA 4OGCA 2GBZA 5FROA 1QHAA 1ESVA 4DR7K 1P8ZA 5JMVA 3SQ2A 4CZIA 4KHNA 4IO8A 4KKOA 4FJ7A 3KJVA 3WNFA 1RILA 2FLOA 4O0JA 3CCMN 5GADP 5GIOA 3WQUA 3OS0A 1RDCA 1XC3A 5KRSA 3DLHA 2P9KB 1NBWA 4MO5A 4MQ3A 3A5MC 4J2DA 1DKGD 3FGUA 1RTIA 3SAFA 1ASUA 2RKIA 3HPGA 3QEVA 3EN9A 4L8RB 3FZMA 4H0XB 4WQ4A 3AVMA 2ATQA 3AY9A 4CHOA 3OYEA 3QETA 3Q7BA 3LALA 4Y1DA 2YHWA 4M7YA 1V4SA 3SJHA 1IG9A 4FW2A 4G1QA 1JLCA 1XMOK 1BHLA 1VQKN 2HF4A 3HTVA 4U7BA 1TK8A 3C6AA 1ASWA 2G8IA 5JLFA 1J5EK 3DXKB 3M8SA 4DLEA 2F9WA 2E2PA 5AFUH 1RT1A 3FZLA 5BRHA 4KO0A 3D2EA 1S6QA 3WUHA 1HR0K 1FK9A 4CIFA 1DLOA 2QWPA 1RBUA 5DM7L 5KGXA 4IZ9A 5AQZA 3NBPA 3O6WA 2E88A 3LAKA 3O08A 2DTUA 3NHGA 5FPNA 3PY8A 3NF9A 1U45A 4CJ4A 3NFAA 1RGIA 4CF1A 1BI4A 4CIEA 3SJJA 1VSKA 1CXQA 1S1TA 3L2VA 5JLHA 3CFPA 4OPHA 4OPAA 1ZC6A 3OYGA 1DEJA 3HP6A 2CH5A 1XNRK 3H08A 4YFUA 3TU5A 1TK5A 4O8KA 3OHRA 5AQKA 3NF7A 2QTDA 3KK7A 1RBTA 5D3GA 2G8FA 1BO5O 1NGIA 2D0OA 1X9SA 4DV7K 4AQYK 3K57A 1RFQA 4DF4A 1WNSA 4EIAA 3VETA 3NDKA 2B6AA 4PA1A 3VGKA 3CCSN 3SQ1A 5AQLA 2I5JA 3F2KA 1UA1A 4E0DA 4M41A 4DG1A 3U9ZA 2A42A 3VEOA 3OS1A 4FWRA 2PAVA 1VSEA 3IUCA 1S1VA 4CGHA 3RR8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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