3VEVA

Glucokinase in complex with an activator and glucose
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
455
structure length
450
Chain Sequence
b'ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 180
structure length 450
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vevA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vevA01
4ISFA 3LDQA 2HOEA 3L4IA 3ULEB 2FSKA 1ZBSA 1RFQA 1NGBA 5FPEA 5AQXA 3WQUA 1IG8A 4H5TA 3SLCA 4XH1A 3HBTA 4RTFD 3TU5A 1BG3A 3DXMA 4KBOA 2BTFA 2QWMA 4H5WA 2I7NA 3A5LC 5BPNA 1Q18A 1E4FT 2W41A 2QWRA 1HJOA 2P9IA 3FZMA 3A8YA 4BGAA 1SZ2A 1Z6RA 3EO3A 4B1WB 4BRIA 2P9UA 1NWKA 2D0PA 2FF3B 2BUPA 1H1VA 2ASMA 4K41A 1E4GT 2FSNA 4HTLA 3VERA 4BRKA 4RWTA 1RDWX 4B1ZA 3QBWA 4H5VA 3JS6A 1CZAN 2Q0RA 4CZHA 4H0VB 4PKHA 2AP1A 2ZGYA 4BR0A 3ID8A 1P8ZA 3FZLA 2GELA 4M7YA 3LDLA 2NRHA 2FLOA 3D2FB 4K25A 3ENOA 3MN9A 3C7NA 1BDGA 2P9IB 3AY9A 4CZEA 5BRHA 1QQOA 1K8KB 3QDKA 3WT0A 1ATNA 5AQLA 2P9KA 3CJAA 5AQIA 4CD3A 2Q2RA 3IMXA 5AQHA 1KAZA 4YDUA 1BA1A 2A5XA 1BA0A 4B1YB 2Q97A 4WYBA 2V7YA 1QZ5A 3CJ9A 3LDNA 2A6AA 1WUAA 4I6MB 1TUYA 4BRMA 3M3ZA 2IVNA 2P9NA 5FPMA 4QS9A 1BWFO 5AQGA 3KZBA 1JCFA 5BRFA 3VEZA 2DPNA 2GWJA 1GLCG 1MWMA 1NGDA 3CQXA 3FZFA 4DQ8A 3H45C 1EQYA 3QMLA 4CZFA 1YAGA 1KAXA 2E88A 3RSEA 4YDUC 4IJNA 5AQJA 2QWLA 4FWSA 4A62A 4BR7A 4H0XB 3MN6A 3GG4A 1GLFO 5AZJB 4FSVA 2E8AA 1BUPA 2QWOA 1LOTB 3S41A 1NGIA 3ATUA 4WQ4A 1XQSC 3A0IX 5I9EB 1T44A 3GL1A 1HLUA 2QWQA 3VPZA 1XUPO 5AZIA 3AARA 3M6GA 4O8KA 4NB4A 4H0TB 2F9TA 2ZF5O 1ESVA 4FWMA 4BRLA 2YHWA 3D2EB 4BRHA 4O5FA 1QQNA 3TPQA 4BR2A 5KPRA 5ADXH 1IJJA 5E26A 5KQDA 3F9MA 5AQFA 2CGJA 4CZKA 5JICA 2ZWHA 4WQ4C 1TYQB 1X3MA 3CERA 3QB0A 1NGEA 4DHYA 4MLHA 2E2NA 3CI5A 2A40A 4BVPA 1HKCA 2GUPA 4ISEA 3VGMA 4BRQA 5AQTA 3VF4A 4BG8A 4CI6A 3U9DA 5EX5A 3FR0A 3MDQA 1QQMA 1S3XA 3P4IA 4BRGA 5JMVA 4FL9A 2AA4A 3FGUA 2Q0UA 5ELZA 1BO5O 1NGHA 3HM8A 4Y0WA 4E1JA 1C0GA 1QZ6A 3SJHA 2E2PA 2KHOA 1GLEG 5KPTA 3B8AX 1NGJA 3HI0A 3W0LA 4AM7A 3CJ7A 4IWVA 3D2FA 4WQ5A 2YHYA 5FPDA 5LY3A 2VCPA 5BN8A 4PL8A 3ATVA 3DWLA 3ZETA 1K8KA 3AAPA 2V7ZA 3FZKA 3R6MA 4JD2B 1T6CA 3WXIA 4CZIA 1NGAA 3CJBA 4BQLA 4CZGA 5JLHA 2GEMA 1HPMA 1V4TA 3KVGA 2ITMA 4BGBA 4FWKA 1TUUA 1KXPA 5BPLA 4B9QA 3U9ZA 4I6MA 5EOYA 4GNIA 3VENA 1JCEA 3IUCA 4WQ5C 1D4XA 3D7EO 3HTVA 4H5NA 2CH6A 3QICA 1GLAG 5EY4A 5CE3A 3ZETB 1MWKA 4FWLA 3O4WA 1NLVA 2W40A 2E1ZA 2P9PB 2PAVA 2VYPA 4FOIA 1S22A 3FLCO 4CZLA 4EFHA 3O08A 3AAQA 3SMSA 5AQZA 3UB5A 4AM6A 4BC2A 1DGKN 3MN5A 5AQMA 3O1BA 5AZJA 4BQZA 2FSJA 5AFUH 2YHXA 2HF4A 4PKIA 4CD1A 3BUZB 1U2VA 2ZGZA 1ZC6A 5BR9A 1V4SA 1OKJA 4BG9A 4A61A 4EAHD 4BR5A 3J8AA 3LL3A 4BVOA 1QHAA 3D2EA 1HKBA 4CBUA 3WEEB 3FE1A 4PKGA 3MN7A 4EHUA 5LJWA 3IFRA 2YJEA 5EXWA 4F9OA 1NGCA 3UKUA 3QBXA 4K43A 2QWNA 2A42A 1TYQA 5AQOA 4BRDA 1T6DA 2HF3A 4BC3A 4FO0A 3BF3A 5AQPA 1U2VB 3UE5A 3VESA 3MCPA 3H3OB 2Q36A 3U8XA 4B1XB 1HX1A 3EKUA 5AQUA 2P9LA 3GBTA 3EL2A 2V51B 3VEVA 4EIAA 5ADXA 2YJFA 1SAZA 2PBDA 4XEIA 3SMPA 2D4WA 1YXQA 3O5BA 3UKUB 3W3DA 1HUXA 3O8MA 2V52B 4MO4A 3ZEUB 3L6QA 3ENHA 4JNEA 3IDHA 4FWPA 3M1FA 4FPAA 3O80A 3LM2A 5TKYA 4JD2A 3VGLA 2P9LB 3A5NC 3DXKA 4IO8A 4B1VA 4BRNA 4BR4A 3G25A 3H1QA 3UKRB 3L0QA 4H0OA 1RGIA 4Z94A 1Z05A 1NGFA 5AQVA 5AQRA 3U4LA 3R9PA 1MDUB 4FWRA 2FF6A 2IVOA 2H3GX 4J8FA 1YUWA 4NO7A 5AQYA 3WUHA 2F9WA 2GTDA 3ZX0A 2VWBA 5E84A 2D1KA 4H0YB 4L3QA 2P9PA 4M7XA 5KPZA 2J4RA 3DXKB 1ZXOA 2P9SB 4C23A 5EVZA 3LDPA 4CZMA 1NGGA 1R59O 3C0BA 4BC5A 4H03B 3DAWA 2NZTA 3H46O 4B1UB 4RCHA 2UYTA 4JAXA 3VF6A 4QS7A 2EWSA 3VEXA 5B8HA 1MA9B 4FPBA 3LDOA 3VOVA 3CQYA 3DJCA 3EZWA 2Q31A 3EKSA 5LJVA 4PL7A 1J6ZA 2YCHA 4FWOA 1JCGA 1SQKA 3I33A 2CGLA 1NMDA 3A5OC 3FZHA 1ATSA 5AQWA 4QS8A 3WEEA 2CGKA 3BF1A 4CZJA 2HMPA 5F2RA 3WQTA 3H6EA 5F0XA 2IIRA 4BROA 5AFUA 2NLXA 5AQSA 5JLFA 3DXMB 1X9JA 3H3NO 1NM1A 3VEYA 3ZX3A 3BEXA 2QXLA 4FWQA 4BR9A 1HKGA 3VEOA 3GDQA 4MO5A 1NBWA 3CHWA 3WXLA 3ZX2A 1BU6O 5KQ8A 2P9UB 4JHDA 5F1XA 3VGKA 3LM9A 1U6ZA 3QFUA 3SK3A 5AQQA 4A2AA 3QFPA 4XH4A 3A5MC 5BRDA 3KHYA 4JN4A 4IJAA 1C0FA 1G99A 2E1YA 4A2BA 2A3ZA 2E2OA 5AQKA 3GE1A 3OHRA 2YI1A 4DCHA 4BRCA 2CH5A 3MMVA 1KAYA 1DEJA 2QW9A 2ASPA 3ZEUA 4FWNA 3C7NB 3CJCA 2OANA 2QWPA 3R8EA 1LCUA 3I8BA 5FPNA 4HWIA 4H0PA 3GOIA 4CBXA 2P9KB 1XC3A 4JHDB 1WOQA 2FXUA 1GLBG 4MLEA 2D0OA 3UKRA 2I7PA 3H1VX 4LC9B 4XH5A 1X3NA 3VF2A 4CJ7A 2P9NB 4DB3A 4H5RA 3JXUA 4FOEA 4IZ9A 4EHTA 3VEWA 3VETA 3WXKA 3EN9A 4BRPA 3ULEA 4BRAA 2IVPA 4BREA 2Q1NA 4GY2B 3O1WA 2GWKA 3RSEB 5AR0A 3CIPA 1GLLO 3CETA 2WUSA 3WXJA 5BPMA 5BREA 3O6WA 5AQNA 2P9SA 3HSCA 4IXCA 1Y64A 5BN9A 4BC4A 1GLDG 4K42A 3CJ1A 1YVNA 2A41A 2E2QA 3BP8A 4CBWA 1DKGD 3MK6A 4ISGA 1ATRA 4M63C 2QM1A 3FFKB 1BOTO 4BRFA 3HZ6A 5AZIB 2ASOA 1GLJO 2E20A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3Q7CA 2Z1IA 4DQQA 3C6UA 2GBZA 2NRXA 1VK0A 1RFQA 3KWIA 4CFDA 2ETJA 3K5OA 3HBTA 4RTFD 3TU5A 4YOUA 4KBOA 2BTFA 3S9HA 3T3FA 1Q18A 4CEOA 3SAHA 1E4FT 2O8BA 3T1YK 3FZMA 4DS4A 1Z6RA 4B1WB 3EO3A 4BRIA 2RPIA 3V4IA 4LY7A 3PIOL 3SI6A 1NWKA 4CEAA 2UUCK 4FJIA 3A2FA 4EZ9A 1VQ7N 1IKXA 2FSNA 4BRKA 1RDWX 2QKBA 2EHGA 1CZAN 4CZHA 3CFPA 1P8ZA 1F21A 2NRHA 3CPEA 3ENOA 3MN9A 4Q0BA 3PY8A 1BDGA 1KCFA 2P9IB 4KH5A 2WONA 3QDKA 3WT0A 1ATNA 1HYVA 4CW7B 4DTSA 3NF6A 3THYB 4CD3A 2XO7A 3IMXA 5AQHA 4YDUA 1BA1A 1BA0A 3AVGA 2Q97A 2ATQA 1QZ5A 3ZT0A 1Q82O 1TUYA 3V1RA 3HVRA 2KZZA 3OS0A 2IVNA 2Q3SA 3KLEA 5FPMA 3PLAA 4QS9A 2PYJA 1C1BA 3L2RA 3LANA 3CQXA 4DQ8A 4FLUA 3OY9A 4DV0K 4B3OA 3HJFA 4FW2A 4MFBA 3RSEA 2NRWA 3K5LA 3BGRA 4IJNA 1RT7A 1NJWA 1GLFO 4KHWA 4OLAA 1QE1A 3DLHA 1RBUA 3LAKA 2QWOA 1Q86O 2GX9A 1C6VA 1UAXA 1K6YA 4O8KA 2GUIA 4H0TB 1CLQA 2JLEA 1HNIA 1W7AA 2VWKA 2ZE2A 1XHXA 3PX0A 1QQNA 3K2PA 5ADXH 2YNGA 4X65K 3F9MA 3IG1A 3AA5X 1RT4A 4KHUA 4NCBA 1TK5A 4WQ4C 2G8UA 1QVFM 4O0JA 3ZSZA 3QB0A 4DHYA 4AHVA 4B3RK 2E2NA 1C0MA 4F3OA 3ZYYX 3V6DA 1U49A 3L4QA 2IOCA 3OS1A 4BG8A 3SPYA 3FR0A 1S3XA 1SL2A 4CGJA 3HM9A 3P4IA 4DR3K 4BRGA 2DFHA 2AA4A 3N4PA 1RTIA 2VG6A 1NGHA 4DR2K 4RW8A 4E1JA 1SKSA 1QZ6A 2E2PA 1GLEG 5KPTA 2HHQA 4FJ7A 1KTQA 2QTDA 3DMJA 4NYFA 1YTAA 3OYEA 1QQCA 4IWVA 2YHYA 2EX3A 4CFBA 5LY3A 2HHXA 2VCPA 1CXQA 4PL8A 5LMUK 3Q7BA 4JKAA 5CR4A 3R6MA 1T6CA 4CZIA 1NGAA 3CJBA 4CZGA 3THYA 2HBJA 2OCEA 1V4TA 1TUUA 3QESA 4CJVA 3RMCA 2D5RA 4K8XA 4FCYA 3THXB 3KWGA 4HCBA 4GNIA 5HL7L 3NGZA 1TKDA 1EO1A 4CIEA 3HTVA 4I2QA 3AO2A 5JS1A 3OYGA 5EY4A 3ZT2A 5CE3A 3MEDA 4FWLA 4IFVA 2W40A 4M3RA 4C8MA 5CZ1A 4FOIA 4QOZB 4EFHA 3AAQA 4DTPA 3SPZA 1ZBHA 1S9GA 3ZSOA 4DMNA 4I7FA 3MN5A 3PIPL 3O1BA 4BQZA 4CVNE 2HF4A 2NRTA 4W5OA 4O5BA 5C10A 2HSTA 1FKPA 4DF8A 2ZGZA 1JXBA 3J7ZO 3JSMA 4FLZA 2BDPA 4JI1K 3R1XA 1EETA 1UOCA 1JKHA 5HLFA 4ILJA 3CCEN 3B6OA 2DTUA 4EHUA 3KLFA 4KH4A 1SUQA 3SCXA 4DV7K 3M8SA 2XY6A 1RDUA 4BC3A 1YI2N 5AQPA 4CGDA 1LWCA 2UXDK 3CC4N 1IBKK 1HX1A 4YFUA 5AQUA 1VQ8N 2NRZA 2V51B 3O9UA 2O8DB 4B9VA 3CYMA 4ELVA 4M42A 3B6PA 3O9QA 4JK9A 4YORA 4L8RB 3W3DA 4HUGA 4O4GA 4IBNA 1NK5A 3P83D 2X78A 5SZTA 4CJ3A 4G1QA 3TI0A 4OJRA 4CF2A 4JNEA 4UY8O 4DR1K 4FWPA 2W6KA 1WB9A 4KHSA 1S6QA 3VQBA 4EP5A 5TKYA 2QI2A 4ELTA 2P9LB 1HMVA 3QIOA 3AVJA 3L2VA 5GAEP 4N5SA 2NRRA 4CJSA 2BANA 4Z94A 3TAEA 4CGIA 1YF5L 3TABA 4H4MA 4E0DA 1S1XA 4FWRA 2FF6A 2B6AA 2DY4A 2XY8A 4CEQA 2H3GX 1YUWA 3CG7A 4DF4A 4OLBA 2XHBA 3PUFA 4RW9A 4H0YB 2D0AA 4KTQA 3DOKA 5KPZA 3DXKB 5LL6Z 3OYBA 2P9SB 4CJWA 4CZMA 4DSEA 1R59O 4BC5A 4H03B 3DRSA 1N6QA 3DAWA 3L2QA 4B1UB 2UYTA 5B8HA 1HRHA 2EWSA 5KTQA 1U04A 3KIOA 4FPBA 4CJEA 2HNZA 4E7KA 3C6TA 3LP2A 4CFCA 4JRQA 3DJCA 4PL7A 1NOZA 2VWJA 3HOSA 3SUNA 2YCHA 3D0PA 1N34K 1QTMA 3I33A 3NAEA 1FK9A 3A5OC 4DTRA 4JEPA 4CZJA 1VRTA 3HO1A 3H6EA 1ZBIA 1X9JA 2RE2A 3H3NO 1NK4A 1SL0A 3MX2A 3OYMA 3BEXA 2ZM6K 3WNFA 4FWQA 3AGKA 3GDQA 2QXFA 3CHWA 3RMAA 5KQ8A 4N41A 3RWUA 4FLTA 4B9SA 3VGKA 4B9LA 1RDAA 1ZBFA 1RNHA 1YHQN 2O8DA 4XH4A 3KHYA 4B08A 4A2BA 1C0UA 1HYSA 4F4KA 3GE1A 1EX4A 4DCHA 2CH5A 5SWMA 1D5AA 4FLVA 5C2DA 4X64K 4ZTJA 3CJCA 3P1GA 1LCUA 4I2PA 4BDZA 4JHDB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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