3VEVA

Glucokinase in complex with an activator and glucose
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
455
structure length
450
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 180
structure length 450
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vevA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vevA01
3JS6A 1Z6RA 4EHTA 5F2RA 3CETA 5KPTA 3A8YA 4H5NA 4CBWA 4JN4A 4QS8A 3WXIA 3I8BA 2YHWA 1HKCA 1NGFA 5E84A 2IVPA 2A3ZA 3MDQA 3VGKA 5AQWA 1JCEA 5AQZA 5AQVA 4XH4A 5AQOA 4BR7A 4BR0A 3IFRA 2E2QA 3FZKA 4JAXA 1QZ6A 2P9UA 5BPMA 3CJCA 3QDKA 5BRHA 4BC4A 1WUAA 4E1JA 1S22A 4BG8A 1JCFA 3CJAA 3WT0A 3CIPA 4QS9A 3VERA 4IXCA 4CJ7A 1MWMA 2E2OA 5JLHA 2PBDA 3SLCA 5ADXH 4F9OA 3CQXA 2BTFA 5AQNA 2NZTA 4EIAA 3VEXA 5LJWA 3BF1A 2P9IA 4LC9B 1QZ5A 3AY9A 3MK6A 2FF6A 3VEOA 4H0YB 2W41A 3VEZA 4H03B 1MWKA 1HX1A 1RFQA 5AQPA 2Q31A 4BRQA 4BRFA 3L4IA 4KBOA 4M7YA 3VENA 4IWVA 1R59O 1GLLO 2WUSA 5AZJB 3O4WA 2P9UB 4MO5A 4BRGA 1X3MA 1ATRA 1XQSC 2V52B 2H3GX 1ATSA 3O08A 5F0XA 4XEIA 1NGDA 3QBXA 2NRHA 5JLFA 4AM6A 5AQUA 5AQLA 3HBTA 2A42A 4A61A 3WXKA 2P9LA 3B8AX 1NWKA 3H3OB 4B1UB 3SMSA 3H1VX 3EO3A 4FWKA 1NGCA 3JXUA 2IVOA 5AQMA 4BROA 3D7EO 1YVNA 4PL7A 2P9SA 2Q2RA 3H45C 2KHOA 3L0QA 4CI6A 3I33A 2P9IB 2QWRA 5B8HA 3U9DA 3A0IX 4H5RA 4PKHA 2HOEA 2F9TA 1BA0A 1KAZA 2D1KA 4HTLA 3LDPA 2QWLA 1TUUA 2ZF5O 1HPMA 1HKBA 3ENHA 1DEJA 1GLEG 1NGJA 2I7PA 2Q0UA 3FGUA 3FLCO 1HJOA 1K8KA 4A2AA 5BPNA 2YHXA 3D2EA 4YDUC 1X3NA 3EKUA 2QM1A 5AR0A 2IIRA 1QHAA 1YXQA 2A41A 2QWPA 3QFUA 4BVPA 4B1YB 2E20A 4CZGA 4CZLA 4QS7A 3UKUA 2ASOA 3A5OC 4EHUA 1GLFO 1BA1A 3LL3A 3ATVA 4IJNA 2P9SB 4ISEA 2ZGZA 3O8MA 4WQ4C 3A5NC 3VF6A 3QFPA 3ENOA 4WQ5C 5AQJA 5EY4A 4M63C 4BC5A 3ZETA 2FSNA 3HI0A 5TKYA 3FR0A 3VGMA 4BC2A 2ZWHA 4H0OA 4C23A 4MLEA 1E4FT 1K8KB 4FWQA 3A5MC 3D2EB 4FPBA 5AQSA 1V4TA 1T6CA 3ATUA 4H5VA 2Q97A 1NBWA 2J4RA 4MO4A 4IO8A 3UKRA 4CZHA 3UKUB 1NGAA 3P4IA 3AAQA 4I6MA 3CJ7A 3GL1A 2VWBA 3LM2A 3OHRA 1NGGA 4FOIA 2V7YA 3SJHA 1NGEA 5LY3A 2A40A 3GE1A 3ZX2A 4BRKA 1D4XA 5JICA 1H1VA 2VCPA 3DJCA 4H0VB 4ISFA 4A2BA 1NMDA 2DPNA 5EOYA 3VGLA 2PAVA 2A6AA 3ZETB 4EAHD 3G25A 3UE5A 4CZJA 3LM9A 5FPMA 5EXWA 5BRDA 3H3NO 4O5FA 4H5TA 2FSKA 3ID8A 3FE1A 5BPLA 1Z05A 4B1XB 5AFUH 3CHWA 2CGLA 5AQGA 2P9NA 2QWNA 5BN8A 1T6DA 4I6MB 2P9PA 3QBWA 5AZIA 3SK3A 5AQIA 2CGJA 1XUPO 3DWLA 3KVGA 3AAPA 2BUPA 3VEYA 4DQ8A 1ESVA 2GELA 3WUHA 2Q36A 5AQFA 4CD1A 5CE3A 1SZ2A 2QWOA 3VOVA 4B1WB 4BRLA 4BR9A 3HZ6A 3IDHA 3U8XA 1ZC6A 2E1ZA 3DXKA 5E26A 1KAYA 1GLBG 1KXPA 4PKIA 1NGHA 1P8ZA 5AQYA 3DXMA 4BREA 3EN9A 3C7NA 2P9KA 2D0OA 4BR2A 3WQUA 1QQMA 1DGKN 1RDWX 5AQKA 3R9PA 4BVOA 1TYQA 4J8FA 3GDQA 3TPQA 3ZEUA 3CJBA 5AZIB 1LOTB 5F1XA 3CJ9A 3DAWA 2YHYA 5AQXA 3SMPA 3D2FA 4BR5A 1CZAN 3ZX0A 5BREA 3GBTA 1BOTO 4JHDA 4M7XA 5LJVA 2E2NA 4FWNA 3A5LC 1YUWA 2GEMA 3VESA 1V4SA 4HWIA 2IVNA 5KPRA 2F9WA 3S41A 2FXUA 4CZKA 3MN9A 3EL2A 4JD2A 2CGKA 2P9LB 3HM8A 3LDLA 3DXKB 1BG3A 1JCGA 4Z94A 3MN5A 1GLAG 3C7NB 2P9KB 3VEWA 4XH5A 4K42A 1YAGA 3R6MA 4GY2B 1ZXOA 4BGBA 4GNIA 4FWLA 2D4WA 1TYQB 4B9QA 4BGAA 5KQDA 3R8EA 1MDUB 1Q18A 2I7NA 4H5WA 3D2FB 3MN6A 4H0XB 4RCHA 2QW9A 4EFHA 2EWSA 3KHYA 1Y64A 1HUXA 2AA4A 3LDQA 1IG8A 3CQYA 3RSEA 4JHDB 2ASPA 2CH5A 5FPDA 1GLDG 2ASMA 1XC3A 4YDUA 4BQLA 3CI5A 4BRCA 2FSJA 3BUZB 1BU6O 3EZWA 4A62A 2V7ZA 4RWTA 2YJEA 3MN7A 4PKGA 1E4GT 3MMVA 4BC3A 2V51B 1U2VA 1ZBSA 1OKJA 4FOEA 4BRNA 4FWSA 5AQTA 4WQ4A 1HLUA 1DKGD 3BP8A 1SQKA 4CD3A 1EQYA 4WQ5A 4BR4A 2VYPA 3WQTA 3O5BA 4B1VA 4XH1A 5ELZA 3HTVA 3WXLA 5ADXA 3LDOA 4CZEA 1NGBA 4RTFD 3U9ZA 5AQHA 3H46O 1X9JA 4Y0WA 3AARA 5AZJA 2CH6A 3RSEB 4L3QA 3UB5A 4MLHA 5AFUA 2HF3A 4CZFA 3QB0A 3UKRB 2YJFA 3GOIA 2E8AA 3O1WA 1C0GA 4FWMA 1NM1A 5EX5A 4DB3A 3QICA 3M3ZA 3VETA 4BRIA 2FF3B 2FLOA 2QWQA 1U2VB 2E1YA 4BRPA 4BRMA 1NLVA 3FZLA 2GWKA 3BEXA 2D0PA 4PL8A 1BDGA 2HMPA 5KQ8A 2QXLA 2UYTA 1QQOA 4FL9A 4CBUA 3M6GA 3W0LA 4FWRA 5BR9A 3W3DA 4BRHA 4NB4A 5I9EB 2OANA 4K43A 3HSCA 4K41A 3QMLA 4O8KA 3EKSA 1T44A 2ITMA 3WEEA 3H6EA 4IJAA 3VEVA 2NLXA 3KZBA 2GUPA 3WXJA 4CBXA 4BRDA 4CZIA 2E2PA 4H0TB 4H0PA 4K25A 3L6QA 4DCHA 2W40A 2Q1NA 4AM7A 5KPZA 2YCHA 4JNEA 3J8AA 1NGIA 2P9NB 3GG4A 1LCUA 3MCPA 3ZX3A 2P9PB 1TUYA 3O6WA 1BUPA 3FFKB 3ULEA 2ZGYA 4IZ9A 3FZMA 4BRAA 3VPZA 5BN9A 2AP1A 4FSVA 4FPAA 3LDNA 5AQRA 1BO5O 3CJ1A 4NO7A 5AQQA 1QQNA 2GWJA 1U6ZA 3M1FA 5FPEA 1SAZA 4WYBA 2E88A 2HF4A 3BF3A 3F9MA 4BQZA 3H1QA 3IUCA 4FWOA 3WEEB 5BRFA 1C0FA 3DXMB 1RGIA 2QWMA 3IMXA 3CERA 1GLJO 1HKGA 1IJJA 2Q0RA 5JMVA 3ZEUB 3VF4A 1J6ZA 3FZHA 5EVZA 2GTDA 3ULEB 1MA9B 4BG9A 3FZFA 4DHYA 4ISGA 4CZMA 1BWFO 1S3XA 3O80A 1G99A 3O1BA 2A5XA 2YI1A 3U4LA 5FPNA 4FO0A 3TU5A 4FWPA 1WOQA 3VF2A 3C0BA 4B1ZA 4JD2B 1ATNA 1KAXA 1GLCG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JS6A 1BIUA 1HNXK 4OGEA 4FLXA 3QO9A 3SQ4A 2YHWA 5M1KA 1HYZA 1VQMN 1HKCA 1NGFA 1VSMA 5E84A 4J2EA 1D5AA 3VGKA 1YJWN 1JCEA 3LP1A 3CMEN 4XH4A 3SAFA 4DQIA 4CFDA 5MLCQ 3I0RA 1W7AA 1FK9A 3VQPA 3HXMA 1QZ6A 2P9UA 3QIPA 2RHKA 3QDKA 1K6YA 5C0YA 1JLCA 1S5JA 5GAGP 3WNFA 3THYA 4E1JA 1S22A 3VQEA 3U6FA 4FJGA 3J80O 3VERA 3VQBA 3LAKA 2Z1HA 2PBDA 4DR7K 1VQ4N 1KFSA 4CJKA 5LJWA 1QHTA 3BF1A 3MK6A 4H0YB 2W41A 3NGIA 1HX1A 5AQPA 1QSSA 4A57A 3HL8A 3L4IA 2P5OA 2O8FA 2WUSA 2P9UB 1BQNA 2W6LA 1X3MA 1ATRA 1XQSC 4Y1DA 1RT3A 3THYB 2XY7A 1EO1A 2NRHA 4Z0UA 3VN5A 5JLFA 1NK7A 3OYFA 3K5MA 3RR8A 4BROA 3JXUA 2IVOA 1YVNA 3D7EO 2B4JA 1JL2A 5J2NA 3DLGA 2UXCK 3OY9A 3I33A 3G10A 3O9QA 2JLEA 3THWA 1DTTA 1I3AA 3A0IX 4W5OA 2F9TA 2D1KA 4Z4IA 2QWLA 1TUUA 2ZF5O 3K5NA 4YNQA 2ZJQL 2O8FB 1NKEA 1GLEG 3FGUA 4O8UA 5SWMA 4CJEA 2B5JA 4OGCA 2G8HA 3AVBA 3WNEA 4YDUC 1X3NA 2QM1A 4KKOA 1YXQA 2E20A 4CZGA 1K73O 1VQON 3OA9A 2ASOA 4EHUA 1HYVA 2W42A 1NJIO 3AO1A 1S72N 2X6NA 3CC2N 4R79A 2JWLA 1QSLA 4JK9A 1NK4A 3O8MA 3THWB 1JLGA 3VF6A 1JLBA 3FFIA 4O55A 3CFPA 3OYEA 2QTDA 3ZETA 4E89A 3FR0A 4FLUA 1VQNN 3DOKA 4N41A 1SL2A 2XY8A 3AVJA 4CJ4A 4CHPA 1V4TA 4LF5K 1NBWA 4ELVA 2J4RA 1EKEA 4DR1K 3P4IA 2KFNA 5C12A 1DTQA 4DV1K 1N32K 3SAHA 2VWBA 1NGGA 5FROA 1NGEA 3ULDA 2A40A 4FLZA 3KLEA 1N34K 4CGFA 3SBTA 2VCPA 2HBMA 4ISFA 3AVGA 3S3NA 1WSEA 4DR3K 4B08A 4X62K 3ZETB 2A6AA 4EAHD 1TL3A 1RDAA 4F2RA 5HL7L 3G25A 3LM9A 2VWJA 5FPMA 4DFKA 1VSJA 4KREA 4O5FA 2RF2A 5KGWA 3NF8A 2FSKA 3V9SA 2WTUA 2JWKA 3CHWA 4OKJA 2DTUA 3SK3A 4ICLA 3KVGA 1KLNA 2BUPA 4DQ8A 2GELA 4DF4A 4A5BA 2PYJA 5CE3A 3MX5A 3K5OA 2Z1JA 3DXKA 4FK0A 1P8ZA 2ETJA 4KI6A 4CIEA 4HUGA 2P1JA 4LF6K 4BR2A 3WQUA 3QERA 1QQMA 1RDWX 3PLAA 2YNFA 1TYQA 4J8FA 1RTDA 3GDQA 3KWGA 3TPQA 3OYHA 1HRHA 1CZ9A 3OYAA 5F1XA 4L8RB 5AQXA 3D2FA 2AJQA 1RBTA 1CZAN 1RT6A 5IWAK 1FKPA 3R3LA 2G8FA 4DSIA 1KLMA 2VG5A 1XWLA 3A5LC 1V4SA 5C10A 4HWIA 3NF7A 3L3UA 2P9LB 4AH9A 3DXKB 4KHSA 3CM5A 3ZT4A 4CEOA 1SS6A 3EE8A 3T1HK 4M41A 3M8QA 1XMQK 1VQ5N 1YAGA 1ZXOA 1RNHA 4Z4GA 4DF8A 4CK2A 1O13A 2NRRA 1TYQB 4HCCA 3ZCMA 5KQDA 3O3GA 2PY5A 1BQMA 4GVEA 4J2BA 1MDUB 4JKDA 2KFZA 3ITHA 3D2FB 4EZ6A 3F2KA 4DV4K 2NRVA 4EFHA 4NCBA 5IT9O 2EWSA 3DLEA 3THVA 1IG8A 4KHQA 1RTJA 5FPDA 3SNNA 5CYQA 3P5JA 4BRCA 3K58A 3BUZB 1BU6O 3EZWA 4DV3K 4W5RA 4F4KA 3G0ZA 2YJEA 4DSFA 3TAGA 3MN7A 3IAYA 3MCAB 4A59A 2V51B 1RCHA 3TAFA 4JV5K 1BCMA 3KK7A 2E4LA 4BRNA 5AQTA 4WQ4A 1DKGD 4GV9A 1SQKA 3OVNA 4DLEA 4DUZK 1REVA 3HPOA 3TARA 4DTSA 3LDOA 4CZEA 4B9MA 2WOMA 1EX4A 4KHWA 1WN7A 1VAZA 1X9JA 4Y0WA 3V1QA 2UUBK 1QTMA 3K9JA 1YTAA 2KLAA 2YX6A 1VSHA 2HF3A 2ITGA 1VQPN 4F3TA 1N8RO 2YJFA 4CHOA 2IOCA 3GOIA 4LF9K 3TAMA 1NM1A 5HRRA 3VETA 4DQRA 1K8AO 4OPKA 1LWCA 3QNOA 1D8YA 5M1OA 2E1YA 1C0MA 1NLVA 3BEXA 1W9HA 3ID6A 2HHXA 1EETA 1QQOA 3PSIA 3W0LA 4FWRA 5BR9A 3W3DA 4NB4A 2QI2A 3VQDA 3L2VA 2OANA 2RKIA 4K43A 3OYLA 3QMLA 4J2DA 4G9ZA 3IKMA 4JK8A 2ITMA 3TANA 4WFBL 3H6EA 1LWFA 3VEVA 4RW6A 2NLXA 3RMBA 4E0DA 4CZIA 1L3UA 2E2PA 4K25A 4H0PA 3L6QA 4IBNA 5LL6Z 5CHIA 2Q1NA 2W6KA 4JNEA 1NGIA 4CJUA 5HRPA 1JLAA 3CXCM 1BUPA 2BH1A 4CK1A 4BWJA 1JLEA 3FZMA 4DSKA 1SKWA 3P39A 4FSVA 5FDLA 3ZYYX 5AQRA 4C8OA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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