3VEVA

Glucokinase in complex with an activator and glucose
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
455
structure length
450
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 180
structure length 450
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vevA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vevA01
4DCHA 2V52B 3DXMA 3FLCO 1QZ6A 2P9KB 4A2AA 1Z05A 3AAQA 5E84A 1NLVA 5B8HA 2CGKA 3D7EO 4BGAA 1U2VA 1BG3A 1QQOA 2E2QA 2P9PB 1X3MA 4WQ4C 4HTLA 3VOVA 4H5TA 2P9LB 3O8MA 2IVPA 2IIRA 4CZEA 4BRLA 4EHTA 4J8FA 4FWLA 4B1ZA 4IZ9A 1TUUA 2ZWHA 3QICA 4FWNA 3CJ7A 2E2NA 3KHYA 3ZETA 3QFPA 4JHDA 2QWOA 4CZHA 1XQSC 2YHXA 2VYPA 3I8BA 1J6ZA 4CZMA 5AZJB 2NRHA 2PAVA 3VETA 2ASOA 3L6QA 2GEMA 5AQTA 3SLCA 3H46O 5JMVA 3VEZA 3FZFA 1NWKA 1P8ZA 3G25A 5JLHA 4KBOA 3VGMA 3B8AX 1XUPO 3EKSA 4HWIA 3FR0A 3CIPA 4BR4A 3D2FB 3D2EB 5AQQA 3WQUA 1ATRA 4B1YB 4XEIA 1BA0A 1SQKA 1TYQA 3A8YA 2ITMA 1OKJA 3CJ1A 2FSNA 3MCPA 5FPDA 3U8XA 4YDUA 4BRIA 4JNEA 4Z94A 1ZBSA 3CI5A 1BDGA 4JD2A 1DGKN 4NO7A 3ZEUA 5F0XA 3KZBA 1RFQA 2P9UB 3IUCA 1ZXOA 3QB0A 4BRGA 2I7NA 2I7PA 3DAWA 4FPBA 2AA4A 3HSCA 4BC2A 3H1VX 4H0PA 5AQKA 5AQLA 4K43A 5AQPA 3LM9A 3RSEA 5AQOA 2Q0UA 4A2BA 1SAZA 3EO3A 1EQYA 2P9NA 4O5FA 5AR0A 1TUYA 1WUAA 4K25A 4EFHA 5AFUA 3SK3A 3VEWA 1HKCA 3M3ZA 2WUSA 1KAXA 1TYQB 3FE1A 3FZMA 3LDLA 4M7XA 2A40A 4CZGA 2P9KA 5EVZA 3VGKA 2BUPA 5AQIA 3GDQA 1T6CA 3WXIA 1NGFA 3H6EA 2OANA 1ATSA 2D1KA 3O6WA 5AZIB 1NGIA 4M63C 5KQDA 3JS6A 4M7YA 2P9PA 3VF6A 2D0PA 1BU6O 3FFKB 5AQZA 2FSKA 2CH6A 2P9LA 4O8KA 1GLFO 3UKUB 5AQYA 4PL7A 2Q31A 2GWJA 3W0LA 2YJFA 2VCPA 5EOYA 5AQWA 4BRAA 4BRHA 3GG4A 3MK6A 1ATNA 1GLEG 2E20A 4FWMA 2P9SB 2ZGYA 4A61A 4FWRA 1CZAN 2V7ZA 3ENHA 2Q1NA 2QWQA 3MDQA 4BC4A 3DXKB 4WQ4A 1HJOA 5AZJA 3IMXA 5BPLA 1YVNA 3CERA 1T6DA 4BR2A 3QMLA 4XH4A 2Q97A 3MN9A 5ADXA 1KXPA 3TPQA 4RWTA 1WOQA 2CH5A 4FO0A 3R9PA 3AY9A 3ZX2A 4BR7A 2E8AA 3S41A 3U9DA 2HF3A 3A5MC 4FPAA 5BPNA 3QFUA 4ISEA 1RGIA 5JICA 3IDHA 1H1VA 4EIAA 1G99A 3D2FA 3D2EA 4H03B 4BGBA 1GLLO 4JAXA 3WQTA 3R6MA 2QM1A 3CJ9A 3O80A 5BRDA 4PKIA 1NGBA 3DWLA 1LCUA 1S3XA 2QWRA 5BN8A 4DHYA 4BQLA 2YHWA 4K42A 5TKYA 2QW9A 4BC3A 4CBUA 1BWFO 1KAZA 4FWQA 3QBWA 4A62A 3UKRB 5KPZA 5LJWA 2YCHA 4QS8A 4E1JA 4BRFA 2P9UA 2UYTA 3A5NC 1JCEA 2QWLA 5AQMA 2P9IB 5BN9A 1NGHA 1NMDA 3A0IX 4BVPA 4IJNA 2ZGZA 4GY2B 4CD3A 1MA9B 2V7YA 4FWKA 1S22A 3R8EA 5AQNA 5BRHA 1YUWA 1MDUB 1SZ2A 1IG8A 4H5NA 3DJCA 2ASMA 3LDPA 4CI6A 3VPZA 2W41A 1V4TA 4MLHA 2IVNA 5FPMA 2A42A 4CBWA 3WXLA 3VGLA 3WXKA 2E1YA 3SMPA 3VENA 4BC5A 3FZKA 1MWKA 5AZIA 3M1FA 5AQXA 5AQJA 5ADXH 2Q2RA 4H5WA 1BA1A 3MN7A 1NGAA 1NGEA 5I9EB 4H5RA 3UKUA 1HPMA 3SJHA 4BRMA 3VERA 3BF1A 4FWPA 3P4IA 3HM8A 4BRCA 3GE1A 2D4WA 4RCHA 5LJVA 2KHOA 2D0OA 5JLFA 2P9SA 2A6AA 4DQ8A 1MWMA 1Z6RA 1QQMA 4BR5A 3BUZB 1GLCG 3J8AA 3DXKA 3ULEB 3LDNA 4CZFA 2V51B 3UB5A 1E4FT 2HOEA 4XH1A 3WUHA 3I33A 4BR9A 4CZKA 2E2PA 2BTFA 4CBXA 2HF4A 3ENOA 2J4RA 3VF2A 4BRKA 4WYBA 4C23A 1LOTB 1HX1A 1Q18A 2FXUA 4B9QA 3CJBA 3MN5A 5BREA 3L4IA 3M6GA 4PL8A 5AQUA 2GWKA 1NBWA 4FL9A 3EZWA 1E4GT 2HMPA 3MN6A 1R59O 3VEVA 4H0YB 1DEJA 2QWMA 3ATUA 2FF6A 4QS7A 5AQHA 3BEXA 3UKRA 2FSJA 2GELA 2IVOA 3H3NO 3CJCA 1HLUA 3VEYA 4CZJA 4BROA 3EKUA 5AQSA 3ID8A 3O08A 4FWSA 4LC9B 2H3GX 3HTVA 2Q36A 2F9WA 2P9IA 3LDQA 4MLEA 3WT0A 1YXQA 1HKBA 1D4XA 2GUPA 1K8KB 1C0FA 4F9OA 1GLBG 4MO4A 4AM7A 3C0BA 2QWNA 1QHAA 4B1VA 2FLOA 4JN4A 4CZLA 1KAYA 4BRDA 3F9MA 3BF3A 3O1BA 3FGUA 5EY4A 3IFRA 5FPEA 2A41A 4H0TB 4MO5A 4PKGA 3GL1A 3WEEB 4EAHD 4BRPA 5AFUH 5KPRA 1NGDA 4B1WB 4QS9A 3SMSA 1NGCA 2GTDA 2W40A 4PKHA 1QZ5A 3FZHA 3ATVA 2EWSA 3O5BA 5F2RA 1BO5O 3CJAA 4FWOA 3C7NB 4Y0WA 1IJJA 3LL3A 4L3QA 5FPNA 4H0XB 4I6MB 5BPMA 1ESVA 4BG9A 2ASPA 3DXMB 5AQRA 3VEXA 4FSVA 3GOIA 3HBTA 3O4WA 3MMVA 4IJAA 3ULEA 3GBTA 5BRFA 4EHUA 4ISFA 4BG8A 1U2VB 2F9TA 2CGJA 2E2OA 2YHYA 3U9ZA 1GLAG 3AARA 4CD1A 4DB3A 2Q0RA 3CQXA 2FF3B 4AM6A 3QDKA 5BR9A 4BQZA 3JXUA 4B1XB 3HZ6A 3LM2A 4CJ7A 4BREA 3A5OC 3A5LC 1X9JA 1Y64A 4FOIA 1T44A 3ZETB 4IXCA 2A5XA 4JHDB 1U6ZA 2DPNA 1NGGA 5AQFA 3OHRA 3L0QA 3QBXA 2YJEA 3W3DA 2A3ZA 4GNIA 4K41A 4ISGA 1X3NA 1NM1A 1DKGD 2VWBA 1XC3A 4WQ5A 1C0GA 1QQNA 1NGJA 4YDUC 5AQVA 2NZTA 1YAGA 1BUPA 1HKGA 4XH5A 4H0VB 3FZLA 1JCGA 1BOTO 1HUXA 3AAPA 3BP8A 3H45C 3O1WA 5F1XA 3LDOA 1K8KA 2CGLA 1JCFA 5EXWA 4BRQA 2ZF5O 4WQ5C 4IWVA 3EN9A 1ZC6A 3VEOA 4FOEA 3ZX0A 1GLJO 2NLXA 3CQYA 5CE3A 1RDWX 4IO8A 2PBDA 5LY3A 3U4LA 2AP1A 3WEEA 3H1QA 4JD2B 3UE5A 3ZEUB 3HI0A 4BVOA 5AQGA 3H3OB 3CHWA 5KPTA 5E26A 3CETA 2QXLA 4CZIA 3VESA 2E88A 3VF4A 4B1UB 2E1ZA 4H5VA 4NB4A 3TU5A 2QWPA 1V4SA 5ELZA 4H0OA 5EX5A 3WXJA 2YI1A 3RSEB 5KQ8A 2P9NB 3C7NA 3ZX3A 4BRNA 3EL2A 4BR0A 3KVGA 4I6MA 4RTFD 1GLDG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AILC 5DMRA 3T1HK 3AVGA 4CIGA 4YFUA 3FLCO 4A2AA 4JK8A 2Q3SA 5LL6Z 3AAQA 4FLVA 3S9HA 2E6MA 1HYSA 4DV5K 2VWKA 3HP6A 1BG3A 2E2QA 1VSHA 4DFKA 3HSTB 3O8MA 1YF5L 3AVAA 3KWGA 4CZEA 4BRLA 5LMUK 4B9SA 4JS4A 4J8FA 4X66K 2QKKA 1YT3A 3OVNA 4Z4FA 4ILGB 2ZWHA 4FJMA 1X1PA 1KLNA 1OVYA 3ZETA 3QFPA 1TAUA 3TTFA 2YHXA 1IKVA 4CZMA 4F3OA 4JYAK 5AZJB 3ZT3A 2NRHA 3HPGA 5DK5A 2ASOA 2GEMA 4FJJA 1FKPA 4JI6K 2QI2A 1T3VA 3TAEA 1ZBUA 3QIPA 3V6DA 3CM6A 3VGMA 2XY8A 4NLCA 3EKSA 3MEGA 4CHNA 3LP0A 4BR4A 2O8CB 3D2EB 4JK7A 4M3UA 3J7ZO 1TKZA 3WQUA 4W5RA 4FJ9A 4B1YB 2ITMA 3AA2A 3MCPA 1RTIA 4N76A 4GMJB 4CEBA 4YDUA 4E89A 4NXMK 2GUIA 2WFBA 5M1OA 3CQ8A 5KTQA 4RW4A 2QEXN 5M1NA 2DFHA 3AO3A 4E7KA 2I7PA 2WONA 1EWRA 4QAGA 4OGCA 2YHBA 1C1BA 1ZBIA 5AQPA 3LM9A 4CJ3A 4JKCA 1HNXK 3MX5A 3RSEA 1SAZA 3EO3A 3THWB 4CCHA 1QQCA 4K25A 3C6UA 3K59A 3VEWA 4KTQA 2WUSA 1KAXA 5I3UA 3FZMA 1WNSA 1CLQA 2P9KA 5EVZA 4KH4A 4CJWA 5AQIA 1LAVA 1W9HA 4IG0A 2UUBK 3H6EA 4B9NA 4DR7K 3OYLA 2NRZA 4KHYA 2P9PA 5BR8K 3FFKB 4IFVA 4W5TA 2Q31A 1K9MO 4BRHA 3DLLL 4BRAA 5C2DA 1WSFA 3GG4A 4W5OA 2IS3A 4H4OA 5M1QA 1C1AA 4FWMA 3ZT0A 4FJ7A 2Q1NA 4FM2A 4EP4A 5JVGL 5HROA 1WSIA 1B92A 1MU2A 1HNVA 4FO0A 4BR7A 4H8KA 3S41A 4JI4K 3U9DA 3EZ5A 4FJNA 1QHTA 3A5MC 3CPEA 1FXXA 3SAFA 3OJSA 2IOCA 1H1VA 1VRTA 2HHUA 4DTMA 4OX9K 1GLLO 4A57A 3O80A 3HJFA 4PKIA 3OTOK 3TANA 2QWRA 3AGRA 4YY3K 2XHBA 4BQLA 5TKYA 3THYB 1BWFO 4FWQA 3U3GA 3TARA 4K0KK 2WBNA 3LP1A 1CXUA 2P9UA 3CCMN 1NK9A 2IAJA 1QSLA 1NKCA 1N34K 2HBMA 2QWLA 1TKXA 2P9IB 1NGHA 1QE1A 3A0IX 3T19A 1KQSM 1BQMA 4M3ZA 4O55A 3T3FA 4CD3A 1X9WA 5T7BA 2X74A 4DR5K 3KKRA 2F8SA 4CI6A 5HOOA 3SUPA 2G8WA 1D9DA 5SWMA 1V4TA 3E9LA 2IVNA 2X78A 4B3MK 4CFBA 3V9UA 3FZKA 1E3MA 1K73O 5AZIA 3DLRA 5AQXA 4ZTFA 5ADXH 4DSLA 2Q2RA 4V19S 2O8DA 3WNEA 2UUAK 4E7HA 5CZ1A 4H5RA 1RTHA 3UKUA 3E9OA 3HM9A 4BRMA 3HK2A 2Z1GA 3BF1A 1VSLA 3GE1A 4RCHA 5LJVA 3ZSWA 3L3VA 3TABA 4JKEA 4DQ8A 3C6HA 1S1XA 3J8AA 3ULEB 4B3TK 2V51B 3UB5A 4RG8A 1E4FT 4XH1A 3V9SA 1N5YA 5FDLA 3AVIA 1SKRA 5GADP 3OYIA 4J2EA 1NNEA 1QSSA 3TSQA 2FXUA 3CJBA 5BREA 3L4IA 2E6LA 3M6GA 5AQUA 2GWKA 4AQYK 3NF7A 1OH5A 1WBDA 4FZYA 2HMPA 4H0YB 1IKWA 2BANA 1VQ4N 3ATUA 3IAYA 4KI6A 3V9XA 1JLQA 4LF9K 1TV6A 3UKRA 4BE0A 2GELA 3CJCA 2IDOA 2UXDK 1BCMA 3DLBA 3SUOA 4JRPA 3TAPA 4M3YA 4KFBA 4JI1K 3P83D 5CHIA 2KLAA 2H3GX 4DV1K 2Q36A 2F9WA 3LDQA 4K8ZA 3WT0A 2GUPA 1K8KB 1C0FA 3SPYA 3VA3A 4AHSA 2Y1IA 4Y1CA 4DMNA 2QWNA 4CFAA 4YOUA 4B1VA 3AVCA 4BRDA 1VQON 3NVKA 1A5WA 2FC0A 3MECA 1ASUA 4YOTA 4DU4A 1NK7A 3RVCA 2B6AA 3P5JA 4BRPA 5KPRA 4PHTX 2HSTA 3VQCA 2UXCK 4ID1A 2ZD1A 1UWBA 4JKGA 4QS9A 4C8LA 1NGCA 1CZ9A 3VA0A 2GX9A 4IFEA 4PKHA 5DM7L 4O0IA 2HB5A 5HLFA 3CJAA 1L3SA 3C7NB 4WCEL 4N47A 4Z4HA 4BWMA 3CMAN 4MDBA 3VTHA 3NHGA 1QVGM 4DR6K 2RHKA 5AQRA 4FSVA 3GOIA 1ZBFA 3MMVA 3CYMA 4A59A 4EHUA 1T03A 1T05A 4I9LA 3QEVA 4O0JA 3SAHA 2F9TA 4CK1A 3U9ZA 1GLAG 4GKKK 3AARA 4GVEA 4DB3A 4CGHA 3BGRA 2FBTA 4FLTA 4B9UA 3JXUA 4B1XB 1KRPA 3M8PA 3NVMA 3OBWA 1T44A 3AVJA 4BDPA 3ZETB 4CIFA 4FJGA 4IXCA 1TKDA 4DG1A 4KV8A 4CGDA 1SV5A 3QBXA 4OVLA 4GNIA 4K41A 1DKGD 3EE9A 2W6KA 3LAMA 3SQ2A 1OH8A 1LW0A 4YDUC 3P38A 1BUPA 1TKTA 4CK3A 1HQEA 3FZLA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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