3VEVA

Glucokinase in complex with an activator and glucose
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
455
structure length
450
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
total genus 180
structure length 450
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vevA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vevA01
4BRCA 1GLEG 4CBXA 4A62A 1WUAA 3L4IA 2GUPA 4JHDB 5EXWA 1GLCG 1NGFA 5E26A 5E84A 4AM7A 4BC3A 1ATNA 2QWLA 1BDGA 3JXUA 4H0PA 3S41A 3VGLA 2GELA 1QQNA 1HJOA 2E2QA 5LY3A 2F9TA 3H6EA 1ATSA 3O6WA 5AR0A 4BREA 4IO8A 3CI5A 4I6MA 4EHTA 1GLFO 4CZIA 2YHWA 4B1ZA 4B1UB 2V7ZA 3VPZA 4CBUA 3OHRA 3WXLA 5AQTA 1DGKN 4BRPA 2NLXA 5EX5A 1Y64A 2BTFA 1QZ6A 3U9DA 3RSEB 3B8AX 2GWJA 4FSVA 4FWQA 2A41A 2FF6A 1SQKA 1NM1A 4HTLA 3VEOA 1XC3A 1MWMA 5F2RA 4RCHA 5AZJB 2F9WA 2H3GX 5ADXH 4JD2B 1ATRA 1EQYA 1TYQA 3U9ZA 1JCGA 4DQ8A 3C7NB 3DWLA 2QWOA 2AP1A 2GEMA 2VWBA 3HM8A 2P9PB 3AARA 3ID8A 4MLHA 5KPTA 2Q1NA 1HPMA 3GG4A 3IMXA 3VGMA 4BRMA 1S3XA 3ZEUB 5JLHA 2A40A 1LOTB 1LCUA 3UKRB 2W40A 3DXKB 5AQGA 1KAXA 5AQKA 4M7YA 4CD1A 4QS7A 5AQQA 5B8HA 3IFRA 4BRHA 5TKYA 2I7NA 2YI1A 1TUUA 3FZKA 1NGJA 3G25A 2PAVA 2NZTA 4F9OA 2I7PA 3QMLA 5AQYA 3EO3A 4EIAA 5ELZA 5KQDA 2FSJA 3GL1A 3M1FA 4PL8A 1NGAA 3MN6A 3UE5A 2FXUA 3LDNA 2QWRA 5KQ8A 3L0QA 4Z94A 3J8AA 1BA0A 3MDQA 3MCPA 2CGJA 4I6MB 4WQ4C 2KHOA 3D2EA 4BR7A 2GWKA 4MO4A 3QFPA 4RTFD 3ATUA 1BWFO 4C23A 4CZLA 5BPNA 3SK3A 1RDWX 1WOQA 3WXKA 4H5WA 3FR0A 3FZLA 5AZJA 5EOYA 2P9NA 3VEYA 4NB4A 5BRHA 4E1JA 1TYQB 1V4TA 3C7NA 5BRDA 4QS8A 5AQIA 2QWQA 4BRGA 4K43A 5AFUA 2P9PA 1HUXA 2DPNA 3WXJA 3WQUA 1U2VB 3ZEUA 4B1YB 1BUPA 3UKRA 3DAWA 2IIRA 5AQFA 3FZHA 2ASPA 1Q18A 5BN8A 2HMPA 3IDHA 3CQXA 4BRDA 3KZBA 2P9SB 4ISEA 1RGIA 2GTDA 1E4FT 1NGDA 5AQLA 5FPNA 5AQZA 4FWRA 4QS9A 4B9QA 3FGUA 3L6QA 2PBDA 2Q0UA 3GE1A 2D0OA 4JNEA 5BR9A 3KHYA 3LL3A 1NGHA 5BPLA 3WT0A 3ZETA 2ASMA 4H0TB 4BG9A 4KBOA 2YHXA 4XH5A 4IXCA 2A42A 2W41A 3VF4A 1HX1A 5I9EB 3A5MC 2AA4A 1JCFA 3VESA 3VEVA 3D2EB 3LM9A 1H1VA 4DB3A 4BG8A 3FZMA 4BC2A 3A8YA 4H03B 1NGBA 3WEEB 3LM2A 1NGCA 1XUPO 3U4LA 3VF2A 3QB0A 3UB5A 4FL9A 2D4WA 4BQLA 2P9NB 2Q0RA 3CJBA 4MLEA 5AQRA 3D2FB 3VENA 4CBWA 2P9IB 3GDQA 4M7XA 4BRNA 3AY9A 1NLVA 4O5FA 4Y0WA 3QFUA 4RWTA 4CZMA 1U2VA 3HSCA 4PKIA 1QZ5A 3SLCA 4CZHA 1K8KA 2ASOA 4B1WB 4A2BA 2P9KB 4FWKA 3H46O 3M6GA 5AZIB 2P9SA 2CGLA 3ENHA 3HI0A 4XH1A 1QQOA 1R59O 2J4RA 5AFUH 4H0XB 4ISGA 2YJFA 4K25A 2A5XA 5BPMA 4BVPA 3AAPA 5AQNA 2FLOA 3W0LA 3H45C 3ZETB 4B1XB 3GOIA 3UKUA 3VGKA 2HF4A 4AM6A 3R9PA 3U8XA 3F9MA 2IVOA 2HOEA 1NGEA 2VYPA 2E1ZA 1DKGD 5JICA 4WQ5A 2E1YA 3CJAA 3VEXA 4H0YB 5F0XA 3HBTA 4H5RA 1GLLO 1NBWA 3WEEA 4A2AA 5FPDA 4EHUA 3SMPA 3VEZA 2CH5A 2UYTA 3BUZB 4BQZA 4EAHD 3SJHA 3D2FA 1C0GA 4BR2A 3H3NO 5AQMA 3O1WA 4PL7A 2A3ZA 4BR0A 3VETA 4GNIA 1DEJA 2P9IA 3IUCA 3EKSA 5JLFA 4K42A 5AQWA 4FOEA 1GLBG 3CERA 2D1KA 3I33A 2YHYA 5BRFA 4WQ5C 1K8KB 2P9KA 4IJAA 5AZIA 3VEWA 1SAZA 3O08A 1ZBSA 2HF3A 5CE3A 3CETA 4IJNA 1T6DA 5BN9A 2FSKA 4FO0A 4LC9B 1YAGA 2Q36A 2QWNA 2NRHA 3A5LC 3AAQA 1KXPA 2E2PA 5F1XA 2OANA 3H1VX 3O80A 4H5VA 1BO5O 3FZFA 3ATVA 3BP8A 4FWSA 4O8KA 4BRKA 2V52B 2WUSA 1GLDG 3UKUB 1C0FA 1X3NA 3O5BA 1J6ZA 3W3DA 2YCHA 3EL2A 2ZGZA 3FFKB 4JN4A 1QHAA 1HLUA 3ZX3A 4BC4A 5AQOA 3ULEA 3WUHA 5LJWA 2BUPA 2VCPA 4WQ4A 3SMSA 3MN7A 4BRLA 1TUYA 1MWKA 4EFHA 3MN9A 3A5OC 1SZ2A 2V51B 1KAYA 4J8FA 3EN9A 3LDLA 3CQYA 1E4GT 3EZWA 3HZ6A 3JS6A 1BA1A 5AQJA 1RFQA 2E8AA 2QWPA 3D7EO 3GBTA 4H5NA 4BRIA 4CJ7A 4DHYA 2E88A 3MN5A 2V7YA 3QDKA 1T44A 1IG8A 2QM1A 3M3ZA 5AQPA 2A6AA 1U6ZA 2IVNA 2E2OA 4FPBA 1ESVA 2CH6A 4BR5A 3CJCA 4FWOA 4BGAA 1OKJA 1YXQA 3DXMA 3VOVA 2E20A 1GLJO 3BF3A 1KAZA 4YDUC 5AQHA 3CHWA 2P9UA 1YUWA 4BROA 4CZEA 1HKGA 2ITMA 1MDUB 3CJ1A 1Z6RA 1NGGA 3HTVA 4H5TA 2Q2RA 4HWIA 3VF6A 1XQSC 2FSNA 1GLAG 3BEXA 5ADXA 1T6CA 1BG3A 1QQMA 2CGKA 5KPRA 3CIPA 5KPZA 4GY2B 3A5NC 2QXLA 3P4IA 3CJ9A 1BOTO 1ZXOA 3H3OB 4XEIA 4BGBA 4BRFA 1V4SA 1D4XA 3MK6A 2D0PA 2ZWHA 4XH4A 4FPAA 4JAXA 5AQSA 3ULEB 3WXIA 3QICA 4FWPA 3QBWA 5JMVA 1IJJA 3BF1A 4MO5A 4CZKA 4FOIA 5BREA 4DCHA 5FPEA 3CJ7A 3O1BA 4H0VB 4L3QA 2P9LA 2QWMA 3EKUA 3ENOA 3WQTA 5AQUA 5EY4A 4CD3A 2YJEA 3C0BA 4ISFA 3LDOA 4BRAA 4B1VA 4BRQA 5FPMA 4JHDA 4WYBA 3R8EA 4H0OA 4YDUA 4BC5A 1G99A 3TU5A 4BVOA 1X9JA 1NWKA 4NO7A 3LDQA 4PKGA 4CI6A 4CZJA 4IZ9A 3DXMB 2E2NA 5LJVA 3O8MA 1MA9B 3H1QA 2EWSA 2P9UB 4K41A 3A0IX 4CZFA 2FF3B 5EVZA 4BR4A 1X3MA 1P8ZA 2ZF5O 1HKBA 3TPQA 3VERA 3ZX0A 3RSEA 3ZX2A 4A61A 3MMVA 3I8BA 4FWLA 1BU6O 4BR9A 1YVNA 5AQXA 4JD2A 1ZC6A 2Q31A 3FE1A 4FWNA 3KVGA 2IVPA 1S22A 2QW9A 4FWMA 3R6MA 2Q97A 4M63C 5AQVA 4CZGA 2ZGYA 4IWVA 3LDPA 1CZAN 1HKCA 3QBXA 3O4WA 1NMDA 4PKHA 3FLCO 3DJCA 1NGIA 3DXKA 1JCEA 2P9LB 1Z05A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRCA 1GLEG 2HBLA 1XHZA 3SYZA 4QAGA 2NRRA 2HB5A 3LP0A 2HBKA 2GUPA 2PYJA 4JHDB 1EX4A 1GLCG 5E26A 1C1AA 4AM7A 5C10A 2QK9A 4IG0A 1BDGA 3JXUA 3VGLA 2GELA 1C0TA 1E3MA 4CJWA 4CFBA 1ATSA 5AR0A 2W6LA 5HP1A 4IO8A 4I6MA 4DSLA 4CZIA 5GADP 4LH4A 3O9UA 2V7ZA 1DGKN 4BRPA 2NLXA 3P1GA 2AJQA 3M8SA 3AVJA 4KH6A 1WSHA 1C0MA 2FF6A 4DSJA 1A5WA 1EETA 3SUOA 2VGNA 3QEPA 4B3OA 3ZT2A 5AZJB 4UY8O 1EQYA 4K8ZA 1JXEA 2UUAK 3U9ZA 4CESA 4DQ8A 3DWLA 2QWOA 3VQ7A 2ZM6K 3C6HA 4E89A 3HM8A 1JLBA 4MQ3A 1HPMA 4DSIA 3VGMA 4BE2A 3ZEUB 4W5TA 1LOTB 1LCUA 3LDSA 1SL2A 3RMDA 3DXKB 4DF8A 4NXMK 4EZ9A 4QS7A 4G1QA 3AV9A 5AQQA 5GINA 1VQMN 4CEDA 3C6AA 3QIPA 3TAFA 4DWIA 2I7NA 2Z1JA 1TUUA 1WSFA 3FZKA 3THWA 2HHSA 2D0AA 4DV3K 5J2QA 4FLZA 1NJZA 4DU3A 3KD1E 4NYFA 1IBKK 4DF4A 2YKMA 1WAFA 4TSXA 3QEXA 1RBTA 3LP2A 3MECA 3BZCA 3GL1A 4PL8A 1NGAA 4A57A 3MN6A 3DLBA 2ZE2A 4Y1CA 4IOXA 4PA1A 3LDNA 4R5PA 3O3FA 2X74A 5KQ8A 4Z94A 3C6TA 3MCPA 4ZHRA 1NNEA 4BR7A 3VQ6A 3T1HK 2RPIA 2W42A 4GMJB 3J81O 4C8OA 3LZIA 2FBTA 3G4SN 2ZQBA 4B9LA 2P9NA 2VQFK 3C7NA 4BWMA 4BRGA 4FJGA 5AFUA 3P31A 4JI5K 1CXQA 4CHNA 3RMCA 2PFUA 2KKZA 4AHCA 3V81A 5M1FA 1BUPA 2ASPA 4N5SA 3IDHA 2KTQA 4PWDA 4JKAA 1JL2A 3TSPA 1E4FT 1NGDA 4ELTA 4DR5K 5FPNA 4E7HA 4QS9A 4B9QA 1YJWN 4KPYA 3OW2M 3KK2A 3GE1A 3PO4A 4O5BA 3DOLA 4HCCA 5HLFA 3TAQA 2ASMA 3G0ZA 3LWMA 2OPSA 3OY9A 3V9SA 4DTSA 4CHQA 1U49A 3VESA 3VEVA 2WTUA 4CE9A 4W5QA 3M5RA 3V9UA 2RHKA 4KHSA 4GV9A 1B92A 1WSJA 3WEEB 1XUPO 1RBSA 2B4JA 1RBRA 4J2EA 3QB0A 2PZSA 1RBUA 3DLHA 3KLHA 4BQLA 3CJBA 3OS0A 3WXMB 2OA8A 2EHGA 4FZXC 3VENA 3L2RA 1DLOA 4BACA 2HSTA 4PKIA 2F8SA 3SLCA 3TANA 3SAHA 2P9KB 4N56A 3AVAA 4OGCA 3AVGA 4B08A 2CGLA 3ENHA 1ZBHA 4RW9A 2WOMA 4FVMA 4K8XA 5M1PA 3F9KA 1SL1A 1IG9A 4KREA 4OKKA 4O8UA 5AQNA 3OS2A 3W0LA 3H45C 3VGKA 2HF4A 4K0KK 1LV5A 4GKKK 4FJ9A 4KH5A 2IVOA 2OTJN 4CHYA 2HOEA 1NGEA 1DKGD 4FJ7A 4IOCL 1RT4A 3CCJN 3AVKA 5JICA 3THXB 2QTDA 4OKEA 4E7KA 5F0XA 1ZBUA 4CHPA 4IFYA 4JKHA 1YF5L 3D45A 1I3AA 5FPDA 5FLXO 4EHUA 3SMPA 1J5EK 4YOYA 1SKSA 4BQZA 3SCXA 2NRZA 4B9MA 1LWCA 4BR2A 1C0GA 3EE9A 1VQPN 3Q7BA 4AHRA 2FBXA 3LPTA 3O1WA 3VETA 3AA3A 1IKVA 1RT3A 4K42A 4IDHA 4FOEA 3NH0A 3WNGA 3I33A 3KD5E 4WQ5C 3K59A 3T69A 1VSIA 2R7YA 5SZTA 4CGFA 1SAZA 4IJNA 1T6DA 2QWNA 3HT3A 1BI4A 3A5LC 4FJJA 4CVNE 1TAQA 2E2PA 3NF9A 1X1PA 1BO5O 4LF8K 5HL7L 4CJLA 1B9DA 3HVRA 4GV3A 4DTPA 1X3NA 1W9HA 4MDBA 3THYA 2ZGZA 3FFKB 3WNHA 1U47A 4FZYA 3WUHA 3E1YA 4BRLA 1TUYA 1MWKA 2O8EB 1SZ2A 4J8FA 3EN9A 3KTQA 1E4GT 4HUEA 5AQJA 5GIOA 3GBTA 4DKWA 4DHYA 2G8FA 1EWQA 4FJ5A 1T44A 1IG8A 5IWAK 2G8WA 3ZSRA 2VWJA 4FPBA 2CH6A 3LZJA 4FWOA 4DU1A 1WN7A 1T05A 4CEFA 4JI8K 2E5LK 1YXQA 4CEBA 3DXMA 3VOVA 3MAQA 1K8AO 3SNNA 4I9LA 1BL3A 4CZEA 5M1QA 2DFFA 4E0DA 2Q2RA 3B6OA 1O13A 3ID6A 4FLVA 4KTZA 1S72N 2G8VA 2FBVA 3J7YP 3QNNA 3O9TA 4WF9L 5KPRA 3V9XA 3RRGA 4BWJA 4CK2A 4HVJA 1NK9A 4GY2B 5KRTA 4JI3K 1ZXOA 3MK6A 4FWPA 3QBWA 5JMVA 3BF1A 3QNOA 5BREA 4FOIA 4DCHA 3CJ7A 4H0VB 2OPPA 3NF8A 3TTCA 5C15A 1S1VA 3PY8A 4NXNK 4CEOA 3C0BA 3LDOA 3VQCA 4BRAA 5FPMA 1FK9A 2NUBA 4WYBA 1S1TA 1ZYQA 1NKEA 4H0OA 1G99A 3TU5A 4BVOA 4NO7A 2O8CB 3LDQA 1OVYA 3KWGA 1NKCA 2PYLA 4YOXA 1NJXA 4WE1A 1OH5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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