3VEWA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz in complex with adp
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
567
structure length
567
Chain Sequence
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
molecule tags Transferase
total genus 191
structure length 567
sequence length 567
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vewA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vewA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vewA03
1HKBA 2IVNA 1Q18A 2E1YA 4BRAA 3CETA 2PAVA 2QWMA 4FWKA 3U9ZA 4EHTA 4RWTA 1RGIA 3BUZB 2D4WA 4XH1A 4CZIA 2GWKA 5AQVA 3ULEA 2QWOA 2A6AA 1NBWA 1SQKA 5LJWA 2QWLA 1TUYA 3VPZA 4BGAA 1OKJA 5ADXH 3WXIA 4A62A 3H3NO 1SZ2A 3MN5A 1H1VA 4FWNA 3LDPA 3VGKA 3SJHA 5BREA 4KBOA 2VYPA 3BEXA 3TSQA 1KAZA 2A41A 3VOVA 1S22A 2Q0RA 1YXQA 3CJ1A 3SK3A 4FOEA 1V4TA 4EIAA 3GBTA 3S41A 2E2PA 4I6MA 1BDGA 4BRMA 2FF6A 4B1ZA 1QZ6A 3U9DA 4LC9B 4CZEA 3GDQA 2FSKA 4FOIA 4K42A 1XUPO 4ISFA 5JMVA 1DGKN 1Z6RA 4IJAA 2V52B 4WQ5A 1NGCA 2P9PA 1Z05A 3R9PA 5FPEA 4JAXA 4C23A 2UYTA 4CZHA 3AARA 5AQLA 1E4FT 3C7NB 4BREA 3SMPA 2VCPA 5AFUH 4FWSA 3EKSA 4MO5A 4H03B 3I8BA 1GLDG 2ASPA 1X3NA 3QICA 2YJEA 2P9KA 3TTDA 3IFRA 5AQGA 3LM9A 3A0IX 3M3ZA 3WQUA 1NGDA 2CH6A 5AQXA 1ATRA 2F9WA 2VWBA 4PKGA 2E8AA 4QS7A 2Q0UA 2HMPA 2FXUA 3MN9A 4CJ7A 3VF2A 2ZWHA 3CJCA 4JN4A 3IMXA 4BC4A 4RCHA 3AAQA 3LDNA 3QFPA 3R8EA 3BF3A 2Q97A 1GLJO 4FL9A 2CH5A 3VTHA 3DXKB 1U2VA 3O4WA 2DPNA 3M1FA 5KQ8A 3MDQA 2E2OA 2YHXA 4JD2A 1GLBG 3CQYA 3KHYA 4BRLA 1YVNA 2E1ZA 4FWQA 4B1VA 3O5BA 1BU6O 3AAPA 3ZX0A 2QW9A 2E20A 2D0OA 5AQIA 4FWPA 4ISGA 3VEVA 3UB5A 4B1UB 3O08A 1GLLO 2P9IB 2P9UB 4BR2A 3H45C 4MLHA 5BPLA 4RTFD 1TYQB 2A42A 3BP8A 4H0XB 3L6QA 5AQQA 5KQDA 2E2NA 4PKIA 4BQZA 1SAZA 4AM6A 4BC5A 4IO8A 2HF4A 5AQTA 3EKUA 3WUHA 3QDKA 3ZEUB 1HKGA 4BGBA 1BG3A 2YJFA 4FWLA 2QXLA 3FE1A 3VESA 3ENOA 1X9JA 3TPQA 1NGFA 1XC3A 3MMVA 3CI5A 4CZFA 3FZFA 2NLXA 1J6ZA 4H0PA 3ATVA 1EQYA 1YAGA 1BA1A 4H5NA 3ZETB 4WQ4A 4BROA 3GL1A 1HKCA 4WQ4C 5AQWA 1JCGA 5AQZA 3OHRA 4H5RA 1BWFO 2A3ZA 2BUPA 2CGJA 4H5TA 4M63C 3TU5A 3JS6A 4A2AA 4CD1A 4BRDA 3FFKB 5FPNA 4DQ8A 3M6GA 2ZF5O 4FO0A 3FZHA 2FF3B 3ZX2A 3TTFA 3DXMB 1RDWX 1QQMA 4BR7A 3SMSA 1GLCG 4CBUA 3HBTA 5FPMA 3VEYA 3WXLA 5EVZA 5E84A 5KPTA 2V7ZA 3EO3A 3AY9A 4EAHD 2A5XA 1HX1A 4M7XA 3EL2A 4YDUA 1DKGD 3JXUA 3ATUA 1C0FA 2P9SB 5AQHA 4A61A 4QS8A 4H0OA 1ATSA 2YHWA 1BO5O 4WQ5C 2ASOA 3FZKA 4BVPA 3LDQA 4B9QA 2GUPA 4CZGA 1JCFA 4BC3A 5BR9A 3QB0A 2P9LB 4IJNA 2BTFA 3ZX3A 3A5MC 2W40A 3QBWA 3WXJA 1LCUA 1QQOA 2V7YA 3MN7A 3D2FA 4ISEA 1MA9B 3UKUA 4MLEA 4GNIA 5BRDA 2PBDA 4DCHA 1NGIA 2FLOA 4NO7A 3CERA 5AR0A 3L0QA 5ELZA 5AQRA 3UKRB 2AP1A 3VGLA 2QWRA 5EY4A 3VGMA 4PL7A 3ZETA 5AQNA 5AZJB 2QWNA 4NB4A 1BA0A 3MK6A 3HSCA 3CJ7A 4L3QA 1S3XA 3HTVA 3FLCO 2CGKA 4BVOA 3FR0A 5AZIB 3C0BA 1GLAG 3FZMA 4CBXA 5LY3A 4JNEA 5KPRA 1BUPA 3ENHA 1E4GT 5LJVA 4AM7A 3TSPA 4BRCA 2F9TA 1QQNA 1YUWA 3IDHA 2P9NB 1NGGA 4QS9A 4HTLA 2Q2RA 2H3GX 3O1BA 5ADXA 3VEOA 4JHDB 2WUSA 1KAYA 2QWPA 4GY2B 1WOQA 1NGJA 4CBWA 4CZLA 1NGHA 3FGUA 3UE5A 5AQMA 4IZ9A 2A40A 1G99A 2AA4A 2ZGZA 3QMLA 4BRGA 4A2BA 4EFHA 1D4XA 3TTCA 4XH5A 4BRPA 3ULEB 3VF4A 4E1JA 2Q36A 4BRNA 3GE1A 3C7NA 1NLVA 2E2QA 1MWKA 2FSNA 2GTDA 3SLCA 3LL3A 4WYBA 3HZ6A 4I6MB 3VETA 3R6MA 3LM2A 1T6CA 2D1KA 4FWOA 1WUAA 3D2EB 3MN6A 1GLFO 3U8XA 1ZXOA 1K8KB 2E88A 4PKHA 3UKRA 2P9PB 4XH4A 2J4RA 3H6EA 5EX5A 2YCHA 2QWQA 3L4IA 3KVGA 1DEJA 2EWSA 5BN8A 5BRHA 1HPMA 4BRHA 1R59O 1HJOA 2D0PA 3DWLA 3H3OB 3RSEB 5AZIA 5F2RA 5BPNA 3CHWA 3DXKA 2P9KB 3O6WA 4K43A 3A8YA 1V4SA 3DAWA 3D7EO 5B8HA 3BF1A 3H46O 4O5FA 3A5OC 2P9NA 1T6DA 3VEXA 3QFUA 3QBXA 4JHDA 2ZGYA 1QZ5A 1MWMA 1TUUA 3CJAA 3W3DA 2OANA 2FSJA 3P4IA 2KHOA 2HOEA 4FWRA 5F1XA 5KPZA 3G25A 4H0YB 2YI1A 1X3MA 4IXCA 2P9IA 3U4LA 4J8FA 5TKYA 2P9UA 3GG4A 3VF6A 1U2VB 3VENA 5EXWA 1TYQA 4EHUA 4BRIA 5I9EB 3WT0A 1ZBSA 2GWJA 3O80A 4YDUC 4CZMA 2ASMA 4H0TB 4JD2B 3F9MA 1NGAA 4IWVA 3A5LC 1XQSC 5AQUA 3WEEB 1ESVA 2V51B 1MDUB 2YHYA 4BRKA 1HLUA 1CZAN 3VEWA 4CI6A 2NZTA 3IUCA 4M7YA 1LOTB 4BR0A 1NMDA 3ZEUA 3D2EA 1K8KA 1P8ZA 4HWIA 4BR4A 3CJ9A 2Q1NA 5EOYA 4K25A 1ATNA 5BN9A 4BRQA 3VERA 4CZJA 2IVPA 4BR9A 2IIRA 1IG8A 3EZWA 4H5VA 5JICA 1KAXA 3RSEA 4DB3A 5E26A 2GELA 5AQKA 1HUXA 4MO4A 3LDLA 3HI0A 2I7NA 3A5NC 4B1WB 1GLEG 1ZC6A 4Z94A 4DHYA 3ID8A 2IVOA 2NRHA 4K41A 3I33A 1Y64A 3DXMA 2I7PA 3O8MA 5AQJA 3CQXA 5AQOA 3CIPA 4BC2A 4BG9A 2Q31A 1BOTO 1U6ZA 2GEMA 3EN9A 3O1WA 4CZKA 3DJCA 1T44A 3GOIA 3WXKA 3H1QA 2P9SA 4PL8A 4BG8A 5FPDA 1RFQA 5JLFA 4Y0WA 3J8AA 3B8AX 3TSUA 3WEEA 3HM8A 4FPAA 1IJJA 4O8KA 1NWKA 2P9LA 5AFUA 4B1YB 2CGLA 4FWMA 3KZBA 4F9OA 1JCEA 4BRFA 4FPBA 5BPMA 4BQLA 1NGEA 4H5WA 4FSVA 3CJBA 5BRFA 1C0GA 2ITMA 4H0VB 5CE3A 3W0LA 1KXPA 4B1XB 5AZJA 2HF3A 4CD3A 3VEZA 4BR5A 1QHAA 3WQTA 3LDOA 5AQSA 5F0XA 5AQYA 3FZLA 3MCPA 1NM1A 5AQFA 3H1VX 4XEIA 2W41A 5JLHA 3D2FB 2QM1A 3UKUB 1NGBA 5AQPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Q18A 4CJPA 4IEIA 4FWKA 3M8SA 3U9ZA 4LFBK 1TVRA 4AHSA 4CEQA 4LFCK 4XIUA 2UUCK 1FW6A 2D4WA 4XH1A 3TAQA 1VSEA 1SQKA 5LJWA 4DR6K 2QA4N 3VPZA 1TUYA 5LL6Z 4QOZB 4JI5K 3MN5A 1D8YA 3VGKA 3PO4A 3VQ9A 3T3FA 5K14A 2VYPA 3BEXA 1HPZA 5FRMA 1KAZA 3OYKA 1VQ5N 3VOVA 2ZM6K 3KLGA 1K4PA 1YXQA 1YTUA 4CGGA 3DYAA 1BDGA 2D0BA 2RN2A 4CZEA 3GDQA 4FOIA 4K42A 5KTQA 3MXJA 4A5BA 4HCCA 1XUPO 4ISFA 3PX4A 4IJAA 4HUGA 2V52B 3DRRA 4IFVA 4CF1A 1Z05A 4FM0A 5FPEA 4CZHA 2JGUA 2UYTA 4M3TA 1B9DA 1SNNA 3CC7N 4E7LA 2FBXA 2YJEA 4K8XA 2P9KA 3QESA 3TTDA 1BHLA 4CIEA 3VQ7A 2HHSA 4I9QA 3K5NA 2CH6A 2IDOA 4LH5A 2WBNA 4JI6K 5I3UA 2HMPA 3HP6A 4Q0BA 3VF2A 3LZIA 2E5LK 4RCHA 1TAQA 3LDNA 1LWFA 3R8EA 3QEXA 1GLJO 4FL9A 2R7YA 2EX3A 2CH5A 2GUIA 4FJ7A 3VTHA 3K58A 3DXKB 3LANA 1U2VA 4I2PA 2VG7A 5M1FA 3J81O 3O4WA 3AVNA 3B6OA 3M1FA 3MDQA 4JD2A 1GLBG 1YVNA 4B1VA 3O5BA 3AAPA 1A5WA 3LWLA 3G6EN 3EE8A 1O13A 5AQIA 1NU0A 2O8DA 4JS5A 1PVWA 5CYMA 1SUQA 1BCMA 1VQPN 3O08A 5SZTA 4BR2A 1HJRA 3H45C 1KLNA 1RBUA 3CFRA 3RMAA 3L6QA 1VQLN 1KRPA 1GOBA 4B3RK 4PKIA 3BDPA 4U67L 1SAZA 4AM6A 2HF4A 3FFIA 1W97L 3EKUA 3WUHA 4FWLA 2QXLA 1VSLA 3VESA 3ENOA 1NGFA 4O44A 1SS6A 3L7VA 4CZFA 4LF6K 4LFAK 4H0PA 3G0ZA 3ENBA 4H5NA 3ZETB 2HSTA 1HNVA 1QS4A 5E41A 1HKCA 1QSSA 4WQ4C 4ELUA 1JCGA 4DSJA 2WFBA 4H5RA 1VQNN 4M63C 4LF7K 5GADP 1T05A 4CD1A 4IDKA 3L3VA 4DQ8A 3M6GA 3ULDA 5JVGL 4HCBA 4P6CA 2OYQA 1RBRA 2O8FB 1QQMA 1JJ2M 1GLCG 4FK2A 4L8RB 4B08A 5FPMA 1S1XA 5E84A 2V7ZA 4CVNE 1IKYA 3I55N 1HX1A 4JKEA 4M7XA 4DR2K 1SV5A 3CCSN 2G8FA 2OZMA 4F3OA 1TK0A 1KCFA 4A61A 1REVA 2YHWA 4BVPA 4IEEA 4NLBA 4JI0K 2P9LB 1HQEA 3PIOL 4HVJA 3A5MC 1ASWA 3MN7A 3SQ2A 4DCHA 2OA8A 1NGIA 5AR0A 3L0QA 3TR8A 2QWRA 1FKOA 3ZSXA 3VGMA 3AGRA 3ZETA 3KK7A 2QWNA 4HUEA 3MK6A 3EYZA 3HTVA 1JKHA 2CGKA 3CCRN 1VQ8N 4BVOA 3FR0A 5LY3A 5J1EA 4JNEA 1E4GT 1NGGA 3L8BA 1RTDA 3LAMA 4CHPA 1P90A 2F7TA 3VEOA 3HT3A 3CC2N 4KHPK 2WUSA 4JKCA 4DG1A 4FJGA 3HYFA 3HP9A 3DI6A 1WOQA 1RT2A 3UE5A 2Z1IA 5AQMA 3JAMO 4IZ9A 1ZBUA 2AA4A 3QMLA 2O4IA 1VRUA 1CXUA 3AA4A 2O8EA 3P83D 1C6VA 3VF4A 2IS3A 4JS4A 5DM6L 4BRNA 5DK5A 4ELVA 3GE1A 2KFNA 1IV0A 1YI2N 3V9ZA 5C2FA 4P6DA 3N4PA 2ZE2A 2HNZA 4DTJA 4I6MB 4KRFA 1MU2A 1NJYA 4B9NA 1K8KB 3G71N 4OJRA 1RDCA 1D9DA 4XH4A 4KI6A 4FW2A 3H6EA 2HHQA 2YCHA 2QWQA 5JVHL 2Z1JA 3E9PA 3AA2A 5BRHA 1SL2A 3T69A 5DMRA 3H3OB 2FC0A 4F2SA 1NOZA 5F2RA 5BPNA 4FK0A 1S1TA 3AVFA 4AHTA 3A8YA 1V4SA 3O9TA 4A5AA 4P77A 3DAWA 3D7EO 4LF8K 3H46O 1T6DA 3ASMA 3QFUA 3QBXA 2LSNA 5CHIA 2X6NA 3V9UA 3CJAA 1FXXA 2KHOA 1LV5A 5KPZA 3G25A 4H0YB 4FYDA 4DV7K 3SV3A 3BY5A 3VENA 5EXWA 1G15A 1TYQA 3U3GA 3L2WA 1ZBSA 1UA1A 2OZSA 4CZMA 3PO5A 5HRRA 1T3VA 4IWVA 2NUBA 4YNQA 5CY4A 2HHUA 1JL2A 4IG0A 1NJWA 4BRKA 4OPAA 3TWHA 3IUCA 2MX1A 4KI4A 4M7YA 1LOTB 4P6PA 3ZEUA 3K2PA 4H4OA 4MDBA 4FLXA 1K8KA 4BR4A 4OGCA 1ATNA 3L2QA 1ASVA 3VERA 3L2RA 1W7AA 2IVPA 4BR9A 4EP4A 2PZSA 4R79A 4CIGA 4CK3A 1RBTA 4FW1A 2OPQA 3AVHA 4CFCA 1TK8A 1D9FA 3LDLA 1JLGA 3HI0A 2I7NA 1GLEG 4DU1A 1T03A 4FJ5A 4LF9K 3OYFA 4DV5K 4OVLA 4C1NI 4ELTA 3LRJA 2NRHA 3OYJA 3SUPA 3I33A 1HRUA 4DTSA 4H8KA 3ZT4A 4OKEA 4BWJA 3MWTA 3JSMA 4FLWA 1L5UA 3AJEA 3V81A 4DS4A 3AO3A 3O4NA 4CFBA 4CF2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4FVM A;  1C0G A;  3TAM A;  3MEC A;  2OPR A;  5CE3 A;  3W0L A;  1CZ9 A;  4BAC A;  1ZBL A;  4BDP A;  2ITG A;  1OH8 A;  1HYS A;  3WXM B;  3VQ8 A;  1ITG A;  3LP1 A;  2NRR A;  4KHS A;  1RDU A;  1JLB A;  4PQU A;  2YHA A;  2QM1 A;  2F8T A;  5GAG P;  1NGB A;  4ID1 A;  3RVC A;  4KTZ A;  5LMU K;  2IVN A;  4ILG B;  2OPS A;  3CET A;  1S6P A;  2QWM A;  3NGI A;  4CJL A;  4EHT A;  3C94 A;  2RKI A;  4KHU A;  4CZI A;  5AQV A;  4NCA A;  4O5B A;  2A6A A;  3OYM A;  4A62 A;  3H3N O;  3SI6 A;  4FWN A;  1TKU A;  3LDP A;  3S3M A;  5KRT A;  4FCY A;  2BGG A;  2Q0R A;  2XY7 A;  2YHB A;  3PIP L;  1IEZ A;  1JLQ A;  1V4T A;  4FOE A;  3GBT A;  4EIA A;  1ZBF A;  3KK2 A;  4B1Z A;  1QZ6 A;  4IOA L;  1Y97 A;  4M3W A;  2O8E B;  3RRH A;  4KHW A;  1Z6R A;  4E89 A;  3UIQ A;  2P9P A;  4F8R A;  2NRX A;  3R9P A;  4C23 A;  1BI4 A;  4EZ9 A;  3SMP A;  2VCP A;  5AFU H;  4FWS A;  1HRH A;  3KKS A;  4YY3 K;  3ZSR A;  3I8B A;  1GLD G;  5SWM A;  4OPH A;  4CHQ A;  3NAE A;  3IFR A;  4YFU A;  1RT6 A;  5C24 A;  3QEW A;  1RT5 A;  5AQX A;  2VWB A; 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 3PY8 A;  5FRO A;  4BE1 A;  1RCH A;  1NGJ A;  4CBW A;  5J2N A;  1G99 A;  4BRG A;  1VSK A;  3VMF B;  4ZTJ A;  4XH5 A;  5HLF A;  3CFO A;  3ULE B;  4E1J A;  4RW8 A;  3MIO A;  3DRS A;  4W5N A;  4W5T A;  1D5A A;  1YF5 L;  4DFP A;  4BDZ A;  2FSN A;  3OYL A;  4FJM A;  2GTD A;  3CC4 N;  3LL3 A;  2KZM A;  3HZ6 A;  3C6A A;  3P31 A;  3PSF A;  4ICL A;  4FJ8 A;  3LZJ A;  4FWO A;  3U8X A;  1N6Q A;  4PKH A;  1IH7 A;  4RW6 A;  1U47 A;  1RNH A;  2JLE A;  1S72 N;  1HMV A;  3Q7B A;  1WAJ A;  4AHR A;  4JKG B;  4B3O A;  3L4I A;  3ZCM A;  3N4Q A;  3QEI A;  1HPM A;  3HXM A;  5HP1 A;  3LPU A;  5AZI A;  3IAY A;  3L2U A;  3O6W A;  4K43 A;  3DLK A;  3E66 A;  1CZB A;  3R3L A;  2G8U A;  3A5O C;  1KD1 O;  3PLA A;  4JHD A;  2QKK A;  4CEE A;  4Z4C A;  3A2F A;  1NJZ A;  4BDY A;  2OAN A;  3E9L A;  3P4I A;  2HOE A;  4FWR A;  4CW7 B;  5F1X A;  4DSI A;  1X3M A;  4IXC A;  4J8F A;  5TKY A;  4LSL A;  2P9U A;  1QE1 A;  2YNG A;  3WT0 A;  3HJF A;  3SPY A;  4FZY A;  4KHQ A;  1N8R O;  1S9E A;  1VSD A;  2NRZ A;  1NGA A;  3WEE B;  1HNW K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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