3VEWA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz in complex with adp
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
567
structure length
567
Chain Sequence
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 191
structure length 567
sequence length 567
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vewA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vewA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vewA03
2YHWA 3AAPA 2P9PB 4Z94A 3AAQA 3VGKA 1CZAN 3O1BA 3TSUA 2P9NA 5JMVA 4H0YB 3LDLA 4FPBA 2F9WA 3FZKA 3WXKA 3GE1A 4BRCA 1NGHA 2E2PA 4IWVA 3WUHA 4DHYA 3ID8A 5AQTA 3FLCO 3QFUA 4AM6A 4C23A 3CJBA 4CI6A 4FWOA 3KZBA 2ZGYA 1P8ZA 2ASOA 2E8AA 1Q18A 2GWKA 3QDKA 5AQVA 4BRNA 5AZJA 4JHDB 3QMLA 1ATRA 3ZX2A 2P9KA 3C7NB 5AQKA 5AQGA 1TYQB 3D7EO 3ATVA 4BRKA 2HOEA 2V7YA 3TSQA 3GOIA 3O08A 1BWFO 1S22A 3D2EA 1G99A 3P4IA 4RWTA 1HKGA 3UKRB 4CZEA 4EHUA 5EY4A 3IUCA 3H45C 4DQ8A 5KPZA 3TPQA 3EKUA 5AQYA 3VF6A 4H5WA 3C0BA 2P9UA 3H1QA 4IXCA 3CJ9A 4WQ5A 1GLFO 2PBDA 4EIAA 3VEOA 2I7PA 5AQLA 3LDPA 3FE1A 2J4RA 1TUUA 4B1YB 2I7NA 5BRDA 5LY3A 3UE5A 1QZ5A 4QS7A 2VCPA 5B8HA 1GLJO 4M7YA 3A5OC 3WT0A 2VYPA 4CBUA 3ZETB 4CZKA 4BC5A 4BRLA 2P9SB 3DJCA 1SZ2A 4BR0A 2QWPA 2ZWHA 4FWLA 2E2NA 3HTVA 1BU6O 1NWKA 1T6DA 3DXKB 5AQWA 4AM7A 2QWNA 2P9NB 1NGDA 1XUPO 4IO8A 4PKHA 3VESA 3JS6A 2P9PA 3F9MA 4I6MB 3S41A 4CZHA 2P9LB 3O80A 4EFHA 4BROA 4BG8A 4EHTA 2YHYA 1BA1A 1ZC6A 2Q97A 1Y64A 2HF4A 3JXUA 1YXQA 1YVNA 4FWQA 2Q0UA 4CJ7A 5EXWA 5AQOA 2NLXA 5BPNA 1NGIA 4NB4A 1TUYA 3M1FA 3KVGA 3CJAA 2Q1NA 5KPRA 5FPDA 1HX1A 4WQ4A 3TTDA 2QWOA 5AQNA 4B9QA 4JHDA 2GWJA 1YUWA 1ATNA 2FSJA 4JNEA 2GUPA 3C7NA 3D2EB 3W0LA 1RDWX 1X3MA 1TYQA 1HLUA 1SAZA 3J8AA 1IG8A 3O8MA 1DGKN 3FZFA 3TTFA 3VETA 4BR5A 3UKRA 2NRHA 4CD1A 3AARA 1U6ZA 2E20A 4YDUC 3CQYA 1GLCG 1DEJA 3L4IA 4K25A 1KXPA 2CGJA 4LC9B 1XC3A 4FWNA 4H5RA 4DB3A 1JCFA 4ISEA 5TKYA 3ENOA 4B1WB 2W41A 1BOTO 4JN4A 5EVZA 3ZETA 1C0GA 3VF2A 2ASPA 2P9SA 4J8FA 1V4SA 2YI1A 4BR4A 1NGCA 4M63C 4HTLA 3DXKA 5AQFA 4B1UB 3BF1A 5F1XA 4I6MA 4FWMA 4F9OA 2A40A 2P9LA 3UB5A 3TTCA 1BO5O 4MO5A 3GL1A 2DPNA 2A41A 3QBWA 1LOTB 4CZFA 1D4XA 4RTFD 1X3NA 2ASMA 3U8XA 4K42A 4A62A 3R6MA 4H0TB 2A6AA 1BDGA 4H5VA 4K43A 3SJHA 1NGBA 3W3DA 4B1XB 5BRFA 2E88A 1XQSC 3WEEB 2E2OA 3KHYA 2Q0RA 4H0VB 1EQYA 3ENHA 3SMPA 2D0OA 3VGMA 1RFQA 1NLVA 3SK3A 4BRDA 3DXMB 4A61A 2W40A 3VERA 4BRQA 2Q31A 5CE3A 5AZIB 1ESVA 1GLEG 3MN5A 2QM1A 4PL8A 4WYBA 2FLOA 3VENA 1BA0A 1SQKA 3CQXA 1BG3A 3CJCA 4A2AA 1NBWA 3GDQA 4BRMA 3U9DA 2E2QA 4PKIA 1QHAA 4FOEA 4GNIA 3BP8A 4L3QA 5KPTA 2QWMA 2V7ZA 4BR7A 1Z05A 3MN9A 1QQOA 4CZMA 3LDQA 3FR0A 5EOYA 3D2FB 3DWLA 3EL2A 2QXLA 3VEVA 4FWKA 3WXIA 4MO4A 4FSVA 4JAXA 3IDHA 3LDOA 2NZTA 2Q2RA 3CIPA 3G25A 3VEXA 1DKGD 5BPLA 5AQRA 1K8KA 1NM1A 3LL3A 2CGKA 4BRFA 2P9IB 3MCPA 5ADXH 1GLDG 2A42A 1HKBA 3MDQA 5AQMA 2BUPA 3I33A 4JD2B 4O5FA 2A3ZA 1NGJA 1Z6RA 3ZX0A 4BR2A 2FSNA 3O5BA 3FZMA 2V52B 4BQZA 2YCHA 3IFRA 2PAVA 2GELA 3HM8A 2ZF5O 5F2RA 3SMSA 4BVPA 2KHOA 2FXUA 2AA4A 3VOVA 4HWIA 3WEEA 4DCHA 4H0OA 3MN7A 4WQ5C 3ULEB 3SLCA 3VF4A 5BR9A 4FWSA 5AQIA 3DXMA 5AFUH 1MWKA 4XEIA 1QQNA 4BREA 2CH5A 5FPMA 4BC4A 1T6CA 4CBWA 5AQUA 4MLEA 5AZIA 3BEXA 4BRPA 3CHWA 4NO7A 2H3GX 5BN8A 1LCUA 3M3ZA 4BVOA 2UYTA 4CD3A 4IJNA 2QWQA 2CH6A 3CJ1A 1HUXA 4H0PA 5FPNA 3A5MC 1ATSA 3R9PA 3AY9A 1V4TA 1MA9B 2FF6A 3VEZA 2QWLA 5AQJA 4BC2A 3VGLA 4FPAA 4KBOA 2WUSA 3WXLA 1KAZA 3D2FA 4BQLA 2IVOA 4EAHD 1GLLO 5E84A 2E1YA 1K8KB 4A2BA 3O1WA 1GLAG 1MDUB 3B8AX 3H3NO 4Y0WA 1KAXA 3OHRA 5AQSA 5LJVA 3CJ7A 1WUAA 3QB0A 3TU5A 4BR9A 3I8BA 4WQ4C 4XH5A 4CZJA 1QQMA 2P9IA 5FPEA 2EWSA 5AR0A 5JLFA 4JD2A 1HPMA 1E4GT 2GTDA 2FSKA 2BTFA 4QS9A 1MWMA 3H46O 1HJOA 3GBTA 1H1VA 4CZIA 4BGBA 1NGGA 5AQZA 2FF3B 3LM9A 5AQPA 3ULEA 1T44A 1U2VB 3GG4A 3UKUB 3QFPA 1NGFA 2AP1A 1ZXOA 1RGIA 3FZHA 5ELZA 4BGAA 2IIRA 5ADXA 1WOQA 2YJEA 3FFKB 4E1JA 4CZLA 5AQHA 3VTHA 2OANA 4H5NA 3LDNA 4YDUA 3CERA 4B1VA 5AQQA 4ISFA 4FWRA 1GLBG 4RCHA 4FL9A 4IJAA 3O4WA 2QW9A 1KAYA 2YHXA 3MK6A 3VEYA 2GEMA 3U4LA 1YAGA 3BUZB 1OKJA 4H03B 1X9JA 3HBTA 4O8KA 2YJFA 5BPMA 2D0PA 3ZEUB 4QS8A 3RSEB 3TSPA 4FOIA 3ZX3A 5AFUA 4MLHA 5I9EB 2VWBA 4H5TA 4XH4A 4BRHA 3A8YA 3A0IX 1JCEA 3HSCA 4BRGA 4ISGA 2V51B 4BG9A 2HMPA 2A5XA 1C0FA 3BF3A 4IZ9A 3QBXA 3H6EA 3O6WA 4FWPA 3VPZA 3WQUA 2F9TA 3FZLA 1QZ6A 4CZGA 4M7XA 5LJWA 5AQXA 3H1VX 2QWRA 5JICA 1ZBSA 3A5LC 3M6GA 5AZJB 1E4FT 2ITMA 3EZWA 4B1ZA 3H3OB 2ZGZA 2P9KB 3CETA 3L6QA 3MN6A 4BRAA 5KQDA 3U9ZA 5E26A 3ATUA 5F0XA 2E1ZA 4H0XB 1R59O 2D4WA 3LM2A 4K41A 1BUPA 1HKCA 5BREA 2CGLA 3WQTA 2IVNA 1U2VA 3VEWA 1J6ZA 1NGAA 3WXJA 3UKUA 5BN9A 3HI0A 2P9UB 2IVPA 5BRHA 2Q36A 4BRIA 4PKGA 3EO3A 3EN9A 1JCGA 5KQ8A 4PL7A 3L0QA 1NMDA 3QICA 3IMXA 3A5NC 4XH1A 3HZ6A 4GY2B 3MMVA 2D1KA 3DAWA 3EKSA 5JLHA 5EX5A 3CI5A 2HF3A 4BC3A 1S3XA 4FO0A 1NGEA 3FGUA 3ZEUA 1IJJA 4CBXA 3R8EA 3RSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJPA 3AAPA 1M1KO 4B3OA 3VGKA 1CZAN 3KLHA 2GX9A 3O1BA 2KW4A 1EETA 1HRUA 4FPBA 2F9WA 3ZSQA 2ATQA 2NRTA 1Q9XA 3GE1A 4BRCA 4IWVA 3QFUA 4CI6A 4K0KK 4FWOA 3KZBA 3DM2A 4BRNA 5AZJA 1RT3A 2WC9A 3VQ8A 3KD1E 4B9LA 3L3UA 3C7NB 5AQKA 3TR8A 4YOVA 2HOEA 3GOIA 3O08A 1BWFO 3V1OA 1G99A 2IDOA 5HROA 1HKGA 4QOZB 4LSLA 3AVMA 3UKRB 1RT1A 4EHUA 1KVBA 3K0SA 3LWMA 4E7KA 4DQIA 1M90O 2QXFA 3TPQA 3VF6A 4H5WA 3H1QA 2P9UA 3VEOA 1TUUA 4KHQA 4OO1J 5B8HA 4E1MA 3WT0A 3VQ4A 3RMAA 4BC5A 2G8FA 4BRLA 3D45A 1S6QA 2G8UA 4N76A 1UA0A 3TARA 3AVIA 3HTVA 1RT5A 3DXKB 4YOWA 5AQWA 1NGDA 4C8NA 1YI2N 3VESA 3C65A 2P9PA 3DLKA 3LQUA 3O80A 4BG8A 1JLQA 2YHYA 1REVA 4IG3A 5CYMA 4JI2K 1L5UA 1N34K 4IOAL 4CEOA 1N6QA 4O8UA 1Y64A 2HF4A 2HBKA 2O8BA 1YXQA 1YVNA 1L3SA 4FWQA 5E41A 4FM2A 4DV7K 4DU4A 4ELUA 3LPTA 1K7JA 3DOLA 3M1FA 3CJAA 5M1KA 5FPDA 2YKNA 1HX1A 3TTDA 4A57A 3OYFA 1ASUA 4B9QA 4NYNA 4C8LA 2FSJA 1K4IA 2QTDA 4DSLA 1SAZA 3SQ2A 1JLBA 1GOAA 5IT9O 4DQRA 3NMUA 4B08A 4DV5K 1DGKN 3QLHA 4DS4A 3LPUA 3K57A 5M1NA 1U6ZA 4P77A 3EZ5A 2F8TA 2E20A 2KTQA 4BDPA 4DSKA 1P90A 3L4IA 4PQUA 3CM5A 4K25A 2IS3A 3SUQA 4U67L 4BACA 4ISEA 1HNXK 5TKYA 1J5OA 2P51A 4B1WB 2JWKA 4JKEA 5EVZA 3ZETA 3MX5A 1C0GA 2P9SA 3SBGA 3S3OA 4PWDA 4BR4A 5HBMA 5AQFA 2W42A 2XY8A 5D3GA 1VSJA 2G8WA 1RTJA 1S5JA 2P9LA 2O8BB 4G9ZA 3SQ4A 4DU3A 4MO5A 3IS9A 3CF5L 1D4XA 2HNZA 3EE8A 3J7ZO 4RG8A 5C2DA 1VSDA 4Z4IA 4GW6A 4H5VA 2G8HA 4K43A 3SJHA 3B6OA 3W3DA 3RR8A 4B1XB 2E88A 3THWA 3EYZA 1KK9A 2WBNA 1SKRA 3J81O 1EQYA 3DMJA 3ENHA 3SMPA 4JS5A 4DF8A 3SK3A 4BRDA 4IDHA 4CIGA 1EXQA 1TK8A 1QTMA 3MEGA 2O8EB 3NFAA 4YNQA 3RRGA 4FJLA 3MN5A 1NJIO 1IKWA 1HPZA 1BL3A 1S9GA 3CJCA 1C6VA 4A2AA 4YOYA 4E1NA 4FOEA 4GNIA 4L3QA 4KV8A 3P5JA 2V7ZA 1Z05A 4JKGB 4DSJA 4CZMA 4DQQA 3LDQA 3FR0A 4O55A 5EOYA 3LAKA 4AHTA 3WXIA 1SKSA 4PUOA 2KKZA 1HNIA 3IKMA 4B8CA 4IEEA 1DKGD 5BPLA 4YHHK 4DTMA 5JS1A 5J2NA 1L3TA 1SL2A 4CJ3A 3MDQA 1RTDA 1EWRA 5FDLA 3I33A 4JD2B 1NGJA 4BR2A 3ZX0A 3O3HA 4DMNA 3SNNA 3CYMA 1RT4A 4ELTA 1KFDA 3L3VA 3HOTA 4IOXA 2AA4A 3WEEA 1BCOA 2DY4A 3VMFB 1I39A 3SLCA 4WFAL 1WAJA 1MWKA 3ZSVA 5I3UA 1QQNA 3EEQA 1F21A 1T6CA 4CBWA 5AZIA 3T1HK 4NO7A 1C0MA 4CHYA 3M3ZA 2UYTA 1B9DA 4CD3A 4CGIA 2QWQA 4FLTA 4FCYA 3HYFA 4H0PA 4Z4FA 3R9PA 1V4TA 2FF6A 3ZYYX 5AQJA 3AO2A 4CJTA 3SV4A 2WUSA 1JLEA 3WXLA 4N56A 3QINA 4UY8O 2QKBA 3BY5A 4BQLA 1GLLO 4X66K 4DV3K 3H3NO 4Y0WA 4CGGA 5LJVA 4CF1A 3ULDA 3TAEA 3WNHA 4BR9A 4Q0BA 1SS6A 1T3VA 5M1QA 3M8SA 4CW7B 2NRXA 1BGXT 2P9IA 1VQKN 4CE9A 1KVCA 3J7YP 3DLLL 3TAGA 2JGUA 5AR0A 1GOCA 3AGKA 4C1NI 3CMEN 1ZBUA 2FSKA 3TAMA 4CHQA 3RVCA 1MWMA 2EX3A 3H46O 2UUAK 3KJVA 5MLCQ 3FFIA 1H1VA 4B8AB 3RRHA 4LSNA 1Q86O 5A2QO 3QEWA 2FBYA 4FLWA 2G8KA 3TAQA 4KHNA 3UKUB 1ZXOA 4B9NA 4AHVA 4JK8A 1UA1A 2KFNA 4E7IA 2D0CA 1JL1A 2YJEA 3FFKB 3VTHA 2OANA 4H5NA 3RTVA 2F96A 5AQQA 4ISFA 5HRSA 3OS2A 1TKTA 3VQBA 2QW9A 1KAYA 3MK6A 4ICLA 3VEYA 3BUZB 1OKJA 5IWAK 4LF5K 4IFEA 3HBTA 3SUNA 1VQMN 4DTNA 2P5GA 1VSMA 2KLAA 2OZMA 2HBLA 2OTJN 4CF9A 3A8YA 4CVNE 3QESA 1JCEA 3DYAA 3L2VA 3ZSOA 4ISGA 3DI6A 3RWUA 2HMPA 3PUFA 4OKKA 1C0FA 3QBXA 4OGCA 5KTQA 2F9TA 2JLEA 4FJMA 1VSEA 1QZ6A 4EZ9A 2YNHA 1TK0A 4CJSA 1YVUA 4PY5A 4BWMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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