3VEWA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz in complex with adp
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
567
structure length
567
Chain Sequence
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 191
structure length 567
sequence length 567
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vewA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vewA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vewA03
3AAPA 2I7NA 3WXIA 3VF6A 2A3ZA 4A61A 3A8YA 4CZEA 1GLBG 4CZKA 1TYQA 3CJAA 3TSPA 3GG4A 3DXKA 5AQZA 1HLUA 2CH5A 3FZHA 3H3NO 5JMVA 2E88A 3VEVA 3ATUA 4PKGA 4H03B 4B1YB 3CQYA 2DPNA 2ASMA 2NRHA 4JAXA 3WT0A 3M1FA 1Y64A 3R9PA 1XUPO 3D2EA 3IDHA 4H5NA 3ZEUB 5CE3A 2GWJA 5BN8A 2Q1NA 2I7PA 2HOEA 2UYTA 3H1QA 1WOQA 1GLDG 3H6EA 3KHYA 1BG3A 1T6DA 3O6WA 3HZ6A 3IMXA 3ZEUA 3CHWA 3QFUA 1LOTB 3FZFA 5ADXH 4BR5A 1JCEA 5BRFA 5KPRA 3FE1A 3ZETB 3MCPA 4BR2A 4FWLA 1GLLO 5AFUA 2E2QA 1ATSA 1G99A 2Q0RA 1NGEA 3CIPA 1NBWA 4CZMA 1KXPA 4FWMA 4BR4A 4FWSA 4H0YB 4HWIA 4M7YA 2FF6A 4BRQA 4BVPA 1NWKA 3SJHA 2IVOA 3MMVA 2P9KB 5AZIB 4DB3A 4WYBA 2FSKA 1YAGA 4WQ4A 4BREA 2J4RA 5AQRA 2YHYA 1HJOA 5LJWA 2GUPA 3VPZA 4BRIA 2P9NA 2IVNA 3ATVA 3QDKA 1GLFO 5AZIA 2BUPA 4J8FA 4WQ5C 3F9MA 5JICA 4M63C 4ISGA 1MWKA 3UE5A 5AQHA 4A2BA 1HKGA 3GDQA 3M6GA 3MN5A 4JHDB 3M3ZA 1ZC6A 2CH6A 2V51B 3FLCO 1JCGA 4KBOA 4BRFA 4I6MA 4BRKA 3FR0A 1D4XA 5AQLA 3G25A 3SK3A 5FPEA 1HKBA 1NGDA 3ULEB 4BC3A 2YJFA 1BWFO 2Q0UA 3O1BA 4JD2A 3UB5A 4PL7A 3TPQA 1X9JA 3SLCA 1U2VB 1NGGA 1SZ2A 3ENHA 3VETA 1KAXA 3QICA 2D0OA 2P9PB 1IJJA 3ULEA 3UKRB 2VWBA 4PL8A 3C0BA 4BC2A 4Y0WA 3KZBA 1TUYA 3WXKA 1U2VA 3VEWA 2E2PA 4FWRA 4BVOA 3TU5A 1V4SA 3CJ7A 4BRGA 3BF3A 2P9PA 3GOIA 4CBWA 4CZLA 1NM1A 4B9QA 1IG8A 4H0OA 3DJCA 3RSEB 2AA4A 3FZLA 5BPMA 3TTFA 4EAHD 4H5RA 4K43A 2Q97A 3VEXA 4FOIA 4LC9B 2CGKA 4A2AA 2IIRA 3RSEA 5AQUA 4RTFD 5F2RA 4GY2B 4CI6A 2D1KA 1RGIA 3EL2A 4JNEA 2P9UB 5AQQA 5AFUH 2GELA 5AQGA 3A5OC 5BN9A 4CBXA 3JXUA 3AAQA 3TTCA 2EWSA 4H5WA 4BC4A 4BRLA 2P9LA 1TUUA 3D2FB 2CGLA 2F9WA 1QQMA 3VTHA 1GLAG 3H45C 4QS8A 3S41A 3VOVA 3O4WA 1P8ZA 4BQZA 4BGAA 4B1WB 3FFKB 4IXCA 4IWVA 1KAZA 5F1XA 4H0XB 3A5MC 4FPAA 1EQYA 1YVNA 2QWQA 2VCPA 3WXLA 3GBTA 3LDOA 3VEOA 4FWQA 4AM7A 3CI5A 4BR7A 1QHAA 3O5BA 1MDUB 5JLFA 1LCUA 4FO0A 2PBDA 4K42A 2QXLA 5BRDA 1WUAA 1R59O 3W3DA 2A6AA 3U9DA 2FSJA 5FPMA 4BRPA 3CJCA 1E4FT 2WUSA 2A41A 3H3OB 4BG8A 3MN6A 3LDPA 1BU6O 2AP1A 3H46O 4PKIA 3VGLA 4A62A 1K8KB 3CETA 3A0IX 3ZETA 4FOEA 4WQ5A 3HTVA 5AQKA 1XC3A 2H3GX 4BROA 1SAZA 3WQTA 4CJ7A 4Z94A 5BPNA 4FWOA 1V4TA 2ZWHA 2QWNA 2P9KA 3EN9A 3MK6A 4ISEA 2Q36A 1Z05A 4B1ZA 4MO4A 2QWLA 1NGFA 2QWPA 4FWPA 5BRHA 2YHWA 5AQNA 3QBXA 3C7NB 4F9OA 3MDQA 2PAVA 4CZIA 1RFQA 2ZGZA 2Q2RA 4QS7A 1GLEG 3DWLA 1GLJO 2P9IB 3AY9A 3UKUB 1BUPA 3A5LC 4FWKA 3IUCA 4BQLA 4H0TB 3WEEB 4CZHA 4MLEA 1T44A 4BRNA 4XEIA 1BOTO 1ESVA 4H0VB 2QWRA 4JHDA 1DKGD 4MO5A 3LDLA 3LDQA 4YDUC 1HUXA 3O1WA 3CJ1A 4CD1A 2YHXA 4ISFA 5KPTA 4QS9A 3TSQA 3IFRA 4E1JA 5BR9A 2ZF5O 3VF4A 4EIAA 3VGMA 2HF3A 3LM9A 3LDNA 2ASOA 2Q31A 3DXMB 3SMSA 4BR9A 2GTDA 2VYPA 5LY3A 2V7ZA 5ADXA 2F9TA 3FZKA 4PKHA 3UKRA 2YI1A 3DXMA 4EHTA 4XH4A 1KAYA 2OANA 1HX1A 5F0XA 5EVZA 1OKJA 5AQTA 1NGHA 4B1XB 4JN4A 2W41A 3TSUA 1NGJA 3H1VX 3WXJA 3HSCA 5E26A 3MN7A 4H5VA 1C0GA 1J6ZA 3U4LA 2E1ZA 3QB0A 4GNIA 2FF3B 4IO8A 1QQNA 4BG9A 1ATRA 2E2NA 5AQIA 4RCHA 2W40A 5KQDA 4DCHA 4M7XA 3ENOA 2NLXA 2BTFA 3BUZB 1NMDA 5AQFA 1NGAA 4BRCA 2P9UA 3DAWA 4BRMA 3KVGA 5I9EB 2KHOA 3CERA 3L0QA 5E84A 2YJEA 4B1VA 5AQSA 1Q18A 3D2FA 3WUHA 3QFPA 1SQKA 2FSNA 3ZX3A 3DXKB 5EXWA 1ZXOA 5BREA 2FXUA 4BRDA 2V52B 4IJNA 1QQOA 1S22A 3WQUA 3I33A 1HPMA 3D2EB 1YXQA 1ZBSA 4HTLA 2E2OA 2A42A 3BEXA 1HKCA 5LJVA 2GWKA 4EHUA 4L3QA 3VGKA 4H5TA 3W0LA 3EKSA 3LL3A 5AR0A 3JS6A 4CZJA 4B1UB 3R6MA 1H1VA 3VESA 2E8AA 3LM2A 1JCFA 3CJ9A 4XH1A 3VEYA 1BA0A 3QBWA 4BGBA 2ASPA 1QZ5A 3U8XA 4H0PA 4C23A 3I8BA 5JLHA 4DHYA 2E1YA 5EOYA 1MA9B 1NGBA 5FPNA 1K8KA 3U9ZA 3VERA 4DQ8A 4CD3A 1C0FA 1X3NA 1NGCA 4K41A 2ITMA 1BDGA 3R8EA 5TKYA 5AQJA 2HMPA 5AZJB 1XQSC 3L6QA 4FSVA 3O08A 3VEZA 3O8MA 4RWTA 2P9NB 2P9SB 2A40A 3A5NC 4MLHA 4CBUA 3HM8A 4YDUA 3FGUA 4AM6A 5FPDA 2IVPA 5B8HA 2E20A 2QWOA 5AQOA 5AZJA 1MWMA 3C7NA 3HI0A 2HF4A 2P9SA 1NLVA 3QMLA 3CJBA 2P9IA 5AQVA 3UKUA 3VENA 3BP8A 4IJAA 4I6MB 3ID8A 4WQ4C 1BA1A 2V7YA 3D7EO 4O5FA 3WEEA 3ZX2A 4O8KA 3BF1A 4FWNA 1NGIA 1X3MA 3HBTA 3O80A 5EY4A 4JD2B 2QW9A 3EKUA 5AQMA 5KQ8A 1RDWX 3TTDA 2A5XA 2CGJA 4BRHA 1Z6RA 1DGKN 2QM1A 5AQXA 2ZGYA 4IZ9A 4CZFA 5BPLA 3VF2A 3ZX0A 5AQYA 1QZ6A 4FL9A 4EFHA 1E4GT 5ELZA 1S3XA 2YCHA 2FLOA 3EZWA 3AARA 3L4IA 2D4WA 5AQPA 5KPZA 3GL1A 1T6CA 1ATNA 2D0PA 3OHRA 4CZGA 4NO7A 3GE1A 3P4IA 4FPBA 1YUWA 3FZMA 4K25A 4NB4A 3EO3A 5EX5A 3MN9A 3B8AX 1BO5O 4XH5A 2GEMA 4BRAA 3J8AA 4BR0A 2QWMA 3SMPA 2NZTA 1CZAN 5AQWA 1DEJA 1GLCG 2P9LB 1TYQB 4BC5A 3CQXA 1U6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJLA 2JWLA 1FK9A 2I7NA 1KK9A 3VQ4A 4DFMA 4A61A 3R3LA 2VQFK 3CJAA 3TSPA 3DXKA 3LRJA 4B3SK 3FZHA 4AQYK 3EY1A 2E88A 3B6PA 3ATUA 3CM5A 4PKGA 3T69A 2HHQA 4B1YB 3CQYA 1J53A 3WT0A 3R9PA 5FLXO 3D2EA 4FJ7A 4CEBA 3PIOL 4JKEA 1BIUA 5MLCQ 1ZBUA 3DLKA 3H6EA 1T6DA 4CEQA 3O6WA 4A5AA 1UWBA 3ZEUA 4B3OA 1QQCA 2HHSA 3HT3A 3VA3A 4CEDA 5CYQA 2RN2A 1YTAA 3JSMA 1HPZA 3I55N 2W42A 3NHGA 3P5JA 2D0CA 4RW7A 4LF6K 3AV9A 3TI0A 4EZ9A 2Q0RA 4DSFA 1TVRA 1NGEA 1WBBA 3CIPA 1NK4A 3SJHA 2YNFA 3CCLN 1IBKK 1WSFA 4Z4IA 3LQUA 3TR8A 4BREA 5AQRA 1GOAA 1HJOA 2IOCA 4CGIA 3AVAA 1XWLA 1GLFO 4ZTFA 1HNVA 3HM9A 3OYEA 1JXEA 4J2EA 2BUPA 1GOBA 3M8QA 5JICA 4M63C 3I0SA 3M6GA 3MN5A 3RR7A 1S6PA 4FJ5A 1ZC6A 1KLMA 2V51B 3FLCO 1NK8A 1WNSA 3OYBA 4CF9A 1KRPA 4FVUA 2R7YA 2YJFA 3L2VA 4JD2A 4BDZA 4PL7A 2ZJQL 3TPQA 1X9JA 3O9RA 3SLCA 2O4IA 3C95A 3C65A 1NGGA 3ENHA 3VETA 4C1NI 4CIEA 3QICA 1IJJA 3CFOA 5FDLA 5IWAK 1NK7A 2NRZA 3UKRB 4O44A 3K57A 4JS5A 4Y0WA 1U04A 3OYFA 1TUYA 3WXKA 1EP4A 1YJNN 4BVOA 4KHNA 3TU5A 3QIOA 4GW6A 5E41A 1NJXA 3AVKA 1FJGK 3BY5A 1WBDA 1IG8A 3RSEB 2WC9A 3FZLA 1YJ9N 4IOXA 4JV5K 3DM2A 2IIRA 2ZD1A 3OS0A 4CI6A 2D1KA 4P8JA 1RGIA 3KK1A 5SZTA 1BQNA 2P9UB 4KV8A 2Y1JA 4YOVA 3SPZA 2HHWA 4BRLA 2P9LA 4DF8A 2F9WA 3O9QA 4ICLA 3SI6A 3VTHA 1JLFA 3ID6A 4QS8A 3S41A 4Q5VA 2QA4N 4AHVA 1P8ZA 1VAZA 4IO9L 4IDKA 3QLHA 4M3XA 2KFZA 5F1XA 2G8VA 3THYA 4I14A 4CJEA 3D45A 1EQYA 3TAGA 1UA0A 3WNEA 5CHIA 4FWQA 4B08A 3LP1A 3ENBA 1QHAA 1MDUB 1NJWA 4FCYA 3EEQA 2OYQA 1CXQA 2IC3A 3AVJA 1QSYA 2O8CB 1S9EA 1S1VA 4DR5K 4BRPA 4E3SA 3SPYA 1N8RO 2OPPA 2RIUA 1K6YA 4BG8A 5C2DA 3LDPA 2BDPA 3H46O 3HXMA 1T8EA 1KFDA 4PUOA 1I94K 4FFJA 1RT7A 4FOEA 5J2QA 4KKOA 2ITGA 4CJ7A 3VQ8A 3LALA 4Z94A 3OYJA 3RTVA 5BPNA 1CLQA 3NMUA 5FROA 2P9KA 5I42A 4B1ZA 1QVFM 3ULDA 2YHWA 1FW6A 3A2FA 4EZ6A 4LF7K 3OS2A 2PAVA 4CE9A 4O4GA 2RISA 4KHPK 3DWLA 1GLJO 3SCXA 3IUCA 4BQLA 2W6LA 4H0TB 4CZHA 4X64K 3L2RA 3UIQA 3LZIA 4H0VB 2F8TA 3KLIA 4JHDA 3ZYYX 3PX0A 1HUXA 5HOOA 3CJ1A 3ZT1A 4DV6K 3IFRA 3VF4A 1S6QA 4EIAA 1D9FA 4FYDA 1ILYA 3LDNA 4WE1A 5LY3A 2V7ZA 4FW1A 2FBVA 1JLCA 3M5RA 1ZYQA 3NFAA 3V81A 1N6QA 3LP2A 3BZCA 3CC4N 4DQPA 4H4MA 3C94A 1HX1A 2RHKA 2VWKA 1NGHA 2KQ2A 2W6KA 1WSIA 1C0GA 4IG0A 2E5LK 4DV3K 3FFIA 1K4PA 3SAFA 3T1HK 3MWTA 4M7XA 4E19A 3BUZB 3QNOA 1NMDA 1NGAA 3HL8A 4NCGA 4E1NA 1YF5L 5I9EB 3BZKA 3CERA 1G15A 2QXFA 2YJEA 4CHOA 1TL3A 3J7AP 3QERA 1Q18A 4KTWA 3WUHA 1Q9YA 4BE0A 3ZCMA 1I3AA 2RF2A 3DXKB 4AHTA 4DTUA 4F8RA 3J7ZO 3QINA 2G8UA 2V52B 4IJNA 1UA1A 1A5XA 3WQUA 3AVHA 3D2EB 3RMCA 4HTLA 4BWMA 3L2QA 5IT9O 4DUYK 4DMNA 1RDDA 4C8MA 4CJQA 4L3QA 3IG1A 3VGKA 3THXA 1VSFA 3OYIA 4YFUA 2P5GA 3PX4A 4CZJA 3JS6A 1ZBLA 2UXBK 1YTUA 4FJKA 3TAPA 3U8XA 4OX9K 2KFNA 3DRSA 2QTDA 4DHYA 2E1YA 3KWIA 5EOYA 4JS4A 4IBNA 3G10A 4CD3A 1TKXA 1C0FA 2ITMA 3HRGA 1BDGA 3R8EA 1Z26A 2I5JA 4GV3A 4DTJA 2HMPA 3T7ZA 4FSVA 1TKTA 3VEZA 2P9SB 3FGUA 4W5QA 4CJUA 3QEXA 2HF4A 5C12A 4CFBA 1NLVA 3P31A 5GIOA 3CJBA 3UKUA 3VTIA 1VQ9N 1NMNA 4WQ4C 3D7EO 4O5FA 4FJXA 4GKKK 1KCFA 4O8KA 4WFBL 3NF6A 4HHTA 1QVGM 1HMVA 4FWNA 3HBTA 1X3MA 3O80A 5GAHP 3VQAA 4JD2B 3EKUA 5AQMA 5BR8K 5KQ8A 3J81O 3CFPA 2PFUA 1ASUA 5AJ3K 4BRHA 1HYZA 1DGKN 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 3OTO K;  2O8D B;  3HVR A;  4DTP A;  3SQ1 A;  3K5L A;  4PKH A;  3UKR A;  2YI1 A;  4OLA A;  1EX4 A;  3DXM A;  1RDA A;  4CJT A;  1KAY A;  2OAN A;  2OPQ A;  4PWD A;  4O0J A;  3KKS A;  4CJL A;  5EVZ A;  1OKJ A;  5AQT A;  3I8D A;  3V4I A;  1Q81 O;  3RVC A;  3AGR A;  4FK2 A;  3TSU A;  3WXJ A;  1KSP A;  2WOM A;  4N76 A;  3P38 A;  2DFH A;  3SQ4 A;  2E1Z A;  3QB0 A;  4GNI A;  2FF3 B;  1RDC A;  4BG9 A;  2E2N A;  3OYH A;  1HNW K;  3TAF A;  4GVE A;  3CC2 N;  4J2B A;  3KD5 E;  4QCL A;  2W40 A;  3E9O A;  3VQ6 A;  4OPK A;  4DQR A;  2NLX A;  3RRH A;  2BTF A;  2ZJR L;  2P9U A;  3SUN A;  3VQ5 A;  5E84 A;  3K5O A;  5AQS A;  5KGW A;  4BDY A;  2HNZ A;  3SV4 A;  4NYN A;  4B9S A;  1T3V A;  4MFB A;  2NRT A;  1O1W A;  5EXW A;  1Q7Y O;  4NCA A;  4RG8 A;  1NK9 A;  1TAQ A;  1QQO A;  4Y1C A;  3SJJ A;  2OPR A;  1HPM A;  2UUA K;  4DF4 A;  1HKC A;  4EP4 A;  3DLE A;  3PO5 A;  1UAX A;  2P51 A;  5LJV A;  1RTD A;  2G8F A;  1LWC A;  3OYK A;  4H5T A;  4JKC A;  1B92 A;  5GIN A;  1RT4 A;  3LL3 A;  3AO2 A;  3OA9 A;  3RMA A;  3R6M A;  2OZS A;  3K58 A;  1LAW A;  4BAC A;  2E8A A;  2O8C A;  3VEY A;  4OGC A;  1BA0 A;  3QBW A;  1QZ5 A;  3V9Z A;  3ZSO A;  2Z1J A;  4A5B A;  5JLH A;  4YOT A;  1NNE A;  2HBL A;  1TK8 A;  2G8W A;  4DQ8 A;  1NGC A;  2JGU A;  1SUQ A;  1U47 A;  5AZJ B;  1WSJ A;  3J7Y P;  1JLE A;  3O8M A;  3CCM N;  4KTQ A;  3A5N C;  3AA3 A;  4YDU A;  1VSE A;  5FPD A;  5LL6 Z;  5AQO A;  2F96 A;  4IFV A;  3N4P A;  4CCH A;  3HI0 A;  1TL1 A;  2UUC K;  4R79 A;  3BP8 A;  2XY5 A;  3ID8 A;  3NF9 A;  3ZX2 A;  4W5R A;  4KI4 A;  3BF1 A;  2RE2 A;  4NLC A;  4KAZ A;  5M1F A;  4CHQ A;  1YHQ N;  1JXB A;  3NH2 A;  3G0Z A;  2QW9 A;  4DTN A;  3THW B;  3TTD A;  4NCB A;  2A5X A;  4CW7 B;  4FLY A;  5AQX A;  4P8E A;  3L2U A;  3ZX0 A;  5AQY A;  3WXM B;  1JLG A;  1E4G T;  4KHS A;  5ELZ A;  2NRV A;  2YCH A;  4A59 A;  1PVW A;  1HYV A;  4RW6 A;  5KTQ A;  4W5O A;  3NGY A;  1VQK N;  4P6C A;  3ASM A;  4E1B A;  1S5J A;  3MEG A;  1J9A A;  4RW8 A;  2NUB A;  4G1Q A;  1ATN A;  4RW4 A;  4YNQ A;  4CVN E;  4FLU A;  5J1E A;  3GE1 A;  4DQS A;  3OYG A;  3Q7B A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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