3VEYA

Glucokinase in complex with glucose and atpgs
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 165
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3veyA01
1ESVA 5EX5A 3O8MA 5BRHA 5E84A 1TYQA 4NB4A 4HWIA 4CBWA 1NGAA 5JLFA 5KQ8A 1DEJA 3IDHA 3HSCA 4H0OA 3O08A 3O6WA 4Z94A 4DB3A 1ATNA 3H1VX 4BRMA 4QS9A 4LC9B 5CE3A 2AA4A 2E2PA 3CJCA 4BRNA 2FF3B 2GWJA 3BP8A 3UE5A 4BVOA 3BEXA 2V52B 4GNIA 5TKYA 2V7ZA 3QICA 3H1QA 1NGBA 5AQIA 3TU5A 3FGUA 4MO5A 3H6EA 2NLXA 1WOQA 2A41A 3VEYA 1C0FA 1SQKA 5AQKA 4I6MB 2F9WA 1ZXOA 4FWNA 3FZMA 5AQSA 4IZ9A 3DJCA 3SMPA 2QW9A 5I9EB 1C0GA 1QZ5A 5FPMA 1YAGA 4PKHA 5EY4A 3WQUA 2YHYA 1NM1A 1BDGA 4JN4A 5AFUH 3U8XA 1NGDA 3L0QA 4H5TA 1U6ZA 3HTVA 4CD3A 1E4FT 5AQWA 3UB5A 3H46O 1GLFO 3U9DA 1KAZA 4BR7A 1KXPA 3RSEB 1IJJA 2ITMA 3D2FA 3CHWA 3QDKA 1R59O 4BRLA 2QWMA 2P9SB 2YCHA 1MDUB 4GY2B 5AQNA 3ZX3A 4B1YB 3DXMA 4BR2A 2E1YA 4FL9A 3CJ7A 1JCFA 1BWFO 2GTDA 3ZETA 4BC4A 2QWLA 1QZ6A 2VCPA 5AQYA 3I8BA 2IIRA 2CH5A 2J4RA 2NZTA 3MK6A 4Y0WA 1HKCA 5F2RA 2Q0RA 3CJ9A 1NLVA 3MCPA 3VEWA 3GG4A 3C7NB 3O4WA 5BN9A 2Q36A 4JD2A 4BRQA 4BRGA 3GOIA 3GBTA 1Q18A 2P9NA 4FWLA 1BUPA 4CZEA 2F9TA 1ATSA 2Q97A 2UYTA 3M6GA 4J8FA 3CJAA 5F0XA 2FF6A 3VF2A 4E1JA 1NGEA 3FZHA 4FWQA 3ULEA 4IJAA 2E1ZA 3AY9A 1ATRA 3EO3A 2OANA 3KHYA 2QWRA 2ZGYA 3VESA 3UKUA 4BGBA 2EWSA 3WXJA 2P9UA 4BRKA 4BC3A 3VEVA 4BQZA 3J8AA 2ASOA 2I7NA 1MWKA 5E26A 5AQMA 4BVPA 3A5LC 3LDQA 3WXLA 1D4XA 3WUHA 2CH6A 4BGAA 5AQHA 4WYBA 5AQVA 3VOVA 4BRCA 1KAXA 3DWLA 1NBWA 2P9KB 3GDQA 3R8EA 3CIPA 4L3QA 3UKRA 5BRDA 3WXKA 3LDNA 3AAPA 5AZIA 3FZFA 1NMDA 1Y64A 4NO7A 4M63C 1DGKN 1HKBA 1ZBSA 4BRPA 4CD1A 2W41A 3CQXA 4H5WA 3WEEB 4F9OA 4BRFA 4CZIA 1NGGA 1S3XA 2H3GX 4IJNA 2A6AA 3VEZA 4FOIA 3O1WA 4B1WB 1WUAA 3FLCO 4BC2A 3JXUA 4PL7A 4I6MA 3D2EA 3ZEUB 2A3ZA 4XH4A 4C23A 1HPMA 2HF3A 3ID8A 5AZJA 1HUXA 4K42A 1EQYA 1GLLO 2I7PA 2HOEA 2YJFA 1K8KA 4H03B 5BR9A 2WUSA 4CZKA 3VF6A 3HZ6A 1Z6RA 3U4LA 2IVOA 2IVPA 3AAQA 3SMSA 5ADXH 5JICA 2FXUA 4H0YB 3RSEA 4BR0A 2P9IA 3A5OC 1V4SA 1NGCA 1TUYA 2D0PA 3DXKB 4RWTA 3R6MA 1NWKA 3FE1A 5EOYA 4ISFA 3VF4A 5AQQA 2GELA 3M3ZA 2P9PB 3A0IX 4JHDB 1T6DA 1GLJO 4WQ5C 4CZMA 4IO8A 1LOTB 4IXCA 3GL1A 2QWQA 2VWBA 5AQTA 1YVNA 2D0OA 1T6CA 4FWPA 3BF1A 3C7NA 4FSVA 3O80A 5AQUA 2ZGZA 3EZWA 3LM9A 5KQDA 3JS6A 4AM7A 2YI1A 2VYPA 5BPNA 4BROA 3C0BA 5KPTA 2D1KA 5ELZA 5BRFA 4BRAA 4EHUA 3WQTA 5AR0A 4IWVA 4ISEA 2W40A 1U2VA 1HX1A 4CZFA 5EXWA 3L6QA 1TUUA 2ASMA 3D2FB 1V4TA 2A42A 4PL8A 3VGKA 1HJOA 3W0LA 5BPMA 4BQLA 4QS7A 5JMVA 3O5BA 4WQ5A 4A61A 2BTFA 5JLHA 4K41A 4FPBA 3QFPA 3O1BA 5AQFA 4B1VA 3ZETB 2GWKA 3M1FA 4H0XB 2PAVA 3IFRA 1BOTO 2P9LB 2YHXA 3CETA 3QMLA 4H0VB 5LY3A 3MN9A 3MN6A 3LDPA 2HMPA 4BR4A 5KPRA 2Q31A 4A2AA 1X3NA 5ADXA 2CGLA 2QWOA 3EN9A 4JD2B 3VGMA 2AP1A 3LL3A 2P9NB 4FWMA 3KZBA 2GEMA 3QBXA 1ZC6A 2E8AA 1NGIA 2FSJA 2Q1NA 2DPNA 4JAXA 3FR0A 2V7YA 3B8AX 3ULEB 2E2NA 3WEEA 4KBOA 4FWSA 4BG8A 1HLUA 5BREA 1T44A 3EL2A 4FWRA 5AQZA 1GLCG 3ENOA 5AQXA 4MO4A 3UKUB 3A5MC 1NGFA 3ENHA 2P9UB 4YDUC 2HF4A 1GLEG 4RCHA 1BO5O 3ZEUA 3MMVA 4K43A 5AQOA 3LDLA 2BUPA 4B1UB 4XH5A 3QB0A 4CI6A 4BR9A 5LJWA 3VGLA 3GE1A 4FWOA 4BC5A 2FSNA 3W3DA 4O8KA 4BRHA 4BR5A 1P8ZA 5FPEA 3DAWA 3SLCA 4H5VA 1HKGA 3KVGA 3UKRB 3D7EO 3VEOA 3ZX0A 3MDQA 4ISGA 1DKGD 3FZKA 3OHRA 2Q0UA 5AZIB 1TYQB 3F9MA 5FPDA 2FSKA 1QHAA 3AARA 1RGIA 1GLBG 4EHTA 4AM6A 4XEIA 3CJ1A 3DXKA 1YUWA 2KHOA 1X9JA 4CBXA 5KPZA 4YDUA 4JNEA 1QQOA 2P9PA 2A5XA 4JHDA 4BRIA 1XQSC 2P9SA 4PKGA 3CJBA 3EKUA 2E20A 2E2QA 4EIAA 1OKJA 1RDWX 1X3MA 5EVZA 3D2EB 1H1VA 3BUZB 3U9ZA 4BRDA 2QXLA 1LCUA 3WXIA 2CGKA 5AZJB 1Z05A 1YXQA 4CJ7A 3QBWA 3BF3A 5AQLA 2ASPA 1K8KB 1JCGA 4H5RA 5BN8A 2ZF5O 2V51B 5AQRA 5AQPA 1XUPO 1NGHA 1QQMA 1RFQA 2ZWHA 3R9PA 3ATUA 4MLHA 3VEXA 1KAYA 2P9IB 3CQYA 4BG9A 4H0PA 1CZAN 2GUPA 2E2OA 1XC3A 4FWKA 1MA9B 1SZ2A 3IMXA 2Q2RA 3ATVA 3H3NO 5FPNA 3ZX2A 2YJEA 3LM2A 3HM8A 3I33A 2QWPA 1GLDG 4B9QA 4B1ZA 4FOEA 5LJVA 3S41A 3P4IA 2D4WA 4PKIA 4CZHA 4A2BA 2P9LA 3VERA 1J6ZA 4CZJA 3G25A 3DXMB 5F1XA 2E88A 4WQ4C 4H0TB 1JCEA 3H3OB 4B1XB 4BREA 3QFUA 4FPAA 4DHYA 3VETA 4RTFD 3FZLA 3HBTA 3L4IA 1S22A 3MN5A 4M7XA 4O5FA 2P9KA 4CZLA 1IG8A 3SJHA 5BPLA 3VPZA 1BA0A 2NRHA 1BU6O 4M7YA 4DCHA 1U2VB 3A8YA 2QWNA 4EFHA 1MWMA 1BG3A 4CZGA 4MLEA 3FFKB 1G99A 3CI5A 1GLAG 5AQGA 4QS8A 2A40A 2FLOA 4DQ8A 3VENA 3A5NC 1QQNA 3HI0A 2YHWA 1NGJA 4WQ4A 1E4GT 3LDOA 4XH1A 3SK3A 3IUCA 2PBDA 3TPQA 1SAZA 3MN7A 5AQJA 3WT0A 3EKSA 2QM1A 1BA1A 4FO0A 2IVNA 3CERA 5B8HA 4A62A 4K25A 5AFUA 3H45C 4EAHD 2CGJA 4HTLA 4CBUA 4H5NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ESVA 3SUQA 5BRHA 3O9QA 1TYQA 4HWIA 1EXQA 2P1JA 5JLFA 3VQ5A 2KFZA 4CHYA 3HOTA 5IT9O 4Y1CA 4J2DA 3O08A 3QERA 3O4QA 3PSFA 1VQ9N 5J2MA 3G6EN 3VQ7A 1VK0A 4QS9A 4FW2A 1WSIA 4BVOA 3EE9A 4CJUA 1L3TA 4B3RK 2V52B 3CCMN 3TU5A 3CC7N 2O8BB 1S9EA 1RDUA 1VSHA 4AHUA 1VSMA 1WOQA 2OPSA 5DM6L 3LPUA 4CFDA 4G1QA 4I6MB 1JLEA 3CFPA 1ZXOA 5KI6A 2QKKA 4IZ9A 2WONA 3SMPA 3KWGA 3QESA 1QZ5A 4K8XA 1YAGA 3SQ2A 1RTHA 3CMEN 2HBJA 4GV6A 3OYNA 3WQUA 1NM1A 4H5TA 1IKXA 3IS9A 4NXMK 1YT3A 4DSFA 3UB5A 4C8LA 4E1NA 4DF8A 1KXPA 3RSEB 2ITMA 2KLAA 3CHWA 3TARA 5AQNA 3VTIA 1U4BA 2ZE2A 3ZT0A 1CXUA 3SAHA 1BWFO 2HBLA 1T7PA 2QWLA 3IRXA 3PV8A 4QCLA 3FFIA 2IIRA 2CH5A 2J4RA 2NZTA 1QS4A 1HKCA 3CCJN 4LF5K 4CHZA 1HQEA 3F9KA 4NLCA 4FCYA 1HNVA 2GX9A 1YITN 3CD6N 3GG4A 1RT2A 3J7AP 1Y97A 5IWAK 4DQSA 5BN9A 5GIOA 3LPTA 3VMFB 1TK8A 1RBTA 3S3NA 3KLGA 4CZEA 3P38A 5JVHL 1ATSA 2Q97A 1ZBUA 2UYTA 3M6GA 5F0XA 1M90O 1SKSA 3ULEA 1ATRA 3EO3A 3P31A 3RMCA 2QWRA 3QIPA 4KHSA 2ZGYA 2YHBA 3ISNC 3VESA 4NLBA 4ELTA 1IKYA 1RDBA 1W7AA 4HUFA 2YKMA 4CJSA 1XNRK 3NF6A 3VEVA 1S72N 3I8DA 1VQON 3BY5A 1MWKA 4BVPA 4A5BA 3A5LC 3LDQA 3K9JA 1UWBA 3PLAA 4BGAA 4DFPA 3E9LA 1QSSA 4BRCA 1C6VA 3JAMO 5GAHP 3P39A 4MDBA 3KJVA 1Q8IA 4KHQA 3R3LA 1NMDA 4NO7A 1BCMA 2QK9A 1VSEA 3SCXA 4AQYK 4CZIA 5JVGL 5CR4A 4IJNA 4E3SA 4B08A 4CK1A 2O8BA 4B1WB 1RT5A 1B92A 4FLTA 4KV8A 5T7BA 3JXUA 4DSKA 1CXQA 4I6MA 1ZBHA 3ZEUB 2A3ZA 1J5OA 3DOLA 2GUIA 5M1OA 1Q9YA 4HUEA 2HF3A 5AZJA 3CCEN 1HUXA 3ZSRA 3MXJA 3HZ6A 2IVOA 3THXB 3L2VA 4WFAL 3RSEA 2FBYA 3K0SA 4IO9L 1V4SA 1T05A 4JV5K 3FE1A 4DSLA 3VQ8A 3KD5E 4BDZA 2HB5A 5AQQA 1KD1O 5I3UA 4C1NK 3A0IX 1QSYA 2F96A 1WSHA 4MQ3A 4R5PA 4DQPA 4CZMA 4EP5A 4FJIA 4DLGA 2YNFA 3M5RA 1T6CA 3HJFA 1L3SA 3CPEA 2ZGZA 5KQDA 1B9FA 1R0AA 2UU9K 3QEVA 4WCEL 4CHOA 2YI1A 2NRXA 3U6FA 1D9DA 1VSKA 2VYPA 5BPNA 1IG9A 3V1QA 3T1YK 1WNSA 4BROA 3C0BA 4BE1A 5ELZA 1LW0A 3AVFA 4OKKA 4EHUA 3S3OA 3OY9A 3QEXA 2W40A 4FVMA 3U3YA 3RVCA 2YV0X 3OBWA 4CGHA 3JSMA 5EXWA 3WNGA 3L6QA 2BDPA 1P90A 1V4TA 3VGKA 3AA3A 3K58A 1DLOA 4DV5K 5JMVA 4WQ5A 4A61A 1S1WA 2O4IA 3QFPA 3ASMA 3ZETB 3IFRA 1BOTO 4M3RA 3CCLN 2P9LB 1BGXT 5C15A 1GOBA 3TAQA 2UXDK 1KLNA 3M8RA 3SUOA 3MN6A 3NH0A 4BWJA 4BR4A 5C10A 5KPRA 3F73A 1WN7A 1IBLK 3OYLA 1X3NA 1I39A 3LL3A 3NBPA 4FWMA 1ILYA 3VQCA 2GEMA 3CG7A 1ZC6A 2OZSA 1I3AA 2E8AA 3NE6A 2DPNA 4YOXA 3FR0A 3WNFA 4IDKA 2E2NA 4FWSA 4BG8A 4ILJA 1T44A 2UXBK 5AQZA 3ENOA 5AQXA 3UKUB 1HPZA 3Q7CA 1VQ6N 3OJUA 3TAPA 2P9UB 5M1KA 1L3UA 3ZEUA 3MMVA 4CJPA 3LDLA 4GW6A 3RRHA 4B1UB 3QB0A 2ETJA 1FKPA 4BR9A 1C0TA 3TSUA 3GE1A 4JK7A 3V1OA 3SAFA 4JRQA 2FSNA 3E1YA 5FPEA 3DAWA 1QSLA 5KGXA 4H5VA 1N5YA 1WLJA 2VG7A 4CJQA 5HRNA 3KLFA 4NCGA 3AVHA 4ISGA 4X64K 3FZKA 3KTQA 5FRMA 3THXA 3CYMA 4RG8A 5AZIB 4YORA 1QHAA 3AARA 1RGIA 4BE2A 1GLBG 4CE9A 4EHTA 4GV9A 4XEIA 3Q7BA 1DTTA 5TKWA 1XHXA 1YUWA 4IBNA 1TAUA 2HVHA 4YDUA 4HCCA 1Q9XA 1C0UA 3QNNA 1OVYA 1OH6A 3OYIA 3EKUA 1OKJA 4ILGB 1WBDA 1N34K 1ZBIA 3E9PA 1H1VA 3BUZB 4O5BA 4MDAA 3HOSA 4FLZA 4JKDA 4M3TA 3S3MA 2NRWA 3G0ZA 3CM5A 1WSEA 3E66A 4DV0K 5AQLA 2RHKA 4JKAA 4H5RA 1YIJN 4U7BA 2ZF5O 2OPRA 3AGRA 2BANA 5AQRA 3BDPA 4DS4A 1YHQN 3P83D 3C94A 3RMAA 1XC3A 3A2FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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