3VEYA

Glucokinase in complex with glucose and atpgs
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 165
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3veyA01
4IZ9A 4I6MB 1BUPA 1Q18A 3VENA 4HWIA 5JLHA 5FPDA 1YVNA 4JN4A 3O4WA 2IVPA 5AQQA 4FPAA 3D2FA 2QXLA 1HJOA 2FLOA 2H3GX 2FXUA 3TU5A 3VEZA 2Q1NA 4FWRA 5ELZA 3QFUA 4K42A 2A40A 4B1WB 1E4GT 3HI0A 5EY4A 1DEJA 3WQUA 4C23A 4DB3A 3ULEA 4MLEA 5AQPA 2P9NA 3L6QA 2PBDA 2CH6A 3UB5A 4CD3A 1JCGA 1TYQA 2QWLA 3L0QA 1GLBG 5E26A 1IJJA 1U6ZA 4XEIA 4B1UB 3CHWA 3GE1A 5AQZA 5AQLA 4JD2A 4H0OA 1NGEA 3BUZB 2YHWA 3IDHA 3FR0A 3U8XA 4XH1A 5FPMA 1ATRA 1JCEA 4FWOA 3ZETA 4XH4A 3ID8A 2W40A 3FLCO 2CGJA 3SK3A 4QS7A 4M7YA 3VF6A 3AAPA 4AM6A 4PKGA 2A3ZA 3FZHA 1WUAA 4RWTA 2FSKA 4RCHA 3FZMA 3HBTA 1ATSA 1V4SA 1QQNA 5BRDA 4J8FA 4BVOA 3GG4A 1SQKA 1C0FA 4BRMA 4JAXA 3P4IA 1S22A 5BN9A 2YI1A 2D1KA 3O6WA 4H5WA 4BVPA 1IG8A 3QBWA 1LCUA 4CZFA 4Y0WA 4O8KA 1ESVA 5BR9A 2D0PA 5AR0A 2QWPA 3L4IA 5AQJA 3VGMA 4IO8A 5AQMA 1ZBSA 3RSEA 2ASOA 3R9PA 3F9MA 5JLFA 2P9SA 4CBUA 3VF2A 4CZGA 2VYPA 5TKYA 1EQYA 5AQHA 4CZLA 2EWSA 3JXUA 5KPTA 3MDQA 3LDPA 4FWPA 3DAWA 4B1YB 2IVNA 3VEWA 3QDKA 3FGUA 4MLHA 4BG9A 4PKIA 3EL2A 1BA0A 2NLXA 1D4XA 4M7XA 3O08A 2IVOA 4IJNA 3GDQA 1HKGA 1NBWA 3QMLA 4B1ZA 3EN9A 2P9LA 5F1XA 1KAYA 2VCPA 3D7EO 1MDUB 2E2QA 1CZAN 2I7PA 3LDOA 3SJHA 4BRIA 5BREA 5F2RA 5AQRA 3WT0A 4EIAA 2E1YA 5LJVA 4BREA 1QZ6A 1BO5O 4PL7A 4BR5A 3FZFA 1QQOA 1XUPO 2V51B 1RDWX 4H5TA 2AA4A 3CERA 3LDLA 1T44A 4ISEA 4XH5A 4B1VA 3ZEUB 4GNIA 1NGDA 2AP1A 3LM9A 4BRCA 3FZKA 2DPNA 3WXKA 4BRHA 4BRLA 3CJ1A 3WQTA 3VGKA 4CJ7A 3CQYA 1X3NA 4FSVA 4FWLA 1NGHA 3UKUA 2QWQA 3DJCA 4EHTA 4PKHA 3W3DA 3CIPA 2P9PA 3ZX2A 2Q0RA 4BRDA 4H0TB 1Z05A 3EZWA 1RGIA 1HPMA 3J8AA 1S3XA 3CJ9A 1GLEG 2A42A 3VERA 3DXMB 2QWOA 3ZX3A 2Q97A 5AFUA 4BR9A 3GL1A 1U2VA 1NGFA 3WUHA 4FWSA 3EKSA 3VPZA 1HLUA 5EX5A 1BOTO 2QWNA 2A5XA 4RTFD 1ATNA 3CQXA 3A5MC 3O80A 1NMDA 3DWLA 1C0GA 2P9NB 5ADXH 4CZMA 4BQLA 2ZF5O 3H45C 3MN9A 2A41A 3KZBA 3VF4A 2NZTA 4A62A 4DHYA 1Y64A 1NGIA 3LDNA 4BRAA 3GOIA 1NGBA 3BF3A 3AY9A 3CJ7A 3VEXA 4WQ4C 1H1VA 4CZKA 3B8AX 3H6EA 4H5NA 2Q0UA 4WQ5C 1GLJO 3CJBA 5EOYA 1HKCA 3WXJA 3H46O 2P9KB 2HMPA 3O1BA 1KAXA 2GEMA 2GUPA 3CJAA 3CI5A 2P9IB 1V4TA 5AQYA 3VEOA 5FPEA 1J6ZA 4YDUA 4K43A 2YJFA 4O5FA 3VGLA 4M63C 4BGAA 1KAZA 1TUUA 2CH5A 3S41A 4DCHA 1TUYA 5BPMA 5AQSA 3IMXA 5F0XA 4FOIA 2D0OA 2ITMA 3EO3A 4IWVA 3A0IX 4JHDB 2P9UB 1WOQA 1HKBA 4NO7A 3QBXA 1P8ZA 4QS8A 3WXIA 3RSEB 5B8HA 2P9SB 2V7YA 4H5RA 5AZIB 1YXQA 1GLFO 2ZWHA 3FZLA 5AZJB 4BRGA 1NGGA 2E8AA 3M1FA 3C7NB 3ZX0A 2GTDA 3BEXA 3VETA 4GY2B 4ISGA 1X9JA 5AQNA 3FFKB 5KPRA 3VOVA 3KVGA 3CETA 1JCFA 3DXKB 5CE3A 3O1WA 4BR4A 2E2NA 4FPBA 1Z6RA 4E1JA 1HUXA 2V52B 3MN5A 4FO0A 3H1QA 4A2BA 2F9WA 4BGBA 3D2EB 1BG3A 2ASMA 2P9LB 3HTVA 3MN6A 4CZHA 1OKJA 2QW9A 5AQVA 3VEYA 3BP8A 5AQXA 4LC9B 4A2AA 4IJAA 5JMVA 4MO4A 4BQZA 1QHAA 4F9OA 1GLLO 2HF3A 4H0VB 1K8KB 4I6MA 4WQ5A 3KHYA 3WEEB 2ZGZA 4BRFA 3UKRB 2E2OA 5BPLA 5I9EB 1HX1A 3MN7A 1MWKA 1NGCA 3SMPA 3CJCA 3H3NO 4FWMA 4A61A 3VESA 1QZ5A 2HF4A 2YHYA 4BR2A 5JICA 3D2FB 2P9PB 4BR0A 3ENOA 4H0XB 4AM7A 3UE5A 3TPQA 3DXMA 4BC2A 3C0BA 3R8EA 4BROA 4CZJA 1BA1A 5AQWA 3G25A 1E4FT 3SMSA 2GWKA 4EHUA 3W0LA 1ZC6A 1BDGA 3ULEB 5KQ8A 1T6CA 5AQIA 2D4WA 2PAVA 5E84A 1NLVA 4BC5A 4CZIA 5KPZA 1TYQB 2QWRA 1U2VB 4L3QA 4HTLA 1T6DA 3ATVA 3HM8A 4PL8A 2I7NA 4K25A 4JD2B 3IUCA 3WXLA 3A5LC 2Q2RA 3BF1A 3H1VX 4BRPA 1YAGA 5LY3A 3OHRA 2FSJA 4FWKA 1MWMA 3MCPA 3U9ZA 2Q31A 5LJWA 3LDQA 2ZGYA 4CBXA 3I8BA 3ZETB 5BRHA 2YJEA 2CGKA 3HSCA 1DGKN 4B1XB 2HOEA 3ENHA 3I33A 4B9QA 4BRKA 4IXCA 4K41A 3MK6A 3O8MA 4BR7A 3AAQA 5AQOA 4CD1A 1GLDG 5AQTA 5AQFA 2NRHA 2P9KA 1ZXOA 3VEVA 3ATUA 2J4RA 3JS6A 4H5VA 3R6MA 3QB0A 5EXWA 2P9IA 3A5OC 1SAZA 2QWMA 2YCHA 1GLCG 3A5NC 4JNEA 3U9DA 2UYTA 4FWNA 4BC3A 2FF6A 2YHXA 1DKGD 2GELA 2F9TA 4H03B 5BPNA 1RFQA 2WUSA 4BRNA 5AQUA 1NM1A 4CZEA 4EAHD 4FOEA 3IFRA 2Q36A 3AARA 5FPNA 5AQGA 3LL3A 4JHDA 3MMVA 2P9UA 2IIRA 2W41A 1NGAA 4QS9A 2A6AA 4DQ8A 3LM2A 5EVZA 5AZIA 3QFPA 1BWFO 1SZ2A 1R59O 2FF3B 5AFUH 5AZJA 4CI6A 3SLCA 1GLAG 1QQMA 3C7NA 4FWQA 3EKUA 4EFHA 1BU6O 5ADXA 4NB4A 2BUPA 3DXKA 2GWJA 4H0PA 4KBOA 5AQKA 2VWBA 1XQSC 5BRFA 4CBWA 1LOTB 5KQDA 4H0YB 3FE1A 3U4LA 2BTFA 2FSNA 3D2EA 2E20A 2QM1A 1NWKA 2E2PA 3ZEUA 2E1ZA 2KHOA 1XC3A 2E88A 3A8YA 3M3ZA 4WQ4A 4MO5A 4BC4A 1G99A 3O5BA 1KXPA 5BN8A 3HZ6A 1X3MA 2V7ZA 2ASPA 4YDUC 1MA9B 2OANA 4ISFA 4BG8A 2CGLA 3WEEA 3H3OB 3QICA 1K8KA 1YUWA 3UKRA 4WYBA 3GBTA 4BRQA 4FL9A 1NGJA 3UKUB 3M6GA 4Z94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XC9A 4DU1A 5FPDA 4KV8A 5GAHP 3CC2N 5CZ2A 4B3TK 4JRQA 2NRVA 4FPAA 2HHXA 1UA1A 3CFOA 3VEZA 2FXUA 3L2RA 3NGIA 1RILA 4JI8K 4B1WB 5M1OA 2HW3A 1D8YA 3BZKA 2P9NA 1M1KO 1Z25A 3CFRA 5C25A 1GLBG 5J2PA 1KVBA 5C2DA 3AVJA 1VQKN 4DF8A 1WSIA 1NGEA 1QSSA 2YHWA 4F3TA 3OYIA 1ATRA 3NF9A 4FWOA 1L3VA 3DYAA 4OGCA 4GV6A 4XH4A 4JK8A 4M42A 3FLCO 3CFPA 3G4SN 4DTNA 1X9SA 3LP2A 1ZBHA 4YOUA 4PKGA 2O4GA 1RNHA 1VSHA 2FSKA 2IDOA 4LF5K 4RCHA 4CEZA 5BRDA 2PZSA 4BVOA 3J7YP 3KK1A 1I94K 3GG4A 1BI4B 3AVLA 3J81O 3OY9A 3V9ZA 3T3FA 4DTMA 2KZMA 2YI1A 2D1KA 4W5RA 4NYFA 1IG8A 1LCUA 1TVRA 1N5YA 3KLIA 5BR9A 4IBNA 2QWPA 3MXMA 1FKOA 5AQMA 3RSEA 3NH0A 2ASOA 3F9MA 3ZSVA 4CBUA 5JLFA 3VF2A 1UOCA 4KH4A 1EX4A 4JKGB 1EKEA 2KW4A 4JKCA 1J5OA 4KAZA 4CZLA 1A5VA 5KPTA 1JL2A 3QEXA 2DFFA 1WSFA 4UY8O 3NH1A 3EL2A 1BA0A 4E7KA 4HVJA 2GBZA 3GDQA 4B1ZA 3QMLA 2QEXN 4PQUA 1Q8IA 4CJ5A 1T8EA 1M90O 3CXCM 2I7PA 3AVNA 4BRIA 4EIAA 4JI3K 3PX6A 4B9UA 4KB0A 4E1MA 4PL7A 4BR5A 2GV9A 4CF2A 1XUPO 3CMEN 1HYZA 2XY7A 2XY8A 4GNIA 2AP1A 4BRCA 3WXKA 4ICLA 5CZ1A 5JVHL 3VQEA 3ULDA 3THYB 3CJ1A 4FJHA 1HJRA 1X3NA 2O8FB 2HBKA 4YOWA 1P90A 2LSNA 3CIPA 3ZX2A 4Y1CA 2OZSA 5K14A 3AO5A 3L3UA 4B3OA 4O0IA 3NE6A 4JS5A 3E9PA 1TKXA 2DTUA 4RW7A 1IV0A 3J8AA 1S3XA 1IKYA 3CM6A 2QWOA 1U49A 5AFUA 1RTDA 1XMQK 1U2VA 1C1AA 1ASWA 3VPZA 5M1QA 3VTIA 1TL3A 4DS4A 2A5XA 4RTFD 4WFNL 3DWLA 2P9NB 1LWCA 2R7YA 5MLCQ 1LW2A 3KZBA 3VF4A 3AVKA 3TSPA 1CLQA 1NGIA 1F21A 1EXQA 3GOIA 3V1RA 3MEDA 3VEXA 3ISNC 3O4NA 4U67L 4AHTA 3M8RA 4FLTA 1BCOA 3G0ZA 1RT6A 3H6EA 3MAQA 1VQ4N 4KHNA 3P38A 1GLJO 4XIUA 4YOYA 1KAXA 4BY9C 2E4LA 2P9IB 1SS6A 1JXBA 3OYHA 4YDUA 1QSYA 1WSEA 4CGDA 2FBVA 3OYFA 4HCCA 2O4IA 3LP3A 1RDUA 2WOMA 4FOIA 4YY3K 3HO1A 2D0OA 4H4OA 2ITMA 1K8AO 5M1NA 5GIOA 2OTLN 1FK9A 3SUPA 1TKDA 1P8ZA 4KPYA 3RSEB 5AZIB 3WXMB 2RF2A 1GLFO 3U6FA 3FZLA 4CF0A 1X9MA 3OYDA 4KFBA 3C7NB 3AVHA 4CHZA 3KK3A 2HB5A 3KVGA 4RG8A 2XY6A 3O3HA 4N56A 1JCFA 3VQ9A 1KD1O 2E2NA 4FPBA 3RMAA 4E1JA 5BR8K 4CF1A 2KLAA 4DTJA 3H1QA 4A57A 2UUAK 4GV9A 4CW7B 3I55N 1Q9YA 3C6TA 4B8CA 3HPHA 3S9HA 4R79A 1WBDA 1NK0A 3WNFA 5DM6L 4FYDA 3TANA 4LC9B 5E41A 3SI6A 1KTQA 4CF9A 1QHAA 4ZHRA 4H0VB 3K5LA 1K8KB 4BE2A 2JGUA 3UKRB 2E2OA 4LF7K 4FK4A 1FXXA 1NGCA 2D5RA 2QKBA 2HF4A 3TAQA 4JKEA 2YHYA 1S1XA 3D2FB 3MEEA 3DI6A 1W2BM 3NGZA 5GAGP 4RW6A 2KQ2A 3C0BA 4BROA 1BA1A 3AA4A 4CHNA 3ULEB 4BDYA 3SPZA 2HBMA 4BC5A 4CZIA 3TAPA 4JKHA 3S3NA 2QWRA 1U2VB 4C8LA 4L3QA 1T6DA 2Z1GA 1VQ7N 4FLZA 1ILYA 4OJRA 4ILJA 4K25A 1TK8A 4JD2B 3HJFA 1MU2A 1YAGA 1MWMA 2EX3A 3LDQA 4CBXA 3C95A 4M3ZA 3I8BA 3CPEA 4IXCA 4K41A 1JKHA 1ZBUA 3NGYA 5FLXO 4W5QA 3NHGA 1VQON 1GLDG 3SQ4A 3JS6A 4DR3K 3R6MA 3K58A 5EXWA 1NJWA 2UYTA 4FWNA 2FF6A 1G15A 1S9EA 4DV6K 3TTFA 1JLFA 1VQ8N 1NK9A 2WUSA 4CZEA 5FDLA 4FLXA 1L3TA 1RBRA 2BANA 3OS2A 1C0TA 3IRXA 4EZ9A 4JHDA 2W41A 4JYAK 4QS9A 4DQ8A 5C10A 5M1FA 4DUYK 5EVZA 4CHPA 1CZ9A 4O55A 4OLBA 3KLFA 1Q82O 2G8FA 1GLAG 1QQMA 2UUBK 1QHTA 1EETA 4FW2A 4K0KK 1L3UA 4FJ9A 1YVUA 3T1HK 1IBLK 1HNWK 1W9HA 2VWBA 4CHYA 1XQSC 2WC9A 4IDKA 1LOTB 1RT1A 4KHQA 3CC7N 2HBLA 3U4LA 4OVLA 3BGRA 1JLAA 3SBTA 2VGNA 3ALYA 2KHOA 1XC3A 2E88A 3ITHA 3M3ZA 4CGHA 3AVBA 4DTXA 2FC0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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