3VEYA

Glucokinase in complex with glucose and atpgs
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
b'TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 165
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3veyA01
1NGAA 4O8KA 5AQNA 3UE5A 4LC9B 3WXJA 4BRHA 2YHYA 2IVOA 1R59O 2CH6A 5BPMA 5E26A 1EQYA 1ZBSA 2GTDA 3H3NO 3ZX2A 2E88A 3D7EO 3FZLA 4M7YA 1WOQA 5KPZA 1LOTB 5LY3A 4BRQA 2P9LA 3FZKA 1YXQA 2IVNA 3ATVA 3FZHA 4WQ4A 4BROA 4CI6A 2P9UA 3O5BA 3ZETB 3VEXA 4QS7A 1DGKN 3KZBA 3QFPA 2P9SA 1Z05A 4YDUC 1C0FA 1RDWX 2D0OA 4AM7A 3WXLA 2P9IB 4HTLA 1YUWA 3JS6A 4I6MB 3ZX0A 2QM1A 1BO5O 1ZXOA 1NGBA 4CBXA 5E84A 5AFUA 3ENOA 3O80A 2KHOA 4IO8A 2ASOA 1T6CA 1NGCA 3H3OB 5AQXA 3ZX3A 3C0BA 3IMXA 4XH5A 1U2VA 4FOIA 2WUSA 5AQRA 3OHRA 2IVPA 3HM8A 3WXKA 5AZIB 3GE1A 4K41A 1IJJA 1V4SA 5AQGA 3VEOA 2FF3B 4BRLA 3AY9A 2I7NA 4CD1A 2A40A 2QXLA 5AQPA 2HMPA 3S41A 3VERA 3MN6A 3O8MA 1NGHA 2UYTA 4A62A 2A5XA 1MA9B 1XQSC 1NGDA 5AQQA 2NZTA 4FPAA 5BR9A 4BQLA 2CH5A 4FOEA 1NGEA 2P9LB 4MO4A 3UKRB 5F2RA 2P9UB 3MN5A 3MK6A 4BG8A 3G25A 3CIPA 3CJBA 3IFRA 4BR0A 3SMSA 5I9EB 3WEEA 3TPQA 5EVZA 2CGLA 1BWFO 4M63C 1T6DA 4JD2A 3W3DA 3QBWA 3WXIA 4BRGA 5FPDA 3O6WA 4RTFD 1HPMA 3QBXA 1NGJA 3M3ZA 1HKGA 3P4IA 4H5RA 2HF4A 3HZ6A 2FLOA 4QS8A 5B8HA 2GWKA 4CJ7A 3ZETA 3FLCO 4DB3A 2E2PA 1KXPA 1HJOA 1XC3A 2QWRA 1C0GA 3LM9A 3I8BA 2P9PA 3FGUA 1BDGA 4I6MA 3SLCA 3MCPA 3U9ZA 4B1XB 4BGAA 1K8KB 4K25A 2ASPA 1U6ZA 2QWQA 5ADXA 1QQMA 1NMDA 2QWMA 5FPMA 3ULEA 3WT0A 3O4WA 3UB5A 1TUYA 2Q31A 2FSNA 3GDQA 3FZMA 4FWNA 5AZIA 3O08A 1D4XA 4H5TA 1RFQA 3CETA 3R9PA 2FF6A 4WQ5C 4MLEA 2H3GX 4BR9A 5JLHA 3WEEB 4EHUA 4JD2B 1ATRA 2QWOA 1HKCA 3TU5A 2FXUA 3IDHA 4CBWA 2GEMA 1G99A 3H46O 2EWSA 4RWTA 4CZMA 4JHDB 4XEIA 4C23A 2Q36A 2AP1A 3UKRA 3VEYA 2BTFA 2CGKA 4B1WB 4BC2A 4BRCA 2P9NB 3CHWA 3LDOA 1SQKA 4XH1A 3CJ1A 5AQLA 3KVGA 4NB4A 3CI5A 2P9PB 4EIAA 4E1JA 3QMLA 2V7ZA 1X3NA 5AQTA 2DPNA 2ZF5O 3CQXA 3QICA 4BR2A 1P8ZA 3CJAA 5AQMA 5AQVA 3ID8A 1ATNA 1GLEG 2F9WA 3ULEB 1KAYA 3BP8A 4BRNA 4BVPA 4WQ5A 3VESA 2AA4A 3AARA 4BRPA 4MLHA 1JCFA 4FWMA 4MO5A 2D4WA 3H6EA 2Q1NA 1NLVA 4DCHA 4Y0WA 2QWNA 1H1VA 1BUPA 1S22A 3AAPA 4BC5A 5AR0A 1HX1A 3ZEUA 2CGJA 3DXMB 3DAWA 1K8KA 1CZAN 4FO0A 3JXUA 2W40A 3CJCA 3J8AA 3QDKA 4F9OA 1BU6O 1GLJO 4K43A 1MDUB 1KAZA 3WUHA 5AQSA 1QZ5A 3VEWA 4FWQA 4YDUA 1E4GT 5AQWA 3FE1A 4A2AA 3EZWA 4DHYA 3VF2A 2E2QA 5AQJA 2A41A 3BF3A 5FPNA 2A3ZA 3SK3A 4CBUA 2YJFA 4CZEA 3MMVA 4BRMA 1JCGA 1E4FT 4H0TB 4EAHD 5AQUA 4CZJA 3L0QA 3H1VX 2PAVA 4JHDA 3DXKB 2A6AA 1SZ2A 3HSCA 4IWVA 4QS9A 3O1WA 2E2NA 4IJNA 1Y64A 2A42A 4H0XB 3RSEB 2I7PA 2E1YA 5BN9A 2P9NA 1TYQB 1GLFO 1ZC6A 3CERA 4FL9A 5AQOA 3B8AX 2NLXA 5BRHA 3R8EA 3D2FB 5BRDA 1QHAA 4H5WA 4GNIA 3A5MC 2V51B 1ATSA 3ZEUB 4FSVA 4ISFA 1HKBA 4KBOA 1GLLO 4M7XA 3F9MA 4FPBA 4BQZA 4BC4A 3O1BA 3GL1A 4EFHA 3U8XA 3DWLA 3LDNA 3H45C 4EHTA 1TUUA 2E1ZA 5TKYA 2YI1A 4IXCA 5ELZA 3VF6A 2HF3A 4WYBA 4B1YB 1JCEA 4DQ8A 3VPZA 2VWBA 4BR7A 3EKSA 4BRFA 1DKGD 1NWKA 4BRDA 4PL7A 2QW9A 4K42A 4CZKA 5AFUH 1YVNA 4BRAA 4O5FA 3DJCA 3DXMA 3FR0A 3A8YA 3U9DA 3MN7A 2QWLA 4CZHA 1HLUA 2Q2RA 1RGIA 2YHWA 4IJAA 3HTVA 2GWJA 3EL2A 3AAQA 4CZIA 1BA1A 3GBTA 2V52B 5AQKA 3VENA 2E2OA 4PL8A 1HUXA 2Q0UA 4NO7A 4B1VA 3VOVA 3M1FA 2VCPA 2E20A 1NGGA 5LJVA 5CE3A 1BG3A 2P9KB 4JN4A 1MWMA 3WQUA 3HI0A 5BREA 1LCUA 3L6QA 4H03B 1NGIA 4BR4A 3DXKA 3A5NC 3UKUB 1T44A 3LL3A 3VEZA 4FWKA 3D2EA 4H0VB 4FWSA 4H0YB 3W0LA 5BPLA 4FWRA 5F1XA 4H5NA 3RSEA 1S3XA 3LDQA 1XUPO 4CZGA 3C7NA 1TYQA 4H0OA 4PKHA 1DEJA 4L3QA 1Z6RA 3FZFA 5EXWA 3D2FA 5EX5A 3CJ9A 1QQNA 1OKJA 2GELA 3KHYA 1X9JA 1Q18A 2ZGYA 3A5OC 3EO3A 4HWIA 4BRIA 3ATUA 3MN9A 2FSJA 4GY2B 4BRKA 4BGBA 2BUPA 3FFKB 5KQDA 2PBDA 4BREA 3QFUA 3EN9A 2J4RA 3LDLA 4FWLA 4CZFA 1QZ6A 5AQYA 5EOYA 2D0PA 1WUAA 2FSKA 4B1UB 2YHXA 4BC3A 2W41A 5F0XA 3ENHA 4BVOA 3LM2A 1X3MA 4AM6A 4H5VA 3QB0A 3U4LA 3VEVA 1GLBG 1MWKA 5KPRA 4RCHA 5BPNA 3BEXA 4B1ZA 4BR5A 3SJHA 1KAXA 1GLDG 5ADXH 1SAZA 2ZGZA 3GOIA 3VGMA 2Q0RA 2YCHA 4ISEA 5AZJA 1YAGA 1NBWA 1GLCG 5AQHA 5BRFA 3D2EB 1NGFA 4H0PA 5AQZA 2P9SB 2V7YA 4J8FA 3A5LC 3C7NB 3VGLA 4IZ9A 5JMVA 2P9KA 4FWOA 1BOTO 1V4TA 2QWPA 5JICA 4PKIA 4A61A 3VETA 4A2BA 1NM1A 3BUZB 2ZWHA 5AQIA 1QQOA 3LDPA 3UKUA 4CD3A 5FPEA 1U2VB 2F9TA 4BG9A 3L4IA 3WQTA 5LJWA 2D1KA 3MDQA 2GUPA 3A0IX 4FWPA 1IG8A 4ISGA 5KPTA 3IUCA 4WQ4C 4PKGA 2HOEA 3EKUA 2Q97A 2YJEA 4XH4A 3CJ7A 4B9QA 2E8AA 2P9IA 3R6MA 1J6ZA 3M6GA 5AQFA 3BF1A 3CQYA 3VF4A 4Z94A 5JLFA 1BA0A 3SMPA 4CZLA 5KQ8A 2ITMA 5BN8A 2NRHA 1ESVA 3HBTA 3H1QA 2ASMA 3GG4A 2OANA 3VGKA 4JAXA 4JNEA 2IIRA 2VYPA 5EY4A 5AZJB 3I33A 1GLAG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DTUA 1NGAA 1VQLN 4A59A 3NVMA 4B3TK 4HHTA 1T3VA 4BRHA 3Q7CA 3LDSA 3ZSOA 1DTTA 5C2FA 3CCVN 3FFIA 1N5YA 2PYJA 5LL6Z 2O4IA 3SV4A 4YOVA 5H1SQ 3L2QA 5KPZA 1TL1A 3NGZA 1LOTB 2NRWA 3ATVA 2IVNA 3FZHA 3O9SA 4BROA 4YOXA 3CC2N 3ZETB 1Z26A 3KZBA 4KH6A 2P9SA 3O9QA 4YDUC 3SV3A 4L8RB 4EP5A 2ITGA 2D0OA 4B8CA 2DFEA 3WXLA 2JGUA 3SUOA 3ENBA 3ZX0A 4M3TA 1B9FA 3OY9A 1BISA 3NH2A 2HHTA 2O8CB 5AFUA 1N32K 4IO8A 3NF7A 2ASOA 3NBPA 4DR3K 3H3OB 3ZX3A 3HOTA 3C0BA 3KTQA 4FOIA 1T05A 2WUSA 3ISNC 4CJ5A 5AZIB 1NU0A 4FJNA 1IJJA 4V19S 5D3GA 3VEOA 4BRLA 3AY9A 4O8UA 4CD1A 3CG7A 5IT9O 2HMPA 1IBLK 3MN6A 1NK9A 1IH7A 5E41A 2NNWA 2O8BA 5KTQA 3HK2A 1QQCA 2OCEA 3F9KA 4CIFA 3PIOL 2P1JA 4FPAA 2CH5A 4FOEA 4PHTX 5HOOA 4DV3K 4MO4A 3UKRB 2RHKA 3MK6A 4ICLA 4DV4K 3CJBA 4BR0A 1FKOA 3OS1A 4M63C 1LWFA 1T6DA 3HM9A 2O8FA 4W5QA 3VQ9A 1D9DA 4GV6A 3N4PA 3AGRA 3THXA 4FJ5A 1NJIO 2QXFA 3CPEA 1X9MA 1HKGA 3P4IA 2ZE2A 3KD5E 3OYKA 4DF4A 3AVCA 5B8HA 4N56A 4DB3A 4N47A 3QEVA 1KXPA 1XC3A 5J1EA 3QEIA 2QWRA 1QE1A 3I8BA 3SLCA 5SWMA 2HHQA 4B1XB 4FM2A 2P5GA 3KLIA 2ASPA 2HB5A 2QWMA 5FPMA 1YJNN 3O4QA 2WTUA 3OYCA 1TUYA 2JWLA 4H5TA 2FF6A 3N4QA 4MLEA 5A2QO 2ATQA 3M8SA 1FKPA 1CXQA 3DLHA 2RF2A 1D9FA 1XWLA 3EEQA 4CJFA 5CHIA 4E89A 1NJZA 4J2BA 4XEIA 1ZBIA 3MXJA 3KKSA 4DTOA 2Q36A 1WAFA 5I3UA 2BTFA 1S72N 4BC2A 3KLEA 4Z4HA 4W5OA 1RDAA 4DQIA 3QO9A 2FBTA 1JLGA 4CEOA 3KVGA 2P9PB 3JSMA 2HNYA 3OBYA 1QSYA 2QKKA 2YKNA 3AO5A 4GV3A 3CQXA 3OJUA 3VMFB 5AQMA 4ILJA 4CE9A 4B9MA 4CHYA 1KAYA 4G1QA 1S6QA 3AVBA 5DK5A 3WXMB 2A1RA 3R3LA 1KLMA 4FWMA 4DTMA 1U04A 3OW2M 1OH5A 2KLAA 2VQEK 1H1VA 1EO1A 1BUPA 2WFBA 1S22A 3PUFA 4BC5A 3ZEUA 2CGJA 3AVFA 1HNXK 3LAKA 4B8AB 4IFEA 1WSIA 3CJCA 4CJEA 1VQMN 4E3SA 4C1NK 2HSTA 1UA1A 4CJVA 5HRRA 4DSIA 1GLJO 2OPQA 5AQSA 5IWAK 5AQWA 4DTNA 4AILC 3SQ1A 3EZWA 4DHYA 3VF2A 3MEEA 4KHYA 3BF3A 1KFSA 3J80O 5HLFA 5C42A 2YJFA 1E4FT 4EAHD 4K8ZA 5AQUA 4IO9L 4ELUA 3OYLA 1JJ2M 4LSLA 3HSCA 4F4KA 1XI1A 2HBMA 4O0JA 1TKXA 3HXMA 3O1WA 4BWMA 4GMJB 1Y64A 4FJMA 3M5RA 4MDAA 4KO0A 3BZCA 4KH4A 4FXDA 4YOYA 3CERA 1Q9YA 1DTQA 1S1TA 3VN5A 4GNIA 3A5MC 3F2KA 1ATSA 1N36K 1KQSM 1VSHA 3EYZA 4DLGA 5C2DA 1YJWN 4RW7A 3O1BA 3GL1A 3U8XA 4JV5K 3DWLA 2YNFA 3LDNA 3OTOK 3TTCA 1TUUA 1YJ9N 4IXCA 1J5OA 3VF6A 2IS3A 1JCEA 5JVGL 4KHNA 1DKGD 1NWKA 1YVNA 4DV0K 4KAZA 2HBLA 3DXMA 3FR0A 2XY7A 3U9DA 1NNEA 3V6DA 3LZJA 2Q2RA 3CFRA 2YHWA 3AAQA 3QNNA 1VQKN 4DU3A 3GBTA 2V52B 3V9WA 1HUXA 4C8LA 1K6YA 2E20A 1NGGA 3V9ZA 3HI0A 1A5XA 3C6UA 3TTFA 3L6QA 1NGIA 2UXCK 4BR4A 3DXKA 5KGWA 1C0MA 3A5NC 1T44A 1IBMK 4FWKA 5FROA 3D2EA 4AHUA 1YIJN 4FWSA 4FJHA 2HNZA 3ZCMA 3W0LA 4PUOA 4H5NA 3RSEA 3LDQA 4CZGA 4H0OA 4OO1J 4FCYA 3D0PA 1Z6RA 5EX5A 3AA5X 1NMNA 3P39A 4CHNA 3KIOA 1VSFA 3A5OC 4DFPA 5CR4A 1RT2A 4JLHA 4BRKA 4BGBA 3FFKB 3K59A 5KQDA 2XY6A 3KKRA 3QFUA 4QAGA 4CGIA 1XMOK 2J4RA 4FWLA 1RT5A 3CC4N 1B9DA 3DMJA 2HHSA 2FBXA 2D0PA 4ILGB 3SQ2A 1Q81O 2YHXA 3AVHA 4BC3A 3TR8A 3CCEN 4AM6A 3VA3A 4RCHA 4QCLA 4M42A 2OA8A 1VQ5N 1GLDG 1LWCA 1IO2A 3HP6A 4E7HA 2FC0A 2Q0RA 1RDUA 4DR4K 5AZJA 2VG7A 1GLCG 2KZMA 1NGFA 1SUQA 4JK9A 5AQZA 1NK7A 4MFBA 3HJFA 1J9AA 1TGOA 3CCQN 3VQ7A 4ZTFA 3CCLN 1VSMA 4IEEA 4OPHA 3TTDA 5JICA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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