3VEYA

Glucokinase in complex with glucose and atpgs
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glucokinase
total genus 165
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3veyA01
4PKIA 4L3QA 3SLCA 4YDUA 4MO4A 5EVZA 5CE3A 1GLJO 2E1ZA 5KQDA 4B1VA 2HF3A 5AQGA 4K25A 1HPMA 2YCHA 5EXWA 3RSEB 5AQYA 3ZEUA 3M6GA 1D4XA 3A5LC 3FGUA 5B8HA 2P9PB 3HI0A 5BRDA 3D2EB 4YDUC 4CD1A 1ATNA 4FO0A 4FPAA 3IUCA 3B8AX 2FSNA 1R59O 3BP8A 3O08A 3VF2A 3KZBA 4CBUA 2GWJA 3SK3A 2NLXA 4FWPA 4I6MA 3WEEA 3UKUB 5AQWA 3CERA 3BF3A 3SMSA 4CZMA 3M1FA 5FPEA 3CI5A 2QWLA 1TYQA 4GNIA 5AZJB 1BO5O 2P9SB 4NO7A 2NZTA 1GLEG 3WQTA 2Q0UA 5LY3A 1BDGA 3ULEB 2NRHA 4BQZA 5AQVA 4CZLA 4EFHA 1XC3A 3VF4A 3DXKB 5AQFA 1OKJA 5F1XA 3HTVA 4BRKA 2D4WA 5AQLA 4PKHA 3H3NO 3AY9A 1C0FA 2P9IA 2V52B 5BRFA 4PL8A 5JLHA 4O5FA 3QMLA 5TKYA 5F2RA 5AZIB 4FL9A 4IXCA 5AQQA 1WUAA 4BGBA 3VGMA 1BU6O 3UB5A 4BVOA 4EAHD 4CZEA 3VEYA 4CZGA 1NGIA 4BR5A 3JS6A 3U8XA 2BTFA 2W40A 5KPTA 3MDQA 3P4IA 3EL2A 3OHRA 3AARA 2E2PA 4O8KA 3UE5A 4CZFA 3TU5A 4B1UB 5I9EB 5E84A 1Y64A 1HX1A 4KBOA 4BC4A 2GUPA 4Y0WA 3GE1A 5FPNA 3WXJA 2P9KA 2D0PA 4BGAA 2GELA 1LOTB 3ZX0A 1QQOA 2CGJA 2QM1A 3QFUA 2F9TA 4M7YA 4BRHA 3GDQA 4NB4A 3BF1A 3A8YA 2D0OA 2QWPA 5AQOA 2ASOA 1KXPA 2QWOA 2ZF5O 4BG8A 5BRHA 4EHUA 3DXMA 4BRDA 5BREA 3KHYA 3A5NC 3CETA 2YHWA 1K8KB 1GLDG 3VETA 1EQYA 3LDPA 5AQZA 3DXMB 4DQ8A 3GOIA 1QZ6A 2FSJA 2E2QA 4JAXA 4CBXA 1BG3A 2IIRA 1E4FT 2CGKA 5JMVA 3MK6A 3D2FB 4CD3A 2ITMA 3ULEA 2PAVA 3VPZA 1U2VB 4CZHA 1MA9B 1HJOA 1HKCA 2UYTA 1IJJA 3I33A 2CH6A 1DKGD 1YUWA 2QWNA 2YHXA 3UKUA 3CJCA 3MCPA 4DB3A 4B1YB 2ASPA 5FPMA 4H0PA 4QS9A 3CIPA 4JD2A 1ATRA 4BR7A 4MLEA 1JCEA 2P9IB 4H5VA 4BROA 2V7ZA 1JCGA 3H45C 4BRGA 3R6MA 5AQJA 3EO3A 3JXUA 2QW9A 3DWLA 3O6WA 4H0TB 4E1JA 2E1YA 1T6DA 4ISEA 2WUSA 5AQKA 3VGLA 3ENOA 4BR9A 2YHYA 3CQXA 3FZFA 3MN7A 2E2NA 3R9PA 4H5WA 3BUZB 2J4RA 5AFUA 3G25A 3BEXA 1X9JA 1YAGA 4QS8A 2VCPA 5AZJA 1NGEA 5EX5A 1NGAA 2YJFA 5KPZA 1MWMA 4FOIA 2IVOA 1JCFA 3WQUA 2P9LA 1QQNA 3R8EA 3MN9A 2A6AA 1TUUA 4EIAA 2BUPA 3O5BA 3WXIA 4JD2B 4WQ5A 1GLCG 4DCHA 2HF4A 1KAXA 2FLOA 3LDLA 1BA0A 3VEZA 4JN4A 1XQSC 1X3NA 3LL3A 1K8KA 4BRFA 4M7XA 1MWKA 3SJHA 4B1WB 1QQMA 4LC9B 1ZXOA 1C0GA 2P9LB 3DXKA 3WXKA 3VEXA 2FF6A 3CHWA 1GLAG 1ESVA 4H0OA 2I7NA 1IG8A 3L6QA 1H1VA 1U2VA 1TYQB 2P9PA 3D2FA 3FE1A 2Q97A 1E4GT 1NLVA 5FPDA 1J6ZA 2FF3B 4XH1A 4GY2B 4MO5A 1SAZA 3ZX3A 5EOYA 4FPBA 1KAYA 3VOVA 2A5XA 5AZIA 1KAZA 3DJCA 5JLFA 4IO8A 3A5MC 3A5OC 2Q0RA 3MMVA 3H6EA 3LM9A 3H3OB 3FZHA 3CJBA 2F9WA 5ADXA 3QICA 3EKUA 4B1ZA 1BUPA 4CZKA 2YJEA 1Z05A 4H5RA 3VF6A 1V4SA 1YVNA 4FOEA 3RSEA 3ZEUB 5LJVA 1HLUA 4FWKA 3A0IX 3HBTA 4FWQA 4BRAA 1CZAN 2P9SA 4BC2A 1YXQA 3O80A 4QS7A 4A61A 4BRMA 3EKSA 5AQUA 4FSVA 1LCUA 4FWLA 3S41A 3QBXA 2HOEA 2AP1A 3M3ZA 3GBTA 4H0XB 1WOQA 4WQ5C 3AAPA 4IJNA 1DEJA 4JHDA 3ZX2A 5LJWA 2A3ZA 2Q1NA 5AQMA 2VYPA 3H1VX 1NGFA 3MN6A 4PKGA 5AQPA 2W41A 3H46O 5BPMA 5AQNA 1MDUB 3HZ6A 1RFQA 3U4LA 4WYBA 4FWOA 4H0VB 3C0BA 3W3DA 2HMPA 2CGLA 2V51B 2P9UB 4WQ4C 2QWQA 3D2EA 3ENHA 3LDNA 5EY4A 4H03B 3UKRA 5AQXA 3HM8A 4BG9A 1S22A 5AFUH 4FWSA 1BA1A 3L4IA 4RCHA 1TUYA 3W0LA 5BPNA 3GG4A 1QHAA 1BWFO 3FZKA 4BRQA 2H3GX 1HKGA 4H0YB 2P9KB 4BR2A 4HWIA 2KHOA 1GLLO 1ATSA 3CJAA 3HSCA 3U9ZA 4H5NA 2P9NB 5BN9A 1X3MA 1Z6RA 4PL7A 4BQLA 3LDOA 4JNEA 2GWKA 4CBWA 2Q31A 4H5TA 2Q36A 4K42A 5AQSA 3VESA 4B1XB 4CJ7A 5AQTA 3FLCO 4AM7A 4BRIA 4CI6A 5AQHA 3CJ1A 2IVPA 3WEEB 3CQYA 4IJAA 4I6MB 1HUXA 4K43A 3IDHA 4BVPA 5AQIA 2QWMA 3QB0A 3I8BA 2PBDA 2OANA 3U9DA 5ELZA 4XH4A 3D7EO 4BR0A 4A2BA 1QZ5A 4BC5A 4A2AA 2E88A 2E8AA 4K41A 3VEOA 4MLHA 2QXLA 4XH5A 1NGJA 4Z94A 3EZWA 3VEVA 3ZETB 2ZGYA 3F9MA 4J8FA 3EN9A 3L0QA 2I7PA 3J8AA 5E26A 1GLBG 2P9UA 3WT0A 4FWNA 4A62A 4BC3A 4IZ9A 3WXLA 3C7NA 3CJ9A 1P8ZA 2A42A 2GTDA 3H1QA 2FXUA 4RWTA 1SQKA 3SMPA 1NWKA 4C23A 4AM6A 4M63C 4FWMA 4RTFD 4XEIA 3VERA 3WUHA 2ZGZA 3IMXA 1Q18A 3LDQA 3VENA 5BN8A 4IWVA 3FFKB 3IFRA 2ZWHA 3ATUA 4JHDB 2P9NA 1NM1A 4F9OA 4B9QA 2Q2RA 2GEMA 3O1WA 4ISGA 1U6ZA 5BPLA 2V7YA 3DAWA 4DHYA 5BR9A 3LM2A 3CJ7A 3QFPA 1BOTO 1GLFO 3ATVA 1T6CA 5F0XA 4ISFA 1NGBA 2A40A 3C7NB 1RDWX 4BRLA 4WQ4A 4HTLA 3TPQA 3MN5A 1NBWA 3ID8A 3FZLA 2DPNA 3GL1A 3ZETA 1NMDA 3O4WA 3KVGA 5AR0A 1RGIA 1DGKN 1NGCA 2E2OA 1T44A 4BR4A 4BRNA 4BRPA 1NGGA 5KQ8A 1ZBSA 4FWRA 1XUPO 3AAQA 2VWBA 3O8MA 1G99A 2QWRA 2YI1A 1HKBA 3UKRB 1V4TA 3O1BA 4BRCA 2D1KA 5KPRA 3VGKA 2IVNA 1SZ2A 2E20A 3FZMA 3QDKA 2FSKA 5JICA 3QBWA 2AA4A 2EWSA 1NGHA 2CH5A 4CZJA 4BREA 1S3XA 3VEWA 4EHTA 5ADXH 2ASMA 1ZC6A 5AQRA 1NGDA 3FR0A 2A41A 4CZIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C6AA 1TVRA 4CJ4A 4L3QA 4DUZK 3OBYA 3SLCA 2RF2A 3CFRA 4AH9A 5KQDA 4B1VA 1N8RO 4K25A 2YCHA 4FJGA 3T7ZA 3KK3A 4NCAA 3P83D 1D4XA 3A5LC 3HI0A 4H4MA 1ASUA 1HQUA 4OX9K 4YDUC 4LH5A 3NH2A 4M45A 2D5RA 3O4QA 5JS1A 1T8EA 4K0KK 1XHXA 4FVUA 4E7LA 4KTWA 1R59O 3O08A 1RBUA 2X6NA 3VF2A 4DV7K 2F4VK 1IKYA 1KRPA 4FJ7A 4J2AA 4W5RA 4LFBK 1NNEA 4FWPA 4JS4A 1N36K 4HUGA 4EZ6A 4DUYK 3M1FA 3TTCA 4C8LA 4V19S 4OLBA 4FZYA 1C0TA 3VQAA 3QNOA 2D0CA 3E9LA 3VQ5A 2Q0UA 5LY3A 3ULEB 3DXKB 5A2QO 4ILHA 4JEPA 4E7JA 3QEWA 4CFAA 2D4WA 4ZHRA 4C1NI 1C0FA 5BRFA 1RBRA 4PL8A 4CK3A 1BIZA 3QMLA 4O0JA 4ZTFA 5AZIB 3NGZA 4IXCA 5AQQA 4BGBA 1RT4A 3UB5A 3AVKA 4CVNE 2QTDA 3D0PA 4BR5A 4GV3A 1A5WA 2HHQA 5J2QA 5KPTA 3SQ2A 3UE5A 1EP4A 3QEIA 4YFUA 3KLGA 2NNWA 4JKFA 4F3TA 2GUPA 4Y0WA 1HNIA 2P9KA 3M8PA 3G4SN 2GELA 3RRGA 3ZX0A 4FJNA 4E1NA 4O44A 2PZSA 1L3VA 3NE6A 4BRHA 1BISA 3MEDA 4NB4A 2D0OA 4CEQA 3DLEA 3O9RA 4CEEA 2ASOA 4NLBA 3DLKA 4R5PA 5DMRA 4DTOA 4BRDA 1Y97A 5SZTA 5C2DA 3AVHA 1K8KB 1C6VA 1KFDA 3AVBA 3LDPA 4C8KA 1DTQA 1X9WA 2CGKA 3M8RA 4CD3A 3HOSA 4DTPA 1E3MA 3G71N 4YOXA 2HVHA 1N34K 3MX5A 3OY9A 4CHOA 3OVNA 2QWNA 1FKPA 2ASPA 4H0PA 1TKXA 4MLEA 3L4QA 4BROA 3H45C 4E89A 3THYA 1UOCA 3EZ5A 3HPHA 1CXUA 5AQKA 2XHBA 3ENOA 4BR9A 3O3HA 3CQXA 4KH5A 3T3FA 4JK8A 2X78A 2E2NA 3WNHA 3VQ8A 1T03A 3ZSYA 4QS8A 4F4KA 4DSKA 1IKWA 4E7IA 4OVLA 3MWPA 2YJFA 3K59A 4FOIA 3WQUA 3FFIA 4CEFA 3L2QA 2P9LA 3CF5L 1QQNA 1TUUA 4EIAA 3WXIA 2HF4A 4I2QA 4BY9C 4CGIA 3VA0A 1K8KA 2KQ2A 1VQMN 4CCHA 3SJHA 4B1WB 2HHUA 1NG9A 1ZXOA 1C0GA 2P9LB 3VQ4A 1GLAG 3B6OA 4OKJA 3KD1E 1VQ8N 3DI6A 3L6QA 4OPKA 1U2VA 3OYIA 4Z4EA 3CQ8A 3DM2A 3T1AA 1NLVA 1FJGK 2G8WA 4GY2B 5EOYA 4A59A 1KAYA 3NHGA 3OYFA 2ITGA 3DJCA 3F9KA 4UQGA 3AVGA 4H4OA 3A5MC 2B6AA 4OPAA 4AHRA 5IT9O 5ADXA 1O1WA 3QICA 3CPWM 1NK5A 4JKGB 4RW6A 4B1ZA 4B9NA 2YJEA 2OYQA 4M41A 4FWKA 3HBTA 4FWQA 1L5UA 4DR5K 3ZSRA 5M1NA 4IEIA 1CZAN 1JL1A 4DTJA 4PUOA 1U47A 3ZSXA 3C94A 3EKSA 3KIOA 4FWLA 1I3AA 3S41A 2HOEA 3ZX2A 5LJWA 3OYDA 1KCFA 4DFJA 5AQMA 2Z1HA 3H46O 3AA2A 5AQNA 1MDUB 3HZ6A 1ZBUA 4BE0A 4B3RK 4WYBA 4FWOA 1NK4A 1D8YA 3TR8A 3M5RA 1QHTA 4WQ4C 3CCEN 3ITHA 4IDKA 2HB5A 3LDNA 5EY4A 3V1QA 3UKRA 3NGIA 1SV5A 1S22A 3ENBA 5M1FA 3U3GA 1OVQA 3KTQA 3V6DA 2I5JA 4RCHA 1QHAA 3VTIA 2XY5A 2G8IA 2F7TA 3ZT3A 2P9KB 1SL1A 2VGNA 2UUAK 4HWIA 1ATSA 3KKRA 2F96A 3EEQA 3U9ZA 4DMNA 4DSEA 3LP0A 1JLAA 4BQLA 3LDOA 3TSUA 3EE9A 3PO4A 2GBZA 4CBWA 4B1XB 1D9FA 4JKBA 3CM5A 5HP1A 4DU3A 4K8XA 2DY4A 3P39A 1ILYA 2IVPA 3WEEB 5C10A 3ZT1A 4I6MB 5C42A 4C1NK 1HUXA 4RW4A 3IDHA 1QE1A 5AQIA 2QWMA 3QB0A 4CF8A 2PBDA 5K14A 3V1OA 4FZZA 2PFUA 1N32K 2P5OA 4BR0A 4A2AA 4JV5K 2YX6A 3VEOA 2XRIA 4MLHA 4DKWA 4XH5A 2O8CA 1VQ6N 3V9SA 4FLVA 4PQUA 1HYZA 2NUBA 4Q0BA 2ZGYA 3F9MA 4IOXA 2I7PA 3J8AA 3TWHA 5IWAK 1B92A 4FWNA 3T19A 3WXLA 1P8ZA 2GTDA 3CJ9A 4DV6K 3NF7A 4KHNA 2O8CB 1SL0A 3O9UA 1HNZK 4AM6A 3AVCA 3HT3A 3TAEA 5FLXO 2WFBA 4CGHA 3VENA 4C8OA 1XC9A 5FDLA 4DSFA 4IWVA 2GV9A 4JHDB 2O8BB 2P9NA 2ZQBA 4E7HA 4DLEA 4PHTX 4F9OA 4B9QA 4FM0A 2Q2RA 2GEMA 2F8SA 1FXXA 1HJRA 2O8BA 4KO0A 2V7YA 4CEBA 4CFCA 2E5LK 1ZBHA 4KPYA 1T6CA 2A40A 1RDWX 4FJHA 4WQ4A 3AO5A 3TPQA 4HTLA 1O13A 3FZLA 2QKKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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