3VEYA

Glucokinase in complex with glucose and atpgs
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 165
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3veyA01
3BEXA 1E4GT 2OANA 3QDKA 4BRFA 5BRHA 4JD2A 1NGAA 3A0IX 4Z94A 3MCPA 4EHUA 2EWSA 4CZEA 3ATVA 3FLCO 3WXLA 2A3ZA 1GLBG 1BUPA 3MN7A 3LDPA 3FZLA 4BRPA 4CZGA 1SZ2A 1S22A 3VENA 2V52B 5KQ8A 4MO5A 3FZFA 5JLHA 1JCFA 3VGLA 4AM7A 4DCHA 3LL3A 4ISEA 4CZIA 1BG3A 1DKGD 4BC3A 3A5MC 2YJFA 3FZMA 1Y64A 2Q0RA 1J6ZA 3M1FA 4IXCA 5E84A 2UYTA 3CIPA 2P9NB 2GELA 1ZBSA 3O1BA 3QMLA 1RFQA 1OKJA 1YAGA 5AR0A 4M7XA 1HJOA 4BR2A 5JLFA 1D4XA 4I6MA 1NGFA 2D1KA 3WXKA 3ZEUB 1R59O 3ZX3A 2E88A 2QWNA 4BQZA 4M7YA 2P9PB 4H0OA 2A42A 5BRFA 2ASPA 4HTLA 4YDUC 3CERA 4FPAA 1K8KA 1WUAA 4B1VA 4BVOA 1T44A 3VERA 2PBDA 2BTFA 4WQ5A 4JD2B 2QWMA 3MDQA 2D4WA 4BG9A 4DB3A 3WXIA 5AFUH 4BGBA 1BO5O 3EZWA 2V7YA 1U6ZA 2QWOA 3C0BA 1GLCG 4CBWA 3HSCA 1X9JA 4BVPA 1V4SA 2CGKA 2CGJA 4BR7A 2YJEA 3RSEA 2FLOA 2H3GX 5BPLA 1EQYA 4BC5A 3DWLA 3ENOA 3ZETB 4WYBA 4B9QA 2HF3A 4IJAA 2QW9A 3S41A 4FWOA 5BPNA 3F9MA 4BRLA 1T6DA 1QQMA 4L3QA 1CZAN 3GOIA 1RDWX 1WOQA 3WUHA 3DXKB 3CQXA 5F0XA 1QQOA 4FWQA 4I6MB 3ULEA 3I8BA 4BRNA 3DXMA 5AQJA 3ID8A 4CZLA 3AY9A 3SJHA 5ELZA 3VGKA 3WQTA 2NRHA 4H5WA 5AQZA 4QS8A 1ZXOA 3HM8A 3A8YA 2QWPA 1K8KB 1NGEA 4BRCA 4B1YB 2E1YA 2GEMA 2QM1A 3I33A 3ZEUA 1TUYA 5F2RA 3VEYA 4H5NA 2P9PA 1C0GA 1IJJA 1YUWA 3H3OB 4FWPA 1BA1A 2GWJA 2QWRA 2V51B 4CZFA 3WT0A 5EY4A 4PL8A 4WQ4A 3GL1A 5AQXA 4KBOA 1QQNA 2CGLA 3U4LA 3RSEB 1KXPA 3O4WA 3LM2A 3OHRA 4FO0A 3QFPA 2I7NA 3QICA 2ZWHA 3ZX0A 2Q97A 5LJWA 3MMVA 4ISFA 5FPMA 4Y0WA 3UKUA 2IVOA 1BOTO 4BRKA 3IFRA 1NGDA 5EVZA 3VEVA 4CI6A 4H0YB 5AQHA 2ASOA 3JS6A 1TUUA 4MLHA 4CBUA 2IIRA 3ULEB 3VF4A 3LDLA 3DXMB 2E8AA 3H1VX 4K25A 3C7NB 2A41A 3IDHA 3FE1A 2FXUA 2CH5A 5BREA 3FR0A 1HPMA 3QFUA 4BR4A 3DXKA 1IG8A 4CBXA 1P8ZA 2WUSA 3O8MA 1XUPO 3A5LC 2AP1A 2E2QA 3W3DA 2E20A 2YCHA 3G25A 4GNIA 3WEEB 1BA0A 4CZMA 3D2FA 2FF6A 5E26A 3CHWA 1HKBA 1TYQB 4H5VA 2A40A 3GBTA 3VEWA 2YHXA 1Z05A 4YDUA 3L4IA 1GLEG 5LJVA 3O80A 5BN8A 1NGHA 5CE3A 2VWBA 3TPQA 1NM1A 4C23A 5BPMA 2ZGYA 4BQLA 3R8EA 3UKUB 2E2OA 2AA4A 3CJ9A 2DPNA 3H3NO 4MO4A 4RTFD 4XH4A 1KAZA 1MWMA 4BRMA 4H5RA 1GLFO 5AFUA 1X3NA 3BF3A 5KPZA 2FSJA 1JCEA 4H0VB 3VESA 3JXUA 3B8AX 3U9DA 4WQ5C 1NGJA 4PKIA 4MLEA 3CJ7A 4CD3A 2QWLA 1HKCA 4RWTA 5B8HA 2Q0UA 3QB0A 4H0PA 1NGIA 3ATUA 5AQNA 2GTDA 5KPRA 5AQSA 2ZGZA 1NLVA 3O1WA 2Q1NA 2CH6A 2E2NA 4FL9A 4NO7A 4EIAA 5AQFA 3ENHA 4FWNA 1YXQA 2P9LB 2IVPA 1RGIA 1HX1A 1ATNA 3SMPA 1HKGA 5AQTA 5ADXA 5FPEA 3DAWA 1T6CA 4IWVA 3C7NA 3MN5A 2YI1A 2IVNA 2VYPA 3D2FB 4QS7A 3HTVA 3UE5A 4CJ7A 4JHDB 4BRDA 2ZF5O 1S3XA 2NLXA 1GLAG 4LC9B 3EKUA 4XH5A 1NBWA 5BN9A 4CZHA 4RCHA 2HOEA 4A2AA 3CJCA 3WEEA 4A62A 3LDQA 5AZJA 3A5OC 3SK3A 5AQKA 4CD1A 2P9IB 2P9UB 4QS9A 1GLLO 3VOVA 5LY3A 1TYQA 4BRHA 4FWRA 4H0XB 4FSVA 3WXJA 2Q36A 3A5NC 1NMDA 1LOTB 3KVGA 2P9SA 5AQGA 5TKYA 4BG8A 3FGUA 3UB5A 1G99A 1BDGA 1U2VA 4J8FA 1BWFO 3R6MA 3HBTA 3O5BA 4K41A 5KPTA 5AQPA 4HWIA 3VEZA 4BGAA 2Q31A 3KZBA 4B1WB 2NZTA 5JICA 3HZ6A 4H03B 3VPZA 4BRQA 3LM9A 1HLUA 5EX5A 3UKRA 3WQUA 4BREA 3H46O 2GUPA 1KAXA 2HF4A 3D7EO 4F9OA 1MDUB 2BUPA 3R9PA 2HMPA 3BF1A 1DGKN 1QHAA 1YVNA 2QWQA 2W40A 4A61A 3FFKB 4EHTA 3SMSA 2ASMA 1NWKA 2F9WA 2FSNA 5AZIA 3KHYA 1GLDG 3M6GA 4DQ8A 2P9LA 4M63C 3HI0A 1XQSC 4H0TB 4O5FA 5I9EB 5AQOA 4BR5A 4FWMA 4B1ZA 4ISGA 2W41A 3VGMA 1DEJA 3VEOA 3TU5A 4FOIA 5AZJB 3CETA 3CJ1A 3IUCA 3AARA 5F1XA 4JHDA 4BR0A 1LCUA 4JAXA 4GY2B 2A6AA 1E4FT 1MA9B 1NGGA 4XH1A 3L6QA 5FPNA 1Q18A 3CI5A 4FPBA 4PKGA 2P9SB 1ATRA 3QBXA 4A2BA 4EAHD 2P9IA 2P9UA 1U2VB 3MN6A 1SAZA 1ESVA 3O08A 3J8AA 4JNEA 3EL2A 5KQDA 5AQWA 2P9KA 4XEIA 3D2EA 1SQKA 2V7ZA 5FPDA 3H45C 4K42A 2QXLA 1H1VA 1Z6RA 5BRDA 1BU6O 3GG4A 3FZHA 2E1ZA 2I7PA 4PKHA 2FF3B 4NB4A 5AQIA 5BR9A 4H5TA 3VEXA 1MWKA 3UKRB 3IMXA 3BP8A 3GDQA 4IZ9A 3FZKA 1X3MA 3VF6A 3ZETA 1NGCA 2YHYA 5AZIB 5AQVA 4BRGA 4DHYA 2F9TA 2VCPA 3AAPA 4BRAA 3W0LA 2PAVA 3GE1A 1JCGA 1GLJO 2D0PA 3CJAA 4JN4A 1V4TA 4AM6A 5EXWA 3BUZB 5EOYA 5AQLA 4CZKA 3MN9A 4BROA 2FSKA 1ZC6A 5AQMA 1XC3A 1QZ6A 3MK6A 2ITMA 5ADXH 3O6WA 4BC2A 2GWKA 4K43A 3L0QA 3CJBA 3H6EA 3QBWA 4FWLA 3EO3A 1KAYA 3P4IA 4EFHA 2J4RA 3LDOA 5AQRA 4IO8A 4BC4A 1HUXA 4O8KA 5JMVA 2P9NA 4IJNA 4BRIA 2Q2RA 3VETA 4BR9A 4PL7A 3EN9A 2P9KB 5AQYA 3D2EB 4CZJA 2A5XA 1ATSA 3U9ZA 3EKSA 3CQYA 3U8XA 3H1QA 2KHOA 3DJCA 4E1JA 2D0OA 4FWSA 4FOEA 5AQUA 4B1XB 5AQQA 1C0FA 4B1UB 3AAQA 3LDNA 4FWKA 1NGBA 3VF2A 3ZX2A 3M3ZA 2E2PA 3SLCA 4WQ4C 1QZ5A 2YHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BEXA 1E4GT 4A5AA 1DLOA 3VMFB 4BRFA 3HK2A 5BRHA 3F2KA 1HYSA 4JD2A 1NGAA 3LWLA 1WNSA 1XI1A 1C0TA 4KFBA 4CZEA 1RT3A 4LF5K 3ATVA 4GV9A 1XHZA 4CW7B 3K5NA 3J81O 4CEFA 3HL8A 1RDCA 3D45A 2V52B 1SL2A 4C8NA 4CEOA 4IEEA 3VGLA 3QIPA 3LL3A 1DKGD 2YJFA 4JKGA 1Y64A 3M1FA 4IXCA 3DRPA 1J54A 4F8RA 4NYNA 2YNFA 1ZBSA 2B5JA 3QMLA 3EY1A 3DOLA 3VQEA 3AVCA 2D1KA 3C95A 1JKHA 1R59O 3TSPA 1RTJA 4BQZA 3THYB 1HRHA 2D0AA 4YOYA 3CFOA 4RW6A 4YDUC 4Z4IA 4FPAA 4RW4A 4L8RB 4OPHA 3KWIA 2BTFA 1RT2A 1CZBA 4CJFA 2QWMA 1Q82O 3MDQA 4ELTA 1VSJA 2KQ2A 3S9HA 5FROA 3ZT3A 1B9DA 4CGHA 3WNEA 1ASWA 3AVAA 4CIEA 2CGKA 4C1NK 2PFUA 4I2PA 4QCLA 1JL1A 2OPSA 4CF2A 2PYJA 5BPLA 1EQYA 1LW2A 3LP1A 3CCRN 4YOXA 3ENOA 2XHBA 3SAFA 4FK2A 4GV6A 4FVUA 3CPWM 4HUEA 3VQ5A 2D5RA 4IJAA 3ENBA 3CCUN 4Z4CA 4E7IA 3S41A 4HUGA 2O8EA 1UA0A 1YTAA 4CGIA 3F9MA 5BPNA 4JK7A 1TVRA 2KLAA 1QQMA 3L8BA 4AILC 1CZAN 1EETA 3HOSA 3GOIA 1RDWX 1RBRA 3RMDA 1WOQA 3A2FA 4PA1A 3ULEA 3I8BA 3AA4A 5AQJA 1XNQK 1EWQA 4B08A 4H4MA 5ELZA 4E7LA 4NYFA 3G6EN 2NRHA 3ZSZA 3V9SA 3HM8A 4FJLA 2QWPA 1QTMA 4W5QA 2E1YA 2GEMA 1IKVA 1BGXT 1QS4A 5F2RA 3VEYA 4H5NA 4DR3K 3JSMA 3ZT2A 4MQ3A 3LAKA 3OYEA 1IJJA 3CG7A 3H3OB 2YNIA 3O4NA 3RMCA 1NKEA 1BA1A 2GWJA 2QWRA 4DTJA 4FK4A 3S3NA 2EHGA 3U3YA 4OPJA 3PY8A 3WNFA 3TARA 1VAZA 1QQNA 3U4LA 4DTPA 4CJLA 3ZX0A 3K59A 1NG9A 2Q97A 4W5RA 3DLBA 1NK5A 4Z4HA 2IVOA 1BOTO 4M3ZA 3IFRA 1U45A 1HPZA 5EVZA 3VEVA 4DR7K 1VSEA 3K5OA 1RBTA 4CI6A 3KTQA 4B9LA 4IDKA 3IS9A 3F73A 2IIRA 3P1GA 4C8MA 3LDLA 3DXMB 2O4IA 4CHQA 2OZMA 3FE1A 3VQ9A 3FR0A 1HPMA 4BR4A 3S3OA 3DXKA 4CBXA 3HVTA 2UXBK 2WUSA 3AO4A 3A5LC 3N4PA 4O5BA 3W3DA 2YCHA 3G25A 1G15A 1BA0A 4B3OA 4Z4FA 4CZMA 3D2FA 4FJIA 1NKBA 1EO1A 2A40A 2YHXA 1Z05A 4YDUA 3LANA 1JJ2M 1NGHA 3P83D 2VWBA 4QAGA 1NM1A 4C23A 4IOXA 2ZGYA 4U67L 4BQLA 4DFPA 2AA4A 3CCJN 4U7BA 4XH4A 1VRTA 4H5RA 1GLFO 1X3NA 1RNHA 3BF3A 1B9FA 1ZBHA 4E7JA 3JXUA 3B8AX 2OPRA 1W7AA 4WQ5C 1IO2A 1NGJA 3CD6N 3PO4A 2O8CA 2Q0UA 3QB0A 4H0PA 5JS1A 5AQNA 3LZIA 3THVA 1D9DA 2HBJA 2QKKA 2BANA 3P38A 4Q0BA 3O1WA 1CXQA 3LP0A 4EIAA 5AQFA 1ZBLA 3I8DA 3CC7N 1BI4A 4M3XA 3ENHA 4CEBA 4JLHA 2NRVA 2WOMA 5ADXA 3DLLL 2XRIA 1DTQA 1NJXA 2AJQA 3C7NA 4DR6K 2YI1A 2VYPA 4QS7A 3T1HK 1S3XA 4H8KA 5SZTA 4OGCA 4KRFA 5KRSA 3EKUA 4XH5A 1YITN 1KVCA 1NBWA 4K0KK 4CZHA 4RCHA 3F5TA 3PX6A 5AZJA 3CYMA 4NLBA 3VOVA 2P9UB 4DMNA 4FLVA 1TYQA 1NU0A 4I7FA 1J53A 4G1QA 3HPHA 1L3TA 2HSTA 3AVGA 4FSVA 1S1UA 3ZSWA 5IWAK 4CHPA 3UB5A 1WAJA 2OPQA 4J8FA 1BWFO 4YFUA 2XO7A 3HBTA 5C15A 3NGIA 3SBTA 3OYJA 1VQ8N 4CJKA 3KZBA 3BDPA 4B1WB 3HRGA 1CXUA 5HOOA 2W42A 3WQUA 4DSKA 5EU7A 4F9OA 2OTJN 3AVLA 3LALA 5C12A 2W40A 4A61A 2QXFA 3THWB 2ASMA 4UY8O 1GOBA 5AZIA 3MEEA 4YOUA 3CF5L 4M63C 4DTNA 4FJNA 4O5FA 4FJXA 1E3MA 5I9EB 5AQOA 4X65K 4FWMA 4ISGA 1K6YA 3OYBA 3LAMA 3CETA 3CJ1A 1BCMA 1KD1O 3E9PA 4B9NA 4LD0A 3SUPA 1E4FT 1HYVA 3L6QA 1VK0A 4IFEA 5FPNA 2O8FB 3CI5A 2P9SB 2IGIA 3QBXA 4A2BA 3L3UA 2YNGA 5C2FA 2IOCA 1ESVA 2ZE2A 5KQDA 1TL3A 4AHRA 4FM0A 4CJEA 1SQKA 2V7ZA 4ZTJA 3T19A 2QEXN 1YJ9N 4OPAA 1YIJN 3M8QA 1C0UA 1RDUA 2I7PA 3BGRA 4JV5K 3G4SN 3NH1A 1VSHA 3SAHA 4IZ9A 4KREA 3VF6A 1BL3A 1S6QA 1NGCA 2YHYA 5I3UA 1OVYA 2WC9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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