3VEYA

Glucokinase in complex with glucose and atpgs
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
b'TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 165
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3veyA01
3UKUB 3D2EA 3MCPA 4H5WA 5I9EB 3H1VX 5AQTA 1MWKA 3QDKA 2QWOA 4FO0A 3QBXA 1YAGA 5TKYA 2CH5A 4PKHA 2GWKA 4XH5A 3CJ1A 4ISEA 4FWQA 4B1UB 1TYQA 4CZIA 2V7YA 3MN7A 4MO5A 1HKBA 4GNIA 4BRDA 4H5NA 1MWMA 4KBOA 1KXPA 3LM2A 5AZJB 4WQ4C 3U9DA 1NGAA 1MA9B 5JLFA 5FPMA 2HMPA 2E8AA 4BRPA 3VGMA 4CBWA 3MDQA 1HLUA 2QM1A 4H0OA 1BWFO 2A42A 5BPMA 1DKGD 2V52B 4FWLA 2FF3B 4BRGA 2A5XA 5AQWA 3MN9A 3HZ6A 3FZKA 5AQIA 3ID8A 4FWOA 1Z6RA 4DHYA 3D7EO 3DXMB 2QXLA 3LDPA 3O1WA 5LJVA 1KAYA 1NGCA 4J8FA 4NB4A 2ITMA 2FXUA 3ENOA 4B1ZA 5AQSA 5EX5A 5AQMA 2ASPA 2VCPA 2P9LA 2A40A 3LDQA 3D2EB 2P9IA 3FE1A 3H46O 3EL2A 1ATSA 3VESA 2Q0UA 4HTLA 1ESVA 4E1JA 2E2NA 1TYQB 1V4SA 5BRDA 3O1BA 3H3NO 2FLOA 4GY2B 2H3GX 2P9KA 5AQQA 4BRIA 4CZFA 3VETA 1GLEG 4FWPA 4B9QA 4BROA 2Q1NA 3WQTA 4FPBA 4WQ5A 2QWQA 3H45C 4CD3A 4H5RA 2A41A 4PKGA 3FR0A 2P9UA 3VEXA 4BQLA 1E4GT 1ZC6A 2BUPA 3ZX3A 2AA4A 4FL9A 1GLLO 3BUZB 4BG8A 4RWTA 3BF1A 3FLCO 4B1XB 4IXCA 4O5FA 2BTFA 1TUUA 1XUPO 5EY4A 5AR0A 3W3DA 2NRHA 3CQXA 3U4LA 2P9LB 4H0VB 2W40A 4BVOA 3ZX0A 1YVNA 3VERA 4FWSA 2WUSA 1X3NA 4BC2A 4M7XA 4H0TB 1SQKA 4CD1A 5ADXH 3L0QA 3HTVA 2UYTA 3HBTA 2D0OA 3WXIA 3M3ZA 1E4FT 3GBTA 2P9KB 5E26A 3R9PA 3WEEA 3EO3A 3VF2A 2F9WA 4BQZA 3TPQA 3GDQA 1DGKN 1XC3A 1BUPA 2V51B 2P9SB 3FZHA 4FWKA 3KHYA 1WUAA 2E1ZA 5LJWA 4FPAA 2GWJA 4K42A 4XEIA 2D4WA 2I7NA 2YJEA 4WYBA 3WXLA 4CJ7A 3LM9A 4JD2A 3S41A 3AAPA 4JAXA 3C7NA 4IJNA 2EWSA 3M1FA 3WQUA 5BN8A 1LCUA 5F2RA 1QZ6A 3EN9A 1Q18A 3A0IX 2VWBA 4DQ8A 5KPTA 1GLDG 1JCGA 3O6WA 1KAZA 4FSVA 4B1WB 4IJAA 4BG9A 3A8YA 4WQ4A 4FWRA 3UE5A 3ZETA 5BPNA 1GLBG 1YUWA 3AY9A 2YI1A 4BRAA 2CGJA 2IVOA 3CI5A 3ULEB 1X9JA 2ZWHA 2Q31A 1EQYA 5JLHA 4BR4A 5JICA 2QW9A 3OHRA 3CHWA 3UB5A 4FWMA 4LC9B 2GELA 3FFKB 3WEEB 1DEJA 5AQHA 3UKRB 3VPZA 3AARA 3TU5A 4BRQA 4BRMA 5KQDA 1NGFA 3RSEB 4XH1A 1GLFO 2QWNA 1D4XA 4JD2B 2DPNA 4JN4A 5AQXA 4A62A 3VGKA 4EIAA 3C7NB 4RCHA 3C0BA 2D0PA 2E20A 2FSNA 5FPDA 5AZIA 1S3XA 4H03B 4M7YA 5EOYA 4IZ9A 3EKSA 4BR2A 4BRLA 3VGLA 4AM6A 2AP1A 4O8KA 3GE1A 4PKIA 5AQGA 1SAZA 3ZETB 3SMPA 2F9TA 2A3ZA 2ZGYA 3ZX2A 2PBDA 3J8AA 3B8AX 4QS9A 2P9PA 2YCHA 2P9SA 3VEOA 5B8HA 4JHDA 4YDUC 1U6ZA 1T6CA 1S22A 1HKCA 1RFQA 1HPMA 5ADXA 3VEVA 3R6MA 2GEMA 2Q97A 3D2FA 3CJ9A 4FOIA 4BR9A 1Z05A 2CGKA 3LDOA 4BRFA 4MLHA 3VF6A 3HI0A 1T44A 4C23A 3QFUA 1X3MA 4XH4A 3L6QA 4BRNA 1C0GA 2NLXA 3O5BA 5AZIB 4CZGA 4CBXA 4K41A 3DWLA 5AQKA 5EXWA 3HM8A 4K43A 1Y64A 3ULEA 1QQNA 2VYPA 4B1YB 5E84A 1SZ2A 1H1VA 3BP8A 1V4TA 1CZAN 4DB3A 2ASMA 5AFUH 5FPEA 1WOQA 3IFRA 1QZ5A 2QWRA 2Q36A 3JXUA 2QWPA 3UKRA 3VEZA 5AQYA 2P9PB 3SK3A 3QBWA 4RTFD 4PL7A 3RSEA 4JHDB 5AQJA 4EFHA 5AQNA 3WXJA 5AQLA 4MO4A 3QICA 3O8MA 3QMLA 5CE3A 4H0YB 2KHOA 4A61A 4A2BA 3D2FB 4CZKA 4ISFA 1NMDA 3LDNA 2FF6A 1MDUB 4CBUA 2IVPA 5BRHA 1NGDA 4IO8A 2CH6A 1NGBA 1NGJA 2ASOA 1JCFA 3VENA 5AQUA 3EKUA 3G25A 4B1VA 4I6MA 5AQRA 4BC4A 1TUYA 4F9OA 3CIPA 2GUPA 1IJJA 1BOTO 1BU6O 1YXQA 3QFPA 3CJCA 3F9MA 3CJAA 1ATNA 2Q2RA 1NGIA 2E88A 1GLCG 2OANA 1BG3A 3IDHA 4EAHD 2D1KA 1BA0A 2I7PA 3MK6A 4EHUA 2HF4A 4CZMA 5F1XA 3BEXA 1G99A 3CJBA 3DJCA 5AQFA 5FPNA 1HUXA 3HSCA 1P8ZA 4QS8A 3CQYA 4FWNA 1K8KA 5EVZA 3FGUA 4BC3A 5AQPA 5KQ8A 2ZF5O 1JCEA 4A2AA 2P9NA 3I33A 3U9ZA 4EHTA 3H6EA 1GLAG 3R8EA 3GOIA 1NLVA 1C0FA 2V7ZA 4BC5A 5F0XA 2Q0RA 3L4IA 1NGEA 2HF3A 1QHAA 3CJ7A 4BRHA 3FZLA 5AQOA 1HJOA 4JNEA 3DAWA 1QQMA 1HKGA 2FSKA 4BREA 5KPRA 4BVPA 1U2VB 4HWIA 5KPZA 1RGIA 2E1YA 4I6MB 3VEWA 1NGHA 4YDUA 3DXKB 3WXKA 2YHWA 2E2PA 3SLCA 1ATRA 5LY3A 3CETA 4H0XB 1ZXOA 1RDWX 4PL8A 2A6AA 2J4RA 4CI6A 5AFUA 2IVNA 4BRCA 3H3OB 2E2QA 4MLEA 4K25A 4FOEA 3W0LA 2NZTA 4BGAA 3GL1A 2QWMA 1BA1A 4CZJA 1BDGA 3JS6A 1K8KB 4H5TA 3ZEUA 5BRFA 4Z94A 3EZWA 2P9NB 5BR9A 3KZBA 5BREA 4IWVA 3IUCA 4H0PA 3M6GA 4WQ5C 4BRKA 4BR5A 1GLJO 1T6DA 3MN5A 3LDLA 3FZFA 5ELZA 1NBWA 3UKUA 5BPLA 4CZLA 3O80A 4L3QA 2QWLA 1NWKA 5BN9A 2YHYA 2HOEA 1R59O 1KAXA 4CZHA 3VOVA 5AQZA 3ENHA 1NM1A 1XQSC 5JMVA 3KVGA 3U8XA 2P9IB 4NO7A 1OKJA 3ATVA 5AQVA 3GG4A 3IMXA 3O08A 4M63C 4Y0WA 3SMSA 5AZJA 1ZBSA 4ISGA 2PAVA 1NGGA 3A5NC 3BF3A 3O4WA 4H5VA 3A5LC 3WUHA 4DCHA 2IIRA 4AM7A 2CGLA 3MN6A 2GTDA 3P4IA 1J6ZA 3I8BA 3QB0A 1LOTB 3A5OC 2FSJA 3FZMA 3ZEUB 4QS7A 3CERA 1QQOA 1BO5O 3A5MC 3MMVA 3DXMA 3VEYA 2YHXA 2P9UB 4BR7A 4CZEA 1IG8A 3VF4A 4BGBA 1U2VA 3H1QA 3SJHA 3WT0A 4BR0A 3AAQA 2E2OA 2YJFA 1HX1A 3ATUA 3DXKA 2ZGZA 2W41A 3LL3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H5WA 1VSEA 5GADP 4O55A 1YHQN 4OPHA 4IG3A 2XY6A 2BH1A 4KTQA 4OLBA 3CJ1A 3MN7A 2ZJRL 5J2PA 1MWMA 1N8RO 3HRGA 2HHWA 1NGAA 2F8TA 3ASMA 2HMPA 1NK8A 4K8ZA 3VGMA 3MDQA 2QM1A 4H0OA 3E9OA 1DTTA 1S1VA 4BRGA 3PO4A 4PY5A 2A5XA 4JK7A 4AHTA 2I5JA 4O5BA 3LDPA 3NF6A 1NGCA 4J8FA 4B9TA 2ITMA 1VSDA 2FXUA 3ENOA 5AQSA 4DLGA 4B9NA 5HOOA 3FE1A 4DV3K 2GUIA 4M41A 2Q0UA 3HL8A 1TL1A 3CCLN 4E1JA 2AJQA 4ILGB 1HQEA 1TYQB 1LWCA 3SV3A 3VETA 2HHSA 3T1HK 2UUCK 4CF9A 4BROA 2DFHA 3L2QA 4FPBA 3SPYA 4CD3A 3K5MA 4RW8A 1ZBIA 5CHIA 3ZSOA 4W5OA 1E4GT 1ZC6A 4IEIA 3THYA 4DSKA 4N47A 4BG8A 3ULDA 3BF1A 3FLCO 4B1XB 3NVKA 3HO1A 4M3RA 4DFKA 1TUUA 1HNVA 3CQXA 4GVMA 1TAQA 4C1NK 3J7YP 3SQ4A 2VG5A 1YVNA 3BGRA 3VERA 3THVA 4YOUA 1IBKK 4A59A 4M7XA 3OYEA 4KB1A 2QXFA 4PA1A 4CD1A 5LMNK 1HR0K 2UYTA 3HBTA 2D0OA 3WXIA 1WBBA 3GBTA 5E26A 3WEEA 3VF2A 4B8CA 3CCVN 4DSEA 2F9WA 1JLFA 4CJ3A 3KD5E 4IFYA 3V9SA 5LJWA 3JYTA 2O8DA 2OPQA 3WXLA 1UA0A 4OJRA 1Q82O 3C7NA 3VN5A 4IJNA 3WQUA 5C25A 1TGOA 4DTRA 2RHKA 1I39A 1QZ6A 3KLIA 4KV8A 3JAMO 3AVLA 3MWPA 1T03A 1GLDG 1WN7A 4DQQA 1KAZA 1FK9A 4BG9A 3SCXA 2JLEA 3I0RA 5BPNA 2HBMA 2ZWHA 2BGGA 3SBGA 4HUGA 4OPJA 4HCBA 3V9WA 1N34K 1C1BA 4DLEA 2O4GA 3LDSA 2GELA 3FFKB 5KGWA 4CJFA 3TU5A 4BRMA 4DQPA 1YVUA 3F2KA 5GAGP 3TANA 1RDCA 2WTUA 4JKBA 5AQXA 1RBSA 4FYDA 4RCHA 4DKWA 4K0KK 4B8AB 4M7YA 4FJLA 3RVCA 1N6QA 3THWB 2O8CB 2EHGA 2R7YA 3OW2M 3H08A 4O8KA 3L2VA 5AQGA 3C6TA 4AHVA 1SAZA 3ZETB 4CGIA 1B9FA 4X62K 3MEDA 1KCFA 3DLEA 3K5LA 1XC9A 4NLCA 4JI8K 3ISNC 3VEOA 1VQ4N 5B8HA 4JHDA 1J9AA 1NJYA 1C0MA 1U6ZA 3E9LA 2QA4N 3HM9A 3DLBA 5ADXA 3E01A 3VEVA 3D2FA 4CGDA 4J2DA 4FOIA 4BR9A 1SV5A 2F7TA 1RTJA 3I55N 4G9ZA 2EX3A 4MLHA 3VF6A 4C23A 4DR2K 2NLXA 1MU2A 4CEOA 4DG1A 3J81O 1RBVA 3EYZA 1VQ7N 1J5OA 4KHNA 3SZ2A 4K41A 4CHNA 3DWLA 3KIOA 5EXWA 5FROA 3ULEA 1Y64A 3SUPA 2VYPA 3J7ZO 1H1VA 3KKSA 1CZAN 1J54A 5AFUH 5FPEA 4BWMA 4N41A 2ZD1A 2KFZA 1HNIA 3KTQA 4E7KA 3JXUA 3WXMB 1UAXA 3VEZA 3EE9A 5AQYA 2P9PB 2VG7A 2G8KA 3DI6A 3RSEA 1CXUA 4CECA 4FZZA 4Z4HA 5AQNA 5AQLA 3K58A 4OKJA 4ILJA 4LSNA 4A61A 1NK4A 4KTZA 2KLAA 3OYJA 1XHZA 3CD6N 3NGIA 4IO8A 4DQRA 4RW7A 2CH6A 1LW0A 4IOAL 1HNZK 1IKXA 3EKUA 2ZQBA 3G25A 4CFAA 5GINA 3CCSN 3UIQA 2Q3SA 4FVMA 3NDKA 1TUYA 4NXNK 3CIPA 4DV5K 1YXQA 3QFPA 1WSEA 3CJAA 2ITGA 3ZT0A 1NGIA 4HUFA 3V9XA 3ZSXA 3IRXA 1VRTA 3IDHA 3TTCA 4EHUA 4JRPA 3BEXA 3CJBA 4Q5VA 4FM2A 3R3LA 4FJ5A 1EWRA 4QS8A 4FWNA 1K8KA 3FGUA 2ZF5O 1Q8IA 3C94A 3P39A 4EHTA 1GLAG 3R8EA 3OYDA 2V7ZA 2Z1IA 3HVRA 3DLRA 2O8FB 4FW2A 1Z26A 4BRHA 3FZLA 1HJOA 4E7HA 1J5EK 3DAWA 2FSKA 2JWKA 2IDOA 1C1AA 2YKNA 4E7LA 4HWIA 2FBTA 3ZT3A 2QK9A 1RGIA 2NRWA 3QIPA 4CHYA 5HRNA 2UUAK 1RBUA 1WSJA 5CR4A 3T3FA 4ELTA 2PFUA 1YJ9N 1VQON 4H0XB 2RKIA 1RDWX 4OKKA 1JKHA 4IDHA 3PIOL 3H3OB 3DLLL 2E2QA 2NZTA 3RR7A 2P5GA 4DV6K 1HNXK 1BA1A 2QKKA 4CZJA 3LAMA 2QEXN 1J53A 1RNHA 4H5TA 3ZEUA 4Z94A 4JS5A 4O4GA 4J2EA 3ITHA 3O9QA 2G8HA 1Q7YO 4H0PA 4BRKA 1TL3A 3CCUN 4B9MA 1GLJO 2GBZA 3TABA 3AA3A 4CZLA 2QWLA 3G4SN 2HOEA 5IT9O 2NRRA 2NRXA 4M3WA 3CPWM 4CJTA 4Z4EA 3HVTA 3AVHA 4M63C 1IH7A 4ID1A 1IKVA 2B4JA 5E41A 3O9UA 3OYFA 2PAVA 5HROA 3A5LC 4R5PA 3WUHA 3K2PA 5FRNA 2HB5A 3HT3A 2CGLA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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