The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
105
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structure length |
105
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Chain Sequence |
GALPNFIPGLGTLYVDPSTLPEGPFLAYDRAGNLVKVVFMVPLKKLNESHKYVDIGTKTLRALGITRIDHVNMIPSGPHPGVSEPHYHIELVLVSVDQERKVLEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Unknown function
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| source organism |
Thermus thermophilus
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| publication title |
Crystal structure of hypothetical protein TTHB210, controlled by the [sigma]E/anti-[sigma]E regulatory system in Thermus thermophilus HB8, reveals a novel homodecamer
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical Protein TTHB210
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| total genus |
21
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| structure length |
105
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| sequence length |
105
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H, I, J
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VG8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1LPZ B; 5EU8 A; 1BRB E; 5HIY A; 2VWL A; 4CR9 A; 3RUO A; 4D8N A; 2TGA A; 2A0Q B; 3SI4 H; 3ZYD A; 1DST A; 1F0S A; 2OP9 A; 2QF4 A; 3I29 A; 4BXW A; 2ZFQ H; 2K8I A; 1Y3V A; 3LGW A; 2ZF0 H; 3MH6 A; 1AN1 E; 5EOK A; 5A0B A; 1GDQ A; 4CRA A; 4MPW A; 5TJX A; 5HIZ A; 1GHZ A; 3TPI Z; 3TJV A; 2OBQ A; 2ZHQ H; 2G5N A; 3MO6 A; 2ANM H; 2ZTX A; 4YLQ H; 4X8T H; 4BAH B; 3O8D A; 1O5G H; 2G4U A; 3MMG A; 3RM0 H; 2AMP A; 4FUG A; 4ISO A; 4AYY B; 2PKA B; 3GDS A; 4MNX A; 4AN7 A; 1HJ8 A; 3OEE D; 1IHT H; 1XKB C; 3A8C A; 2FS8 A; 1LVB A; 3SI3 H; 1Y5U T; 3W94 A; 2H1U A; 1K9O E; 3ZZ4 A; 1LKB A; 3BTD E; 2TGP Z; 3VB4 A; 1A4W H; 4ABD A; 2PKA A; 2BQ7 B; 5E2O A; 2YNB A; 3UR9 A; 2F3C E; 2B9L A; 1XX9 A; 2BXT H; 4TT3 D; 1EP6 A; 1KSN A; 4INK A; 2BVR H; 5C5N A; 2UUY A; 3B8J A; 3KQC A; 4FVB A; 4A1V A; 6CHA B; 1GJC B; 1QRZ A; 1ZJK A; 2PUQ H; 1SB1 H; 3P8G A; 1TX6 A; 1ELE E; 3BEF B; 3NPS A; 1OWI A; 1W0J D; 4ABG A; 5A2M H; 2P3F H; 3BN9 A; 2ZDL A; 4ISL A; 1GHB F; 1HAZ B; 3SNA A; 3SU0 A; 3DSO A; 1IQI A; 3E16 B; 3LGY A; 1KTS B; 1UVT H; 2P95 A; 4X6N A; 5DP6 A; 2HAL A; 1EP5 A; 3GY5 A; 1W10 U; 4ABA A; 4F4O C; 1TNH A; 2FOB A; 4BTI B; 1P9U A; 2AIP A; 1DWC H; 4TY7 A; 3PWB A; 5GDS H; 3T2N A; 3S9B A; 1Y3Y A; 3OY5 U; 4OGY A; 1YKT A; 1GCD A; 2R2M B; 2FOF A; 2UUK B; 4WF8 A; 1O35 A; 2BD8 A; 3KEE A; 5IYT A; 1P10 A; 1Z8I B; 3OTP A; 2BHG A; 2HLD D; 1TBZ H; 2BY5 X; 1UCY E; 5EQR A; 3SZN A; 3GS9 A; 1L1J A; 3A88 A; 3QDZ B; 3GCN A; 1KXA A; 2RCE A; 1MKW K; 1NRN H; 5GCH G; 2GKV E; 5DG6 A; 3AW1 A; 3RXK A; 4BTU B; 1A0J A; 1EAS A; 1TPA E; 1KXD A; 2OQ5 A; 3ZYE A; 2PWX A; 3F0P A; 1T4V H; 1DS2 E; 3LIW A; 3QTV H; 4D9R A; 2P94 A; 1JXP A; 1D6W A; 2J5U A; 1DY9 A; 3SGA E; 4K69 A; 2ZGC A; 4X1N U; 4FUD A; 1TX7 A; 1Y3X A; 4UE7 H; 1A5H A; 4OS4 A; 4DIH H; 1AGJ A; 3LKW A; 4YXW D; 1O2V A; 1O2O A; 3FZD A; 3GY3 A; 2TGD A; 4BAN B; 3QK1 A; 1O3B A; 2ZQ2 A; 1P12 E; 5A8Z A; 2XBW A; 3NWU A; 2C3S A; 1ZML A; 4AG2 A; 2D8W A; 2B0F A; 1K1I A; 1GBL A; 1FAX A; 2NU0 E; 1FY4 A; 1O2P A; 1OS8 A; 1DXP A; 1XXD A; 3FN8 A; 1SVP A; 4IC6 A; 1FXY A; 3RXT A; 3O8B A; 2GCH G; 3KQD A; 4X6O A; 1EB1 H; 1C1V H; 1PPE E; 4BNR A; 3WWF A; 4WMD A; 1SI5 H; 1AI8 H; 4IMQ A; 1TGB A; 3KQB A; 1VCW A; 1K2I 1; 4AFQ A; 3RXL A; 1RRK A; 4GCH F; 3U8R H; 3SV9 A; 2OTV A; 2QXH A; 3C1K A; 4KP0 A; 4INH A; 2FX6 A; 3NRL A; 4F48 B; 1THP B; 3E6P H; 4Y8X A; 1K1O A; 4ABB A; 2GV7 A; 1CHG A; 3SUG A; 4ZKO U; 1H9L B; 4B6F A; 3D49 H; 2EI6 A; 4ZCN A; 5L30 H; 3FZZ A; 3K65 B; 2P8O C; 3FAO A; 3LON A; 3EAJ A; 4ZH8 A; 5C0U A; 2ZA5 A; 5EST E; 2WPK S; 1AO5 A; 3QZR A; 1SLV B; 3P8O A; 1QBN A; 3RXJ A; 1O2K A; 3UFA A; 2FOE A; 1ZRB A; 3KYG A; 5F8Z A; 2PHB A; 1ANE A; 3RXQ A; 1CA0 C; 1GHX H; 5BPE A; 2Y7X A; 2AIQ A; 3TLO A; 2ODP A; 2JH5 D; 1SLU B; 4Y8Z A; 3ZZ6 A; 1J9C H; 5EJZ A; 2ZO3 H; 1C1R A; 1UHB A; 2BMG B; 4Z0K A; 2HVX A; 1TIO A; 3LC3 A; 4GPG A; 2H6M A; 5A0A E; 2ZU3 A; 5LPF A; 1HJ9 A; 3RU4 D; 4LZ1 H; 1GMH G; 1AWH B; 2VBC A; 1ZSK A; 2BOH B; 3A87 A; 3GIC B; 4NSV A; 2D2D A; 1F5L A; 2F91 A; 4Y0Y E; 2BDG A; 3PV5 A; 3UQO A; 2Z3E A; 2L74 A; 1AU8 A; 4ZXY H; 1NFY A; 1XMN B; 4B2B A; 3AAV A; 3GY7 A; 1O38 A; 2G81 E; 1DLE A; 1P2I A; 4J1Y A; 2JH0 D; 1O2U A; 1O2M A; 3RML H; 5T6G A; 1GCT C; 1S83 A; 1G3D A; 2FOG A; 2ANK H; 1OP0 A; 3SUD A; 1FNI A; 2BDB A; 5B6L A; 2QYI A; 1F5K U; 5GPI B; 1S6L A; 2Y80 A; 1UJ1 A; 2HGT H; 1HIA B; 4JZD H; 2AMQ A; 4K1S A; 3ZZ9 A; 4YOJ A; 4AB9 A; 1UTJ A; 3DUX H; 1P04 A; 1KLI H; 5F8X A; 3B23 B; 5DO4 H; 1MQ6 A; 2Y5H A; 2BYA X; 1RS0 A; 3H09 A; 3OX7 U; 4D7F A; 1SGE E; 1O3E A; 1U6Q A; 1UK4 A; 1UVU H; 1W12 U; 4FET A; 3T27 A; 4X1S U; 3RU4 T; 4Z1M D; 3GDU A; 1F2S E; 1A46 H; 2KAI A; 3ATW A; 1K1J A; 3ZVF A; 2H2Z A; 1OP2 A; 4F49 A; 3RXS A; 2Y7Z A; 1UTN A; 2EI7 A; 1THR H; 5E0G A; 2KR7 A; 3PTB A; 3GCT G; 3BIV H; 3GY8 A; 1DUA A; 4ZKN U; 1Q31 A; 4HG6 A; 5E2P A; 1T7C A; 4YZU A; 3E90 B; 5FL7 D; 1CGJ E; 3R0F A; 2M2A A; 3RXU A; 3CNR A; 1TON A; 1O3M A; 5EW2 H; 3VFE A; 2SGD E; 3F2G A; 3RXA A; 1GJ5 H; 5FCK A; 2ODY B; 1XUK A; 1MAX A; 2QY0 B; 1AUJ A; 1N6X A; 1C4U 2; 2P8O B; 1UTQ A; 4WH6 A; 1TOC B; 1L4D A; 1DFP A; 1G36 A; 4E7N A; 4VGC C; 5DGJ A; 3KQE A; 2QC2 A; 2ZPS A; 1LVO A; 1CA0 B; 1ETT H; 3O8C A; 2JIZ D; 1HDT H; 3RXO A; 1AD8 H; 1WSS H; 2THF B; 2B7D H; 2LEL A; 4IS5 A; 4E05 H; 4LXB H; 4P02 A; 3EA8 A; 1DX5 M; 1CSO E; 3ZVE A; 3HPT B; 2ZCK P; 3IIT A; 1O2S A; 4D76 A; 2KCO A; 1C1S A; 1F0R A; 3RXV A; 2PTC E; 1FPC H; 1DT2 A; 1TNI A; 3GCO A; 1NRP H; 4X2Y A; 3MWI U; 3M7T A; 1GJ7 B; 1GCT B; 3BTE E; 1C5Q A; 5HYO A; 3OU0 A; 1O2R A; 1A61 H; 1O34 A; 4THN H; 1NY2 2; 1Z8J B; 4Q2K A; 1N8O C; 4H4F A; 3ATI A; 3EDX B; 2OQU A; 1ZHP A; 1NU9 A; 3SBK A; 8EST E; 2GZ9 A; 4WME A; 3UTU H; 1ELA A; 1UVS H; 1GBC A; 1YGC H; 1J14 A; 1MBM A; 2R0L A; 3URD A; 2FLR H; 3OAA D; 4K1T A; 1HNE E; 4NZQ A; 4TWW A; 1UVO A; 2HNT C; 4IN2 A; 3BEU A; 3KNX A; 1GG6 C; 1AE5 A; 2B8O H; 3PV4 A; 2KCA A; 2ZHF H; 1DIT H; 1YLD A; 1GI6 A; 1DE7 H; 1S84 A; 2W26 A; 1SGD E; 2P59 A; 1G2M A; 3L3T A; 1ZHR A; 2WPL S; 3F6U H; 1KXF A; 4DCD A; 3RLW H; 1WCZ A; 1W0Y H; 5LPE A; 4TPI Z; 1ELB A; 1W7X H; 2XBX A; 1B0E A; 1P2Q A; 1S81 A; 3Q3Y A; 4B6E A; 3S9C A; 1HB0 B; 3BTG E; 3K2U A; 1P01 A; 3MU0 A; 1C2L A; 3FKS D; 2FIR H; 3P6Z B; 2BY8 X; 5EGM A; 2VIW A; 4X8U H; 1O2N A; 4Q80 A; 5EXN A; 1GJ6 A; 3VB7 A; 3U9A H; 3I77 A; 1HCG A; 1H8H D; 2BD7 A; 1B5G H; 3FP7 E; 3HGP A; 1O36 A; 2FOA A; 1UTL M; 4DVA U; 2R0K A; 1S0R A; 1TAW A; 1BJV A; 3PWC A; 4O97 A; 3S0N A; 4DGJ A; 4GCH G; 3P95 A; 1BMF D; 4Y7A A; 3DFJ A; 2F9U A; 5J4S A; 1IQH A; 5GCH F; 1Z7K A; 2ZGH A; 4RT0 A; 4YO9 A; 2ASU B; 1K0H A; 1Q3X A; 1EB2 A; 1SR5 C; 4ASH A; 1ARB A; 1CO7 E; 1F7Z A; 4D7G A; 1FPH H; 4HFP B; 2J95 A; 4ISN A; 1A2C H; 1NC6 A; 5JBB S; 1EJA A; 4NIV A; 5JB8 S; 5EIY A; 1HAO H; 1SFQ B; 5C1Y A; 1HRT H; 3UOU A; 3URE A; 3RDZ A; 2IJD 1; 4XD7 D; 3W95 A; 2AEI H; 4B75 A; 1VKY A; 3TJO A; 1MAY A; 2KFW A; 1C1Q A; 4K8Y A; 5DP9 A; 2Z9L A; 3P8F A; 1N8O B; 4CRC A; 2ZGJ A; 1C2I A; 5DP4 A; 4AG1 A; 1FQ3 A; 3PRB A; 3G01 A; 1O5B B; 3P92 A; 3LDX H; 1RIW C; 3PO1 C; 3V0X A; 4KTS A; 2HRV A; 2ZFS A; 2GCH F; 2G5V A; 3CEN A; 4NA9 H; 5GJ4 B; 2CGA A; 1A0L A; 3P8N A; 2NWN A; 7GCH G; 1D6R A; 2W7U A; 5K0H A; 1GG6 B; 4MNV A; 2ZDA H; 3RMO H; 1A0H B; 2SNW A; 1PQA A; 4Y79 A; 2V35 A; 1MZD A; 3EA7 A; 3UPE A; 1BCU H; 1GI5 A; 2XW9 A; 1RTK A; 5L2Z H; 1YF4 A; 1YC0 A; 3QZQ A; 4A6L A; 1BZX E; 2TPI Z; 3M36 A; 1KYN A; 1EX3 A; 5FXL A; 4B76 A; 4DT4 A; 2P93 A; 1FY3 A; 5FHT A; 2W3K A; 1C5O H; 1EJN A; 3SOR A; 7KME H; 1ZR0 A; 3IG6 B; 1TLD A; 4YLU A; 2DE9 A; 1WTH D; 2XNI A; 3UB0 A; 1AVG H; 4IGD A; 2ANY A; 5C94 A; 1GBE A; 1C2D A; 3E1X B; 4F55 A; 2V6N A; 1ZLR A; 2I6S A; 1TNJ A; 1P02 A; 1O3G A; 1DXW A; 2BVS H; 1GMH F; 5DPA A; 2O8W A; 3LC5 A; 4A92 A; 4NA8 A; 1WTG H; 3SHC H; 1O2Z A; 2OD3 B; 2R3U A; 3ZZ3 A; 4CBO A; 2ZTZ A; 3DD2 H; 1GBH A; 4A1T A; 4XE4 A; 1SKY E; 4B73 A; 3D62 A; 3SJO A; 1YY3 A; 4RT1 A; 3LT3 A; 2ZDM A; 2GZ7 A; 3LGT A; 1TQ0 B; 1ZRK A; 3PTN A; 1TPS A; 3KHV A; 1DIC A; 1QHR B; 1XXF A; 3E0N B; 1V2M T; 2WPM S; 4Q7Z A; 1L1N A; 2J97 A; 2JKH A; 1TMT H; 1V2S T; 4MPV A; 3SV7 A; 1SC8 U; 1C1P A; 2FI5 E; 3EYD A; 3UIR A; 4FUC A; 1O2Q A; 1ORF A; 3AAU A; 1GBI A; 1GBT A; 1HAV A; 2L6O A; 3F2F A; 2R2W U; 5L2Y H; 1HXE H; 1RGQ A; 1D4P B; 2VB0 A; 4Y7B A; 1RIW B; 3CS0 A; 3PO1 B; 4AC9 A; 1GMD G; 5FBI A; 4Q63 A; 3UAI C; 1C1O A; 1C2F A; 2ZNK H; 1AQ7 A; 1K22 H; 3BTF E; 3U8O H; 2AMD A; 2W6I D; 1Y5B T; 2V0B A; 1MMJ N; 1AFE H; 1L4Z A; 1P3E A; 1NFX A; 1TE0 A; 3TH3 H; 1LHF H; 1IQF A; 4UFD H; 3GCT F; 4KTU A; 1QQU A; 5C5O A; 1ELD E; 1JIM A; 2FM2 A; 4ZAE A; 1TRY A; 1EQ9 A; 4FUH A; 3LJJ A; 1QB6 A; 2GT7 A; 2WYJ A; 3M37 A; 3AW0 A; 2P16 A; 4GHQ A; 3SU5 A; 3VB6 A; 5L6N H; 2GMT C; 1CGI E; 1LTO A; 1AVX A; 4MDS A; 3BTK E; 2B5T B; 3TIT A; 1O3J A; 3A7Z A; 4OS6 A; 1C2K A; 4Q7Y A; 6LPR A; 1KXE A; 3PYH A; 3MO3 A; 2QXG A; 1IQM A; 1FLE E; 2BD3 A; 4GAW A; 1LCY A; 2FPZ A; 3RXD A; 4JZE H; 2AGI X; 5EQS A; 1GVL A; 5CDF E; 2FOC A; 1C2J A; 3OTJ E; 4XBD A; 2AER H; 2VWM A; 2GV6 A; 1IQL A; 1OHH D; 1ABJ H; 1JRS A; 3MH5 A; 4NFE A; 1FDP A; 1GJ4 H; 3A81 A; 1QL7 A; 2KZ4 A; 3DT0 H; 3UOP A; 3RXE A; 4OS5 A; 8GCH G; 1HAX B; 1TNL A; 3RMM H; 4OS1 A; 3SOS A; 3QGN B; 4FUI A; 2CJI A; 3O8R A; 3PB1 E; 1XM1 A; 1GI0 A; 1Z1I A; 2BLQ A; 3DA9 B; 5T6D A; 3VB5 A; 8KME 2; 2SGE E; 2TIO A; 1BA8 B; 3S7H B; 4BXS A; 1TRM A; 4X0W U; 1DWD H; 1W0K D; 2J38 A; 2F9O A; 3W1E A; 5A09 A; 2ZU1 A; 1YPG H; 2FOH A; 5HGG A; 2LPR A; 1ZSJ A; 1ZHM A; 3PM3 A; 2EI8 A; 3FP8 E; 3SV8 A; 4NSY A; 3RXH A; 1RD3 B; 2RG3 A; 1DLK B; 3MQK C; 3C27 B; 4CH8 B; 3L33 A; 2C8X B; 4RI0 A; 3NUM A; 1O3C A; 1AHT H; 3A83 A; 1EPT C; 3LU9 B; 5SGA E; 1PQ5 A; 1NFU A; 2KCP A; 2ZQ1 A; 1VCP A; 3SV2 H; 2ZFR H; 5CHA C; 1TAB E; 2PW8 H; 1BBR E; 2XCF A; 1T8M A; 1FV9 A; 4Y10 E; 1V2N T; 2IN2 A; 1S6F A; 2A45 B; 5JDU B; 1LHG H; 1MH0 A; 5FPY A; 2IOT A; 1O31 A; 2BQW B; 1T32 A; 1BJU A; 1SHH B; 3SJK A; 1MU6 B; 3ZVD A; 1BRC E; 1QUR H; 1H8E D; 2SGF E; 5C2Z A; 1XVO A; 3NXP A; 4MPU A; 4ZHA A; 1ETR H; 1QZ8 A; 1GHV H; 3K9X B; 4YTA A; 4LZ4 B; 3EST A; 4H42 U; 1NTP A; 3ZV9 A; 3FFG A; 3QN7 A; 2GMT B; 1ZTJ A; 3KCG H; 4AFU A; 2ZDK A; 3OY6 U; 3U28 C; 3MHW U; 1CGH A; 2O8U A; 2XRC A; 4XFQ A; 1UK3 A; 1KY9 A; 1WQV H; 2G51 A; 1GBA A; 1HAY B; 1HAP H; 2UWP A; 1ZOM A; 2ZCL P; 1BTY A; 2C90 B; 1C1N A; 1E1R D; 1GL0 E; 1SOZ A; 9EST A; 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