The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
105
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structure length |
105
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Chain Sequence |
GALPNFIPGLGTLYVDPSTLPEGPFLAYDRAGNLVKVVFMVPLKKLNESHKYVDIGTKTLRALGITRIDHVNMIPSGPHPGVSEPHYHIELVLVSVDQERKVLEG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of hypothetical protein TTHB210, controlled by the [sigma]E/anti-[sigma]E regulatory system in Thermus thermophilus HB8, reveals a novel homodecamer
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical Protein TTHB210
|
| molecule tags |
Unknown function
|
| source organism |
Thermus thermophilus
|
| total genus |
21
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| structure length |
105
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| sequence length |
105
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H, I, J
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VG8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1S6F A; 2BVX H; 4BXS A; 3HGN A; 1TE0 A; 5FX5 A; 1H8E D; 5K0H A; 4AG1 A; 2ZFS A; 3PV2 A; 4B74 A; 1W0J D; 4UFG H; 1NBM E; 4MQA A; 5EQR A; 1LHE H; 4BTI B; 1QNJ A; 3SU2 A; 1INC A; 2Y6T A; 4MNV A; 2O8M A; 2ZTX A; 2FXR A; 3RLY H; 2CF9 H; 1LQE A; 3G01 A; 1A5H A; 2GP9 B; 1YWU A; 1DUE A; 2VIQ A; 1TGT A; 1GBE A; 2QC2 A; 4ZKS U; 3V12 A; 1E37 B; 3LGT A; 1FIZ A; 3DFJ A; 3A7W A; 3SNE A; 1BHX B; 2GV6 A; 1T7C A; 1O2J A; 4Y0Z E; 5EGM A; 4CHA C; 5DP8 A; 2QF5 A; 3H5C B; 2XND D; 5I46 H; 5DSF A; 2VGC B; 4JZF H; 4FUB A; 1P03 A; 5FBE A; 4FET A; 2XBY A; 4ASH A; 1ZGV A; 3QGN B; 4DIH H; 1FUJ A; 1O3A A; 1GJC B; 1MAX A; 3BTE E; 5FX6 A; 1KTT B; 4MDS A; 3N7E A; 2OBQ A; 2A4R A; 2HVX A; 1QBO A; 1GI5 A; 3A7V A; 1P3E A; 1W11 U; 4IW4 E; 4Q2K A; 3RM0 H; 3SNB A; 3RC4 A; 4RN6 A; 3SU6 A; 2J95 A; 1TAB E; 8GCH F; 4RI0 A; 1KXC A; 2R2M B; 3MTY A; 5TCA A; 4BAK B; 4M7G A; 1O3N A; 1PPB H; 4X2V A; 3SJ9 A; 1O32 A; 3LH1 A; 3SV6 A; 1C4U 2; 2ZPR A; 5F8X A; 1NRN H; 6GCH F; 4ZHA A; 3GCO A; 2K8I A; 4Y0Y E; 4GHQ A; 1GMD G; 1NS3 A; 1SPJ A; 5FL7 D; 1ABI H; 2J94 A; 3MU0 A; 4HFP B; 1UTL M; 1T8N A; 3PTN A; 2VID A; 2FOG A; 5JBB S; 3DD2 H; 4NZL A; 1SQT A; 1C5O H; 3NRL A; 2PR3 A; 8LPR A; 1UVS H; 3ZYD A; 3DA9 B; 3VGC C; 1ELE E; 3AK5 A; 3A7Z A; 4YO9 A; 1CHG A; 4CRE A; 4WH6 A; 2FX4 A; 1YPM H; 1KXA A; 2RA0 A; 2CN0 H; 4CRG A; 4UFF H; 4ZKN U; 1T8L A; 1WBG B; 1OWI A; 4K1T A; 2A2X H; 2PP6 A; 2W26 A; 3I77 A; 1G32 B; 1HYL A; 2ZGB H; 3OE7 D; 3ENS B; 1MCV A; 1CA8 B; 3B8J A; 4YOJ A; 4AGK A; 1WOF A; 3BG4 C; 2ZFR H; 3ZYE A; 3TNS A; 2VIW A; 1TPS A; 5EJZ A; 3ITI A; 1C5W B; 1TX6 A; 2BDI A; 3ZZ7 A; 2J4I A; 1SB1 H; 3M61 U; 4GUX A; 9EST A; 3S7H B; 3TPI Z; 2ZIQ H; 4WMD A; 4U30 A; 2NWN A; 1E0F D; 1S0Q A; 1OYT H; 5C5O A; 4TPY A; 4I31 A; 1A46 H; 5HXF A; 3MU4 A; 4D9Q A; 2XW9 A; 1GCT B; 2AH4 X; 3UNR A; 3BF6 H; 5EG4 A; 3PTB A; 3VB4 A; 1BTH H; 3EDX B; 3ZZ6 A; 4XFQ A; 4LZ4 B; 3A88 A; 1GBT A; 4RKJ B; 1Y3W A; 5EPN A; 1AFQ B; 3MH7 A; 1Y5U T; 4OS5 A; 7LPR A; 5FPT A; 1NN6 A; 1YPE H; 1ZGI A; 3SHA H; 2BZA A; 3GY5 A; 3P92 A; 1NFX A; 1UK3 A; 4MNX A; 1Z1I A; 2HLD D; 1H8H D; 1WCZ A; 3RMM H; 3BIU H; 3P6Z B; 1TIO A; 2VH6 A; 5KED A; 3U1I B; 3A8D A; 1UTO A; 1TBR H; 2K1Q A; 2JH6 D; 1K1J A; 2GD4 B; 2PGQ B; 3TJO A; 3SU1 A; 4YOI A; 1FN8 A; 2GT7 A; 1A4W H; 2Y5F A; 1S5S A; 2YNB A; 1ID5 H; 1OWK A; 1LVM A; 3Q77 A; 3SN8 A; 3STI A; 3PMB B; 2EQN A; 2A32 A; 3KQB A; 2BDA A; 1QBV H; 3OTJ E; 4Y6D A; 2HWL B; 1QFK H; 1O0D H; 1LQD B; 1T8M A; 1V2P T; 1GHA F; 4JYU H; 2WPH S; 3EAJ A; 1SC8 U; 3M3S A; 2AMD A; 1W2K H; 1AKS B; 2VWL A; 3BTM E; 4NIX A; 1UTJ A; 2ANY A; 4IMQ A; 4GCH F; 1ELT A; 1VCQ A; 3B23 B; 5DP3 A; 3SO3 A; 3K65 B; 4LK4 A; 2VWN A; 1ETR H; 4DCD A; 3NZI A; 3H7O A; 2SGE E; 4XDE A; 1BBR E; 1FDP A; 2ZFQ H; 3TJU A; 1MU6 B; 1OYQ A; 1V2T T; 2HNT C; 1BBR H; 1KXF A; 4XRN A; 2ANW A; 1EKB B; 3E1X B; 1AGJ A; 1TYN A; 3CEN A; 4IBL H; 2IPH A; 1NC6 A; 1DWD H; 1Z6J H; 5A2M H; 1AHT H; 1HJA B; 5C3N A; 1B0E A; 2ILN A; 1P2O A; 3MU1 A; 3HPT B; 1HAO H; 1RIW C; 2J98 B; 2AS9 A; 1EZQ A; 2L6O A; 1YGC H; 4IC6 A; 3UIR A; 4FUH A; 1GBK A; 1GJ5 H; 3SZE A; 1QB1 A; 4X2Y A; 1ZHR A; 2C8Z B; 3TGK E; 1G9I E; 1O5D H; 2G00 A; 2GV7 A; 1K1N A; 2XNI A; 1C1Q A; 5JBT A; 1KLI H; 4ZUH A; 5C0T A; 4UDW H; 2FYQ A; 1O3J A; 3P70 B; 3OAA D; 1GBL A; 3FP6 E; 1C2M A; 1XUH A; 4GSO A; 4MG3 A; 5E0H A; 3GY4 A; 1T4V H; 2BLV A; 2FOA A; 1CVW H; 1EX3 A; 3V13 A; 2BD5 A; 1SGC A; 3DHK H; 2HPQ H; 1NBM D; 3DSO A; 1DFP A; 1GVL A; 2YMS B; 1BMM H; 1BDA A; 3NKK A; 3BTK E; 1E79 D; 1O3B A; 2WUC A; 1DSU A; 2P59 A; 3ZZ9 A; 2KFW A; 1SGR E; 3URD A; 1BIO A; 1W0K D; 4YLQ H; 5GDS H; 3F0P A; 3LPR A; 2ZDL A; 2QXG A; 2SGA A; 1MH0 A; 4H6S B; 5EJL A; 2DE9 A; 5EU8 A; 1SFI A; 3GY8 A; 4FUC A; 4X6M A; 1TON A; 2Y7Z A; 7GCH F; 2Y7X A; 1V2N T; 3KID U; 1BB0 B; 2PKS B; 4O3T A; 1RTF B; 1H9I E; 4NA7 A; 4NSV A; 2GCH G; 3UFA A; 1V2L T; 2P16 A; 2DUC A; 3SYJ A; 4LZ1 H; 2PTC E; 1J8A A; 4ZXY H; 1XUG A; 1SQA A; 2W3K A; 1OXG A; 2RA3 A; 2FIR H; 1RS0 A; 1FIW A; 1O5B B; 2KCO A; 2ZDK A; 1ZMN A; 3F9F A; 3F68 H; 3Q3K A; 2BD4 A; 3F9E A; 1FPC H; 2STB E; 2RDE A; 1FI8 A; 4R8T B; 1T8O A; 1JBU H; 2Z3C A; 2C8W B; 4NWK A; 1UVT H; 3MFJ A; 1YCP K; 3A85 A; 1GHX H; 3ZVE A; 2PW8 H; 1UTM A; 3P17 H; 1KSN A; 1VIT F; 1NES E; 5JPM H; 1CGH A; 1HJ8 A; 1ZPB A; 3VXE H; 1AMH A; 2Z9I A; 4TY7 A; 1GJB B; 2XC5 A; 1CHO F; 2J9N A; 4KTC A; 4DVA U; 2GJG A; 3KQC A; 3QDZ B; 3D65 E; 2Y5H A; 2BDB A; 2SGF E; 1OWH A; 1C1P A; 1C2L A; 4HGC A; 1BTY A; 2W3I A; 3LON A; 2VGC C; 5FCR A; 2CF8 H; 1NRO H; 1EQ9 A; 3FO8 D; 5T6D A; 3A84 A; 3RC6 A; 3GCH B; 1QB9 A; 2FOF A; 2UWO A; 2I6Q A; 1TNK A; 1MUE B; 6EST A; 1L0Z A; 3GY3 A; 1CGI E; 1A61 H; 1V2R T; 3IIT A; 4DY7 B; 2Q6D A; 4DT7 B; 1MTU A; 1O5G H; 1SG8 B; 3RDZ A; 1ARC A; 2XWA A; 4BTT B; 4WY3 A; 1GI4 A; 4IN1 A; 3LU9 B; 2PWX A; 1K2I 1; 5EW1 H; 3ZZB A; 5GCH F; 1NZQ H; 2JET C; 2H1U A; 1AZ8 A; 2SNW A; 1TRY A; 3RLW H; 3W94 A; 1C5L H; 2R3U A; 3U98 H; 1AY6 H; 4AB9 A; 2V0B A; 3TK9 A; 4ABJ A; 2NU0 E; 2BX3 A; 1UVO A; 2XBW A; 3BTW E; 3UY9 A; 1YY3 A; 1DT2 A; 3F1S B; 3K2U A; 1GHY H; 1XUJ A; 5EPY A; 3W95 A; 3SJK A; 1EOL A; 3GDS A; 4MPW A; 5DGJ A; 1DWB H; 2BXT H; 1EP5 A; 1DLE A; 1C2I A; 1O3F A; 1YPL H; 1J16 A; 2QIQ A; 2Y5G A; 3OYP A; 3RM2 H; 2ANM H; 1GVZ A; 1M9U A; 4AOQ A; 1SGN E; 1QJ1 B; 3U9A H; 1KXE A; 3BEF B; 5EXN A; 1XX9 A; 1UMA H; 1C5Y B; 1QL7 A; 3URE A; 4YXW D; 1FAK H; 4YOG A; 3LGV A; 3AAU A; 2ZCL P; 1ZOM A; 3UNS A; 4SGA E; 3A82 A; 3MNX A; 2XC4 A; 2F9V A; 1DWE H; 2BVR H; 2G5V A; 1TMU H; 1PPC E; 2ZTY A; 1NRQ H; 3RXQ A; 3QZQ A; 4YES B; 3RXO A; 2VWM A; 1AKS A; 1XM1 A; 3OX7 U; 4K1E A; 2BDH A; 1FMG A; 1K1P A; 5J4Q A; 2QCY A; 3KQD A; 1BRU P; 2G8T A; 1BTZ A; 1L4D A; 1XVO A; 3SUF A; 1HXE H; 1JMO H; 3FAO A; 3RXA A; 1P2M A; 5FPS A; 1L1N A; 2A0Q B; 2RCE A; 1C2K A; 3D49 H; 1V2U T; 3D62 A; 1Q2W A; 2FX6 A; 1W13 U; 2FWW A; 5C1U A; 2GZ9 A; 2XOK D; 3LJO A; 5F53 A; 3FKS D; 1GBH A; 2C3S A; 2VB0 A; 2WZQ A; 4XE4 A; 1AFQ C; 1ESB A; 1F2S E; 1MQ6 A; 1QRZ A; 5EXM A; 2BD2 A; 2J34 A; 5B6L A; 1BA8 B; 3QX5 H; 4P02 A; 1EJM A; 3WWB A; 2C90 B; 3U8O H; 1PQ5 A; 3KHV A; 5FHT A; 1LKA A; 4AZ2 B; 2FES H; 3ZV8 A; 2BY8 X; 4UFE H; 2Z3E A; 1K9O E; 1NY2 2; 1EOJ A; 1E36 B; 1GI7 B; 1D3T B; 2ZEB A; 1ANE A; 3WY8 A; 2FLR H; 1W3C A; 2XYA A; 2NU4 E; 1XKA C; 5CMX H; 4NIV A; 1TAW A; 4IC5 A; 2GZ7 A; 1KTS B; 2VJ1 A; 3DUX H; 4FU7 A; 1TAL A; 1LO6 A; 2AYW A; 8KME 2; 2ODY B; 2P94 A; 1ZPC A; 1GMC G; 4U01 A; 3ZZA A; 2D2D A; 1LCY A; 3L6P A; 1Q31 A; 2EST E; 1WU1 A; 4ISI H; 1BTX A; 5A09 A; 1BTW A; 1HIA A; 3Q00 A; 5IDK A; 2KAI B; 1ZPZ A; 2VU8 E; 4GHT A; 1O3I A; 1ORF A; 1O5F H; 3M5O A; 3SGB E; 2WPI S; 4DGJ A; 1RD3 B; 2BDC A; 1P57 B; 3DSG A; 1NRR H; 4DJZ B; 4I7Y H; 1PPF E; 4TT3 D; 6CHA B; 1BRA A; 3EQ0 H; 2OUA A; 3A80 A; 1HJA C; 1N8O B; 1ABJ H; 1GI8 B; 2AMP A; 1HUT H; 1LHF H; 3MHW U; 4B1T A; 1HDT H; 2PTN A; 4WVP E; 4X1N U; 2ZC9 H; 4MLF B; 2J5U A; 1DY8 A; 1MQ5 A; 2HRV A; 3M5L A; 3VB5 A; 2BOK A; 1ZLR A; 1ARB A; 4WME A; 1UK4 A; 3RXC A; 3LT3 A; 4AB8 A; 2ZKS A; 2JJ1 D; 1NO9 H; 3RMO H; 1YBW A; 4UD9 H; 3WWF A; 1PYT D; 4PRO A; 1C1M A; 1C5T A; 3MYW A; 3U28 C; 2PKA A; 2FO9 A; 3UWJ H; 4FVD A; 1GG6 B; 5E8E H; 4ZHM U; 3L3T A; 4TY6 A; 1C2E A; 4Z0K A; 4BAO B; 1HV7 A; 1RTK A; 3UOP A; 1MBQ A; 2BD9 A; 2YMS C; 4RKO B; 1IQM A; 1IAU A; 1WQV H; 3TH4 H; 1QB6 A; 3E6P H; 2AGI X; 1ZYO A; 1GDN A; 2VIN A; 1EPT B; 3ZIA D; 3A89 A; 1V2O T; 1O37 A; 1FX0 B; 3OU0 A; 4FUF A; 3LC5 A; 3PV4 A; 3A87 A; 1YPJ H; 3ZVA A; 3E0P B; 4O3U A; 1PPE E; 3OTP A; 3FN8 A; 5EQQ A; 1SGE E; 1O3D A; 4K2Y A; 1SL3 A; 3AW1 A; 1V2V T; 1WV7 H; 4F48 B; 1ELG A; 1ETS H; 1P3C A; 2W7S A; 4D9R A; 2PKS C; 1O3K A; 2BZ6 H; 1OOK B; 4F49 A; 1D6W A; 1A0J A; 2HNT F; 4NA9 H; 3U8R H; 1P9S A; 2SNV A; 1SQR A; 4NSY A; 4F55 A; 1O2H A; 1FY4 A; 1ZJD A; 3AAV A; 1K1I A; 3VG8 A; 4RT1 A; 5AFY H; 1THP B; 4ZXX H; 3SQE E; 2V3O H; 1PQA A; 1C5U A; 3SGQ E; 1G2M A; 3GY7 A; 1WXR A; 1S81 A; 1LMW B; 2JET B; 3MH6 A; 4BXW A; 1BUI A; 1SKY E; 3LKW A; 4KTS A; 4X8T H; 5FBI A; 3SI3 H; 3NXP A; 3RXP A; 1VIT H; 2ZCK P; 3SU4 A; 2LPR A; 1ZR0 A; 2ZTZ A; 1YPH E; 1NU9 A; 4UFD H; 3EGK H; 3ZZC A; 1EZS C; 4OS7 A; 1BJV A; 4TYD A; 3NUM A; 4A5T S; 3SOR A; 2WIN I; 1O2R A; 1PQ8 A; 2A5I A; 2BY9 X; 1QL9 A; 1PPH E; 3PRO A; 1QQU A; 1V2J T; 2QF0 A; 4X8S H; 1E38 B; 1L4Z A; 4A6L A; 1FXY A; 4XBC A; 1BMN H; 3FZZ A; 3BTQ E; 3GDU A; 2HOB A; 2TGD A; 1G3D A; 2GZ8 A; 2OP9 A; 1DIT H; 4K1S A; 5EOK A; 1O2Y A; 3VB7 A; 1GMH F; 2B0F A; 2F91 A; 1TRN A; 4BAN B; 1TOM H; 4CRF A; 1O3P B; 1GHB F; 1IQK A; 2HPP H; 3F2G A; 1A1R A; 2XWB I; 3O8B A; 3RML H; 4X6P A; 1UHB B; 3GCH C; 1Y3V A; 1Z8I B; 1ELB A; 2QF4 A; 8GCH G; 3KN2 A; 2Z9J A; 4CRD A; 1AVG H; 3KQE A; 4KP0 A; 5L2Z H; 5DP9 A; 1GPZ A; 4K8Y A; 4NWL A; 3RXE A; 6GCH G; 1SQO A; 2FS9 A; 1O2S A; 4CR5 A; 1BJU A; 4A1V A; 5AF9 H; 3T2N A; 2P93 A; 2XBX A; 4XBB A; 1HAV A; 2FOD A; 2TBS A; 1C1S A; 3EA9 A; 4D7F A; 3VPK A; 1NTP A; 2Y80 A; 3SUD A; 2ZF0 H; 3NK8 A; 2Q6G A; 1DOJ A; 2QA9 E; 4FU9 A; 1J17 T; 4FOU C; 2O9Q A; 1O3C A; 3LGI A; 5T6F A; 3K6Z A; 1UCY K; 2ZI2 H; 3RXU A; 3RUO A; 1C5S A; 5F8T A; 3ZZD A; 1D3Q B; 4JZD H; 1WSS H; 1J9C H; 1C2D A; 2RFK C; 2XTT B; 3AVZ A; 1ELC A; 2ZDN A; 1AUJ A; 3DT0 H; 5AHG H; 1TPO A; 1A5I A; 1KXD A; 1GL1 A; 3V3M A; 1CO7 E; 3FP8 E; 1O3E A; 2V3H H; 4FUI A; 5IK2 D; 3K6Y A; 2UWL A; 4BTU B; 8EST E; 1BRC E; 4AFQ A; 1WUN H; 3EA8 A; 3U1J B; 1Q3X A; 3PLK A; 2QE7 D; 2WPM S; 4Y71 A; 1BHX F; 2FOM B; 4A1T A; 2P95 A; 3M5M A; 2FI5 E; 2FOH A; 3SI4 H; 1J14 A; 1C5P A; 2RG3 A; 5IYT A; 2G55 A; 3UUZ A; 3BSQ A; 1YCP H; 2C4F H; 3F9H A; 2BLQ A; 1IQN A; 1MKW K; 3TK5 A; 1AWF H; 1GCD A; 1NFU A; 3ZZ4 A; 1K28 D; 1TBQ H; 2V7Q D; 4KEL A; 3SV8 A; 1GHZ A; 2ALP A; 2VIV A; 1DVA H; 1T32 A; 1C1U H; 3F3B A; 1OP0 A; 4H4F A; 2KZ4 A; 2PSX A; 1FQ3 A; 4IMZ A; 2O8U A; 3EE7 A; 2QAA A; 5L30 H; 2Z6B D; 2JJ2 D; 3HKJ B; 2ZG0 H; 1IHS H; 3PMA B; 2H5C A; 3PB1 E; 1GBB A; 2NU1 E; 3BTF E; 1TNL A; 2O8W A; 1Z71 A; 2VVC A; 5TJX A; 2JIZ D; 2BQ7 B; 4ACA A; 3T25 A; 3URC A; 1ZSJ A; 3RU4 E; 4IGD A; 4K69 A; 1HBT H; 2W5E A; 5BPE A; 2GDD A; 2G4U A; 3KEE A; 1G36 A; 4Z1M D; 4BAM B; 4TSF D; 3LGY A; 3KF2 A; 1WYK A; 5A0C A; 1GHA G; 5G4B A; 2J2U A; 1VCW A; 3GYL B; 2BOH B; 1O2I A; 1TLD A; 1PFX C; 1EZU C; 4JYT A; 1EXF A; 5LPF A; 3P95 A; 4GCH G; 1BTP A; 2BYA X; 3S9A A; 2VBC A; 5DKM A; 3TIT A; 5EJ1 A; 1AU8 A; 1EAT A; 2F9N A; 4J1Y A; 3N99 A; 1HAX B; 4Y8Z A; 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