3VOVA

Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
MKVVGLDLGGTKIAAGVFDGKRLLSKVVVPTPKEGGERVAEALAEAAERAEREAGVRGEAIGLGTPGPLDFRRGVIRNIPGVQDFPIRRILEEATGRPVFLENDANAAALAEHHLGAAQGEESSLYLTVSTGIGGGVVLGGRVLRGERGQGGELGHLTLLPGGPACGCGLEGCLEALAAGRALERDATYAFQRPVDTRELFRLFQAGDPKAERLVLQAARYVGIGLASLVKAFDPGVVVLGGGVALNAPEGYWEALLEAYRRYLQGWEAPPLRRARLGAEAGLLGAALTAYLEVKDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title Characterization and crystal structure of the thermophilic ROK hexokinase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
molecule tags Transferase
total genus 95
structure length 297
sequence length 300
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vovA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vovA02
2Q31A 1LCUA 2P9KB 3U9ZA 5AQYA 4CBXA 2V52B 3O4WA 4DB3A 3CJ1A 3QMLA 1BU6O 3IDHA 3M3ZA 1QQNA 1HPMA 2GTDA 3A5MC 1GLLO 1KAXA 3WEEB 5AQVA 3S41A 4IJNA 5BRFA 3H3NO 4RTFD 1MDUB 3CI5A 4FO0A 1ZC6A 5AQQA 3FR0A 2E2NA 3IUCA 2E2QA 4FWPA 3ZETB 1WOQA 3KVGA 1OKJA 5LY3A 4O5FA 4BR4A 4L3QA 3VEWA 2P9SB 3A5OC 4FWLA 2QWPA 2Q1NA 4PKHA 4XEIA 4BRKA 3B8AX 3H45C 3VEZA 1NMDA 4CD3A 3VEYA 3CJCA 3DAWA 4DHYA 4E1JA 5I9EB 3DXKB 2PAVA 4PKIA 1C0FA 5EY4A 2QM1A 4H0PA 5AQNA 3LDNA 4BG8A 3L0QA 1YAGA 1WUAA 1ZXOA 2GWKA 4BQZA 3M1FA 4PL7A 1ATNA 1GLDG 1IJJA 1T6DA 2CGJA 3VPZA 3GBTA 4MO5A 5EVZA 1X3NA 4BC4A 2P9IA 3MK6A 3FE1A 5AQZA 3QDKA 1TUYA 2GEMA 4C23A 3ATUA 1T44A 1ATSA 4CZHA 3VENA 3CJAA 3C7NA 5EXWA 4AM6A 1U2VB 4XH5A 4FPAA 5AR0A 1TYQB 4WQ5C 2ASOA 3LDOA 3HTVA 3FZFA 1BWFO 3VGKA 1MWKA 3RSEB 4EHUA 4HTLA 4JD2A 3HM8A 4GY2B 1S3XA 1HKBA 1NGDA 3LDPA 4BC3A 1NGGA 1NBWA 1QHAA 2QW9A 3CJ9A 4LC9B 4EFHA 3VEOA 5EOYA 2P9KA 4B1XB 4WQ4C 3EL2A 4FWKA 2A42A 3CHWA 3VEVA 4ISGA 3SK3A 5AQSA 5BRHA 1T6CA 4BG9A 2HOEA 4FL9A 3WEEA 4K41A 4M7YA 3VF6A 3FZMA 5F0XA 4PKGA 1Y64A 3ZETA 4H0VB 1YVNA 5AQXA 2Q97A 4CJ7A 4FWMA 5BN9A 3O5BA 5KQ8A 1Z05A 1BA1A 2P9SA 4MLEA 1GLBG 3FGUA 3QICA 1P8ZA 4CBUA 3VGLA 1KXPA 1RDWX 3H3OB 3WT0A 2IVOA 5AQKA 3D2FB 3DXKA 5F1XA 5BREA 4B9QA 2FLOA 4FWRA 2AP1A 2QWLA 4FOIA 2CH5A 2D0PA 2FSKA 2E88A 3R8EA 3A8YA 2ASPA 2BTFA 3HBTA 3CJBA 5AZJB 4I6MB 2YI1A 3KZBA 5F2RA 1EQYA 2GWJA 3VERA 4CZIA 4CZEA 5KPTA 2KHOA 5AQIA 5KQDA 3TPQA 2ZGYA 2P9PB 3ZX2A 3L4IA 4M7XA 4BR7A 4BQLA 2ZF5O 4A2BA 1Z6RA 4M63C 5BR9A 1XQSC 3AAQA 2E1YA 5BPNA 4BC2A 2FF3B 2UYTA 2VYPA 4GNIA 1U2VA 3MDQA 3VF4A 3D2EB 4JN4A 1TYQA 4H0XB 4H03B 3ZX3A 4BGAA 2ZGZA 2YJFA 3VEXA 2F9WA 5KPRA 1CZAN 4DQ8A 3FLCO 2QWQA 3MMVA 3RSEA 4BROA 4BRHA 3MN5A 4CZMA 3BEXA 2HMPA 3EKUA 3GOIA 4IO8A 4QS7A 4BR2A 3QFUA 1TUUA 5EX5A 3HSCA 2Q0RA 3SJHA 5AFUH 3EO3A 3GE1A 1YUWA 1BO5O 4BRNA 1NGEA 1V4TA 3ZEUB 2P9NB 3SLCA 4NB4A 1K8KB 4ISEA 4H5TA 4FWOA 5KPZA 4IXCA 4AM7A 4FSVA 4BVOA 3OHRA 4XH4A 3LL3A 3CETA 3GL1A 4BRFA 1NWKA 2V7YA 3TU5A 2BUPA 4H0TB 3GDQA 5FPMA 4B1WB 3MCPA 4CZGA 2P9UB 2QWOA 3ENHA 3WXLA 1NM1A 3FFKB 5LJWA 5E26A 4BRDA 4EHTA 4CZFA 1KAYA 4J8FA 3KHYA 2CGKA 4BR0A 3EKSA 2V51B 3GG4A 3WXIA 4CZLA 5AZIB 3EN9A 3FZHA 3D2FA 3AY9A 3H6EA 4JHDB 4YDUC 5CE3A 2QWMA 1MWMA 2ZWHA 2E2PA 3CIPA 4BRLA 3DXMB 4BGBA 2HF3A 2NZTA 5AQJA 4QS8A 4F9OA 1DEJA 2NRHA 4BRGA 1HUXA 4DCHA 5AZJA 4I6MA 3O6WA 4CZKA 5FPDA 1GLAG 2A3ZA 1YXQA 3WQTA 1NGCA 1SAZA 3WUHA 5JMVA 2P9PA 1BOTO 4K43A 1BG3A 1C0GA 4B1ZA 5E84A 5AQTA 5ADXH 1RFQA 3U8XA 2D4WA 3W3DA 2YJEA 3AARA 3CQYA 3F9MA 2FSJA 3D2EA 4FOEA 3O1BA 4FWNA 1NGFA 2YHYA 2VWBA 2A5XA 3I8BA 3BP8A 2GELA 3JS6A 1NGBA 3O08A 1R59O 1BA0A 2A6AA 4O8KA 5JLFA 2Q0UA 4H5WA 4K42A 4WYBA 2AA4A 4WQ5A 2QWRA 3MN6A 4HWIA 3C0BA 4H5RA 2WUSA 4BC5A 3R9PA 1KAZA 4CZJA 5AQFA 3R6MA 4BR5A 1JCEA 5AFUA 1XUPO 3ZX0A 2V7ZA 2ITMA 1QZ5A 3IFRA 4IWVA 1G99A 3JXUA 3ZEUA 2P9NA 2E1ZA 3ATVA 1K8KA 4MO4A 5B8HA 3MN7A 2E2OA 3UE5A 5BPMA 5TKYA 1Q18A 1QQOA 2GUPA 4BRQA 1GLFO 4CD1A 5AQHA 2IIRA 4PL8A 4WQ4A 3UKRB 2HF4A 3U4LA 3W0LA 4ISFA 2D1KA 3DJCA 4NO7A 1NGHA 1D4XA 1E4GT 5AQPA 3WXKA 2P9UA 3BF1A 1SQKA 2FXUA 3QBWA 3SMPA 3H1QA 4H0OA 1NLVA 3O8MA 3UKUB 5JICA 3BUZB 3VGMA 3A0IX 4IZ9A 5AZIA 1LOTB 3WXJA 3G25A 5ELZA 1GLEG 2I7PA 4B1UB 3BF3A 3QFPA 4JHDA 2PBDA 5AQMA 3LDLA 3SMSA 2I7NA 5AQOA 4BR9A 3ULEB 3DXMA 3WQUA 1X9JA 2P9LB 2ASMA 2YCHA 4A2AA 3FZKA 1NGJA 1NGAA 4H5NA 2QXLA 3HI0A 2FSNA 5BPLA 3H1VX 4B1VA 3P4IA 1E4FT 3I33A 3VF2A 1H1VA 2D0OA 3QBXA 1XC3A 4JNEA 5ADXA 1QQMA 1DKGD 2W40A 2FF6A 5AQLA 3U9DA 1QZ6A 5AQWA 2OANA 4EIAA 5LJVA 3O80A 2A40A 4EAHD 2IVNA 1U6ZA 3M6GA 2EWSA 1MA9B 2IVPA 4JAXA 2E20A 2J4RA 2DPNA 3A5LC 4Y0WA 5FPEA 1BDGA 1JCGA 3UB5A 1HLUA 1NGIA 2H3GX 2Q2RA 3H46O 4B1YB 3J8AA 1GLJO 1J6ZA 5AQGA 3MN9A 4IJAA 3DWLA 4RWTA 2W41A 4CI6A 1HJOA 3ID8A 4FWQA 2NLXA 1DGKN 1RGIA 5FPNA 2CH6A 3UKRA 4H5VA 3D7EO 3VETA 3L6QA 1SZ2A 4CBWA 1HKCA 3VESA 3IMXA 2F9TA 3CJ7A 4FPBA 2CGLA 4MLHA 3A5NC 4BRPA 2Q36A 4BRMA 2VCPA 1ESVA 2YHWA 3LDQA 3AAPA 4BRIA 4BREA 1S22A 3LM9A 3QB0A 4QS9A 4KBOA 2P9IB 3UKUA 5BN8A 1V4SA 4XH1A 1IG8A 4FWSA 5AQRA 4Z94A 4A61A 1JCFA 3C7NB 1BUPA 2YHXA 1ATRA 1HKGA 4BRCA 4RCHA 3ULEA 4H0YB 3FZLA 4BRAA 3O1WA 2P9LA 1HX1A 3EZWA 3CERA 4YDUA 3VOVA 5BRDA 5JLHA 4BVPA 2QWNA 1ZBSA 3CQXA 3ENOA 3LM2A 4JD2B 1GLCG 4K25A 1X3MA 2E8AA 4A62A 3HZ6A 5AQUA 2A41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K0SA 2P9KB 1BL3A 4I2QA 3QMLA 3CMEN 3IDHA 1Q86O 4M3TA 1HPMA 1GOCA 5BRFA 4RTFD 2O8BB 4M41A 4FO0A 3G6EN 2E2QA 3DLRA 1WOQA 5TKWA 1SKRA 1JLCA 1S9EA 4DQIA 2GX9A 5SZTA 3T69A 2P9SB 3A5OC 4M45A 4XEIA 3RTVA 4FLWA 3NVKA 4EZ6A 1JLEA 3AVGA 3CC4N 4LF7K 4CGGA 3I56N 1QTMA 3ZT2A 2UU9K 4E1JA 5I9EB 1WSJA 4E7HA 2PAVA 2OPRA 1C0TA 2QM1A 4H0PA 5C2DA 4F2SA 3LDNA 5KGXA 4F8RA 4BG8A 3OYEA 5DK5A 4KI4A 3PX4A 2ZJQL 4OLAA 3CM6A 4BQZA 5HRSA 1RDUA 1ATNA 5DM7L 1GLDG 1IJJA 2YV0X 3VPZA 4MO5A 1IKVA 1X3NA 3IS9A 2E6LA 2OZMA 3NF9A 3MK6A 4CJFA 3QDKA 3VTHA 1T44A 4CZHA 4FJXA 2XRIA 1EKEA 1LW2A 3KLGA 3S3MA 4AM6A 1U49A 2HSTA 2VG7A 3HL8A 1M1KO 2ASOA 4CGHA 3HTVA 5C42A 4B3MK 3H08A 2UUCK 1RT7A 4DTRA 2HHUA 4AHVA 3DM2A 1MWKA 3O4NA 4YNQA 4EHUA 1N6QA 3ID6A 4KHNA 4JD2A 3HM8A 1TKTA 4M3YA 4BDYA 1HYVA 1NGGA 1QHAA 3CJ9A 1YIJN 1WSGA 1GOAA 3C6TA 3IG1A 5KRSA 3OYBA 1J53A 4B1XB 1QSLA 3AVMA 4E7JA 3K58A 1ASUA 3SK3A 4E3SA 4F3OA 4DFMA 1VSMA 4BG9A 2OPPA 3WEEA 1BI4A 1FKOA 4KHWA 3OYNA 1UWBA 2I5JA 3PSFA 5M1QA 3DLHA 3L2UA 1Q81O 3J7AP 3TTDA 2UXCK 2HHVA 3TAQA 5KQ8A 2ZJPL 1Z05A 3HVTA 4FZYA 4O0JA 3ZSRA 4I7FA 2W6KA 4G1QA 3QICA 4PUOA 1P8ZA 1TKXA 3NMUA 3H3OB 4C1NK 4CJVA 4LD0A 4R5PA 1JJ2M 1SV5A 3MCAB 3I8DA 1YJ9N 3D2FB 3ZCMA 4FWRA 2AP1A 1NMNA 3NCIA 4OKKA 1O13A 1BHLA 4X64K 3A8YA 1FW6A 1WAJA 5MLCQ 5F2RA 4CJWA 3OYGA 1U48A 4K8ZA 2Y1JA 4CZEA 4IOXA 3TTCA 4YHHK 1SL0A 2ZGYA 4DR4K 4DR2K 2JWLA 4BE1A 4M7XA 2ZF5O 4A2BA 3WNGA 2PYLA 1XQSC 4FVUA 4JYAK 4CW7B 4BC2A 2FF3B 1VSFA 1S5JA 3MDQA 4M3RA 4BWMA 3B6PA 3CF5L 2BH1A 1NOZA 3D45A 5J1EA 1A5VA 1SL1A 3CMAN 3FLCO 2QWQA 3MMVA 4OO1J 1RDBA 4CZMA 3BEXA 3EKUA 4IO8A 1RBVA 4BE2A 1VQ5N 1WSEA 2YNGA 4FM1A 4QS7A 4BR2A 3SJHA 3OBWA 3L3UA 1T3VA 1FJGK 3V81A 4IFYA 1TGOA 3SLCA 1D8YA 1K8KB 1W97L 4RW7A 3AVFA 1WN7A 3DRPA 1K6YA 4NYNA 4B8AB 4BRFA 1NWKA 2V7YA 3NGIA 3OYIA 5FPMA 4B1WB 3MCPA 3WXLA 3O3GA 1E3MA 4CFAA 4CHYA 4EHTA 2HVHA 4CZFA 4A59A 4J8FA 2Z1HA 4YFUA 3TAFA 2LSNA 4CFCA 3CCMN 2V51B 4DTSA 1YJWN 3MX5A 4YOTA 3AY9A 2QWMA 1MWMA 1VK0A 5BR8K 4GKKK 3KJVA 4DU1A 1QVFM 1HMVA 3QEVA 3DXMB 3S9HA 1DEJA 4BRGA 2DY4A 3QEPA 3O6WA 4Z0UA 3WXMB 4FLZA 1GLAG 2A3ZA 4CEEA 3VQCA 3WQTA 1NGCA 1NG9A 1BOTO 3K2PA 1TV6A 4B1ZA 3NAEA 5AQTA 4X66K 3CQYA 2PY5A 1EP4A 4FWNA 1NGFA 2A5XA 3AA4A 5JVGL 4DV4K 3VTIA 2A6AA 4O8KA 2Q0UA 2NRZA 4WQ5A 3CG7A 3MN6A 5CR4A 4YOUA 4H5RA 4BC5A 3FFIA 4YY3K 1B92A 2HBJA 3V9ZA 3HPHA 5CYMA 5KTQA 2D0CA 1R0AA 4DR6K 3ZX0A 4Q0BA 3VQ5A 1HR0K 4IOAL 2QTDA 1BQNA 1RNHA 2OYQA 3ATVA 5B8HA 3MN7A 2E2OA 3RRGA 3DLBA 5TKYA 4CIEA 4KPYA 2GUPA 4BRQA 1GLFO 4CD1A 4WQ4A 3K9KA 2HF4A 3W0LA 4ISFA 4FLXA 1KTQA 3DJCA 3VQ9A 4O8UA 5T7BA 2HNYA 1VAZA 1HNXK 1VQ6N 2P9UA 3O9RA 4CK2A 1RDCA 2QKBA 3DRSA 2A1SA 1UAXA 4FJJA 4G9ZA 1N34K 3SMPA 4H0OA 2O8DA 1NLVA 3UKUB 4CE9A 4IZ9A 1LOTB 4K0KK 1C1AA 4DSEA 3RR7A 3LDLA 3SMSA 3SUOA 3NH1A 3WQUA 4NLCA 5M1FA 4FJGA 3QNOA 4B08A 4CESA 2O8CA 2ETJA 4F2RA 3K57A 2QXLA 4FW2A 3O9SA 4B1VA 3MXMA 1Q9YA 3CCSN 4OPJA 5ADXA 1NJWA 1QQMA 1N8RO 1DKGD 4KB1A 2KTQA 3BZKA 4Y1DA 2W40A 5DMRA 4BDZA 1QZ6A 3SQ1A 1XHXA 5JVHL 1VRUA 2OANA 4CERA 5LJVA 3J81O 3SQ4A 3BGRA 3ZLJA 2IVNA 2HVIA 4CECA 1ZYQA 3A5LC 4NXMK 1HLUA 2Q2RA 3PY8A 4PHTX 3H46O 2GBZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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