3VPQA

Crystal structure of bombyx mori sigma-class glutathione transferase in complex with glutathione
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
PNVKFYYFPVKALGESQRLLLAYGGQEFEDNRISSENWPEFKPKTPFGQMPVLEIDGKQYAQSTAICRYLGRKYGLAGANDEEAFEIDQNVEFLNDIRASAASVHYEKDEAVKAKKKAELEETKYPFFFEKLNEILTKNNGHIALGKLTWGDFVYAGMYDYLKAMLQKPDLEQKYPAFRKPIEAVLAIPKVKAYVDAAPRTEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a Bombyx mori sigma-class glutathione transferase exhibiting prostaglandin E synthase activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase sigma
molecule tags Transferase
source organism Bombyx mori
total genus 74
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2012-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3vpqA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3vpqA01
2JACA 2PN8A 2CT6A 4OFTA 2PWJA 5CAXA 4K7IA 3ERGA 1SKSB 3WGEA 1TRWA 3MWHA 1XIYA 3LGCA 3MNGA 3IK9A 4AJ8A 4NHWA 2FY6A 4YQVA 4HDEA 2JSYA 4RQRA 5IO0A 4ZBBA 1WOUA 4MP4A 2HZEA 5B8BA 5JCUA 3GRXA 2V6KA 3KCMA 2GZYA 5EL8A 3TRXA 1V98A 1XW9A 4GF0A 2GZZA 1W4VA 3WT2A 1F37A 4IP6A 4POKA 1VGLA 3IHQA 5G5EA 2YJHA 1JZOA 2MMAA 3APSA 7GSSA 4XTSA 2M72A 4HU9A 3ZL5A 1KNGA 4EF0A 3HVVA 3O76A 1X0RA 2BMXA 3UBLA 4FYCA 5HR3A 3EU4A 1Y25A 1XWAA 3NOFA 1K0CA 5IMDA 1JZWA 1PRXA 1M2AA 4E8EA 4KDYA 1FVJA 4AJ7A 3E3EA 1ML6A 4ZBAA 5KN0A 1G7EA 5G30A 4EO3A 1VF2A 4D73A 2IMEA 1XCCA 1FHEA 3RPNA 2HT9A 1EV9A 2ON5A 3KMOA 3IRAA 4MJBA 3QR6A 2R3XA 2N5BA 4KUNA 4BWQA 2H73A 4QQ7A 3GMFA 2H71A 1XBSA 2YANA 3Q74A 2ALBA 2WJUA 1URMA 3P7XA 4KCEA 2FCHA 2IWTA 4KE3A 5HR1A 1K0MA 22GSA 1TRVA 3L9VA 3ZIVA 2I1UA 4IHUA 4P3YB 4G2EA 1YEXA 3Q18A 4ISDA 3L78A 3FY7A 3ISOA 5DJLA 3LORA 3GFKA 4BPYA 4X43A 2JZRA 2X8HA 2D2ZA 5IMFA 4BL7B 2PUKC 1WWJA 4HS1A 2YNXA 3GH9A 5ECNB 1T4YA 4FIWA 2LRTA 4KX4A 4Q5RA 2LRCA 3EWLA 5GZZB 2UZ8A 1OC9B 3HJMA 4QL7A 4PX1A 2PMTA 1PL2A 3ME7A 5ECOB 1DE2A 4TXOB 4MJCA 2LQOA 1SJIA 3HA9A 1THXA 5ECSA 3M9JA 1HD2A 1G7OA 3CRUA 3KP9A 1MEKA 3KEBA 8GSSA 4LA1A 2MMNA 4MF6A 5DJMA 2DJKA 3KD0A 3IDVA 3N9JA 4TRXA 4PNFA 4EDZA 4DSSA 3FZ9A 5CO3A 2QC7A 3GH6A 4WKWA 3ZITA 3GHAA 4PNGA 1EWXA 2AV4A 2YWOA 1EZKA 1TK0B 1SD8A 3W6GA 4YAPA 5ABRA 1JHBA 1SYXA 5H5SA 2IMFA 5A4VA 5F06A 2A2RA 2K18A 4GTUA 2B7JA 4ZB6A 2NDOA 1IYHA 2HRFA 1MDIA 4KF9A 5FT3A 3UVHA 6GSYA 4F9ZA 5HFIA 4LMWA 1SKRB 2EC4A 2WDUA 1AUCA 3SBCA 3HDCA 1OYJA 3DD3A 3IC4A 3E9JB 1HNAA 4BVXB 3LYKA 3WGDA 2VCVA 4F2IA 3VWVA 3Q19A 2XBIA 3GKXA 1FAAA 3QFAC 2WRTA 3R3EA 4F82A 3CTGA 2H1DA 3K8NA 1FB0A 4ECCA 1QK8A 4V2NA 2DMLA 3UL3A 1TRSA 3E0UA 3A2XA 1GTIA 1M99A 5AIVA 4V1Ag 3GN3A 3P2AA 2GT5A 5JWQB 3GUSA 3NIVA 5D9XA 4F0CA 3EU3A 1GH2A 1BEDA 2CA8A 2B5EA 2FA4A 5AISA 1GUKA 3VPQA 5ELAA 3HVSA 4K7OA 3DVXA 1A8YA 2GSQA 1VF4A 1XOBA 5IPHA 2ZUPA 3QD9A 3BBYA 1A0FA 1OE7A 1PL1A 3UVTA 2JADA 3ZIJA 3U6VA 3TJKA 2CZ2A 2N5FA 4YQUA 2KP1A 4IQAA 1GUHA 4HUAA 4NV5A 1ST9A 2H6ZA 1ACVA 3TKRA 1M7TA 5C00A 2JSZA 1TW9A 4KSMA 1JZDA 3IOSA 2ZNMA 3DVWA 1YF0A 2V2GA 2FWHA 3HY2A 3TJGA 1PKZA 5FHIA 4FO5A 1U3AA 3GNJA 1V9WA 4N0ZA 4I5QA 1XWGA 4KDUA 4XS6A 5D9VA 3CBUA 2NTOA 13GSA 4PQ1A 4Q5NA 2AAWA 3KH9A 4K0NA 2VCTA 5DALA 4G0KA 4PUFC 2YCDA 4BL7A 4MF7A 1HYUA 5J9BA 1G6WA 1E6BA 2H1GA 3RBTA 4E8HA 5DAKA 2RIIA 5ECHB 5B7CA 3VFIA 4L0UA 3VLNA 1X9WB 1F3AA 3ED3A 3Q6OA 1J9BA 3TRQA 2K6VA 4NAXA 5CRDA 3HHVA 3OR5A 2GT6A 2PU9C 1XOAA 3DKSA 1GWCA 2R5GA 4PGTA 2HSMB 2CAQA 1OE8A 5CREA 3UARA 4OO4A 1WPIA 4KB3A 3EVIA 2C8UA 3H8QA 4MJAA 4FH8A 1QGVA 6GSXA 3TKQA 3W8SA 4KW6A 3TOUA 4HEA2 5CRGA 6GSVA 5J3RA 1O7UA 2PERA 5J5NA 5IPGA 2M46A 3U5RE 3C73A 2VOCA 1U6TA 2C4JA 1JLWA 5FWGA 4XRDA 1G6YA 2C3TA 1MD4A 4OMVA 3FR6A 3R2QA 4MF5A 9GSSA 1PA3A 1QUWA 2PPTA 3TUEA 3A2WA 2VL9A 2CX3A 4DVCA 3C7MA 4J57E 4BVXA 1E2YA 4TR1A 2ZCTA 2YZHA 2X8GA 1WP0A 1TKDB 1OC3A 4G19A 1B4PA 4JE1A 1M2BA 1EP8A 3L9UA 3GIXA 1ZZYA 1S3DA 2HXKA 2LS5A 4IW9A 4ZILA 1GP1A 4WETA 3DYRA 1SJ6A 1ON4A 2TIRA 4GXZA 1BQ7A 4GCIA 3TOTA 4ZB8A 1EOGA 1FB6A 2PBJA 4HOJA 2C1YA 2DJ0A 3TDGA 2FNOA 1SKWB 3QAGA 3UMAA 2H1BA 2MBTA 1IYIA 2AB6A 2HFDA 1USBA 1I5GA 2OADA 1JZRA 4GWRA 3GX0A 1Z5YE 4LLRA 1YDKA 3H79A 4K7NA 5IM9A 1PX7A 2WS2A 4PTSA 4MZCA 1Q4JA 2QKEA 1U3IA 2HE3A 1PGTA 1OKTA 4G9HA 1TXXA 5ECMB 2EIQA 5L71A 3GURA 1SU9A 3FHKA 3LYPA 3A5WA 3LWAA 1FO5A 1MTCA 3EYTA 4XRAA 3TJJA 19GSA 3UJ1A 5LCZA 5AGYA 2DJJA 1R26A 4XS4B 1ILOA 2H30A 1NSWA 3JCML 4O7HA 2R4VA 4IJ3A 4OFMA 3V1WA 2JL4A 2L4QA 1TU8A 1AQWA 5EPFA 3EC3A 1TTZA 4CDOA 1T1VA 1GLPA 1AW9A 1W89A 1X9SB 1S3CA 3P90A 4J2FA 3FR9A 3IXRA 3H93A 3HKRA 3VK9A 2WULA 5CRHA 2DBCA 3QDNA 4TN8A 4BA7A 2P0GA 1K0NA 1ZYEA 5HFGA 2OBIA 2X8CA 3DIEA 2X64A 3F6DA 1C72A 3D22A 3TKSE 2RM6A 10GSA 3WT1A 6GSTA 5F0GA 2R6KA 2C0DA 2VL3A 4KSOA 2VCZA 2XHFA 4EXJA 3F63A 1T8EB 1ERVA 1WJKA 2YWIA 2HRKB 3CSJA 1A0RP 4AF2A 2HQTA 5BMUA 4BVYA 2DIYA 3TJBA 4EDYA 2F3MA 3O3TA 3IPZA 2I3YA 5GAND 1GTUA 4HJ2A 1YZXA 1B9XC 3IBHA 3APOA 1XXUA 5F07A 5G31A 4YAVA 5DVBA 1CQHA 2HSMA 2DJ2A 4K8MA 1O73A 1XW5A 1YF1A 6GSUA 1BAYA 2F8AA 5D8IA 2RLIA 1RW1A 14GSA 1GUMA 1ERWA 4JBBA 1H4OA 1KBNA 4OFNA 1CQGA 2VCQA 3I9V2 3PINA 4Z7XA 3RAZA 4IELA 2CVDA 2LRNA 2L5LA 1V58A 1YKAA 2MYGA 3S9FA 1F2EA 2YV9A 1HQOA 4OD7A 3C1RA 1MDJA 1K3OA 3TB2A 1PN9A 2H6YA 2K8SA 3APQA 1M9BA 2H0HA 1SL0B 3LG6A 1AC1A 4MJEA 4V2MA 5H5QA 5DCHA 5ID2B 3BCKA 1EGOA 1XZOA 4Q5QA 2IL3A 4NPBA 4LL4B 2E7PA 2LKUA 4K9ZA 1XWKA 4ECIA 3FEUA 2IMIA 2RUFA 1X5EA 4KGIA 1AAZA 1XVQA 2AYTA 2HRAA 3D4MA 5IOXA 3LEFA 2YWMA 2VM2A 2H66A 2WZ9A 2IMDA 2OACA 4DEJA 1UVZA 3VWUA 4MH3A 3TJFA 2V41A 2C0GA 3PGTA 4ZIJA 3HZ8A 1B8XA 5HR0A 3FZAA 1ERUA 2O7KA 4IP1A 1XWCA 2L6CA 3ZREA 2FWEA 3EINA 4DSRA 3PR8A 3D5JA 4EC0A 1A2MA 3L4NA 4I97A 4KNDA 5J9CA 4G0LA 2F9SA 3UOMA 2B6MA 4K0GA 4GQFA 4ILFA 3EMXA 5IMCA 1EEMA 12GSA 3GX8A 4TR4A 1GTBA 4DSQA 2OE1A 3J7Yb 2H01A 2A2SA 4MA9A 4KH7A 2LV3A 3GSTA 1O6JA 2O8VB 2KLXA 2X99A 1NM3A 3QFBC 2YN1A 1JFUA 2LSTA 3GL3A 5JCGA 3ZMKA 2G2QA 1KEBA 2TRCP 2KOKA 4L8EA 2LJAA 4I8BA 5INYA 4MPFA 4XS4A 4WBRD 3PPUA 1Q98A 2FHEA 6GSWA 3I6AA 3KP8A 4ML6A 2DJ3A 1TK5B 1VF1A 1LBKA 1A2LA 1ZYQB 5D93A 4I2TA 1B48A 2VLUA 4IN0A 4OCFA 4I6XA 2DMMA 1SYRA 2YWNA 2YP6A 2H19A 4L0WA 1GNEA 2K9FA 16GSA 2C0FA 5F05A 4RI6A 4WR5A 2OA7A 4V1Ap 4EUYA 2HZEB 3TGZA 1H75A 4IBPA 3DWVA 5CRWA 2OJLA 1K3YA 3F4RA 1GL8A 4F03A 1R5PA 5ECRB 2HZFA 2OE0A 2GTUA 4HI7A 4IVFA 4EL1A 2HRNA 2DLXA 4JEDA 5EY6A 4RI7A 2OKAA 2CQ9A 2H0IA 2FUG2 4K1FA 3UIWA 2GQMA 5G1LA 4IGJA 4ML1A 3UEMA 2IFQB 4PQHA 3F4TA 2PVQA 5JWOB 11GSA 4NV2A 3GTUB 2MBSA 4ZL7A 2BJXA 1GSDA 3I69A 1VF3A 3BCIA 3C8EA 2I9HA 3TKSC 2HSNB 3D21A 4F0BA 4O5RA 2DC5A 5IQYA 4LL1B 1K0AA 3W8JA 18GSA 3DGQA 4TVEA 5IIZA 1SL1B 3M9KA 1OC9A 3ZFBA 2GZPA 5HQPA 5ENUA 5JCWA 2XPEA 4TXOA 4Q5FA 4POMA 3ZYWA 2H72A 4NMUA 1FVKA 1ZCPA 4G0IA 2B5XA 3QPMA 3NZNA 2VLVA 1VRSD 5JWRB 3SWLA 5ECLB 1KTEA 3ZVJA 4HZ2A 5G1KA 1T4ZA 4OO5A 2OE3A 4TXVA 3IE3A 1R4WA 4L5LA 1JLVA 1GSSA 3WYWA 4POBA 4KA0A 1NW2A 1SJZA 4ULXA 5G2ZA 4NWYA 3QAVA 1RQMA 2GLRA 2CVBA 3VI5A 1M9AA 4K2DA 4RUVA 3GKNA 2GDRA 4WF4A 2MMOA 3QMXA 2DJ1A 1SK0A 3VWWA 1OVNA 3TKPA 5E59A 3L9SA 5E4WA 1F6MC 2H75A 3KM6A 1AQXA 2CZ3A 3HXSA 3IA1A 3MDKA 1YJ6A 3ERWA 2E0QA 4TR0A 2CV4A 1A2JA 2L4CA 1EP7A 3CTFA 3IR4A 3HVXA 2L59A 3QOUA 3F8UA 4TR3A 2M80A 3FRCA 1O81A 1F3BA 3A2VA 2GSSA 4MMMA 3US3A 2YZUA 3GYKA 1WRYA 1M2DA 2C3QA 5D96A 4ZL8A 3RHBA 5B6NA 4IKHA 2K8VA 3M8NA 4ZBDA 1PKWA 4DSSB 3F0IA 1EV4A 2KP2A 4G10A 2XPDA 2ES7A 2V1MA 1XW6A 3BD2A 1SK1A 2GQLA 3D4TA 1ZGNA 4KDXA 1V40A 3KTLA 1O85A 2AJQB 3F3QA 2B1LA 3KXOA 2KHPA 4EKZA 1K0DA 1M0UA 1TI1A 1K0BA 3LJRA 1PQNA 1F9MA 3LFLA 4PUAA 2R2JA 4OCEA 3CSHA 1N2AA 3ZZXA 5D73A 1R5AA 4TW5A 1V2AA 5GSTA 2H1AA 3I43A 1HNBA 4KCAA 3ZLPA 4AGSA 5GAPD 1U88A 2B3SA 3FK8A 4YQMA 2VAFA 2JU5A 4X0XA 1A23A 1Y6EA 4PQIA 2IJYA 1AIUA 4HZ4A 1UC7A 3IV4A 4ACSA 3G7IA 4EE0A 3HZ4A 4WR4A 4MZBA 1XVWA 2LNSA 3EURA 4AJ6A 1BYEA 3FW2A 3D6IA 1OC8A 4YH2A 4FYBA 4GRFA 6GSSA 4EVMA 2LJRA 4TKYA 3C1SA 5J4UA 2IFQA 2N5AA 5ECQB 5HR2A 4POLA 1QMVA 1BX9A 2LQQA 5A4WA 3GTUA 2EIRA 5GSSA 2VLTA 4XHMA 3DRNA 1GSEA 4GSNA 3GA4A 4FQUA 3KZQA 5IMAA 3UAPA 2IIYA 3L0HA 1X9MB 1OKDA 1Z3EA 4JU5A 2F8FA 3IAM2 2XC2A 1DUGA 3HYPA 4MABA 2HSYA 5B8AA 3CYNA 3N5OA 1FG4A 5ECIB 1S3AA 4KAEA 3RDWA 2FD3A 3CSIA 4MPGA 3VWXA 3GKMA 1WIKA 1YEPA 1B4QA 5DDLA 2G0FA 2Z9SA 3IAS2 5G5FA 5CP1A 2NBSA 3GV1A 2B1KA 1HNCA 1I9DA 4OWYA 5COHA 1SD9A 1SK2A 2P31A 3M0FA 1Z6MA 1GRXA 3LSZA 4FYUA 3VURA 1T3BA 3HJOA 3HD5A 3RHCA 5AIXA 2LJKA 2QGVA 1TJDA 5DQSA 5KEJA 2FLSA 4MLYA 3DMLA 5J41A 2EIOA 1ERTA 4H86A 5DALB 3BOAA 4XIHA 3GKKA 4HQSA 3KH7A 2YV7A 2O87A 3FYGA 3FKFA 5CYYA 5KN3A 4TOPA 1DBYA 5DAKB 5F8BA 5IMZA 5IO2A 5H5RA 4N30A 2AUVA 3CMIA 2H74A 1ZL9A 1MD3A 4HJMA 2E2MA 2VL2A 3M1GA 1TU7A 2PVOC 3TKSA 1EOHA 4ZL9A 1G0TA 5CNWA 3WGXA 1PD21 3ZRDA 3FR3A 3C71A 1Z7RA 4LMVA 3KIJA 3F9UA 2C3NA 5KN1A 3G7YA 4JRRA 2E2GA 1U87A 3VPTA 2WFCA 1TRUA 5EVOA 3O6TA 4MDCA 1MDKA 2BTOT 5DBQA 3F4SA 1AQVA 1QXHA 3LXZA 1GSQA 2MMZA 3MSZA 1EEJA 3TCOA 2L5OA 2HI7A 3RPPA 3GL5A 4JR4A 2P5RA 2VM1A 1AXDA 2LUSA 1X5DA 2I81A 4WEYA 5HFKA 2RUEA 2TRXA 5AN1A 1GSUA 2H0GA 4RQXA 2LNTA 2NPBA 2XBQA 4X1UA 2V6OA 4V2LA 1ABAA 3A3TA 2FWGA 2IMKA 4GQCA 1J08A 4N10A 2C0EA 5IMVA 2NVLA 4IQ1A 1X5CA 4ECBA 1NHYA 4GSSA 2ON7A 3DXBA 1R7HA 4MH2A 3D0ZA 1TDIA 1GLQA 4IS0A 1NHOA 1PSQA 5LNKe 4CHSA 4WF5A 4ZXGA 3KJYA 1A24A 1Z6NA 1YY7A 2O89A 2L6DA 2VCWA 1O8WA 3HCZA 4TR1B 2VCXA 2LTKA 2WGRA 3TRPA 2GQKA 2RM5A 2R37A 2IPAA 2VIMA 2FA8A 2VO4A 4IJIA 2YJ7A 4MCUA 1DSBA 2JZSA 2JZTA 3H1NA 5ECPB 2HSHA 3GSSA 2OBKA 2IN3A 1XPVA 2QSIA 4JR6A 1GSFA 2DSAA 2L57A 2KUCA 4XS1A 2B7KA 3M3MA 4K6XA 3G9BA 1QFNA 3G7JA 5DQYA 3BJ5A 2GSTA 3CRTA 1YKCA 2A4VA 1QQ2A 2WCIA 1UN2A 3QCPA 1OAZA 1T00A 4J56E 2REMA 3DEXA 2YPMA 2H76A 2HRKA 5ECKB 2H8LA 5ELGA 5A5KA 1V57A 3LXTA 2I4AA 3EMPA 2HLSA 2B5YA 1SL2B 2J23A 2WB9A 3F3RA 4PXOA 4N0VA 1DE1A 2HNLA 3WD6A 1UA5A 3ME8A 3F6FA 4XCSA 3J7Yk 5C04A 4MK3A 4JZQA 1YQ1A 3IK7A 4ID0A 2VL2C 1PMTA 4HQZA 3UBKA 4NXIA 3QAWA 2P5QA 3ZVJD 3FZ4A 1TOFA 4BWSA 3KGKA 4USSA 3IC8A 2F51A 4PURA 1LJRA 4D73B 4O32A 5KN2A 1BJXA 2GGTA 3ZTLA 1O8XA 1N8JA 4O92A 4CW9A 1B9YC 3PH9A 3AY8A 1GSYA 1Z9HA 4NHZA 2CAIA 2J9HA 1BG5A 2GS3A 4HU7A 5LD0A 3H4KA 4QL9A 5ID2A 20GSA 3LQ7A 5DCGA 5D9WA 3ZFLA 4BVYB 1EGRA 3FZ5A 4I2UA 2FGXA 1ZMAA 4GSTA 1TK8B 2YOIA 4WBJA 2H6XA 1T7PB 1THOA 2VUPA 3KTBA 2PGTA 1PX6A 1TP9A 1FW1A 1K0OA 1RK4A 1WMJA 2V32A 2H70A 2AHEA 2HYXA 17GSA 1LU4A 1Z7PA 2FWFA 4ECJA 2CVKA 3KMNA 1GNWA 5D9TA 1K3LA 2LEGA 3P8WA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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