3VV5A

Crystal structure of ttc0807 complexed with (s)-2-aminoethyl-l-cysteine (aec)
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
FQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
total genus 94
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vv5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vv5A02
1DPPA 2Z23A 4FATA 4N6PA 3TEPA 4R9FA 1JEVA 2DXYA 2NOOA 3C32A 3RLFE 3I3VA 4PFUA 1A7LA 4EXKA 3TTMA 1D3KA 3BKIB 1AH5A 1ATGA 5AA4B 4NMYA 3RGYA 2E1SA 3C4MA 3KBRA 3A3CA 3TCHA 1UQWA 3CSBA 2AL5A 4NWCA 5AA4A 2OWSA 3SEXA 3E4RA 2NXOA 4NEDA 3K01A 4FIMA 3GBAA 3A09A 3K0VA 1B1HA 1IIWA 3VLWA 2V3QA 2X7PA 2UVHA 4ND9A 1OLCA 1GR2A 3G3KA 1B7UA 3PPRA 1MQIA 4EF2A 1QUJA 4GXSB 4LA9A 4DZ1A 4C0RA 1Z7ME 3PPNA 5ICTA 1A40A 3Q25A 1H3DA 3IOVA 2BJJX 1GGGA 4YZZA 4Q30B 5JTYB 1XS5A 4KFQA 3T96B 4GIZA 3RT8A 5H8FB 1USYH 3UA8A 4OZ9A 4DCXA 5JTYA 1IITA 4O3CA 2D3IA 4OFJA 1LCTA 1S50A 3MWBA 1LFIA 3KGCA 2O6AA 2PT1A 2Q2AA 2F34A 1B1XA 4H8IA 5B70A 1B3FA 4DLDA 3MP6A 4MLQA 2ZYMA 2PT2A 4NF8A 3S9NC 4H8JA 4BLAA 2F8DA 4U23A 1MG1A 4P0GA 4GD5A 4YAHX 2H9BA 3QYTA 3K6VA 2XXPA 1HSEA 3SEUA 1SW4A 1HSLA 3IL1B 1PBPA 2NWJA 3S2VA 4GVOA 3M3LA 4KI0E 4IGRA 2B65A 5DVFA 3RNNA 5DEXB 2HQ0A 3TYHA 5A5XB 2XX9A 4NF5A 3W9VA 1IEJA 1FQFA 1SW5A 3MC2A 3MUQA 2ZNTA 4OETA 2Q9TA 3G3IA 2DWHA 5K2XA 3N26A 1IZ1A 1VFDA 4G8HA 1FQCA 2DS9A 3CFZA 1B51A 1NL5A 1URDA 1N76A 2ALUA 5KCJB 1B5IA 1Y3PA 5KZTA 3TDJA 3PUWE 4UACA 4F19A 2ANJA 2V3TA 1TT1A 2DSFA 2O68A 1D9YA 1XVXA 5I84A 3CVGA 2XX7A 5H8NB 3H06B 4OYVA 2I3WA 1SYIA 4ZDMA 3QUFA 2REGA 1USYE 4ECFA 4ZEBA 3H4ZA 2A5TB 2ZYNA 1NNPA 3CG1A 2F7AA 2OK2A 1DSNA 3RTFB 3SEYA 3LBSA 3OOAA 4F2QA 2A5TA 3PMWA 5H8HA 1JW4A 4TLMB 1NNTA 1LB8A 1QJMA 1LCFA 3CG3A 4RJZA 4GWOA 2DWIA 3OXNA 4FAJA 1IXIA 3H3GA 3RN8A 4JBZA 4IO7A 1OQGA 2NVUB 3ZKKA 2ZMBA 2HEUA 3G3HA 3KOSA 2B3FA 3GXAA 5FHOA 5FHNA 1AMFA 1PB9A 1T0KA 2RINA 3OSQA 1BKAA 1URSA 5HBCA 4LQ2A 2O7IA 4KQPA 4EUOA 4RK9A 3H03A 3HSTA 1RYOA 4LZ8A 2R6GE 2UYFA 4IY6A 3PUYE 2QS1A 4F1VA 4YB6A 3U93A 1PDAA 5CMBA 4ELOA 5JEIA 2YLNA 1FQEA 3KJ7A 5DVJA 1MXVA 4XKPA 3CI8A 2E0SA 4QFNA 5LOMA 5FHMA 4LATA 1FQBA 3IOTA 3S9MC 1TWYA 3K1NA 3THIA 3PMVA 4XXUA 5CI5A 3IJOB 2OZZA 2XHDA 5AA2A 5CMCA 4ZZEA 3QSLA 5H8QA 3H6TA 3T66A 1OMPA 1Y3NA 3K02A 5I2KB 3WAEA 1N04A 4YKJA 1UTBB 1BP5A 1S9TA 3E9XA 4OEVA 3Q28A 3S9EA 2O1MA 1B52A 1N3WA 1QUKA 3CSGA 5L9OA 1OLAA 1UTBA 1OIBA 1LB9A 2P1SA 3LSWA 1P1NA 3QAXA 1H43A 3FJGA 3KEIA 5J1DA 1MPDA 4NE4A 4RA1A 3MP1A 3UK4A 3K6WA 4F3GA 4IO6A 3RUMA 3RY3A 1B40A 4NF4B 3VLVA 1VE4A 1LAFE 3VVEA 2B3BA 1B3LA 3UORA 4RYAA 1M5DA 1DTGA 2ONKE 2DP8A 3PV0E 4E0WA 1MY0A 4F1UA 1DPEA 1DOTA 3V89B 1L5TA 2XXRA 1POY1 3MAMA 2RC7A 5JK4A 3E3KA 3O2AA 3SKPA 2GH9A 1D4NA 3CIJA 1ZKBA 4JSDA 5KDTB 3PUZE 5I59B 4XTCQ 3USDA 2O1LA 3S4UA 2WKYA 5L8DA 5I59A 3TQLA 1JW1A 4GQOA 4OMBA 1B6HA 1SBPA 4JWXA 1EZ9A 2Y84A 2HZLA 3BFUA 1XOCA 3LC8A 1MQJA 1O63A 4XKRA 3M8UA 2YJPA 3FIRA 4YU0A 5DTBA 2XXYA 1B46A 4O3AA 3R6UA 4M4GA 4FEBA 2H25A 3DM0A 2I49A 5IKBA 3K6XA 1ZJLA 3FVGA 3K1MA 3U1OA 3O97A 4QHQA 4N07A 4MH5A 3KN7A 3O6IA 1FTMA 4P11A 4H6DA 3VVDA 4OFOA 1FTOA 1SI1A 1XC1A 4BDOA 3PPPA 5EHMA 4PP0A 3RT6B 2H5YA 3PD8A 3KN8A 2R71A 1WVJA 1B58A 1MH3A 1A8EA 3ZKLA 1FTKA 1MQDA 3K6UA 3G3JA 1XVYA 4ZE8A 2XXHA 4R75A 2HXWA 1AIVA 1ZU0A 2OCUA 3DELB 4DXUA 1IXGA 3C9HA 4QF9A 4QFOA 3P7IA 3KSXA 4EQ9A 2VHAA 4PFTA 4F3BA 3H6UA 1NNKA 3TUSA 3MBPA 5TPAB 5H8FA 3FJMA 3T9HB 1EU8A 1A8FA 3PPOA 2VP1A 1ZBMA 2XX8A 4PFWA 5TPAA 3ILUB 3PPQA 5FTIA 4F3SA 3VXCA 2HCAA 2VD2A 1YTVA 5K2YA 2I0BA 2OBGA 1B3HA 3OMBA 3MVXA 4JDFA 1R9LA 3MVYA 3TMGA 1MY2A 2UXAA 2I0CA 4U4XA 2Q2CA 4OQOA 4OHNA 3LR1A 5CMMA 3K00A 2XXWA 4MF3A 1LFHA 1P1OA 3IK6B 2RKMA 2Y7PA 3C31A 1MXUA 5EHSA 4DCYA 4EQ7A 3G7WA 1MM6A 2UVIA 5L9SA 5DEXA 3D4CA 4IO5A 1FQDA 5A5XA 5HPQA 3IB1A 4H0WA 3PGFA 2Y7WA 3SEVA 2AYSA 3K1PA 1QKAA 3TPAA 3OENA 3EHUA 3TTLA 1B7HA 2Y7KA 1I69A 5B7DA 4YB7A 3K2DA 4X1DA 4EF1A 4DIGA 4POWA 3VDFA 1LBBA 4GRKA 2YPNA 2QL3A 3H6VA 4MBPA 4H67A 4F3PA 2XD3A 2FA7A 5DVIA 3LUYA 3UIFA 4RY1A 2NUVA 2V25A 1FW0A 5KCJA 3Q29A 2I4CA 4H1XA 2H98A 3HN0A 1US4A 1MPCA 1Y20A 4ELPA 1M5BA 3TQWA 3EHSA 5H8NA 3DP6A 4L17A 2IEEA 4EDPA 3ZSFA 4ZS9A 1R6ZA 2QMWA 1FCKA 1Q35A 3B6WA 3EF7A 4DXBA 3HV1A 5F1QA 5BUUA 2F5XA 3O29A 4RXLA 2UVGA 3EPEA 1RKMA 2PMSA 3W15C 1B3EA 3RQTA 1GV8A 4YMBA 3O66A 1VSOA 3WAFA 3IOUA 3ODBA 2REJA 2O7UA 4NF6B 3FXUA 4THIA 3ECRA 1O64A 4X48A 1URGA 3FZVA 4MFIA 1US5A 4POXA 1AOVA 1I6QA 3O9PA 4PQJA 3FD3A 3OO7A 3JZJA 1MXYA 1Y1MA 4YKPA 1P99A 3TODA 1FTJA 4LP2B 4ESXA 1P1WA 3T93B 1CE2A 2F35A 3UP9A 1Y4CA 3ONMA 4OENA 5F7VA 4F18A 3GBBA 4E0XA 3PMXA 4OFLA 3CFXA 2DE4A 5ITOA 2OWTA 2ZXTA 3K4UA 2F7CA 2AIXA 2GHAA 3OO8A 2X26A 3OEMA 2HAUA 2ZNUA 3EQ1A 4YB5A 3QIMA 1SI0A 3VFJA 1LAHE 3H7MA 2QJEA 3C35A 3QUJA 2I48A 4DE8A 2QS2A 4F31B 3OSRA 5CRYA 1R1NA 2THIA 2DQVA 1SDXA 2DWJA 3KFMA 3TTRA 3O6GA 4BDRA 4IO3A 4KCDA 3FGSA 1FQAA 4R72A 4RPNA 3FUZA 1M5CA 1EZOA 5DYHA 2H99A 4U22A 3IORA 3MJNA 4LQ5A 1GTKA 3HCQA 2DWAA 5I2KA 1A55A 1LAGE 2DE2A 4R6YA 3LSLA 3HHFA 1MPBA 4GOTA 3TFLA 2FYIA 1ANFA 2V93A 3U72A 3UGWA 2H4IA 3IAZA 3N6TA 4GLIA 2W7YA 3I5OA 1MY3A 1LFGA 1GVCA 4HCWA 3G3FA 2RC9A 2VD3A 4TQUQ 1B2HA 4IB2A 5M2VA 4R9GA 4NF4A 2ESNA 3D4GA 2CMOA 4XKNA 2PVUA 4WKMA 1A54A 1PB7A 4RPOA 3VXBA 4LUBA 3SERA 2Y7RA 1S7YA 3OELA 4FECA 2LAOA 1M5FA 4ZECA 2Q88A 3U94A 5DT6A 3HO7A 3T22A 4TLLB 1UIVA 1XHYA 1I6BA 3U92A 1LBCA 1N7XA 1WODA 2UYEA 4DXCA 4UA8A 2Y7IA 1MXXA 2UVJA 3BFTA 4G77A 4C1TA 2PX1A 2ZYOA 1SVXB 1QW0A 1ZLQA 1PBQA 5KDTA 4AQ4A 1VR5A 3IB0A 3FVKA 4GL8A 1H45A 3TTNA 2XXVA 3W9WA 3RPWA 5I57B 4QFKA 3FV1A 4FORA 5ICQA 3HPIA 4G2ZA 2XXXA 3PUVE 1F9BA 3SESA 4WEPA 1UIUA 5EYFA 4I1DA 2Z22A 2QRYA 4EQBA 3DP8A 1POTA 5I56B 3LSXA 4KYEA 2XD2A 4HTGA 4QSDA 1B9JA 3B6QA 1ZTYA 1IQ7A 3VV5A 5BWJA 2Z8EA 3MP8A 1II5A 1MRPA 1I6AA 2HAVA 4ZEDA 2F6PA 4QFPA 1ZIUA 3TCGA 4X9TA 3N94A 2QS3A 1EZPA 3GLBA 2IA4A 4Q8RA 4U21A 1JNFA 2O69A 2CZLA 1TXFA 1QULA 2HFBA 1B5JA 1CB6A 1PEBA 1B05A 4F22A 1M5EA 4FE8A 4G68C 3KJTA 4LVQA 1MDQA 1IUDA 2ABHA 3SETA 3SDFA 4OEUA 1LSTA 2PYYA 3JV9A 1NFTA 3KG2A 1MY1A 4XIGQ 4R6HA 2ONSA 1B4HA 5TU0A 3ZS6A 4F29A 4IO2A 2QS4A 2F78A 2I3VA 3V5AA 3PD9A 1O7TA 2GFEA 2O84X 4OVJA 1B0LA 3F11A 3MZ1A 1SQYA 3MPKA 4ELQA 1MH4A 1MM7A 2QSXA 2XXQA 1WDNA 1Y4TA 3KSJA 3FVNA 3FXRA 1FTLA 1MXZA 2Q89A 4QSCA 4OTEA 1D9VA 3QK6A 3M3FA 3OD7A 4XKQA 4X1BA 3FASA 5CMKA 1BTJA 2ONRA 2RF1A 3MVZA 2DXRA 4I8CA 2QPQA 3IOWA 5AA3A 2V3UA 2VOZA 3B7DA 4HW8A 3DLNA 4YMAA 1QVSA 3MVWA 4AB5A 1SYHA 4NF8B 4QRZA 3OO6A 4TOZA 4QFLA 2AL4A 1JETA 4JWOA 4BDQA 3A3UA 4JSOA 3H6WA 3C36A 3QXMA 3O28A 5AA2D 5ELVA 3VLUA 4M1VA 4OXVA 1BLFA 1YPNA 4NF5B 4R2BA 2ZNSA 3FV2A 3TKDA 5ITPA 1VFEA 4ZEIA 3R26A 1KWHA 2G93A 4OERA 3CFLA 3N5LA 3C34A 1MY4A 1OVBA 5CBSA 1TFDA 4PE5B 4PETA 1AL3A 3TTKA 1Q1KA 1H44A 4IO4A 1SD3A 4GXAA 3MW0A 3KN3A 4U1OA 5AE4A 1NH8A 3T9XB 3N6UA 3MZ9A 4JXIA 1MQGA 3T9VA 4ESWA 1Z7NE 4ISUA 4G68B 1LGBC 1N0TA 4HCYA 3IJXB 5H8SA 1P1UA 1Y1ZA 4G68A 2DVCA 4R2FA 1JW5A 4ELRA 2PBWA 3FVOA 4RK2A 3C33A 3L6HA 3MQ9A 3TAJA 2XXTA 4AB6A 4RNSA 4Z7EA 4YKKA 2F6GA 1EH3A 3CRBA 4K3FA 2O51A 1N84A 5AA1A 4WEDA 2DYXA 1OVTA 4OWDA 1B3GA 1YCJA 1JVXA 1DTZA 5H8HB 4F1YA 4EXLA 1HSJA 2VGQA 1QKBA 4BDLA 3AXFA 4LONB 5I2NB 4R6KA 3HHGA 4G8MA 1QUIA 1B5HA 3FATA 5I2NA 1J1NA 4BDMA 3TCFA 5HM4B 5CM6A 3M3KA 3IR1A 4KYDA 4YICA 4NF6A 2DVZA 5ISUA 3BBRA 4HS7A 2P2AA 3T9UA 4ZZAA 3EN3A 3E13X 4H5GA 4FEDA 2V84A 4GL0A 1Y3QA 4OESA 2OJTA 4IY5A 1MS7A 1MDP1 3DP4A 3UN6A 3GZGA 2M8CA 3JYRA 5L9MA 2X7QA 1NKXA 1LAXA 1N3XA 4P0IA 1UTHB 4MLVA 4YKIA 1IXHA 4O3BA 1PC3A 1UTHA 4F2OA 3RTWB 3SEWA 2FNCA 3FXQA 4NTLA 1JEUA 2QMXA 1LLSA 3MPLA 5IAIA 3CR9A 4ZEKA 3PU5A 4U2RA 3FJ7A 1R9QA 3U8QA 3OEKA 2RCAA 4Q5TA 3O6HA 4ONYA 1JQFA 4G8NA 5CC2A 3KZGA 4KR5A 1JVYA 1YAEA 5AA2B 4BDNA 4JB7A 5H8QB 3KOTA 4I62A 3VE1B 3S9LC 3IO6A 4ZEFA 3B6TA 3ILTB 4R73A 4IGTA 1MXWA 1SW2A 1NMUA 3I6VA 4LZ7A 2A5SA 2F36A 1P1QA 1NH7A 3Q26A 2I6EA 4PFYA 4N13A 2XXIA 5TP9B 2D21A 2GRVA 4H5FA 2R9JA 2F7BA 1A99A 1H76A 1OQHA 5TP9A 3V8XB 4GF8A 2GHBA 3IO4A 4C1UA 4U1ZA 2XXUA 4G4PA 1B0HA 2P0SA 3VVFA 1ZMGA 2RCBA 2Z8FA 4GFRA 2DOJA 4JWYA 2OLBA 1RYXA 2KLFA 1B7ZA 4U4SA 4I9DA 4WXJA 3G3GA 4Q0CA 4Z0IA 4QSEA 2Q8JA 1PB8A 4H65A 4KHZE 3TZAA 1B4ZA 3LSFB 3EHTA 4DDDA 3IB2A 2HZKA 3R7XA 1ELJA 2Z8DA 4LZ5A 1BIYA 1IXCA 4FJPA 2F97A 5I58B 2I4BA 1B32A 4ZE9A 3OO9A 2I58A 5I58A 3V83A 4KPTA 2ZYKA 5I57A 4NWDA 4KD5A 1Y9UA 4R74A 3MZBA 5FTHA 3IX1A 3TELA 1MQHA 1XT8A 3L6GA 1NNFA 4F39A 2D5WA 5I56A 5CBRA 2G29A 1SW1A 1DMBA 2RC8A 3Q27A 4KYSA 1N7WA 4KCCA 1TFAA 2DE3A 3PUXE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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