3VV5A

Crystal structure of ttc0807 complexed with (s)-2-aminoethyl-l-cysteine (aec)
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
FQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
total genus 94
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vv5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vv5A02
1ZBMA 3G3GA 3C31A 4FE8A 2QS2A 3FJ7A 1B51A 1N7XA 1B46A 2RF1A 4MLQA 4X1BA 5EYFA 3M3FA 4NF5A 1B5HA 4AB5A 5AA4B 3S9NC 2Q2CA 3K6UA 5L9SA 3TQWA 5CBSA 5FHMA 4MF3A 4WXJA 4HW8A 3OO9A 3ECRA 4BDMA 3OMBA 1BKAA 1USYE 4G2ZA 2H5YA 1RKMA 3G3KA 3TQLA 1MS7A 3H6TA 4PQJA 3K6VA 3PUXE 2H99A 5I57A 1MXWA 2VP1A 5KDTB 1NH8A 2WKYA 1P1OA 1B58A 4IO3A 5JTYB 4U4XA 3P7IA 2X7PA 1FTJA 4U23A 5DVFA 1ELJA 3PUZE 1NNFA 3QK6A 3ONMA 1D9YA 3SEVA 3C32A 2B65A 1SI0A 2Q88A 3OEKA 3KG2A 4OYVA 1QUKA 5FTIA 3Q29A 3TTRA 5HPQA 3KZGA 3MVWA 2P2AA 4QFOA 4DLDA 4N13A 2E1SA 2ONRA 1Y9UA 2HXWA 1LAGE 3H03A 3MP6A 4R72A 3TTNA 2D3IA 1NFTA 2I3WA 1I6BA 1MXZA 3FUZA 4GL8A 4G8MA 1M5EA 3CG3A 5I56A 1SD3A 1B7UA 1B3LA 3S9MC 2RCAA 4R6YA 4HCWA 4Z7EA 3IOVA 4G77A 3PPQA 4PFYA 5H8NA 1F9BA 4U1ZA 2Z22A 3TTKA 1A8EA 3PD9A 1FQCA 5ELVA 1JEUA 3H6WA 4ECFA 1IUDA 3OSQA 1PB9A 3E13X 4KYSA 3B6TA 2RC9A 3K4UA 1FQDA 1M5FA 2O7IA 4POWA 3TFLA 3PU5A 4BDLA 1TWYA 1EZOA 1JNFA 3ZSFA 1ZIUA 1SYIA 2HZLA 4TLLB 1OIBA 4FECA 1MH3A 3R26A 5DEXA 3FASA 4BDNA 3HSTA 1O7TA 4X1DA 5ICTA 3T66A 4F3BA 1HSLA 4F29A 4THIA 2VD2A 2YJPA 4XKQA 4F22A 4YMAA 3C36A 3UA8A 3DELB 4ESWA 4DXUA 1YTVA 4BLAA 3RLFE 1SW5A 1QKBA 1MXUA 1N0TA 2Q2AA 3O2AA 4G8HA 5CI5A 2H9BA 2XD3A 3V8XB 4F3GA 3UORA 3DP8A 2UVIA 3FXRA 5L8DA 4U22A 1LGBC 1N84A 1MY3A 2HZKA 1FQAA 5F7VA 3IO4A 3HN0A 1Z7NE 2FNCA 4MFIA 2O68A 1MQDA 4N07A 2D5WA 4RK9A 4JSOA 3PPRA 2O69A 4KR5A 2GHAA 3FJGA 5FTHA 3O29A 2H25A 1NNPA 3N26A 3LR1A 4GFRA 3S9EA 3GBAA 2YLNA 3RT8A 1S50A 1GR2A 4KHZE 3ZS6A 5ITOA 4DXBA 3R7XA 3SEXA 5I58A 2H98A 4R2BA 2XX8A 2QJEA 4H0WA 2Y7PA 3L6HA 4EQ9A 1GGGA 3VFJA 2IEEA 2RKMA 4OFOA 4FEDA 4Q5TA 4QRZA 3FXUA 4E0XA 3KGCA 1UIVA 4ND9A 3GXAA 1XVXA 3EHSA 4DCXA 2YPNA 3H3GA 5ISUA 1MM6A 2LAOA 3T22A 3LSLA 3N6UA 2I48A 1US5A 4LQ2A 3T93B 3PMXA 1TT1A 4M4GA 3JYRA 3VV5A 3VXCA 3VE1B 1J1NA 1P1WA 3VLWA 3H7MA 3SEWA 4ZZAA 1MPBA 3RGYA 1OLCA 1TFAA 3QUFA 4GRKA 3A09A 1O64A 3E9XA 1ANFA 2GHBA 3DP6A 3H06B 3VVDA 5I58B 1OQGA 4F1YA 1CE2A 3O6IA 4U21A 3RY3A 1Y1MA 1B4ZA 3CIJA 3PPNA 1KWHA 1M5DA 1QUIA 4ZS9A 2V3QA 4POXA 1QVSA 4P0GA 1PB8A 2HAUA 5KCJA 1LBBA 3KJTA 1B3GA 1YAEA 2FA7A 4JXIA 1B40A 1URSA 1MY4A 1UIUA 1N3WA 1Y1ZA 1IZ1A 3IAZA 4LUBA 4NE4A 3FATA 1AH5A 3CFLA 5F1QA 5H8FB 4ZE8A 5I57B 1SI1A 3PGFA 1S9TA 3RN8A 1PB7A 1OMPA 2PT1A 1LCFA 5DVJA 1II5A 1IXGA 2DS9A 2HFBA 2O84X 2DWJA 2BJJX 3CR9A 4GL0A 4NF4B 3S2VA 3VVFA 1XHYA 4R2FA 1IIWA 1B3EA 1YCJA 2QRYA 4OTEA 1LSTA 5AA3A 3PPOA 3I5OA 4IO5A 4QSCA 2NWJA 5I56B 4ELQA 4JDFA 1P1NA 1LBCA 2O1MA 2ZMBA 1DOTA 2V3UA 3QXMA 4G68B 2DVZA 3G3JA 4ZEIA 4EUOA 4JBZA 3EF7A 1A55A 3K0VA 4KQPA 3R6UA 3TZAA 5KCJB 4GF8A 1UQWA 1Y3QA 4UACA 2I4BA 2RCBA 3IB0A 2DWAA 4XIGQ 4K3FA 4OENA 4YU0A 3T9XB 5H8NB 1B3HA 2DOJA 2REGA 2ZNUA 3CI8A 3KN8A 1JW1A 3U72A 3K1NA 2NXOA 2PMSA 5FHNA 3LSXA 2G93A 1FQEA 2F8DA 1MDP1 2X7QA 1DSNA 3OO7A 5KZTA 1MY2A 1LB8A 2A5SA 3U1OA 2UYEA 3V89B 2XXWA 1P1QA 1N7WA 3BFUA 1MXXA 2QS3A 5TP9A 1EU8A 2R6GE 4F3PA 1B9JA 4XTCQ 4H8IA 4OHNA 3Q27A 4Q0CA 4QFLA 1FCKA 4IO4A 2OCUA 5H8HA 1VFEA 1XOCA 2GH9A 2PYYA 3DLNA 4QHQA 4R6HA 5DEXB 3U92A 1T0KA 4Q30B 2ZYOA 3PUWE 5IKBA 4U4SA 1GTKA 3KJ7A 4WKMA 5HBCA 3TKDA 4OEVA 1QUJA 1ZLQA 1ZKBA 3IB2A 4GOTA 2Z23A 1Q35A 1JVYA 3LBSA 5I84A 3Q26A 1IXIA 1AMFA 1B5JA 2Y7KA 4DXCA 1M5CA 3O97A 4PP0A 3OENA 2F7CA 3EQ1A 4QF9A 4RYAA 1A7LA 2R71A 1HSJA 3VLUA 4EQBA 4PFTA 1PDAA 1OVTA 4ELRA 3S9LC 4GWOA 2PVUA 4I1DA 1MH4A 4DZ1A 4PFUA 1NMUA 2UVGA 1Q1KA 1S7YA 3UGWA 1LFHA 3K6WA 4RNSA 3G7WA 3Q28A 2QL3A 4QFPA 1Y3PA 1SW1A 5BWJA 2AIXA 1R1NA 3CRBA 2Q89A 4LZ8A 3KFMA 3O9PA 4ELOA 3EHUA 4NTLA 4WEPA 2ZXTA 1BP5A 1ATGA 5B70A 3ZKKA 5CMCA 5CM6A 1URGA 1XC1A 3W15C 1LAFE 3BKIB 1QULA 3O28A 2H4IA 1XT8A 1SVXB 2ONSA 3MZBA 1B32A 4X48A 2O1LA 2Z8DA 3KSXA 4G68A 3GLBA 4UA8A 1UTHB 3C34A 5AA4A 5JTYA 1NNKA 4FEBA 1AIVA 1JEVA 4R9FA 3FVNA 2OZZA 1SYHA 5I2KA 1I6AA 1R9LA 3MVYA 3PPPA 5DYHA 1NNTA 1DPEA 2P0SA 1AOVA 3OELA 2HQ0A 5I2NA 3CVGA 3FVKA 4H5FA 4IY5A 1B0LA 3E3KA 1LFIA 3IO6A 2ZNSA 4TLMB 3HCQA 4IB2A 2QS1A 1SBPA 5LOMA 5J1DA 3CFXA 3MZ9A 3JV9A 4NF8A 4NF5B 3RTFB 3S4UA 3AXFA 3B6QA 1URDA 1US4A 1B3FA 2ONKE 2W7YA 4R74A 5CRYA 3RUMA 5L9MA 4H1XA 1Y20A 1H44A 2F6GA 3PD8A 1POY1 4OERA 1XS5A 2DVCA 2IA4A 3HPIA 5I59B 3IJXB 4I8CA 1CB6A 4NWCA 4F31B 3ODBA 5AA2A 4JWYA 4MBPA 3SDFA 3ILUB 4NMYA 5H8QB 4ZEBA 3U93A 1VR5A 4F39A 3MP8A 2RC7A 2Y7RA 3K02A 3HV1A 4ZEKA 4XKRA 1SW4A 2F97A 4KYDA 2HCAA 3FD3A 4R6KA 4OZ9A 4OVJA 4XKPA 3T9VA 2I58A 3IL1B 3C35A 1MQIA 1FW0A 1DTZA 2RC8A 3EHTA 2E0SA 3TCFA 4P0IA 3U94A 4LZ7A 4R75A 2NOOA 4BDOA 1VFDA 5AA2D 3OEMA 4O3CA 4O3BA 3IB1A 1GVCA 5TP9B 4C1UA 3T96B 2B3FA 4EXKA 2QS4A 3KOTA 4KCCA 3SEUA 4FATA 3W9WA 3FXQA 4YKIA 5FHOA 3RQTA 2F5XA 3SESA 5EHMA 3FZVA 4G8NA 4KFQA 4EF2A 4RPOA 1H43A 4PFWA 1OLAA 1OQHA 4EDPA 3W9VA 2F35A 3TCHA 1JVXA 4YB7A 1JW4A 3CG1A 3UP9A 3SETA 1WDNA 4OETA 3RNNA 4GIZA 4FORA 3VLVA 2UVJA 2XXRA 3M3LA 1N04A 4GXSB 1A99A 1LAXA 1WODA 1BLFA 1FTKA 1PEBA 1B7ZA 2GFEA 2M8CA 4N6PA 4ZDMA 3TELA 5DT6A 4KI0E 4EF1A 4AB6A 1MPDA 4F2QA 5IAIA 3IORA 5A5XB 3H6UA 3TPAA 4RK2A 3C4MA 3TEPA 2I3VA 4GLIA 1B52A 1P99A 4YZZA 4YKPA 2ANJA 1IEJA 4ZZEA 1ZJLA 3O6HA 4JSDA 4TOZA 1Y3NA 4RPNA 4BDRA 2FYIA 1OVBA 3O6GA 4MLVA 1H76A 1IITA 1AL3A 2I4CA 3K2DA 4IGTA 2F34A 2DE2A 4IO7A 3QSLA 1JETA 2OWTA 3IOTA 3U8QA 4EXLA 2F78A 4F1UA 3C9HA 3RPWA 2ZYKA 3MVXA 5L9OA 1TXFA 2XXQA 3VDFA 2DXRA 1B05A 2XXUA 4LP2B 1B1XA 4E0WA 1EH3A 2AYSA 4X9TA 3MUQA 3QAXA 4XXUA 3TTLA 4H6DA 3DP4A 3MVZA 2Y7IA 1FTMA 3VVEA 2Y7WA 3K6XA 1MXVA 2RINA 2V25A 2Z8EA 3BBRA 1UTHA 3OO8A 4WEDA 3K1PA 1N76A 4H67A 3IR1A 5HM4B 1WVJA 2Y84A 2P1SA 1R9QA 3N5LA 3MP1A 1QKAA 5ICQA 4G68C 3MZ1A 4QFKA 1ZMGA 4F1VA 2OLBA 1I69A 3D4CA 3FV1A 3G3FA 1O63A 1B7HA 4YICA 3QIMA 2OK2A 3I3VA 3WAEA 2CMOA 1QW0A 2O6AA 3GBBA 2OJTA 3OOAA 2A5TA 3T9HB 1B2HA 2PBWA 2QSXA 1A8FA 4KD5A 3T9UA 5K2YA 1UTBB 4YKKA 2NVUB 2DE4A 2OWSA 2ZYMA 2F7AA 4OWDA 5AA1A 3OD7A 4F18A 1VE4A 2HAVA 2Q9TA 2XX7A 1Z7ME 5CMKA 3PV0E 1Y4TA 2G29A 3IX1A 4GQOA 4NWDA 3SEYA 5B7DA 4NEDA 2ALUA 3PUYE 4ONYA 3LUYA 1JQFA 4YB6A 3O66A 2D21A 4F19A 3GZGA 1D3KA 2V84A 2XXTA 3IOUA 4EQ7A 2R9JA 4AQ4A 1RYOA 3B6WA 3HHFA 1B1HA 3EN3A 3MC2A 1EZ9A 5EHSA 5BUUA 5JK4A 3PMWA 3OO6A 2VOZA 1SQYA 3FV2A 5TPAB 3KBRA 3CSGA 5M2VA 3Q25A 2A5TB 1H3DA 4DCYA 3FVGA 2QMXA 3TDJA 2ABHA 3VXBA 5H8HB 1USYH 2XHDA 4KCDA 5I59A 3JZJA 3E4RA 4QSEA 1LFGA 1JW5A 1MPCA 4P11A 1ZU0A 3IK6B 2I49A 3KSJA 3OXNA 4LQ5A 1FQBA 3ZKLA 4ZEDA 5A5XA 1MQHA 3K01A 4L17A 3UIFA 3UN6A 1FTLA 5I2KB 3CFZA 5CC2A 3TMGA 3K00A 1MM7A 2F6PA 2NUVA 1LCTA 3M8UA 4HCYA 3MW0A 4QFNA 4U1OA 5H8SA 2QMWA 4JB7A 1A54A 3QYTA 1DPPA 2CZLA 4OFLA 1NH7A 5KDTA 1HSEA 4H65A 4ISUA 4NF8B 4XKNA 2O7UA 3KN7A 5DVIA 3THIA 4OFJA 5ITPA 4C1TA 4LVQA 3SERA 5AA2B 4G4PA 1LLSA 4OQOA 4LATA 5TPAA 2Z8FA 4ZECA 1NL5A 4PE5B 2OBGA 1MY0A 1B5IA 4JWOA 3FIRA 2XXHA 4GXAA 3V5AA 3MJNA 3BFTA 3FVOA 3SKPA 4Z0IA 2HEUA 3KN3A 3MPKA 3KEIA 1FQFA 2GRVA 3HO7A 2UXAA 1VSOA 4LA9A 4LZ5A 2XXXA 4PETA 4YAHX 4MH5A 5CMBA 4ESXA 3FJMA 2DP8A 3PUVE 4IO6A 3IJOB 4LONB 1GV8A 3H6VA 2V93A 4KYEA 4M1VA 3RTWB 3MAMA 1B6HA 1ZTYA 2AL5A 2PX1A 3OSRA 1P1UA 4OEUA 1Y4CA 4IO2A 4TQUQ 2DXYA 4DDDA 1MQJA 4YB5A 1IXHA 1XVYA 4BDQA 3A3CA 2V3TA 4FIMA 2XXIA 1UTBA 4QSDA 1PBQA 1H45A 5JEIA 2UYFA 4F3SA 4I62A 3TODA 3USDA 1I6QA 1MDQA 3D4GA 4DE8A 2QPQA 2XX9A 2DE3A 3KOSA 1MXYA 3LSFB 5CMMA 2I0CA 4FJPA 1IQ7A 2X26A 3MQ9A 3MWBA 4NF6A 3V83A 1NKXA 3B7DA 2UVHA 3F11A 2VGQA 3IOWA 4KPTA 5TU0A 4RJZA 2ZYNA 4HS7A 2DSFA 3C33A 1YPNA 3LSWA 3G3IA 4YKJA 3M3KA 4ELPA 1FTOA 4ZE9A 4GVOA 1PBPA 3EPEA 1DMBA 1LAHE 1MY1A 2REJA 4HTGA 4OXVA 4GD5A 1TFDA 1B0HA 4OMBA 4F2OA 3TYHA 2ZNTA 2VHAA 4C0RA 4DIGA 3TCGA 3TAJA 1MG1A 1MRPA 5H8QA 3WAFA 1DTGA 4FAJA 5CBRA 4O3AA 4U2RA 2ESNA 5DTBA 4JWXA 4Q8RA 4IY6A 1RYXA 3MBPA 4ZEFA 2DYXA 4R73A 3DM0A 3L6GA 2Q8JA 4YMBA 3G3HA 4NF6B 1MQGA 3PMVA 1R6ZA 2PT2A 2THIA 4NF4A 4RXLA 2DWHA 2XXVA 1N3XA 1A40A 3N6TA 4RA1A 2B3BA 4R9GA 3QUJA 2VD3A 1EZPA 4I9DA 1QJMA 1SDXA 2KLFA 3TUSA 2O51A 3H4ZA 2F7BA 4H8JA 2F36A 3A3UA 5H8FA 3UK4A 2XXPA 5K2XA 4IGRA 5AE4A 3HHGA 3LC8A 5I2NB 1B4HA 1PC3A 3MPLA 4RY1A 4H5GA 2I6EA 1BIYA 1BTJA 2XXYA 2AL4A 3CSBA 3FGSA 3N94A 4OESA 3RT6B 3TTMA 1LB9A 2DWIA 1M5BA 2XD2A 3ILTB 2I0BA 3K1MA 1IXCA 1D4NA 1D9VA 1POTA 2DQVA 1SW2A 1L5TA 3I6VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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