3VYEA

Human renin in complex with inhibitor 7
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
340
structure length
335
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Design and discovery of new (3S,5R)-5-[4-(2-chlorophenyl)-2,2-dimethyl-5-oxopiperazin-1-yl]piperidine-3-carboxamides as potent renin inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 335
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vyeA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vyeA01
4YE3A 1OD1A 4K4RA 1AJVA 3VYDA 4MC9A 5P66A 2VIEA 3MSLA 3NDTA 4N00A 2QHYA 5OYUA 4U7QA 2QZWA 5OZVA 1YTIA 5OZIA 4FS4A 4Z22A 4YOBA 5OZCA 2NNKA 5P6VA 3R0WA 1GNOA 3ZKQA 3EL9A 3FIVA 5P6YA 7UPJA 3O9CA 5OZ7A 3D1YA 3UDNA 5P2AA 3GGUA 1ZPKA 5FIVA 5P1HA 1G2KA 4EXGA 3TNEA 2UXZA 4F73A 1B6LA 4GIDA 5P2XA 3KDDA 3H5BA 3N4LA 3PBZA 5KR2A 5P4AA 4R93A 2PH6A 1SIVA 5P35A 3SA7A 4H3IA 4ZPEA 3RTHA 1FQ8A 3S7MA 4A6CA 5OZJA 5AH9A 5P6BA 3EKVA 4M8YA 1YT9A 3SA8A 2PSUA 3EM3A 5P4HA 4ZSQA 5P7PA 3RTMA 1FQXA 4Z2ZA 4DQHA 5P7MA 2QMDA 5P4QA 2BPZA 1WBMA 1W6IA 2WF0A 1NSOA 4DFGA 5P50A 2P4JA 2AQUA 3PSYA 5ER2E 4YD7A 5P8DA 5P6HA 5P5DA 3HVPA 4EPJA 4HDFA 4EWOA 5P0LA 1W51A 1ZSFA 2I4UA 5CONA 4Y5BA 1LZQA 5P1UA 3EXOA 5P2LA 4RRSA 2OHTA 1QBTA 3TPLA 1AJXA 5OYYA 2G27A 2O4NA 5P3BA 4RVIA 1HSHA 4ZSPA 1EBZA 3EL4A 5P4WA 5OZKA 5P1YA 4XX3A 4JP9A 3G6ZA 3OUDB 3VSXA 5KR1A 5ISKA 3UF3A 5P7KA 1SGUA 3LIYA 5SY2A 4DJRA 5P79A 5KQZA 3UFLA 2VJ9A 4Y48A 4GJ8A 4J1IA 4EHCA 5P6WA 1J71A 2OHQA 2RENA 3KFPA 2PQZA 4RCEA 5P5KA 5P72A 2IGXA 5P8IA 5P7CA 3SO9A 4Y3NA 4YD3A 5P69A 5DPZA 2H6SA 3TKGA 4JPEA 1MT9A 2B8LA 5HVPA 1GVUA 4EP2A 4ACXA 2QD8A 4RZ1A 5DGUA 5P7DA 5P2VA 5P43A 4YD5A 5P4IA 4Y5CA 5OZ1A 1EBKC 5P8JA 4HZTA 4BEKA 3QROA 4L1AB 1KZKA 2IS0A 5P7QA 2CEJA 2V10C 1MESA 4FSLA 2V16C 3OU4B 1PROA 1ZBGA 1UH7A 2QI7A 5P0QA 3NDUA 1APVE 3K5CA 5T4SA 3KF0A 1AAQA 2FIVA 5I3VA 5KR0A 1K2BA 3UQWA 4I1CA 3PM4A 3FSMA 4FRKA 4NJSA 4DH6A 4Z4XA 1Z1HA 3OU3A 1ER8E 3LHGA 2ER6E 1FG6C 4B1CA 5P04A 5IVQA 1HVCA 3ZPTA 2JXRA 2G1NA 1HXWA 4FLGA 1BBSA 4YA8A 3CYWA 2G22A 3NU5A 2QU2A 4H1EA 5P62A 3S43B 2FNTA 5HDZA 4NKKA 5P65A 1EC1A 5OZDA 5P58A 1IVPA 5P29A 2XYEA 2V00A 2PSVA 5P0HA 3VV7A 3UQPA 2AOEA 3JVYA 1K1TA 4AA9A 3OU1A 5P24A 2J9JA 3OU4A 3OUCA 2NNPA 5P1WA 5P4MA 5P6CA 2ANLA 2I4QA 3K5FA 3EKTA 1DAZC 4FM8A 2PSGA 3IN3A 5P3QA 2PMAA 3UPJA 5P13A 2G1OA 3DJKA 3BGCA 5P2OA 2UY0A 5P8GA 3QBFA 3PVKA 1BXQA 5P3RA 5PEPA 4Y3PA 3IA9A 4YCTA 5P4VA 2IDWA 2IQGA 5P1JA 1XN3A 4D83A 1VIKA 2NXMA 5P8UA 2OHKA 4OD9B 1ODWA 5OZ2A 4K9HA 2UPJA 3MSJA 3O9DA 3OTYA 5P0SA 5P7IA 2B7ZA 2FGUA 5P28A 1TZSA 4OC6B 4Y3SA 3N3IA 3PLLA 5P5NA 3O99A 4PYVA 3D20A 1HHPA 1APWE 5P3XA 3OOTA 4WTUA 3IXOA 3NU3A 2Z54A 1FLHA 2G24A 3SA4A 5P6XA 5P4DA 5P83A 1E82E 1W5XA 1YTJA 5P7ZA 5P07A 3T7PA 1A8KA 3OAGA 5P0CA 3UCBA 5P38A 5P41A 2V12C 4EP3A 5P3DA 1FMUA 7HVPA 5OZXA 2AVVA 4J55A 2ZE1A 1SP5A 3ZPSA 3IVHA 2ER9E 4GZFA 2QZLA 2ZYEA 5P0VA 6UPJA 2IKOA 4CPUA 1PPME 3R0YA 5P8KA 4YHQA 3KDBA 2FGVA 1MUIA 2VNMA 1MERA 4AMTA 3TLHA 4ZEAA 2H6TA 1K6VA 4MC1A 4QGIA 5P1FA 5P7RA 5OZ3A 5P6KA 5P4GA 4J1HA 1META 1HVLA 4Y4JA 4I0JA 1MTBA 5P7GA 5P5ZA 3IN4A 4TRZA 1B11A 4Y45A 4DJYA 1UH8A 5HU0A 4I8WA 5P40A 2FXDA 1EPQE 4Y3HA 5P7TA 3K4VC 5P73A 3KFRA 4RVXA 3SPKA 5P54A 1IZDA 3UDMA 4JECA 5P4YA 4FSEA 3IGBA 3OXWA 1T6GA 5UPJA 5P2HA 4Y41A 1HWRA 9HVPA 5P00A 4DJWA 2BBBA 4QJ6A 5DR4A 4X7IA 5HDXA 1K6TA 5P63A 2F3EA 3TTPA 2MIPA 4TVHA 4Y3MA 5JODA 2AOGA 3UQUA 3C9XA 5P5IA 2QI3A 5P5PA 2QI4A 2QHCA 5P44A 4Y36A 1FQ5A 3DV1A 3FV3A 5P6FA 1EEDP 3I8WA 5P0PA 3INFA 2QI5A 1K1UA 4TRYA 1LV1A 4J54A 3K5DA 1T6EX 3URLA 4DQGA 3MSKA 5OZ5A 1HTEA 5P05A 3BXRA 5P6QA 5P3WA 3EKYA 5P6NA 4NJTA 2Q55A 4RVJA 5P6UA 5KOQA 4HEGA 5P0FA 1CPIA 5P0MA 5P77A 1Z8CA 4ZLSA 1BDLA 3OXXA 1WKRA 4IVTA 4Y3WA 3OADB 1HVSA 3ER3E 4I8ZA 4I0DA 1A9MA 2WHHA 1DPJA 2VA7A 2SAMA 1SGZA 5COPA 3EM4A 2PK5A 4CPWA 5P6AA 1PSNA 1DW6C 5P3SA 4D85A 3S8IA 2IGYA 3QAAA 5HE7A 4PZXA 5OZYA 1RNEA 5OZLA 4HVPA 2AVQA 2R9BA 4FRSA 5P2YA 4Y38A 2OHNA 2F3FA 5SXNA 5OYRA 3DCKA 5P3OA 1HPXA 3GI5A 3TPJA 1LF4A 2JJIA 4I10A 1D4IA 3EMYA 3PWWA 1FFIC 3KN0A 5P3TA 5P2KA 5P6EA 1RPIA 3RSXA 4Y4TA 1LYWA 3LITA 5P87A 4QJAA 5JFPA 5OZBA 2AZ9A 3OGPA 5P2UA 1IZIA 4J17A 5P5TA 5P5SA 3L59A 4H3JA 4DQCA 5P4TA 3QVIA 1NPVA 5P4KA 2JE4A 5P39A 4I0FA 4J0VA 2FXEA 5OZWA 2OHLA 4OBJA 5P3UA 3OQFA 5P7BA 5I3WA 4QJ9A 1XE6A 5P5XA 2FNSA 3S45A 3QRSA 5OZEA 5P11A 3UDQA 3APRE 3PJ6A 4LAPA 4Q5MA 1B5FA 3OK9A 3QN8A 3HLOA 5P0BA 1EBWA 3CICA 4GJ5A 3UDPA 4Y53A 3VF7A 4QJ2A 3BUHA 2NMZA 2V0ZC 3PBDA 1EBYA 1XE5A 5AHCA 5IS4A 5OZNA 4FGXA 1MSNA 2Q64A 2CENA 3R4BA 5P7JA 1ZSRA 5P6IA 3BUGA 3D1ZA 2FDPA 4NJUA 5HE5A 5P3AA 3WB5A 4J5JA 3BXSA 5HE4A 3PWMA 2EWYA 3INHA 5P3VA 3QRMA 4XX4A 4I12A 4Y4GA 4Y3TA 3DM6A 4OBDA 5P52A 5P4SA 2G1SA 5OZQA 5P08A 5OZ8A 4I0HA 2B7FA 2ZDZA 5P5WA 4R5NA 2JJJA 5SY3A 5P1AA 1BV9A 2WL0A 3DOXA 3MWSA 5BRYA 3UHLA 2WF2A 5P25A 1HTRB 4YDFA 3I2LA 5P1DA 3TOGA 5P0XA 3TOHA 4DJUA 4A6BA 5P6MA 2F3KA 1C6XA 4R95A 5HCOA 2G20A 3VEUA 2O40A 3NU6A 2FMBA 5C9FA 3L5BA 4GMIA 4LXMA 4CMSA 4DJXA 4EJDA 2VIZA 5KQFA 5P5RA 5P34A 3A2OA 1GVVA 4B78A 4M8XA 3I7EA 4DJOA 2NXDA 2F81A 4AUCA 3SFCA 4YCYA 5AHBA 5P7AA 3OQKA 4QLHA 4Y3FA 5C9DA 4LP9A 5P7HA 2PH8A 4AZYA 2B60A 1BIMA 2I4WA 5P27A 5P22A 4Y3EA 5P3KA 5KR8A 3BVBA 3PSGA 3DCRA 5TOLA 3AUPA 4TVGA 5KQXA 4R8YA 1HOSA 5IVRA 5E5KA 1BVEA 1HVIA 4Y5MA 1XL2A 5P4NA 5P6JA 1YTHA 5P5JA 3GI4A 2NR6A 1KJGA 1G0VA 3D1XA 3WZ7A 4K4QA 4FM6A 4FM7A 1AM5A 1QRPE 1LF2A 3L5EA 1WBKA 2V11C 5J25A 1SDTA 3UDKA 3DV5A 1B6JA 4B1DA 2OHUA 4FE6A 3NU4A 5P70A 4I0ZA 5P3IA 4K4PA 5F00A 4Q1NA 5IVTA 2QNQA 3KMYA 1FF0C 5P5QA 3OU1B 3KMXA 2AVSA 3QPJA 2J9JB 3FNUA 5HU1A 3K5GA 5P3CA 5P6SA 1AIDA 2ZJNA 4Y5LA 5P0WA 1ZP8A 3VF3A 4Q1WA 1XS7D 3ZPUA 2RSPA 3S7LA 3SACA 2Q11A 5P7WA 4RYGA 1HSIA 2AODA 4DVFA 4L7GA 3S56A 3SLZA 4ER2E 4L6BA 1IVQA 4Y3AA 4L7HA 1EPPE 1T3RA 4J0ZA 4Y37A 4OBZA 2WECA 5P0KA 5P8PA 3EL1A 4BFBA 3S2OA 1IDBA 4FRIA 4E43A 5COKA 3OQ7A 5P89A 3ZKMA 4MC2A 5F01A 2ZHUA 3VV8A 5P1ZA 5P6PA 2ER0E 1BV7A 3OXVA 2QNNA 2OHSA 2R3WA 4FAEA 5HCTA 1G6LA 5P0OA 5OYWA 1U8GA 3HZCA 5P3YA 4RLDA 3SA5A 1HIHA 1BDQA 2CEMA 3QIHA 4X2LA 1LYAA 5OZUA 1CZIE 5P19A 3PSUA 5P1CA 1QBRA 3BHEA 3S85A 1FIVA 2FLEA 3LNKA 1BILA 4Y51A 2AVOA 1E5OE 5AH8A 4A4QA 2AOJA 3OAGB 4EXHA 4COEA 3HW1A 1GVXA 4I0IA 1AZ5A 1UH9A 1KJ7A 4Y5EA 5OYXA 5P74A 3M9FA 2B8VA 2P3AA 4Y4BA 2R5PA 4RRNA 5P78A 3GI6A 4GB2A 3GI0A 3KM4A 5P03A 3R2FA 3ZOVA 3WSJA 5BS4A 1NH0A 3UDHA 5P5BA 2QZKA 3SA3A 5P8QA 1EPME 4Q1XA 4J1CA 3HAWA 4FIVA 5AHAA 3T6IA 4F75A 4DUSA 1M4HA 4Y56A 4DQEA 5ISJA 1EAGA 5P6RA 5P6GA 3O9LA 5DQ1A 3NR6A 5OZOA 2G1YA 5P3JA 3WZ6A 1AVFA 3WZ8A 5P61A 1T7JA 1XDHA 2AOFA 5DR7A 5P7VA 3VSWA 4L7JA 2IRZA 1HVRA 2IL2A 5P2GA 5P2IA 4Y5AA 2PC0A 5P0JA 1MT8A 2VJ7A 4Y4EA 3LIQA 1HVHA 4Y4XA 4QJ7A 1YM4A 5OYVA 4LHHA 5P8OA 1HXBA 5ER1E 5P59A 4I0EA 3ZL7A 5P2TA 5DQCA 1B6PA 1SIPA 5P30A 5OZRA 3Q3TA 1DIFA 5E5JA 1LYBA 4GJDA 5P2RA 2RMPA 1N49A 5P2EA 4ZPFA 5HDVA 3TL9A 1GVTA 3ZLQA 3VLBA 3SAAA 3UDRA 1D4SA 5I70A 5P1RA 3EKQA 4Y43A 5DR3A 4EQ0A 3QS1A 5P1NA 5P51A 1D4LA 4KE1A 2IEOA 4BFDA 4J1KA 4RCFA 1Z1RA 2I1AA 4WY6A 2O4KA 2PK6A 2B42A 2HM1A 1C6YA 4Y3ZA 5BWYA 1BXOA 4YD4A 2BQVA 4LBTA 5KQYA 5HDUA 5P17A 2AZCA 4F74A 5P8LA 4CPQA 4Y3YA 4NPUA 3CIDA 4FAFA 1KJHA 4LXKA 2I4VA 1E80E 2BPXA 3IXJA 3TH9A 2WEAA 5P1OA 5P1PA 3EBZA 5P8HA 4K8SA 5P1LA 4D8CA 5P8SA 5ENKA 2ZGAA 5P4FA 3Q6YA 1PPKE 2I0AA 1TSQA 4HLAA 1SMRA 1IZEA 5JG1A 3RSVA 5P2QA 4EJLA 5P7NA 5I3YA 3NWXA 5P68A 1CMSA 3FNSA 2QI1A 2AOHA 5P5EA 5P8BA 4IVSA 4APRE 3O9GA 3U71A 3I25A 1NPAA 4Y47A 1OEWA 5P56A 1W6HA 2NMYA 2I0DA 4I11A 5OZHA 2R3TA 4HDBA 5OZ9A 1DP5A 1LYWB 5P3HA 3LIXA 4J0YA 1W5YA 3PCZA 3ZKNA 2XYFA 1T7IA 2F8GA 3DUYA 3KYRA 1BWBA 2QHZA 1B6KA 1HEFE 3ECGA 2AIDA 5P1TA 1M0BA 1Q9PA 1TCXA 1JLDA 5OZGA 4J1FA 5OZSA 3BRAA 5P01A 5P10A 3NXEA 1T7KA 2QNPA 2FS4A 5EZXA 1YM2A 2P3BB 3SM1A 5P4OA 4CP7A 4EJKA 3B80A 5HTZA 5P42A 3I6OA 1EPLE 4R91A 5P1EA 3LPIA 2G94A 1B5FB 2RKFA 3RTNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4YE3 A;  1OD1 A;  4K4R A;  1AJV A;  3VYD A;  4MC9 A;  5P66 A;  2VIE A;  3MSL A;  3NDT A;  4N00 A;  2QHY A;  5OYU A;  4U7Q A;  2QZW A;  5OZV A;  1YTI A;  5OZI A;  4FS4 A;  4Z22 A;  4YOB A;  5OZC A;  2NNK A;  5P6V A;  3R0W A;  1GNO A;  3ZKQ A;  3EL9 A;  3FIV A;  5P6Y A;  7UPJ A;  3O9C A;  5OZ7 A;  3D1Y A;  3UDN A;  5P2A A;  3GGU A;  1ZPK A;  5FIV A;  5P1H A;  1G2K A;  4EXG A;  3TNE A;  2UXZ A;  4F73 A;  1B6L A;  4GID A;  5P2X A;  3KDD A;  3H5B A;  3N4L A;  3PBZ A;  5KR2 A;  5P4A A;  4R93 A;  2PH6 A;  1SIV A;  5P35 A;  3SA7 A;  4H3I A;  4ZPE A;  3RTH A;  1FQ8 A;  3S7M A;  4A6C A;  5OZJ A;  5AH9 A;  5P6B A;  3EKV A;  4M8Y A;  1YT9 A;  3SA8 A;  2PSU A;  3EM3 A;  5P4H A;  4ZSQ A;  5P7P A;  3RTM A;  1FQX A;  4Z2Z A;  4DQH A;  5P7M A;  2QMD A;  5P4Q A;  2BPZ A;  1WBM A;  1W6I A;  2WF0 A;  1NSO A;  4DFG A;  5P50 A;  2P4J A;  2AQU A;  3PSY A;  5ER2 E;  4YD7 A;  5P8D A;  5P6H A;  5P5D A;  3HVP A;  4EPJ A;  4HDF A;  4EWO A;  5P0L A;  1W51 A;  1ZSF A;  2I4U A;  5CON A;  4Y5B A;  1LZQ A;  5P1U A;  3EXO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4PHV A;  4MC6 A;  1HVK A;  2ER7 E;  2G26 A;  3OUB A;  5P86 A;  5P0E A;  5JFU A;  2OF0 A;  3S43 A;  3UDJ A;  5IVS A;  8HVP A;  1ZAP A;  3OGQ A;  4Y3G A;  4YCK A;  2QMP A;  3ST5 A;  5OZ0 A;  5P5C A;  3SA9 A;  4DJQ A;  3NDW A;  4ER1 E;  1MIQ A;  5P57 A;  1MRX A;  4Y4Z A;  3FNT A;  3IXK A;  1FMX A;  5P5G A;  3DK1 A;  2VJ6 A;  4GYE A;  5P4X A;  1RL8 A;  2ZJH A;  1LS5 A;  4FCO A;  2OHM A;  3PLD A;  4Y3X A;  3PMU A;  2APR A;  2HPE A;  3TPR A;  2QD7 A;  1F7A A;  4H3G A;  5P88 A;  5P48 A;  2Q15 A;  3SQF A;  4OD9 A;  1E81 E;  3R1G B;  4HDP A;  4Y3R A;  3H0B A;  4RGH A;  3TOF A;  1HPS A;  5P06 A;  1BAI A;  5P3P A;  1EC3 A;  3HBO A;  3VG1 A;  3MXE A;  4OC6 A;  4Y3Q A;  3SKG A;  5P7O A;  5ENM A;  2NXL A;  5P8V A;  5P3E A;  2ZJL A;  3T11 A;  5P4B A;  1RQ9 A;  4YOA A;  3URI A;  5P1G A;  2A4F A;  5P55 A;  5P18 A;  5P6T A;  3PCW A;  5P6L A;  3SM2 A;  3SKF A;  1OHR A;  2Q54 A;  4Y4A A;  5P6Z A;  3L5C A;  1HPV A;  5P37 A;  1GVW A;  5P3M A;  3LPJ A;  4FRJ A;  5P2C A;  5P5L A;  3CKR A;  2WF1 A;  3Q5H A;  2HS1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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