3W15C

Structure of peroxisomal targeting signal 2 (pts2) of saccharomyces cerevisiae 3-ketoacyl-coa thiolase in complex with pex7p and pex21p
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
389
structure length
389
Chain Sequence
GSMSQRLQSIKDHLVESRSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein transport
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Crystal structure of peroxisomal targeting signal-2 bound to its receptor complex Pex7p-Pex21p
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxisomal targeting signal 2 receptor
total genus 135
structure length 389
sequence length 389
ec nomenclature ec 2.3.1.16: Acetyl-CoA C-acyltransferase.
pdb deposition date 2012-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3w15C00
2RC9A 1EZOA 4QFOA 2VP1A 2O84X 4H5GA 4U21A 4NF6B 2D3IA 4H8IA 1CE2A 1F9BA 2CZLA 1PB7A 4RK9A 5TP9B 4F1YA 2Q89A 3FXUA 4RPOA 3UGWA 3FVGA 2DWJA 4EUOA 1NFTA 3G3IA 4JBZA 5BUUA 5K2XA 5AA2A 3RT8A 3UP9A 2ZMBA 1B1XA 1SW4A 3H6VA 4R74A 5AA2D 3A3CA 1B7UA 4FJPA 3SERA 1VE4A 1B4ZA 2R6GE 3S9MC 1PB8A 5I58A 4GFRA 1L5TA 4R72A 3GBBA 4LONB 4X9TA 2OBGA 4XXUA 4LZ7A 2XXHA 3MUQA 4PFTA 1SBPA 3VE1B 5AA2B 3H3GA 1AH5A 1JVYA 1B46A 3ONMA 4C1TA 3OD7A 4RXLA 2I49A 5CMMA 4XKQA 3OEKA 4EXKA 1B3GA 4BDNA 4EF1A 2QS1A 3S9EA 3K00A 5I58B 1M5CA 1XT8A 2F7BA 2V3TA 1US4A 3KZGA 3KEIA 4GLIA 3PMWA 1P1NA 2UVGA 3AXFA 2QL3A 3CI8A 1BTJA 1M5FA 3VFJA 1VR5A 3DP8A 2R71A 4WEDA 1IQ7A 2DXRA 2XXVA 2YJPA 1M5DA 2RF1A 4Z7EA 3MPLA 2H4IA 1H3DA 4R6HA 5L8DA 3CRBA 3TCHA 5DVFA 3SEVA 2RC7A 1USYE 3ZKLA 4R6YA 4I9DA 3B6QA 3PPQA 4FIMA 4PFYA 3N6TA 1H44A 3HSTA 4LATA 4G8HA 4N07A 2QMWA 3GZGA 2QSXA 1Y1ZA 3Q25A 3IORA 3FVOA 2XXWA 4DDDA 2H5YA 5TU0A 3VLUA 3EHTA 1B0LA 3IOWA 3R7XA 3T66A 2VOZA 2E1SA 3CFZA 3TELA 3FJGA 4ESXA 3KN8A 4KQPA 3RPWA 2IEEA 1FW0A 3K1PA 4FEDA 2OZZA 4G68A 1PBQA 3KJ7A 4UA8A 1Y4TA 1B7ZA 3Q26A 2A5SA 4I62A 1FQBA 3TFLA 1H45A 5AA4A 3IB0A 3TDJA 3FGSA 1B7HA 1XS5A 5HPQA 2DP8A 5I2NA 1GVCA 3HHGA 3O97A 3CSBA 2BJJX 2Q9TA 4F2OA 1QULA 2DOJA 3IR1A 3F11A 4P0IA 4G68B 2HZKA 2Q2AA 3IK6B 3MP6A 4OENA 3H6TA 2F35A 1LFGA 1MQGA 3TTRA 4EF2A 4R9FA 1LFHA 5AA4B 4XIGQ 4IY5A 4M1VA 4F3BA 1Y20A 3QAXA 3QUFA 1NH8A 2D21A 3G7WA 5I2NB 2QRYA 4BDRA 1Y9UA 3ILUB 4FEBA 4F29A 2FNCA 1MQIA 4QSDA 4ISUA 1SI0A 4G77A 2GHAA 2I58A 2HCAA 1H43A 2DSFA 3U92A 3ZS6A 3HCQA 1NL5A 2B65A 2H99A 2I0CA 3RTWB 4F2QA 2H98A 4ZE9A 1EH3A 4DE8A 1XVXA 3G3FA 4OZ9A 2DS9A 2V3QA 3TPAA 1LBBA 1R6ZA 3TMGA 1OMPA 4C0RA 2D5WA 4U23A 3UIFA 3THIA 1USYH 1WVJA 1MH3A 2I3WA 4DIGA 1URGA 5F7VA 3VV5A 3RUMA 1Y3NA 1D3KA 3DP4A 1B40A 2THIA 4ZECA 5DEXA 1UTHA 4EXLA 1I69A 2B3BA 5ICTA 3PD9A 1M5BA 3TCGA 2ZYMA 1S9TA 1JEUA 3USDA 2UVJA 2AL4A 3ECRA 4I1DA 3K02A 1A54A 1EZ9A 4NMYA 3IJXB 5DVJA 3V83A 5ITPA 4IO6A 4BDMA 4JWXA 3C4MA 5DEXB 3KG2A 1P1OA 3RY3A 1UTHB 5H8HA 5L9MA 1MQJA 1YCJA 1ZIUA 3RQTA 5CMBA 2Q88A 4OEVA 1Z7NE 5FHNA 4AB6A 1MXZA 3IB1A 4LP2B 4FE8A 3T93B 1Y3QA 2ESNA 4MLVA 2E0SA 5H8QA 5H8FA 4RJZA 3VLWA 2NWJA 2RINA 1IUDA 4U4XA 1OVBA 2ONRA 3OO8A 3FV1A 3TTKA 3KOSA 5H8HB 3DLNA 4F1VA 2XXXA 3IB2A 1MDP1 4GIZA 3PMXA 5CRYA 4LUBA 1AL3A 1B0HA 2F7AA 1FTLA 1OQHA 2O1MA 2F78A 1SW5A 4KHZE 4R2FA 4ECFA 3T9UA 2XXRA 3HV1A 4QFNA 3FXQA 2WKYA 5H8QB 4THIA 4U4SA 5H8FB 3CSGA 4NTLA 2HAUA 2DVCA 3PGFA 1XHYA 3MW0A 1MY2A 1NMUA 3A09A 3SEUA 2O51A 5IKBA 3KFMA 3IJOB 2P1SA 4G4PA 3OELA 3N5LA 4KCDA 1S50A 1ATGA 4QSCA 4G8MA 1B4HA 4IO2A 1SVXB 1URSA 3IX1A 1MXUA 3MQ9A 4YKPA 4DCXA 5DT6A 4ELQA 5EHMA 5JK4A 2HQ0A 1IITA 4QFKA 1N3WA 3MBPA 3EHSA 1DPPA 5ICQA 1NNTA 4F3SA 1WDNA 3D4GA 3H7MA 1MXYA 3S2VA 1HSLA 1ZU0A 2NUVA 3K6XA 1ZKBA 3U1OA 5KDTA 1QUKA 4PFUA 2Q2CA 3ZSFA 1YAEA 4NF4A 3K2DA 1BIYA 4OMBA 1XVYA 4U1ZA 3B7DA 4QSEA 2AIXA 4O3CA 3SDFA 3FD3A 4FORA 4MBPA 5K2YA 3BBRA 2O7UA 1GR2A 3GXAA 2DE3A 3MVXA 2V3UA 1TT1A 2V84A 3PUVE 3OMBA 4EDPA 3E9XA 3IOTA 5KDTB 2NXOA 4NF4B 1B9JA 2I48A 4H5FA 4YKKA 2Z8DA 4IGTA 1DTGA 1B05A 2P0SA 2Y7KA 1T0KA 1SW1A 5CBSA 2LAOA 1N7WA 3MZBA 4H67A 4LA9A 4H0WA 3CFLA 2NOOA 3EN3A 2XXTA 3M3LA 2AL5A 1NNPA 1FQDA 3O6GA 3MC2A 1N04A 4O3AA 4PP0A 3C35A 3MJNA 1GV8A 5EHSA 1MPDA 3PUYE 4JWOA 1Z7ME 3EPEA 2ZYKA 1ELJA 1AOVA 3EHUA 4YICA 4U2RA 3VVDA 4N13A 4HS7A 5CMCA 2GRVA 4F18A 3ODBA 4C1UA 1LB9A 4M4GA 3OENA 4TLMB 2B3FA 4Z0IA 5I57A 2QS2A 1MM7A 4Q0CA 2XXQA 1OIBA 3D4CA 3PMVA 3UA8A 2IA4A 1SYHA 2YPNA 2PVUA 3QK6A 1N84A 1B3LA 2OJTA 4L17A 4POWA 1D4NA 2Y7IA 3O6IA 3U94A 3Q29A 2ABHA 3W9WA 1YTVA 3FJ7A 1DMBA 4F22A 3B6TA 1M5EA 4NF8A 4YAHX 1LSTA 5I57B 2ONKE 3QYTA 2GHBA 4OFLA 5FTHA 2H9BA 3Q27A 3G3HA 3FUZA 4OETA 1MH4A 1NNKA 3BFUA 2GFEA 3BKIB 4IO7A 2PMSA 2O68A 5H8NA 1B3FA 4WKMA 4GL0A 3RTFB 2V93A 4GOTA 1POTA 2F6GA 4NF8B 3KSJA 2O6AA 1PDAA 4OEUA 4GD5A 1ZBMA 3FATA 4NEDA 3P7IA 4F3PA 4QF9A 5TPAA 3WAEA 5H8NB 5M2VA 3FVKA 5HM4B 1DSNA 3BFTA 1PEBA 4OXVA 1ZMGA 4TLLB 4GL8A 3RN8A 4LQ5A 3N6UA 4XKPA 3VXBA 1MY3A 3MZ9A 3C34A 3H06B 1R9QA 1MRPA 1A99A 4DLDA 2F5XA 3PUXE 3W9VA 1FQAA 2XXYA 1I6QA 4E0WA 4OESA 3WAFA 4KFQA 1A40A 1GTKA 1FTKA 4QHQA 5TPAB 5IAIA 2RCAA 2M8CA 2I4CA 4R73A 5L9OA 1SQYA 4QFLA 3MP8A 3OOAA 3FV2A 3C32A 4Q8RA 1ANFA 4HW8A 5KCJA 4LVQA 2XD2A 1Q35A 1TWYA 3MZ1A 1QKAA 1RYOA 5AA3A 4RYAA 4KYEA 2DVZA 4ZEIA 3T22A 1SW2A 4GWOA 4LZ8A 5CM6A 4KPTA 3LSLA 3OO7A 4OWDA 3H4ZA 4ELRA 2HXWA 5I56A 4QFPA 4HCYA 4ZDMA 1HSJA 2DWIA 2YLNA 1MPBA 4IY6A 1MXVA 4XTCQ 3QSLA 3S9NC 5KCJB 4ZZAA 3V89B 2GH9A 1A8FA 1LAHE 2CMOA 1N7XA 2A5TA 4TOZA 5I56B 2X7QA 4XKNA 2G93A 2VHAA 1P99A 4GQOA 2I0BA 4E0XA 2H25A 2PT1A 1SD3A 1VSOA 3CVGA 1PBPA 3O29A 2Y7RA 2Z23A 2PX1A 1SDXA 3JZJA 4IO3A 2ZNUA 2HFBA 5JEIA 4YB6A 4R2BA 1B6HA 2ALUA 4JB7A 4BLAA 1QW0A 4ONYA 1P1WA 3PPNA 4GVOA 5I2KA 3ZKKA 1QUJA 2A5TB 4P11A 1IXHA 1TFDA 3U72A 1FQEA 4KR5A 3MP1A 1KWHA 2Y7PA 1PB9A 3GBAA 4AQ4A 2OLBA 2QPQA 1VFEA 4YB7A 1N0TA 2Q8JA 1AIVA 4GXSB 2PT2A 4BDQA 1HSEA 1R9LA 3UK4A 5I2KB 1N3XA 3R6UA 3TCFA 1IZ1A 1LLSA 2KLFA 3HPIA 4ESWA 1MS7A 3TQWA 3DM0A 3U8QA 1IXIA 3K4UA 5AA1A 3LR1A 1LGBC 4LZ5A 1BP5A 2Z22A 2RCBA 4H1XA 3MVWA 5FTIA 3E3KA 4KYSA 1YPNA 4F19A 1IEJA 5JTYA 4OTEA 4R75A 3TEPA 3V8XB 4DXBA 3W15C 4RA1A 1BLFA 3TZAA 1A7LA 3O66A 4RNSA 3FIRA 3T9VA 3IO6A 3LSFB 4OYVA 3KOTA 1FQFA 1JETA 3OO6A 2ANJA 4ELOA 1LCFA 3C33A 3MWBA 1JEVA 2VD3A 5JTYB 4I8CA 1I6BA 4OFJA 1SYIA 1SI1A 2O1LA 1LB8A 4KD5A 1A8EA 4EQBA 1IXGA 4KYDA 1B52A 1O63A 5DTBA 1Y3PA 4PETA 2OWTA 3FJMA 1LAFE 4TQUQ 3E13X 3SEYA 3HN0A 2V25A 1QUIA 4ND9A 2QJEA 4X1BA 2OCUA 5L9SA 4JSOA 2Z8FA 1DPEA 4Q30B 2FYIA 2NVUB 1US5A 1Q1KA 4MFIA 3PUWE 3T9HB 2PYYA 2XX7A 5DVIA 4YU0A 4AB5A 2XD3A 2OK2A 4JXIA 3LBSA 3V5AA 1OLAA 2REGA 3FZVA 1UQWA 1NH7A 4JSDA 1DTZA 1P1QA 3R26A 3EQ1A 3LSWA 4OQOA 1ZLQA 4JDFA 1UTBA 3C9HA 4NE4A 1II5A 2UVHA 4EQ9A 3PU5A 1MY4A 1JW4A 1OVTA 1S7YA 3M3FA 3PUZE 1XC1A 1FTJA 3PD8A 3K6WA 4JWYA 4HCWA 3T9XB 4MLQA 5CBRA 5F1QA 5H8SA 3L6HA 4FATA 5LOMA 2R9JA 3CG3A 3TKDA 3C36A 4ELPA 1UTBB 4NF5A 4UACA 3M3KA 4IO4A 5J1DA 3SETA 1QJMA 1B3HA 3KGCA 4R9GA 5AE4A 4OVJA 2DE4A 4IO5A 4GRKA 5I84A 3LUYA 4F3GA 1JVXA 4OHNA 3JYRA 4NF5B 2DWAA 3MVZA 4F1UA 3HO7A 4ZEDA 4GXAA 5DYHA 1Y4CA 2UXAA 1B5HA 1EZPA 2ONSA 4IGRA 2DE2A 1PC3A 3K6VA 3RGYA 1FCKA 3UN6A 5FHOA 1D9YA 3K0VA 4G8NA 3Q28A 3VXCA 1B5JA 1JW1A 3IOUA 1LFIA 4POXA 2I6EA 2F8DA 3O28A 4BDOA 4XKRA 1ZJLA 3S9LC 2FA7A 4PFWA 2DWHA 3B6WA 3I5OA 3L6GA 2ZNTA 4PE5B 4H65A 4F31B 1DOTA 3MAMA 4G2ZA 1JQFA 1MY0A 5FHMA 2VGQA 1MXWA 1MQDA 3U93A 1R1NA 2Y7WA 2REJA 2DYXA 3T96B 2F7CA 3IL1B 1P1UA 5A5XA 3N26A 1FTOA 1B51A 1A55A 4MH5A 4PQJA 1H76A 3N94A 1GGGA 1B2HA 4IB2A 4YKIA 3IOVA 2OWSA 5CMKA 1NNFA 4X1DA 4U1OA 3TQLA 1MPCA 1FTMA 4NWCA 1LBCA 4BDLA 2PBWA 5CI5A 5A5XB 1QKBA 3FXRA 1OLCA 2XXPA 3MVYA 3A3UA 1UIVA 3RT6B 4P0GA 3PV0E 3LSXA 3SEXA 1I6AA 1MQHA 3TTMA 4ZE8A 3HHFA 3I3VA 1MDQA 2W7YA 4Q5TA 2UYEA 4OERA 1AMFA 1WODA 3O6HA 3KN3A 3M8UA 4K3FA 2ZXTA 2G29A 5B7DA 3G3KA 4DXCA 1BKAA 4KCCA 2O69A 4F39A 1N76A 3RNNA 4RPNA 3E4RA 1TFAA 3VLVA 5KZTA 4DXUA 4ZS9A 1OQGA 1IXCA 3H03A 1POY1 4RY1A 2HZLA 3OXNA 4ZEKA 3OEMA 2ZNSA 1O7TA 4H8JA 3TAJA 4YKJA 5BWJA 3IAZA 4HTGA 1UIUA 3CR9A 4FAJA 3KBRA 2DQVA 1RKMA 1MY1A 3K6UA 4ZEFA 4R6KA 2XX9A 3GLBA 1LAXA 4OFOA 4G68C 5CC2A 1LCTA 3O2AA 2XXUA 2I4BA 2Y84A 1LAGE 1MG1A 2XXIA 3FASA 2O7IA 3KJTA 4EQ7A 2UVIA 4X48A 3PPRA 1B5IA 3C31A 3O9PA 4YZZA 4RK2A 4KI0E 1MXXA 3JV9A 4U22A 1URDA 4MF3A 3TYHA 5I59A 2Z8EA 1JNFA 3TUSA 4GF8A 4NWDA 4N6PA 3H6UA 4ZEBA 4QRZA 2UYFA 1B3EA 2I3VA 5HBCA 2F36A 3KSXA 3K01A 3SKPA 1RYXA 1B58A 1Y1MA 3MPKA 5ITOA 2RKMA 5EYFA 3VVEA 3FVNA 3VVFA 4FECA 5I59B 3TTNA 3LC8A 4WEPA 5ISUA 2P2AA 4O3BA 3TODA 1VFDA 2XX8A 1TXFA 3IO4A 1FQCA 2RC8A 1D9VA 3DELB 3K1MA 3SESA 3SEWA 5B70A 2X26A 4DZ1A 4YMAA 1B1HA 1J1NA 3OSQA 2QMXA 4WXJA 3QUJA 3RLFE 4YMBA 1NKXA 2XHDA 2HEUA 2ZYNA 3OSRA 2ZYOA 5ELVA 3QIMA 2QS4A 2DXYA 3PPPA 1EU8A 2F34A 3CG1A 3TTLA 3KN7A 3OO9A 2X7PA 2F97A 1MM6A 4ZZEA 3K1NA 3QXMA 1XOCA 4NF6A 2VD2A 2QS3A 3PPOA 3VDFA 3G3JA 3H6WA 1B32A 1O64A 2F6PA 1ZTYA 3S4UA 5TP9A 3DP6A 2AYSA 3EF7A 1QVSA 1CB6A 4DCYA 4H6DA 4LQ2A 3ILTB 3CIJA 2HAVA 4YB5A 1JW5A 3UORA 3I6VA 3G3GA 1IIWA 3CFXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RC9A 1EZOA 4QFOA 2VP1A 2O84X 2Q74A 4H5GA 1FBEA 4U21A 1NUYA 4NF6B 5F24A 1XI6A 2D3IA 1NV0A 2PFZA 4H8IA 1CE2A 1F9BA 2CZLA 4MMPA 1PB7A 4RK9A 5TP9B 4AS5A 1QGXA 4F1YA 2Q89A 3FXUA 4RPOA 3UGWA 3FVGA 2DWJA 4EUOA 1NFTA 3G3IA 4JBZA 5BUUA 5K2XA 5AA2A 3E78A 3RT8A 3UP9A 2ZMBA 1B1XA 2WBBA 1SW4A 3H6VA 4R74A 5AA2D 3A3CA 1B7UA 2MKZA 4FJPA 3SERA 1VE4A 1B4ZA 2R6GE 3RYDA 3S9MC 1PB8A 4PTKA 3KBZA 5I58A 4GFRA 1D9QA 1L5TA 4R72A 3GBBA 4LONB 4X9TA 2OBGA 4XXUA 4LZ7A 2XXHA 3MUQA 4PFTA 1SBPA 3VE1B 5AA2B 3H3GA 4P9KA 1AH5A 4PAKA 1JVYA 1B46A 3ONMA 4C1TA 3OD7A 4RXLA 2I49A 5CMMA 4XKQA 3OEKA 4EXKA 2HPGA 1B3GA 4BDNA 4EF1A 2QS1A 3S9EA 2QVUA 3K00A 5I58B 1M5CA 1XT8A 2F7BA 2V3TA 1US4A 3KZGA 1FBPA 3KEIA 4GLIA 3PMWA 1P1NA 3FBPA 2UVGA 2ZZVA 3AXFA 5IZ3A 2QL3A 3CI8A 1BTJA 1M5FA 1IMAA 3VFJA 4DI4B 1VR5A 3DP8A 2R71A 4WEDA 2CEYA 1IQ7A 3B8BA 2DXRA 2XXVA 2CEXA 2YJPA 1M5DA 2RF1A 4N8YA 4Z7EA 3MPLA 2H4IA 1H3DA 4R6HA 5L8DA 3CRBA 3TCHA 5DVFA 3SEVA 2RC7A 1USYE 3ZKLA 2KQZA 4R6YA 4I9DA 3B6QA 5IZ3B 3PPQA 4FIMA 1K9YA 4PFYA 3N6TA 1H44A 3HSTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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