3W15C

Structure of peroxisomal targeting signal 2 (pts2) of saccharomyces cerevisiae 3-ketoacyl-coa thiolase in complex with pex7p and pex21p
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
389
structure length
389
Chain Sequence
GSMSQRLQSIKDHLVESRSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Peroxisomal targeting signal 2 receptor
publication title Crystal structure of peroxisomal targeting signal-2 bound to its receptor complex Pex7p-Pex21p
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Protein transport
total genus 135
structure length 389
sequence length 389
ec nomenclature ec 2.3.1.16: Acetyl-CoA C-acyltransferase.
pdb deposition date 2012-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3w15C00
4Z7EA 3GXAA 2NWJA 4UACA 3DP4A 4TOZA 1UTHA 4M1VA 2DWIA 4KFQA 2QPQA 3N26A 1OQGA 4IO7A 3V8XB 1QW0A 2Z23A 2QS3A 1N7XA 1MXXA 2IEEA 1CB6A 1N7WA 1NH8A 5CBRA 4WEDA 2VHAA 1A99A 1FQAA 4GLIA 4WXJA 2W7YA 3LSXA 1DTZA 2H4IA 1NFTA 1NNFA 4H6DA 4DIGA 2ABHA 4E0WA 1TFDA 2OJTA 3G3FA 4Q30B 1ZTYA 5TP9A 1B3FA 3VXBA 4H65A 5TPAA 4EF1A 2HQ0A 1OLAA 1SYHA 4IY5A 3O2AA 3RPWA 4YB5A 4OQOA 1VR5A 4JBZA 3O6GA 3PU5A 5FTHA 1B4ZA 3EF7A 3KOSA 4NF5B 4KQPA 2F78A 4F1VA 1DPEA 3DELB 4IB2A 4ONYA 1WVJA 5ISUA 3T9VA 4R73A 1ZBMA 3LSLA 3G7WA 3H03A 3CR9A 1JQFA 3IOTA 5I59B 5AA2A 5L9OA 5KZTA 3PUYE 5I2NA 1LBBA 3O29A 3ILUB 3MJNA 1DSNA 4TLLB 1D3KA 3LBSA 3QK6A 1LBCA 2A5SA 4X9TA 1Y4CA 3K2DA 4FORA 2XD3A 4MFIA 2HAUA 3KSXA 3KG2A 3PUVE 4ELPA 1IIWA 1N84A 1ANFA 4FE8A 4OHNA 1BLFA 3FXRA 4HCWA 4JB7A 3QUFA 4KYSA 4H67A 4OFJA 4TLMB 4QFLA 2DXYA 5JK4A 4KPTA 1ZJLA 2G29A 3T9HB 3MZ9A 1FQDA 2AIXA 3ZKLA 2VGQA 1MXUA 2XXHA 1F9BA 3IJXB 4ZDMA 1B6HA 5FHMA 1R6ZA 4DE8A 1AOVA 2DQVA 1P1QA 3MZ1A 1OQHA 5F1QA 4NWCA 4QFNA 3LR1A 3ONMA 3SERA 1OLCA 3FZVA 5H8HA 2DE2A 1NMUA 3E4RA 3VVFA 4X1BA 1XS5A 4PP0A 4RYAA 2ZYOA 4BDOA 2UVIA 3I3VA 2B3FA 3IJOB 4YICA 2UYFA 3ZSFA 1JNFA 2RF1A 4ND9A 3OO8A 3PPQA 4QFPA 3Q28A 3U92A 4R72A 2DWHA 5BUUA 4G2ZA 4FAJA 3MVZA 2O6AA 1MQDA 1US5A 3KN3A 3O97A 2HXWA 1B3LA 1SW5A 3EN3A 3T22A 3FJ7A 4U4XA 5HPQA 4H1XA 5H8FB 4ZS9A 1B46A 1M5BA 1SI0A 1L5TA 5CMBA 4GL0A 3O6HA 4H5GA 1RYXA 1B7HA 1I69A 1B5IA 1B3GA 1YAEA 1IQ7A 3FVKA 3L6HA 1Y4TA 1B58A 4RK2A 2GH9A 2VP1A 2I4BA 2LAOA 4H5FA 3VLWA 3S4UA 4XXUA 4IO6A 1MH4A 3IAZA 4KHZE 1BP5A 3CSBA 4I8CA 1LFGA 3GBBA 1JW5A 4GD5A 1OMPA 4YKKA 4NF8A 1LAHE 4LA9A 2HEUA 3T93B 5CMKA 3V83A 3Q26A 2DVZA 2F6GA 4R75A 4R9FA 1QULA 3RTWB 1GVCA 4ZECA 4X48A 3SEVA 4JSOA 3USDA 3QXMA 5CC2A 2F8DA 4NF6B 1QKBA 4DCXA 3MP8A 1IXHA 4Z0IA 4N07A 2AYSA 2Q9TA 3RT6B 4HCYA 4XIGQ 5H8SA 3KZGA 4JSDA 4ESWA 1DPPA 4OFLA 2I3WA 4FJPA 3S9EA 5I57B 2XX7A 1WODA 4MLQA 2FA7A 3KFMA 4FEDA 2M8CA 3UP9A 1SI1A 2RC7A 2E1SA 3TTLA 1MPBA 2Y7IA 3KGCA 4U21A 2A5TB 3CIJA 4R6KA 2Q89A 2RCAA 5I2KB 3K1MA 4F39A 1JW1A 3SEWA 3G3GA 4LZ8A 1B2HA 2I48A 4ZZEA 4ZE8A 4U2RA 3OD7A 4IY6A 4DDDA 3MBPA 1A7LA 4AB6A 1H43A 4O3AA 3VLVA 4O3BA 2DSFA 2ZMBA 2H9BA 2O7IA 3IR1A 2F34A 1NKXA 1WDNA 1LFHA 4POWA 5L8DA 3THIA 3KN7A 1NL5A 4GXSB 1MY0A 3K6WA 3HSTA 3K00A 5IKBA 1A8FA 3MQ9A 4I1DA 3GLBA 1M5CA 4MH5A 4EDPA 1UIVA 1AMFA 4TQUQ 2ZYMA 1ELJA 1A40A 1Z7NE 5TU0A 2XXYA 1B5HA 3I5OA 2REGA 3OO7A 4IO4A 2THIA 1MXZA 3HN0A 5H8NB 4EF2A 1VE4A 3TELA 3KOTA 4BDLA 1M5DA 1I6QA 3N6TA 4XKNA 1TT1A 4MF3A 1H76A 4F29A 3D4CA 4U22A 5HM4B 4R6HA 1N3WA 1ZLQA 1S7YA 1FTKA 1BIYA 4F3PA 1XHYA 2Q8JA 2DWJA 2UYEA 3H6TA 3K6VA 4KD5A 3UORA 1O64A 4OWDA 2I4CA 2XD2A 1USYE 3TQLA 3TTNA 4C1TA 1O7TA 2VOZA 3LC8A 2QS4A 3TMGA 2UXAA 4Q8RA 4G8NA 4QF9A 4F2QA 3FVOA 4NF5A 1Y3QA 2F35A 2Y84A 4FEBA 4G77A 4EQ7A 4OXVA 3OXNA 4F3BA 2Z8DA 2D3IA 2I0BA 1JETA 1VSOA 2FYIA 1I6BA 3B7DA 1H45A 4DCYA 4OYVA 1A55A 4MLVA 2Q2CA 3EPEA 1AIVA 3ECRA 1YTVA 2XXWA 5I59A 4RY1A 1MPCA 5AA1A 5IAIA 4YAHX 1QUKA 1OVTA 3TEPA 1JW4A 1US4A 4YKJA 5L9MA 4ESXA 3PUXE 2G93A 2F5XA 5I56A 2DYXA 2RC9A 1USYH 3U94A 4H8JA 1URGA 3OMBA 3MW0A 1IEJA 2OWSA 2Q88A 4PFWA 4GRKA 3E9XA 1B4HA 2R9JA 1FTLA 2V84A 3TCGA 1POY1 3VVDA 3HPIA 3TTMA 4DXUA 1QUJA 3RLFE 3FASA 5K2XA 4QSDA 3U8QA 1R9QA 3IORA 3SESA 1UTHB 1QKAA 1RKMA 3H4ZA 4QHQA 3GBAA 3ILTB 2XXXA 1POTA 2DOJA 4XKRA 2I6EA 3K02A 2H98A 1FQFA 2H25A 4RJZA 5EYFA 2E0SA 1B3EA 2XXTA 5L9SA 4GF8A 3V89B 3VDFA 1EU8A 4ZEIA 2V3TA 1MY2A 3ODBA 3H6VA 3EHSA 2CZLA 3KJTA 3LUYA 4F31B 3BBRA 2B65A 4X1DA 4IGRA 5DT6A 1A54A 4QSEA 3F11A 4UA8A 1ZU0A 3DP6A 1FQCA 4JWXA 3U1OA 4PE5B 3CFZA 1T0KA 1MDP1 1LCTA 3KN8A 1Y1MA 3QUJA 4BLAA 3W9VA 4LP2B 3IL1B 4WEPA 3K6XA 3C32A 1URDA 5LOMA 3PUWE 2ANJA 2DP8A 3JV9A 4NEDA 2ESNA 4IO5A 1XOCA 3M3KA 5B7DA 4DZ1A 4RPOA 3KBRA 3CFLA 2IA4A 3FV1A 2QSXA 1LSTA 4DXCA 5EHSA 4ZZAA 4ZEDA 3BFUA 3TCHA 5AA2B 1MRPA 3IK6B 1MXVA 4XKPA 1O63A 4R2FA 3HV1A 1PC3A 5AA4B 3PMVA 3OO9A 1IZ1A 5CM6A 3VVEA 4XTCQ 1Z7ME 1N0TA 5CBSA 2ONKE 2AL4A 3Q25A 2R6GE 2DWAA 2X7QA 4KI0E 1MY3A 3UN6A 2OCUA 4N6PA 3MPLA 3VE1B 4ELQA 1FQEA 4Q5TA 1MXYA 1B51A 4R2BA 2KLFA 4NF6A 2AL5A 4C1UA 3U93A 4G8MA 3L6GA 4QRZA 1Y3NA 2QJEA 3RT8A 5ELVA 4PFTA 3IX1A 5ITPA 2V93A 5I57A 5KDTB 3D4GA 1FQBA 3PV0E 3A3UA 4PETA 3PMXA 1ZKBA 1B1HA 2Y7KA 2NVUB 4FIMA 3PPRA 1Q1KA 4LQ5A 2O1LA 4OERA 2Q2AA 5ICQA 1GR2A 3UK4A 3SDFA 1UTBA 3PPOA 4GVOA 4IO2A 2A5TA 4PQJA 3IOUA 5M2VA 1DTGA 1OIBA 1P99A 2DS9A 4RK9A 3DM0A 3K4UA 3EQ1A 4KCDA 1PBQA 5JTYB 1P1NA 1SBPA 1PBPA 2UVHA 2ZYNA 5FHNA 3WAEA 1MQJA 1RYOA 3AXFA 4F3GA 3MC2A 3PD9A 3ZS6A 1EZPA 3E13X 3G3HA 4F18A 5A5XB 3FD3A 3K01A 1YCJA 4U1ZA 2X7PA 2QMXA 2I49A 4RXLA 4H0WA 1LCFA 1N3XA 4F19A 2F7BA 3RY3A 3S9NC 5BWJA 3ZKKA 3CVGA 3IB1A 5AA3A 2Y7RA 4LUBA 1PEBA 4OFOA 3IO4A 3MVXA 3C9HA 4XKQA 2F97A 3CSGA 1Y20A 1BKAA 3H3GA 4NTLA 5H8NA 4G68A 1MY4A 2HZKA 1Y9UA 1MM7A 2Z22A 4QFOA 4C0RA 2DXRA 2ZNSA 3K1PA 4JXIA 1XVYA 4YZZA 5DVIA 2VD3A 2PBWA 2CMOA 3S2VA 3DP8A 4P0GA 1PB9A 1GGGA 2GRVA 3RQTA 4KR5A 4P11A 4LONB 1JVXA 3FXUA 2YPNA 3C35A 3P7IA 2PT1A 4R6YA 2I58A 1JVYA 4ELOA 1M5EA 2HAVA 1ZIUA 4YMAA 4PFYA 3SEUA 5I58B 3O66A 3PMWA 4KYDA 4BDRA 1XVXA 3MVWA 3RUMA 1NNPA 1LAXA 2QS1A 1TWYA 3BKIB 4NF4B 5ITOA 5AE4A 1P1WA 3HHFA 3Q27A 5DVFA 3HCQA 1PDAA 1B3HA 3RNNA 1LFIA 4OENA 3PUZE 1HSLA 4F22A 1B05A 3SEXA 3OEMA 3TFLA 4F1YA 3C36A 4O3CA 4KCCA 3OSRA 4EUOA 4R9GA 1SQYA 3FUZA 4ZEFA 1LGBC 1D9VA 2XHDA 4HS7A 4DXBA 1XC1A 2O68A 3PGFA 3TTKA 4OESA 1MM6A 5DTBA 2VD2A 5FHOA 1S50A 2ONRA 2OK2A 3IB2A 4LATA 4P0IA 2P1SA 1P1OA 3LSWA 1FW0A 5I84A 1IITA 3S9MC 4IO3A 2R71A 2QL3A 2REJA 4HTGA 2GHAA 1R1NA 2V25A 2UVGA 2V3QA 2O7UA 1MQHA 2X26A 3FJGA 2XX9A 4POXA 4YMBA 1TFAA 1B7ZA 3MP1A 5H8QB 1SDXA 3G3IA 3TODA 1S9TA 3N5LA 3E3KA 4MBPA 3CRBA 1BTJA 4LVQA 3C33A 1Y3PA 1IUDA 3V5AA 2ZYKA 3RGYA 1VFDA 4G8HA 1LB8A 3FV2A 2ONSA 5KCJB 3H7MA 4RNSA 3TZAA 3N6UA 3C34A 1P1UA 1NH7A 5DEXB 1H44A 1B7UA 3I6VA 4YB7A 2O51A 3A3CA 2XX8A 1B40A 3RN8A 3M8UA 4EXLA 5CRYA 4QFKA 3MPKA 1B0HA 1FTMA 3QYTA 3OOAA 2OLBA 1UQWA 1N04A 1Y1ZA 3FXQA 4M4GA 2XXIA 2YJPA 1URSA 2OBGA 1J1NA 3IOWA 4FECA 4ZEKA 4OETA 1CE2A 4ISUA 2O69A 5AA4A 3OEKA 4KYEA 4LQ2A 4YU0A 3TPAA 3W9WA 2RINA 2RKMA 5TP9B 4OZ9A 4JWOA 3K6UA 5I56B 3QIMA 5TPAB 1MY1A 4AQ4A 1JEUA 1QUIA 1VFEA 2PX1A 3O6IA 4LZ5A 4G4PA 5CMCA 4GQOA 4NMYA 2QRYA 3BFTA 1SVXB 2DE4A 3T9UA 1OVBA 3SKPA 1LLSA 3EHTA 4IGTA 4WKMA 5H8FA 1IXIA 1R9LA 3SEYA 5KDTA 2HZLA 3MAMA 3B6QA 3B6WA 1MQGA 1PB8A 5B70A 1SYIA 1MH3A 4THIA 2OZZA 4OEVA 3TYHA 4JDFA 2Z8EA 5I2NB 3FVNA 3PD8A 4LZ7A 2O84X 5DVJA 2ALUA 1II5A 3OSQA 3MZBA 4N13A 5FTIA 3VLUA 1DOTA 1AH5A 3R7XA 1B52A 3OO6A 1LAGE 2F7CA 3S9LC 4NWDA 1GTKA 2FNCA 2B3BA 5K2YA 3FATA 4YB6A 5JTYA 3VFJA 3C31A 3TQWA 3FJMA 3EHUA 4OMBA 3IO6A 2BJJX 3K0VA 2DVCA 2O1MA 1ZMGA 1EZ9A 3PPNA 2ZNUA 2Y7WA 1IXGA 3TTRA 4GOTA 2F7AA 2GFEA 4ZE9A 4GFRA 3TAJA 3W15C 5A5XA 3UIFA 1H3DA 2P0SA 2XXVA 4U1OA 3DLNA 2XXQA 1I6AA 3PPPA 1TXFA 4GL8A 1EH3A 1A8EA 1N76A 2XXUA 4RPNA 1HSEA 1XT8A 2I0CA 3CI8A 3MP6A 3QAXA 3N94A 3M3LA 3T96B 2Z8FA 3B6TA 3R6UA 1QVSA 2ZNTA 4I62A 1B32A 1MDQA 4GXAA 3H6UA 5ICTA 5DYHA 1FTOA 1YPNA 4EQBA 3R26A 5H8HB 3K1NA 5I2KA 1D9YA 4RA1A 2P2AA 1NNTA 2GHBA 4ELRA 1D4NA 1ATGA 1M5FA 1B5JA 1SD3A 2QS2A 1MQIA 3CG3A 3IB0A 2XXRA 4K3FA 3UGWA 4H8IA 1MS7A 2YLNA 3VXCA 4AB5A 3HO7A 4L17A 4U23A 3JYRA 3JZJA 4QSCA 1HSJA 4GIZA 3TDJA 3MUQA 2H5YA 1DMBA 2HCAA 4PFUA 4U4SA 4F3SA 3FIRA 1FTJA 3QSLA 2ZXTA 1JEVA 3MVYA 5CI5A 4GWOA 3T66A 1LAFE 3CFXA 4E0XA 5I58A 3KJ7A 1IXCA 1SW1A 1MXWA 5CMMA 2OWTA 1UIUA 4ZEBA 1B1XA 4NF4A 3WAFA 4NE4A 3Q29A 2F6PA 2RCBA 1UTBB 2PYYA 3LSFB 2V3UA 3MWBA 4EXKA 4NF8B 4YKIA 5AA2D 5F7VA 1FCKA 2RC8A 3KEIA 2D21A 3FVGA 4DLDA 1B0LA 1QJMA 4F2OA 2H99A 3U72A 4EQ9A 3O9PA 1EZOA 3TUSA 2F36A 5HBCA 3TCFA 1NNKA 3RTFB 4BDMA 3M3FA 3C4MA 3TKDA 3KSJA 4BDNA 2Y7PA 1LB9A 3A09A 3HHGA 3VV5A 4JWYA 1SW4A 2HFBA 1AL3A 4G68C 3UA8A 2D5WA 4HW8A 4I9DA 5J1DA 3G3KA 1SW2A 2UVJA 3H6WA 4ECFA 2PMSA 5JEIA 2I3VA 1MG1A 2XXPA 2PT2A 4FATA 3IOVA 1GV8A 4G68B 2NXOA 2WKYA 3OELA 3CG1A 4BDQA 5H8QA 3FGSA 4YKPA 3H06B 1PB7A 4Q0CA 1B9JA 2DE3A 2QMWA 3GZGA 4F1UA 4OVJA 1KWHA 5KCJA 3T9XB 3O28A 3G3JA 4OTEA 1MPDA 3OENA 1Q35A 5DEXA 5EHMA 4R74A 2NOOA 2PVUA 2NUVA 4OEUA 3SETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Z7EA 3GXAA 2NWJA 4UACA 3DP4A 4TOZA 2Y5LA 1UTHA 4M1VA 2DWIA 4KFQA 2QPQA 3N26A 1OQGA 1IMDA 4IO7A 3V8XB 1QW0A 1FBEA 2Z23A 2QS3A 1N7XA 3KC0A 1FJ9A 1MXXA 2IEEA 1CB6A 1N7WA 4GWSA 4GWYA 1G0HA 1NV5A 1NH8A 5CBRA 4WEDA 2VHAA 1A99A 1FQAA 4GLIA 4WXJA 2W7YA 3LSXA 1DTZA 3ISPA 2H4IA 5EQ7A 4NN3A 1NFTA 1NNFA 4H6DA 5IM2A 4DIGA 2ABHA 4E0WA 1TFDA 2OJTA 4OVSA 3G3FA 4Q30B 1ZTYA 5TP9A 1B3FA 3VXBA 4H65A 5TPAA 4EF1A 2HQ0A 1OLAA 1SYHA 4IY5A 3O2AA 3RPWA 4YB5A 4OQOA 1VR5A 4JBZA 3O6GA 3PU5A 5FTHA 1B4ZA 3EF7A 3KOSA 4NF5B 4KQPA 2F78A 4F1VA 1DPEA 3DELB 4MJOA 4IB2A 4ONYA 1WVJA 5ISUA 3T9VA 4R73A 1ZBMA 3LSLA 3G7WA 3H03A 3CR9A 1VDWA 4P1EA 1JQFA 5ET7A 3IOTA 3T0JA 2FBPA 5I59B 5AA2A 5L9OA 5KZTA 1FBGA 1DK4A 3PUYE 5I2NA 1LBBA 3O29A 3ILUB 3MJNA 1DSNA 4TLLB 1D3KA 4NF0A 3LBSA 3QK6A 1LBCA 2A5SA 4X9TA 3B8BA 1Y4CA 3K2DA 4FORA 3E78A 2XD3A 4MFIA 3E79A 1Q9DA 4MMPA 1NUYA 2HAUA 2MKZA 3MSTA 3KSXA 3KG2A 4OVTA 3PUVE 4ELPA 1IIWA 1N84A 4GWWA 1ANFA 4FE8A 4OHNA 2VT5A 1BLFA 3FXRA 4HCWA 4JB7A 3QUFA 4KYSA 4H67A 4OFJA 4TLMB 4QFLA 2DXYA 4PE3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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