3W15C

Structure of peroxisomal targeting signal 2 (pts2) of saccharomyces cerevisiae 3-ketoacyl-coa thiolase in complex with pex7p and pex21p
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
389
structure length
389
Chain Sequence
GSMSQRLQSIKDHLVESRSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of peroxisomal targeting signal-2 bound to its receptor complex Pex7p-Pex21p
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxisomal targeting signal 2 receptor
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Protein transport
total genus 135
structure length 389
sequence length 389
ec nomenclature ec 2.3.1.16: Acetyl-CoA C-acyltransferase.
pdb deposition date 2012-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3w15C00
2HAUA 2I58A 4F18A 3FASA 5KCJB 3C32A 3FVKA 2PT1A 1FTJA 2VHAA 3PD9A 3GBBA 3VFJA 3K2DA 3OO6A 3CVGA 4GOTA 2DP8A 2H4IA 3CSBA 5ISUA 1FQDA 2ZYMA 1Y3NA 3EHUA 3H06B 3LR1A 3O6IA 4U22A 3N5LA 3QIMA 4FE8A 3D4CA 5JTYB 3IORA 1POY1 1MY2A 3FIRA 3ILUB 3N94A 5F7VA 3TAJA 4Z7EA 2XX7A 3FATA 3TTMA 1USYE 1VSOA 4U4XA 2HEUA 1XHYA 3R26A 3SEYA 2RCBA 1JW5A 3LUYA 4RPNA 1QULA 3U1OA 2HZLA 3MVWA 1B5IA 3G3HA 1URGA 3OO7A 4YZZA 4GVOA 1M5EA 4O3CA 4R74A 3THIA 3N26A 2RKMA 5CBSA 1B4HA 5I56A 4HS7A 5ITPA 4ZEDA 4FJPA 1H44A 4EQ7A 2XD2A 4F3SA 2UYEA 2IEEA 4PFTA 3LC8A 4OWDA 2F34A 4BDMA 2IA4A 2ONSA 1MXYA 2X7PA 2UVJA 5I59A 3O6HA 3U92A 4G8NA 1L5TA 4MLVA 3G7WA 5BWJA 1ZKBA 2I4BA 3IB2A 2VGQA 5J1DA 4OMBA 4IO6A 5DEXB 2A5TB 4H8IA 2DE3A 3K01A 2KLFA 3CFLA 1ZIUA 4KHZE 3ZSFA 4X9TA 1LCTA 3K6UA 5I57B 3QUFA 3TKDA 3TCFA 2F36A 4JSOA 2XHDA 1B7ZA 5CMMA 2F97A 2H98A 4M1VA 1TFDA 3FUZA 1QKAA 1JEUA 4TLMB 1ANFA 4Z0IA 3MZ9A 4XKNA 1LLSA 3MP6A 4XKPA 2F35A 2M8CA 1JQFA 3K00A 4U21A 2O68A 1Q35A 3C35A 4POWA 1Z7NE 3SEVA 3PUWE 2Y7RA 3T9HB 4NF4A 4O3AA 3FJMA 1FQBA 4H6DA 1POTA 4YB5A 4GF8A 4HTGA 2THIA 3TUSA 2Z8DA 5A5XB 1J1NA 2F6GA 2PYYA 3MP1A 3N6TA 3ZS6A 3K6XA 4X1BA 4F22A 4R2FA 2YPNA 1MPBA 4G68A 1P1WA 3PU5A 2CMOA 2FNCA 1B5JA 3S9EA 3E3KA 3V89B 3DLNA 3VLVA 3SETA 4BDRA 3RLFE 3ECRA 2VD3A 3OEKA 2GFEA 3G3GA 1QW0A 4H5FA 3FXUA 5AA4A 4KCDA 1KWHA 3TMGA 2DSFA 1HSLA 3QSLA 3CIJA 3PPRA 1UTHB 1TT1A 1LGBC 3H6VA 3IJXB 1IXIA 4RA1A 3RGYA 4KFQA 2Q88A 2D5WA 1EZPA 3O66A 4U23A 1FTOA 4OFJA 4YB6A 1LFGA 1LAFE 3KBRA 4WXJA 4OTEA 3OENA 4XTCQ 4LQ5A 5I58B 5FHNA 2DWJA 1SD3A 2YLNA 2RINA 4LQ2A 1RYOA 2H99A 4R6HA 5KDTA 4NF6B 4EF2A 3JV9A 2PBWA 5H8NA 1MPDA 4EDPA 4DZ1A 3EQ1A 3PUXE 4Q0CA 2DE4A 1OLAA 1GR2A 4GWOA 4QFPA 5DVJA 2XD3A 4U2RA 2QSXA 1PDAA 3CG1A 3CFZA 1WODA 1O63A 2RC9A 4F39A 4BDNA 2DYXA 2HCAA 3MP8A 4ESXA 1DSNA 1LAGE 2OBGA 4I8CA 4RPOA 1NNPA 4IGTA 3OSRA 1QUKA 3VLWA 4HW8A 4YKPA 1JVYA 2ZNUA 3PPQA 1XT8A 4RNSA 4LP2B 1B3HA 5CI5A 5ELVA 4EQBA 4QFKA 3S9LC 2Z8FA 1NNFA 4EUOA 3FXRA 4TQUQ 1LB8A 4C1UA 4JB7A 1AMFA 3VVFA 2R71A 3A3UA 2VD2A 2LAOA 1MDP1 3JYRA 3A3CA 3IO4A 3OO9A 2V93A 4DIGA 2H5YA 4F1UA 4DXCA 3E13X 1IUDA 3TZAA 4PFYA 4AB6A 4I62A 2G93A 4NF8B 3O9PA 3D4GA 1O64A 3A09A 1AH5A 3T96B 2ZYOA 1O7TA 5IAIA 2P2AA 1JNFA 1EH3A 1LB9A 3SEXA 1BLFA 3V5AA 4PETA 4JDFA 3VLUA 4MH5A 5B7DA 1MDQA 5H8HA 3FV2A 1CB6A 1PC3A 3KJTA 4H1XA 2O69A 4JBZA 1OQHA 1BP5A 1ZU0A 1A54A 3HV1A 2R9JA 2XXYA 2ZNSA 4L17A 3T22A 2W7YA 2UYFA 4XIGQ 3P7IA 2O1MA 5CRYA 1ZJLA 4AB5A 2I48A 4U1OA 1B3GA 4XXUA 4EXLA 5I59B 2Y7WA 2QS3A 1A40A 5ITOA 4FAJA 1OVBA 2VP1A 1VE4A 1QVSA 1MQIA 2QJEA 2X26A 4WEPA 2FYIA 3L6HA 4PFWA 4MF3A 3C34A 3VXCA 2UXAA 3PD8A 3UN6A 1LAHE 3MW0A 5I2NA 2REGA 4H5GA 4H65A 5CMCA 1ZLQA 3ONMA 4E0XA 2RCAA 1IXGA 3TTNA 1B52A 1LBCA 5DT6A 2F7AA 2OZZA 1IQ7A 4F2OA 3SESA 4FECA 1P99A 1URDA 4DLDA 3U93A 1N0TA 1Y1ZA 5AA2B 2I3WA 3UGWA 4NF4B 3TTLA 4C0RA 1NNKA 4XKQA 3G3IA 1A99A 1B46A 2ANJA 3V8XB 4N07A 1IXCA 3HN0A 4F1VA 5TP9A 1D3KA 3K1NA 4PQJA 4OFOA 4LZ8A 1NFTA 4Q30B 2P1SA 3OO8A 1NH7A 1DTZA 1ZBMA 4OESA 5DTBA 3UP9A 3BFUA 2NUVA 5FHMA 4G68B 4OFLA 2F6PA 4EXKA 4R75A 1RYXA 3U8QA 1MXXA 3C31A 2RC7A 2AIXA 1B7UA 1HSEA 2F7BA 3OELA 4IO7A 4Q5TA 5CMKA 1AOVA 1Y4CA 1UTBA 4QSCA 2F8DA 1FCKA 1PBPA 1MM6A 5AA4B 4ELOA 1GTKA 1UIUA 4ESWA 3HSTA 3DP6A 1YTVA 1QUJA 3R7XA 4P0IA 4HCWA 3KSJA 4F2QA 4OERA 1US5A 4ZE8A 2F78A 3K02A 1MY1A 4EQ9A 1UIVA 4ZEKA 4TLLB 1R9LA 3VV5A 1BTJA 4XKRA 1GV8A 2V84A 3G3KA 2PT2A 5KDTB 4KD5A 3K4UA 3UORA 4QFOA 1MY3A 4QRZA 3TTKA 1GGGA 5H8NB 2Q89A 4R9GA 5ICTA 1Y4TA 1VR5A 2VOZA 1QUIA 3Q29A 4F3GA 4M4GA 3EHTA 2ONKE 3Q25A 3KOSA 3C4MA 1D4NA 1SYIA 2D3IA 4OETA 1D9YA 3CG3A 3UIFA 3IOWA 3SERA 1QJMA 3IK6B 3H3GA 5LOMA 4IGRA 1IZ1A 3MAMA 1N3XA 3OXNA 2ESNA 1R9QA 4F19A 3MZ1A 3QK6A 1AL3A 1Y20A 3USDA 3MBPA 2B65A 3IB1A 1Y1MA 4NF5A 3QYTA 1II5A 2XXXA 3FGSA 5AE4A 3K0VA 1IITA 1LFHA 1SW4A 2QMWA 1MS7A 3RT8A 3K6VA 5H8FA 2WKYA 3R6UA 5JTYA 4BDQA 2AYSA 4PFUA 4THIA 3L6GA 4IO4A 1S9TA 3EPEA 4FIMA 3G3FA 2Y7KA 1TXFA 1OMPA 4N6PA 3UA8A 1FW0A 1B51A 4IO5A 1XOCA 1MXUA 4ZE9A 2XXTA 4LVQA 3MVYA 2UVHA 4IB2A 4F3BA 1B05A 3TEPA 3O97A 5H8HB 4ND9A 3FJGA 4IY5A 3B6TA 3DM0A 3O29A 5EHSA 3TCGA 4ZEFA 4P11A 3CSGA 3RN8A 1USYH 3S9NC 1EU8A 4R9FA 3BBRA 3K1PA 2RC8A 5IKBA 3KZGA 3I6VA 3PPNA 3VVEA 2QRYA 1SW5A 4KQPA 2ALUA 3HHFA 1WVJA 3TELA 1A55A 4YKIA 4R2BA 2ZYKA 3T9XB 3EF7A 4JWXA 2V3QA 1M5BA 3SEWA 1NKXA 1YAEA 2CZLA 2DXYA 1I69A 2XXQA 1D9VA 5CM6A 2QPQA 1MY0A 5H8SA 5I2NB 3M3KA 1B6HA 2DWAA 1MH4A 4LZ5A 5TPAA 2I0CA 3CR9A 4GLIA 5I57A 2GHBA 2NWJA 1ZTYA 2XXVA 1TFAA 3W9WA 3O2AA 3FV1A 3TQWA 2B3BA 3N6UA 3U72A 3TODA 2O1LA 3Q26A 1B58A 2Z23A 1PEBA 4KPTA 3PMVA 3MJNA 2V3TA 4X48A 3RQTA 4O3BA 3HCQA 1B1XA 5TP9B 4OZ9A 4YMBA 4QSDA 4R72A 4RY1A 1SW1A 1VFDA 3T66A 3MUQA 2HFBA 2V3UA 3EHSA 3M3LA 3MPKA 3F11A 2V25A 3H6UA 4YICA 4KYSA 5CC2A 3IO6A 4QFNA 4FEDA 1XC1A 1DPEA 3DP4A 5L9MA 4ISUA 1FTKA 3LBSA 4LZ7A 2OWTA 2OJTA 4U4SA 2QS1A 4QFLA 4OENA 2QMXA 4LA9A 1UTBB 2Q2CA 2Q9TA 4KYDA 5EHMA 4ZEIA 3GLBA 3IAZA 2RF1A 1LCFA 3DELB 3HPIA 2HQ0A 4IY6A 5M2VA 4IO3A 3PMWA 4RXLA 4FATA 1SVXB 5TU0A 1P1UA 3OOAA 5I56B 2XXHA 4N13A 5H8QA 3FVOA 3KGCA 3KFMA 1SI1A 1LBBA 3FVNA 5CMBA 3PMXA 4G77A 1XS5A 1YPNA 1MQGA 1N3WA 3IX1A 1MY4A 2Z8EA 5I84A 1LSTA 3FVGA 3CRBA 4KR5A 3S9MC 1MQJA 1XVYA 1R1NA 1OQGA 3PV0E 1Y9UA 3PGFA 2ONRA 2O84X 3ILTB 1A7LA 4P0GA 4ELRA 2O51A 3T9VA 4DCXA 5K2XA 3KN7A 2OCUA 4NWDA 3MVXA 1MXWA 1B2HA 1ELJA 4FEBA 5HBCA 1PB8A 2DXRA 4BDLA 5DYHA 4K3FA 2Q8JA 3VE1B 1DOTA 3SKPA 4DCYA 4I9DA 3O6GA 3IR1A 1OIBA 1B0HA 3QUJA 3ODBA 3RUMA 4JWOA 3GXAA 4YB7A 1US4A 3HHGA 4LATA 1B3LA 1FQCA 1FQAA 4R6KA 3PUVE 1DTGA 4ELQA 1UQWA 4RJZA 4DXBA 1SQYA 1JETA 4NF5B 3TCHA 4I1DA 2ZNTA 5KZTA 2Q2AA 2P0SA 4JSDA 1GVCA 1BIYA 1H76A 4ZZAA 1OVTA 4KI0E 1H45A 1N7XA 5H8FB 4OXVA 3QAXA 1AIVA 2OWSA 3KOTA 4MFIA 2ZXTA 4X1DA 3B6QA 1EZ9A 4KCCA 3DP8A 2Y7PA 5CBRA 4DDDA 1NH8A 2Y84A 2DOJA 4WKMA 5FHOA 3Q28A 3E4RA 2F5XA 3OMBA 1MM7A 1P1QA 3UK4A 4EF1A 1N76A 4NF8A 2QS4A 1B5HA 3S4UA 4G4PA 3ZKKA 5I2KA 4LUBA 3TQLA 3OD7A 3TTRA 1I6QA 4PP0A 2ABHA 3B7DA 2HXWA 1PBQA 1F9BA 3IJOB 3MZBA 1JW4A 3KSXA 2B3FA 3TDJA 1Q1KA 2O7UA 2DVZA 1S50A 4UACA 4YKJA 3K1MA 4GXAA 5B70A 3H03A 3H4ZA 4QF9A 4AQ4A 2QS2A 1YCJA 1SW2A 3OSQA 1H43A 2OK2A 4YU0A 4ECFA 1OLCA 3VXBA 5TPAB 1M5DA 1N7WA 3CFXA 1TWYA 3BFTA 1A8EA 3IOUA 5FTIA 1SBPA 3I5OA 4ELPA 4ZECA 4BDOA 2O7IA 1MPCA 1T0KA 5KCJA 4F1YA 4KYEA 3FZVA 4NEDA 3CI8A 1DMBA 4LONB 3MVZA 1LAXA 5AA2A 2G29A 3M8UA 1BKAA 2PMSA 1QKBA 1WDNA 3B6WA 3RPWA 1A8FA 3IL1B 3RTWB 2Z22A 4YKKA 5AA2D 4DE8A 2GRVA 1SDXA 4YMAA 4NTLA 1B40A 3KEIA 2FA7A 1B3EA 3IB0A 1HSJA 2XX8A 1I6AA 4H8JA 4F31B 3WAFA 4BLAA 3MC2A 2GH9A 3SDFA 4MLQA 3VVDA 4RK2A 3O28A 4DXUA 3K6WA 4GQOA 5EYFA 1EZOA 4ZS9A 1Y3QA 2Y7IA 1N84A 1JW1A 4R73A 1URSA 4Q8RA 5JK4A 4OHNA 1R6ZA 2DS9A 2XXUA 3MQ9A 3H6TA 4PE5B 5H8QB 1I6BA 1SYHA 1N04A 4F3PA 3KN8A 1S7YA 4RK9A 3QXMA 1MRPA 3Q27A 3H6WA 2I49A 2XXPA 3LSXA 3MWBA 1H3DA 4OYVA 4GXSB 1P1OA 4FORA 4ZDMA 1FQEA 1JEVA 1XVXA 5K2YA 3PUZE 3T93B 2REJA 1MQHA 4HCYA 2I6EA 2A5SA 2ZYNA 3MPLA 4OEUA 3KN3A 2O6AA 4OEVA 2HAVA 3BKIB 4GD5A 2XX9A 3VDFA 1FQFA 2GHAA 5DEXA 2DWIA 2A5TA 2F7CA 3E9XA 4G8MA 4QSEA 4TOZA 4IO2A 4RYAA 3WAEA 4ZEBA 3GBAA 5DVIA 3S2VA 2AL4A 5HM4B 4GL8A 5F1QA 3I3VA 4G2ZA 2YJPA 2NOOA 1IEJA 4GRKA 2OLBA 4OQOA 3RY3A 1NMUA 2I3VA 1NNTA 4C1TA 3GZGA 2D21A 5DVFA 1PB7A 3JZJA 2I0BA 2UVIA 3ZKLA 4JXIA 4MBPA 4NE4A 1B4ZA 3TFLA 2DVCA 4GIZA 4R6YA 2QL3A 5FTHA 1B9JA 5A5XA 2XXWA 4ZZEA 3RTFB 3C33A 3AXFA 4JWYA 1PB9A 2NVUB 3LSWA 3T9UA 2ZMBA 4GL0A 2XXRA 1M5FA 5L9SA 1M5CA 4NWCA 1ATGA 2E0SA 1LFIA 1FTLA 2NXOA 3M3FA 1B1HA 4U1ZA 3U94A 5AA3A 4POXA 2HZKA 3HO7A 5L9OA 1CE2A 3OEMA 2UVGA 1B32A 4E0WA 1ZMGA 1B7HA 2BJJX 2PVUA 3W9VA 4G68C 3SEUA 4WEDA 3LSFB 4QHQA 5I2KB 3KJ7A 1MXZA 2PX1A 3EN3A 3H7MA 1FTMA 2R6GE 1B3FA 1MG1A 4H0WA 1MH3A 1P1NA 1UTHA 1MXVA 4H67A 5HPQA 3RT6B 4ONYA 3W15C 2AL5A 5BUUA 4GFRA 2H9BA 3RNNA 2E1SA 1MQDA 4NMYA 3PUYE 4UA8A 4OVJA 4F29A 1JVXA 5AA1A 4YAHX 1Z7ME 1NL5A 5I58A 1RKMA 3LSLA 5JEIA 1IIWA 3IOVA 2H25A 4G8HA 3TPAA 2X7QA 3FJ7A 3G3JA 1Y3PA 1DPPA 3PPOA 4NF6A 2I4CA 3KG2A 3V83A 1VFEA 3FD3A 3C36A 5L8DA 1B0LA 2DWHA 2DQVA 3TYHA 1IXHA 2XXIA 1SI0A 3IOTA 3PPPA 2DE2A 5ICQA 3FXQA 3C9HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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