3W15C

Structure of peroxisomal targeting signal 2 (pts2) of saccharomyces cerevisiae 3-ketoacyl-coa thiolase in complex with pex7p and pex21p
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
389
structure length
389
Chain Sequence
GSMSQRLQSIKDHLVESRSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of peroxisomal targeting signal-2 bound to its receptor complex Pex7p-Pex21p
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Protein transport
molecule keywords Peroxisomal targeting signal 2 receptor
total genus 135
structure length 389
sequence length 389
ec nomenclature ec 2.3.1.16: Acetyl-CoA C-acyltransferase.
pdb deposition date 2012-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3w15C00
1D3KA 1MQGA 1RYXA 2OWTA 3IB1A 4KFQA 2RINA 1YPNA 1NH8A 2P0SA 3EHUA 1JETA 3IAZA 3IOWA 4FJPA 3V8XB 4EQ9A 5KDTA 3N94A 2DWJA 1I6BA 2Y7IA 2A5TB 4N07A 1B4HA 3E13X 1LBCA 4ISUA 4JWOA 1BP5A 1SYIA 2H9BA 3FZVA 3IB0A 4GF8A 5ICQA 2D5WA 5L9OA 2R6GE 1FW0A 3TAJA 3SEWA 4H6DA 1DTGA 4NF4A 5A5XA 1MPBA 1PB8A 1URDA 1VFEA 2XXXA 3FJMA 2G93A 4U2RA 4ELPA 5I2NA 4IGRA 2ZXTA 4XXUA 3V89B 3SEVA 1URSA 3RT8A 1R6ZA 4GVOA 3A09A 3Q27A 2DE3A 3H03A 1QUKA 2HZKA 3F11A 3S9MC 4IO6A 3ODBA 1NL5A 3GZGA 4QFOA 5CMCA 3T93B 5CC2A 2PX1A 2FA7A 3FASA 1M5BA 5KDTB 3PUXE 1A55A 3OO6A 1POTA 1P1OA 2ZYMA 4I62A 2DQVA 2F6PA 1H44A 3LSXA 3PGFA 3Q28A 1MPCA 4UACA 3TKDA 4F3GA 4YB5A 1O7TA 2O51A 3PPNA 3DP8A 1B7ZA 3U93A 3SEYA 3A3CA 3EPEA 4AB6A 1GGGA 4R74A 3KFMA 1MDQA 4C0RA 1AOVA 2VD3A 1LFIA 3IOUA 1SW1A 2RF1A 3OOAA 1XVXA 4GOTA 2NVUB 5HM4B 5LOMA 3U94A 3ZS6A 1N04A 4FATA 1ZKBA 4OFJA 3UN6A 2OK2A 3W9VA 1TFAA 2Z22A 3G3GA 3H6VA 4JBZA 5I57B 3GLBA 4G68A 4BDLA 1EH3A 2ALUA 2PT1A 4MH5A 3T9HB 4F1UA 3C35A 4FAJA 3U8QA 2ZNSA 1EZOA 1P1WA 3CFXA 3PV0E 4KYDA 5CM6A 5A5XB 2PT2A 5K2XA 1US4A 2DS9A 3R6UA 4GRKA 1MY0A 3B6QA 5I58B 4DE8A 1LB9A 1Z7NE 3PPOA 2ZYNA 1LCTA 1HSEA 2A5TA 2O1MA 1B58A 4OESA 5I2KB 4ESXA 4PFTA 3MJNA 1T0KA 5I58A 3DM0A 4YB6A 4GD5A 1OLAA 3TQLA 4IB2A 5ISUA 4ZEFA 4ZEIA 1NNFA 1ZU0A 3CFZA 4JWYA 1N0TA 4N6PA 4JDFA 2VGQA 3MZBA 3MAMA 1USYH 4TLLB 1EU8A 3LR1A 3B7DA 4GQOA 1LFGA 3W9WA 2XXUA 1JW1A 1OLCA 4GWOA 5F1QA 3ZKKA 3EHTA 3TCHA 4G8MA 1MH3A 1IUDA 1MY2A 3RUMA 3VVFA 2PVUA 3O6IA 3MBPA 1WVJA 1B46A 3OEMA 4OTEA 4FE8A 3O29A 1KWHA 2Z8FA 3MVXA 4LVQA 2QS3A 3OEKA 2DP8A 1MY1A 4IO7A 3PU5A 2Z23A 4BDMA 3K2DA 4QSDA 5AE4A 4QRZA 1B7UA 1P1QA 1IZ1A 3QIMA 2V25A 4JB7A 2UVHA 2Y7RA 1DTZA 1LCFA 1B1XA 2I4CA 2QS2A 2XXIA 4KYSA 1ZLQA 2IA4A 3ILUB 4RA1A 3ONMA 1JEVA 1IXHA 5I56B 3FXQA 3SKPA 1MH4A 2AIXA 5TPAA 3U92A 1GTKA 2QRYA 1B3GA 1POY1 2G29A 2ZMBA 3I5OA 3LSFB 3M8UA 4NMYA 3FV1A 5DEXB 3KBRA 4NWDA 3TEPA 2H5YA 4RPNA 3MP6A 3TTLA 3PPPA 1B51A 1DPEA 2NWJA 4IGTA 4IO5A 1MQJA 1P1NA 2V93A 3VVDA 3K6XA 3FIRA 2F34A 3I3VA 1QVSA 4R6KA 2W7YA 5I2NB 1B4ZA 1DMBA 4OXVA 1H43A 3O2AA 4E0WA 1AL3A 4Q5TA 2XX7A 3DP4A 5B7DA 4XKRA 4ZEDA 5H8FB 2NUVA 3TDJA 2ZYOA 3KZGA 3O6HA 3HPIA 5EHSA 1Q35A 1B6HA 3VE1B 3EF7A 3KSXA 4KQPA 3OO8A 3S9NC 2XXPA 5BUUA 1NFTA 3N6UA 5ICTA 1SI0A 3H4ZA 1LBBA 2B3BA 3IB2A 2AYSA 3BKIB 4XIGQ 5H8NB 1I69A 3C32A 2H25A 1MRPA 4OYVA 1VFDA 2I6EA 1B1HA 2UVJA 4O3CA 3RTWB 3O97A 1M5CA 3RN8A 2RCAA 3THIA 1A99A 2B3FA 1NNPA 3N26A 1R9LA 3CSBA 3RY3A 4ELQA 3VFJA 3M3LA 2BJJX 4IY5A 3USDA 3IX1A 1N76A 3MW0A 1JW5A 2OCUA 4ND9A 4OERA 4QFLA 5F7VA 5L9MA 3B6WA 4DXBA 1FTKA 1B3FA 1XHYA 3C33A 1Y3PA 2I0CA 1B2HA 2UYEA 1QKAA 2UVGA 3TTKA 1Z7ME 2UYFA 4NE4A 2V3TA 5FHNA 5JTYA 2QMXA 3RLFE 3OSRA 4O3BA 3UA8A 4R75A 3PPQA 4H1XA 3SDFA 3RT6B 1Y4TA 4F2OA 1JVXA 2CMOA 2LAOA 2DYXA 2PYYA 4LQ2A 4YKIA 1SW5A 2ABHA 1N3WA 2B65A 4I8CA 4NF5B 1SW4A 4LZ8A 5DEXA 3FJ7A 4U23A 4U4XA 4MBPA 4NF5A 1NNKA 1XVYA 4H5GA 1OMPA 3WAFA 5AA4B 2VHAA 4F2QA 4F19A 4OMBA 4P0IA 2A5SA 4WKMA 4AQ4A 1Y1MA 2H4IA 3IOTA 4QSCA 3FXUA 3C36A 3IORA 3FXRA 5AA1A 1WDNA 4ELOA 4F3BA 4I1DA 2REJA 4WEPA 1YTVA 3FJGA 3IJOB 4G2ZA 2PMSA 3K6VA 1OIBA 2CZLA 2V3QA 3IO6A 3H06B 4GLIA 2Y84A 4Q0CA 3UORA 2VOZA 4G68C 1MXWA 3OD7A 3H3GA 4X9TA 2D21A 4HS7A 4RJZA 3TYHA 1N7XA 4BLAA 5L9SA 3Q26A 5H8SA 4QSEA 3U72A 3BFUA 4NWCA 1UTBB 1BLFA 3T66A 4F1YA 4AB5A 4BDNA 4KD5A 1JEUA 1HSLA 4H8IA 4BDQA 1FQBA 5DT6A 1JQFA 1I6AA 1S9TA 1MDP1 1ZIUA 5EYFA 2XXHA 3K1PA 2Q2CA 3C31A 1VR5A 5CMMA 3LUYA 5FTIA 3A3UA 3MPLA 4F1VA 3IR1A 3RTFB 5M2VA 3O28A 2Q88A 2Z8DA 5H8FA 1B40A 3QUJA 1M5DA 3TELA 4DCXA 1AMFA 5CBSA 3UP9A 1B0LA 3W15C 2HCAA 4WXJA 3VXCA 3QUFA 3RQTA 2DE4A 4YKPA 2DXYA 1DSNA 4QFKA 1BKAA 4H8JA 3RNNA 3O6GA 3FGSA 4LUBA 3G3KA 1YAEA 3SETA 4F3PA 1IXIA 4UA8A 5KCJA 1TT1A 4F3SA 3QYTA 2XX9A 5JTYB 1LSTA 1S7YA 2FYIA 4PE5B 5TP9B 3ECRA 1PB7A 5IKBA 1FQEA 2I49A 1B5IA 1O64A 1XC1A 2AL4A 1B9JA 1FTLA 4P11A 1ZBMA 4OZ9A 5TPAB 4BDRA 2DE2A 2DWAA 3MUQA 2RC7A 1XOCA 2R71A 3G3FA 1SBPA 4RYAA 5HBCA 4K3FA 4JSDA 4YICA 2V84A 4EXLA 4GXAA 3T9XB 5IAIA 3KJTA 1BIYA 1RYOA 2THIA 3G7WA 3G3IA 1B32A 5CBRA 1SD3A 1Y3QA 1FTMA 4I9DA 3OENA 4PP0A 2QJEA 4ONYA 5BWJA 3U1OA 3CIJA 4FIMA 2P1SA 3MWBA 3G3JA 2UVIA 4G8NA 1SI1A 4MF3A 5CI5A 4ZEBA 4G77A 2I3WA 5H8HA 2DWHA 2XD2A 1TWYA 4JXIA 4EXKA 3BFTA 4OEVA 5I2KA 1B5HA 2E1SA 1ANFA 1MQIA 2KLFA 2XXRA 1IXGA 3IJXB 4XKNA 4IO3A 2F97A 1M5FA 1LFHA 3QSLA 4HCYA 4Z0IA 1B52A 4M1VA 3KEIA 2QMWA 3KN8A 2NXOA 2VD2A 3FVNA 1SDXA 3LSLA 1NMUA 4LZ7A 4BDOA 1A54A 5I59B 1M5EA 2O6AA 2OJTA 1TXFA 2RCBA 3SEUA 4L17A 3D4CA 3TCGA 3G3HA 4G4PA 2Q9TA 1B7HA 4G68B 4GIZA 4RNSA 3JYRA 3ZSFA 2F36A 4IO4A 2D3IA 4WEDA 1MQHA 5H8HB 4YMAA 4YB7A 1MPDA 2QL3A 1IQ7A 3KN7A 1ELJA 4KI0E 4ZECA 3QXMA 1R1NA 3MVZA 3O9PA 2REGA 1D9YA 3QK6A 5I84A 3TTMA 3KGCA 4DIGA 1MY3A 3FVOA 3P7IA 3V5AA 3VV5A 4DCYA 1S50A 3FV2A 4R2BA 3PUWE 4DZ1A 1B0HA 2DSFA 3OELA 1US5A 1ZTYA 1N7WA 2Y7WA 4H65A 3FD3A 3KOSA 4Q30B 3MP8A 3GBBA 4X1DA 2E0SA 3T9UA 3CG1A 5H8QA 5AA2A 3PUZE 4ZE8A 4ZZEA 1O63A 4HTGA 3H6UA 4QF9A 3PMWA 3K4UA 2VP1A 3OSQA 3AXFA 1TFDA 2V3UA 4GFRA 3ILTB 4QHQA 1GV8A 5B70A 1N84A 2I48A 1R9QA 2GHBA 2I0BA 1Y4CA 1MG1A 1FQAA 4EDPA 3S9LC 2UXAA 3PPRA 4X48A 3VLWA 3IL1B 4C1TA 1FQDA 4O3AA 1PBQA 2Y7PA 4IY6A 1JVYA 2HFBA 4HCWA 2RKMA 4JSOA 5FHOA 3PD9A 4RXLA 2GHAA 2XXQA 2ONKE 2QS4A 3K6UA 1QUIA 4POWA 1XT8A 3CG3A 4LQ5A 1Y9UA 2RC8A 4NF8A 4X1BA 4R72A 2OZZA 5AA3A 4MLVA 2XHDA 4THIA 4ESWA 5J1DA 3E3KA 2HXWA 2Y7KA 1Q1KA 4R73A 5DTBA 4EF1A 1LAGE 2DXRA 2F35A 3FVGA 3T22A 4F22A 5I59A 1MM6A 3MZ9A 4NF4B 4DDDA 3T9VA 3MP1A 1B3EA 1I6QA 4PETA 1XS5A 3CI8A 3CVGA 2F6GA 1B3LA 1LAHE 3KG2A 2YPNA 1UTBA 3T96B 1QJMA 3TCFA 4ELRA 4KCCA 3TTNA 3MZ1A 2QPQA 4TOZA 5L8DA 2XXVA 4NEDA 4F31B 4KHZE 2DVZA 2H98A 5AA2D 1OQGA 4EQBA 3FUZA 4F39A 1A40A 5TP9A 3HHGA 3EQ1A 2GH9A 3MVYA 2P2AA 3K02A 1ZMGA 1LAFE 3DLNA 3MQ9A 3LC8A 3OO9A 3GBAA 3PD8A 5ITOA 2X7QA 1AH5A 1EZPA 3PMXA 1B5JA 4KYEA 4R9FA 4IO2A 3M3KA 5AA4A 3KOTA 2RC9A 2WKYA 4LP2B 4RK2A 1QULA 3IO4A 4U22A 3LBSA 3HV1A 4YKJA 4YKKA 4YZZA 3UGWA 2F7CA 2ZNTA 1EZ9A 1URGA 3E9XA 2H99A 2O84X 4PFWA 3TMGA 3K01A 2F7AA 4U1OA 4GL8A 4U1ZA 4FECA 2F5XA 4G8HA 1QKBA 3EHSA 4KR5A 3QAXA 5ELVA 1L5TA 1QUJA 3WAEA 1N3XA 2HZLA 2QS1A 2OWSA 4GXSB 2O7IA 3JV9A 4OVJA 5TU0A 3TODA 4Z7EA 2Z8EA 1J1NA 1UIVA 2O7UA 2PBWA 1IXCA 2M8CA 4OFLA 5DVFA 3S4UA 1B3HA 4OHNA 3H7MA 3N6TA 1IITA 2DVCA 1CB6A 1LLSA 3K6WA 2Q8JA 3VLUA 2I3VA 2YLNA 2X26A 2GRVA 4C1UA 1ZJLA 2F7BA 1A8EA 3FATA 1PBPA 4RK9A 4POXA 1Y1ZA 1MXUA 1MXVA 3CSGA 3LSWA 3PUYE 1A7LA 4GL0A 4H5FA 4H67A 5DYHA 1CE2A 4EQ7A 1F9BA 5HPQA 5H8NA 1UTHA 5CMKA 4XKPA 1P99A 1PEBA 4OFOA 4P0GA 4LA9A 3RGYA 4PFYA 1PC3A 2X7PA 3TZAA 3TTRA 4LONB 4FORA 1OQHA 2ANJA 3N5LA 3ZKLA 1MY4A 3C34A 1D4NA 3KN3A 3VLVA 2OBGA 2O68A 2I58A 3C9HA 5CRYA 2ESNA 1SYHA 2FNCA 4KCDA 4MFIA 4U21A 3TQWA 3VDFA 1MM7A 1OVBA 4ZDMA 3RPWA 3OMBA 1JNFA 4YU0A 4XKQA 3TPAA 2O1LA 4ZS9A 2XX8A 5KCJB 2ONRA 4ZEKA 1PB9A 4OENA 2Q89A 3Q25A 3GXAA 3E4RA 1GVCA 1RKMA 1BTJA 4NTLA 2O69A 4NF6A 1H45A 1NH7A 1QW0A 4EUOA 4R9GA 5JK4A 2QSXA 3M3FA 4YAHX 1LGBC 2XD3A 4R6HA 1GR2A 1LB8A 2R9JA 3UIFA 2ZNUA 3TUSA 1MXXA 2HAVA 5K2YA 1PDAA 3OXNA 4PFUA 4FEBA 1SQYA 4R2FA 1FQCA 5ITPA 4OEUA 1AIVA 4QFPA 4XTCQ 1VSOA 1H76A 4FEDA 2OLBA 3TFLA 4LZ5A 3H6TA 3VVEA 1B05A 1P1UA 3MC2A 4R6YA 4N13A 5KZTA 1VE4A 4E0XA 4QFNA 1Y20A 3S2VA 3S9EA 3HSTA 5FHMA 2AL5A 3L6GA 1NKXA 2I4BA 3D4GA 4OQOA 1DPPA 1YCJA 1FQFA 4U4SA 4TLMB 2F8DA 2DWIA 3K0VA 2IEEA 4PQJA 3SERA 4ECFA 4OETA 4F29A 1HSJA 4OWDA 1MXZA 4YMBA 3V83A 2NOOA 1JW4A 3K00A 1DOTA 3IOVA 1UIUA 1UTHB 3VXBA 4Q8RA 5EHMA 1A8FA 1ATGA 3H6WA 1IEJA 3MVWA 4EF2A 3CR9A 3OO7A 3B6TA 2XXYA 4NF8B 4H0WA 1MS7A 2HEUA 1OVTA 3KJ7A 2Q2AA 4HW8A 1USYE 1II5A 3DELB 1NNTA 4M4GA 1IIWA 1WODA 2DOJA 3I6VA 3IK6B 4RY1A 5DVIA 4ZZAA 5CMBA 3K1MA 5FTHA 4NF6B 3HN0A 2ONSA 4DXCA 5I56A 1LAXA 3R26A 4TQUQ 2F78A 1MQDA 3JZJA 3KSJA 4DXUA 3MPKA 1MXYA 2ZYKA 3EN3A 3PUVE 4F18A 3SESA 5I57A 5JEIA 3HHFA 1SVXB 3CFLA 3DP6A 2XXWA 3FVKA 3O66A 3Q29A 4MLQA 3HO7A 3PMVA 5H8QB 2HQ0A 5AA2B 3CRBA 2YJPA 3SEXA 4JWXA 4KPTA 1SW2A 5DVJA 1FTOA 1FTJA 3BBRA 4LATA 1Y3NA 3R7XA 2GFEA 3K1NA 3L6HA 1FCKA 4RPOA 1H3DA 2HAUA 4DLDA 4ZE9A 2XXTA 3UK4A 1D9VA 3HCQA 1UQWA 3C4MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D3KA 1MQGA 3EHUA 1YPNA 3V8XB 3N94A 2Y7IA 1B4HA 4JWOA 3FZVA 4GF8A 2D5WA 2R6GE 1DTGA 5A5XA 2XXXA 2G93A 4IGRA 3SEVA 3H03A 3F11A 4JVDA 1NL5A 3OO6A 4UACA 2DQVA 3Q28A 1H44A 1MPCA 1FPEA 3PPNA 3SEYA 5FBPA 3KFMA 4C0RA 3OOAA 1XVXA 3U94A 5EQ8A 1ZKBA 4OFJA 4MHFA 3GLBA 1FTAA 2PT1A 4PE3A 3LUZA 3T9HB 3U8QA 2ZNSA 4NAPA 1EZOA 4KYDA 3CFXA 5CM6A 5A5XB 2PT2A 1US4A 5LTCA 4LN5A 1FBGA 4PGNA 1LB9A 4XEQA 2ZYNA 1HSEA 4ESXA 1T0KA 1OLAA 1ZU0A 1FPBA 3CFZA 1N0TA 4N6PA 1EU8A 1JW1A 3ZKKA 3EHTA 1IUDA 1MY2A 2PVUA 3OEMA 4OTEA 3MVXA 1MY1A 3PU5A 4BDMA 5AE4A 3K2DA 4QSDA 1P1QA 2Y7RA 4U2RA 1B1XA 2QS2A 2IA4A 1YZ0A 1JEVA 3FXQA 3SKPA 2AIXA 2XWIA 3M8UA 2ZMBA 3D1RA 3MP6A 3IFAA 3PPPA 3TTLA 1B51A 1IMBA 2NWJA 3VVDA 1QVSA 1NV0A 1DMBA 3O2AA 4N6KA 4XF5A 2ZYOA 3KZGA 5EHSA 1Q35A 2XXPA 5BUUA 5ICTA 2B3BA 4XIGQ 2I6EA 4O3CA 1FPLA 3RY3A 3IX1A 4ND9A 3B6WA 1XHYA 2UYEA 2UYFA 2V3TA 3RLFE 1FPJA 3UA8A 1JVXA 2CMOA 2PYYA 1EYIA 1SW5A 2ABHA 1N3WA 4F2OA 4LZ8A 4U23A 4U4XA 4MBPA 2VT5A 1NV5A 4F2QA 4OMBA 4QSCA 1D9VA 3FXRA 5AA1A 4I1DA 2WYPA 2CZLA 3H06B 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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