3W1LA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-chloroorotate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-chloroorotate
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 108
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1lA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1lA01
4XWUA 2X30A 4MY1A 2NV2A 4N4PA 1WX0A 3PBWA 3EWYA 2A1YA 4FEZA 2TYSA 1DVJA 3ABSA 2QJGA 5J5RA 3HGRA 4MYXA 4JX4A 1J5TA 4FX8A 3W1RA 5TQLA 4BF9A 2FQIA 5IM51 2PRHA 3LXCA 3NQFA 3GZ3A 4J9JA 1YYAA 2ZDRA 3A23A 4O19A 3FKRA 3NQ7A 4AHQA 3DI1A 4BI6A 1RR2A 2ABBA 4LS2A 4EWND 3IIXA 3IIVA 5FF2A 3L0GA 1TTPA 1R46A 5H91A 2B7NA 5CZTA 3L5LA 3FLUA 4JS3A 1MXSA 3LRKA 3ATZA 2PCQA 2WSQA 2QCMA 4RZ6A 5HQEA 1KTCA 4IPJA 4ZQNA 4DBDA 1B4KA 1K7EA 3B03A 2X1TA 4ML9A 3P67A 1F7BA 3DXIA 5C6MA 3QPZA 1OG0A 3WJZA 2VFDA 5KZDA 1DL3A 3LBCA 3C3NA 2QAFA 4K8EA 4Q32A 1IXNA 2V5BA 2C19A 2Y7EA 3RLUA 3TR2A 3R12A 2DZWA 2A7PA 5TBOA 3S5ZA 1XXXA 2JGQA 1X6UA 3LX9A 4QJ1A 2ABAA 2DJXA 3TJLA 4NJJA 1S5TA 2QAPA 3G1YA 4PC8A 3R8RA 3A5FA 1OFAA 1DV7A 1GVQA 3FJ6A 3E49A 1M5WA 3E12A 5AB3A 4RLIA 1GG0A 4JX6A 5F4SA 4NT0A 1GTHA 2NLIA 3L5MA 4JD4A 1PHQA 1U83A 4H4IA 1VHCA 4XUGA 4HNNA 1JUBA 4FX6M 1YXCA 2E6YA 2YFOA 3PBYA 1Z41A 1FCUA 4UMBA 1ME8A 2FJKA 2FLIA 5AYYA 3STEA 1GYLA 1TTQA 1OK6A 2W0UA 4UXDA 2HMCA 2VEIA 3ZWSA 3TE9A 3E0IA 3PSWA 2H90A 5HMSA 4TMBA 3ABRA 1XM3A 4ZL1A 3GDRA 2DP3A 3CT7A 3IRDA 4FB7A 1G67A 5AYZA 4TO8A 1DOSA 3BV4A 5EPDA 3W7LA 1YADA 5LHEA 1TO3A 1KW1A 3LHYA 1ALDA 2Z6JA 3STFA 2C16A 1QOPA 1E51A 5CGQA 5LKYA 3W2JA 4K38A 2V30A 4Q33A 5LGZA 1N55A 1H62A 5D30A 5CZJA 5FEPA 3BLEA 4H3DA 3QZEA 4JTJA 3FFSA 3BG9A 1GJPA 1DJNA 4MUZA 2J9ZA 3KAOA 3TXZA 3QC3A 1GVRA 4C1KA 3W2LA 5A8GA 4U28A 1YTDA 3DFTA 3M5VA 4O14A 4NJKA 4JTSA 4DF1A 3HG3A 2B4GA 1PS9A 2QEZA 4AF0A 2RH9A 4MY9A 3W7JA 4PEKA 5HWNA 3HIJA 1TCDA 3ZR4A 3NO5A 1P1XA 3BGGA 4YWIA 3UWQA 1W5PA 1WQ5A 1TYGA 3QW3A 3M0ZA 1OK4A 3P62A 2WNQA 2ISSA 4JTTA 3W1UA 1C8VA 1F05A 1EUNA 4GUIA 2GOUA 2A2IA 2NV1A 2NXIA 1VGAA 3B4UA 2B7OA 3DZ1A 1YTKA 2V0TA 3G8RA 3L66A 3ABQA 4WD0A 5F2IA 3W1QA 3FIGA 3LM7A 2OCZA 3DHFA 1K7XA 3BLFA 3S1XA 4HNVA 3S0CA 1FX6A 4NJIA 1B9BA 4LUIA 2ATSA 2ZA2A 3I7SA 4JTHA 4O12A 4UTMA 3N9RA 3UWZA 4EIVA 1PVNA 3NPUA 3OA3A 3LXAA 2YSWA 2BX7A 4M5PA 3W72A 1EA0A 3EX3A 3A5VA 2CLEA 3LRMA 2A6LA 1MEWA 3TQVA 1VLWA 3GAKA 4RXGA 1LRTA 1EP3A 2EPHA 3RNDA 5D2TA 1Q45A 3EB2A 4AXKA 1S3HA 3EX6A 3LHUA 5DLCA 4AAJA 3Q94A 5D09A 2V82A 3LHTA 1PV8A 2H8XA 3FS2A 2QCDA 3EX4A 1V5XA 2RDTA 1SU5A 1FUYA 1K02A 2E6FA 2ISWA 3HOJA 1A5BA 1NSJA 4MLJA 4OGZA 3NPWA 1KM3A 1TPUA 3OVQA 2YPIA 3MI2A 4DO6A 1P5BA 1ZFJA 1KM6A 3FOKA 2E68A 2VEPA 3LXBA 1TTIA 4TX9A 3TK7A 1TSIA 1DKWA 1TQJA 1XDLA 1MSSA 2QUTA 3O16A 5IBXA 1T96A 1VPXA 3KX6A 3Q2DA 3W7QA 3HMJG 4UMCA 1SW3A 1S5VA 1VHNA 3MI6A 1NF7A 1OYCA 1QO5A 2ISVA 3LV6A 3PF3A 5D2WA 5F1UA 3FA5A 3DKLA 2QCLA 2BXVA 3YPIA 4I7UA 3KRSA 1VYRA 4FIRA 2VFIA 3W1LA 3S1UA 4R34A 5G5IA 2V2DA 4UTLA 3IIOA 2WNZA 1WOAA 4UTWC 1JQXA 4FNTA 2A21A 5CPNA 3G22A 4IXXA 3IVSA 3T55A 3USBA 5LNSA 4HSNA 7TIMA 2QCGA 3TW6A 4UFLA 1F73A 3RLVA 2WSYA 3LCHA 2DZPA 3PAJA 1JCLA 4IX0A 3LTPA 4N9DA 5C5YA 5K4ZA 2H6RA 1OFDA 3QYQA 5I3JA 3GIYA 1F6KA 1ML1A 1VYPX 3M1ZA 1OX5A 4Y9AA 4Y96A 3NM1A 2ZZ3A 3O15A 3OVRA 4N6EA 3QQ1A 3W1AA 3W7CA 5DCBA 5CG7A 1TIMA 3M41A 1VLIA 3LCWA 1OFQA 3WJSA 5K7JA 3NG3A 4JGDA 4GFSA 3WJWA 3DFNA 3O06A 1XCFA 4NNCA 2ZZ1A 2ATMA 5CZ0A 3W2NA 3NL2A 4O10A 3HGOA 4HPXA 1VCFA 2RKXA 4C1LA 3OEXA 3M43A 2B7QA 3M6YA 3NL3A 2H3DA 1TJRA 3LBMA 3EWWA 4JX5A 4RCXA 5CZSA 2VOMA 3LRLA 4ZQCA 5AC7A 2YR1A 5HWMA 1B3OA 3PS7A 1RVGA 2FPTA 1Q6QA 5U4NA 3PULA 3W7KA 2CZ5A 6ALDA 1O95A 1O4UA 4R7JA 1X8FA 4BWLA 1JUEA 5LNWA 2Y61A 5DCEA 1T8XA 3C2FA 3INPA 1LOQA 4MZYA 2E6AA 1RZMA 1EUAA 3UNDA 5K3VA 4A2SA 2PRMA 5TIMA 3CEPA 4MZ1A 2OMAA 1F5ZA 1OVDA 2CLFA 4Z1BA 1NFBA 2R8WA 1GTEA 3CIXA 3PY2A 3PVFA 5BMXA 4GC4A 3NQDA 5K4XA 2RDUA 3O05A 2JKPA 2ZBTA 3G8EA 4JICA 1KFJA 3TFXA 3P7YA 3WJYA 1FXQA 3PUDA 4LU0A 4QISA 5FEXA 1P0KA 2YYTA 1DBTA 3I7QA 5LNVA 1X1OA 1IIHA 5DELA 1Z42A 5HWJA 4K7VA 5A5WA 4E0CA 2AQWA 3L0KA 4UTTC 2GUUA 3KHJA 4JYFA 4LTSA 2GJLA 4HHPA 1F6PA 3EWUA 4S2CA 3PUEA 4IGHA 2W79A 4L4LA 3W23A 3THAA 1ICQA 5CSRA 1UB3A 2YX0A 4GUGA 3IV3A 4MPQA 4AF0B 2CFFA 5CSSA 3O8AA 4ICNA 5F2LA 5LHFA 1O60A 2WOQA 2NX1A 1JRCA 4O52A 1H7PA 3B0UX 1UJPA 3PBVA 1O5KA 4OT7A 2QKFA 5BRBA 1EWDA 1MZHA 3LOTA 3F1QA 3P5ZA 4LY8A 3P8IA 4LW7A 3GAYA 2OJPA 3JS3A 3NQGA 5G2HA 3QF0A 3HO8A 3CTLA 3IVTA 3WK0A 3MP5A 1QNVA 2ZRXA 1WA3A 2P1FA 3KVMA 2A0NA 5KMYA 5LNRA 2CZFA 1CX9A 3MBFA 2A5HA 2EF9A 4NQ1A 2YCEA 2ZA3A 2Y89A 3G1AA 2GVGA 2JKAA 1RQEA 1O94A 1ME9A 3O6CA 3TMQA 3VKJA 2Y7GA 1R2RA 4WUIA 3BK0A 5G1YA 3W1NA 2C1HA 2CLOA 4FHAA 3ELFA 1R30A 3TKFA 3P8JA 4ORIA 3W7GA 4DEFA 4ALDA 2G97A 3PWAA 3M7WA 3UWWA 2BZNA 1K03A 3DAQA 2QDHA 4UR8A 3GXTA 2FB2A 2NX3A 3M44A 4X9SA 3S1VA 1ZALA 4DF2A 2E77A 1XFBA 3N2MA 1XBZA 2V9DA 3NQ8A 2Q8LA 3PG9A 4IPIA 2QCDB 1LM1A 1IXPA 1I2NA 3MWAA 4LV4A 3V1PA 2YXGA 2JKEA 2FPVA 4WOQA 4AH7A 3ZFHA 3G18A 2GQ8A 3W1PA 3LLFA 2J6XA 3NR0A 5BNKA 5E1QA 4EF8A 4LRSA 2R94A 1W3TA 3T44A 4QIUA 2VC6A 3P84A 4IXHA 3IEBA 1LORA 4YCPA 2IQTA 2NXGA 3F4WA 1M7OA 4WX2A 4WZHA 2FIQA 1EIXA 1UCWA 1HTIA 4M6PA 8TIMA 3GX9A 4Z0SA 1PIIA 1KM0A 3OHIA 2F7FA 3N19B 3IIPA 4NJGA 2QCEA 1G4PA 1PE1A 3LTSA 3LV5A 5AN7A 3LGEA 1M7PA 2HS8A 3DGRA 3AO0A 3GXPA 3W7NA 3SGZA 3MUXA 2XFWA 3ABOA 3GYEA 4UC5A 3HG4A 5L6UA 1JCNA 4LWWA 1WYIA 4O17A 4XKYA 1KTBA 2Y7FA 4UCGA 4JTIA 2CZEA 2XN0A 3TNOA 1W0MA 3HB9A 1I2OA 3PBUA 3HGSA 4DPPA 2X16A 2ZTKA 4JNMA 3GKFA 1K7FA 3HBLA 2WSRA 4IMGA 5FI8A 4M19A 2ALDA 1VS1A 3SW6A 1FDYA 3P80A 1QPOA 1WAUA 3G1VA 3P61A 1L6WA 3NQ2A 3W7OA 4BI5A 1LLZA 3EX1A 5EBUA 2C13A 3RU6A 1FCQA 2DORA 4CCDA 4QITA 1SR9A 1V7YA 4FNPA 1WBHA 3TU9A 1PL9A 3UXDA 3THQA 1G6CA 2LLEA 2NZLA 1YLVA 1YPIA 3KRUA 3CM4A 3W3OA 3W2MA 4DO5A 1IIGA 2X1SA 4X22A 2QCCA 2F84A 3CQ0A 3L65A 3TSDA 4A2RA 1ZAHA 1GT8A 2X2GA 2JGYA 2ZZ4A 1ZJIA 3EXSA 3IGSA 3W70A 1H7NA 4IUOA 2G5WA 2BSLA 3W7DA 2G95A 4UNKA 2Q3RA 1HFBA 3TSMA 5CPOA 5I3HA 3EX2A 3RF9A 1XUUA 3H53A 3O63A 5KITA 4N4QA 4O57A 3U6WA 4K36A 1SW0A 2CZDA 2HS6A 3L5AA 5AHFA 1H7RA 3AJXA 3R2GA 5D04C 1FCVA 1RD5A 4PFMA 5DCDA 1AW5A 2VFGA 4FXSA 5F4XA 3A24A 1L6YA 4Y6GA 1MEHA 5D32A 2QJHA 4OWGA 4Z1DA 3Q37A 4RZ4A 1G7VA 5HUPA 1KA9F 2FDSA 2NUXA 3SZ8A 2J9YA 2C14A 2QCNA 3LB0A 2EKCA 1JRBA 3LCFA 3C52A 3WFAA 2Y63A 2BLEA 3NVTA 2V5LA 3BG3A 1TRIA 2P0OA 4O1AA 3E96A 1J2WA 4GE8A 1FDZA 5C54A 2ZZ5A 4MFEA 5AHIA 1SFJA 2OX1A 4X3ZA 4HPJA 4KFOA 2ZRUA 1SQ7A 3SJ3A 3O07A 2UV8G 2ZCGA 1Q6LA 3C56A 2C18A 1T0OA 3CHVA 3NL5A 2ZZ6A 1SO4A 4CNOA 3RK8A 3W7HA 4UMAA 4UFKA 5AC6A 5DBTA 4BI7A 4IMCA 5AHMA 1VZWA 4A21A 2Z2UA 3DKJA 1FY6A 3HJZA 4M7SA 3UXAA 2CLIA 4GUHA 4KWWA 1WDWA 3TMLA 1U5JA 3PC0A 4E2BA 3W6YA 3UYCA 1AL7A 3MYOA 2YW4A 4O54A 1WBJA 1SZGA 1XDMA 1F2JA 4QSHA 3IGUA 3EXTA 1VJIA 2A7RA 1S5WA 2I1OA 4LC8A 4WXZA 3UQNA 3PUOA 1GYNA 3BO9A 3N73A 3C4UA 2QUUA 1D3HA 5FESA 1K8ZA 2AAMA 5I3FA 4DO4A 5F1VA 1H50A 3P81A 1N7KA 3LCXA 2FPYA 1OF6A 1I45A 1LROA 3UWYA 4S1FA 3L21A 1JQVA 1H1ZA 1ZY9A 1XL9A 3LHWA 3W1XA 1TREA 4MFDA 4X2RA 3W07A 3NL6A 3D0CA 2ZA1A 1GVFA 4TIMA 1ZENA 4POCA 3QSTA 4FO4A 3W2UA 5DXXA 1LRQA 1P4CA 2J88A 3DHDA 3G24A 1QFEA 3T40A 4ZVJA 3GNNA 4IOTA 3T4CA 3W7IA 1K8XA 1KV8A 1FWNA 5EMUA 3P5YA 3W71A 1W54A 4RZ5A 2A7NA 3MO7A 4EOUA 3QM3A 3DFOA 1DHPA 1R2SA 3TROA 3T78A 3VNDA 4LUJA 3FEMA 1L2UA 3DH7A 4GBUA 2NWRA 3UWUA 3NPXA 2NUWA 4JIQA 3A9IA 4UTKA 3LERA 3IIZA 2BWGA 4JXCA 5CPLA 3GKAA 1BTMA 4N9CA 3LLDA 3L68A 5D2VA 4A29A 1TPB1 1IXOA 5ABTA 4ZQOA 4GUFA 4UFMA 5SWUA 1QAPA 4JTUA 2CLKA 3GNDA 3QMTA 1H61A 1LBLA 3C2RA 4FIQA 1BKSA 4I7WA 5KTLA 2B7PA 5AHEA 5HULA 2TSYA 3SY5A 1GOXA 1IF2A 3NDOA 1EP1A 3UZJA 4DXVA 1PCKA 3SSJA 5IBXC 4UTUA 2O7SA 4O4WA 1TB3A 5I3KA 3S8HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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