3W1QA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with nl-2
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with NL-2
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 104
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1qA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1qA01
3STGA 3RU6A 4JDBA 4CQ8A 1U5JA 4AHPA 1SSDA 2CLHA 1X7FA 3NOEA 1TPB1 5H91A 4U28A 5ABTA 2OX1A 3MW7A 1QNVA 4LY8A 5FEPA 1S5TA 1PVNA 1X1OA 2QUTA 3G1HA 4HN4A 3CPRA 4Z1CA 1A5CA 3NQFA 3MBFA 2Y89A 3LCGA 1K8XA 2VFGA 2JK2A 3SGZA 1SW3A 4JIPA 3W1PA 5EBUA 4LTSA 2FFCA 3DFNA 3QW3A 3CHVA 2YX0A 4RZ6A 4DPQA 3TFXA 2Y70A 3B4UA 2V81A 3W87A 4QAIA 3I7QA 1BWKA 4DEFA 3BO9A 4RZ4A 3W23A 1ZHAA 4HNVA 4PL2A 1SR9A 3NM1A 4M5PA 3LCIA 3N34A 2CLKA 4LT9A 4PA8A 3S1UA 2J9XA 3NL5A 1OHLA 3HGOA 4UR7A 3B0PA 3PF3A 3NNTA 1TPH1 4JR5A 3WJSA 4M6PA 4O57A 4JX5A 3A24A 4O18A 5CZTA 2E6AA 4DO4A 3EXSA 1KV8A 1P5BA 1FBAA 4BFAA 4GUFA 4NJGA 3QSRA 4YMZA 1H1YA 3V75A 2Y7GA 1VYPX 4LW7A 3C61A 2NV2A 5AHEA 3QM3A 2BWGA 3HGJA 4ML9A 4AWTA 4I7WA 2QEZA 2VFIA 1UUMA 4HKPA 4LRTA 2QCEA 1N8FA 3VI2A 1TQJA 2QCDB 4FEZA 1KTNA 1PHQA 1HFBA 1O4UA 2A5HA 3TAOA 2YDAA 3DHDA 3SSJA 3PAJA 1KLYA 4CQAA 1OFQA 3DBPA 3C0JA 1OK6A 1Q6QA 3OVPA 4QISA 5CKSA 3LV5A 3QQ1A 2DJXA 4JIQA 3TK7A 5G2WA 3NGJA 3HQ1A 4PEKA 3VE7A 5E1QA 3PB0A 3TH6A 2A6LA 1H7RA 3NQVA 3GAKA 5D2XA 3W7KA 3PC0A 1KM1A 1P4CA 2DZTA 2B4GA 4N9CA 1LRNA 2R14A 1SFLA 4HPJA 3S1XA 3QW4B 2C19A 1W5PA 3IIPA 2B7NA 3FEMA 1SU5A 3MHUA 3MI6A 4PC8A 1TV5A 5EYWA 4BWLC 2VFHA 4MLRA 1KFCA 5HR6A 3ELFA 2ATSA 1XL9A 4DBEA 2A7NA 3TU9A 3CT7A 1W31A 2V30A 4S2CA 3M9YA 1R2TA 1K8ZA 1MEHA 2EPHA 2QAPA 4PODA 3S0CA 5LHFA 1TPUA 2P1FA 2ZFAA 1D3GA 2ABBA 3L0NA 3W7MA 8TIMA 2PRLA 4O1CA 2LLEA 2YCEA 2WKJA 5DN1A 4EWND 3LXAA 4R7JA 3OVRA 2GQ8A 2ZYFA 3LXBA 3W1RA 3TE9A 1Q6OA 5J5RA 5AHFA 4XTDA 3NL3A 5HNRA 1LBFA 3EX1A 3HO8A 5DCEA 5KZDA 2NXGA 5HWNA 1YDOA 1QPQA 3H55A 4MJMA 2ZRVA 1F2JA 2WOQA 4PCFA 3FYPA 3NYZA 3VNDA 3I68A 5CSRA 4FIRA 3GXPA 3QPYA 4JTJA 1XFBA 4N9BA 1JRCA 3W2MA 3NR0A 4AEOA 2H3BA 4IPJA 3L66A 3P60A 3GAYA 3G0SA 3W71A 2J24A 1XUUA 1W1ZA 1Z44A 3S1VA 1Q45A 1NVMA 2X1TA 1OG0A 3TXVA 1LZOA 3TNOA 3UYCA 2NX9A 1W3TA 2C18A 4N9EA 1DHPA 3THAA 4EVZA 3NEVA 4QIUA 5LNVA 3LX9A 1B4KA 4H6KA 4BF9A 3GDMA 5L6UA 4UTMA 4EF9A 5G2HA 1HG3A 3LBMA 4NZJA 4TX9A 3A23A 3TAKA 4FX7A 1DQXA 1I2OA 5DY2A 5U4NA 3G0UA 3O6CA 2HMCA 3IGUA 2VENA 2CZ5A 3O06A 3LHZA 4UFLA 4A22A 4NX0A 2OT0A 3LCFA 2ABAA 1FCVA 3W7IA 1RZMA 2WSYA 3C2VA 2BSLA 3GR8A 3TROA 3P67A 5H2ZA 1VZWA 4KFNA 2R91A 3H54A 4E2DA 3P61A 4UFIA 3NPVA 3CU2A 3L5AA 3QMTA 3DENA 4JY8A 2V2HA 5DCDA 1ZAJA 4FXSA 5FF0A 1GVFA 3L67A 5LNUA 5DXXA 1I4NA 3G1AA 3DFSA 2V0TA 1PIIA 1H62A 2NLIA 3EKZA 4M6QA 1IIHA 1FQ0A 4OV9A 2PE4A 3WK0A 1L9WA 2H8XA 3BPWA 1TV8A 3GKAA 2AAMA 3W7GA 5G1YA 5KTLA 3B06A 4QNEA 5AYZA 3P8JA 3RLUA 4UTHA 3DZ1A 4LU0A 5D2WA 5C2XA 3EX2A 3P7YA 3B04A 4HNNA 3LCWA 4O50A 3N9RA 1JRBA 1KTBA 1P0KA 1KM0A 5KINA 3U2OA 4DO6A 2Q8ZA 4O0KA 1YTEA 1AMKA 3TW6A 3LB0A 3SZ8A 5DELA 3G22A 3PBUA 3O6DA 3LLFA 4OGZA 3HPXA 3GNDA 4UFMA 2VFDA 3GDRA 4OQVA 3OIXA 1ZCOA 1FWSA 5D33A 4XBKA 4XWUA 2ZZ1A 1GG0A 4NNBA 1FXQA 4A21A 5SWUA 1PE1A 4EIVA 3DGRA 3CEUA 1PCKA 2HS8A 1SPQA 2VEKA 4TIMA 5HJLA 2P10A 2QAFA 3TJLA 3W7DA 3P5ZA 3LHTA 3STCA 2VXNA 2FJKA 1H61A 2WNZA 5CPOA 2QKFA 3U8GA 4A29A 1TJRA 1TREA 3MP5A 2Y7FA 3BVJA 4NUWA 1AW1A 3OA3A 5F2LA 3W7JA 3BLFA 1YPFA 1TIMA 3EKLA 1MZHA 4ZVJA 2DP3A 3G1SA 2TMDA 3ANYA 4UTLA 3EB2A 3GDTA 3T44A 1TRIA 3LHUA 4JICA 4Z1BA 2NZLA 3FLUA 1F5ZA 3S9YA 2BZNA 4UMCA 3MP3A 4M19A 5AN7A 5FEXA 3F4NA 5A5WA 3VE9A 3W1UA 1D9EA 3W88A 2B7OA 3NQCA 1H7WA 5FEWA 5BW6A 3USBA 2Y63A 4K8EA 1U83A 3W70A 3CWOX 3GX9A 2ISSA 1SQ7A 2GPTA 3T78A 3GIYA 5KZEA 4K6AA 1FDYA 3UPBA 4HHPA 4WY0B 4MYXA 3T55A 3W22A 1QPOA 4KKXA 4IMFA 3EWBX 5EPDA 1PV8A 4ORMA 3QPZA 4AF0B 3LHVA 2ISVA 1EEPA 3MO7A 1YYAA 1W5NA 1ZENA 5GVJA 4Y90A 2OZ0A 1RQBA 2ZZ2A 1FWRA 2DZWA 4FNQA 1N55A 5D2VA 3QZEA 4N4PA 5D37A 5IM51 3GYEA 1TO3A 5LGZA 1TPC1 1JUKA 3TC6A 5D2YA 3W76A 5F2MA 4RV8A 1KA9F 2Q3RA 1ICPA 5FESA 5D02A 1SO6A 2Y61A 3IIXA 4JTLA 3DAQA 4HNUA 3HB9A 4JS3A 4L4MA 2EHHA 4UXDA 3S5OA 4K38A 4ZQRA 2QCGA 1TB3A 4NZFA 1KBJA 3O63A 3QJAA 4ZQMA 1C29A 1OFRA 3R13A 1W5QA 2A4AA 3IVTA 1FXPA 4MPQA 3M16A 2O7SA 2NV1A 3EXTA 1R46A 4HSOA 1KBIA 4IMGA 1EP3A 4UMAA 3VFLA 2NX1A 4FNPA 4RLIA 3NQ6A 1LP6A 4IX2A 4WX2A 1KFLA 5LKYA 1M5WA 3IIZA 2E77A 3IVUA 4CQ9A 1T8XA 3KOFA 4Z1DA 3MYPA 3R2GA 4UR8A 3DI1A 2V2CA 4TU1A 1DVJA 1MEWA 4FHAA 2DZVA 5LNRA 3VKJA 3KXQA 3B05A 4JNMA 1L2UA 3L9CA 2Z6IA 5D38A 4Y6GA 3R8RA 1GYLA 3F03K 2DU2A 4CNOA 3HF3A 4ZMGA 3PUDA 3LTPA 4DPPA 4EF8A 3W2KA 3NL2A 1WV2A 4LRSA 3WK1A 3TR2A 4K39A 3W3OA 4UTTA 4JTFA 2QCHA 5DLCA 4GC4A 1LOSA 1EWDA 1C9DA 3ABOA 4ALDA 1VPXA 3KVLA 5D05A 1OK4A 1GVRA 3LERA 4NJHA 4W9TA 4O53A 2C0AA 5K3VA 3L5MA 1GT8A 2RFGA 1TYGA 1YTKA 3SECA 2FB3A 3AJXA 5K7JA 4ORIA 1QPRA 4QM1A 4OWGA 4ZZ9A 4JDYA 5G2IA 4XKYB 5DY3A 1F05A 1XDLA 2X16A 5AYXA 4RZ5A 4E0CA 5TIMA 2C3ZA 2VEMA 2YXGA 4NVTA 3LM7A 1B4EA 2GQ9A 2J27A 4JYFA 4JTSA 2ZRUA 2W79A 3G1DA 4ADTA 2G97A 5D09A 1L6WA 3O6YX 4Y8FA 4FNTA 1H7XA 4LV4A 2CLOA 2DZPA 2Z2UA 1QOQA 1FDZA 2WPBA 2FPYA 3S42A 3GR7A 4JX6A 1JQXA 1G4EA 4IUOA 4IOTA 1SUXA 1WBJA 3NPUA 3W1TA 2X1RA 1K7XA 5HQEA 1ZFJA 5EA9A 1SW7A 2J88A 4LUJA 1G4SA 3ZWSA 2C14A 3BW4A 1K8YA 2Z6JA 3O05A 5BOOA 1Q3NA 2F84A 2CLFA 1QAPA 1R30A 2WV8A 1YLVA 1UBSA 1GTEA 1F76A 1GEQA 3H53A 3SW6A 5FF4A 1R2SA 4WXZA 2ZTJA 4YCOA 3UY7A 1XBXA 4WOQA 3A9IA 3W1QA 1A5SA 1H7OA 1FX6A 2C1HA 3PY2A 1K7EA 2RDTA 4JEQA 1G4PA 3L2IA 1JQVA 2H6RA 2ZZ3A 1M6JA 1F73A 2Y62A 3LOTA 5EY5A 3IGSA 1M7OA 3EX4A 1NF7A 4KFOA 4B5NA 1VCVA 3SFKA 4Q33A 2J9YA 1IF2A 4BR1A 4DQWA 2D73A 1TPDA 1TCDA 3RF9A 1RVGA 4Q32A 3IIOA 3W7CA 4AAJA 1FCQA 1VHNA 3TKFA 5G5IA 1EX5A 3W6YA 3L65A 3M44A 2FPTA 2QCFA 3HGSA 1UJPA 3OBKA 2E1DA 4MIMA 3BGGA 3MYOA 4MVAA 4JGDA 1IIGA 1KV5A 1IXNA 3KVJA 2I14A 5K9DA 2G95A 3RK8A 3W7NA 3UD6A 3TX9A 3I65A 3JS3A 4QQ3A 3PUOA 2ZQ0A 3DHFA 2YR1A 4GUJA 1AL8A 2DZSA 4R53A 2QJIA 5D03A 4JTTA 3TSMA 3THQA 3WJWA 3C6CA 1OFEA 1J2WA 2ZZ7A 2QCCA 3G1XA 3MP4A 3UNDA 2ZTKA 3SGUA 3S5NA 1LM1A 4AMAA 3NDOA 1VLIA 2O7QA 4L4LA 3KRUA 1XKYA 1OX4B 1ICQA 3KVMA 4RKAA 3NQ8A 3RLVA 4YL2A 4ZQNA 3CIXA 3SR7A 4FX8A 4UCGA 3UZJA 3QQ0A 3W1LA 1OF6A 5AB3A 4XZ9A 5F4WA 2I9EA 4M6VA 3BW2A 1AL7A 4RR4A 3RNDA 3OEXA 1W54A 2E68A 1OYBA 1B3OA 2JBMA 4ZL1A 3EWZA 5FF7A 3ZWTA 1YXCA 1PCWA 2XN1A 1GQNA 3MMTA 3LDVA 4UTWA 3EX3A 4NU7A 2ZRWA 1KLZA 1ZALA 4AH7A 3NAVA 3QC3A 4IWWA 4LVGA 2F7FA 1EIXA 2FPVA 4PTNA 3P74A 1OFBA 1UB3A 3VCRA 1A50A 5C55A 5MHBA 5CPLA 1N7KA 1I45A 1H63A 5T26A 2J9ZA 1GZGA 1KM2A 3CIWA 1IXQA 3NG3A 4O4VA 5HUOA 4UTTC 1GPWA 2Z1BA 3MUXA 4E38A 5E93A 3HG2A 1EWEA 1DJNA 1DBTA 2ZA1A 2OCZA 3BLEA 3K30A 3ZFHA 4H4IA 2EAWA 1NFBA 3O16A 4Z0JA 2E6DA 2ZBTA 4GFSA 4O13A 3STFA 3G3MA 3PB2A 1FCUA 1WBHA 3FKKA 4JX4A 5TBOA 1HUVA 1YTDA 1AK5A 4C1KA 3FJ6A 3N14A 1Q6LA 1S3HA 3O1NA 3RMJA 2GVGA 2JGQA 5HUPA 5TQLA 3PULA 4MY8A 1FWNA 1VYSX 3F1QA 3FA5A 3LXCA 3TDFA 3TW7A 3R89A 3F4WA 2ZZ5A 3GNNA 1QO2A 1D3HA 4AHOA 6ALDA 2NUYA 2CW6A 3P80A 3DFOA 2TYSA 3FFSA 3M5VA 4LWWA 2CZDA 1DL3A 4LC6A 3G1FA 2OMAA 3DI0A 2R8WA 1GG1A 1VLWA 1VH7A 2NXHA 2A0NA 1ICSA 2ZZ6A 5EKYA 2XFWA 1P1XA 1KM3A 1ZY9A 1F7BA 5G4WA 4N6EA 4FIQA 4HPXA 3W1NA 2V9DA 3ABSA 3EWUA 1ZAIA 2Y88A 3IVSA 2X2GA 4ZQPA 1V5XA 3W75A 2B0MA 2VC6A 3P81A 3G8RA 3P5YA 3PSVA 1ML1A 2RDWA 4UFKA 3P8IA 2A7PA 2JKEA 3HGRA 3IEBA 3TA6A 1J5TA 2ALDA 5J5DA 2VEPA 4O28A 4A2SA 1BKSA 4I7VA 2ZA3A 4WUIA 4UIOA 4N2YA 1BWLA 3E9AA 2GJLA 1KFKA 1CX9A 4JY9A 3PBYA 4ONVA 1K3UA 2YZRA 3QRHA 1YDVA 5K4ZA 3EWYA 4I9AA 4QJ1A 1JCYA 3S5YA 3NPXA 3TQ0A 2E5DA 5AFDA 3W7LA 2NXIA 4DF1A 3G0XA 1JUBA 3W7RA 4AWUA 2GVJA 4Z08A 4GUHA 3TQKA 4GWEA 1VS1A 3M0ZA 1XXXA 3W7OA 4CNPA 3LBCA 4X2RA 1S5WA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 1XI3 A;  3CLM A;  4MUZ A;  1JJK A;  1ZJI A;  2Y6Z A;  2YW3 A;  1VJI A;  1IGS A;  2YW4 A;  4IMD A;  4NJK A;  1C8V A;  5F1V A;  2G96 A;  3NQE A;  1RD5 A;  5F4X A;  3N2M A;  2H90 A;  3HPS A;  3HMJ G;  3W86 A;  2C15 A;  4O1A A;  4O54 A;  1QWG A;  1EUA A;  1LYX A;  3M41 A;  3TFC A;  3UWW A;  3EX6 A;  3MJY A;  3LGE A;  5AHI A;  1T0O A;  5KMY A;  4HIB A;  3GKF A;  4GXM A;  3GB6 A;  1CI1 A;  4UC5 A;  4K8H A;  2NUW A;  3T40 A;  2DZX A;  3UWZ A;  1JR1 A;  4XUG A;  2VOM A;  1F74 A;  2WNN A;  4DO5 A;  1EUN A;  1VR6 A;  2XN2 A;  4GRS A;  5F4S A;  3EXR A;  3TIM A;  1DV7 A;  4UUI A;  1GYN A;  1UAS A;  2V82 A;  3G1Y A;  2X30 A;  4CNN A;  1IXP A;  4WY0 A;  4O16 A;  3LI0 A;  1THF D;  3IIV A;  3QH2 A;  3G18 A;  1ONR A;  3CWN A;  4NX5 A;  5G4E A;  2ISW A;  3HG3 A;  3E12 A;  3YPI A;  3A22 A;  2E5C A;  3LI1 A;  3BW3 A;  3B0U X;  1NSJ A;  1XCF A;  3JR2 A;  3C2F A;  1FCB A;  1G7U A;  2HSA A;  2C6Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3STG A;  1V6Y A;  3GVR A;  4AHP A;  1X7F A;  5H91 A;  1CCW B;  5ABT A;  3NTY A;  4B92 A;  2H9A A;  2QUT A;  3WQ5 A;  3G1H A;  3UCQ A;  4Y7E A;  3AIW A;  1GVY A;  4PBE A;  1UR0 A;  4CU8 A;  3GUW A;  4C6C A;  2FFC A;  3BAK A;  2XZ9 A;  3BJS A;  4PMO A;  4RZ6 A;  4YWS A;  3HMC A;  3W87 A;  4QAI A;  1IEQ A;  1AQM A;  3AS3 A;  1MRQ A;  3BO9 A;  1UWR A;  2V3D A;  1M68 A;  3ANU A;  4YU1 A;  1SR9 A;  4KET A;  3DFY A;  4M5P A;  5ECV A;  1EZW A;  1MFV A;  1UQZ A;  2X7V A;  2J9X A;  3HGO A;  4UR7 A;  1ONW A;  3WJS A;  3ITO A;  3PP7 A;  2OEJ A;  3T8Q A;  5XIA A;  4ZFM A;  4DIA A;  3ITT A;  4YMZ A;  1H1Y A;  1VYP X;  4TVU A;  2XFY A;  6PTD A;  1IEX A;  3QM3 A;  2BWG A;  3HGJ A;  4ML9 A;  4PUM A;  5JBE A;  1E1F A;  1E4N A;  1UUM A;  4CN6 A;  3LUT A;  2QCE A;  3TYE A;  3WBA A;  5E9X A;  2QCD B;  4FEZ A;  4QJ4 B;  1PHQ A;  1HFB A;  1XH2 A;  4PTM A;  1S2C A;  2A5H A;  3TAO A;  2YDA A;  3R7M A;  3HM7 A;  4CQA A;  1OFQ A;  5M17 A;  1CEC A;  3DBP A;  1XIJ A;  4RDW A;  2JFE X;  1OK6 A;  3RJY A;  4QJ5 B;  1Q6Q A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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