3W1QA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with nl-2
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with NL-2
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 104
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1qA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1qA01
4LT9A 2TMDA 5BW6A 4BK9A 4BR1A 3FIGA 3PSWA 5KZDA 1SO3A 4RK8A 3W1UA 4DPQA 1DVJA 3KOFA 4HNTA 3L67A 4K7YA 3TSMA 4DF2A 1YTDA 4JS3A 4O57A 4MY1A 3BLEA 3CWNA 1YYAA 3UYCA 1DQWA 4NNAA 3DFQA 1TPB1 5EA9A 1YXCA 4ZVJA 1DBTA 3T40A 1OFAA 4H4IA 2EAWA 3EWYA 3NA8A 3W3OA 2QUVA 3S5YA 1HG3A 2VFEA 4FX7A 4FNRA 3F03K 3IIZA 3V1PA 4PCFA 1K02A 5LHFA 1AG1O 5AHMA 3MMTA 1JQXA 3GIYA 1MO0A 2RHGA 1L2UA 4QNEA 3QF0A 1SPQA 3ABRA 4EOUA 3EWZA 3NNTA 2V82A 1C9DA 2CU0A 4X3ZA 3KRSA 3GYEA 1ZHAA 2HTMA 1OG0A 2X1TA 3AJXA 3HG4A 3FS2A 4QSHA 3Q37A 2PRMA 1OF8A 2JKPA 1Q6QA 4NJGA 3SGZA 5U4NA 2NV2A 3CPRA 2ZTJA 1W37A 4DO4A 4A2SA 3NPXA 4O14A 3L9CA 2A2IA 1YDOA 3TQVA 3IGUA 4ORIA 3P67A 2QKFA 3P61A 4LU0A 1VHCA 5G2HA 3DXIA 3OVPA 1FXQA 3V75A 3B4UA 3P84A 4LC8A 3TH6A 4ZMGA 2OX1A 3EWWA 3QSTA 4ZQRA 3MHGA 3M5XA 3GDKA 4M7TA 5DCBA 3WJXA 4Z0JA 3EKLA 4UIOA 1KBIA 3VNDA 1B57A 3A24A 1OFRA 2JKAA 1VR6A 3GDMA 5AYZA 1KM1A 2A0NA 4JTEA 5F2GA 1N55A 3A21A 1XXXA 3W1LA 2I9EA 3C3NA 2C15A 5DCEA 1NF7A 3C52A 4HSOA 3QM3A 3IVUA 3TC6A 1M6JA 1K8YA 4DF0A 3DBPA 3N34A 1AL8A 1TO3A 3NZ1A 2ISSA 3O8AA 1ICSA 1PHQA 1K8ZA 1SO6A 5DBUA 1H7XA 2ATSA 6TIMA 2CLIA 4X2RA 4NX0A 3PG8A 2DZTA 2EF9A 3HIJA 3GDLA 4O16A 3JRKA 4PC8A 3N9SA 5LZLA 4IOTA 3W1TA 2Y7GA 4E38A 4ZQCA 3ZFHA 5HULA 4OBTA 1H63A 1ONRA 2YZRA 2I14A 5I3KA 3NL5A 3MO7A 4YCPA 4OHQA 5K9DA 1KTBA 5C55A 1SU5A 2R14A 2Y70A 3W7EA 5D04C 2WQPA 3G1DA 3CEPA 1FUYA 1ZNNA 5A8GA 1LTDA 1JCYA 1BWLA 2JBMA 1OJXA 1SO5A 5FF2A 3S6DA 1NEYA 3NM1A 1SSGA 4AAJA 3BW3A 3C2FA 1H5YA 3OA3A 2NXHA 3S1VA 1QPNA 4LVBA 1KM0A 4GUGA 1FBAA 2YCEA 1H7RA 2GQAA 2G5WA 4K37A 4A22A 3UD6A 3HJZA 2C18A 3DFNA 5AC7A 3HQ1A 4IMEA 4DEFA 1TTIA 4HN4A 4O4VA 1VLWA 1XUUA 2C13A 4W9TA 5EL1A 5EBUA 1Q6LA 3UWVA 4JTIA 2QAFA 3NM3A 2WSYA 3EXRA 3OIXA 1ZENA 3O16A 1FQ0A 5HUOA 3L21A 5TQLA 2W0UA 1XFBA 1KFEA 1C8VA 1P1XA 3TFCA 4JD4A 2FB2A 5LHEA 1QO2A 3NQAA 3PC0A 2ABBA 1TV7A 3W7OA 3F1QA 3W85A 4GBUA 3P8JA 1V7YA 3VI2A 4MUZA 4JX4A 3P62A 1P0NA 3GZ3A 1WQ5A 1ADOA 4ZQMA 3B0UX 4O15A 4OE7A 1DQXA 1QCWA 4AHOA 2ABAA 2B7OA 1KV5A 4NZJA 4UCGA 3A5VA 1XCFA 2Z2UA 2A21A 1YDVA 1LRQA 4N02A 2CLFA 1U5JA 3FYPA 3LTPA 2V8ZA 1IXOA 2VEIA 2Y89A 2Y7EA 7TIMA 4UTTC 2Y6ZA 1EA0A 4P61A 3E12A 4GC4A 1L6SA 2V81A 3QQ1A 4JIPA 3EKZA 2ZQ0A 4L4MA 1RR2A 4O17A 1AW5A 3HGSA 1BTMA 4CQ9A 1VLIA 1YLVA 5F4XA 2GJNA 4UTLA 3FJ6A 4UFIA 1PCWA 3O6DA 3TIMA 4LVAA 1NFBA 4NUWA 5HWJA 2VFFA 3LCIA 3MHFA 1LBMA 1TV8A 3F4WA 1EP3A 1UBSA 3HGRA 1KM6A 1G69A 3LTSA 4MZYA 1LBLA 3A5FA 1DHPA 2O7QA 5A5WA 1R46A 2QCDA 3TX9A 3U2OA 3LGEA 1ZCOA 3NQCA 3O6CA 3B0VC 4LOCA 3SZ8A 1KFKA 3UXDA 4LUIA 3PB2A 1SFLA 2P0OA 2A5HA 2WO5A 3TQ0A 2WV8A 4LV4A 4UR8A 4UTKA 1EX5A 3NOEA 4NJKA 2H3BA 1YDNA 1DJNA 5HJLA 3BGJA 3O15A 1DKWA 3LHVA 3H54A 4JGDA 3R13A 4PTNA 1TPWA 5CZJA 4K7VA 4HNVA 3I7RA 4FHAA 2ZZ4A 2TRSA 2EHHA 2G95A 1TSIA 4FNSA 3HG5A 2DJLA 1W54A 3LLFA 3HO8A 3W87A 4J9JA 1W5OA 3HPXA 4O54A 3QH2A 3W1QA 2QCDB 1Q45A 1C29A 1OYBA 4MFEA 6ALDA 3B03A 3RFAA 1LLZA 5EPDA 4ORMA 1ZAHA 2VXNA 4QITA 5C6MA 1AK5A 4AWTA 1B9BA 4IMGA 4K6AA 3QSRA 1MEHA 1PVNA 1Z41A 2NV1A 3NPVA 3N3MA 3W1XA 1YTEA 1L6YA 3W88A 3TMQA 3UWQA 4IX2A 5MHBA 4MYXA 3RU6A 3CIXA 4M7SA 4MKNA 1O95A 3R89A 4AHQA 3ABOA 2GUUA 2A7NA 3G24A 4JTTA 3OVQA 4UMBA 3L0KA 2V2HA 3NQ8A 1T96A 4Y6GA 8TIMA 2E6AA 1FDYA 1S3HA 5HMSA 5HUPA 1VQTA 5J5RA 1M7OA 2A7PA 4DBDA 2YYUA 4QNWA 2P10A 4O19A 4UMCA 3S5OA 3LXAA 4FO4A 4M5PA 3W1PA 1A5CA 1WX0A 1LCOA 3GK0A 3GAKA 5I3HA 4BWLC 3G22A 3H53A 3DFOA 3Q58A 3VE7A 3LCXA 1H7OA 4R34A 1ME8A 2EPHA 1ICQA 3NZRA 1RQEA 2NXIA 2CLOA 3STCA 3C61A 5G1YA 1N8FA 1GTEA 4Q32A 3EWXA 1WOBA 3W23A 2QJGA 2B4GA 2V5LA 2ZRWA 1LRTA 3TC7A 1I8JA 1FWTA 1OK6A 4K38A 3T44A 1SSDA 1CX9A 4GRSA 5LGZA 1TQJA 3SGUA 3W7JA 1ALDA 2OT1A 2ZA2A 4NJIA 3NXFA 3TW7A 2J24A 1JCNA 2FDSA 3SY5A 3EWUA 3P74A 4N6EA 3SSJA 3G0XA 4NX5A 1G4EA 3UZ5A 4HSNA 3UWZA 1VC4A 1G4SA 2GVLA 3SECA 3NQEA 4JTSA 3P8IA 3GXPA 1L9WA 3N2XA 1Z48A 2NUWA 2BZNA 4IMCA 2NXGA 4JY9A 1FDJA 2YDAA 3L5AA 3DFPA 5LNVA 1GVOA 3EX2A 3W2UA 1WBJA 1W5NA 2CLLA 5FESA 1AL7A 4FNQA 4QM1A 4MJMA 4HPXA 2J6XA 5AC8A 4LVGA 1K7EA 4R53A 3PAJA 3CIWA 1LOSA 3EX4A 1PHWA 1SZFA 1FWRA 4N2YA 4UTMA 5DCDA 4MY9A 1A5SA 1W3TA 4RZ4A 2QCGA 4AB4A 1GG1A 4UTIA 2ZZ3A 3BGGA 4O0KA 2CFFA 4P2VA 4BF9A 1F76A 5LGXA 3GKAA 1FCUA 3GLCA 3S0CA 5CG7A 4DF1A 3QZEA 3D0CA 2C0AA 3PBVA 1XDMA 2IQTA 3THQA 3NO5A 2CW6A 3NVTA 3STFA 1NAL1 1I2RA 2RDTA 3P7YA 1LOLA 1OX5A 1OK4A 2Z6JA 3QJAA 2NLIA 2DZXA 3F4NA 3Q94A 3PB0A 1L6WA 3C2RA 2C6QA 3TUUA 5KSWA 5FEXA 3UZJA 1T0OA 4M19A 1D3GA 3MW7A 3PR2A 4ADSA 3BG3A 5I3IA 4KFNA 2ZRYA 4I9AA 5D2TA 2PRLA 1XBVA 3IIPA 3PF3A 3M7WA 4M6PA 4GFSA 1KTCA 4UTWA 1GYNA 1FDZA 4XTIA 3E96A 3IV3A 1TTJA 5K4ZA 4R7JA 4RR4A 3P5YA 3FYOA 1IF2A 3LBCA 3G0SA 3R12A 3W75A 3O07A 4JTGA 3T55A 3NDOA 4O1AA 4XBSA 2ZA1A 3BK0A 1TJPA 1DORA 4NT0A 2DU2A 2X30A 1OYCA 3HG2A 2PURA 2JK2A 1GOXA 1MEIA 2V5BA 3TSDA 1KW1A 3NQGA 4NNBA 3TDFA 5CPLA 1P0KA 4Z1BA 3HGJA 3G1VA 4WZHA 1W3IA 3PS7A 2J9YA 4UTJA 3FEMA 5GVJA 4ZQOA 1SZEA 3W7DA 5CZSA 2QDGA 4ZL1A 1HO4A 4Y96A 4ADTA 2DP3A 1TPEA 3M47A 3DI1A 3NGJA 1RV8A 2H6RA 1JQVA 4RV8A 3SIZA 3OHIA 3W2MA 1TRDA 4FNTA 3IRDA 4X22A 1ZY9A 5BMWA 4GE8A 4IXXA 4LVDA 2A6LA 4TIMA 2WSQA 2FPYA 1AMKA 3PM6A 1XDLA 3O63A 4Y9AA 1RD5A 3LCFA 3WJYA 3MUXA 4GUIA 3I7SA 1VHNA 4MZ8A 3UXAA 2Q3RA 2GPTA 5K9XA 4UFKA 3C8FA 5BOOA 3W73A 3TAKA 5L9FA 4IMFA 2A7RA 1SUXA 1X6UA 2Y62A 4LTSA 2C1HA 1Y0EA 1G4TA 1EB3A 1JUBA 1TPFA 3UNDA 1N7KA 5KITA 1P5BA 3UPBA 1I2QA 2GVJA 3LXBA 4LV9A 3BV4A 4Y8FA 3LCHA 1JULA 3QMRA 3S42A 3ZWSA 3HOJA 2YX0A 3QMTA 3M0ZA 5FEZA 2CZ5A 2A85A 4A3UA 1QR7A 2E6FA 2ZZ6A 3H55A 1I2PA 2ZBTA 2GOUA 3TCEA 1JR1A 1S5VA 1JCLA 2E6YA 1FCVA 3MJYA 1YPIA 3L2IA 5DXYA 4MY8A 5C2XA 2PE4A 3P81A 4K8EA 1UUOA 4JYEA 3T78A 2H8XA 5CGQA 1W3NA 4IX0A 3PBWA 3G1YA 4AF0B 2QJIA 1WAUA 4ZQNA 1FCBA 2CWNA 5CPOA 2NX3A 4FEZA 3W74A 3BG9A 1D9EA 4XUGA 4YL2A 1KLYA 2CLMA 4FNUA 3ZS4A 3G0UA 4O52A 2CZDA 4LRTA 4DBEA 2BLEA 1GYLA 4UFLA 1WBHA 2QJHA 5AYXA 4N4QA 1B3OA 3NQ2A 1KM3A 1I2NA 4XQ6A 5HQEA 4WOZA 1ZALA 3TAOA 4AXKA 1OHLA 1W5QA 1NVMA 3VKJA 1GVSA 1GVRA 1RPXA 3IIXA 4IMDA 2J9ZA 4G1KA 2NX1A 5AB3A 4FIQA 4PH6A 2B7NA 5EY5A 2E09A 3HMJG 1LOQA 4CNNA 4IJBA 2D73A 3Q2DA 2C3ZA 2X16A 3LM7A 1QAPA 4JTJA 5G5IA 5LNWA 1M7PA 1PE1A 1VCVA 1LP6A 4OQVA 1F74A 1UB3A 1OX6A 4HKPA 4U4MA 3JR2A 1UCWA 3IGXA 2J9XA 5FF3A 3UY7A 2ZRUA 3LCGA 4IPJA 4NVTA 3LCLA 3N19B 4S2BA 3W72A 1KTNA 1Q3NA 3L5MA 4IGHA 1THFD 4QJ1A 4HHPA 5C5YA 3SFKA 3HPZA 3DFTA 1RQHA 3O06A 3M43A 5D05A 3QPZA 3BW4A 3QYQA 2ISVA 2X2GA 1BWKA 1TIMA 3W7MA 2VEPA 3W22A 2RFGA 4AWSA 1H60A 4FF7A 1O4UA 5AHEA 3O6YX 2E5DA 2ZA3A 5I3FA 4WY0F 5HR7A 3RLVA 1F2JA 4CNPA 2FIQA 3OEXA 5G1TA 1QO5A 2W6RA 1UASA 2BWGA 2VENA 4OV4A 5I3GA 1HO1A 3TA6A 3E0IA 5CZ0A 4JTUA 5IM51 3G1HA 1QPQA 1WDWA 3M5YA 2QCFA 4UNLA 1JUKA 1PCKA 3CB8A 3TXVA 3K30A 2E5CA 4JEQA 4K8HA 3WK3A 1Z42A 3RLUA 3T4CA 5HINA 1W5PA 3RMJA 2FPTA 4LVFA 3W7PA 1EWEA 3KRZA 3QPYA 1OFQA 4TX9A 4AWUA 1SW0A 4JYDA 3TSBA 3S1XA 1UUMA 3KXQA 4EF8A 1O94A 4XKYB 1QPOA 2FB3A 1TV5A 1F6PA 3LHYA 4IWWA 3N73A 3NQVA 4O18A 2WNNA 4JR5A 3BO9A 3T7VA 3P82A 3EX3A 2BX7A 5TIMA 3NQFA 3B8DA 4UFMA 3L65A 3MP5A 2WKJA 1VYSX 1IIGA 2QR6A 2CLHA 3E49A 5D2XA 2QCCA 2CLEA 2ZRXA 4OT7A 3ELFA 4JX5A 2YPIA 2UV8G 3THAA 4TMBA 3C0JA 3JS3A 4UFJA 4Q4KA 3ABQA 3LV5A 3TU9A 5H91A 1TCDA 3ANYA 1G6CA 2E1DA 3EEGA 4O11A 3LERA 3LLDA 4YMZA 3LI0A 1KLZA 3S8HA 2C16A 2GVGA 5F2LA 3SJ3A 4R33A 3W7NA 3R2GA 4LS2A 1ZAJA 1VH7A 2V0TA 4XTDA 3R8RA 1J5TA 4NJHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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