3W6BA

Crystal structure of catalytic domain of chitinase from ralstonia sp. a-471
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
PPTNPPTTVTKPAEVPSRIWTYVMNADNAYGKGGDFALLLSAVIKKESYFGDGLSGSPSAGDGLMQVEPNTRNAYLSQFSAKYGHAYNHSSEQDQVYMGSLILNEKIVRFGSIYSGLLHYNGGDYWYPGATDSYGRPILADQYANTVYAQYKSYGGRYSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Ralstonia
publication title Crystal Structures of the Catalytic Domain of a Novel Glycohydrolase Family 23 Chitinase from Ralstonia sp. A-471 Reveals a Unique Arrangement of the Catalytic Residues for Inverting Chitin Hydrolysis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme-like chitinolytic enzyme
total genus 61
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w6bA00
4XENA 3LHMA 3TXIA 1B7NA 1G7LC 1C46A 4LT1A 4UWUA 3J4GA 3ZVQA 9LYZA 4MR1A 5I5QA 4LYOA 1HELA 4XJGA 1KXYA 4MCKA 1HFYA 3CB7A 4HJYA 1XEJA 1GAYA 3A3RX 3CT1A 1IOQA 1LSCA 4DYGA 5B07A 5T3FA 3TMWA 5ILCA 1ZV5L 1GFVA 2YBJA 4GCEA 3AYQA 4H90A 5C6LA 3AZ5A 2HEBA 4NWEA 3HBEX 1B5ZA 1BWIA 4NIJA 5HNLA 4B4EA 4W94A 4B4JA 2FBBA 1FKQA 3WUAA 5A3ZA 4RDSA 2GV0A 1IEEA 1HMKA 3WXTA 1UIDA 1XSFA 1B7RA 1EQEA 1UIEA 1VDSA 2Z19A 4H1PA 1JHLA 2YBHA 1NQIA 2W1LA 2ZYCA 1LJHA 2MEDA 2VB1A 5LIOA 1CKFA 4WM6A 4GCFA 1IX0A 2YVBA 3WW5A 2ZIJA 1CKGA 1J1XY 3N9AA 5APDA 1IP2A 4HTKA 3WH1A 3RU5A 3D9AC 1GF5A 4GCDA 2BQJA 1QDRA 2LZTA 1PZYA 4H94A 5KXNA 4XJFA 1E8LA 1O23A 4AXTA 1VFBC 1JTOL 1VDQA 5LXWA 4NGLA 3M3UA 2LYOA 4TUNA 1LJ3A 4WM1A 4LT0A 5HMVA 4LYZA 1UUZC 1G7IC 1IOCA 2DQIY 4ML7A 4TTDA 4Z3MA 4H93A 3A93A 2A7DA 1LHIA 4OW1A 5FSTA 1LMNA 4DD1A 1IOSA 4ZFPA 1YIKA 3ATOA 1JIYA 1W08A 2G4PA 4G4CA 1LZ1A 2N5ZA 5AMYA 4B0DA 4DT3A 4CJ2A 2BLXA 3QY4A 3W6AA 207LA 1QIOA 2IHLA 3WL2A 1WQOA 1LZ6A 2BQDA 3LN2A 2B5ZA 1GEVA 3IWRA 4YOPA 4WLXA 5DN5A 1LJ4A 1IWXA 3W6EA 3WU7A 4B1AA 1TBYA 1EL1A 5F14A 1JJ1A 2BQEA 4TSBA 3RZ4A 1HC0A 1IVMA 4R6CA 2MEFA 1MELL 1CNSA 1HEPA 4DD9A 5IHGA 2MEGA 4J7VA 5F81A 1NKHA 1C7PA 1INUA 1YKZX 4BADA 5K7OA 5LVJA 1RCMA 1D6QA 4ZEEA 1KXWA 1RFPA 5KXOA 1LSFA 1LZ9A 1YQVY 1BWJA 3CQLA 3A34A 4PJ2C 4PPOA 1GE0A 1LJEA 1SLYA 5KXSA 4YF2A 1GE3A 1J1OY 1LZSA 5KXZA 2BQLA 2DQGY 1JKDA 1VEDA 2Z37A 3GXRA 3N9CA 3WMKA 1XGUC 2D6BA 134LA 4PRQA 1BVKC 2NWDX 3EXDA 5JENB 4WG1A 1LHMA 4OWHA 3LZ2A 3A94A 1QSAA 1OUCA 2DQEY 1YAQA 1JPOA 2D4IA 5FELA 4D9ZA 1D9UA 2YBMA 1GB9A 2Z39A 3TXBA 4H9IA 3D3DA 1UACY 3LYZA 4GCBA 2ZNXY 2Z38A 5FDJA 4QY9A 5LVHA 1IWWA 1RJCB 2BQFA 3OJPA 1GF8A 1T6VL 4N1EI 1LKRA 4DD3A 5KY1A 1HEWA 4KL7A 3WU8A 4HTQA 4DDCA 1LZRA 1QSWA 154LA 5F9XA 1IWTA 4X3BA 2Z12A 1JJ3A 1B0DA 1B7SA 4NG1A 4CGEA 2H9KA 4NSIA 1LZTA 5F9UA 1GFHA 1H6MA 3T6UA 2MEBA 1LZDA 1UC0A 1HENA 2DBTA 2F4AA 4RW1A 4XJBA 5LYZA 5C6IA 3LYTA 1F6SA 5FCPA 2BAAA 1LSBA 1YILA 4NY5A 3F6ZA 3P66A 3RW8A 4AGAA 1UICA 1LZEA 208LA 1LMTA 3EO5A 4HJZA 8LYZA 1JKCA 4OWEA 4C3WA 4WM2A 4C5FA 1HEOA 3ATNA 1LYSA 1BVXA 3J6KA 1NBZC 2EIZC 3ZEKA 1LSMA 3WULA 1LZBA 2WARA 4NGOA 1RI8B 3TXGA 1BQLY 1DI4A 1UIHA 3LYOA 5DM9A 2YBLA 2D4KA 4WM5A 1HMLA 4PGJB 4J1BA 3GXKA 4G9SA 1AZFA 1CJ8A 4WO9A 5LVKA 1BB3A 4GLVA 2DQJY 2XJWA 1GFJA 1ZMYL 1AKIA 1DXJA 4H9BA 4ET8A 4XJIA 3IJVA 5L3IA 1OUIA 2ZYPA 4G49A 1JISA 5L3HA 3W6FA 1CJ6A 3WUMA 1LHLA 1LYYA 1NDGC 4I0CA 4H9EA 4DD7A 1QQYA 1LJFA 5EBHA 1IWYA 2I25L 4E3UA 4EOFA 3TXFA 5HNCA 5HQ1A 5FEKA 4WG7A 3BKHA 193LA 3B0IA 4NSHA 1JEFA 1XFPL 4BS7A 1LYOA 5APFA 5KXWA 4ZIXA 4UWNA 4NGVA 4BAFA 1TEWA 4HV1A 4J1AA 4ETEA 4H9CA 2PC2A 4DD2A 1LZ4A 1BB4A 1G7JC 5I54A 1TAYA 2D4JA 1WQQA 4HPIA 5KXMA 5IDDA 1GFGA 1FBIX 1FLQA 1G7HC 2DQAA 1B5UA 2YDGA 1LZAA 1GDXA 1FDLY 4PHIA 5LAGA 1JWRA 2W1MA 3AJNA 3AZ4A 4FDYA 4YEOA 2EKSC 5B05A 4GN5C 4WMGA 5LVIA 3LYMA 4LYMA 1JUGA 4IASA 1G7MC 1LJJA 1LJNA 1CKDA 2W1YA 5DLAA 2FBDA 1H87A 1YROA 2DQCY 1GF4A 3EMSA 4L41A 3AGHA 1IY4A 4KPMA 4WM3A 6LYTA 1NHEA 2EPEA 4GN3A 2G4NA 5KKIA 2IFFY 5KXTA 1XGRC 2CGIA 4PRUA 1IC5Y 4FJRA 1OP9B 4RLMA 3WXUA 1YAPA 1C45A 2I6ZA 4B49A 1IP6A 1B7MA 1GBWA 1DPWA 2BQKA 4M6DA 3B0OA 1GD6A 5APEA 2HEEA 3A90A 4GN4A 1C43A 4DC4A 5LVGA 1I56A 1A4VA 2YSSC 1HSWA 2ZQ4A 3TXHA 3LZTA 1HF4A 4NGYA 1JSEA 4TX7A 1KIRC 5M1YA 3A92A 1A2YC 3A3QA 1NWGA 1KIPC 1GB8A 5IELA 1YKXX 5I53A 2DQHY 1XEKA 1JITA 1DZBX 2HEDA 4YENA 1WVVA 5KXPA 3W6BA 1B5WA 1DKKA 3T36A 5L9JA 1GFUA 2BLYA 1IY3A 2BQGA 2HU1A 3G3BB 4NGZA 1ZVYB 3AW6A 4OOOA 4WL6A 1LSAA 1TCYA 3AZ7A 3WVXA 2CJLA 4LYBA 4NSGA 1DQJC 4HV2A 4MSTA 1GBOA 2MEEA 2F2NA 5E4PA 1B9OA 1JSFA 1LKSA 4WOAA 1BGIA 1CJ9A 1UA6Y 1JJ0A 2MEHA 3TXJA 5KXXA 2LZ2A 1HSXA 1LCNA 4DDAA 2MEIA 4EMNA 1GEZA 1ZVHL 2ZIKA 1IWUA 4M4OA 1VAUA 1CJ7A 3WPJA 1LSDA 1IP5A 4KXIA 5B59A 1FLWA 5I4YA 1J1PY 2RSCA 1NDMC 7LYZA 5LYTA 4NGKA 1GB7A 1GB3A 1HEQA 1LMAA 3MGWA 1OUFA 5FHWA 1XEIA 4N5RA 1LTMA 1LJKA 1LZ5A 2DQDY 2Q0MX 2LYMA 1C08C 1EQ5A 1YL1X 5LINA 1B5VA 3TXKA 4GCCA 2D91A 2ZILA 4ETDA 2LYZA 4RLNA 1WQMA 3A91A 3VWOA 4LZTA 1P2CC 1GAZA 2H9JA 5LA8A 1QUSA 1T3PA 4Z41A 3FI7A 1LMOA 3WPLA 2LHMA 1AT5A 1DKJA 3WPKA 3AW7A 4OWBA 1W6ZA 2EQLA 3B72A 3CT5A 2DQFC 5A3EA 4RW2A 5DN4A 1YANA 1GBSA 5KXKA 2HU3A 3QNGA 1GDWA 1HFXA 1GF6A 1IWZA 1AT6A 4ET9A 4TSCA 3SP3A 5J7CA 2C8OA 1GXV2 5ILFA 4WLYA 2BQIA 4YEMA 3A6BY 1GFEA 4H91A 3TXDA 4B4IA 1GFTA 1EQ4A 2HEFA 1IP4A 3EBAB 2W1XA 3TMUA 4OWAA 1C10A 1LSPA 5KXLA 1VDPA 1GFRA 1YL0X 4NFVA 1CKHA 1I1ZA 4TWSA 2Y8PA 1B7OA 4IATA 1OUBA 5HLLA 3WUNA 5F16A 1B5XA 1F10A 1REZA 1YKYX 3A8ZA 3CSZA 2Z2FA 4HJVA 1OUDA 1WQPA 1LPIA 1DPXA 1GPQC 1LZCA 3E3DA 1DI3A 2C8PA 1RE2A 4H9HA 2HTXA 2FYCA 2YBNA 5B1GA 4YM8A 3KAMA 4U3XB 1WQRA 4ETCA 2Z18A 3G3AB 1B2KA 1LAAA 1LJIA 1QUTA 1MLCE 2Z2EA 1IR8A 3P4ZA 3QE8A 4NGJA 4WL7A 4CFPA 3HBDA 2HEAA 3HFMY 4NG8A 4W96A 1F0WA 4NHPA 1LZNA 4Z46A 3W6DA 1HHLA 4NWHA 2BPUA 4HTNA 1NMMA 1IC4Y 1LOZA 3K3TA 4WLTA 2F4GA 1IP7A 1OUAA 4ETAA 3B6LA 3CT0A 4N9RA 1GE4A 1IR7A 1XGTC 3TMXA 1GBZA 1IP3A 5I4WA 4J0LA 1B7PA 133LA 1GFAA 1JTPL 1OUJA 4H8ZA 5D5CA 3RT5X 4XJDA 4A7DA 5KXRA 1FLYA 1UIBA 3W3EA 1LSEA 4NHSA 1OQMA 1IR9A 2H5ZA 2F30A 4N0JA 4O34A 3OK0A 3RNXA 1JTTL 5I4XA 4QGZA 1OUEA 3BKVA 4CFOA 1GB0A 194LA 1GF7A 1GF0A 1GXXA 4NHTA 1V7SA 3M18B 1LMQA 3ULRA 1UIAA 5KXYA 1HEMA 1UCOA 4CHXA 1DI5A 1LHHA 4ETBA 1UIGA 2G4QA 1WTMA 2A7FA 2BQBA 1I20A 2XTHA 3CSQA 1XGPC 1BHZA 5HMJA 1REXA 1D6PA 4P2EA 4ANRA 3WU9A 2XBRA 4WLDA 1GBXA 2MEAA 3AGIA 1D0KA 1HNLA 1KXXA 3WW6A 1NBYC 3FE0A 4BAPA 4OOTA 1IC7Y 1QDTA 1OUGA 1WQNA 4NEBA 5LAFA 4NHIA 1GB5A 1CKCA 3B0KA 3AGGG 1IP1A 1AM7A 1B5YA 1D0LA 1IORA 4LYTA 3N9EA 4NHQA 1V7TA 4NGWA 1JKAA 1XGQC 3P64A 4QEQA 5E9RA 1REMA 1REYA 2BQNA 4LGKA 4XADA 2CWIA 4WM4A 1VDTA 1UBZA 1IIZA 6LYZA 132LA 1JKBA 4DDBA 1BWHA 1LMCA 4NGIA 1GB2A 1LZ8A 1GE1A 1GFKA 1Z55A 1LSYA 4OWCA 1LSNA 1YAOA 1YAMA 3TMVA 3ZVQB 4DWXA 1NF5A 1HFZA 3WVYA 5KKJA 1GF9A 2ZNWY 3HBHA 4NSJA 5LA5A 1LHJA 4HPEA 1LZYA 1UIFA 1LYZA 1GB6A 1GHLA 3CSRA 4H9FA 4XN6A 1FN5A 1GWDA 1GF3A 1LMPA 1OUHA 3WYHA 2HECA 1D0MA 4XYYA 5APCA 1N4FA 5II3A 1F6RA 4LFXA 1SQ2L 3P65A 1IO5A 1LZGA 5B06A 5LYMA 3P68A 2FYDA 2CDSA 4GLAA 4N8ZA 4UWVA 2HUBA 5C6JA 4IJ4A 153LA 1GE2A 4QDNA 4R0FA 1IWVA 5D5FA 4H92A 1B7LA 4WO6A 1ALCA 2X0AA 3AZ6A 4DD0A 1KIQC 5KJ9A 1PS5A 1VATA 4HP0A 4LFPA 4Z98A 1LJGA 1WVUA 5DL9A 1QTKA 2I26L 1FKVA 1GBYA 1B7QA 3A67Y 2BQMA 4HSFA 4G4HA 1LSGA 1IOTA 2YBIA 2BQCA 4H9AA 4N1CC 4LT3A 1QTEA 3A95A 2MECA 1HERA 2ZQ3A 1WTNA 1BB7A 2BQAA 135LA 3A6CY 4KT3A 3TXEA 1FLUA 1TDYA 3A96A 4H8YA 4I8SA 3W6CA 2ZWBA 3AB6A 2AUBA 2BQOA 4II8A 1LHKA 4XJHA 4LYCA 2BQHA 4LT2A 5B1FA 2XBSA 2DKVA 1BB6A 4H8XA 1LSZA 3IJUA 4G4BA 1BB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LHMA 3TXIA 3DN2A 1G7LC 1C46A 3ZVQA 4MR1A 2RAZX 4MCKA 2NTHA 1XEPA 3CT1A 3A3RX 1LI2A 4DYGA 5B07A 4LDLA 5T3FA 2YBJA 4GCEA 3HDFA 3AZ5A 2HEBA 4B4EA 1BWIA 5HNLA 182LA 1L87A 3WUAA 1L45A 1LWKA 3HU9A 3L64A 1B7RA 1UIEA 3GUJA 2ZYCA 4ARPA 142LA 1SSWA 5LXWA 3M3UA 218LA 107LA 5HMVA 1C6HA 3A93A 1IOSA 1YIKA 4I7QA 1L29A 1JIYA 2RBNA 1LZ1A 200LA 2N5ZA 3C82A 4B0DA 175LA 3OE9A 1QIOA 234LA 1LZ6A 2BQDA 4ARMB 5DN5A 2BQEA 4EKRA 2MEFA 5F81A 1NKHA 1YKZX 4BADA 1L88A 1RCMA 1D6QA 1RFPA 1LJEA 4Z41A 167LA 1GE3A 1L86A 1G0JA 2BQLA 3GXRA 3N9CA 3WMKA 5JENB 4WG1A 3LZ2A 4YXCA 2DQEY 1JPOA 2D4IA 1L17A 4D9ZA 3UONA 1UACY 2Z38A 4I7OA 2RAYX 1C6NA 1LKRA 4HTQA 154LA 5F9XA 1L26A 199LA 4CGEA 1T8AA 2OU0X 1L74A 1L69A 2B6YA 1GFHA 2RBRA 4RW1A 173LA 1C6JA 1F6SA 4NY5A 1QT5A 1UICA 3EO5A 1JKCA 4C3WA 1L23A 4WM2A 1HEOA 3ATNA 3J6KA 1QT6A 144LA 3ZEKA 2WARA 259LA 1UIHA 3DN1A 3LYOA 2YBLA 1LYFA 141LA 3G3XA 3GXKA 4WO9A 5LVKA 4GLVA 1GFJA 1PQOA 1L06A 162LA 5L3IA 1OUIA 4G49A 1JISA 4E3UA 1L16A 3TXFA 1L76A 3SB5A 4NSHA 240LA 108LA 5KXWA 1TEWA 213LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4XEN A;  3LHM A;  3TXI A;  1B7N A;  1G7L C;  1C46 A;  4LT1 A;  4UWU A;  3J4G A;  3ZVQ A;  9LYZ A;  4MR1 A;  5I5Q A;  4LYO A;  1HEL A;  4XJG A;  1KXY A;  4MCK A;  1HFY A;  3CB7 A;  4HJY A;  1XEJ A;  1GAY A;  3A3R X;  3CT1 A;  1IOQ A;  1LSC A;  4DYG A;  5B07 A;  5T3F A;  3TMW A;  5ILC A;  1ZV5 L;  1GFV A;  2YBJ A;  4GCE A;  3AYQ A;  4H90 A;  5C6L A;  3AZ5 A;  2HEB A;  4NWE A;  3HBE X;  1B5Z A;  1BWI A;  4NIJ A;  5HNL A;  4B4E A;  4W94 A;  4B4J A;  2FBB A;  1FKQ A;  3WUA A;  5A3Z A;  4RDS A;  2GV0 A;  1IEE A;  1HMK A;  3WXT A;  1UID A;  1XSF A;  1B7R A;  1EQE A;  1UIE A;  1VDS A;  2Z19 A;  4H1P A;  1JHL A;  2YBH A;  1NQI A;  2W1L A;  2ZYC A;  1LJH A;  2MED A;  2VB1 A;  5LIO A;  1CKF A;  4WM6 A;  4GCF A;  1IX0 A;  2YVB A;  3WW5 A;  2ZIJ A;  1CKG A;  1J1X Y;  3N9A A;  5APD A;  1IP2 A;  4HTK A;  3WH1 A;  3RU5 A;  3D9A C;  1GF5 A;  4GCD A;  2BQJ A;  1QDR A;  2LZT A;  1PZY A;  4H94 A;  5KXN A;  4XJF A;  1E8L A;  1O23 A;  4AXT A;  1VFB C;  1JTO L;  1VDQ A;  5LXW A;  4NGL A;  3M3U A;  2LYO A;  4TUN A; 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 4WM4 A;  1VDT A;  1UBZ A;  1IIZ A;  6LYZ A;  132L A;  1JKB A;  4DDB A;  1BWH A;  1LMC A;  4NGI A;  1GB2 A;  1LZ8 A;  1GE1 A;  1GFK A;  1Z55 A;  1LSY A;  4OWC A;  1LSN A;  1YAO A;  1YAM A;  3TMV A;  3ZVQ B;  4DWX A;  1NF5 A;  1HFZ A;  3WVY A;  5KKJ A;  1GF9 A;  2ZNW Y;  3HBH A;  4NSJ A;  5LA5 A;  1LHJ A;  4HPE A;  1LZY A;  1UIF A;  1LYZ A;  1GB6 A;  1GHL A;  3CSR A;  4H9F A;  4XN6 A;  1FN5 A;  1GWD A;  1GF3 A;  1LMP A;  1OUH A;  3WYH A;  2HEC A;  1D0M A;  4XYY A;  5APC A;  1N4F A;  5II3 A;  1F6R A;  4LFX A;  1SQ2 L;  3P65 A;  1IO5 A;  1LZG A;  5B06 A;  5LYM A;  3P68 A;  2FYD A;  2CDS A;  4GLA A;  4N8Z A;  4UWV A;  2HUB A;  5C6J A;  4IJ4 A;  153L A;  1GE2 A;  4QDN A;  4R0F A;  1IWV A;  5D5F A;  4H92 A;  1B7L A;  4WO6 A;  1ALC A;  2X0A A;  3AZ6 A;  4DD0 A;  1KIQ C;  5KJ9 A;  1PS5 A;  1VAT A;  4HP0 A;  4LFP A;  4Z98 A;  1LJG A;  1WVU A;  5DL9 A;  1QTK A;  2I26 L;  1FKV A;  1GBY A;  1B7Q A;  3A67 Y;  2BQM A;  4HSF A;  4G4H A;  1LSG A;  1IOT A;  2YBI A;  2BQC A;  4H9A A;  4N1C C;  4LT3 A;  1QTE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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