3W6BA

Crystal structure of catalytic domain of chitinase from ralstonia sp. a-471
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
PPTNPPTTVTKPAEVPSRIWTYVMNADNAYGKGGDFALLLSAVIKKESYFGDGLSGSPSAGDGLMQVEPNTRNAYLSQFSAKYGHAYNHSSEQDQVYMGSLILNEKIVRFGSIYSGLLHYNGGDYWYPGATDSYGRPILADQYANTVYAQYKSYGGRYSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme-like chitinolytic enzyme
publication title Crystal Structures of the Catalytic Domain of a Novel Glycohydrolase Family 23 Chitinase from Ralstonia sp. A-471 Reveals a Unique Arrangement of the Catalytic Residues for Inverting Chitin Hydrolysis
pubmed doi rcsb
source organism Ralstonia
total genus 61
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w6bA00
2F2NA 2ZYCA 1EQ5A 4LZTA 2EPEA 1KXYA 3M18B 5KXTA 4Z46A 3TXKA 3LHMA 2NWDX 2I6ZA 1GB2A 1C43A 1UIFA 2D6BA 1UIAA 1LZBA 5I4WA 2DQEY 4GN4A 1LHMA 1KXWA 1GB3A 4LYMA 4WL6A 4R6CA 1NBYC 1LJFA 5KJ9A 1LJIA 4LGKA 1UIGA 3RNXA 1VDSA 4AXTA 1MLCE 4NY5A 1IY4A 2YSSC 1UA6Y 2DKVA 1AKIA 2BQGA 2H9JA 5IHGA 2YBNA 4HPEA 1LSAA 4P2EA 4WLXA 1GBXA 5II3A 1QUSA 1UUZC 1C08C 153LA 5DL9A 1NHEA 1IOCA 1IWZA 1G7HC 1UBZA 1JJ0A 3A93A 3FI7A 3HBEX 1FLQA 1WVUA 2D4JA 4UWUA 5KKIA 5KXLA 1LYZA 2F4AA 1XGRC 3CT5A 1YL0X 3A3RX 1D6QA 4NHTA 1EL1A 4BS7A 1GFKA 4QDNA 2LYOA 1XGQC 4E3UA 1I1ZA 3B0KA 5HMVA 3E3DA 5KXYA 2BQNA 133LA 4LYBA 4C5FA 1GXXA 3F6ZA 2LYMA 1REMA 4J7VA 4RLNA 3WU9A 2LYZA 3W6EA 1LSBA 1TEWA 3ZVQA 1LZCA 4GLAA 1XGUC 4H9EA 4OWBA 1JTPL 1NQIA 1OUGA 2HECA 1CKDA 1GB5A 3WUNA 2ZWBA 4GCFA 1QTKA 4H9FA 1ZVYB 1T6VL 3A34A 1IIZA 5FSTA 4YEOA 5B1GA 1GB8A 1LSYA 1JSFA 4UWNA 1YAOA 4NWEA 5KXZA 3W3EA 1GE2A 4G4BA 4X3BA 1LHLA 2MEAA 2YBMA 1D0KA 1LJGA 3GXKA 1LOZA 1JPOA 4WG7A 2HEAA 3A67Y 4DDBA 2FBDA 1GDWA 4LFPA 3CT0A 1J1PY 1B5ZA 1JEFA 1T3PA 1B9OA 1RE2A 2MEDA 4H92A 1YIKA 4WO9A 4NHQA 2F30A 1JTOL 4XENA 1LMNA 3T36A 2G4PA 2HU1A 3A6BY 1B5VA 1GB7A 1LJ3A 2G4QA 2XTHA 2ZNXY 4YM8A 2HEEA 1JKDA 1QDRA 4QEQA 1IR8A 1IC7Y 5IDDA 4HTQA 2FYCA 1JIYA 1LKSA 132LA 3W6AA 5FCPA 5C6LA 5B1FA 193LA 1UIDA 2BQFA 2IHLA 1UICA 1XGTC 2EIZC 1FLWA 2BQOA 4NHPA 5DLAA 3AZ4A 5E9RA 3EBAB 4DWXA 4G49A 4H9BA 3CQLA 4CFOA 3A6CY 135LA 1NDMC 1GDXA 2YBJA 4N0JA 1D9UA 1YAPA 1LHJA 1V7TA 5FEKA 2F4GA 1RFPA 4QY9A 4WO6A 4IJ4A 2Z37A 1IC4Y 4ZEEA 3B0OA 1HFZA 4WLDA 1NWGA 1UCOA 2YBIA 1LMCA 1LJNA 1PZYA 2RSCA 5KXPA 4LYZA 1WQRA 3WH1A 1REYA 1IC5Y 4XJFA 5B07A 3ATOA 1G7IC 4IATA 4DD0A 1B2KA 1B5UA 1GE1A 1YKXX 2GV0A 4HP0A 3W6CA 5FELA 3TMVA 4LYOA 2Z18A 5I53A 5LINA 4N9RA 5APDA 4W94A 1H6MA 3WW6A 207LA 4DDCA 1JITA 4M4OA 1IVMA 5KXKA 1FLYA 3A95A 4NGWA 1JJ3A 4A7DA 1IWTA 4PJ2C 1QSWA 5D5CA 5HLLA 1LTMA 2MEHA 1FKVA 4WLTA 1GBOA 1UIEA 1OP9B 4ANRA 2BQCA 2CJLA 3P65A 3WXTA 1GE3A 3GXRA 4LT1A 2ZQ3A 1KXXA 1XEIA 3B0IA 2C8PA 2DQAA 1IORA 5KXRA 4IASA 4H9AA 1B7NA 2LZTA 4FJRA 4QGZA 4TX7A 1GF6A 2X0AA 1D6PA 1WQOA 4FDYA 1LCNA 1LSDA 4MSTA 1GFGA 1LJ4A 1XGPC 2D4IA 4H8XA 4DYGA 1GD6A 1IOTA 4N8ZA 3WW5A 1IY3A 3OK0A 3P4ZA 1IOSA 3N9AA 5KXSA 1BHZA 3K3TA 3N9CA 1LYOA 4G4HA 3SP3A 1GWDA 1BWHA 1XFPL 4NGKA 1IR9A 1HEMA 1IP2A 3WPKA 4II8A 3QNGA 1ZV5L 3EXDA 5I4YA 3BKVA 4LYCA 3LYZA 1N4FA 1YROA 2BLXA 4LT0A 4NGIA 154LA 5DM9A 1IO5A 2CGIA 3LYMA 4ETBA 4WM4A 3N9EA 1B7LA 2Z12A 5LA5A 1LZNA 2YDGA 3HBDA 4XYYA 5B05A 4G4CA 1TAYA 2BQJA 1VDQA 1QTEA 4J0LA 1LMQA 2BQBA 194LA 3WL2A 1LHHA 2CWIA 1LMOA 2I26L 3IWRA 2Z39A 5L3IA 1BVKC 2XBSA 1GB9A 1HERA 1JISA 1IX0A 1CJ9A 5APEA 4GCBA 1DZBX 1GXV2 1QUTA 4H8YA 4B49A 4H9IA 4WM5A 4RW1A 1CNSA 1LZ4A 3RU5A 1HEWA 1DKJA 4Z3MA 5KXMA 4XJGA 2MEEA 3LZ2A 1GF0A 3QE8A 1HFXA 1JKCA 1IOQA 4GCCA 1A2YC 3ZVQB 2VB1A 1YKZX 1GE0A 1CKGA 1QDTA 1WTNA 1NBZC 2DQFC 1GF4A 4LT3A 4CJ2A 1DKKA 2FYDA 1AZFA 3HFMY 4NSHA 4CGEA 5K7OA 1LSFA 2HU3A 4H8ZA 5F9UA 4B1AA 1IP4A 1VATA 1BQLY 2BQAA 4L41A 3A91A 4H91A 3IJVA 1XSFA 5LA8A 1OUCA 2W1MA 5APCA 4B4JA 1IR7A 5LVIA 2ZNWY 1D0MA 2DQCY 4HTNA 1QQYA 4H90A 2ZIJA 3A96A 1IP6A 5I5QA 3TXFA 5LVKA 1HSXA 2XBRA 4D9ZA 1LZAA 5LAFA 1UACY 1GBWA 1OQMA 1XEJA 4DD7A 1FBIX 3CSRA 4NHSA 4NGOA 2BQKA 1FN5A 3AW7A 4BAFA 1FLUA 1VFBC 1GF5A 5KXNA 1LZ9A 1F6RA 5DN5A 2W1XA 3AB6A 3P68A 4WG1A 1ZMYL 4HV1A 5L9JA 1SLYA 4ETAA 1C45A 1JHLA 4MCKA 1BB4A 1CJ7A 1GAZA 1HEQA 2N5ZA 3AGGG 1LMAA 3AYQA 1YILA 1CJ6A 1LHKA 1GPQC 1NDGC 2MECA 5AMYA 1RI8B 1GF9A 2DQGY 3LYOA 4NWHA 2ZYPA 2DQJY 4OOTA 1LJHA 4AGAA 6LYTA 1A4VA 5A3ZA 3AZ7A 4H93A 3WPJA 4GLVA 4OWCA 1AT5A 4OWHA 1WQNA 3P64A 4N1EI 1YL1X 3KAMA 4TUNA 1J1OY 1HF4A 1LSMA 3FE0A 4WM3A 3VWOA 4ET9A 2A7DA 1HEOA 2AUBA 2FBBA 1YAQA 2XJWA 1G7JC 3D9AC 4GN5C 3CSQA 4UWVA 5LIOA 5M1YA 2MEIA 1LKRA 4PPOA 4ZIXA 4ETCA 4XJBA 4DT3A 1C10A 1WTMA 1F0WA 1LSEA 2BAAA 1LJJA 4RW2A 5C6IA 2LZ2A 1OUBA 5LVJA 3CB7A 3TMXA 4J1BA 1W08A 3AGHA 1SQ2L 5C6JA 4YOPA 1V7SA 4ML7A 4NSGA 3TXIA 5HNCA 1YAMA 5I54A 1DPXA 1DXJA 1LZEA 2A7FA 1LJKA 1F10A 5FHWA 5LAGA 5LVGA 2DQDY 5IELA 4WOAA 3J6KA 2BQIA 2DQIY 2DQHY 2MEGA 1RJCB 4NGVA 4PRUA 1UC0A 1JKAA 1LZ1A 3WPLA 5KXWA 4NSIA 3CSZA 1YKYX 1AT6A 2BQHA 1D0LA 3WYHA 1LSPA 5LVHA 3RZ4A 1JUGA 3P66A 5KY1A 1I20A 1H87A 1B7QA 1OUHA 4OW1A 1ZVHL 3W6BA 4LT2A 4PGJB 2W1YA 2HUBA 4XJHA 1DPWA 2LHMA 1WQMA 1HMKA 2Y8PA 1GF8A 1GFAA 4PRQA 1IP7A 3TXBA 1C46A 3G3BB 4RDSA 3WU7A 1GBSA 1GAYA 1HENA 1UIBA 1EQEA 1GFUA 1BGIA 1IEEA 1LZ8A 1REXA 4YENA 5HMJA 1IP1A 4Z41A 1LZ6A 4RLMA 5LYZA 1CJ8A 1OUJA 5F14A 2BQDA 1KIRC 1GB0A 1GF3A 1B7PA 4N1CC 3TMWA 1IWVA 4XN6A 1VAUA 1LSCA 4NGZA 2BLYA 4LYTA 1WQPA 1HNLA 3WVYA 1KIQC 1JKBA 2Z2EA 4I0CA 1LZGA 1IWYA 2HEDA 1DI5A 1GF7A 1MELL 2BPUA 2YVBA 1HELA 4DD9A 4WL7A 4B4EA 5HQ1A 1O23A 5LYTA 3A8ZA 4ETEA 2HEFA 4CHXA 1JSEA 4CFPA 1WQQA 4KXIA 4O34A 3HBHA 1UIHA 4ETDA 1G7MC 1B0DA 1CKHA 2Q0MX 4WMGA 3B72A 4ZFPA 4NGLA 3G3AB 1IP3A 4GCEA 4H94A 3BKHA 4HJVA 4NGJA 3LN2A 2D4KA 4HJYA 3IJUA 1XEKA 2H9KA 1HHLA 1LPIA 4TTDA 1LHIA 8LYZA 4H9CA 1LZTA 1E8LA 3AGIA 1GHLA 3J4GA 1YQVY 5E4PA 3W6FA 4DD2A 4BAPA 1INUA 4YEMA 1LZSA 1NMMA 4U3XB 4HV2A 4H9HA 5EBHA 3TXHA 4DDAA 5ILFA 3AZ6A 2WARA 1G7LC 2HTXA 4NEBA 1OUAA 3QY4A 1BB5A 4GCDA 1GFRA 1REZA 4R0FA 4HTKA 1OUDA 4KL7A 4XJDA 1BB6A 1J1XY 1BWJA 4TSCA 4ET8A 4HPIA 134LA 2BQLA 4B0DA 3ULRA 1VDPA 3TXJA 3AJNA 1GFEA 1OUEA 6LYZA 208LA 3D3DA 4LFXA 1DI4A 4C3WA 1I56A 5JENB 1RCMA 5F16A 1BB3A 3RT5X 3WULA 5KKJA 1LJEA 2MEBA 4EOFA 2CDSA 4B4IA 5DN4A 4NHIA 3W6DA 3EO5A 1ALCA 1BVXA 1NKHA 4OOOA 1VDTA 1GFHA 1LAAA 1FDLY 1HFYA 2YBHA 4H1PA 1OUFA 5ILCA 1B5YA 1LSZA 4YF2A 1TDYA 3RW8A 1F6SA 1QIOA 7LYZA 1GEVA 1GFTA 1IWXA 1HEPA 1KIPC 3ATNA 3LZTA 1B5WA 1C7PA 4I8SA 3ZEKA 3WMKA 2PC2A 2D91A 5HNLA 4WM6A 2Z38A 5D5FA 3WUMA 2BQMA 4NFVA 1DQJC 5A3EA 1YANA 4DD1A 3WVXA 1PS5A 1B7RA 1EQ4A 1LZYA 2G4NA 1IP5A 2W1LA 5FDJA 2H5ZA 5LXWA 2ZILA 1LZRA 3WU8A 2EQLA 4W96A 1Z55A 1GEZA 1FKQA 3CT1A 4WM2A 5KXXA 5L3HA 1QSAA 2Z2FA 4GN3A 4MR1A 9LYZA 1B7MA 3A3QA 3MGWA 1LZ5A 1GB6A 1B7SA 3B6LA 1LSGA 4HJZA 5F81A 3TXGA 1TBYA 1CKFA 1JWRA 3M3UA 2B5ZA 4OWEA 5J7CA 4NIJA 5LYMA 2MEFA 2BQEA 5F9XA 5B59A 3TXEA 3TXDA 1JTTL 4WM1A 1GBZA 2ZQ4A 4TSBA 3AW6A 4M6DA 1HMLA 3WXUA 1VEDA 5I4XA 3AZ5A 2C8OA 3TMUA 2I25L 1B5XA 3A92A 4XADA 2Z19A 4EMNA 4Z98A 3WUAA 2HEBA 1JJ1A 1OUIA 4KPMA 2EKSC 4XJIA 4HSFA 4WLYA 1GBYA 4DC4A 2YBLA 3T6UA 1LMPA 2DBTA 3LYTA 2ZIKA 4DD3A 3A94A 1GFJA 3EMSA 1DI3A 4NSJA 4NGYA 4NG8A 4G9SA 5APFA 1IWWA 1B7OA 5KXOA 3OJPA 4N5RA 1LYSA 1W6ZA 4OWAA 5B06A 2IFFY 4J1AA 1BB7A 1HC0A 1GE4A 5T3FA 1TCYA 1BWIA 1NF5A 1IWUA 4KT3A 1AM7A 1HSWA 1GFVA 1LSNA 1LYYA 4TWSA 4PHIA 1WVVA 4BADA 1LMTA 1P2CC 4NG1A 3A90A 1CKCA 1LZDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EMLA 4Z46A 3TXKA 2I6ZA 1UIFA 3PBLA 4PK0A 192LA 3VW7A 1LHMA 1L85A 1L14A 4LYMA 137LA 4ARJA 140LA 1NBYC 5KJ9A 4AXTA 3D4SA 1IY4A 5IHGA 1L21A 2YBNA 4P2EA 1QUSA 252LA 153LA 5DL9A 1L97A 1SSWA 1QUHA 1LGXA 1IWZA 1JJ0A 5KXLA 5KKIA 1LYZA 3CT5A 1LW9A 3A3RX 1D6QA 4NHTA 1EL1A 4E3UA 1GFKA 2OTYX 3B0KA 109LA 5KXYA 133LA 259LA 4RLNA 3WU9A 3W6EA 1L74A 3ZVQA 4OWBA 1XEPA 1L64A 2HECA 1CKDA 1L68A 2ZWBA 5FSTA 1IIZA 119LA 5KXZA 3W3EA 1LHLA 2YBMA 222LA 1L40A 4WG7A 1D3NA 4DDBA 2MEDA 3NY9A 4WO9A 1OV5A 1B5VA 1LJ3A 1JKDA 233LA 1IC7Y 2FYCA 176LA 163LA 2IHLA 1UICA 1OYUA 3CDOA 185LA 3HDFA 3EBAB 4DWXA 189LA 142LA 1TLAA 135LA 1LWGA 1D9UA 2F47A 2F4GA 4QY9A 4ZEEA 245LA 3SBAA 1C6CA 3WH1A 1REYA 218LA 1L99A 4IATA 1B2KA 3W6CA 2GV0A 1LGUA 1L89A 5LINA 1NHBA 2NTGA 3WW6A 1C6NA 1IVMA 1CUPA 4NGWA 4A7DA 1QSWA 1L29A 3WXTA 1GE3A 1KXXA 3B0IA 5KXRA 4H9AA 4EPIA 2X0AA 172LA 1LCNA 3G3XA 1GFGA 1XGPC 1L49A 223LA 256LA 2LC9A 3V2YA 1GD6A 4N8ZA 1L63A 1QT7A 145LA 1DYCA 1LYOA 253LA 4G4HA 1BWHA 1IP2A 4II8A 1ZV5L 1SWZA 3BKVA 156LA 1L34A 1YROA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2F2N A;  2ZYC A;  1EQ5 A;  4LZT A;  2EPE A;  1KXY A;  3M18 B;  5KXT A;  4Z46 A;  3TXK A;  3LHM A;  2NWD X;  2I6Z A;  1GB2 A;  1C43 A;  1UIF A;  2D6B A;  1UIA A;  1LZB A;  5I4W A;  2DQE Y;  4GN4 A;  1LHM A;  1KXW A;  1GB3 A;  4LYM A;  4WL6 A;  4R6C A;  1NBY C;  1LJF A;  5KJ9 A;  1LJI A;  4LGK A;  1UIG A;  3RNX A;  1VDS A;  4AXT A;  1MLC E;  4NY5 A;  1IY4 A;  2YSS C;  1UA6 Y;  2DKV A;  1AKI A;  2BQG A;  2H9J A;  5IHG A;  2YBN A;  4HPE A;  1LSA A;  4P2E A;  4WLX A;  1GBX A;  5II3 A;  1QUS A;  1UUZ C;  1C08 C;  153L A;  5DL9 A;  1NHE A;  1IOC A;  1IWZ A;  1G7H C;  1UBZ A;  1JJ0 A;  3A93 A;  3FI7 A;  3HBE X;  1FLQ A;  1WVU A;  2D4J A;  4UWU A;  5KKI A;  5KXL A;  1LYZ A;  2F4A A;  1XGR C;  3CT5 A;  1YL0 X;  3A3R X;  1D6Q A;  4NHT A;  1EL1 A;  4BS7 A;  1GFK A;  4QDN A;  2LYO A;  1XGQ C;  4E3U A;  1I1Z A;  3B0K A;  5HMV A;  3E3D A;  5KXY A;  2BQN A;  133L A;  4LYB A;  4C5F A;  1GXX A;  3F6Z A;  2LYM A;  1REM A;  4J7V A;  4RLN A;  3WU9 A;  2LYZ A;  3W6E A;  1LSB A;  1TEW A;  3ZVQ A;  1LZC A;  4GLA A; 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 5HNL A;  4WM6 A;  2Z38 A;  5D5F A;  3WUM A;  2BQM A;  4NFV A;  1DQJ C;  5A3E A;  1YAN A;  4DD1 A;  3WVX A;  1PS5 A;  1B7R A;  1EQ4 A;  1LZY A;  2G4N A;  1IP5 A;  2W1L A;  5FDJ A;  2H5Z A;  5LXW A;  2ZIL A;  1LZR A;  3WU8 A;  2EQL A;  4W96 A;  1Z55 A;  1GEZ A;  1FKQ A;  3CT1 A;  4WM2 A;  5KXX A;  5L3H A;  1QSA A;  2Z2F A;  4GN3 A;  4MR1 A;  9LYZ A;  1B7M A;  3A3Q A;  3MGW A;  1LZ5 A;  1GB6 A;  1B7S A;  3B6L A;  1LSG A;  4HJZ A;  5F81 A;  3TXG A;  1TBY A;  1CKF A;  1JWR A;  3M3U A;  2B5Z A;  4OWE A;  5J7C A;  4NIJ A;  5LYM A;  2MEF A;  2BQE A;  5F9X A;  5B59 A;  3TXE A;  3TXD A;  1JTT L;  4WM1 A;  1GBZ A;  2ZQ4 A;  4TSB A;  3AW6 A;  4M6D A;  1HML A;  3WXU A;  1VED A;  5I4X A;  3AZ5 A;  2C8O A;  3TMU A;  2I25 L;  1B5X A;  3A92 A;  4XAD A;  2Z19 A;  4EMN A;  4Z98 A;  3WUA A;  2HEB A;  1JJ1 A;  1OUI A;  4KPM A;  2EKS C;  4XJI A;  4HSF A;  4WLY A;  1GBY A;  4DC4 A;  2YBL A;  3T6U A;  1LMP A;  2DBT A;  3LYT A;  2ZIK A;  4DD3 A;  3A94 A;  1GFJ A;  3EMS A;  1DI3 A;  4NSJ A;  4NGY A;  4NG8 A;  4G9S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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