3W6IA

Crystal structure of 19f probe-labeled hcai
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
publication title Quantitative Comparison of Protein Dynamics in Live Cells and In Vitro by In-Cell 19F-NMR
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 71
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence E
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3w6iA00
4K0SA 1I9OA 4Q9YA 4Q90A 4JSWA 4FVNA 1BN4A 4QIZA 2HKKA 2NWZA 1F2WA 4PQ7A 5SZ0A 1AZMA 3MHIA 3RLDA 2NN1A 3M40A 1UGFA 1TH9A 5CA2A 1BNUA 5CACA 3T82A 1I9LA 4QSBA 1G0EA 3SAXA 1TEQX 3JXFA 4KUYA 1Z97A 3KKXA 1LZVA 5SZ7A 1HCAA 4KNJA 3U7CA 5DSLA 4N16A 3JXHC 5SZ6A 1CVCA 1HEDA 2EZ7A 4Q7SA 3IGPA 4ITOA 1CVHA 2POVA 1G46A 2VVBX 4GL1X 2VVAX 4YWPA 1CA2A 1ZFKA 3KLDB 4Q06A 3RYYA 2O4ZA 4QJ0A 5JQ0A 3M96A 4DZ7A 5EKHA 4L5VA 5DRSA 4XIXA 5JEHB 1FSRA 3V3FA 3DV7A 4R59A 9CA2A 1YO1A 3D0NA 1Z9YA 3R16A 5FNKA 4RIUA 6CA2A 4K0TA 1ZSCA 4QSAA 1FR7A 1HCBA 1G52A 5FL5A 3V3JA 1CVBA 4CNRA 3MWOA 1V9IC 3P3JA 2FOYA 4KNIA 4K1QA 3V2MA 2X7TA 3NI5A 4KP5A 5C8IA 4PZHA 5EHWA 5FLRA 3HKUA 1CNYA 3IBNA 3RG3A 1BNNA 3R17B 4ZWYA 2OSMA 1CCSA 3M2NA 4QJWA 1RAYA 2ILIA 3MHCA 1CNWA 1TBTX 3RJ7A 3B4FA 3W6HA 2ABEA 1CAOA 5FLOA 4YXIA 1BN3A 5FLQA 3IBUA 5E5UA 1G3ZA 1RZCA 2CA2A 3MDZA 1ZE8A 1DMXA 2QO8A 5FNMA 4Q8XA 1ZSAA 5AMGA 1KOPA 4WW6A 4RUXA 1BNTA 3IBLA 2FOVA 5EOIA 4HBAA 2WEOA 1BNVA 3FE4A 2NWPA 1OKNA 1CAHA 5E2KA 3U47A 4E3DA 3T84A 5FNJA 1CAYA 3D8WA 5CLUA 3TMJA 1CILA 3MNUA 4WL4A 1I9PA 5CJFA 1THKA 2X7UA 1XQ0A 4E49A 4Z1KA 3V2JA 5E2RA 3ZP9A 3CA2A 1FQRA 3PJJA 3DCWA 5DSMA 1BZMA 1HECA 2EU2A 5E2SA 1CA3A 1G4JA 1HUHA 3U45X 4MDMA 1TB0X 1UGAA 4YYTA 3MNAA 4E3FA 4R5AA 5EIJA 3M2XA 1FLJA 4QK2A 4YGNA 1CANA 4Q6EA 5BRVA 1TEUX 1BCDA 4TWLA 3OYSA 5FL6A 4RN4A 1CINA 5DSIA 1G54A 3DCSA 4ILXA 1I8ZA 5LMDA 3DCCA 3N2PA 5JG5B 2WEGA 1ZSBA 1V9EA 3DAZA 1YDAA 3S73B 2NXTA 1ZNCA 3RZ8A 4ETQC 4ZWZA 1BNMA 1TG9A 3F7BA 4Z0QA 4Z1EA 1YDBA 2H15A 2NMXA 3HS4A 3TVOX 4Q7PA 3D93A 5BRUA 3MZCA 3M98A 1G6VA 3M5TA 5G01A 1EOUA 3DVBA 3RZ0B 3L14A 2NNGA 1CNJA 2POWA 1UGDA 4JSSA 3S97A 12CAA 3S9TA 4ZAOA 3DBUA 1TG3A 3S74B 3ML2A 5DSJA 1I9MA 4IDRX 1RZEA 5FDIA 4C3TA 3N3JA 4L5UA 2Q1QA 5AMDA 1RZAA 1T9NA 1CNBA 4Q7WA 4ZX0A 3MHMA 5E5RA 3MYQA 4YGKA 3T83A 4HT2A 3M5EA 5DSNA 4Q87A 4KUWA 3OYQA 3OIKA 3BL1A 4RUYA 5FNGA 5SZ2A 1ZFQA 1KWRA 2QP6A 3QYKA 3KOKA 1CAZA 1CAMA 5E2NA 3RYXB 1RZBA 2NN7A 3M04A 2NWYA 2CBAA 3KNEA 4FU5A 3U3AX 3M3XA 2AX2A 3S78B 2CBDA 3HFPA 4CNVA 1BNWA 2FOUA 3V7XA 4RIVA 3N4BA 1H4NA 5DOHA 1TE3X 1I9NA 1BN1A 3EFTA 2WD3A 5JEPB 1UGCA 3PO6A 5FNIA 5L3OA 2FNNA 1JCZA 3DC3A 4MDLA 3FW3A 3IEOA 4E3GA 4E4AA 4QK3A 5DSKA 5BRWA 2NXRA 4ZWXA 4WUQA 4XFWA 1FSNA 3RYZA 4BF6A 1CCTA 1CVFA 1BNQA 1CAIA 3DC9A 4ZWIA 4M2VA 2ZNCA 3DVCA 4YXOA 2NWOA 3EFIA 4XIWA 3RYJB 4Q49A 4QJOA 2OSFA 3NB5A 4G7AA 4XE1A 3DD0A 4KV0A 1MOOA 5JG3B 4MLXA 2WEJA 3B1BA 1CNXA 4MTYA 5SZ4A 4Q83A 1JV0A 4Q08A 1FSQA 4JSZA 3CAJA 4Z1NA 3P44A 1UGGA 2HD6A 4KAPA 1IF6A 4QJMA 3M1JA 1G48A 3JXGA 4CACA 1HVAA 4HEWA 1KOQA 5EZTX 1CNIA 1Z93A 1CCUA 3P4VA 3S72B 3MMFA 4LU3A 4R5BA 3MHLA 4Q78A 2QOAA 4QTLA 3OKVA 3OY0A 3D9ZA 5EKJA 1YO0A 4CNXA 3MHOA 3Q31A 4K0ZA 3P58A 1CNCA 4PYXA 4HT0A 2GD8A 5SZ5A 7CA2A 2Q38A 3KONA 4Q7VA 5G0CA 5JQTA 5DVXA 1FQMA 5FL4A 4WR7A 5EHEA 2FNMA 1I91A 4QSJA 3HLJA 1MUAA 3SBIA 3MNKA 1HUGA 4JS6A 5E28A 3N0NA 3F8EA 5EH8A 2FW4A 5FDCA 2EU3A 3F7UA 3M67A 5SZ1A 4Q81A 1H9QA 1KEQA 2POUA 4QY3A 1AVNA 5E2MA 3KOIA 1HEAA 4ZX1A 1CNHA 5EHVA 3DD8A 2FMGA 3M2ZA 3OIMA 4IWZA 3T5ZA 2CBEA 3S77B 1OKMA 4PYYA 2FMZA 5FNLA 4YGLA 4MO8A 5BYIA 1JD0A 4CQ0A 1CNGA 2CABA 4QJXA 3VBDA 5FLPA 3K34A 1URTA 2NXSA 1DCBA 4E3HA 1OQ5A 1LG6A 1J9WA 1CALA 3SAPA 3TVNX 2WEHA 1UGEA 3FFPX 5JESB 1CNKA 4HF3A 3W6IA 2IT4A 3OKUA 2HL4A 1BICA 3SBHA 5JDVB 4E5QA 3KS3A 3S76A 1YDDA 4RH2A 2H4NA 4X5SA 1A42A 1G45A 4ITPA 3ZNCA 3V5GA 1LGDA 5JGSB 3CZVA 3M5SA 3M2YA 1UGBA 4CA2A 4K13A 3V3HB 3RGEA 4E9OX 4KNNA 3D92A 4RFCA 4YXUA 5L6KA 1CAKA 1KWQA 2GEHA 1FQNA 4YGFA 4M2UA 5AMLA 1OKLA 1CRAA 2NNOA 4BCWA 3IBIA 2CBCA 1LUGA 3RG4A 4XZ5A 3CYUA 5FLTA 5G0BA 1IF4A 3K2FA 4PXXA 1CVEA 4Q8ZA 3S75B 3RYVB 3PYKA 4DZ9A 4CNWA 4QJPA 4Q09A 3P5LA 3P55A 3K7KA 3BETA 5DOGA 3KIGA 1G0FA 3M14A 4JSAA 3DVDA 1ZGEA 1RJ5A 4YVYA 4LP6A 1IF7A 1H9NA 4RUZA 3GZ0A 4QIYA 3OILA 4TWMA 3P3HA 3S8XA 2WD2A 4Q99A 3UYNA 3P5AA 5EH7A 1IF9A 1CVAA 3BL0A 3M1KA 4Q8YA 3S71B 4Q6DA 3F4XA 2F14A 1ZH9A 3IAIA 1IF8A 1XEGA 1RJ6A 4KUVA 5IPZA 4MDGA 1HEBA 2W2JA 4M2WA 1DCAA 3DA2A 3ML5A 4N0XB 1YO2A 3M1WA 2HNCA 4Q07A 5FLSA 4COQA 3UYQA 4KNMA 1FQLA 3HKQA 1TTMA 3KWAA 2FOQA 2HFWA 1I9QA 1YDCA 4HEYA 1FR4A 4BF1A 2FOSA 5A25A 4MLTA 4LHIA 4Y0JA 4G0CA 3M1QA 3HKNA 4RFDA 5EH5A 4M2RA 4YGJA 1IF5A 2FNKA 1XEVA 4UOVA 5A6HA 1CAJA 1RAZA 2NNVA 1RZDA 4L5WA 5G03A 2Q1BA 5DSOA 1G1DA 5JEGB 8CA2A 3NJ9A 2AW1A 4YHAA 4HEZA 3MNJA 4FVOA 5DSPA 1CIMA 4FRCA 1Y7WA 4QSIA 4FL7A 3RZ5A 3MNHA 4FPTA 2HOCA 1DMYA 4WUPA 3T85A 2CBBA 4KP8A 1I90A 4WW8A 5EKMA 5DSRA 3RZ7A 1CRMA 4Q0LA 5J8ZA 4Z1JA 1XPZA 4YX4A 5DSQA 5JGTB 2NNSA 5BNLA 1AM6A 1LG5A 5HPJA 3LXEA 4HU1A 5SZ3A 1CVDA 1G53A 1G4OA 3V3GB 3MNIA 3HKTA 1CZMA 4QK1A 1ZGFA 5FNHA 3C7PA 1BV3A 4FIKA 3V3IB 2X7SA 4QEFA 3T5UA 3RZ1B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4K0S A;  1I9O A;  4Q9Y A;  4Q90 A;  4JSW A;  4FVN A;  1BN4 A;  4QIZ A;  2HKK A;  2NWZ A;  1F2W A;  4PQ7 A;  5SZ0 A;  1AZM A;  3MHI A;  3RLD A;  2NN1 A;  3M40 A;  1UGF A;  1TH9 A;  5CA2 A;  1BNU A;  5CAC A;  3T82 A;  1I9L A;  4QSB A;  1G0E A;  3SAX A;  1TEQ X;  3JXF A;  4KUY A;  1Z97 A;  3KKX A;  1LZV A;  5SZ7 A;  1HCA A;  4KNJ A;  3U7C A;  5DSL A;  4N16 A;  3JXH C;  5SZ6 A;  1CVC A;  1HED A;  2EZ7 A;  4Q7S A;  3IGP A;  4ITO A;  1CVH A;  2POV A;  1G46 A;  2VVB X;  4GL1 X;  2VVA X;  4YWP A;  1CA2 A;  1ZFK A;  3KLD B;  4Q06 A;  3RYY A;  2O4Z A;  4QJ0 A;  5JQ0 A;  3M96 A;  4DZ7 A;  5EKH A;  4L5V A;  5DRS A;  4XIX A;  5JEH B;  1FSR A;  3V3F A;  3DV7 A;  4R59 A;  9CA2 A;  1YO1 A;  3D0N A;  1Z9Y A;  3R16 A;  5FNK A;  4RIU A;  6CA2 A;  4K0T A;  1ZSC A;  4QSA A;  1FR7 A;  1HCB A;  1G52 A;  5FL5 A;  3V3J A;  1CVB A;  4CNR A;  3MWO A;  1V9I C;  3P3J A;  2FOY A;  4KNI A;  4K1Q A;  3V2M A;  2X7T A;  3NI5 A;  4KP5 A;  5C8I A;  4PZH A;  5EHW A;  5FLR A;  3HKU A;  1CNY A;  3IBN A;  3RG3 A;  1BNN A;  3R17 B; 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