3W7E | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-5-179 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	107
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7eA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7eA01

3TC7A 4O19A 4M5PA 2Q3OA 2JK2A 2Y7DA 4BI7A 3LRKA 4N6EA 4NUWA 3MO7A 1F76A 1EP3A 5BMWA 1YPFA 1F73A 4GC4A 4A21A 2C6QA 3SI9A 5CPLA 1SW7A 2J27A 1YADA 4X3ZA 1B4EA 1TPB1 3U2OA 1A53A 1D3HA 5DXYA 4JTTA 2VOMA 5BRBA 3NOEA 1EWEA 3KX6A 4LTSA 3DGRA 2PURA 3NAVA 3W23A 2E68A 3NL6A 2DORA 3B06A 5EY5A 3SECA 1DJNA 1O60A 5FEWA 2JKEA 3T55A 1QFEA 2Y6ZA 3MYOA 4O28A 3LERA 3G1DA 1LRQA 1SQ7A 2ZRWA 4JYFA 3MJYA 1QOPA 1O5KA 3FOKA 2Y88A 3IRDA 3ATYA 2QCDB 4JTHA 2E6YA 3W7DA 3UWZA 2H6RA 1KBJA 2J24A 4NVTA 3BW4A 1LLZA 3HG2A 2KZHA 4MUZA 3G3DA 5DXXA 3P8IA 2QEZA 1H7WA 4JYDA 4FXRA 3VI2A 1W1ZA 2FB2A 1U5JA 2CLLA 5CZTA 4JN6A 4H3DA 1UB3A 4IX2A 3EKZA 4JY9A 2OX1A 2WO5A 1OK6A 2NX1A 3N9SA 2ZA2A 4IOTA 4Y8FA 2B0MA 1FWNA 2Z1BA 5AHNA 1OX4A 3L9CA 4L4LA 1F6KA 3LCGA 1QNVA 3OEXA 1EIXA 5G2WA 4O50A 2DZXA 2QCCA 5AFDA 3CIWA 5HUOA 3QSRA 4LY8A 5I3JA 5AHIA 1XCFA 2G96A 4JGDA 2ZCGA 1A5BA 2NZLA 3ATZA 3TQ0A 4HKPA 2Z6IA 1S5TA 1ME9A 1ZAHA 3EWYA 4YWIA 5LNVA 1X1ZA 3TJLA 1KM3A 4NJIA 3ZWTA 5D33A 1G4PA 1FWRA 3M1ZA 1Q6RA 4YMZA 5LNSA 5BOOA 2DP3A 1GTEA 1P4CA 4B5NA 1F7BA 2A1YA 1PHQA 4O10A 3SSJA 1CW2A 1TREA 2C3ZA 2FPVA 2V9DA 2P0OA 2CZFA 3NVTA 4Y96A 1LYXA 2CU0A 1ME7A 1LRTA 3DENA 5G1TA 3KVMA 2CW6A 3L5MA 3G18A 1KFKA 3KRUA 4QSHA 2PE4A 2QDGA 2QUUA 2Y7EA 4Z08A 4LV9A 3NL2A 3GXTA 3EX3A 4K7VA 1RQEA 4Z0SA 3MBFA 3C2OA 3MBDA 1EUAA 3B0VC 1VHNA 1LP6A 1LOSA 4FNTA 3GNDA 1OFQA 1ICSA 3PSWA 3H54A 3TXVA 3W2LA 1QPNA 5H91A 3LOTA 1CX9A 5CPMA 2J6XA 3VCRA 2Z6JA 3QW3A 4R7JA 3B05A 3C0JA 3B0UX 1RQBA 3WK0A 4MIMA 3TX9A 4JEQA 4N2YA 3G8RA 1T99A 2RHGA 4NZFA 4CQAA 3S1XA 1KFEA 2E6DA 5F4XA 1Q6QA 2JKPA 2V30A 5LNWA 4O1BA 2NXHA 3TROA 3LX9A 1SZFA 3IIXA 2QF7A 3GK0A 4C1KA 4O14A 4UR8A 2NV2A 1DBTA 3DFOA 1K8YA 1SO5A 5HINA 4DO5A 2A85A 1ME8A 2V2CA 4LS0A 3LHUA 3PAJA 2HS8A 1VYRA 3LM7A 3BG5A 1OG0A 2YDAA 4FNQA 2D73A 1RR2A 1KTBA 3OVQA 3IIVA 4Q4KA 3KVLA 3B03A 3W74A 4IGHA 2VFFA 4CLMA 3W7MA 2I1OA 4LRSA 3BW2A 1H7OA 3DHDA 4G1KA 5DCEA 3S5OA 3HG5A 1G7VA 3MP5A 2QDHA 3NL3A 4HT3A 4HIBA 1RQHA 1JCMP 1TPEA 2Y63A 3QQ0A 3H55A 4LW7A 5EPDA 4EF9A 1JCNA 4GBUA 3Q37A 4Z1AA 1TTIA 4OV9A 1T8XA 4JTUA 2DJLA 2A7RA 4FX7A 1U83A 4JY8A 1TQXA 3VE7A 2ZFAA 3GDLA 2W6RA 4FO4A 1NF0A 1TB3A 1W5NA 1PIIA 2Q8ZA 3FYOA 2NUXA 3USBA 3TQVA 3NEVA 3MP4A 3C2RA 4JTFA 3UPWA 4DBDA 3PUOA 1TQJA 3NQDA 4NJHA 4CQ9A 2QCDA 1ZENA 1ZNNA 3BGGA 1K7XA 4ZQRA 3N73A 2B4GA 1FDJA 1TPDA 5LGXA 1KM4A 1A5SA 2O7QA 4A3UA 2NXIA 5G5IA 1S5VA 2CZDA 4LS1A 2WNQA 2ZZ6A 3KHJA 2QR6A 3LV6A 4E2DA 5G2IA 1JCJA 3PBVA 2QAPA 1YDOA 3SGUA 3L5AA 2ZA3A 3INPA 3HGJA 1BWKA 4UIOA 3WJZA 2ZRVA 2JBMA 5AC8A 3O05A 2C0AA 4UNLA 1H5YA 1R47A 5CKSA 3P5ZA 4UCGA 1NAL1 4DF2A 1HL2A 3BLEA 4ZL1A 4KFNA 2GVLA 4AWUA 3UY7A 3BARA 3C56A 3W1UA 4ADSA 3O6CA 3G0UA 1VQTA 4YCPA 3ANYA 3O07A 3OBKA 1V7YA 2CFFA 4RR4A 3G1SA 2E09A 3LRMA 3MHGA 2RDUA 5AN7A 4NXKA 3CIXA 3S5YA 1M6JA 2Y7GA 1VRDA 4M19A 3R5EA 4RZ5A 3BG9A 3PR2A 1TJPA 2QUTA 1UJPA 1MO0A 1TRIA 4LVBA 2NUWA 4GUFA 3GNNA 4WJEA 2CZEA 3G1XA 3UWUA 3C61A 2ZRUA 3GVGA 2YW3A 1LROA 2Y7FA 1GVOA 5H2ZA 2BZNA 3LXBA 3L21A 4N9DA 3M9YA 4O12A 1SZGA 1N55A 2WSYA 3IIPA 3U8GA 5K7JA 3P81A 2WSRA 4ZVJA 1RZMA 2OJPA 3ELFA 3F4WA 1DQWA 3MI6A 3W2JA 4BF9A 1SZNA 1OX4B 4U4MA 1OYCA 2ZTJA 2A7NA 3ABQA 1XBVA 3FJLA 2B7NA 4J9JA 1XDMA 4LVAA 1YTDA 2Z2UA 5MHBA 1IXOA 4IMDA 2ATMA 5GVJA 1YDNA 3I7RA 3PBUA 5K3VA 1EPXA 1VHCA 3R89A 3STGA 1SU5A 4JIPA 1GPWA 1O5XA 1Q45A 5EYWA 4C1LA 2IQTA 3MI2A 1LLWA 2H3DA 4AWTA 1KLYA 2NWSA 3NYZA 1KFLA 2X1UA 5D2VA 2QCGA 2XN0A 3UQNA 1XI3A 5AOUA 3LBMA 3MW7A 4MLRA 4UFIA 3P80A 1W5MA 3GYEA 3M6YA 2ZZ4A 3EX6A 3UWWA 3NA8A 3EWZA 4QNEA 2QCLA 5LHEA 3L0NA 3CC1A 4XBSA 2F7FA 3SW6A 1BEUA 2VELA 4ALDA 3HB9A 1XXXA 4XUGA 1JUKA 2C14A 3N3MA 4RKAA 3G1HA 3DBPA 4MZ8A 3FYPA 4O15A 2J88A 5DELA 3IEBA 3S8HA 3EWUA 3QPZA 4LVFA 3CTLA 3GAKA 5LNRA 3P5YA 2G95A 1WV2A 1B4KA 3QRHA 2TMDA 3W87A 3W6YA 2C19A 1UASA 3DHFA 3TA6A 1H1YA 5D2TA 1I2NA 4Y9AA 3DKLA 3QYQA 4IUOA 3E0IA 3QH2A 4AXKA 3NGJA 4LOCA 5FI8A 1H62A 5DY2A 1GOXA 3CU2A 3P7YA 1GTHA 3P84A 2X30A 5D38A 1GJPA 1RV8A 3HOJA 4RV8A 1KM5A 1EEPA 5CZSA 4NT0A 3IGXA 3QMSA 3NQEA 2YZRA 3MMTA 1ALDA 1X6UA 4FNPA 3M5YA 4GNJA 1ONRA 4GXMA 3TW6A 3NQAA 2H90A 4O17A 5F2GA 3E9AA 3GDTA 3VE9A 2E6FA 4R53A 1KV5A 4OHQA 4K8EA 3PB0A 3G1FA 4QQ3A 1W5QA 3EX2A 1FX6A 1I4NA 3VFLA 1GT8A 3KVKA 5F4SA 4XTIA 2NV1A 5HUPA 4UMCA 3ZWSA 3DH7A 5EMUA 1TPWA 4IMGA 3PBWA 3ZR4A 4AB4A 1G6CA 3LHZA 3W7QA 2FTPA 2VEMA 4O1AA 3LLDA 1DOSA 5CZJA 3V1PA 1GVSA 2A7PA 5LGZA 4NJKA 1VH7A 4NNBA 1F05A 4DPQA 3NM3A 4TX9A 3SIZA 5K9CA 1FXQA 4IX0A 3R8RA 2TYSA 4PL2A 2G5WA 1XFBA 4OT7A 5LSMA 2ZBTA 1C29A 4PCFA 5D2WA 5F2LA 1K03A 4PA8A 4NZJA 4A2SA 4LRTA 4EF8A 2Y62A 5IBXC 4NJJA 2YX0A 4NXSA 5C2XA 2J9ZA 3MWAA 3NQ6A 4JTJA 4XBKA 2DZWA 3RFAA 4JXCA 5EA9A 4RZ6A 4UC5A 3LXAA 4DPPA 1AW2A 1KV8A 2Q3RA 3A5FA 2FB3A 5AB3A 3W7IA 3IVTA 1M7OA 1Q3NA 3DFSA 3LCXA 1SZEA 2OCZA 1K7FA 3E96A 2V5LA 1PL9A 5C5YA 1OFRA 1KTNA 3GIYA 3W7HA 5I3FA 3HQ1A 4LU0A 1ZALA 2ZQ0A 3HBLA 4HSOA 4IMEA 1W31A 3HPXA 2ZZ7A 1A50A 2XN2A 3W86A 3QQ1A 1JULA 4W9TA 1YYAA 3NQMA 5EKYA 3SR7A 3MHFA 1HG3A 3TFXA 1IF2A 3A23A 4LWWA 1J5TA 1V5XA 4ORIA 4N6FA 1JCLA 5K4XA 5F4WA 3DFQA 5IM51 4ZQOA 2Z0IA 3GKAA 3LDVA 4O18A 5K9XA 2A0NA 5TBOA 1B9BA 4XKYB 4UMAA 1IGSA 2C1HA 2X2GA 4ORMA 4UFHA 3KVJA 4GE8A 4AVFA 2ISVA 3W1MA 1OF6A 3TSDA 3NG3A 1H1ZA 4IXHA 4UFKA 3QF0A 5HNRA 4MYAA 1OJXA 1W3NA 3TKFA 3EWBX 5HR6A 3N2MA 2I9EA 3NDOA 2NUYA 4O8RA 1KM6A 3M44A 4CNPA 4N9EA 5I3KA 2H3BA 1EUNA 4I7VA 5AYZA 3LTPA 4K8HA 3G3MA 3M0ZA 1KFJA 3M7WA 3NO5A 2P10A 2V0TA 4GUIA 1OYBA 5DY3A 4UTMA 4M7TA 3S5NA 1LCOA 4Z1DA 2BXVA 3KAOA 4KWVA 4M6VA 3LTSA 2GOUA 4DO4A 6ALDA 2R91A 4UTHA 2EHHA 2QCNA 5G1YA 4DEFA 3IIOA 3S9YA 3N19B 4QJ1A 1TRDA 3EXTA 1THFD 3GXNA 5FESA 4RXGA 4JDYA 4HNUA 5FF4A 2WOQA 1NF7A 2B7PA 2YCEA 1PCKA 4FF7A 1Q6LA 1SW3A 1L9WA 2AQWA 5HMSA 2OT0A 4Q33A 5G2HA 2YSWA 3SGZA 1VS1A 1P0KA 3G1AA 4MFDA 2YR1A 1EB3A 5FEZA 1OK4A 3I7QA 4UR7A 2HTMA 4P2VA 3W2KA 5AHFA 2CLIA 1YXYA 5L9FA 5AYXA 3UZJA 4CNNA 4FEZA 5CGQA 1YTKA 3HGOA 2FQIA 3BO9A 1HFBA 4QISA 3TH6A 3RLVA 2A6NA 3BV4A 2YGYA 3I7SA 3FKRA 4AHPA 3W7EA 1WBHA 4WUIA 4FIRA 3TDFA 3LHYA 4TO8A 4MZ1A 2W79A 1H7NA 1NVMA 3TR2A 2BTMA 1DQXA 4TIMA 2B7QA 3ZS4A 1OFOA 3NPVA 3QFEA 4ZQNA 1HO1A 3P62A 4IPIA 1YXDA 4O52A 2OMAA 2A2IA 2AAMA 2ZTKA 4WXYA 2YXGA 2YYUA 4DF1A 4LVDA 3TSMA 3EWWA 3Q2DA 4S2CA 1K8ZA 4MY8A 1XL9A 2HMCA 2GPTA 2WKJA 3PY2A 3A21A 3LHTA 1GQNA 4LNYA 3E49A 4RJEA 3GB6A 3QMTA 4UMBA 4UFLA 3W1AA 3SFKA 1H51A 4NX5A 5CPNA 1N8FA 3TV8A 3M5XA 4JTKA 1S5WA 2ZYFA 4OE7A 3G0SA 1F5ZA 4MVAA 1BKSA 3PBYA 2C15A 1RVGA 4R34A 4IJBA 3V75A 1VGAA 4FIQA 3W7CA 4M6QA 3FS2A 5EL1A 3W1QA 5DBTA 3PS7A 4A22A 5FF0A 3L66A 2GUUA 5AYYA 4PFMA 3LHWA 2VEPA 3NL5A 5ABTA 1DHPA 1ZFJA 3RMJA 1QWGA 4RK8A 4Z1CA 3NR0A 1VC4A 2FLIA 5HULA 3L0GA 3TQKA 2RDWA 1KM1A 2OZ0A 1T0OA 1JRCA 1YPIA 3TXZA 4MJMA 3STCA 1SFJA 3O63A 4A2RA 1D3GA 4QM1A 2QJIA 3RNDA 2NX9A 3W7NA 1W37A 2TSYA 1VCFA 2F84A 3SJ3A 4ML9A 3FLUA 1M7PA 2VKZG 4NNAA 5L6UA 3GX9A 3TU9A 5D32A 3WK1A 4OV4A 3W1LA 2WJZA 3TC6A 4ZMGA 4OGZA 3LCHA 5KZEA 4PODA 4XKYA 1ZHAA 3UY8A 4Y90A 2ISWA 4EIVA 2X1SA 4K36A 1TO3A 3WJWA 4AEOA 1QPOA 3GDRA 3GLCA 4MJZA 4MZYA 1D9EA 4GFSA 1VCGA 3O6DA 1DORA 2Y85A 2DJXA 5KZDA 4NJGA 2X1TA 4ZQPA 2FFCA 4JR5A 1JR1A 3OHIA 3CM4A 2DZTA 2DZUA 2QCMA 4WX2A 2FIQA 1W3IA 2ALDA 4ONVA 2HS6A 3HPZA 3CQ0A 3P74A 4O0KA 5FEXA 3W1PA 3O16A 3QW4B 4O13A 1PHWA 4NU7A 1BWLA 2WSQA 2WNZA 1AMKA 3I68A 1LOLA 3DXIA 1GYNA 1FCUA 4HPJA 3LGEA 4UTJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W7EA

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