3WEEA

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
462
structure length
425
Chain Sequence
QDSILIIYPRSQTTLVQFGLNEETFTVPELEIPTQIYRTTRQDGSYTYHSTNKDNKAELIKPIQNGEIIDISAFTQFLRLIFVSILSDRSNIPLLLITHHSWSQSDLEIITQYVFESLEINNLIQLPASLAATYSMISLQNCIIDVGTHHTDIIPIVDYAQLDHLVSSIPMGGQSINDSLKKLLPQWDDDQIESLKKSPIFEVLSDDAKKLSSFDFGDEGTLNVAEIITSGRNVKNSDLEFNTFWDEKGNEIKVGKQRFQGNNLIKNISNRVGLTLDNIDDINKAKAVWENIIIVGGTTSISGFKEALLGQLLKDHLIIEPEEEKSKREEEAKSVLPAATKKKSKFMTNSTAFVPTIEYVQPTVIKLAKYPDYFPEWKKSGYSEIIFLGAQIVSKQIFTHPKDTFYITREKYNMKGPAALWDVQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords Actin-like protein ARP9
total genus 111
structure length 425
sequence length 462
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA01
3.90.640.60 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeA03
2AA4A 3FLCO 3QICA 3C7NB 2FSJA 5KPZA 5FPDA 1KXPA 3UKRB 4MLEA 4RCHA 4BRQA 2FF6A 2E2PA 1KAXA 5KPRA 2E8AA 3VEOA 4B1ZA 3EL2A 4J8FA 5F1XA 3EO3A 5EY4A 3BP8A 3SK3A 4BR5A 1BWFO 3VF2A 5AQYA 1QQMA 4RTFD 5AQTA 3LDPA 5AR0A 5AQZA 1BDGA 1S22A 2YHYA 3EZWA 3MDQA 3IUCA 4CD1A 2P9NA 1NGFA 4JHDA 1NGEA 3A5LC 2CH5A 3H6EA 1ESVA 1TUYA 3SMPA 4H0XB 3VEVA 2GEMA 2FXUA 4WQ5A 3VGKA 2A6AA 5BREA 3LDOA 3GOIA 3RSEB 3WT0A 2ASMA 4NO7A 3JXUA 1BO5O 1NGAA 1MWKA 3HSCA 4H5TA 1NGIA 4BC4A 4BQLA 3ATUA 2E2NA 3ZX0A 3O08A 2Q31A 1U6ZA 1BG3A 3DXKB 3UB5A 3DJCA 2P9IA 5AQMA 3ZETA 3LDNA 2P9PA 3HTVA 3CJ7A 5KQ8A 4Z94A 4H0TB 2E88A 3CQYA 2Q36A 2E1YA 1HUXA 5FPMA 1TYQA 1Z05A 3VEYA 2CH6A 3DAWA 3WUHA 1HKGA 4AM6A 5AQVA 1NGBA 4FWPA 4BRMA 3H3OB 3LL3A 1P8ZA 4PKIA 3WXJA 4WQ4A 4ISEA 3AAPA 3A5MC 1E4GT 2FSKA 4BRAA 3BEXA 3VEWA 3QFPA 1NM1A 2AP1A 3MN7A 1DGKN 1QHAA 3OHRA 4H5RA 3QBXA 1NGHA 4K43A 3C0BA 2H3GX 1GLCG 2Q0RA 3UKUA 4BC3A 5EOYA 4WYBA 2I7PA 4FWQA 1GLDG 2NZTA 4FL9A 1HLUA 3O4WA 2BTFA 3GL1A 5FPEA 3O6WA 4H5VA 2YJEA 3DWLA 5AQIA 3LDLA 3ULEA 2I7NA 1RGIA 5AQGA 1V4SA 1IG8A 2V7ZA 4PKGA 1E4FT 1GLEG 4QS9A 1GLFO 3DXMA 4DCHA 5E26A 4BRLA 2P9NB 2VCPA 1KAYA 3A5NC 4FWOA 5AQHA 3IDHA 1BA0A 5AQKA 4CZIA 5E84A 4A62A 4ISFA 3I33A 5AQLA 3ZX3A 4BC5A 4BRPA 4CBXA 3ATVA 4H0YB 1XC3A 1IJJA 4DB3A 2IVOA 1ATSA 2E1ZA 3SMSA 5AQJA 4B1XB 2QWMA 2P9SA 2FSNA 4Y0WA 1NGDA 3ZETB 2GWKA 2VWBA 5BPLA 1XUPO 4O5FA 1D4XA 3FZLA 1DEJA 2DPNA 1TYQB 1H1VA 5AFUH 3IFRA 3MN5A 4C23A 3A5OC 2HMPA 4BVPA 4PKHA 3AY9A 3M3ZA 4BC2A 3R8EA 4CZFA 4QS7A 1MDUB 1X9JA 5TKYA 1HPMA 5LJWA 5BRDA 1EQYA 1HJOA 1SQKA 4BVOA 3UKUB 4JD2A 3B8AX 1U2VA 4B1WB 2FF3B 3MMVA 1QZ5A 3CI5A 2UYTA 3D2EA 3KVGA 3JS6A 3GE1A 1Z6RA 3W3DA 5EVZA 3WEEA 1V4TA 3BUZB 5AQUA 4BRFA 3ULEB 2A42A 4K42A 4FWMA 3LM2A 1BU6O 2OANA 1HKBA 2F9TA 4FWLA 3VF6A 2Q1NA 4IXCA 1T44A 4XH5A 1J6ZA 2IVNA 2CGLA 3M6GA 3VETA 1GLBG 2P9KA 4BR4A 3DXMB 3MK6A 1MA9B 5EX5A 1JCGA 4FWSA 4BGAA 4XEIA 3R6MA 2D0OA 3FZMA 1ZC6A 2ASOA 4EHUA 4CBUA 3HI0A 3MN9A 3H1QA 5CE3A 2ITMA 1ZXOA 3R9PA 1CZAN 3CQXA 2FLOA 3CJCA 2P9SB 3H45C 3L6QA 2VYPA 4LC9B 3L0QA 5ELZA 4BGBA 3AAQA 3HM8A 4FWRA 4BRIA 1BOTO 4I6MA 2ZGZA 3FZFA 5F0XA 5AQOA 3HZ6A 1WUAA 3BF3A 1BUPA 4KBOA 4BRHA 2Q2RA 3SLCA 2ZGYA 2E2QA 3I8BA 3ENHA 2A40A 4CZMA 3UKRA 5LY3A 4BR7A 1GLAG 4JNEA 1GLLO 1X3NA 2D0PA 2ASPA 1ATNA 1JCEA 3ZX2A 3IMXA 4B1VA 1OKJA 4ISGA 4CZJA 2HF3A 4DQ8A 3EN9A 5JLHA 2HF4A 5JLFA 4IJNA 4PL8A 4FOEA 4XH4A 3L4IA 1G99A 4BG8A 4IZ9A 3WXKA 2NLXA 4IO8A 1NLVA 3EKSA 4BQZA 2YHXA 3O1WA 4GNIA 3FZKA 2F9WA 4JD2B 4K25A 1U2VB 4JHDB 1Y64A 1QQNA 4M7YA 1NBWA 3WXLA 1RDWX 3WQTA 3ZEUA 4BG9A 4BRKA 3WEEB 1QQOA 1K8KA 1BA1A 1LCUA 4HTLA 3WXIA 2QM1A 3RSEA 2QWOA 3KHYA 3G25A 4IJAA 3VGMA 5B8HA 4EAHD 3CJAA 2P9KB 1NGGA 4CZKA 4QS8A 5AFUA 2P9IB 4GY2B 2P9UA 2P9PB 3QFUA 3VENA 4YDUC 1T6DA 4F9OA 1DKGD 2A41A 2KHOA 2QWRA 4CI6A 4MLHA 4BRDA 3VPZA 3SJHA 3WQUA 4CZGA 5AQXA 1JCFA 5AQPA 3GDQA 4CD3A 4NB4A 1LOTB 2A5XA 5ADXH 4I6MB 2GTDA 3H3NO 2YCHA 2W41A 2CGKA 2YI1A 5AQFA 4JN4A 2ZF5O 4B1UB 5LJVA 1WOQA 3QBWA 5KPTA 3BF1A 5F2RA 2PAVA 4BRNA 3O80A 4FOIA 1ZBSA 4BRCA 4MO5A 4B1YB 3FFKB 2P9LA 5JMVA 4H0VB 4K41A 4H5NA 3CJ1A 4H5WA 4EIAA 1KAZA 4BR0A 3H46O 5AZJA 3VESA 2HOEA 3CJBA 3FE1A 3CJ9A 4FWKA 1YVNA 3MN6A 2GWJA 4WQ5C 2D4WA 4CZHA 3U9ZA 5AQWA 3ZEUB 1NGJA 3O5BA 3MCPA 5AQQA 4H0OA 3D7EO 1TUUA 2V51B 4PL7A 4EFHA 3TU5A 3CIPA 3QMLA 4BR9A 1K8KB 2QWLA 5BN9A 3D2FA 3H1VX 4MO4A 3M1FA 4CZLA 4IWVA 2W40A 3O1BA 2IVPA 4M7XA 5AZIA 5EXWA 3P4IA 4DHYA 1NWKA 3KZBA 3CHWA 2J4RA 2P9UB 1X3MA 4AM7A 3U9DA 3LDQA 2CGJA 3S41A 4A2AA 5BR9A 3HBTA 4FSVA 2BUPA 2YHWA 4H0PA 3C7NA 3UE5A 1MWMA 2GELA 4M63C 2IIRA 4WQ4C 4A61A 1SAZA 4O8KA 3QDKA 3TPQA 3U8XA 1GLJO 3ENOA 2GUPA 5KQDA 1ATRA 2Q0UA 3VEXA 4CZEA 5BRHA 3GG4A 2QXLA 2V52B 1QZ6A 3AARA 1T6CA 2QWQA 4BR2A 5BPNA 1YUWA 3VERA 3CERA 5JICA 4BREA 1NMDA 5AQNA 5BN8A 4L3QA 2WUSA 3O8MA 5FPNA 2Q97A 4FPAA 3D2EB 4HWIA 1HKCA 3FR0A 1HX1A 3FZHA 3VEZA 2E20A 4XH1A 2P9LB 2QW9A 2E2OA 3J8AA 5AZJB 4BRGA 1Q18A 4FO0A 5AQRA 4FPBA 3VGLA 4CJ7A 4A2BA 3ID8A 2PBDA 3EKUA 4RWTA 2QWPA 2ZWHA 1YXQA 1S3XA 4BROA 5AQSA 3DXKA 2YJFA 2A3ZA 4FWNA 1XQSC 2EWSA 4E1JA 4EHTA 3FGUA 3QB0A 1C0FA 5ADXA 3D2FB 5BRFA 3LM9A 4YDUA 3U4LA 2NRHA 2D1KA 3VF4A 1C0GA 3A0IX 4H03B 5I9EB 1SZ2A 3GBTA 5AZIB 2V7YA 3A8YA 4B9QA 1RFQA 3VOVA 5BPMA 4JAXA 1NGCA 3CETA 1R59O 1YAGA 3F9MA 4CBWA 3W0LA 2QWNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FLCO 2P5OA 3HPHA 2FSJA 1TK0A 1WSEA 4BRQA 2E2PA 3V81A 3ZCMA 5M1OA 4FLYA 3MAQA 3VEOA 4B1ZA 4DMNA 5F1XA 4FM1A 3U3YA 3BP8A 1EWRA 4EP5A 3RWUA 3LPTA 2D0CA 4O8UA 1IBKK 3KLIA 3SYZA 4NCBA 4JK8A 3P31A 4RTFD 1RBTA 4KH6A 5AR0A 3MEGA 4CD1A 3IUCA 4JHDA 4B9NA 1ESVA 3VEVA 4BDZA 4KRFA 2GEMA 3T1HK 1VQ5N 1QS4A 1RT2A 3TAFA 3OVNA 3AVMA 4HHTA 4DF4A 3JXUA 1BO5O 4E19A 3THXB 4I2QA 4GVEA 1X9SA 1NGIA 5C2DA 3SAGA 4BQLA 1CXUA 3O08A 3UB5A 3ZETA 3LDNA 1HRHA 4H0TB 3I55N 4C8NA 2Q36A 3SUPA 1MU2A 5FPMA 1Z05A 2KLAA 3VEYA 3HT3A 3QEWA 3P1GA 3SUNA 3RTVA 5FROA 4WFBL 1HKGA 3O3FA 1NGBA 3CQ8A 4K0KK 3PLAA 2BDPA 3WXJA 2LSNA 4FLUA 3O9QA 4YHHK 1UOCA 1FXXA 4CEQA 3MN7A 2VQEK 3OHRA 2O4IA 1RT6A 1QSSA 2WFBA 3TSPA 4YNQA 4K43A 2H3GX 3LWLA 4BC3A 3CC4N 2OPPA 2NRVA 4WYBA 3OYIA 2I7PA 4B9SA 2GX9A 4CJ3A 4QCLA 2KFZA 3O4WA 1JLEA 2BTFA 4H5VA 1D8YA 2FBYA 3DWLA 4DSLA 3LDLA 4KTQA 1HR0K 1VQ8N 1E4FT 4DWIA 2HHTA 2NRXA 3DXMA 4BRLA 4CHNA 3E9PA 3A5NC 5AQHA 3IDHA 3L2WA 4FCYA 2OYQA 5E84A 3E9OA 1CZ9A 4F8RA 3I33A 3ZX3A 1WSJA 4YOYA 4FLWA 4H0YB 4B3SK 5FRNA 5GADP 1BIUA 5M1KA 1ATSA 1JL2A 2P9SA 2FSNA 4M3XA 3AV9A 1T8EA 2I5JA 4CECA 5BPLA 2HHXA 4O5FA 1BHLA 5HRRA 4DS5A 1DTTA 1RNHA 5AFUH 1JLQA 3MN5A 4C23A 3PX4A 3CFOA 2HMPA 3J80O 4PKHA 2QKBA 3MEDA 3OYKA 3V9SA 2QKKA 2XY8A 4X62K 3R8EA 4O0JA 4QS7A 2YX6A 1NMNA 1HPMA 5LJWA 2O8EA 1VQ7N 2ETJA 2Z1IA 1SQKA 3VTHA 5BR8K 4CGHA 3UKUB 4O0IA 1VQLN 3SZ2A 4A57A 1QZ5A 2HHHK 4F2SA 3D2EA 3MEEA 3NF8A 4KB1A 5LL6Z 2JWLA 1S9EA 1Z6RA 1S5JA 3WEEA 3TTFA 1NK9A 1NK6A 2UXBK 4FWMA 2YNGA 3LP1A 1BU6O 2HHQA 4JLHA 1J6ZA 1M90O 3MX2A 3M6GA 1IG9A 1MA9B 3B6PA 4MQ3A 1RTDA 3NH2A 3JSMA 4JKAA 2RF2A 4CE9A 1VQKN 3SAHA 3HI0A 3KK2A 3DLRA 4FJHA 5MLCQ 1YTUA 4DLGA 1UA1A 5SWMA 1KSPA 1NJYA 2OA8A 1W2BM 1IBMK 4EP4A 1QSLA 3DYAA 3HM8A 3KK3A 4LH5A 3FZFA 4CHYA 3HZ6A 1XHXA 3AVLA 4KBOA 3MWTA 1SS6A 3O4QA 2E2QA 2A40A 2VGMA 4BR7A 1R0AA 3I56N 1ATNA 3CCEN 1JXEA 4DFPA 3IMXA 3K5OA 4ISGA 3QINA 4JI6K 2HF3A 2OCEA 5IWAK 1WSGA 1QVFM 4IJNA 3KKSA 3O9UA 4ILJA 2NLXA 4IO8A 2XY5A 3DLBA 3BGRA 3O1WA 4GNIA 1VQPN 3AVGA 4CJKA 4FZYA 2HVHA 4K25A 4JD2B 3TWHA 4ZTFA 1N34K 4JHDB 1Y64A 3ZT0A 1NBWA 1Y97A 1HNVA 1RTJA 2VWKA 4KI4A 1A5WA 4DR5K 3S3OA 3I8DA 1TAQA 5GIPA 1IO2A 3KHYA 2GBZA 2O8BB 4DR7K 1EXQA 4R79A 1BQMA 2P9UA 1YJWN 1S1UA 2HBJA 1ZYQA 1TL1A 1DKGD 2OZMA 1RBRA 3VQCA 4CCHA 1JXBA 4CI6A 1VSEA 3VPZA 3SJHA 3WQUA 4JKEA 4JI3K 1JCFA 4O44A 2G8FA 1FKOA 4Q5VA 4DS4A 3HJFA 4J2AA 2YCHA 5KGWA 1KD1O 1N5YA 2ZF5O 4B1UB 5LJVA 4RW6A 3QBWA 1RBSA 5FRMA 3OYBA 2ZQBA 4CJ4A 4BRNA 3FFKB 2G8HA 4K41A 4Z4EA 4BR0A 3P38A 3VESA 4BWJA 3K57A 4CF2A 1UA0A 4FWKA 1YVNA 3MN6A 3O3HA 5DK5A 2PFUA 4CZHA 3L8BA 3ZEUB 3QNNA 3OJUA 3O5BA 3MCPA 3OW2M 4H0OA 4PL7A 4EFHA 1IBLK 4BR9A 4BE2A 5BN9A 3ZT2A 3D2FA 4A5AA 4B9VA 3OYGA 4EZ9A 1VK0A 3O1BA 1OH5A 2IVPA 3NBPA 3AVJA 4AM7A 3O9SA 3LDQA 1HNWK 3S41A 5C12A 1VSJA 4DSJA 2HHVA 3L3VA 4C8KA 3HBTA 4FSVA 4H0PA 3DLLL 1L3TA 3UE5A 3ZSOA 3CCMN 4G9ZA 3ZYYX 1NKBA 3LP2A 4ID5A 4N41A 3OYFA 3ENOA 3VEXA 4CZEA 5BRHA 4JI8K 3ITHA 4WFAL 2QXLA 4F4KA 3PO5A 2V52B 3AARA 2QWQA 1SKSA 2O8EB 3F2KA 5CZ2A 1EETA 1L3UA 5JICA 3NAEA 3SBTA 5BN8A 1U48A 3KLEA 3OYEA 3O8MA 4IDKA 2Q97A 4KTZA 5FPNA 4FJIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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