3WEEA

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
462
structure length
425
Chain Sequence
b'QDSILIIYPRSQTTLVQFGLNEETFTVPELEIPTQIYRTTRQDGSYTYHSTNKDNKAELIKPIQNGEIIDISAFTQFLRLIFVSILSDRSNIPLLLITHHSWSQSDLEIITQYVFESLEINNLIQLPASLAATYSMISLQNCIIDVGTHHTDIIPIVDYAQLDHLVSSIPMGGQSINDSLKKLLPQWDDDQIESLKKSPIFEVLSDDAKKLSSFDFGDEGTLNVAEIITSGRNVKNSDLEFNTFWDEKGNEIKVGKQRFQGNNLIKNISNRVGLTLDNIDDINKAKAVWENIIIVGGTTSISGFKEALLGQLLKDHLIIEPEEEKSKREEEAKSVLPAATKKKSKFMTNSTAFVPTIEYVQPTVIKLAKYPDYFPEWKKSGYSEIIFLGAQIVSKQIFTHPKDTFYITREKYNMKGPAALWDVQF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein ARP9
molecule tags Transcription regulator
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
total genus 111
structure length 425
sequence length 462
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA01
3.90.640.60 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeA03
4BRDA 4PL8A 3A5OC 4HWIA 4MLHA 4XH4A 3D7EO 3AAQA 4K43A 2YHWA 1BOTO 2BUPA 4BG9A 1HLUA 2P9KA 3CJ7A 3MN6A 3O8MA 4QS8A 2E20A 4HTLA 1QZ6A 1TUYA 4BRGA 4BGBA 4FOEA 5EY4A 1ZC6A 4BRQA 5JLFA 3IFRA 1WOQA 3LDLA 4CI6A 3O1WA 3DXKA 3RSEA 1ZBSA 5FPNA 1HKBA 4I6MB 4WYBA 2P9SB 1NGHA 1MWMA 3CJAA 4BRKA 2E8AA 4IXCA 4BG8A 3CIPA 2E1ZA 5AQYA 3CJ9A 4PKHA 3EO3A 1QQOA 3TPQA 3WT0A 1HUXA 3LM9A 3GDQA 3VF6A 1C0GA 3JS6A 3R8EA 1YAGA 3FZKA 1X3NA 2HF3A 2ZGZA 3O6WA 4BRNA 4BR4A 1S22A 4A2AA 2W40A 1NGEA 4RCHA 3CERA 4FWKA 5F1XA 2QWMA 5FPEA 3VGMA 1T6DA 3C0BA 3MN9A 1ZXOA 1GLBG 5BN8A 1YUWA 3UKRA 3H1QA 4FO0A 3AARA 3U9ZA 4BRHA 5ADXH 4MO4A 1V4SA 4EIAA 3MN5A 3ENOA 5BRHA 5AQGA 1SZ2A 3GG4A 3GOIA 4PKGA 5TKYA 5LY3A 3M3ZA 4FOIA 5I9EB 3HBTA 3A5NC 1HKGA 3ZEUA 1XUPO 2KHOA 1TYQB 3LDNA 2ITMA 3QFPA 1IJJA 4WQ4A 1MDUB 1X9JA 1V4TA 3MMVA 3I33A 4BR5A 1JCEA 3U4LA 4CZIA 4BR0A 1ATRA 4FPAA 4ISEA 4L3QA 4CZHA 4FWQA 3KVGA 5AQMA 2P9NA 1IG8A 2ASPA 2GEMA 4WQ4C 5BRDA 4IZ9A 4FL9A 1BA0A 4DB3A 3FZFA 3L4IA 1BUPA 1RFQA 4E1JA 2YCHA 2CH6A 3VEWA 4BR7A 1LCUA 2UYTA 4M7XA 4QS7A 1Q18A 4O5FA 3ULEB 1HJOA 3D2EA 4ISGA 3HSCA 3H1VX 3EKSA 5AQTA 4CZEA 3FR0A 4CBUA 4H0TB 3LM2A 4IJNA 3C7NA 4WQ5A 1TUUA 3S41A 3H46O 5BPNA 3O80A 2P9SA 4BR2A 5EXWA 3HZ6A 3DWLA 3VOVA 5LJVA 2CGJA 3CQXA 4FWSA 1H1VA 1NGCA 3QICA 1Z6RA 4AM7A 3UB5A 1BU6O 2D1KA 4BRCA 2AP1A 3P4IA 3ULEA 3FZHA 4FPBA 2PBDA 2VWBA 3M1FA 2WUSA 4RTFD 2HMPA 4H0VB 5AQKA 4BRIA 4H5RA 5F0XA 2YI1A 4EHTA 3VEVA 1BO5O 2F9WA 1U2VA 3BP8A 4FWLA 5ELZA 2P9LB 4Z94A 2YJFA 3VGLA 3D2EB 4B1VA 3QDKA 3AY9A 3VENA 2QWPA 3A8YA 4FWRA 3CQYA 3GE1A 3VF4A 4XH5A 1KAZA 1QHAA 1X3MA 4B1XB 4IO8A 3CHWA 4MO5A 1HKCA 3EZWA 2ASOA 4H0XB 1G99A 4FWMA 2BTFA 3VF2A 3LDOA 3WXLA 5AZIA 1QQNA 1GLDG 3G25A 4J8FA 1NMDA 3EKUA 4CJ7A 4YDUC 2E2NA 3UE5A 1WUAA 4BROA 5AFUH 1RDWX 2D4WA 4Y0WA 4AM6A 5BR9A 2VCPA 2QWLA 3J8AA 3IMXA 2CH5A 4CZMA 2PAVA 1CZAN 1E4GT 4CBWA 3VEOA 4BRAA 2ZGYA 3FZMA 4QS9A 2GUPA 2D0OA 4LC9B 3WXKA 4BC4A 3BUZB 3BF3A 3ID8A 1DGKN 3UKUA 4YDUA 2FSNA 4H0OA 5AQNA 4B1ZA 3DXMB 5BPMA 2E1YA 2IVPA 2J4RA 4BGAA 4IJAA 2Q36A 3WEEB 1NGIA 1P8ZA 3B8AX 1NLVA 4FWNA 2P9UA 3WQUA 3I8BA 4MLEA 1S3XA 2FXUA 4CD1A 4BRFA 5JLHA 3GL1A 1GLEG 1D4XA 2QM1A 4B1YB 3LDQA 3BF1A 4CZKA 1GLAG 4CZJA 3VEXA 4BVOA 2D0PA 2P9KB 3OHRA 5AQHA 5AQPA 4BREA 3C7NB 3CI5A 4M63C 3ZX0A 2A42A 4JNEA 4PL7A 4BRPA 2EWSA 3FLCO 5AQUA 2NLXA 3MK6A 3SJHA 2IVOA 3VPZA 1NGBA 2QWRA 2IVNA 1T44A 5BPLA 4JN4A 4B1UB 1Y64A 3ZETB 3QMLA 2DPNA 4H5VA 2GWJA 4ISFA 4JHDA 5LJWA 5AQQA 4XH1A 2V7YA 4FWPA 1GLCG 1DEJA 4DQ8A 3MCPA 4GY2B 4CZFA 2QXLA 3ATUA 1E4FT 5AQVA 5F2RA 3HTVA 3MN7A 2NRHA 2V52B 1MA9B 3H3NO 3O1BA 2GELA 3CETA 3W3DA 1J6ZA 1XC3A 3VERA 1BA1A 2FSKA 4EAHD 2HOEA 3QFUA 4CZLA 1K8KA 4NO7A 4BRLA 3QBWA 2NZTA 1XQSC 4BRMA 3UKUB 5AZJB 3JXUA 3VEZA 4F9OA 3H6EA 4KBOA 1HPMA 3F9MA 2CGKA 4O8KA 4CZGA 2P9UB 3EL2A 4GNIA 1OKJA 1TYQA 4XEIA 2YHXA 1KXPA 3ZEUB 5KQDA 1LOTB 3AAPA 3VEYA 4BR9A 3TU5A 3WQTA 2FLOA 4CD3A 3A5LC 3QB0A 2A40A 3FE1A 3L6QA 1NGFA 1NWKA 4M7YA 5AQXA 2V51B 5AQOA 5AQZA 4C23A 5EX5A 2QWNA 3MDQA 4H0PA 4DHYA 1NGDA 2Q2RA 3SK3A 4BVPA 1GLJO 4FWOA 5AQSA 4H03B 5KQ8A 3W0LA 5AZJA 4EFHA 3FGUA 3D2FA 3SMPA 5AZIB 2V7ZA 3HI0A 4BQLA 3KZBA 4A61A 2GTDA 2IIRA 3A5MC 2P9LA 2FF6A 5BN9A 2I7NA 4BC5A 5KPRA 3ZX2A 1NGJA 5BRFA 5FPDA 2FSJA 2ZWHA 1GLLO 2H3GX 2Q31A 1KAXA 4DCHA 1BDGA 3R9PA 2F9TA 3DXKB 3WUHA 3BEXA 1QZ5A 4H5WA 3DAWA 1JCGA 4A62A 5AFUA 3R6MA 2GWKA 1K8KB 3DJCA 5AQIA 5KPTA 1NBWA 1U6ZA 4EHUA 2W41A 1SQKA 1U2VB 2Q1NA 3VETA 1Z05A 2Q0RA 3ZETA 5AQRA 5KPZA 5BREA 4K41A 1C0FA 4I6MA 1JCFA 5AQJA 3IDHA 4H5TA 4BQZA 2E88A 5EOYA 3RSEB 4BC3A 3L0QA 3VESA 4H5NA 3SLCA 2P9IA 1MWKA 2FF3B 3WXIA 2OANA 1ATNA 5CE3A 4JD2A 2E2PA 2QWOA 1BG3A 3D2FB 4IWVA 3O4WA 2P9NB 3LDPA 1T6CA 2QW9A 3WEEA 4K25A 1BWFO 3FZLA 3SMSA 1QQMA 4CBXA 1ESVA 4B1WB 4B9QA 2A41A 2QWQA 5EVZA 2AA4A 1KAYA 1R59O 5AQFA 3IUCA 1NM1A 2HF4A 3WXJA 2ZF5O 3CJCA 1HX1A 2VYPA 3KHYA 5E26A 3H3OB 5AQWA 3CJBA 2A6AA 4RWTA 1DKGD 3H45C 2P9PA 2YJEA 3DXMA 2A3ZA 3M6GA 3CJ1A 3QBXA 2ASMA 3VGKA 1NGGA 3O5BA 2Q0UA 2P9PB 3ENHA 3HM8A 4H0YB 1RGIA 3A0IX 3GBTA 5E84A 4WQ5C 5JICA 4BC2A 1YXQA 2I7PA 5JMVA 5FPMA 4FSVA 1GLFO 3UKRB 5AR0A 1NGAA 3LL3A 2A5XA 3O08A 2CGLA 4JAXA 5ADXA 1EQYA 3U8XA 4JD2B 4K42A 3FFKB 4A2BA 5AQLA 2P9IB 5B8HA 3ATVA 4NB4A 4PKIA 2E2OA 3U9DA 3EN9A 4JHDB 2E2QA 1SAZA 2Q97A 2YHYA 1YVNA 1ATSA 3ZX3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RR7A 3TR8A 4CIEA 2W42A 5GIOA 3KD5E 4NLBA 4DLEA 3CJ7A 2KLAA 3QLHA 4QS8A 1L3TA 5HLFA 5JS1A 4CHNA 1VK0A 1YTAA 2G8UA 1LW2A 1JLEA 3CFOA 3IFRA 3OBWA 3SUPA 4BECA 4BY9C 4M42A 4DSIA 4I6MB 4O0IA 3K9JA 4CHOA 4LH4A 4IXCA 1LW0A 3AGRA 4BG8A 4B08A 3CJ9A 2GUIA 3EO3A 2ZJRL 4FLWA 1OVYA 4GKJK 5M1QA 3VF6A 5J2PA 4JKHA 1C0GA 3JS6A 1YAGA 2HF3A 2ZGZA 3O6WA 3IAYA 4LH5A 1BI4B 4BRNA 3OY9A 4BR4A 4RCHA 2O8CA 5FLXO 2PYJA 4LF7K 1T6DA 1ZXOA 1JLQA 3UKRA 3AARA 3P38A 4DTJA 3ZLJA 2KKZA 5ADXH 3HOTA 1WSHA 1TK8A 2OPSA 4PKGA 5TKYA 3VQ4A 5LY3A 3M3ZA 3U6FA 3ZEUA 2VG6A 3ZSWA 3QFPA 3K59A 3RWUA 4JI2K 1NJZA 3I33A 2IDOA 4BR5A 1JCEA 5C2FA 5IT9O 4NXMK 4ISEA 1WBDA 3SNNA 3KK3A 4OGEA 4FWQA 2F96A 3AO3A 4Q5VA 3LAMA 4DB3A 1RFQA 4E1JA 4WFBL 3VEWA 4M7XA 4QS7A 1Q18A 3MEGA 2XY8A 3O9UA 3DYAA 4TSXA 4AHCA 3PX0A 1JKHA 3EKSA 4RW7A 1WSFA 4KHSA 1KD1O 1C0TA 2QEXN 4CJUA 4WQ5A 4ILGB 3JYTA 5BPNA 3O80A 4BR2A 3HZ6A 1TKTA 2NRVA 3ZSOA 4E1MA 3RMCA 1J9AA 1KVAA 5CR4A 3ZT4A 1NGCA 3QICA 4AM7A 1NG9A 3UB5A 4YOVA 3DLEA 1RT1A 2VWBA 4RTFD 2WUSA 4KAZA 4F3TA 2QKBA 4X65K 3OW2M 3VQEA 2X74A 5ELZA 3TTCA 2P9LB 2VG7A 1VQPN 3L2QA 3KD1E 1KRPA 1TKXA 4DR7K 3TTFA 3RVCA 4CF0A 3D2EB 1SUQA 4CJVA 4B1VA 2UXBK 3AY9A 3OYLA 3L3VA 3ZT0A 4FWRA 3CQYA 3GE1A 1WN7A 4DV4K 1KAZA 4WE1A 3SYZA 1QHAA 1K9MO 1X3MA 3THXB 4IO8A 4JI5K 3EZWA 2HHSA 4FWMA 2F8SA 2BTFA 4LSNA 1NJXA 3VF2A 5AZIA 1GLDG 3KK1A 3DLLL 3LZIA 3K2PA 4PWDA 4CEOA 4RW4A 3EKUA 1K8AO 1RILA 5JVGL 2E2NA 1RT3A 4BROA 5AFUH 1RDWX 4FVMA 4R5PA 2D4WA 4DSEA 3O3FA 1NK9A 2G8HA 3LPUA 2IC3A 3IMXA 4CZMA 1E4GT 2VGNA 1C0MA 3FZMA 2O8BB 3WXKA 4CJFA 4JRPA 1GOCA 4YDUA 5AQNA 4DQRA 3DXMB 5LL6Z 4BGAA 1RT5A 4FK2A 3M8QA 4FWNA 3WQUA 2P9UA 3S3MA 1QQCA 3QEXA 2O8FA 1VSKA 1S3XA 3C6HA 5C0YA 4BWMA 4IG0A 5JLHA 4CJQA 1D4XA 1U04A 3CXCM 4B1YB 2P5GA 3LDQA 4CEAA 4N41A 4OKJA 4BVOA 2D0PA 1T3VA 3OHRA 3SAFA 3C65A 3C7NB 3OYNA 3KIOA 3CI5A 3RMDA 4YOWA 3ZSQA 3KJVA 3S3NA 2NRXA 4DV6K 3BZKA 4JNEA 2O4GA 3AVHA 3K5NA 3V4IA 1UAXA 3QIPA 1FKPA 4FJLA 4C8NA 3FLCO 1ZBFA 4HCBA 1JLAA 1Q9YA 4C8MA 3LWMA 3ZSXA 4L8RB 1NGBA 4AILC 4F4KA 4B9VA 5BPLA 4B1UB 3ZETB 3THYB 2GWJA 4I2PA 4JHDA 2D0CA 2VWJA 4FWPA 4DQ8A 4CZFA 3HXMA 2QXLA 2YNHA 1NJYA 3HTVA 1QVGM 3O1BA 2NRHA 1QSLA 3W3DA 2QXFA 2IOCA 3V1OA 1BA1A 4ICLA 5KI6A 2FSKA 4EAHD 4OO1J 3QFUA 4WF9L 3CYGA 4B3TK 4KREA 2NZTA 3QNOA 3VEZA 3AVMA 3OYCA 3LAKA 4F9OA 4JKCA 3H6EA 4JI4K 4CEBA 3EL2A 4DUYK 4XEIA 2YHXA 3ZEUB 4F2SA 3V9UA 4FW2A 3KLGA 2FLOA 2A40A 1W7AA 1RTDA 3KKSA 4C23A 4E7KA 5EX5A 2JWKA 1P90A 3MDQA 4RW8A 5DM6L 5KQ8A 5D3GA 4CECA 3PV8A 5AZJA 3AO1A 4EFHA 3P39A 3FFIA 4W5TA 5CYMA 4UY8O 3KZBA 2GTDA 4RW6A 4I2QA 3A5MC 4KI4A 3CCLN 1IH7A 4BC5A 5A2QO 3SUOA 1A5VA 5BRFA 5FPDA 4W5OA 4JI8K 1YT3A 4FK0A 4CE9A 2Y1JA 1EWRA 5HRSA 3CCJN 1BDGA 4E89A 2WC9A 3I56N 3OS0A 3BEXA 4H5WA 1JCGA 4FLZA 3TI0A 1KTQA 3R6MA 2VG5A 4O4GA 5HRNA 4BE7B 4KKOA 5MLCQ 3SQ1A 2B5JA 1NBWA 3LP2A 4G9ZA 1SQKA 3VETA 2Q0RA 4JI3K 1D8YA 1DTQA 1VRTA 1ITGA 1ASUA 3CCVN 3OYDA 4FJMA 2LSNA 1C0FA 1VAZA 4IOXA 1B9DA 3IDHA 3NE6A 4BE1A 4BC3A 2HNDA 3LDSA 4O55A 3ZT2A 3CC2N 4IWVA 2P9NB 3DMJA 1T6CA 3V1RA 4KTWA 4IFEA 3WEEA 4K25A 4CHPA 3FZLA 3M8SA 4CBXA 1ESVA 2KFNA 1HQEA 4OPHA 1EP4A 5C12A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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