3WEEA

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
462
structure length
425
Chain Sequence
QDSILIIYPRSQTTLVQFGLNEETFTVPELEIPTQIYRTTRQDGSYTYHSTNKDNKAELIKPIQNGEIIDISAFTQFLRLIFVSILSDRSNIPLLLITHHSWSQSDLEIITQYVFESLEINNLIQLPASLAATYSMISLQNCIIDVGTHHTDIIPIVDYAQLDHLVSSIPMGGQSINDSLKKLLPQWDDDQIESLKKSPIFEVLSDDAKKLSSFDFGDEGTLNVAEIITSGRNVKNSDLEFNTFWDEKGNEIKVGKQRFQGNNLIKNISNRVGLTLDNIDDINKAKAVWENIIIVGGTTSISGFKEALLGQLLKDHLIIEPEEEKSKREEEAKSVLPAATKKKSKFMTNSTAFVPTIEYVQPTVIKLAKYPDYFPEWKKSGYSEIIFLGAQIVSKQIFTHPKDTFYITREKYNMKGPAALWDVQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Actin-like protein ARP9
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 111
structure length 425
sequence length 462
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA01
3.90.640.60 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeA03
1GLDG 3C7NB 4PKHA 3U9DA 1QHAA 5F1XA 1K8KA 1Y64A 5BN9A 1BG3A 3U9ZA 4B1YB 2IVPA 2D4WA 3QFUA 3R8EA 4RWTA 2P9KB 4CBXA 2EWSA 3QDKA 1BWFO 3DXKA 3WUHA 4WYBA 5BPMA 1YAGA 1NGDA 4RCHA 5EVZA 3FFKB 3GG4A 2YJEA 2V52B 5AQQA 1HKBA 2P9SA 4H5WA 3HTVA 1NGFA 1ATSA 2HOEA 4JAXA 1YVNA 3VGKA 3U4LA 3CJCA 3R6MA 4FWRA 1NBWA 4BRNA 5AQOA 3GE1A 4K43A 3F9MA 4CZGA 4PL7A 4I6MB 3WEEA 1D4XA 5FPEA 4B9QA 2E2OA 5JICA 1DGKN 5AZIA 2HF3A 3H45C 2E8AA 2P9UA 1QZ5A 2D1KA 2E2QA 2FSKA 3VF6A 2F9TA 3D2EA 3UKRA 4XEIA 5ADXH 4H0PA 2GEMA 5EOYA 4EHTA 3LM9A 5BPNA 4DHYA 1NGJA 5AR0A 5JLHA 3LDNA 4H0TB 4BR2A 2PBDA 1C0GA 3IUCA 2Q31A 4M7YA 5LJWA 5AQNA 4MLEA 2WUSA 4BC5A 3FZLA 3JXUA 4FO0A 4B1XB 2QXLA 5FPMA 3FE1A 3UB5A 1GLFO 1KAXA 3L0QA 4BR4A 1NM1A 3FGUA 4IJAA 1S22A 3A5MC 3MMVA 4JD2A 2QWOA 1NGAA 3MN9A 3ID8A 3ENHA 2GWJA 2I7NA 5JLFA 3UKUA 2Q0UA 1BOTO 4BGAA 5FPDA 1NLVA 1T6CA 4ISGA 2V7ZA 4C23A 4FWOA 4ISFA 3LDQA 3WXLA 1BDGA 4CZLA 2IVOA 4PKIA 4LC9B 4FWNA 2A6AA 2FF3B 2FSNA 3IMXA 3VPZA 1H1VA 4K42A 1T44A 4H0XB 4BRMA 2YHYA 4B1ZA 1P8ZA 1X9JA 1GLCG 3J8AA 4CZIA 1RGIA 3CETA 3JS6A 3VF4A 2YJFA 2P9SB 3ZX0A 5LY3A 1HKCA 3L4IA 2NLXA 3QBWA 2Q0RA 3ULEB 2VYPA 3A5OC 3EO3A 3GL1A 5ELZA 4A2BA 3WXJA 4CZHA 3O5BA 3AAPA 1TUYA 1JCGA 3SLCA 3FR0A 4CJ7A 4CBWA 2ASMA 5AQHA 4MLHA 1SZ2A 1G99A 3P4IA 5AQMA 2NZTA 4JN4A 3SMPA 3VEOA 5BREA 2A3ZA 2CH5A 3RSEA 3VEZA 2P9PB 5CE3A 1XQSC 4RTFD 4H5NA 4BC2A 1BA0A 3SJHA 4BR5A 2J4RA 1R59O 3BUZB 1GLAG 1TYQA 1LOTB 3KVGA 1BU6O 2VCPA 4FOEA 1V4TA 3FZFA 4DCHA 2A40A 3W3DA 1ESVA 3VETA 2OANA 2CGJA 3FLCO 5KPRA 3H3NO 2ASPA 3CERA 1C0FA 2UYTA 3VERA 3H1QA 3L6QA 1DEJA 4NB4A 3SK3A 4JHDA 3WXKA 3WXIA 3ZEUB 4CZEA 2Q36A 3U8XA 4BVOA 5AZJA 4E1JA 2W41A 3H46O 4QS8A 3GBTA 1BUPA 1OKJA 4BR9A 3VEXA 3C7NA 3M1FA 3EN9A 2BUPA 5AQVA 3ATVA 3AARA 5EX5A 3WT0A 2CGLA 2Q97A 4YDUA 2E2PA 3ATUA 5AQYA 1WOQA 1E4GT 3MCPA 5JMVA 1DKGD 3VEWA 2P9NA 2P9IA 3FZKA 1MA9B 3KZBA 4B1WB 5TKYA 4WQ4C 2V7YA 4DQ8A 4BRKA 3DXMB 3D2FB 1Z6RA 4MO4A 5AFUA 1LCUA 3A8YA 3O1BA 3ZETB 3A5LC 4H0OA 2Q2RA 5BRHA 3TU5A 3VEVA 4BRQA 3HZ6A 4DB3A 1ATNA 4PKGA 1IJJA 3UE5A 4CZKA 3AAQA 2KHOA 4FSVA 1NGEA 3CJAA 2P9LA 3CJ7A 3CQXA 5AQPA 4B1VA 4EAHD 3IFRA 3I8BA 4M7XA 2GELA 3HBTA 1ATRA 3W0LA 1RFQA 1U2VA 4A62A 1K8KB 2A42A 3S41A 4AM7A 4FWLA 4NO7A 5AQXA 3CQYA 3VGLA 2HMPA 4I6MA 1NMDA 4IXCA 4AM6A 4HTLA 2YI1A 3I33A 2E20A 3AY9A 3DXKB 5EY4A 3EKSA 1GLEG 3VF2A 4H0YB 3LL3A 1JCEA 1E4FT 1HPMA 3EZWA 4FPBA 2ZGYA 4GY2B 3FZHA 2ZWHA 5KPZA 3HI0A 2DPNA 1NWKA 4CZMA 1HX1A 5BRFA 1QQMA 2I7PA 2QWMA 3IDHA 2IIRA 5KQ8A 3VOVA 5B8HA 1RDWX 1TYQB 1NGIA 4EHUA 4BR0A 5AQGA 4CZFA 4BRHA 1TUUA 2NRHA 3EL2A 2QM1A 4BGBA 4BG8A 4XH4A 1GLLO 2CH6A 1T6DA 4Y0WA 1GLBG 4EFHA 5AFUH 4FWPA 4K25A 3MK6A 3WEEB 5ADXA 3BF1A 3CJ9A 1KXPA 1HLUA 2ASOA 1U6ZA 3BP8A 4O8KA 5AZIB 3VEYA 4CBUA 3H3OB 2P9UB 3DAWA 3DWLA 1WUAA 1MDUB 3D2EB 5AQTA 3O80A 3R9PA 2GWKA 3UKRB 2FLOA 3ENOA 2AP1A 4WQ4A 4BREA 4IJNA 5AQSA 4FL9A 4B1UB 2ZF5O 5AQWA 4CD3A 5E26A 5F2RA 2P9NB 2P9IB 4JNEA 4H5RA 2A41A 4K41A 2GTDA 2E88A 5AQZA 1NGGA 3QFPA 2D0PA 1QQOA 5EXWA 4CZJA 3GDQA 3G25A 1SAZA 3HM8A 3C0BA 1NGCA 3HSCA 4BRPA 2QWNA 1QZ6A 2PAVA 1MWKA 4EIAA 1XUPO 5I9EB 1CZAN 4JD2B 3O8MA 4KBOA 2FXUA 3EKUA 4XH5A 5BR9A 4BRGA 5E84A 5AQRA 3ULEA 4F9OA 1QQNA 2P9LB 2D0OA 3CIPA 4WQ5C 5BRDA 2QWQA 4CI6A 2V51B 2FF6A 4H0VB 3UKUB 3A0IX 1Z05A 3O6WA 4FWMA 3TPQA 4BQLA 4IZ9A 5BN8A 1KAYA 1U2VB 4H5TA 4CD1A 4BR7A 4BRAA 4HWIA 5F0XA 4BRLA 1ZC6A 3SMSA 2P9KA 3B8AX 3VESA 1GLJO 3QBXA 4GNIA 3LDLA 2E2NA 3M3ZA 3GOIA 3QICA 3M6GA 3QB0A 1BA1A 3MN7A 5AQIA 3KHYA 2P9PA 2QWLA 4IO8A 4BRCA 2YHWA 4M63C 3H6EA 4FOIA 4H5VA 4BG9A 1HUXA 4FPAA 4BRFA 3FZMA 2VWBA 1NGHA 1X3MA 3MDQA 2GUPA 1HJOA 1Q18A 1MWMA 2W40A 4PL8A 3A5NC 1YUWA 2F9WA 4L3QA 2ZGZA 4FWSA 1EQYA 2FSJA 3CI5A 3VENA 1XC3A 3QMLA 1X3NA 1JCFA 4O5FA 2E1YA 3LM2A 4XH1A 3LDOA 5BPLA 3BF3A 1ZXOA 3ZEUA 2CGKA 2QWPA 4BROA 3WQTA 5KQDA 3VGMA 5FPNA 2YCHA 3H1VX 4QS7A 5LJVA 2H3GX 2ITMA 3RSEB 3D7EO 3O4WA 1S3XA 2YHXA 4FWKA 1YXQA 4J8FA 3BEXA 3OHRA 1HKGA 2AA4A 4QS9A 3CHWA 4FWQA 3MN5A 1NGBA 5AQUA 1ZBSA 3MN6A 1V4SA 4A61A 2A5XA 4ISEA 4Z94A 4H03B 2E1ZA 4BC4A 4BC3A 3LDPA 2BTFA 3D2FA 3DXMA 1IG8A 3WQUA 4YDUC 5KPTA 1SQKA 3ZETA 2QW9A 5AQKA 3ZX2A 3CJBA 4IWVA 3O1WA 4A2AA 1J6ZA 1BO5O 4BRDA 4WQ5A 4BRIA 4BQZA 3DJCA 3O08A 4JHDB 4BVPA 2QWRA 5AQLA 5AZJB 4MO5A 5AQJA 2Q1NA 3CJ1A 1KAZA 3ZX3A 5AQFA 2IVNA 2HF4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CHIA 1GLDG 1HR0K 3U9DA 3HRGA 4NLCA 1Y64A 1BG3A 3C94A 4NCBA 2DFEA 4DV7K 4BECA 4JV5K 4M3XA 4B9UA 3VTHA 1BWFO 3IKMA 2PYLA 1QVGM 1VQ4N 4LFBK 3DRSA 2KKZA 4LSNA 1K9MO 5BPMA 5D3GA 3C6HA 4JKDA 3AGRA 1BIZA 4RCHA 3FFKB 4YOXA 2YJEA 5AQQA 1VQON 1HKBA 4H5WA 4IFVA 1NGFA 4L8RB 4CGGA 1CXQA 4BDPA 3PX0A 3CFOA 4A5BA 4RW6A 3D45A 1QSYA 4BRNA 4YHHK 3GE1A 1IKVA 4WE1A 4CVNE 5GINA 4CECA 4FCYA 1NK8A 4JKGB 2NNWA 4I6MB 3CCEN 3KD1E 3H08A 1DGKN 2HF3A 3H45C 2E8AA 4ELUA 2P9UA 5SWMA 3SPYA 1BL3A 1WAFA 3D2EA 3UKRA 4XEIA 5ADXH 4H0PA 4FVUA 4E7IA 2BGGA 5EOYA 3V9SA 4EHTA 4B9LA 4DHYA 3KWGA 4H0TB 3SUNA 4DSKA 2NRVA 4RW4A 5GADP 4MLEA 3NDKA 3HSTB 3JXUA 4B1XB 2G8FA 3OYDA 3UB5A 1GLFO 1KAXA 4CFAA 3TAMA 3L0QA 5KI6A 1QSLA 4BWJA 1S22A 3O9QA 4FJHA 2QWOA 4KTQA 1HQUA 1ASWA 4LSLA 4ISGA 3KTQA 2V7ZA 4C23A 4FWOA 3F9KA 4CZLA 4PA1A 4TSXA 5I3UA 1HNWK 2A6AA 3OYMA 4FLXA 2DY4A 3CCJN 4UQGA 3E9PA 1B9DA 4IG3A 2ZQBA 4AHSA 4B1ZA 1RGIA 3CETA 3LAMA 1HKCA 1IV0A 4EP5A 2Q0RA 2BH1A 4CHNA 5ELZA 4HHTA 5KGWA 3PY8A 1SS6A 1NK7A 3AAPA 1KSPA 1JCGA 3SLCA 1KQSM 1XWLA 4Y1DA 4FJ5A 4KO0A 4JI1K 4NYNA 2ZJPL 4G9ZA 3VEOA 2A3ZA 4CHYA 3VEZA 3DLRA 4C8LA 1CLQA 4IG0A 4KV8A 4DTMA 2F4VK 3ZSYA 1XQSC 4BC2A 1NU0A 3SJHA 2XY5A 4B3SK 1R59O 3BUZB 2X74A 3MEDA 1K8AO 3W3DA 1ESVA 4JI7K 2OANA 2CGJA 3FLCO 4LFAK 5C2DA 2O8BA 1VSIA 1REVA 3TANA 1BIUA 4NB4A 3K59A 3ZEUB 1YITN 2IGIA 4E1JA 2HNDA 2W41A 3H46O 4M3YA 4QS8A 4M41A 1BUPA 4JRPA 4JI8K 4DR5K 3VEXA 4LF4K 1WSEA 3ATVA 3DRRA 5EX5A 3WT0A 4CEQA 1D8YA 2E2PA 3RTVA 1WOQA 2HNZA 4E19A 3MCPA 1VSKA 5JMVA 3VEWA 2P9IA 3IRXA 2ZM6K 1MA9B 2ITGA 3AVCA 4B1WB 2V7YA 2P5GA 4OLAA 1SV5A 3MX5A 1A5XA 4DQRA 2Q2RA 5BRHA 5C15A 3DLEA 1RT3A 3QINA 2KHOA 4J2AA 2P9LA 1IBMK 4B1VA 4EAHD 1N32K 1A5WA 3I8BA 5HL7L 1RT5A 3S41A 4AM7A 4FWLA 5J2PA 3AVMA 1FW6A 2HMPA 1NMDA 5C25A 1VQ5N 2YI1A 4RG8A 3BGRA 3O9RA 3AY9A 1VQMN 3EKSA 4E7HA 3LL3A 4DFJA 1E4FT 3OYFA 3EZWA 4DUYK 2BE2A 5IT9O 3FZHA 2BDPA 3RMBA 5M1OA 4CERA 4CZMA 5BRFA 1QQMA 3MXIA 2PY5A 2QWMA 3AVFA 3VOVA 1TYQB 3OS1A 4BR0A 4CZFA 3LZJA 3AA4A 3OBWA 4FLUA 4M3TA 3EL2A 3HOSA 2CH6A 1BGXT 3QETA 4GKKK 4Y0WA 4J2BA 4OX9K 4MDBA 3CJ9A 1WAJA 4CBUA 4WCEL 1CZBA 2P9UB 4BE1A 3D2EB 3O80A 3R9PA 3TTCA 2GWKA 3UKRB 2FLOA 3ENOA 4WQ4A 2VG7A 4DFKA 1KVBA 4BREA 4FM0A 5MLCQ 1WSJA 1TVRA 4F8RA 1RNHA 1Q9YA 2KZMA 2ZF5O 2O8FA 3THWA 4XIUA 1D9DA 3T19A 1ZBFA 4H5RA 4CJLA 2GTDA 4JS5A 3SUPA 3RR7A 2XY7A 3QFPA 1C6VA 3WXMB 3LDSA 3SCXA 4HCBA 1QQOA 3G25A 3TSQA 3SV4A 4CHZA 4KHYA 2QWNA 2PAVA 1MWKA 3K5NA 3SUOA 3LPUA 3PIOL 4C1NI 2W42A 1J5EK 2ZJQL 2WBNA 2B6AA 4XH5A 5AQRA 3ULEA 4WF9L 3ZT1A 1QQNA 3CIPA 3CFPA 5C24A 4YOWA 2FF6A 1WSIA 3A0IX 5BN8A 4ID1A 4IZ9A 4U7BA 1U2VB 4H5TA 4CD1A 4BRAA 3B8AX 4E72A 2E2NA 3QICA 1IKWA 3M6GA 3O9SA 3VQBA 1BA1A 5BR8K 1BQMA 4OLBA 4IO8A 2P9PA 4NCGA 3NE6A 2YHWA 1Q86O 4KI6A 1CZ9A 4V19S 3QEXA 4H5VA 3ZLJA 4BG9A 4IKFA 1L5UA 2VWBA 2VGMA 2VGNA 3L3VA 1BISA 1MWMA 2W40A 3OYKA 4HUEA 1TAQA 3A5NC 1FK9A 5KRSA 3NGYA 4FWSA 2G8KA 2FSJA 1IBKK 3T3FA 3CF5L 5HOOA 1S1VA 4FJNA 5FRMA 1HYZA 1XC3A 2E6LA 3EEQA 3QMLA 1JCFA 4O5FA 2E1YA 1ZXOA 2CGKA 3O4QA 1IKYA 2NRZA 4F2SA 3OYBA 4KHPK 3J7AP 3CCSN 3PIPL 3MWPA 2W00A 2YNGA 4QS7A 2H3GX 1I94K 2ITMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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