3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein ARP9
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Transcription regulator
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
5ADXA 3ULEA 4CJ7A 3VENA 4A2AA 1LOTB 4JNEA 4CZGA 3D2FA 4IO8A 1U2VA 1Z05A 3UKRA 4H5VA 1NM1A 5KPZA 2E1YA 3DXMB 2I7NA 4EHTA 5F1XA 3MN5A 4BC3A 1DGKN 5FPEA 2HF4A 2V51B 4WQ5C 2YHWA 4WQ4C 3VERA 2P9LA 2P9NA 3FGUA 2Q31A 4FOEA 3H1VX 3UKUA 3FE1A 3QBXA 4B1ZA 5JICA 1BDGA 5E26A 1GLFO 2D0PA 1HUXA 3A5LC 1TYQB 3EKUA 1SQKA 3BF1A 2A5XA 3C7NA 2D4WA 5EXWA 2E2QA 1R59O 1BO5O 3MMVA 3QMLA 3M6GA 4QS8A 4JHDB 1E4GT 2J4RA 4BRMA 4K42A 4FO0A 2Q97A 1YUWA 4LC9B 3S41A 1S22A 1NWKA 5AQYA 4C23A 2HMPA 4MO4A 4BR4A 1DKGD 3EL2A 3DXMA 4WYBA 5AQWA 1XQSC 2AP1A 2QWQA 1QQOA 4H0YB 3G25A 4H5TA 1X3MA 2E88A 4FWLA 4K41A 5E84A 4ISFA 4DQ8A 2HOEA 2E2NA 2VWBA 2P9UA 3HBTA 5AQZA 5BREA 4CZJA 1K8KB 5BRDA 4BR0A 2EWSA 1NGGA 3VGLA 1RGIA 3KHYA 4Y0WA 1ATNA 2NRHA 5JLFA 2ZWHA 5BN9A 3AAPA 2ZF5O 3CQXA 1YAGA 1TYQA 2QWPA 2Q0UA 1HKGA 5AQRA 3M1FA 4K43A 4FWOA 1C0FA 3BP8A 4B1UB 4JD2B 2Q0RA 4BRKA 3VEOA 4CZLA 1G99A 3SK3A 3VEVA 3WUHA 1BA0A 3FZKA 4BC2A 4FWRA 2GELA 3U9DA 4BVPA 2A6AA 5AQGA 4H0VB 5AQPA 2E20A 5B8HA 4FWPA 1MWKA 2QWOA 5BPNA 3LDNA 3L6QA 2YJEA 2Q2RA 3KVGA 1HPMA 4A61A 1K8KA 1TUYA 3O08A 4PL7A 4FPAA 3EKSA 1EQYA 1NGBA 2P9KB 2YHXA 3A8YA 3HTVA 1JCEA 1ESVA 3VEXA 3BEXA 3ENHA 3BF3A 3VGMA 1BOTO 3EO3A 2ITMA 2IVNA 5LY3A 5AQKA 3FLCO 3VOVA 2ASOA 4FWKA 3C0BA 3LM9A 2P9PB 3HSCA 5AQNA 4JD2A 2QW9A 3F9MA 3SMSA 3TPQA 5AQMA 5LJVA 4RWTA 3VEZA 3DJCA 2D1KA 1CZAN 5JMVA 1GLEG 3ATUA 3ATVA 3H3NO 5AQFA 4BREA 4CBXA 2GWKA 2P9UB 1XC3A 4YDUA 4JAXA 3D2EB 4BRLA 3SMPA 4CZMA 3VF2A 4EFHA 5AZIB 1NGHA 3A5OC 1BG3A 4BG9A 4HTLA 1KAYA 5BPMA 1IJJA 4IJNA 2P9KA 3QFPA 2E1ZA 4EHUA 1C0GA 1J6ZA 3CJAA 3MN6A 4M7YA 5LJWA 2ASPA 5AQHA 3M3ZA 2Q36A 4K25A 3I33A 1QZ5A 5AQUA 5I9EB 1KXPA 4ISGA 4PKGA 1GLLO 1HLUA 2P9PA 2FF3B 5EOYA 5JLHA 2F9WA 3LDPA 1Y64A 1NGCA 3W3DA 1ZBSA 1KAXA 5F2RA 5AQJA 4DB3A 1QQMA 4CZKA 3ENOA 1NMDA 3MN9A 1E4FT 3VEWA 2FF6A 4CBUA 2GEMA 2V52B 2GTDA 4ISEA 4XH4A 3SLCA 3D7EO 1YXQA 1WUAA 2P9SB 3D2EA 2AA4A 4YDUC 5ELZA 4FWNA 2F9TA 3FFKB 3L0QA 5AQXA 5KQ8A 5AZIA 4JN4A 3RSEB 3LDLA 5AFUH 3VPZA 1U6ZA 2A3ZA 3LDQA 3ID8A 4CBWA 3I8BA 4XH5A 3GBTA 3VF6A 4BVOA 1ZC6A 4BRHA 3JS6A 3ZEUB 4BGAA 2YHYA 4BRAA 4E1JA 3CHWA 2CGJA 3H6EA 3H1QA 2VYPA 3R9PA 3DAWA 2E2PA 3GDQA 1Q18A 3GOIA 4A62A 2CGLA 1D4XA 4MO5A 1MA9B 3A5MC 3SJHA 1NLVA 4CI6A 2P9IB 1X9JA 4MLEA 5AQSA 4FWMA 2W40A 4EIAA 4FSVA 3DXKA 4QS9A 2P9SA 5FPDA 2E2OA 3MK6A 3U9ZA 1DEJA 1QHAA 2E8AA 4O5FA 3RSEA 1YVNA 5BRFA 3H3OB 3FZHA 3A0IX 4BR2A 3CJCA 3ZX0A 4B1VA 3FZLA 4B1WB 1GLCG 3AAQA 3IUCA 3QB0A 4NB4A 2QWLA 3ZETB 3ZEUA 4BRFA 2YCHA 3O1WA 3CJ7A 3H45C 1S3XA 3O4WA 3LDOA 4BC5A 4BRPA 3B8AX 3KZBA 4BQZA 3O80A 2BUPA 2V7ZA 5AQTA 2Q1NA 3EZWA 4CZIA 4FWQA 4FL9A 1XUPO 1T44A 5AZJB 5AQIA 4H5WA 4CD1A 2IIRA 4CZHA 3DWLA 5ADXH 2P9IA 4HWIA 4L3QA 2W41A 4FWSA 1T6DA 2YI1A 3CI5A 4QS7A 1MDUB 1WOQA 1BWFO 3WQUA 2H3GX 5AR0A 4H0XB 5FPNA 3CERA 3ZX2A 5CE3A 4FPBA 1V4TA 3O8MA 3LL3A 4IXCA 3GG4A 1QZ6A 1BUPA 1NGEA 4BG8A 4IZ9A 3GE1A 2QWMA 4GY2B 5TKYA 4CD3A 1NGDA 3FZMA 4O8KA 3UB5A 3IDHA 3WXLA 3ZETA 3AARA 5EX5A 5AQVA 5KPRA 2I7PA 2GUPA 4BRIA 1ATSA 3WT0A 4BRQA 2OANA 3HZ6A 1X3NA 3VESA 4I6MB 3EN9A 5AQOA 3CJBA 1OKJA 2FSNA 5AZJA 2QWNA 3FZFA 1LCUA 3WQTA 5EVZA 3WXJA 1GLDG 1SZ2A 3FR0A 2CH5A 3H46O 3CJ9A 3DXKB 1H1VA 1ATRA 1BU6O 3VETA 4B1YB 1TUUA 2WUSA 4H5NA 1BA1A 1GLBG 1SAZA 3R6MA 1V4SA 3WXKA 5EY4A 2FLOA 5BN8A 3AY9A 3VEYA 4BR9A 4EAHD 2A40A 2ZGZA 4Z94A 5AFUA 1JCGA 1NGJA 1RDWX 2V7YA 4BC4A 3HM8A 4PKHA 3O5BA 1HKBA 2ASMA 3L4IA 2QWRA 4XH1A 2ZGYA 2DPNA 2FSJA 4DHYA 3LM2A 5AQQA 1ZXOA 3HI0A 3O6WA 3CIPA 5FPMA 4BRGA 1RFQA 2YJFA 3QICA 4F9OA 4KBOA 3TU5A 4RTFD 3WEEB 1IG8A 2QXLA 3A5NC 3QDKA 4A2BA 4BGBA 2A42A 2BTFA 4I6MA 1NGIA 1MWMA 2KHOA 4XEIA 1HX1A 3CJ1A 4JHDA 3UE5A 2GWJA 3MDQA 2UYTA 3W0LA 3P4IA 3JXUA 4BR5A 3ULEB 4PL8A 5BR9A 2FXUA 1Z6RA 4CZFA 2IVPA 1NGAA 3IFRA 3OHRA 1GLJO 4AM7A 1GLAG 3D2FB 4H0TB 1U2VB 3UKRB 1HKCA 4M63C 4J8FA 5BPLA 4GNIA 1QQNA 3MN7A 5KPTA 4H0OA 4BRNA 2PBDA 4WQ5A 3O1BA 4BRCA 4AM6A 4RCHA 4IWVA 4M7XA 3BUZB 4IJAA 3CQYA 3U8XA 2NLXA 4WQ4A 3VF4A 1JCFA 2CH6A 4B1XB 4DCHA 5KQDA 2IVOA 2P9LB 3QFUA 4B9QA 2P9NB 4CZEA 3WXIA 1NGFA 2CGKA 3UKUB 4H03B 4BROA 4BQLA 4MLHA 1P8ZA 2D0OA 2A41A 2FSKA 1KAZA 4PKIA 4NO7A 3ZX3A 2VCPA 4H0PA 2HF3A 4FOIA 4BRDA 3QBWA 3IMXA 4BR7A 1HJOA 3C7NB 3VGKA 3R8EA 2NZTA 5BRHA 3CETA 4H5RA 1NBWA 3WEEA 3U4LA 2QM1A 3GL1A 1T6CA 3MCPA 5AQLA 3J8AA 5F0XA 2PAVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WNGA 4A2AA 4U67L 2WBNA 5JENA 1ZYQA 3PIOL 1ZBHA 1U2VA 3G71N 4AILC 1IBMK 2E1YA 3AVFA 3DXMB 2HVHA 5C2DA 2HF4A 4WQ5C 3CCSN 2YHWA 3VERA 2P9LA 1RCHA 3KK1A 4FOEA 3AO4A 1VSFA 3H1VX 1N6QA 4FZXC 3SUPA 5GAGP 2W00A 3BZCA 3OYBA 4AHCA 5J2MA 5CYQA 1GOAA 1SKRA 2IAJA 2D0PA 3A5LC 3RMAA 3BZKA 4CEFA 3BF1A 2A5XA 3C7NA 1BO5O 3CQ8A 1ASVA 5C42A 4BRMA 4M3YA 3HPOA 4FK0A 2Q97A 1VSDA 3D6RA 2HMIA 3CPEA 2UUCK 3S41A 1REVA 1S22A 1NWKA 4C23A 3PX0A 1NJXA 3HJFA 3UIQA 2HHIA 4DFPA 4LFCK 4FZYA 3AGRA 3DXMA 5AQWA 2WONA 1QQOA 4H5TA 3SAFA 4ISFA 4LD0A 2E2NA 2VWBA 5AQZA 3EEQA 2Z1IA 4YY3K 1K8KB 5J2QA 2X6SA 1YTUA 3MCAB 1NGGA 2IC3A 3LP0A 3K57A 1VRTA 3BDPA 1FW6A 1X9MA 4TSXA 3NH1A 1OH8A 5JLFA 4OPAA 2ZWHA 5BN9A 4CJ4A 1X9WA 3C65A 2Y1JA 3M8RA 4JI0K 3O9QA 3AA4A 3K5OA 5JS2A 1VRUA 4CEOA 3L3UA 4R79A 3HXMA 1Q86O 4LF5K 3BP8A 2YKMA 4BRKA 4O44A 4E0DA 4NCBA 3SQ4A 1RBSA 3VQAA 1K6YA 4YFUA 4IDKA 2HSTA 3CC4N 3WUHA 2RKIA 4ICLA 2JGUA 4DQRA 5B8HA 4FWPA 1MWKA 2QWOA 1TL3A 1N34K 2YJEA 1HPMA 1K8KA 4I2PA 4CJTA 4NLCA 1TV6A 1VQON 4OO1J 1HPZA 3E01A 3LP1A 1ESVA 3MXIA 1IG9A 1C0TA 4Z0UA 4DV7K 3SAGA 3HOSA 5CY4A 2IVNA 3EE8A 1U47A 2B4JA 1BI4B 4DS5A 2C1IA 4CJKA 3TARA 4K0KK 4WCEL 3NCIA 5AQNA 4NCGA 5LMUK 5AQMA 4KFBA 3KLGA 1L5UA 1LAWA 3C94A 3IG1A 3DMJA 4RWTA 5EU7A 3ASMA 4HUEA 2A1SA 1QQCA 1VQ6N 3MAQA 1UA1A 3H3NO 3RMCA 2LSNA 4CBXA 3KD1E 1WSIA 2IDOA 2VWKA 4B3SK 1LW2A 1XC3A 4YDUA 1SUQA 3V1RA 3QINA 3PSFA 4Q0BA 1Q81O 4W5NA 4CZMA 4DMNA 4KHNA 4EFHA 4FJMA 5BPMA 4IJNA 4E7LA 2ATQA 2E1ZA 5C15A 3OBWA 1LW0A 4DR3K 5FLXO 4EHUA 4KREA 1CZBA 2Z1HA 2RF2A 2W6KA 4N56A 1RTDA 3MN6A 5LJWA 3DLBA 4FJ5A 1BI4A 5I9EB 1KXPA 4PKGA 3VQ9A 2ITGA 3VQBA 2FF3B 3PIPL 5CR4A 5GIOA 1Y64A 4DTPA 2HHXA 3LPUA 2OPQA 1S9EA 4DB3A 1KVAA 1RT5A 4IO9L 2GEMA 5CZ1A 4MQ3A 1YITN 3PX6A 1NMNA 4XH4A 5LMNK 3OS2A 1VQ5N 2AA4A 2ZD1A 3RVCA 4PHTX 5AFUH 1JKHA 3OYEA 4CHPA 2A3ZA 3ZYYX 3LDQA 3I8BA 5A2QO 2XY7A 1SS6A 1TKXA 4BVOA 3M8PA 4JKGB 1EP4A 3OYGA 1WNSA 3ZEUB 2I5JA 3DOLA 3CHWA 3L2VA 2CGJA 3H6EA 4FJLA 3DAWA 3GDQA 1WLJA 1JLBA 3SPYA 4J2EA 1DTQA 3AVMA 1RDCA 3G6EN 4CI6A 2VWJA 4FVUA 1HQEA 4FJJA 1SKWA 1Q82O 2ZJRL 2BH1A 2W40A 4CGIA 3SPZA 3MK6A 4JS4A 4NYNA 3J7AP 2DFEA 3AVIA 4OGCA 4B1VA 3K9KA 3CMAN 3FZLA 2UXBK 3O4NA 4JKGA 4DR4K 3QB0A 3CF5L 3ZEUA 4CEZA 3L4QA 3O1WA 3D0PA 5HBMA 1U4BA 2O8CB 4ILGB 1NKEA 4CJWA 3O80A 3IRXA 1E3MA 2V7ZA 3K5NA 1RDBA 5AQTA 3EZWA 4KO0A 2HNDA 1RTJA 1XUPO 1TK8A 4M3WA 1JL1A 4OKKA 3NFAA 4FWSA 4RW9A 3CCMN 2PZSA 2KQ2A 1XC9A 3SJJA 3P1GA 2H3GX 1XMQK 1RBRA 3OA9A 1T03A 3S3OA 4DV4K 1V4TA 4FVMA 3BY5A 1Y97A 3LL3A 1VQKN 1HNXK 1VSMA 4IXCA 1QZ6A 4BDYA 3GE1A 1RT2A 2XRIA 1NGDA 3FZMA 4CK1A 3WXLA 3DLRA 3KWGA 3V9WA 2O8CA 4B9LA 4B3RK 1C1AA 4BRIA 3I0RA 4KTZA 3SV3A 2NRTA 3HZ6A 4OLAA 4KV8A 4W5TA 4GKJK 5AQOA 1EETA 4DSIA 3OVNA 1IKYA 4JS5A 1HMVA 3VA0A 4FLVA 2XY5A 3WQTA 1KD1O 5EVZA 4CJQA 3EZ5A 4CGDA 2YNHA 1ATRA 4ZTFA 3RR8A 4O0IA 1NU0A 3NGYA 1GLBG 4DSJA 1W2BM 4YOTA 1A5WA 3AY9A 1D9FA 4DR5K 3HSTB 4KHYA 1HJRA 1RDWX 3K9JA 1ASWA 1K8AO 1S1TA 3L4IA 5I42A 2QWRA 2JLEA 4CF1A 4LSNA 2FBYA 4O5BA 4XH1A 2DPNA 4DTRA 1VQ8N 3CCRN 2YKNA 1I39A 4AHSA 3ZSRA 3TU5A 4DTSA 3CMEN 4RTFD 1IG8A 3QDKA 3J81O 2ZE2A 4FJKA 1MWMA 2KHOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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