3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein ARP9
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Transcription regulator
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
5AQXA 3MDQA 2HMPA 4FWLA 3VGKA 1HKCA 1ZC6A 1KAYA 2GWKA 3C7NA 3UB5A 3VEVA 3AAPA 3SMPA 5KQ8A 5FPEA 3VPZA 3L6QA 3SLCA 5JLHA 2P9IB 4BVPA 4XH1A 2YHWA 2P9IA 4NB4A 1QQOA 1WOQA 3LDQA 3O6WA 4BRDA 3SJHA 1NGFA 3M6GA 4JN4A 4IO8A 1Y64A 2A6AA 3H1VX 4IJNA 2FSKA 2V52B 4B9QA 2GTDA 3IFRA 3VEZA 3O4WA 4BR0A 3WT0A 3O08A 1GLFO 3ZETA 5FPDA 4DCHA 5BRDA 2W40A 4BRHA 2D4WA 2A42A 1HKBA 2QXLA 3D2EB 5AR0A 3LDOA 2D0OA 2I7PA 4BRIA 3D2EA 4BREA 3JXUA 4BRMA 4FWKA 5AQHA 3WQUA 1T6CA 1E4FT 4BRFA 3WQTA 3WXJA 1ESVA 4Z94A 3IMXA 5AQPA 1NGAA 3VEYA 2NRHA 4QS7A 4K43A 5BREA 1QQMA 1BUPA 1HJOA 4CBXA 4BG8A 3ZEUB 3CJ7A 3VEWA 1SZ2A 4CZEA 3ZEUA 1SAZA 1GLEG 1ATNA 1S22A 2CGLA 2KHOA 2ZWHA 5BN8A 5JICA 4K42A 1V4TA 2YHXA 5AFUH 5FPMA 2J4RA 3LDPA 3VGLA 4EFHA 4WYBA 1DEJA 2ITMA 2FF6A 3M1FA 4XH4A 3ENHA 3B8AX 1JCEA 2IVNA 3DXKB 4DHYA 1GLJO 3CHWA 3DXKA 4JAXA 1Z05A 2CH5A 3KVGA 2QWLA 3A5LC 3CQXA 3BP8A 5ELZA 3U9ZA 2QWOA 3MCPA 4H0YB 5BRHA 4BQZA 4E1JA 5BRFA 2HF3A 3IDHA 2VYPA 2YHYA 2PAVA 4ISGA 2V51B 4IWVA 3UKUB 3BF1A 2VCPA 1NBWA 1BA0A 4HWIA 4A62A 3VOVA 3GE1A 3DWLA 3MN6A 2E20A 3CJ9A 3FR0A 3OHRA 3R6MA 3D2FB 4DQ8A 3CJAA 5LJWA 1GLDG 1QZ6A 3GL1A 3VENA 1C0GA 4H5RA 3RSEB 4BRLA 3O8MA 4IJAA 2F9WA 2IIRA 5AQZA 3H45C 3RSEA 1U2VB 5AQIA 1GLLO 3U4LA 5ADXH 2CGKA 5KQDA 4PL8A 1HX1A 1KAXA 3DAWA 2OANA 3I33A 3FZMA 4FWMA 4HTLA 3TU5A 3HI0A 2P9LB 3F9MA 4GY2B 4BGAA 4B1UB 3FFKB 4FWPA 3AARA 1GLCG 2PBDA 1YUWA 3SK3A 1BU6O 1NGBA 2E2PA 2ZF5O 1BA1A 4M63C 4B1XB 3ZX0A 4F9OA 1RDWX 3GDQA 4CBWA 3U8XA 4CZFA 5KPTA 2QWPA 2ZGYA 1TUUA 5E26A 1MA9B 4M7XA 2ASMA 4RWTA 1NGHA 3R8EA 3ZX3A 4BR7A 4DB3A 1KXPA 5AQMA 2P9KB 3FLCO 3VESA 4H0OA 4O5FA 2HOEA 2P9SB 4H0TB 4FWRA 4IZ9A 4BRNA 4FPAA 1BG3A 3MN5A 5AQTA 5EVZA 3M3ZA 5AFUA 1HKGA 2YCHA 1C0FA 3CIPA 1NMDA 1NM1A 1ATSA 1NLVA 4AM7A 3EKSA 4BR5A 1ATRA 5AQGA 1X3MA 2E8AA 4M7YA 2E2NA 4RTFD 5AQYA 1RGIA 5AZIB 3SMSA 3HTVA 4B1WB 2NLXA 5AQFA 1T6DA 4FL9A 2E1ZA 1NGDA 3LDLA 2P9UB 2ASOA 2Q36A 4H5VA 5EX5A 3TPQA 3EN9A 3WEEB 2E2OA 4JHDB 1K8KB 3MK6A 1MWMA 1S3XA 2QW9A 4JHDA 3ENOA 3H3NO 1K8KA 1P8ZA 4FWNA 3S41A 3VF4A 4CBUA 1OKJA 4MO5A 5KPZA 3AY9A 4XH5A 4JD2B 2EWSA 4EAHD 2F9TA 4JD2A 4FO0A 2QM1A 3ULEB 2D0PA 2GEMA 3A5OC 3ULEA 3H46O 1GLAG 5AQRA 2FF3B 1V4SA 1XC3A 3MN9A 3FZFA 3U9DA 1TYQB 4YDUC 4WQ5C 3FE1A 3WUHA 5BPMA 1NGEA 2P9NB 5AQOA 1DKGD 1U6ZA 4CI6A 5KPRA 4FWSA 1MWKA 4BGBA 2Q2RA 2ASPA 5AQSA 5TKYA 2BUPA 3ZX2A 2FSJA 3VEOA 2CGJA 2YI1A 4A2AA 4QS9A 5AQLA 3UKUA 3J8AA 3VEXA 3VF2A 3I8BA 3UKRB 3O5BA 3CJ1A 4QS8A 3UE5A 5EY4A 4RCHA 2P9PB 3UKRA 5B8HA 2A40A 5AQKA 5LY3A 1TUYA 2P9PA 3BEXA 2ZGZA 3D2FA 2UYTA 1DGKN 3GOIA 4BRKA 3DJCA 2Q0UA 3G25A 1E4GT 3VF6A 3H3OB 4PKHA 2D1KA 5AQQA 1U2VA 4BRCA 3QBWA 3HSCA 4BC4A 4BR2A 3C0BA 1Q18A 1CZAN 4H5NA 2P9LA 3O1WA 2QWMA 2HF4A 4KBOA 2Q0RA 5BPNA 5F1XA 2Q1NA 3QB0A 5FPNA 3CJCA 4BC3A 5EOYA 2WUSA 1EQYA 2DPNA 4H03B 3QICA 4L3QA 2GUPA 5AQVA 1H1VA 3A8YA 3DXMB 3AAQA 2A5XA 2YJFA 4EHTA 5LJVA 3EZWA 2E1YA 3CI5A 3ID8A 1D4XA 2VWBA 3KZBA 2GWJA 2Q31A 3EL2A 3A5MC 4PKGA 4FOEA 4BRGA 1WUAA 1ZBSA 4B1YB 2P9KA 2E2QA 5AQJA 4K25A 1J6ZA 4PL7A 3FZHA 3FZKA 2P9SA 3VGMA 5BN9A 4YDUA 4WQ5A 2CH6A 4MLHA 3C7NB 4BC2A 2BTFA 5AQUA 4MLEA 4BR4A 5JLFA 3CQYA 4FOIA 5CE3A 5AQWA 3LM2A 4BRQA 3P4IA 1NGGA 1R59O 4C23A 4ISFA 3H1QA 2GELA 1LOTB 5E84A 1XQSC 2H3GX 2W41A 1XUPO 3H6EA 3FZLA 4EIAA 5AZIA 4BRAA 1T44A 4LC9B 4CZLA 2NZTA 1JCFA 3CERA 3ZETB 5I9EB 3W3DA 1SQKA 4GNIA 2A3ZA 2E88A 3VETA 3WXIA 2P9UA 3QBXA 1BWFO 4H0XB 1HPMA 1YXQA 3WEEA 2V7ZA 1JCGA 3A0IX 4FPBA 5F2RA 5AZJB 2AP1A 5AZJA 1YVNA 2QWNA 4WQ4A 5JMVA 1HUXA 1Z6RA 1QHAA 4CJ7A 2IVPA 3LM9A 3LL3A 3CJBA 1NGIA 2QWQA 5ADXA 1BDGA 3EO3A 1G99A 4CD3A 4K41A 1TYQA 4XEIA 3MMVA 4H0VB 2V7YA 4PKIA 1LCUA 3BUZB 5AQNA 1NGJA 2P9NA 4B1ZA 3LDNA 1GLBG 1X9JA 1IG8A 3A5NC 3BF3A 1QZ5A 3L0QA 4EHUA 1YAGA 2FSNA 3GG4A 3WXKA 3FGUA 4BR9A 1IJJA 4H0PA 1RFQA 3IUCA 3GBTA 3QDKA 3WXLA 3QMLA 3R9PA 4H5WA 4CZIA 4BC5A 4Y0WA 5BPLA 4I6MB 5EXWA 3W0LA 3EKUA 4BQLA 1HLUA 4I6MA 4JNEA 4CZMA 3D7EO 2YJEA 1MDUB 1BO5O 4BRPA 4J8FA 1QQNA 4O8KA 2IVOA 4A2BA 4CZKA 3MN7A 3HZ6A 3ATVA 1NGCA 4CZJA 4WQ4C 1ZXOA 4A61A 1NWKA 4ISEA 4AM6A 3QFPA 3O1BA 4NO7A 4IXCA 1KAZA 2AA4A 2FXUA 4BVOA 4CD1A 4CZGA 4H5TA 4CZHA 2FLOA 2QWRA 3JS6A 4FSVA 4FWQA 1X3NA 3O80A 4BG9A 4BROA 2A41A 3QFUA 3HBTA 3VERA 4FWOA 3ATUA 3DXMA 1BOTO 3L4IA 2I7NA 5BR9A 5F0XA 4MO4A 4B1VA 3HM8A 3CETA 3KHYA 2Q97A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ALYA 4JS5A 3KKSA 1HKCA 1ZC6A 2GWKA 3C7NA 1SL0A 3SMPA 5KQ8A 2UUAK 1BI4A 2JWKA 3VPZA 3CYGA 3CXCM 4H4MA 3B6OA 3SJHA 4H4OA 4GKKK 3MEEA 3VTHA 1ASWA 2A6AA 2FSKA 4CEAA 2OTJN 4RW4A 3ULDA 3PX6A 3WT0A 5BRDA 4BRHA 2QXLA 2D0OA 1G15A 2I7PA 3ZT3A 4BRIA 4FWKA 5AQHA 3WQUA 1T6CA 1E4FT 1ESVA 4Z94A 3VQ5A 3AVMA 2O8BB 5AQPA 3T1AA 1ASVA 2UXBK 3ENBA 4K43A 5M1KA 3L3UA 4QAGA 1QQMA 2HBJA 3PSIA 4Z4IA 4BG8A 4CGIA 5LMNK 4LFBK 3CJ7A 3ZEUA 3JSMA 4HCCA 3WNFA 2ZWHA 4YOYA 3DRSA 4CHQA 4W5NA 1VQ7N 4DLGA 3ZT4A 4EFHA 1DEJA 4E3SA 2FF6A 3HRGA 3M1FA 3VTIA 3L2VA 1FJGK 2WONA 1OH5A 4BY9C 2IVNA 4N5SA 1N8RO 3CHWA 2VQFK 1LWEA 5JS1A 2HNYA 5MLCQ 1Z05A 2CH5A 3LANA 3CD6N 4JRQA 3A5LC 4OGCA 5ELZA 3VQQA 4H0YB 3DOLA 4E1JA 3G0ZA 4EP5A 2NUBA 3NE6A 2UXDK 2HF3A 4HTUA 2B5JA 4YY3K 1YVUA 1RTDA 2V51B 4IWVA 3RR8A 1BA0A 3R3LA 1I39A 4DSJA 2JGUA 4FYDA 3GE1A 2HHWA 4GV6A 2W6LA 4IFEA 3CJAA 3ZT1A 3ZSOA 3HT3A 4LF8K 4V19S 4PY5A 1QZ6A 4H5RA 3RSEB 3O8MA 2ZJPL 5AQZA 1OH7A 4W5QA 5AQIA 2WBNA 4OKEA 5ADXH 2CGKA 5KQDA 3NFAA 1KAXA 3VQ7A 3D6RA 3NH2A 2VWKA 3AVJA 4K8ZA 3TU5A 3K9JA 1RCHA 4FJMA 1QSSA 4BGAA 3FFKB 4FWPA 3AARA 2AJQA 1GLCG 3ZSRA 4IG0A 1NGBA 2ZF5O 1BA1A 4FK2A 3QO9A 4F9OA 4DQQA 4I9QA 2ZGYA 1TUUA 1MA9B 3ZX3A 4FJIA 4M3UA 4DB3A 2KZMA 4B8CA 4H0OA 1T03A 1VQMN 2P9SB 3G6EN 4IZ9A 4DFMA 5CY4A 1BG3A 3T7ZA 4AH9A 4I2QA 3ZCMA 3TAFA 1TL1A 4DFJA 1XMQK 1NMDA 1T8EA 3ZSQA 4AM7A 3TI0A 3EKSA 4BR5A 1ATRA 3THWB 3EEQA 3K5OA 4LF6K 3NDKA 5CZ2A 4M7YA 4WE1A 4CJWA 1VQ9N 2E2NA 5AQYA 1F21A 1RGIA 2LSNA 3AA2A 5AZIB 5J1EA 3RWUA 2YNFA 3BDPA 4KHQA 1RT3A 1JLCA 4RW9A 5AQFA 1T6DA 4FL9A 4JI3K 2O8BA 3LDLA 3LPTA 5KGXA 4YNQA 5IWAK 1WLJA 2ZE2A 4C1NK 2O4GA 3TPQA 4Z4CA 3EN9A 3WEEB 2W6KA 2GV9A 4AHVA 3K5NA 4CEBA 1S3XA 1VQKN 2QW9A 3AVFA 3H3NO 1K8KA 3SV4A 4FWNA 4B9NA 3VF4A 4MO5A 3KK2A 1ITGA 4CJUA 2YV0X 5JVGL 2FC0A 4NCBA 2E4LA 3G10A 5CR4A 3ZT2A 3ULEB 3KLHA 3OYJA 2D0PA 4FM1A 3OYAA 1JLQA 3SJJA 1L3VA 1ZBFA 2HHSA 1UOCA 5AQOA 3NBPA 4CECA 4CI6A 2C1GA 1RT5A 4IFYA 1JLFA 2Q2RA 3O3HA 4FJNA 4JV5K 2ASPA 5TKYA 3VEOA 3RMCA 2CGJA 2YI1A 3OBYA 4A2AA 4DV5K 4DMNA 5AQLA 3LWLA 2ZM6K 5LL6Z 1VSDA 4FJ8A 3I8BA 3CJ1A 1LWFA 4QS8A 1N36K 5EY4A 2P9PB 5CYMA 5AQKA 1XC9A 1KVAA 2W00A 2HHVA 2KTQA 2O8CA 4Y1DA 3THYB 1OVQA 1WBDA 3NF6A 4KRFA 4DTXA 4FJXA 4HHTA 3M8QA 4A5AA 2D0CA 5HBMA 3IAYA 5AQQA 4BRCA 3VA0A 5A2QO 1IKVA 4ELVA 3TAQA 3BY5A 1Q18A 1CZAN 4B8AB 2Q0RA 4E1NA 3SUPA 5KRTA 2YHBA 3QB0A 3CJCA 2WUSA 2DPNA 3F9KA 2GBZA 3QICA 4H03B 4KI6A 2A5XA 2YJFA 4EHTA 5LJVA 4FXDA 3EZWA 1KLNA 3DM2A 2VWBA 2Q31A 4KKOA 4FOEA 4BRGA 3CCMN 2E2QA 5AQJA 4PL7A 3CCVN 2P9SA 5BN9A 1KRPA 4YDUA 3LP1A 4Q0BA 4MLHA 3OYLA 3SYZA 4BC2A 1YJWN 5JLFA 5CE3A 3CC2N 3P4IA 4CF1A 3AO4A 1R59O 2KFZA 1IO2A 2EX3A 2X78A 1XQSC 5CZ1A 3IKMA 4X62K 3H6EA 2F8TA 1IG9A 4HUEA 4B3SK 4CJ3A 4OX9K 5AZIA 3AVBA 1T44A 4DSIA 2EHGA 1SV5A 2NZTA 3KK1A 4DR6K 5DM7L 4DTNA 3ZETB 4F2RA 3TAGA 3T19A 5GADP 2E88A 3QBXA 3CCQN 1NOZA 4BWMA 1HPMA 1YXQA 3WEEA 1CZBA 1TAUA 2OZMA 5AZJB 4BDZA 4FM0A 4B9UA 2AP1A 2KKZA 1JLAA 4FW2A 4DV0K 4WQ4A 5JMVA 1HUXA 1Z6RA 4W5TA 3AVLA 2X74A 2DTUA 3CJBA 4B9LA 3RR7A 4CHNA 2ZD1A 1X9WA 4H0VB 3AVNA 3EE9A 5AQNA 4BE7B 3QEXA 3NVMA 3LDNA 5C15A 4BDPA 1IG8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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