3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
b'NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein ARP9
molecule tags Transcription regulator
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
3FFKB 2OANA 4BRQA 3CJBA 2A3ZA 3LM9A 2FLOA 1XQSC 1MWKA 5AFUA 2FF6A 3AAPA 4CD1A 5AFUH 1QQMA 1BA0A 2IVNA 5TKYA 2IIRA 5FPMA 3RSEA 4EAHD 3UE5A 2A41A 3VF4A 1LCUA 4BQLA 5ELZA 3VEVA 4XH5A 3MN5A 3HM8A 3OHRA 5AQTA 3WXJA 3M3ZA 4BRCA 2BUPA 1TUUA 3ZEUA 3KHYA 4H0VB 2HOEA 3O8MA 5KPZA 1QHAA 5F2RA 4WQ5A 4FWSA 3I8BA 4IZ9A 2E2QA 4BRKA 3FZFA 4BC5A 5B8HA 1YXQA 5AQYA 4BRLA 2AP1A 4A61A 2P9NB 3LDPA 4LC9B 2AA4A 2ZGYA 4CZHA 1XUPO 4CZMA 4BRAA 2CH5A 2GWKA 4WQ5C 2ITMA 5FPEA 4M7XA 3MDQA 3CHWA 3H3OB 3BF3A 4A62A 1T6CA 1NGEA 2ZGZA 3GE1A 3WXLA 3DXMB 4K42A 1ATNA 2VWBA 2UYTA 2P9LB 4XH4A 3ULEA 4BG9A 3VGLA 3C7NA 3R6MA 4WQ4C 3FE1A 3BUZB 1K8KA 3SMSA 3HBTA 5LY3A 3A5NC 3ZETB 5AQMA 3JS6A 5AQHA 3FZKA 2FSJA 2F9TA 3ENHA 1G99A 4A2AA 4MLHA 3D2EB 3DXKA 2NZTA 4KBOA 5EY4A 1NLVA 4IXCA 2A42A 1X9JA 2FSNA 1HUXA 3EZWA 3SJHA 1NGHA 5BRHA 1NMDA 5AQOA 3O08A 5AQFA 5ADXH 3MN7A 4EFHA 2I7PA 3FZHA 2A40A 4B1XB 3O5BA 3TPQA 4JHDB 1MWMA 4BR7A 4Y0WA 3ZX2A 3O1WA 1ATSA 1LOTB 1NWKA 3D2FA 3ENOA 1HKBA 1ZXOA 5AQVA 3SMPA 4FPAA 3UB5A 1U6ZA 2IVPA 3C7NB 3VF2A 4BR9A 3UKRB 2E1YA 3VENA 4PKHA 3VGMA 4PL8A 3ZEUB 2D1KA 3LM2A 4K25A 4FOIA 1GLJO 2D4WA 1NGCA 2YHWA 1S22A 2E88A 3S41A 2V52B 1YAGA 3LDQA 2QWLA 4NB4A 4DQ8A 3AARA 4MLEA 4BC3A 4MO4A 1S3XA 3IMXA 3M1FA 5KPRA 3IFRA 3GBTA 4FSVA 3VOVA 2NLXA 2P9IB 1NGGA 3DXKB 3HZ6A 3RSEB 1HPMA 3WXKA 3U4LA 4B1ZA 4JNEA 4CZGA 1SZ2A 1GLLO 1QZ5A 4PKIA 3EO3A 4CBWA 2EWSA 4NO7A 4J8FA 5AZIA 4ISEA 1SAZA 3MCPA 2Q1NA 4H5TA 3LDLA 4HWIA 3DWLA 3JXUA 4BR2A 3G25A 4BRFA 1JCEA 1QZ6A 2VYPA 4BRNA 3F9MA 2FSKA 3UKRA 1NGDA 2P9SB 4H5VA 3IDHA 1BU6O 2P9KA 4M7YA 3GL1A 1GLCG 3HTVA 4H0XB 3UKUA 3KZBA 3VEWA 2Q31A 2YCHA 1E4GT 4FOEA 3O6WA 3W0LA 4RWTA 4BVOA 3HSCA 1IG8A 2BTFA 1ZC6A 5AQPA 5F1XA 2E1ZA 2A5XA 3O80A 3TU5A 1J6ZA 4BGAA 1BOTO 4CI6A 5AQIA 5AQLA 5AQWA 4BVPA 2YHXA 5JLHA 1NGJA 2QW9A 3EKSA 1Y64A 3H6EA 2QM1A 1DGKN 3VEYA 1HLUA 4XEIA 3MMVA 2ZF5O 3L0QA 1E4FT 4BROA 4XH1A 1X3MA 4IO8A 1R59O 2ASMA 4B1VA 3SLCA 4JD2A 1BG3A 3B8AX 3H1VX 2F9WA 4JN4A 5BN9A 1BWFO 3VEXA 4CD3A 2QWMA 2A6AA 3EL2A 2P9KB 4BQZA 2P9UB 1YUWA 3UKUB 5E26A 1BDGA 1RGIA 3CERA 3QDKA 1SQKA 4CZEA 2D0PA 3DJCA 3CJCA 4ISFA 5JICA 2PAVA 3A5OC 4ISGA 3AAQA 3CJ1A 4DB3A 1YVNA 1OKJA 4EIAA 3QICA 3ULEB 1NGAA 3L4IA 2FXUA 4H0TB 2V7ZA 2CGLA 2Q0UA 5AZIB 1BO5O 5KPTA 4PKGA 5CE3A 3H1QA 1WUAA 3H45C 3VPZA 4BRGA 4K43A 3VETA 1QQNA 3ATVA 3VESA 3CQXA 1HKCA 4MO5A 3D7EO 5AQXA 4B1UB 5FPNA 1NGFA 2E8AA 3IUCA 2Q97A 3LL3A 5LJWA 3GG4A 3M6GA 4GY2B 4FWNA 4QS9A 3DAWA 2P9PB 4RTFD 5AQQA 1MDUB 3MN9A 3QBXA 5EVZA 1ESVA 4BRPA 4YDUC 4BRMA 1T44A 5AQRA 1TYQA 2HF4A 3BP8A 3W3DA 4FL9A 3CIPA 1U2VA 4H03B 1D4XA 4FWLA 5I9EB 1ATRA 5AQJA 1V4TA 4BRDA 4JAXA 3A5MC 1GLBG 1K8KB 1JCGA 4FWKA 1KAYA 5AQZA 3VF6A 3ZETA 5AQKA 1NBWA 3QFUA 3DXMA 4CBUA 3O4WA 1XC3A 3ZX0A 2P9LA 2E20A 4L3QA 3C0BA 4FWOA 3FGUA 2P9SA 4FO0A 2W40A 3FLCO 1NGIA 3VEZA 2CH6A 1DEJA 5AZJA 3D2EA 2QWQA 4AM7A 4BR4A 1HX1A 1IJJA 1QQOA 2IVOA 3QBWA 4I6MA 2J4RA 4BRIA 1H1VA 1C0FA 4JD2B 2FF3B 4BREA 5BREA 4BC4A 1ZBSA 4GNIA 2GWJA 1GLEG 5EOYA 4PL7A 2QWRA 4BRHA 4FWQA 2YHYA 2Q36A 3WEEA 5BRFA 5ADXA 4BGBA 4B1WB 5FPDA 1CZAN 2PBDA 3GOIA 4A2BA 2GELA 1KXPA 3FZLA 4K41A 4BR0A 2KHOA 3WXIA 4H0YB 5E84A 1T6DA 3SK3A 2QWOA 4B9QA 1Z6RA 2HF3A 4CZJA 2ASOA 1BUPA 5EXWA 3ATUA 4C23A 1WOQA 2DPNA 2YJFA 4QS7A 4M63C 3U9ZA 1TUYA 2YJEA 1Q18A 3A5LC 5AQSA 1GLAG 3FR0A 2ASPA 1HJOA 4CBXA 4HTLA 3LDNA 4H0PA 1RDWX 3R8EA 3A0IX 3R9PA 1GLDG 3GDQA 2V7YA 2E2NA 4BC2A 2HMPA 4IWVA 5LJVA 2NRHA 4CJ7A 2Q2RA 5BN8A 3I33A 3L6QA 1TYQB 4H0OA 3CJ9A 4FWPA 4FPBA 3FZMA 1EQYA 2P9UA 4CZFA 3WUHA 5EX5A 2GEMA 4H5WA 1BA1A 3VEOA 3U9DA 2WUSA 4H5NA 4O8KA 3EN9A 4EHTA 2QXLA 4I6MB 2CGJA 5JMVA 2P9NA 4BR5A 1RFQA 3EKUA 2QWNA 3BF1A 3A8YA 5AQNA 1NM1A 2ZWHA 3AY9A 4FWMA 1C0GA 3CQYA 5KQDA 1P8ZA 4IJAA 2GTDA 2P9PA 4O5FA 3LDOA 1NGBA 2V51B 5AQGA 5BRDA 3O1BA 5AZJB 2GUPA 4CZLA 3WQTA 4IJNA 4H5RA 1V4SA 4FWRA 3MK6A 4DCHA 1U2VB 4WQ4A 2VCPA 5BPNA 1JCFA 1MA9B 5BR9A 5BPLA 3CJ7A 2YI1A 1X3NA 3QFPA 5F0XA 4JHDA 2H3GX 3WEEB 1KAXA 4B1YB 3BEXA 4WYBA 3CETA 3WQUA 3HI0A 4Z94A 2CGKA 2I7NA 1KAZA 2Q0RA 3H3NO 3WT0A 3QB0A 3MN6A 3P4IA 5BPMA 3CI5A 3QMLA 2W41A 2QWPA 3H46O 4YDUA 4E1JA 2E2PA 4CZIA 1Z05A 4AM6A 3CJAA 4DHYA 3J8AA 4F9OA 5JLFA 1HKGA 3D2FB 3VGKA 4BG8A 3VERA 5KQ8A 4EHUA 5AQUA 3ZX3A 4RCHA 1GLFO 3KVGA 4QS8A 3ID8A 5AR0A 1DKGD 2E2OA 2D0OA 3U8XA 4CZKA 2P9IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QS4A 2G8KA 4CJKA 4RW4A 1N32K 3ZLJA 3CCUN 2VG5A 5AFUA 1JLQA 3V9UA 3VQ7A 3AAPA 4FJ5A 4CJ5A 1NNEA 4W5OA 4J2AA 3N4PA 3O9SA 1LCUA 5AQTA 3WXJA 2BUPA 1JLBA 2FBYA 5CR4A 3CPEA 3M8SA 3CC7N 1N5YA 4N76A 3E01A 2DFFA 1S1TA 2YHBA 3TI0A 5F2RA 4IOCL 1WBBA 3V9SA 5FROA 4FWSA 3LDSA 2WC9A 3O3GA 5DM6L 3F2KA 3MXIA 2OZMA 3SNNA 3V81A 1ZBUA 1U4BA 3KLHA 4YOTA 5B8HA 5AQYA 2P5OA 3LDPA 4FJ8A 2ZGYA 1K8AO 1XUPO 4BRAA 2CH5A 1J5OA 4H4MA 3SI6A 2OA8A 3H3OB 4F4KA 3BF3A 1RT6A 1NGEA 3GE1A 2O8DA 1ATNA 2VWBA 5GADP 2I5JA 4I9LA 4XH4A 1JXEA 2IGIA 3PX4A 2B6AA 3G0ZA 3VGLA 3FE1A 2Z1HA 1LAWA 3BUZB 4CJRA 3NGYA 3OYBA 4A5AA 1W9HA 4CJLA 3ZETB 5AQMA 2FSJA 4NLBA 3C6AA 3OS0A 5C24A 1G99A 3PUFA 3D2EB 1LWCA 3THWB 3JSMA 2FC0A 3VQBA 1VSIA 3KLIA 1X9JA 4H4OA 1JLFA 4DQPA 4B9NA 3SJHA 3EZWA 3J7ZO 5KGWA 3O08A 4OKEA 3U3YA 2I7PA 4JKGB 5GAEP 3P5JA 3TPQA 4FJGA 3MX5A 4DWIA 4BR7A 4Y0WA 4JS4A 4ID1A 1LOTB 5C25A 1Q8IA 3ULDA 5AQVA 4L8RB 4FPAA 1U6ZA 3CC2N 4BR9A 3UKRB 2E1YA 4K25A 5FLXO 1NOZA 3AGRA 1NGCA 1JLCA 1S22A 5C42A 2G8UA 1YAGA 2QWLA 3K9KA 3AARA 4MLEA 3OA9A 4BC3A 1S3XA 4DV3K 2P1JA 4LFCK 3M1FA 3PLAA 4M3XA 3WXKA 3M8PA 4B1ZA 3CM5A 1HYZA 1SZ2A 4CEFA 1GLLO 1TL3A 1FKOA 1YT3A 3EO3A 3DLKA 2Q1NA 4H5TA 3LDLA 3HOTA 3K9JA 5M1QA 3DWLA 3NHGA 4F3OA 4PA1A 4KHYA 1KFSA 3DLLL 3TAMA 5HROA 4KTZA 4DV4K 1IO2A 4LFBK 4PWDA 2P9SB 1TKZA 4JRQA 3D45A 4M7YA 4Z4HA 1SL2A 3ZSWA 3UKUA 3QLHA 3G10A 3KZBA 3VEWA 3J80O 2Q31A 4RW8A 3L2QA 1HQEA 3O6WA 3BGRA 1RBVA 2OPSA 3W0LA 4FJMA 5F1XA 2E1ZA 1VSMA 3TU5A 4CI6A 4LSLA 5AQLA 5AQWA 2YHXA 2HBMA 4RW6A 3TR8A 1NGJA 1OVYA 2QW9A 1Y64A 3H6EA 4CGGA 1CZBA 3U6FA 1WLJA 3HSTB 3P38A 4AHUA 4F8RA 2KQ2A 4HCCA 1IV0A 1XHXA 2KZZA 4PY5A 1BGXT 4AH9A 4IKFA 3MCAB 3ASMA 4IO8A 1NJIO 3DRRA 1NJWA 4JD2A 3B8AX 3THWA 5BN9A 1BWFO 3DM2A 4I2PA 3NFAA 2QWMA 3PIPL 4BQZA 2P9UB 3SUOA 3CCEN 1YITN 3T3FA 3G71N 1NK0A 4LF8K 3LP2A 2NNWA 4CEDA 4U67L 3MAQA 4CZEA 2HBJA 4ISFA 5JICA 4KB1A 1VSEA 2QKKA 1NK9A 4LFAK 5J1EA 1NGAA 3VMFB 4B9LA 2O8BB 3OS1A 1WAJA 3OYKA 4A59A 4CHYA 4K8ZA 1Z25A 3H1QA 1WUAA 3H45C 4QAGA 1RTHA 1QQNA 3HVRA 3CQXA 4DTRA 4I9QA 3HP6A 5LMUK 5FPNA 1S6QA 3K5MA 3IUCA 1ZYQA 5C0YA 1JL2A 4CGDA 4X64K 4CEEA 2P9PB 4IEEA 2HNDA 1UOCA 3C6TA 3SJJA 3ZSVA 3HPHA 3ZT3A 4BRMA 5AQRA 4IG3A 2HF4A 3W3DA 4Z4FA 3THYB 1JXBA 2VGNA 4FL9A 1WSIA 1B9DA 5AQJA 4B9UA 1GLBG 4CJ3A 1RDAA 1KAYA 4CBUA 1XC3A 4YOUA 2BGGA 3MXJA 5CYMA 1NJZA 4FWOA 4FVUA 1U04A 4OLBA 5TKWA 4WF9L 3AA3A 1KLNA 5D3GA 2G8VA 3RTVA 1HPZA 5C12A 3OYGA 3VQDA 2HHWA 4KB0A 3ISNC 3QEVA 4LF6K 1SUQA 1IJJA 5A2QO 1QQOA 4FJ9A 4I6MA 1JJ2M 4KTWA 3B6OA 4JD2B 4IEIA 4JKBA 3OYFA 4GV9A 4CJEA 2YHYA 1ASUA 3WEEA 5ADXA 1TV6A 4BGBA 1VHXA 4B1WB 1RT7A 3PIOL 3EYZA 1TKTA 3GOIA 3AVHA 4Z4IA 4A2BA 3FZLA 3AVJA 3DLHA 1S6PA 2IS3A 3LAMA 3SK3A 1Z6RA 3K5NA 1Q9YA 2HF3A 1BUPA 5EXWA 4C23A 3OYAA 1VQPN 3KD1E 4CW7B 4M3RA 4MQ3A 4Y1DA 3M8RA 4CBXA 2ZQBA 3H08A 3AVAA 4H0PA 3V9XA 3K2PA 4DF4A 4C8KA 2ZD1A 1WNSA 3GDQA 2V7YA 2E2NA 3MXMA 5LJVA 3QEIA 2NRHA 1HR0K 3QETA 2YNIA 1QSLA 4E1MA 3THYA 4FWPA 4FPBA 1EQYA 4ELVA 4RG8A 4MDBA 1QQCA 1VQON 3ZSQA 2GEMA 4H5WA 4F2RA 4F3TA 3U9DA 4DV0K 4DS5A 4E72A 3ZT4A 4O8KA 4FW1A 4B8CA 4BWJA 4N41A 4IG0A 4DTXA 2P9NA 3RR7A 4BR5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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