3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein ARP9
molecule tags Transcription regulator
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
4H5VA 5KPRA 4A2AA 5F1XA 3EL2A 3AY9A 3HZ6A 3W3DA 3A8YA 3D2EA 4BRDA 2HMPA 4H0XB 4HWIA 5TKYA 3QB0A 2HOEA 1NGEA 2VCPA 4H5WA 3EKSA 3J8AA 3L6QA 4BRMA 4CI6A 4CZMA 4GNIA 4FWQA 2F9WA 4CZIA 4FPAA 4LC9B 1XQSC 3OHRA 5ADXA 3O4WA 4XH4A 1NGHA 5AQLA 3O1WA 5BN8A 5AQXA 3WXIA 4K42A 3WUHA 3ZEUB 3UKUB 1BUPA 3A0IX 3MCPA 5AFUH 2D4WA 4JNEA 1NGIA 2Q31A 3O8MA 5AQWA 2Q36A 3L0QA 4HTLA 5AQHA 2GELA 1G99A 2CH6A 4B9QA 2E1YA 3LM2A 2NRHA 2YHYA 4YDUC 1SAZA 1YXQA 2FXUA 3A5LC 4FPBA 3LL3A 1MA9B 2P9LB 1BA0A 3QICA 2V7ZA 2FSKA 4A2BA 1V4TA 3WXLA 4DQ8A 1K8KA 4GY2B 4FO0A 2VWBA 4CD1A 2P9PB 4BRAA 4ISFA 3H3OB 4BGBA 5FPEA 3P4IA 1GLDG 2A5XA 3A5NC 1NGDA 2DPNA 3MDQA 2P9SB 4WQ5C 4NO7A 3LDQA 5AZIA 4E1JA 3FFKB 1HPMA 5BR9A 1MDUB 3HM8A 5AQIA 3CETA 2V7YA 4CBXA 1ZXOA 1D4XA 3KHYA 3UKRB 2P9NA 1GLEG 4FSVA 1BWFO 4B1ZA 4XH5A 4K41A 4BRIA 3LM9A 2P9UA 4PL8A 4A61A 4BRQA 4BVOA 2GTDA 5AQQA 2GWJA 2QWQA 2ZGZA 5AQVA 5EVZA 3SLCA 4H0PA 3IUCA 4BR4A 3F9MA 4BRPA 3QDKA 3ENHA 3ZX3A 3ZX2A 2A6AA 3VGLA 2YCHA 5AZJA 4QS8A 1GLCG 5JLFA 4RTFD 4BREA 4I6MA 1ZC6A 5E26A 3B8AX 4BQZA 2AA4A 3SK3A 4DB3A 3FZFA 4BRKA 3R6MA 1QZ5A 4F9OA 3FLCO 3DXMB 4RWTA 5BPNA 2A3ZA 2NLXA 5AQJA 3G25A 4BQLA 2IVPA 3UB5A 1NGCA 3MN5A 1HLUA 4FOIA 1MWMA 5F2RA 5JMVA 2HF4A 3ULEB 2A40A 2E2QA 4B1UB 4RCHA 4BR0A 3H1QA 3HBTA 2CH5A 5EY4A 3CIPA 5LY3A 3W0LA 3CERA 2D0PA 1QHAA 4IZ9A 3GOIA 1T44A 4JD2B 2QM1A 3WQUA 3U4LA 3MMVA 1BA1A 1HX1A 2PBDA 3MN7A 4CZLA 5FPNA 3GBTA 3WT0A 4CZEA 3CJAA 4BC5A 3FZKA 4K43A 2AP1A 4FWKA 3ZEUA 4IJAA 3VF6A 3ZETB 4BRNA 1TUYA 4BR5A 4FL9A 5EX5A 3LDPA 3H6EA 1T6DA 4PL7A 4BR2A 4KBOA 3M3ZA 1NMDA 3M1FA 3QBXA 3EKUA 3A5OC 2QWMA 5AQGA 4M63C 3I33A 4ISEA 4CJ7A 3CJ7A 1TYQB 4BG9A 2CGJA 5KPZA 3BP8A 4B1WB 1S3XA 1JCFA 1GLFO 2P9LA 5AR0A 4B1VA 4H0TB 1NWKA 1EQYA 1DGKN 2YHXA 5EXWA 1NLVA 1NGAA 4CZKA 4MLHA 3VEOA 2WUSA 4YDUA 3D2FB 4NB4A 3CQYA 2E2PA 2IVNA 2IVOA 5KPTA 1BDGA 1KAXA 5BRHA 5BPLA 2P9SA 4H0OA 2YHWA 4FWRA 1XC3A 3FZHA 4FWMA 2E2OA 4BR7A 5E84A 3CHWA 4BRHA 1ATRA 5AQMA 4JHDB 1QZ6A 4PKIA 5FPDA 3O6WA 1J6ZA 1YVNA 3UKRA 1NGFA 4WQ5A 1LOTB 3LDOA 1ESVA 4ISGA 2NZTA 2P9IB 2Q2RA 2F9TA 4AM6A 2FF3B 3VEYA 2Q1NA 4MO4A 2GWKA 1Z05A 2OANA 2Q0RA 3AAQA 3QBWA 5AQTA 1BO5O 2E1ZA 3WXKA 2ITMA 3C7NB 3GG4A 3VEZA 3ZX0A 2QW9A 4BC2A 4BRCA 4CBWA 4CD3A 5CE3A 3MN6A 2Q97A 3O5BA 5JICA 4CZFA 1C0FA 1HKBA 1KAZA 3O80A 1KXPA 1QQNA 4FWLA 4QS7A 3IMXA 3DXMA 3VERA 3JS6A 1IJJA 5LJWA 3U8XA 4CZHA 1NGBA 5ELZA 3RSEB 1X9JA 1E4FT 3FZLA 4FWPA 1YAGA 3ULEA 3VGMA 4MO5A 4BRFA 2V51B 2YI1A 1K8KB 2E8AA 1NGJA 5AQOA 3S41A 3BEXA 3A5MC 1V4SA 4JD2A 4WYBA 5AQRA 1SQKA 1BOTO 4K25A 3HTVA 2FLOA 1LCUA 3CJCA 1NBWA 2H3GX 3FZMA 3R8EA 3BF3A 1ATSA 3CJBA 1R59O 2P9KB 3CI5A 3I8BA 4JN4A 4FWOA 4H0YB 3SMPA 4BROA 4XEIA 3VPZA 2KHOA 2J4RA 3SMSA 1RDWX 1TYQA 3TU5A 4DHYA 2E88A 2CGLA 3HSCA 3O08A 2FSJA 1U2VB 1ZBSA 3UKUA 2QWNA 1RFQA 5FPMA 4CZGA 1XUPO 4EHUA 2BTFA 4Z94A 2QWOA 1BG3A 4PKGA 3DXKB 1DEJA 4WQ4C 4BRLA 2D1KA 3DWLA 1QQMA 1WUAA 2E20A 3VEXA 3ATUA 2EWSA 4JHDA 2I7PA 3GDQA 5AQPA 3VEVA 3WEEB 4CZJA 2I7NA 3AARA 4C23A 3VETA 2A42A 2P9IA 2P9PA 1NM1A 3EN9A 5LJVA 5BRDA 3BUZB 4DCHA 3ENOA 4FOEA 3VF2A 3JXUA 3QMLA 1RGIA 3H3NO 5B8HA 3FGUA 4AM7A 2VYPA 4BG8A 5BN9A 2GUPA 3ATVA 5BPMA 4PKHA 3C7NA 4M7YA 4XH1A 5KQ8A 2QWLA 3IDHA 3MK6A 1GLAG 1OKJA 2A41A 1X3NA 4IO8A 3HI0A 3M6GA 3VGKA 4EHTA 1GLLO 5AQZA 3GL1A 3D2EB 3O1BA 4QS9A 2GEMA 4H5RA 1GLBG 3D7EO 3DJCA 4BR9A 3GE1A 5AQYA 3RSEA 3BF1A 3VESA 3SJHA 2YJFA 3VF4A 2Q0UA 4L3QA 4EIAA 2IIRA 5BREA 3LDNA 5EOYA 1U6ZA 5AFUA 1BU6O 2PAVA 1Z6RA 2ASMA 4BGAA 2QXLA 3C0BA 2D0OA 1JCGA 3VENA 1WOQA 3AAPA 4CBUA 3UE5A 3CQXA 5BRFA 4MLEA 1SZ2A 2W41A 1C0GA 1NGGA 3EZWA 3QFUA 1HUXA 3VOVA 4BC3A 4BRGA 3WQTA 5AQNA 1H1VA 3VEWA 3EO3A 4A62A 2P9KA 5AQUA 2FSNA 3H45C 1P8ZA 4EAHD 4BVPA 4IJNA 4M7XA 3FR0A 1Y64A 1DKGD 1MWKA 4B1YB 1GLJO 3IFRA 4IWVA 3H46O 4Y0WA 3KZBA 5F0XA 1S22A 4BC4A 2HF3A 4H0VB 2QWPA 4O8KA 5AZIB 2ASOA 1IG8A 3CJ1A 3QFPA 2BUPA 3KVGA 1U2VA 3L4IA 1KAYA 3MN9A 3TPQA 3ZETA 3U9DA 4JAXA 1Q18A 2ASPA 2P9NB 4H5NA 5AQFA 3WXJA 1T6CA 2QWRA 1QQOA 3DXKA 2P9UB 1ATNA 1HKCA 5ADXH 3H1VX 5I9EB 1X3MA 4FWSA 1CZAN 3DAWA 3WEEA 4H5TA 4O5FA 3ID8A 2YJEA 5AQSA 1TUUA 4EFHA 1HKGA 5AZJB 4WQ4A 3FE1A 3D2FA 5AQKA 2ZWHA 2ZF5O 3U9ZA 4FWNA 4I6MB 4B1XB 2FF6A 2E2NA 4H03B 4IXCA 1JCEA 3CJ9A 1E4GT 1YUWA 4J8FA 5JLHA 2UYTA 2ZGYA 2V52B 3LDLA 3R9PA 5KQDA 2CGKA 1HJOA 2W40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KFZA 3QO9A 1J5EK 3EL2A 3VQAA 3AY9A 3W3DA 1S1VA 3SNNA 4CEDA 2HMPA 1NK9A 4HWIA 3QB0A 2HOEA 1I3AA 4CK2A 4OPAA 3OYEA 2DFEA 4FWQA 2D5RA 4CZIA 1TK5A 4FPAA 3O4WA 5AQLA 4OKEA 1DLOA 3NCIA 3CCJN 4CGFA 3UKUB 4OLBA 1WSFA 2DFFA 4CHZA 2DTUA 4CJ5A 3DLLL 2HMIA 5AQHA 1XHXA 2GELA 1G99A 3S3NA 1IKVA 4B9SA 1IKWA 1MA9B 3BGRA 4C8KA 4M3TA 4FO0A 4EZ9A 2G8HA 2YHAA 4BRAA 4BGBA 5CYMA 4DV7K 1EX4A 3WNHA 3SAGA 4DR6K 1GLDG 4FLUA 3PX0A 2A5XA 1ZBIA 3TSPA 1RBTA 4DQPA 5AZIA 5CHIA 2NUBA 4DSKA 2NRWA 1TVRA 3HM8A 3CETA 4LD0A 4JI5K 1D4XA 3KHYA 3IRXA 4OX9K 1VSEA 4B8CA 3CCUN 1QHTA 4LF9K 4XH5A 4YOVA 1QSSA 4K41A 4BRIA 2G8VA 1HYVA 4BRQA 2OZSA 2GTDA 4AH9A 4KPYA 1Z25A 2QKKA 3CPEA 4LFBK 1FK9A 4LFCK 4LH5A 4KKOA 2HW3A 4F8RA 5C12A 2FBXA 3ZX3A 2A6AA 4V19S 4Z4FA 1VSJA 3NMUA 3VQ5A 1NJYA 4RTFD 1YHQN 4I6MA 3CCQN 2O8BA 4MQ3A 3R6MA 1QZ5A 4C8LA 4JRPA 3UIQA 4KH5A 4BQLA 4W5RA 3SJJA 3UB5A 3SBGA 1ZBUA 1MWMA 2QI2A 3TTFA 5GAHP 1IO2A 2HF4A 4KHPK 2A40A 1KVCA 3HBTA 2CH5A 4JKBA 4K8XA 3DLGA 4Z4GA 1VQMN 3GOIA 3JAMO 1VQ7N 1L3SA 2QM1A 4FVUA 2KKZA 3U4LA 3WT0A 3R1XA 4CZEA 4ZTFA 3FZKA 1F21A 3I0RA 2AP1A 3QLHA 4E89A 3NDKA 4CHOA 5HRSA 1TUYA 4XJXA 1XNRK 1ZBHA 3H6EA 1T6DA 3J7ZO 3LP2A 2WFBA 4IG3A 4DSIA 1RT6A 4O5BA 4CJ7A 1SL0A 2CGJA 2XY5A 4B3RK 1JCFA 1NU0A 5J1EA 4J2EA 5EXWA 1NGAA 4CZKA 2WUSA 4YDUA 4NB4A 3CQYA 2IVNA 2IVOA 3V6DA 1KAXA 4E0DA 4NYFA 2HHHK 1IH7A 4DTNA 2YHWA 4EZ6A 4IFVA 1YTUA 4HCBA 2E2OA 1LWEA 2PFUA 1U49A 3O6WA 4DR5K 3CC2N 1Y97A 5GADP 5M1QA 4WQ5A 2Q2RA 4KH6A 3O3FA 2F9TA 3TR8A 3VEYA 1L3UA 4HHTA 2GWKA 1BCMA 5AJ3K 1JLCA 2ATQA 3QBWA 1T7PA 5KRSA 1BO5O 4JKFA 3HVTA 3C7NB 3VEZA 4CBWA 4BC2A 3MN6A 4R79A 4CZFA 1C0FA 3QEWA 5IWAK 3V4IA 1KCFA 1KAZA 4DQQA 1KXPA 2NRTA 4QS7A 3VQ7A 3IMXA 4BECA 1A5VA 4BDPA 3NVMA 1REVA 5C24A 1RDCA 1UA1A 4DU4A 3TARA 4CHNA 1QQCA 3F73A 2YNGA 3RSEB 1X9JA 4O4GA 3FZLA 3WNGA 1YAGA 4Y1CA 3HOTA 3VGMA 4JK7A 2OYQA 3G10A 2E8AA 1NGJA 5AQOA 3A5MC 1V4SA 3OW2M 2HNZA 3AA3A 3MWPA 1BOTO 1QSYA 1LCUA 1EWQA 3ZSYA 3FZMA 4QOZB 1HQEA 3D6RA 1HNXK 1YJWN 3CCMN 4OO1J 4JN4A 4C8NA 3VPZA 4CJFA 4BE7B 3VMFB 3SMSA 2HSTA 4FJHA 4FM2A 3IG1A 2E88A 3LPUA 3LDSA 2CGLA 2Y1JA 3O08A 3KK2A 1ZBSA 2QWNA 4DG1A 1FKPA 3AVKA 5HRPA 2F8SA 1WBDA 2BH1A 3NGIA 4Z94A 2QWOA 1OH6A 3DRPA 2HHTA 3MAQA 4WQ4C 4FJNA 1VSKA 4QCLA 2I7PA 3VEVA 4CZJA 2P1JA 3K57A 4B8AB 3CPWM 2P9PA 2WC9A 4ICLA 3L3VA 4FCYA 5BRDA 4KB1A 2OPSA 5FRNA 2GBZA 2Z1GA 3TSUA 4FOEA 3VF2A 2G8WA 4LFAK 1RGIA 3AVIA 4WE1A 3ZSVA 3C7NA 2JWLA 2XY6A 4FJKA 2QWLA 3IDHA 2G8FA 4RW6A 5GIPA 1CZ9A 2A41A 4IO8A 5EU7A 4J2BA 4IKFA 3KTQA 3HP9A 3FFIA 1NK6A 4DR1K 1JLQA 1SS6A 4FLTA 5AQYA 3RSEA 1S6PA 3VESA 1VQ4N 2YJFA 3HYFA 4KHWA 1TKTA 3CMAN 2Q0UA 2IIRA 1NK4A 1ASWA 5BREA 1YI2N 2PAVA 4IFEA 1Z6RA 3VQ9A 2QXLA 2O8DB 5A2QO 4AQYK 3VENA 4DSFA 1KLMA 2FC0A 3AAPA 3OYCA 4JYAK 2OTLN 4HVJA 4Q5VA 4CJVA 3QFUA 4N56A 1HUXA 5AQNA 1H1VA 3NHGA 4B9LA 3TSQA 4DR7K 2FSNA 4OGCA 3O9RA 4IFYA 2X6SA 5KGXA 1DKGD 1VRTA 2JLEA 1RBVA 1GLJO 5LMUK 1HNZK 4IWVA 3SUQA 1RT7A 4Y0WA 4ZTJA 4GKKK 4O8KA 3I56N 2ASOA 2IDOA 1OH7A 1VSDA 3L4IA 3P39A 3ZETA 2UUAK 2DY4A 4CFDA 1NJXA 1Q18A 3MWTA 4E72A 2BDPA 2XO7A 2OA8A 3DLRA 2O8FB 1NK0A 2QWRA 3L2UA 3KLIA 2P9UB 5KTQA 4A5BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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