3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Actin-like protein ARP9
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
3EO3A 3WUHA 3VEWA 4B1XB 3ULEA 4H0XB 1D4XA 2P9LA 1DGKN 1GLBG 3A5OC 3WEEB 1DEJA 3D2EA 1XQSC 2J4RA 4M7YA 5LY3A 4WQ4A 1ATNA 4NO7A 4BR2A 5AFUA 5AQMA 3SMSA 2Q2RA 3BP8A 3D2FB 3VENA 5JMVA 4B1UB 4H5RA 1P8ZA 3U9DA 5BPNA 1LCUA 1HKGA 2A5XA 2GUPA 3HM8A 3O4WA 3QBXA 4QS8A 1TYQA 3I8BA 4BQZA 1RDWX 2VYPA 4CBXA 3HTVA 1QZ5A 2QWRA 3CJ1A 3IMXA 4F9OA 3VF4A 4JHDB 1C0FA 1ATRA 3D7EO 2IVOA 3ZX0A 2E8AA 4IWVA 4CZIA 1NGFA 4BC3A 3FR0A 3VF2A 1E4GT 4BRKA 4BC4A 4CZFA 3UKUA 4CZLA 2FSJA 1KXPA 3LDQA 5AZJB 2HMPA 4WQ5A 1ZXOA 3VESA 3ULEB 1QQNA 3FGUA 3IFRA 1HX1A 3A5NC 4EIAA 5JICA 2VCPA 3KZBA 3AAPA 2CH5A 4K42A 4BRHA 2E2PA 4MO5A 1GLFO 1TUYA 4A2AA 4WYBA 1G99A 1J6ZA 1MA9B 3VGLA 2BTFA 3M1FA 4BRNA 3FFKB 4J8FA 2V7ZA 2QWOA 1JCGA 4AM6A 3BF3A 4BRIA 1HPMA 4H0OA 4FOEA 5KQDA 2CH6A 4ISGA 2W40A 1Z05A 3D2FA 4GNIA 3GOIA 4CBUA 4FPAA 2NRHA 3UKRA 3OHRA 1T44A 3ZETB 1ESVA 3FLCO 1YUWA 4FWSA 5KPZA 5CE3A 4MLHA 4B1VA 3W3DA 1C0GA 3H3NO 3L4IA 3MN7A 4E1JA 4Z94A 3AAQA 3FZHA 3O1WA 3HZ6A 4JAXA 1S3XA 3R6MA 2V52B 1K8KA 4BRCA 3LL3A 4QS9A 2E2QA 1BWFO 2FXUA 4FWOA 3CJBA 3ENOA 1GLAG 3VOVA 4PKHA 1E4FT 1NM1A 1JCFA 1NGEA 3VEOA 3DWLA 3BEXA 4H0VB 2Q1NA 3ZX2A 5FPNA 4XEIA 3LDOA 2V7YA 5EVZA 4O8KA 5BREA 2IVPA 3IUCA 4BR4A 3C7NA 1GLCG 2KHOA 3A8YA 1NLVA 2YI1A 4FSVA 4BC5A 3U4LA 2EWSA 4C23A 4JN4A 5AQZA 4XH1A 3VF6A 3GE1A 4CZGA 2Q97A 2ASMA 3HI0A 4FWNA 1H1VA 3WEEA 2D1KA 1X9JA 5EY4A 5FPDA 3DJCA 5AQHA 3VEZA 4DHYA 4BRQA 3WXLA 1Y64A 3UKUB 4KBOA 3JXUA 1SZ2A 3L6QA 4FPBA 3DXKA 3SK3A 2CGKA 1V4SA 2ZF5O 3SJHA 3MN5A 3O80A 4H0PA 4IJNA 4BVOA 3VEXA 3A5LC 3R8EA 4RTFD 3VPZA 4EHTA 1MWKA 1QHAA 2QW9A 2F9WA 3MK6A 5AQSA 3A0IX 3FE1A 3D2EB 5AQNA 2ASOA 4B1WB 3ATUA 3P4IA 3B8AX 1Q18A 2YHXA 3CQYA 5E84A 3RSEB 4EFHA 4BC2A 4FWMA 4H0YB 5BRHA 1WUAA 4M7XA 4BR5A 4BGAA 2P9LB 1KAXA 4B1ZA 2YJEA 3UE5A 5AQPA 3CJAA 4BRPA 3TU5A 3VETA 1HJOA 2YHYA 1RFQA 1X3NA 2P9IA 1T6DA 3EL2A 4ISEA 3TPQA 3M6GA 3RSEA 3ZETA 2P9SA 3ZEUA 4A2BA 5KPTA 2GWKA 5BPLA 1HLUA 5AQLA 2A3ZA 3CETA 5EX5A 2HOEA 4B1YB 1ZC6A 1ATSA 1XUPO 4B9QA 4PKGA 2E2OA 4CZMA 2BUPA 3GDQA 3GL1A 1QZ6A 5BN9A 1NGJA 2AA4A 3KVGA 4H5NA 5AQFA 2P9PA 2FLOA 5AQOA 3CJCA 3CERA 5AQIA 2NZTA 2A40A 4IJAA 5AQRA 2QWMA 4FO0A 3H3OB 1DKGD 3VGKA 3GBTA 3CIPA 2V51B 5AQXA 3UB5A 3S41A 4BQLA 3LM2A 3VEYA 3O5BA 2QWNA 4BG8A 3FZMA 1NGDA 3EKUA 2P9KB 2GTDA 2ASPA 1U2VB 2E2NA 2D0OA 3QMLA 2Q36A 3QB0A 1SAZA 1IJJA 5AQTA 3BF1A 4YDUA 3QFPA 3CHWA 1JCEA 2A41A 2YHWA 3DXMA 3VGMA 4AM7A 1RGIA 5AZIB 4H5WA 2D4WA 2YCHA 4CZJA 1QQOA 1BA1A 2E20A 3GG4A 3C7NB 4FWKA 4PL8A 4PL7A 4FWRA 1YAGA 2QXLA 3AARA 4I6MA 4BGBA 3QDKA 1QQMA 3QBWA 4QS7A 4JD2B 4O5FA 5F1XA 5AQYA 1MDUB 3WXIA 1XC3A 3I33A 2PBDA 3CJ9A 2YJFA 2ZWHA 1U6ZA 4DQ8A 4L3QA 3U9ZA 1BOTO 4CD1A 1ZBSA 2Q31A 5AZIA 3MN9A 4CI6A 4BR9A 3DXMB 4IO8A 4K41A 4YDUC 1NBWA 1U2VA 2P9UB 4EHUA 2P9KA 4WQ5C 3BUZB 5AQKA 1NGGA 3KHYA 3H6EA 4JHDA 1K8KB 5EXWA 5BRFA 3EKSA 1BA0A 2PAVA 1NGIA 2I7PA 2ZGZA 4LC9B 5AQQA 2GWJA 5LJVA 3J8AA 2H3GX 4CZHA 3ATVA 5BRDA 2DPNA 3UKRB 4M63C 5F2RA 4A61A 1BO5O 3ID8A 4BRLA 5E26A 4IXCA 2E1YA 3O6WA 4IZ9A 5AFUH 3QFUA 5FPMA 3LM9A 4BREA 3HBTA 4CZKA 4BRMA 1IG8A 3QICA 5LJWA 4FWQA 2E1ZA 3LDPA 3IDHA 4HTLA 2FF6A 4CD3A 5AQUA 1NGCA 1GLDG 2P9NB 2P9PB 4EAHD 3CJ7A 3F9MA 4BROA 2QWLA 1NMDA 1R59O 2I7NA 2Q0RA 5FPEA 4XH4A 4FOIA 4BR0A 3HSCA 1CZAN 3WT0A 4ISFA 1S22A 2NLXA 3MDQA 4BVPA 1BDGA 1KAZA 4BG9A 2P9SB 3ZEUB 4BRFA 2FSNA 3H1VX 2E88A 4BRAA 4FWLA 4CZEA 1NGBA 5JLFA 1NWKA 2ZGYA 4RCHA 3C0BA 3SLCA 1LOTB 1HUXA 4NB4A 4BRDA 2WUSA 2GELA 4H5TA 1Z6RA 5AQWA 4H5VA 3MCPA 3MN6A 1HKCA 2F9TA 4FL9A 1SQKA 2FF3B 5JLHA 5EOYA 3LDLA 5AR0A 1TYQB 4MLEA 5KQ8A 5BN8A 3H46O 4JNEA 4HWIA 5AQJA 4I6MB 5ADXA 3O08A 2UYTA 5BPMA 4JD2A 2CGLA 3O1BA 2A42A 2IIRA 4RWTA 3CQXA 3G25A 2A6AA 4DCHA 5KPRA 5AZJA 1EQYA 2Q0UA 5B8HA 1BUPA 3DAWA 4H0TB 1HKBA 4DB3A 3AY9A 4WQ4C 3VEVA 3ZX3A 4BRGA 2VWBA 4K25A 5AQVA 4Y0WA 5I9EB 2P9IB 2QM1A 2FSKA 2AP1A 3WXJA 1BG3A 3MMVA 3M3ZA 1MWMA 4A62A 5F0XA 3W0LA 4PKIA 3LDNA 3H45C 3VERA 4GY2B 4XH5A 1GLEG 3O8MA 2HF3A 3JS6A 5ELZA 3FZFA 5ADXH 3ENHA 1GLJO 1TUUA 1BU6O 2HF4A 2D0PA 1WOQA 4CBWA 5AQGA 2P9NA 2P9UA 4CJ7A 4MO4A 5BR9A 1V4TA 4FWPA 2ITMA 3EN9A 3WQTA 3EZWA 3WXKA 2QWQA 3FZKA 4K43A 1NGHA 5TKYA 3FZLA 2W41A 3L0QA 2QWPA 2IVNA 3R9PA 4BR7A 2OANA 1GLLO 1NGAA 1T6CA 1YXQA 3CI5A 3SMPA 3H1QA 1X3MA 3A5MC 3WQUA 1YVNA 3DXKB 3U8XA 2GEMA 2CGJA 4H03B 1OKJA 1KAYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJWA 3WUHA 4KH4A 4DSEA 1D4XA 5C12A 3LZJA 3DLHA 1XQSC 3AVBA 5M1KA 4DUYK 3LWLA 1ATNA 3QIPA 4N41A 4CHZA 5AQMA 1OVQA 1LWFA 2Q2RA 2FBYA 4ID5A 1P8ZA 4CW7B 1LCUA 2UU9K 1VQMN 2D0CA 3OW2M 4HHTA 4BDPA 4Z4IA 3HM8A 1KRPA 4ILGB 4QS8A 1XMQK 5KGWA 3AGRA 2VYPA 5HOOA 1IKXA 1QZ5A 5CR4A 1NG9A 5CYQA 3I8DA 3KK2A 3VQ5A 3V6DA 2E8AA 5HRSA 1TV6A 1OH6A 3VF2A 3ZT0A 4B9VA 2YNHA 3KLEA 3CCLN 1C6VA 1U48A 3LDQA 4CECA 2HMPA 3HVRA 3VESA 3ULEB 2G8HA 1QQNA 3ITHA 2A1RA 3IFRA 1Q9YA 4EIAA 5JICA 3KLHA 3AAPA 4BRHA 1KFSA 5GAGP 1TUYA 4WYBA 1G99A 1J6ZA 1WSGA 3VGLA 3O9QA 4OX9K 4CEAA 3LP2A 3AO2A 3U3GA 1FXXA 1ZBFA 2QWOA 3NE6A 2HMIA 4AM6A 3BF3A 3K2PA 1CXQA 4OGEA 4CEQA 3QERA 3THXA 3PY8A 4FOEA 3Q7CA 1SKRA 1VQ4N 3GOIA 3OHRA 3FLCO 3T3FA 4CJPA 1M90O 4B9MA 3I0RA 4MLHA 3W3DA 3L2VA 1C0GA 2F4VK 3OA9A 2ZE2A 3HM9A 3L4IA 3KIOA 4Z94A 3AAQA 3FZHA 3HZ6A 1S3XA 3R6MA 3OYKA 3ZSYA 4QS9A 4DV3K 2E2QA 1EWRA 4JYAK 4FK4A 4L8RB 4FWOA 2UXCK 3CJBA 2OTLN 1KTQA 1LWCA 5CZ1A 1NM1A 4ZTJA 1BI4B 3VEOA 3BEXA 1C0UA 2B5JA 3WNGA 3CM6A 5FPNA 4CJQA 4O8KA 1VQ5N 1GLCG 1S1XA 3A8YA 2HHTA 4BC5A 4CERA 2KLAA 4YOXA 4DLGA 4W5QA 1I94K 2O8CA 1ILYA 5KRSA 3RMDA 5AQZA 4LF4K 3VF6A 3GE1A 4DQSA 4MDBA 1TAQA 4M45A 1VQ8N 2KQ2A 1X9JA 5DM6L 3DJCA 1WSFA 3VQPA 2YNGA 4LFAK 2O8BB 1VRUA 4GV3A 1OH8A 3HK2A 2Y1JA 1Y64A 3UKUB 4DF8A 3OYEA 4K8XA 4B08A 3LDSA 3DXKA 3KLIA 4DU1A 4DU4A 1TKZA 1V4SA 3OVNA 4M3YA 4KTZA 4IBNA 4JKHA 3Q7BA 1HQUA 4FJ8A 1D8YA 4IJNA 3A5LC 4RTFD 4DS4A 3VPZA 1QHAA 4GKKK 5AQSA 3MK6A 2YKMA 3VQ6A 4DR4K 3ASMA 4NCGA 3NH2A 4I2PA 4X66K 3NGIA 4AF1A 1HYZA 3B8AX 1JLEA 5E84A 3L8BA 4M3UA 4O5BA 1JL1A 4E19A 3NHGA 4B1ZA 1EKEA 2YJEA 3UE5A 3CC4N 4BRPA 1HJOA 3J80O 1XHZA 5C2FA 2OPQA 4DTOA 3DMJA 4ISEA 3M6GA 3RSEA 2BGGA 2P9SA 4B3OA 2D5RA 1RT4A 5BPLA 5M1OA 1RT1A 5EX5A 4B1YB 5HL7L 4WFAL 1ATSA 1XUPO 1JLQA 4DR5K 3K9JA 1XMOK 3THVA 4PKGA 3GDQA 1U47A 1NGJA 3KVGA 1OVYA 3T1YK 2NZTA 1GOBA 4CFBA 2DFHA 3H3OB 3RVCA 4QOZB 3M8SA 2V51B 4G9ZA 3S41A 3KK1A 4Z0UA 1TKXA 2ASPA 4B3TK 2D0OA 3ID6A 3NFAA 4Y1DA 3QB0A 3KKRA 3AO5A 4CIFA 5AQTA 4YDUA 1RBUA 4JKGA 3FFIA 2Z1JA 1RT3A 4ZHRA 4DFJA 3OYLA 3IRXA 1FJGK 4J2AA 4GVMA 1NKCA 4FLZA 1I3AA 1RGIA 1YVUA 2PZSA 2D4WA 4A57A 2B4JA 4CZJA 4B9LA 1QQOA 4JK8A 5C25A 1RNHA 4FJJA 3AVJA 4UQGA 3S5TA 4JI8K 3L2RA 1WAJA 4C8NA 3V9WA 1T05A 3MX2A 4QS7A 3L2UA 4DV7K 2FBVA 3NGYA 4JKBA 3CXCM 4LSLA 5AQYA 3PIOL 3MAQA 3F9KA 1VSHA 4CJFA 3I33A 1CXUA 2W6LA 1C0MA 4Q0BA 4L3QA 1KVCA 4FCYA 1T03A 3ZYYX 1ZBHA 2HHWA 4KPYA 5AZIA 3LAMA 3AA3A 3KK7A 1N32K 4BE2A 4K41A 4WF9L 4OPHA 1U2VA 4C8KA 4DQQA 1BISA 1K8KB 3D0PA 1BIUA 1LW0A 2EHGA 2QXFA 3AVMA 1NGIA 2I7PA 3SYZA 4JKAA 3RR8A 5BRDA 5F2RA 4NCBA 4A61A 2NRRA 2FC0A 1YTUA 4BRLA 1HYVA 4DG1A 3KD5E 4MDAA 3QFUA 3OYIA 3VMFB 2HBMA 3EYZA 4FLXA 5LJWA 3QEVA 2FF6A 4CD3A 2YKNA 1QSSA 1GLDG 2P9NB 3CJ7A 3RRGA 1T7PA 2QWLA 3F2KA 2C1IA 1SKSA 2Q0RA 4OJRA 3VTHA 3HSCA 1CZAN 3WT0A 4KHYA 3K0SA 4KB1A 1UAXA 1S22A 2NLXA 1BDGA 4LSNA 1GOAA 4BRFA 2FSNA 3AV9A 3CPEA 4IG0A 2QI2A 1HUXA 4NB4A 3PLAA 2X78A 2F9TA 3O4NA 1RILA 4JLHA 3DI6A 4OPJA 3LDLA 2QK9A 1S9EA 5BN8A 4N76A 3H46O 5AQJA 3T69A 4DSLA 2OYQA 2Z1IA 2UYTA 2CGLA 1NK7A 2A42A 2PY5A 3CFOA 4KHWA 5JS1A 3G25A 3V9ZA 3AVHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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