3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
b'NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein ARP9
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Transcription regulator
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
3QICA 4BR2A 2ZWHA 4BVPA 4JAXA 2E8AA 5AR0A 3BF3A 2IIRA 5LY3A 2BUPA 4H5VA 3CJCA 4MLHA 3QFPA 3O6WA 4CZLA 2GUPA 3AAQA 3VENA 4YDUA 1D4XA 3UKRB 4B1ZA 3A8YA 1ZC6A 1HX1A 4HTLA 5AQGA 4FL9A 1EQYA 2A40A 4QS9A 5BPLA 3GBTA 4BG9A 3H3NO 4WYBA 3MMVA 2YHYA 2V51B 4EFHA 1BDGA 4CZMA 4FWNA 3LM2A 5E26A 5AZJB 3ENHA 3WEEB 1GLCG 3FR0A 3DXMA 2FXUA 4BRLA 3LL3A 4L3QA 1KAZA 2YJEA 3I8BA 4M7XA 4DQ8A 4K25A 4H5RA 4CZHA 1KAXA 4H5WA 3QB0A 1YXQA 3FE1A 1TUYA 4EHTA 1SZ2A 2VYPA 3VF4A 4JD2B 1NGDA 4FSVA 4IXCA 3H1QA 4A2BA 1C0FA 2Q36A 3CERA 4BR5A 1NGJA 3QDKA 3F9MA 2CGJA 4IJAA 5AQLA 3WUHA 2P9SA 3M6GA 5AQTA 4DHYA 3A5OC 4K42A 2FSKA 3VERA 4FWKA 3SMSA 2ASMA 3SJHA 1X3MA 3WQTA 2P9LA 5AQMA 3WXIA 3S41A 4WQ4C 2YCHA 4F9OA 5BR9A 4BRKA 4XH4A 4BR7A 3R6MA 4WQ5A 3VPZA 3OHRA 1DKGD 4BC5A 3L0QA 1YAGA 1XQSC 2E2PA 4H0OA 4EIAA 3DXKB 3UKRA 3CQYA 5BPNA 3R9PA 1NGHA 5JLHA 1S3XA 2P9PB 5BN9A 5FPEA 2I7NA 3AAPA 3P4IA 3GL1A 4FO0A 3VF2A 4ISFA 1QQOA 2FSNA 4CZGA 4FWLA 2D1KA 5ADXH 4DCHA 5CE3A 5EOYA 3HZ6A 3GDQA 3O4WA 4FWRA 1ZXOA 2D0OA 2IVOA 5AZJA 4AM7A 3MN6A 4H0VB 3WEEA 3SMPA 1BA1A 3FFKB 2V52B 1GLEG 4MLEA 5ELZA 3IUCA 5BPMA 3EL2A 5B8HA 4BRAA 4Z94A 4IZ9A 3WXLA 2YHWA 3LM9A 1HKGA 2CH6A 3DJCA 1E4GT 3IMXA 4FWOA 4BC3A 5AQPA 4FOEA 1TUUA 2HMPA 4B1YB 2F9TA 3RSEA 1NMDA 5AQNA 5ADXA 4H0YB 3CJ1A 3ZX0A 4FOIA 5KQDA 1NGEA 2NLXA 2P9LB 4JD2A 1LOTB 2WUSA 2P9UB 5AQSA 5AQWA 5FPNA 2ZF5O 2P9IA 4CBWA 1NBWA 4FPAA 3L6QA 2ASOA 1QQNA 4MO4A 1KAYA 3KHYA 4M63C 1TYQA 1NGBA 4H0TB 4GNIA 3MDQA 4RTFD 1Z6RA 2A5XA 4BGAA 2A42A 2KHOA 5LJVA 4BRIA 3O1WA 4PL7A 1WOQA 5I9EB 3IDHA 1G99A 4E1JA 1C0GA 4BRFA 1U2VA 3B8AX 3LDNA 3MN7A 5AQVA 1HKCA 2UYTA 4CJ7A 4B1UB 4A2AA 2YI1A 1JCFA 2BTFA 3VEWA 5BRDA 1E4FT 3C7NA 3DXKA 3VEVA 1H1VA 2AA4A 3EKSA 5BRFA 4CZIA 2P9PA 1BUPA 2IVNA 3ATUA 4BVOA 5E84A 1Z05A 2GEMA 1BA0A 4GY2B 5BRHA 4CBXA 1QZ6A 1YUWA 3D7EO 3CJAA 1GLJO 3RSEB 2QW9A 1QHAA 1ATRA 1R59O 2CH5A 3A5LC 1ATNA 1MDUB 2W40A 3LDPA 4FPBA 3CJ9A 2P9IB 4BRGA 3A0IX 2I7PA 4BRDA 2QWOA 3MN9A 3AY9A 2QWPA 4BG8A 1SQKA 4A61A 1JCEA 2D4WA 1TYQB 1X9JA 3HBTA 2NZTA 1P8ZA 3ULEB 4PL8A 4JHDA 3D2EB 4M7YA 5AQOA 3GE1A 4BR4A 2P9UA 2OANA 4IWVA 5AQZA 2NRHA 3BF1A 3VEYA 4B1XB 4FWQA 1ATSA 2CGLA 3VEOA 1U2VB 3BEXA 1GLBG 2V7YA 1BO5O 3WXJA 4O5FA 5KPTA 4BC4A 3VF6A 4EAHD 1ZBSA 3CI5A 4NB4A 1NGCA 1BOTO 3C7NB 4H0XB 3WXKA 3VESA 3VETA 4BGBA 5AQXA 3VGKA 2HOEA 3O80A 3VOVA 4BREA 4FWMA 1GLFO 4BC2A 4CD3A 3CJ7A 2PBDA 5BREA 1Q18A 3U9DA 3SK3A 4C23A 2GWKA 4CZFA 4BROA 2HF4A 1XC3A 3ZX2A 3O1BA 3HSCA 1X3NA 3HTVA 2V7ZA 4PKHA 3L4IA 3KZBA 4LC9B 1GLAG 4BR0A 5AQJA 4YDUC 3U8XA 3A5NC 4B1VA 4BRPA 1HUXA 1XUPO 2FLOA 2YHXA 1NM1A 3FZKA 4ISGA 3FZFA 3UKUB 1IJJA 4I6MB 4JN4A 5F0XA 3MN5A 1JCGA 4JHDB 1RDWX 1ESVA 1HPMA 3EKUA 1K8KA 4WQ4A 5AQUA 4CD1A 3TPQA 2QWMA 5EXWA 1KXPA 1NWKA 3VEZA 4PKGA 5FPDA 4H5TA 2HF3A 2Q1NA 3BUZB 5AFUA 2E88A 1Y64A 5JMVA 2PAVA 2QM1A 3ULEA 1GLLO 3CIPA 3MK6A 3WT0A 1T6DA 3AARA 3D2EA 3H45C 4K43A 4XH1A 4H03B 1NGIA 4BQZA 2GELA 4BRCA 1NGGA 2A41A 3KVGA 3QFUA 1MWKA 3JS6A 4BR9A 4BQLA 5LJWA 3QBWA 3H46O 3W0LA 4B1WB 1MWMA 1NGAA 2J4RA 3G25A 5BN8A 4DB3A 4BRHA 2ITMA 3EZWA 5KPZA 3MCPA 2P9NB 3FZHA 4H5NA 2P9KB 3O08A 1YVNA 1BWFO 3GG4A 5KPRA 1BU6O 5F1XA 3QBXA 5AQFA 2QWLA 5AZIA 5AQYA 1V4TA 3H1VX 3H3OB 3GOIA 2VWBA 4QS7A 1K8KB 4WQ5C 3DAWA 3HI0A 3H6EA 2QWQA 1BG3A 5KQ8A 2Q2RA 3ZETB 2FF3B 4O8KA 3FLCO 1DGKN 3ZEUB 4H0PA 4EHUA 3UKUA 2E1YA 4I6MA 2ASPA 5EVZA 3O8MA 4MO5A 2QXLA 3FGUA 3BP8A 1T6CA 3CHWA 3CJBA 4BRNA 2FF6A 5F2RA 1T44A 2ZGYA 3J8AA 1DEJA 5JLFA 3ATVA 3D2FB 2DPNA 4JNEA 4XH5A 5AQQA 1QZ5A 5EX5A 2IVPA 5AQRA 2FSJA 3LDQA 2QWNA 2W41A 4FWPA 2GTDA 2GWJA 1QQMA 3CQXA 2ZGZA 3I33A 3EO3A 2A6AA 1NGFA 1RGIA 2YJFA 2Q97A 3IFRA 4A62A 1OKJA 4XEIA 3M3ZA 1IG8A 5AQHA 2E20A 1V4SA 5FPMA 3HM8A 3A5MC 5AZIB 3U9ZA 2E2NA 2CGKA 3LDOA 1WUAA 4AM6A 2QWRA 5EY4A 3EN9A 3VGMA 4KBOA 3CETA 4BRMA 1LCUA 2A3ZA 4RCHA 4CI6A 4CZJA 2Q0RA 2P9NA 2P9KA 2VCPA 3DXMB 4Y0WA 4CZKA 5AFUH 4FWSA 4J8FA 3WQUA 3UE5A 1HKBA 3VEXA 3W3DA 1SAZA 3R8EA 2AP1A 4PKIA 2EWSA 3LDLA 3U4LA 4RWTA 1NLVA 3DWLA 2E2QA 5AQIA 1S22A 2Q0UA 4BRQA 1U6ZA 3O5BA 3FZLA 2H3GX 2E2OA 3ZETA 2E1ZA 3UB5A 3M1FA 2Q31A 4IJNA 4B9QA 1HJOA 4CBUA 3JXUA 5JICA 1MA9B 2P9SB 3ZEUA 3TU5A 3QMLA 4QS8A 1RFQA 5TKYA 1HLUA 1CZAN 2F9WA 3FZMA 1GLDG 4IO8A 4K41A 3VGLA 3ENOA 1J6ZA 3C0BA 3ID8A 3SLCA 4CZEA 3ZX3A 4HWIA 2D0PA 4NO7A 5AQKA 3D2FA 4ISEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BR2A 4JAXA 2E8AA 4H5VA 3CF5L 1RT5A 4C8OA 3AAQA 3VENA 4IKFA 1GOCA 4HTLA 4FL9A 3KLEA 2E4LA 4QS9A 4CK1A 3ZSRA 5BPLA 3H3NO 4WYBA 3NAEA 3MMVA 1REVA 3O3HA 4DFJA 3OS0A 3TAEA 3KK3A 3IKMA 1BDGA 3DLHA 3RTVA 3AO2A 3LM2A 1NJIO 2Z1GA 3AO1A 3WEEB 3FR0A 3DXMA 4JV5K 1VSDA 3RRGA 1SS6A 3AA4A 4J2EA 3OS1A 1KAZA 2YJEA 4DQ8A 4H5RA 3HM9A 4CZHA 1RBUA 1HNWK 3VQ6A 4DV4K 1YXQA 1JLAA 2QA4N 1SZ2A 4WE1A 1NOZA 4IXCA 2W00A 5C2DA 4KHSA 4F3TA 2Q36A 3CERA 2Q3SA 4JS5A 3RMCA 2CGJA 3M6GA 4CJEA 5AQTA 1C1AA 4DHYA 4LSLA 5T7BA 1NK5A 3VERA 3AVMA 3SMSA 2ASMA 5AQMA 1RBSA 4RW6A 3S41A 3CMEN 4WQ4C 1B9FA 3RMDA 4DF4A 4FM2A 4JRPA 5BR9A 1K73O 4C1NI 2G8FA 4DTSA 4BR7A 4W5TA 3J80O 3HJFA 2KLAA 4BC5A 5M1OA 3L0QA 4EIAA 3OJUA 3DXKB 3L3UA 3SBGA 1D8YA 1RBTA 5BN9A 2I7NA 3AVHA 4BE1A 1BCOA 1VQ6N 1HYVA 4Z4GA 4FLUA 3TANA 2XO7A 2D1KA 4YHHK 3EE8A 3QIOA 4KTWA 5CE3A 1Q82O 4FWRA 1VSLA 4RW7A 1N5YA 3MN6A 4H0VB 3KLHA 3WEEA 2V52B 3ZSOA 4MLEA 3SQ0A 3N4QA 4JKBA 3VQEA 5GADP 1NKCA 4KHYA 3E1YA 3S3NA 4IBNA 2FC0A 3WXLA 1HKGA 3G71N 3NFAA 1TUUA 3AV9A 3WNHA 4M3RA 1NMDA 1A5WA 3CJ1A 3DMJA 4FOIA 1NGEA 3OJSA 3J81O 3HO1A 1LOTB 1SL1A 5KRTA 5AQWA 2ZF5O 4CESA 4Q0BA 2P9IA 3E9PA 4JKHA 4YOUA 5CZ1A 2OA8A 2GUIA 4DS5A 4M3TA 3LWMA 4GNIA 2PYJA 4KTZA 5TKWA 5M1NA 4FJXA 5CR4A 2G8IA 1NK9A 3O9SA 3O1WA 1NK6A 5I3UA 3RR8A 4BRFA 1U2VA 3TARA 3LDNA 3JAMO 3MN7A 4DV6K 4C8NA 4A2AA 3VEWA 2BTFA 1C0MA 5BRDA 3VQCA 3DXKA 1BCMA 1HPZA 1H1VA 1YTUA 2AA4A 3ZT3A 4CZIA 3MEDA 5IWAK 4K8XA 1L3VA 4IG3A 3SUOA 1YUWA 5CYMA 5J2PA 3RSEB 3PIPL 5FRNA 2QW9A 1QHAA 1ATRA 2CH5A 3A5LC 4CEAA 5C2FA 4DTMA 3T1YK 4M3UA 2UXCK 2W40A 2G8UA 3TAQA 4G9ZA 3OYGA 3DRSA 5C25A 4JKDA 1U48A 2I7PA 1HNIA 2QWOA 2O8DA 3LPTA 4JK9A 5J2MA 2D4WA 3ULEB 4B9NA 4DTPA 3IAYA 3GE1A 2VGMA 3SPZA 3HPOA 5AQZA 5HL7L 3B6OA 4CFDA 2C1IA 4FWQA 1ATSA 1FK9A 1RDAA 3VEOA 1GLBG 3SQ2A 3KWIA 4BC4A 3ZT2A 3VTIA 3NHGA 3L2UA 3CI5A 1WAFA 1W97L 2VWJA 2XRIA 4FK4A 4ELUA 4BGBA 3VGKA 3VOVA 4FJ7A 1TAUA 3I0RA 1Z25A 4FLTA 5BREA 4R79A 2WC9A 3KTQA 4CZFA 2UUCK 1HRHA 5I42A 4E72A 3KKRA 3MXMA 4JI4K 1W2BM 1X3NA 4GV6A 4PKHA 1YITN 3L4IA 1IKYA 1GLAG 5AQJA 4KV8A 4O8UA 1QTMA 3OBYA 3HYFA 3CYMA 3UIQA 4BRPA 1VSEA 1VQLN 1NM1A 4CJRA 2P1JA 2QKBA 3MN5A 3D45A 4OKJA 1VSJA 3VQPA 1HPMA 5AQUA 4JKFA 3J7ZO 1SL0A 4CD1A 5A2QO 1T7PA 1KXPA 1NWKA 4M3WA 2E88A 1T8EA 3VQ4A 2QM1A 3LANA 5H1SQ 3ULEA 1GLLO 3CIPA 3MK6A 4NCAA 4JS4A 3K58A 4K43A 2WONA 4O0JA 3L2QA 3V9SA 2DFEA 4DV0K 4OPAA 1IBMK 3H46O 3VQ8A 4E1NA 2HBLA 3SQ4A 4BECA 1NGAA 1UA1A 2O4IA 4PY5A 4R5PA 4DB3A 4FW2A 4H5NA 2P9KB 2HHSA 4E7KA 3AVIA 1VAZA 4QCLA 1S1VA 3V1RA 5KGWA 1V4TA 1YI2N 1KVAA 4W5QA 1WNSA 3MAQA 3GOIA 2YKNA 1RT6A 3DAWA 3NGIA 1BG3A 3KWGA 3QESA 1JJ2M 2OPSA 4O8KA 4C8KA 1DGKN 3DRPA 1JL1A 5BR8K 2E1YA 1C0TA 3SQ1A 2DFHA 1WAJA 2YV0X 1IKXA 2YX6A 3AGRA 4HUGA 4CE9A 1B9DA 3FGUA 4BRNA 3SAGA 4K0KK 2VGNA 1C1CA 2DPNA 4OPHA 4XH5A 2A1SA 2XY5A 1J5EK 3LDQA 3OYMA 1W9HA 4FWPA 1EWRA 2GWJA 1W7AA 2P5OA 4H8KA 4KHWA 3EO3A 1NGFA 2YJFA 1JLBA 5AQHA 1C0UA 4KPYA 4RW4A 4AH9A 3HM8A 4FJ9A 4G1QA 5AZIB 4KHPK 1RTDA 4E7JA 2CGKA 3LDOA 4IEIA 3PV8A 3AVBA 4LH5A 3VQBA 3CETA 1LCUA 4PWDA 3KK2A 2P9KA 2IC3A 3M8SA 1QVGM 3WQUA 3MWTA 3UE5A 3MXIA 4ZTFA 2HHHK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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