The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
138
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structure length |
138
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Chain Sequence |
MTREEIKMIQKSWLRVIDKMDEAGLLFYRRLFDVEPKVRPLFKIDIEKQGRKLMDVLNWIVLNLQDIDAALDAARELARRHVKYGVKAEHYPVVGHTLIWTLRKMIGSEWTKQLEQLWTQAYEALAQVMIEEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of a Novel Site-Swapped Globin: Proximal and Distal Sites Constituted by Two Separate Subunits
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin-like flavoprotein fused to Roadblock/LC7 domain
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Methylacidiphilum infernorum
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| total genus |
61
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| structure length |
138
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| sequence length |
138
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-07-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y45 A; 3D17 A; 3B75 B; 1HDB A; 1NS9 B; 2MGM A; 1Y01 B; 1YE0 B; 3WCU C; 1HGB A; 4MQH B; 1YHR B; 4FWY A; 2H8D B; 2LH3 A; 1MKO A; 3K3U A; 1EBC A; 5AZQ A; 1Y4V B; 5EU2 A; 2NSS A; 3LB4 A; 5HY8 A; 3GQR A; 2QU0 B; 5JOM A; 2W72 B; 1CBL A; 4YU3 B; 1HHO B; 1KD2 A; 3ASE A; 4G1V A; 5CN6 A; 1BIN A; 1G0B A; 5CNB A; 4AVE A; 1YVQ B; 2ZLT A; 1YEQ A; 2GL3 A; 2ZT2 A; 1DUO A; 1HAC A; 1Y4G A; 3BJ3 A; 3S65 A; 1RQ3 B; 1QI8 B; 2O5S X; 3UHC A; 1LJW B; 4UZV A; 1OR6 A; 2WTH A; 1GBV B; 3WCV D; 5M3S A; 3MBA A; 4MQI A; 3G4Y A; 2D60 A; 3GK9 A; 2AUR A; 1B86 B; 1LFQ A; 1SDL B; 104M A; 1F63 A; 3ECX A; 1RVW B; 1JP8 A; 1Y7C A; 3CIU A; 2NRL A; 3QM7 A; 3R5I A; 3MYN A; 1Y4P B; 3A59 A; 3K8B B; 5SW7 B; 3OZU A; 2GTL B; 1JF4 A; 4PNJ A; 3LR7 A; 3DUT B; 1X9F C; 3NL7 A; 3WR1 B; 1A3O B; 1M6C A; 1YGF A; 2G0Z A; 4ROM B; 1O1J A; 3UHW A; 1HGA B; 3E5I A; 2MGG A; 1GZX B; 1MBN A; 1HBG A; 2MGJ A; 3AT5 B; 1A00 A; 1MLN A; 2ZSY A; 1DTM A; 2RI4 A; 1MLH A; 3ZJO A; 1J3F A; 1GCV A; 1HBR B; 2D2N C; 2GLN A; 1NIH A; 4TWU A; 2D2M D; 1YEO B; 3GKV A; 2HHE B; 4PQC A; 2W31 A; 2HBF A; 3WCW A; 1C7D B; 4G1B A; 3WTG A; 3NML A; 2R4Y A; 4X0L B; 3IC0 A; 3RGK A; 3OO5 A; 1FCS A; 1Y7Z B; 2MGA A; 2BWH A; 2D6C A; 1MNO A; 1URV A; 1BZP A; 3VAU A; 4NS2 A; 2QLS A; 1SDK A; 2MGD A; 2LH6 A; 3PEL A; 3OO4 A; 1HBH B; 1B0B A; 2FAM A; 5EOH A; 1LH6 A; 3OVU C; 1WVP A; 2MYC A; 3EOK A; 1FAW A; 3WCP B; 3WCV B; 2V1K A; 1S5X A; 1Y7D B; 5JGG A; 3PI2 A; 2MGF A; 2GDM A; 1Y2Z A; 1ECO A; 5CHR A; 3SZK B; 1Y46 B; 4ZVB A; 2PEG B; 3HRW B; 4O4T A; 5CNG A; 1CMY B; 4O2G A; 4IT8 A; 1LA6 A; 109M A; 4MU5 A; 4HHB B; 2W72 C; 1XZ4 B; 1YHE A; 3ZHW A; 103M A; 4NI0 A; 1PBX A; 4WJG A; 3BJ1 A; 3LHB A; 2QRW A; 4FH6 A; 5JDO C; 1V4W B; 1YDZ B; 1O1O B; 2ZS1 A; 1Y0C A; 1YHU A; 5EV5 A; 3LQD B; 2DN2 A; 3OK5 A; 3GQG B; 1RPS A; 3WCU D; 2R80 A; 2FAL A; 1HGC B; 4WJG 1; 2G0X A; 1MLQ A; 4F68 A; 1NWI A; 3ONZ B; 3WHM B; 5CND A; 1BVC A; 1AJ9 B; 1DXV A; 3ARJ A; 1YIH B; 1A01 B; 4MBN A; 1MNH A; 4DWT A; 3QJD B; 1HDS B; 1Y5J B; 1YZI A; 2GTL C; 1HAB A; 1CLS A; 1CG8 A; 1H1X A; 2H35 A; 1DKE B; 2D2M B; 1VXB A; 4OF9 A; 1ABW A; 5C6E A; 1G09 B; 1HLB A; 3WCT D; 1HV4 B; 1N9X A; 1O1K B; 4PQ6 A; 1IDR A; 3QJE A; 1OUT B; 1MOB A; 2IG3 A; 1C40 B; 1IBE A; 1EW6 A; 1DWT A; 3A2G A; 3UGY A; 2HHB A; 1C7B A; 2BLJ M; 1MBS A; 4M4B B; 3IC2 B; 2D5X B; 1Z8U B; 4IRO A; 1CH9 A; 1MOC A; 3ZH0 A; 2HBS B; 1VRF A; 1O1L B; 3IXF A; 1V4X A; 1Q1F A; 1BAB B; 3A5B A; 111M A; 2ZT0 A; 3D4X A; 1X9F D; 1HCO A; 1YEN A; 4UUR A; 2BNL A; 1YMB A; 2H8F A; 4PQB A; 3MJU B; 2ZLU A; 1ABS A; 1FSL A; 1A0U B; 1JY7 A; 3PI8 B; 1VXA A; 2DHB A; 1XZV B; 1QXD B; 3OZW A; 107M A; 1HBB A; 2DN3 B; 3VRE B; 1LFL A; 1J3Y A; 1SPE A; 1CIK A; 2MGE A; 2HBD B; 3VRG A; 3UHS A; 2NRM A; 1A3N A; 1J40 B; 2G0V A; 3FH9 A; 4U8U A; 3PIA B; 3QZX A; 1GJN A; 1OUU B; 2D5Z B; 1VXH A; 1S6A A; 1IT2 A; 1THB A; 1YE2 B; 3QJC A; 2D2N D; 1YH9 A; 1G9V A; 5EYJ A; 3WCU B; 1XYE A; 3ODQ B; 3KMF C; 6HBW B; 4XS0 A; 2HBC B; 4ILZ A; 1GDJ A; 2B7H A; 3WFX A; 2G10 A; 2O58 X; 4TYX A; 1Y0W B; 2AUQ A; 3WI8 A; 2HBE A; 3QQR A; 2ZFO D; 1QPW A; 1J7Y B; 1YFF A; 1YEV A; 3EU1 A; 2MYA A; 5EE4 C; 4KJT A; 4UIQ A; 2HZ1 A; 3BOM A; 3VHB A; 2ZSZ A; 1J7S A; 3UHT A; 4H2L A; 1BBB A; 1YMC A; 1I3D A; 1BZZ A; 3FS4 A; 1A9W A; 1GLI B; 4F6G A; 1MLU A; 1EMY A; 3B75 A; 4MQC A; 3WCT B; 4NXC A; 3UHX A; 3OGB A; 2Z8A A; 5KKK A; 2JHO A; 1DO7 A; 1NQP B; 1X3K A; 1SPG A; 4MQH A; 3ZJI A; 1YHR A; 1DXT A; 2M6Z B; 1EWA A; 1A0Z B; 2LH7 A; 3MYM A; 3NFE A; 1JF3 A; 3QM9 A; 2HCO B; 1TU9 A; 3UHY A; 1HLM A; 1YGD B; 1YG5 B; 1MLG A; 1Y0A A; 3UHU A; 3IA3 B; 1X9F B; 3BCQ A; 5JDO D; 1A6G A; 1M9P B; 2D2M C; 1LFZ A; 1Y7G B; 3MKB A; 4MQJ A; 2O5T X; 1LH3 A; 1LH1 A; 1RQA A; 1V75 A; 5KDQ B; 3O89 A; 3G4U A; 1JP9 A; 1Y0T B; 1MBI A; 1G08 B; 1J3Z B; 1HBI A; 1LH2 A; 2ZS0 A; 1X46 A; 4MQK A; 3BJ2 B; 3UHR A; 3GQP B; 1BVD A; 1CIO A; 2D2N B; 5E83 A; 3ZJN A; 5AB8 A; 1UX9 A; 4OOD A; 1DTI A; 4MQG A; 2YRS A; 2DN1 A; 2QMB B; 3HYU B; 1IWH B; 3PI9 B; 2VHB A; 4B3W A; 1Y85 B; 4GZG A; 3DHT B; 102M A; 1YIE A; 2WTG A; 1NPG A; 1BZR A; 4DC8 A; 1VXE A; 1KFR A; 1A4F B; 2QFN A; 1DXU A; 3E5O A; 2ZFO B; 2GRF A; 5CNE A; 3UH3 A; 2QSP B; 3HXN A; 1XZU B; 1QSH B; 2V1E A; 1XY0 A; 1FN3 B; 1GZX A; 1N9H A; 3ECL A; 3PT7 A; 1Y31 A; 4F69 A; 3PI4 A; 1A6N A; 5EUI A; 4F4O A; 2RAO B; 3HF4 B; 1LH5 A; 112M A; 3G4R A; 1MOH A; 1XZ7 A; 4MPM A; 1HBR A; 3MJP A; 3K9Z A; 2MGB A; 1JEB B; 2KSC A; 2BW9 M; 3UI0 A; 2ZLV A; 5ILP A; 2ZS1 C; 1Y35 A; 1Y8W B; 1MWC A; 2ZLX A; 4ODC A; 3GOU A; 2GRZ A; 1NEJ B; 2QSS A; 5E29 B; 4YU4 B; 3D1K B; 4F6I A; 1IOP A; 2GNV A; 5CMV A; 1Y4B B; 1S69 A; 3A0G A; 4LPI A; 1IRD B; 3WCT C; 1BJE A; 2FRK X; 4N8T A; 1SI4 B; 2G12 A; 2MGC A; 3D7O B; 3AT6 B; 4FC3 A; 1V4U B; 1LFV A; 3QZZ A; 1R1X B; 2DC3 A; 1YVT A; 3ZJS A; 3S66 B; 4NZI A; 2MGL A; 1BZ0 A; 1T1N B; 3HHB B; 1XZ2 A; 3V2V A; 3W4U A; 1XXT B; 1R1Y B; 1H97 A; 1BUW B; 1MYG A; 5EE4 D; 2VLZ A; 1Y09 B; 1DWR A; 1HDA A; 3QM8 A; 2V1H A; 1O1M B; 3SDH A; 2R4X A; 3AQ6 A; 1LUE A; 2W6W A; 5KER B; 2ZSR A; 4G51 B; 2OHB A; 1I3E A; 1VXG A; 3P5Q A; 1RSE A; 4ROL A; 2OH8 A; 1RQ4 B; 3NMM B; 3UGZ A; 1LHS A; 3GYS B; 2HHD A; 1CH3 A; 3WHM A; 1CG5 B; 1N9I A; 3WFW A; 4B4Y A; 3UHE A; 4N7O A; 1K0Y B; 1YEU B; 3HEP A; 1MWD A; 3TLD A; 1A01 A; 1MNJ A; 2OIF A; 1UT0 A; 3LB1 A; 1F5P A; 1HDS A; 1MOA A; 3DHR A; 1CO9 A; 4N7N A; 2VEB A; 1C7C B; 1Y45 B; 2PGH A; 2LH1 A; 1BZ6 A; 3D17 B; 4L7Y A; 5MBN A; 1S56 A; 1GDL A; 1HDB B; 1MLK A; 3NG6 A; 1GBU A; 2V1J A; 2BLI A; 1O1P A; 2CMM A; 1HGB B; 2ZFO C; 1S5Y A; 1MKO B; 1C40 A; 4F6J A; 3WCW D; 1G0A A; 5HBI A; 5HU6 A; 1UC3 A; 5HY8 B; 3GQR B; 2E2Y A; 1FSX A; 3GDJ A; 4F6B A; 2W6V A; 1Y8I B; 3CY5 A; 1KD2 B; 5ILE A; 1QXE A; 1G0B B; 1K1K A; 2R50 A; 2VLY A; 3ZJM A; 1NWN A; 4DC7 A; 3UHB A; 1O1L A; 1YEQ B; 2EVK A; 3BJ3 B; 1J7W A; 1Y4G B; 3S65 B; 1MLR A; 2OHA A; 3UHN A; 2MGK A; 4JAC A; 1OFJ A; 1QXD A; 1GCW A; 4MQI B; 1FHJ A; 2DXM A; 2D60 B; 1J52 A; 1TES A; 2ZSQ A; 1LFQ B; 1J40 A; 2OH9 A; 1MBO A; 3CIU B; 3R5I B; 2D5Z A; 3ZJJ A; 3A59 B; 2ZST A; 3G53 A; 4HRT A; 2BKM A; 101M A; 4C44 A; 5CN7 A; 1RTX A; 1DM1 A; 3NL7 B; 1D8U A; 2OLP A; 1AJG A; 3ODQ A; 1NS6 A; 2G11 A; 3ZJQ A; 2ZS1 D; 1YGF B; 5EYS A; 1O1J B; 1MLL A; 1VWT A; 1NXF A; 5CN5 A; 3RJN B; 1BZ1 B; 1QSI A; 1U7S A; 1HBS A; 1DLW A; 1LTW A; 4FWX A; 5JDO E; 3ED9 A; 1JP6 A; 2Z6N A; 4NI1 A; 1DO3 A; 1SHR A; 2ZS0 C; 3S1I A; 2RI4 B; 1VRE A; 4O1T A; 4MXL A; 1GCV B; 2IN4 A; 4ZVA A; 1PMB A; 1Y4Q A; 1UIW A; 3O7N A; 6HBI A; 1A6K A; 1DLY A; 5JDO F; 3GKV B; 1N9F A; 3ARK A; 2HBF B; 3QJB A; 3TM3 A; 3WCW B; 3D1A B; 3M39 A; 3ZJH A; 3WTG B; 3S1J A; 2GKM A; 2G14 A; 3IC0 B; 110M A; 3OO5 B; 3SDN A; 1O1N A; 3PT8 A; 5D5R A; 5C6Y A; 1Y4F A; 1GDK A; 4M4A A; 1OJ6 A; 1MBA A; 5IKS A; 2QLS B; 1SDK B; 3PEL B; 3AQ9 A; 2XYK A; 2AUO A; 3OO4 B; 4HRR A; 1MTI A; 3AQ5 A; 2R1H A; 1WMU A; 1XQ5 A; 1FAW B; 2O5M X; 1MLO A; 2Z85 A; 2W6X A; 1Y8K B; 1Y0D A; 5JGG B; 1W92 A; 2ZSN A; 3R0G A; 3G46 A; 1CH2 A; 4HSW A; 1LA6 B; 1HBA A; 3VRF A; 1BIJ A; 2LH5 A; 3GQP A; 1YHE B; 4WCH D; 1PBX B; 1XZ5 B; 4KMW A; 3BJ1 B; 4U8U D; 1Y5F A; 2QMB A; 1LFY B; 2ZS1 B; 5E6E A; 1Y0C B; 1MZ0 A; 2DN2 B; 1RTE A; 1URY A; 2R80 B; 4BJA A; 1HRM A; 5F0B A; 1FN3 A; 4N7P A; 1Y4R A; 1Y8H A; 2Z6S A; 1DXV B; 3QQQ A; 1YZI B; 3GKT A; 1NZ2 A; 4HSX A; 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1YFF B; 3EU1 B; 3BOM B; 1J7S B; 4KMV A; 4H2L B; 1BBB B; 1YOG A; 1CP0 A; 1O16 A; 3G52 A; 2MYB A; 1DUK A; 1BZZ B; 2ZSS A; 1YEO A; 5F2A A; 4F6F A; 2HHE A; 1MLM A; 4MQC B; 1C7D A; 1YHU C; 2HZ3 A; 1OR4 A; 4X0L A; 1SPG B; 1Y7Z A; 5B84 A; 2C0K A; 1DXT B; 1NZ4 A; 1MLF A; 4MXK A; 1V9Q A; 3NFE B; 1Y5K B; 3G4W A; 1JPB A; 3PI1 A; 2O5Q X; 1HBH A; 1Y8I A; 2VYY A; 3WCP A; 1Y0A B; 3BCQ B; 5CNF A; 3WCV A; 2ZSP A; 1GDI A; 1CO8 A; 3KMF A; 1Y7D A; 3SZK A; 1LFZ B; 3MKB B; 4MQJ B; 1Y46 A; 4TWV A; 2PEG A; 3EDA A; 3V2Z A; 3HRW A; 1MGN A; 3UHQ A; 1CH5 A; 1RQA B; 2MHB B; 1V75 B; 106M A; 3QMA A; 2MB5 A; 4L2M A; 1J41 B; 1CMY A; 4HHB A; 1XZ4 A; 1FLP A; 2ZS0 B; 4HBI A; 1HJT A; 4MQK B; 1NZ3 A; 1V4W A; 5E83 B; 1YDZ A; 1O1O A; 2MGH A; 1S61 A; 4MQG B; 3LQD A; 2YRS B; 4JYQ A; 3GQG A; 1UFJ A; 2ZSX A; 2DN1 B; 1HGC A; 4VHB A; 3AG0 A; 3MVC A; 1CPW A; 2V1G A; 1YIE B; 1MYJ A; 5EQM A; 1L2K A; 2R4W A; 3ONZ A; 2AA1 B; 2NSR A; 1DXU B; 2VLX A; 7HBI A; 3HXN B; 4NXA A; 1AJ9 A; 1YIH A; 1XY0 B; 1M6M A; 3QM5 A; 4O35 A; 3QJD A; 1Y5J A; 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