3WGDA

Crystal structure of erp46 trx1
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
HMSKHLYTADMFTHGIQSAAHFVMFFAPWCGHCQRLQPTWNDLGDKYNSMEDAKVYVAKVDCTAHSDVCSAQGVRGYPTLKLFKPGQEAVKYQGPRDFQTLENWMLQTLNE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Radically different thioredoxin domain arrangement of ERp46, an efficient disulfide bond introducer of the mammalian PDI family
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 5
total genus 35
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wgdA00
1YF0A 3QFBC 4JRRA 2HYXA 3FK8A 2HRFA 2WZ9A 3WGDA 2DJ2A 4PUFC 3I6AA 1GSUA 3VWVA 1PX7A 2AHEA 4ISDA 2H30A 2IMKA 5CYYA 1EGRA 2PGTA 1MDJA 2GT6A 2PUKC 4IS0A 3CMIA 2B7KA 1K0CA 3BJ5A 4EDZA 2H70A 2WGRA 2GZZA 5IPGA 2WRTA 2IN3A 4DVCA 4GF0A 3UMAA 3APSA 2CVBA 1K3LA 1A23A 1TOFA 3O6TA 6GSXA 5JWQB 5ECOB 5HQPA 2DLXA 1TU8A 1SK0A 3KTLA 4KE3A 1EP8A 1K0DA 2V6KA 3GYKA 5J9BA 4XS4A 1XIYA 1YEPA 5H5SA 1U87A 3HVXA 4GQFA 5LCZA 1C72A 5LD0A 4YAVA 2AYTA 1YY7A 3RPNA 2C0FA 5J9CA 4XIHA 1OC9B 1XW9A 2OBIA 5HFIA 2B5XA 4LL1B 3N9JA 1X5EA 2OKAA 4K6XA 2HT9A 1GP1A 1OE8A 4IJ3A 3VFIA 1FOVA 2IMFA 1FHEA 2MMNA 4GSSA 5DJMA 3HXSA 2BMXA 1WMJA 3F8UA 5B6MA 3GH6A 5C04A 2XBIA 4MJBA 3U6VA 4NWYA 3APQA 1TJDA 4TOPA 2PERA 2V2GA 3RBTA 4BL7A 3TKPA 2LQQA 4PXOA 3ZTLA 3PGTA 2CX4A 2H74A 3HJPA 4MF5A 3TJGA 3EU3A 5ID2A 4O5RA 1ERWA 2B6MA 3EURA 1XW5A 1DUGA 5HR1A 1F2EA 3DMLA 2I81A 3ZMLA 4LL4B 1YKCA 5CP1A 5F8BA 3TKRA 3LSZA 2DJKA 5EVOA 1O6JA 3QMXA 1V9WA 2DJJA 2VL9A 3WYWA 1AUCA 2PVOC 4L0UA 3FR9A 4GRFA 3UVHA 3GV1A 3KGKA 3IA1A 5FHIA 2C3QA 1TRSA 4K1FA 1G0TA 2B5YA 5B8AA 1Y25A 1O8WA 3ZREA 1X9MB 3DKSA 4G9HA 4O32A 2VL2A 4IELA 4TR4A 1N8JA 3Q19A 4AGSA 3O3TA 2MMOA 2F3MA 4WBJA 1XW6A 1M7TA 5H5QA 4N30A 4FYBA 5IO2A 2HNLA 4MZCA 1TI3A 2YV7A 4L8EA 1B4QA 1AQXA 1LBKA 3EU4A 4KUNA 1XVWA 4KX4A 3RHBA 1TK8B 3TJFA 3CSHA 2MZCA 1OVNA 2H6XA 3M0FA 4WETA 1Z9HA 10GSA 4XTSA 2ON7A 3HYPA 4GQCA 5GZZB 5ECIB 3W8JA 3IDVA 4HJ2A 1K0BA 2GLRA 1DBYA 4IW9A 3H79A 2VLUA 2HZEB 4TRXA 3PINA 3ERFA 4KGIA 4BWQA 3TDGA 4N11A 2J23A 2LKUA 3QCPA 3UBLA 2VL2C 2M80A 1NM3A 2H72A 2AB6A 1T7PB 1J08A 4MK3A 4IP6A 3UOMA 4HDEA 2OACA 1XZOA 2C80A 4ZBDA 3ZL5A 2CV4A 1PKZA 5AIXA 4I2TA 1YKAA 4G2EA 3UL3A 2GZPA 1JLWA 2I9HA 2PVQA 5ECKB 1ABAA 2M72A 2ZCTA 2WJUA 4HZ2A 4AJ7A 2JU5A 4EVMA 4OO5A 2IMEA 3KH9A 1E6BA 3M9JA 3AY8A 4V1Ap 2K18A 2H75A 1RW1A 3ERWA 2HSYA 1JZDA 5HFGA 1SKWB 3CSJA 4IGJA 5A4VA 1VF4A 3F4TA 1G6YA 4Q5FA 4AJ8A 1R5PA 3A3TA 2VUPA 1SD9A 2PBJA 3D22A 3DGQA 1R26A 2HRNA 1AQWA 5J5NA 3KD0A 3A2XA 3GKXA 1H4OA 2B5EA 4CDOA 1FG4A 1V57A 3UEMA 2GT5A 3BCIA 5ECNB 3GUSA 5GAND 1Z5YE 5IM9A 3GMFA 1Z7RA 4F0CA 1X5CA 2H8LA 4JR6A 4NPBA 2V41A 4WF5A 2CA8A 1WJKA 3UAPA 3D4MA 2C3NA 4MJCA 2O85A 3IK9A 5IQYA 5IMDA 2C1YA 2V6OA 3IOSA 1F3BA 1M2BA 3LYPA 1O85A 4NHZA 3LGCA 4PURA 1TXXA 2RUEA 1SK1A 2DMLA 2LRTA 2YCDA 3HZ4A 2CT6A 2IFQA 3SBCA 2D2ZA 5CREA 4QL7A 1R5AA 3F4RA 4H86A 2DJ0A 2AAWA 2K8VA 4OD7A 1A2MA 1DE2A 3IR4A 1Q4JA 2WDUA 2CZ2A 2JADA 3F6DA 4I8BA 2TRCP 5JCGA 5DQSA 4V2LA 3RAZA 4ECCA 1W4VA 2MBTA 2EIRA 3LXTA 5IMZA 2JACA 3PH9A 3P90A 3TRXA 3ME7A 4EXJA 1F3AA 3VWUA 1USBA 2NDOA 4POLA 3P7XA 2VL3A 4J56E 3IE3A 2XHFA 3DXBA 7GSSA 2EIOA 2EIQA 3ZYWA 5ECLB 2QC7A 2ON5A 4ZL7A 22GSA 2V1MA 4HJMA 1M99A 3LQ7A 4MF7A 1EWXA 4OO4A 1WP0A 2F8AA 4IQ1A 9GSSA 4KSMA 4O7HA 4HU7A 2KHPA 4NMUA 3GFKA 2YP6A 2FD3A 2LQOA 3GIXA 2OA7A 1T8EB 1XVQA 5HFKA 3IAS2 3JCML 2CZ3A 1TKDB 2OADA 2F8FA 4V1Ag 3MNGA 3L0HA 5EPFA 1EZKA 4CW9A 5FT3A 4KDUA 2RM5A 1PL1A 1GWCA 4WR5A 4TR0A 4POKA 2CX3A 5JWOB 3Q74A 3FR6A 2EC4A 1PL2A 4JBBA 4GCIA 1ERTA 2C4JA 4BPYA 3TOUA 1WOUA 5GSSA 3KM6A 4WXTA 1SJ6A 3M1GA 1HNBA 1GLPA 2P5RA 4PQ1A 5COHA 2DJ3A 4MA9A 3F3QA 5D73A 1BEDA 1AAZA 5A5KA 4N10A 2E7PA 3UIWA 2X8GA 1T4YA 3VLNA 4GSNA 5ENUA 2VOCA 2B1LA 4LA1A 1Z7PA 2YWNA 3CTGA 2R37A 1WIKA 2XPEA 5CRHA 3F4SA 2PPTA 3GKMA 1XWBA 3Q6OA 4NHWA 5DBQA 2VCTA 3VI5A 3QAVA 2OE0A 4X43A 3TJJA 3KEBA 2GSQA 3VPQA 4O92A 4OCEA 3TGZA 4DSRA 4NV5A 5KN0A 1SK2A 13GSA 4IHUA 4QQ7A 3TRPA 2HE3A 2B3SA 5DCHA 2O87A 4P3YB 2X99A 5JCUA 1G6WA 4KA0A 5D8IA 3BD2A 3IHQA 1H75A 1SU9A 3F9UA 4BWSA 1YEXA 1GTAA 5IMAA 3VURA 4TKYA 3CXGA 5IO0A 3ZRDA 1K3OA 1J9BA 1AIUA 4GLTA 1O73A 3A2VA 4DSSA 2FWGA 4PGTA 5IMCA 1I9DA 1THXA 1LU4A 3EVIA 5AIVA 4NV2A 5G2ZA 19GSA 4JZQA 5DJLA 3G7IA 4J2FA 1U3AA 5DVBA 3WGXA 2KUCA 3VK9A 1FVJA 5CNWA 2X8HA 3F63A 4MP4A 1QK8A 5IOXA 2L59A 1SKSB 4K0GA 3P2AA 1HNCA 4LLRA 2LNTA 3KIJA 6GSSA 2VLVA 3ZLPA 5DALB 1O8XA 2L6DA 1EEMA 3FHKA 4BVXA 1YZXA 1K0OA 2IL3A 2RUFA 1GSSA 4KB3A 2NVLA 3GURA 3GNJA 4TW5A 1JLVA 1S3AA 1A8YA 1XPVA 3G7JA 5G5EA 4LMVA 2DIZA 3DVXA 4I97A 5IIZA 3W6GA 5J3RA 2YANA 3LXZA 5F06A 3D0ZA 5ECMB 3GSSA 3IRAA 2LV3A 5CRWA 2YN1A 4K7NA 3WGEA 3LWAA 3QFAC 4KDYA 1XWKA 3EINA 5G1KA 3G7YA 1O7UA 4WEYA 5ELGA 2L6CA 3GTUB 4K8MA 4OWYA 1FVKA 4EL1A 2N5BA 4HS1A 1EOHA 3MAKA 4EUYA 2IIYA 1AC1A 4DSQA 1ERUA 1DSBA 4HZ4A 3G9BA 3F3RA 2MBSA 2VCQA 3QDNA 4MZBA 4WBRD 1PA3A 1ZZYA 2VIMA 3DIEA 4POMA 3A2WA 5IMFA 2R2JA 4IKHA 4Z7XA 3BOAA 1B9XC 4F0BA 3VI7A 4FO5A 4POBA 2VCWA 2CVDA 3HHVA 4NAXA 4MABA 4KCAA 4Q5NA 1YF1A 1SL1B 1PSQA 1GNWA 3RPPA 4KCEA 1ZCPA 2O89A 1OYJA 3QPMA 4ZB8A 2R5GA 5D9WA 4XRDA 4F2IA 2FY6A 3VPTA 4XS6A 1RQMA 2IPAA 3LG6A 2IJYA 2ZNMA 4RQXA 1VF3A 5ECPB 2IWTA 3Q18A 3GX8A 1UA5A 3BBYA 5JCWA 3DWVA 2YWIA 1MEKA 1GSQA 1GH2A 4TR1A 4DEJA 2B7JA 1EGOA 3KMNA 1F37A 2A4VA 1SL2B 2VCZA 1JZRA 1GSDA 3I9V2 1QUWA 2I3YA 2YWMA 4MZWA 4HUAA 5J41A 5AN1A 5IMVA 2YZHA 1U3IA 2F9SA 3IAM2 4FYCA 2YJHA 3TJBA 3F0IA 4PNGA 1XBSA 5D93A 2BJXA 1V40A 4Q5RA 5AGYA 1GUHA 4ZL8A 4GXZA 1FB6A 3FZ5A 3HKRA 4ML1A 1X5DA 3DEXA 4MPFA 4WF4A 3GL5A 2MYGA 1AW9A 3HVVA 1A0RP 1CQHA 2JZRA 3WD6A 4BA7A 1OKDA 5G1LA 1FAAA 3US3A 4I5QA 4Q5QA 1OC8A 1QGVA 2HZFA 2OJLA 1TW9A 5INYA 3MSZA 3I43A 1K0NA 4ULXA 3NZNA 1OC9A 2DSAA 3ZFBA 2P31A 2PWJA 2L5LA 2H71A 2AV4A 4AJ6A 6GSWA 4XS4B 4HOJA 2K8SA 1T00A 2P0GA 2E2GA 1ON4A 4X1UA 3C73A 4PNFA 4WR4A 1GSFA 2FLSA 6GSUA 2O8VB 2HI7A 1YJ6A 2H1BA 5EL8A 1GTIA 3C71A 5DALA 2X8CA 4K7OA 1FB0A 2RM6A 2FGXA 4MF6A 5AISA 3GKNA 2GS3A 4JR4A 1X9WB 1HYUA 2WB9A 1PN9A 4G10A 3M3MA 1XOAA 1TTZA 5ECSA 3GA4A 1LJRA 3P8WA 1NHYA 4E8HA 3N5OA 1B9YC 1HD2A 2KLXA 2IMIA 2VCVA 1EV9A 2LSTA 1W89A 2OE3A 2YWOA 3GTUA 2LTKA 1T3BA 1I5GA 4ZBBA 4ACSA 2GQLA 4CHSA 2GSTA 2A2RA 3E0UA 5C00A 3ISOA 1M9BA 1BG5A 1GL8A 4QL9A 3HJOA 3FZ9A 3TKSE 1TK5B 1F6MC 3OR5A 4YAPA 3D6IA 2YPMA 3TOTA 3EYTA 3APOA 2ZUPA 4N0ZA 2LRNA 1X0RA 5HR0A 4MLYA 3TB2A 1DE1A 3DVWA 3GN3A 2JL4A 2LUSA 5J4UA 2XBQA 4K0NA 2R3XA 2M46A 2YZUA 4I2UA 5GAPD 3ZIJA 1T4ZA 2KP2A 4JEDA 1R7HA 1B4PA 2GZYA 2PMTA 1XCCA 1MDKA 2QKEA 2XPDA 5ECQB 2L57A 5F07A 2FA4A 3S9FA 1HQOA 2WFCA 4L5LA 5DDLA 17GSA 3E3EA 4ML6A 3K8NA 2KOKA 5LNKe 1BQ7A 1EP7A 4GWRA 3H1NA 1Z3EA 1OC3A 1URMA 1A8LA 1TK0B 3DD3A 1JZOA 2HZEA 2I4AA 1THOA 4PUAA 3M9KA 3R2QA 4TXOB 3HVSA 3ED3A 1MD4A 3GRXA 3LORA 2ALBA 3TKQA 2GQMA 3C1RA 4F82A 1SJIA 2FUG2 3RDWA 4IQAA 4ZL9A 3HZ8A 5HR2A 1MTCA 2OBKA 5ECRB 1OE7A 4FYUA 3KCMA 5B8BA 2CAQA 3J7Yb 2YV9A 4MJAA 1M0UA 2H19A 2GSRA 2VM1A 5HR3A 2MMAA 1G7OA 2L5OA 3KXOA 3HDCA 3FZ4A 4EDYA 1A0FA 3TCOA 4ID0A 4L5OA 3SWLA 3C8EA 1WPIA 4NXIA 3CYNA 4MMMA 4PX1A 2AUVA 1PKWA 1U88A 4K7IA 5CRDA 2K9FA 4XCSA 4ZIJA 1KTEA 4OMVA 4KH7A 1BYEA 1QMVA 1SENA 3IK7A 1KNGA 2R6KA 1ZMAA 4XRAA 1V98A 1VRSD 2I1UA 3ZFLA 4ZB9A 3VWWA 2HSHA 5A4WA 4G19A 4XHMA 1A2LA 1K0AA 6GSVA 3C1SA 5IPHA 3ZZXA 1UN2A 2VLTA 3QD9A 2WS2A 4KNDA 1MDIA 4FH8A 2GDRA 2GTUA 1G7EA 2H0GA 2LJAA 4J57E 5G31A 3GSTA 1OKTA 1ZYEA 2MMZA 2AJQB 5H5RA 3GX0A 4EC0A 1JHBA 2VD0A 1KBNA 3LJRA 2LEGA 1PGTA 5G30A 2TIRA 4MCUA 1U6TA 1WRYA 2LJRA 3GH9A 4EO3A 1TP9A 4MDCA 4I6XA 3O76A 4PQIA 3C7MA 2H6ZA 2YJ7A 3MWHA 1NHOA 1ZGNA 4WKWA 3L4NA 4JU5A 1M2DA 1JFUA 1JZWA 3KMOA 4GSTA 1QQ2A 5JWRB 3CTFA 4IVFA 3D5JA 1A24A 5KN1A 4D73B 5ELAA 2CVKA 1J0FA 2X64A 2VM2A 2LJKA 2H6YA 2LS5A 3H8QA 5GSTA 1Q98A 1M9AA 2BTOT 5F05A 3KP8A 3ZIVA 2VO4A 3FEUA 5KN2A 4ZBAA 1EEJA 3L9SA 3NIVA 2H66A 4LMWA 2F51A 1RK4A 5CRGA 3UJ1A 4K2DA 5ABRA 2OE1A 1IYHA 1GNEA 1BAYA 2R4VA 3ERGA 2IFQB 2L4QA 1TU7A 3UARA 3PR8A 3ZVJA 2H1GA 2NBSA 5DAKB 2XC2A 1TRUA 2H1DA 1PMTA 1GUMA 4IP1A 2DBCA 1N2AA 4KDXA 3HY2A 5A4UA 4KW6A 2Z9SA 8GSSA 1XFLA 2YNXA 4IJIA 1XWGA 2C0EA 3WT1A 2GQKA 4KAEA 3FRCA 3A5WA 3M8NA 3VWXA 3QAWA 3FY7A 2LRCA 2O7KA 4MJEA 11GSA 3FR3A 1ERVA 3FKFA 4TXVA 2E2MA 3DYRA 1ML6A 3D4TA 3RHCA 3I69A 4TXOA 2FWHA 3L9UA 3V1WA 1MD3A 5EY6A 1B48A 3CRTA 1E2YA 4ZILA 2REMA 2FWEA 5D9VA 6GSTA 5CAXA 5E4WA 4ILFA 1SD8A 2JSZA 4MH2A 1SYRA 1UC7A 2G2QA 2ES7A 1ST9A 1UVZA 3ME8A 4K9ZA 3EE2A 4KSOA 4FIWA 2DC5A 4EF0A 4HQZA 1PD21 4L0WA 4PQHA 16GSA 4IN0A 2JZSA 2N5FA 1SL0B 4AF2A 2VD1A 1O81A 2GSSA 2NPBA 2N5AA 3UBKA 5IOWA 2DMMA 3EWLA 3HJMA 1GLQA 4YH2A 3IBHA 2KP1A 1GSYA 3KH7A 2C3TA 4RI7A 3CRUA 1HNAA 1F9MA 3J7Yk 2NTOA 1Y6EA 2FHEA 3TKSA 3UVTA 4IBPA 2FNOA 3IPZA 2C0DA 1EOGA 3MDKA 4TN8A 1PQNA 4N0VA 3IXRA 1ZL9A 1S3DA 3H93A 3W8SA 2WCIA 1WWJA 4E8EA 2PN8A 3L9VA 1K3YA 4ECJA 2C8UA 4TR3A 2HXKA 4BVYA 1TRVA 4F9ZA 4OFNA 2V32A 4HI7A 3CBUA 1GULA 2TRXA 5KEJA 1XXUA 3NOFA 2YOIA 4D73A 1TI1A 3LFLA 2DJ1A 4JE1A 4ZB6A 3TKSC 4DSSB 5ECHB 2JZTA 2IMDA 4ECIA 1XWAA 5G5FA 5DCGA 2J9HA 1XWCA 1XOBA 3FW2A 3HD5A 4X0XA 1CQGA 4HQSA 4OFTA 5B6NA 2GGTA 2H76A 3E9JB 1ZYQB 3LEFA 4OFMA 1R4WA 1V58A 1TDIA 5E59A 4YQUA 1S3CA 3GL3A 2RLIA 2B1KA 2HLSA 1GSEA 3WT2A 4RQRA 3ZITA 1GTBA 2P5QA 1SKRB 5KN3A 1Z6NA 3TRQA 1IYIA 1KEBA 4GTUA 2JSYA 4RUVA 4YQMA 4F03A 3KP9A 2DIYA 3F6FA 2CQ9A 5DAKA 1B8XA 5ID2B 3ZVJD 4HU9A 1PX6A 4MPGA 3CSIA 1BX9A 3KJYA 1Z6MA 2WULA 4RI6A 2E0QA 4ZXGA 1T1VA 5F0GA 1WE0A 3DRNA 5CO3A 12GSA 4V2NA 3EMXA 3QR6A 2H73A 1GTUA 3BCKA 18GSA 4EE0A 2RIIA 2C0GA 1FO5A 1EV4A 1VF1A 2QGVA 2VAFA 14GSA 1M2AA 1GRXA 5L71A 1QXHA 2K6VA 1PRXA 3EC3A 2H01A 1NW2A 1AQVA 1ILOA 1SJZA 3FYGA 1VGLA 2PU9C 1NSWA 2H1AA 4TVEA 3KZQA 1FW1A 3L78A 3TUEA 1TRWA 1VF2A 5D96A 2HFDA 3EMPA 2LNSA 5DQYA 1OAZA 1A2JA 6GSYA 1AXDA 1SYXA 3GKKA 1BJXA 4MH3A 3D21A 3LYKA 1YQ1A 3KTBA 2H0HA 5D9XA 3U5RE 4ECBA 5D9TA 1K0MA 1V2AA 1YDKA 2G0FA 2A2SA 2VCXA 1GUKA 3TJKA 2FA8A 2QSIA 3HA9A 3IV4A 2H0IA 4V2MA 1QFNA 3GHAA 1ACVA 1ZOFA 3FZAA 3H4KA 4HEA2 20GSA 3IC4A 2FCHA 4OCFA 3QAGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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