3WGEA

Crystal structure of erp46 trx2
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
b'GSHMGLYELSASNFELHVAQGDHFIKFFAPWCGHCKALAPTWEQLALGLEHSETVKIGKVDCTQHYELCSGNQVRGYPTLLWFRDGKKVDQYKGKRDLESLREYVESQLQR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Radically different thioredoxin domain arrangement of ERp46, an efficient disulfide bond introducer of the mammalian PDI family
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 5
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase
total genus 37
structure length 111
sequence length 111
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wgeA00
1NHOA 4WR5A 4LA1A 1VF4A 4IKHA 3U6VA 5AN1A 3D4MA 2B5YA 2CAQA 3O3TA 3RAZA 4POMA 3MDKA 5DAKA 1XW9A 3RHBA 4KDXA 1AQWA 4KUNA 5IO0A 1SD9A 1V40A 4KH7A 4MH2A 5HR2A 2YJHA 1B4PA 5H5RA 1N2AA 4KDUA 3UAPA 3EC3A 1HNBA 1ST9A 3UMAA 2I9HA 5IQYA 1PKWA 2WZ9A 3DYRA 1ERUA 1O81A 2RM5A 1U87A 2R37A 2PPTA 4ECIA 1QUWA 5J3RA 1HNAA 4BPYA 3VI7A 5D9TA 3QCPA 5E59A 4EUYA 3L9SA 4I2TA 3DWVA 2H71A 3KJYA 4HJMA 4O32A 1USBA 2DMMA 4KW6A 3GX8A 2C3TA 4YH2A 2XPEA 3F4SA 4I6XA 1JHBA 3IAS2 5F0GA 1GSDA 2YV7A 3HY2A 2FCHA 1AW9A 2DIZA 4OCEA 4PNGA 2IMFA 1X0RA 2VL3A 4HOJA 3E3EA 2FA8A 1SD8A 4EL1A 3TRXA 2YPMA 5EL8A 4ECBA 2LQQA 2GS3A 2WRTA 1OAZA 1PA3A 1A0RP 1THOA 3EYTA 2MBTA 2E0QA 2P31A 4AJ6A 3HJOA 1K0BA 4NHZA 3BCKA 2H8LA 2XHFA 4QQ7A 4MLYA 2QC7A 1V58A 1RW1A 4V1Ag 4WETA 5EY6A 2O7KA 2H73A 2R6KA 4X43A 3LEFA 2VM1A 3L0HA 5GSSA 2H74A 2M46A 4L0WA 1ZYQB 2E7PA 2F9SA 4ZXGA 3RPPA 2JADA 2O87A 1T4ZA 4HU7A 4ZBAA 2OE0A 2B3SA 1M2BA 5HFKA 2LRCA 2OADA 2GZPA 5ECRB 2IFQA 1A2JA 4J57E 1ZYEA 3D5JA 2WJUA 3DXBA 2GT5A 5IO2A 3HKRA 3VK9A 3GX0A 1G7EA 4MZWA 1YEPA 1OKDA 4KNDA 3P2AA 3F9UA 3LQ7A 3HXSA 1XVWA 3KP9A 3HZ8A 1QXHA 1Q4JA 2B7JA 1F6MC 1TKDB 3C73A 3KZQA 5CYYA 5IM9A 1GWCA 1QMVA 3GN3A 1OC9B 5EPFA 2R3XA 8GSSA 2GGTA 3EINA 5IMDA 1EOGA 2DIYA 3FYGA 2VLUA 1Z5YE 4RQRA 2LJAA 1SK2A 3VWWA 3F6DA 5G2ZA 3GH9A 1R26A 3TKPA 1ZCPA 1GSYA 2GQLA 2LSTA 3FZAA 1U88A 3TJKA 2FWGA 5DJLA 1ERVA 4XS4A 5JCUA 3QOUA 1J9BA 5IMCA 2CV4A 3FR9A 4D73A 4PUAA 4G9HA 1CQGA 3C1RA 3ERGA 4DSRA 4MJEA 2NBSA 1HQOA 3H4KA 3IR4A 5KN3A 1NM3A 1AQXA 1SJZA 4FO5A 2IL3A 3BCIA 2V6KA 3D4TA 1YEXA 3VFIA 3G7JA 1LBKA 2MYGA 2CT6A 1WMJA 4KSMA 3QMXA 2N5AA 2FA4A 3TGZA 5B8AA 3K8NA 1TOFA 5CNWA 2XC2A 2AV4A 2CAIA 1XIYA 1WPIA 1YZXA 5ECQB 5CRDA 1EOHA 2DJ3A 2H01A 4OO4A 4KA0A 1JZWA 3M0FA 1S3CA 3QPMA 1TRSA 3QD9A 2H1BA 3C7MA 1DE2A 4EVMA 1XWAA 5ECNB 2YOIA 5J9BA 5DCGA 5DALB 1R5AA 1GSSA 1TI1A 5C00A 3F4TA 3NOFA 1HYUA 2B5EA 3H93A 1X5EA 5A4WA 4ZB6A 2LNTA 5IMVA 2VCVA 5IMFA 4KSOA 4MK3A 4TR3A 1X5DA 4PUFC 3FHKA 2ALBA 1V2AA 3DRNA 1EP8A 1XCCA 4H86A 2DJ1A 5ELAA 3EU3A 1JFUA 1J08A 4GXZA 6GSTA 1VGLA 3HJMA 4OFTA 4NWYA 2VM2A 2QKEA 2JACA 4YQMA 3ZMKA 1GUKA 2FD3A 4IS0A 4ZL8A 4F03A 1Z3EA 3ZREA 4TR4A 2D2ZA 1NSWA 5G5EA 4ZBBA 3US3A 1ZZYA 1B4QA 4K7IA 2EC4A 1Z7RA 4ZB8A 19GSA 2O8VB 2CX4A 4KGIA 4CHSA 3CSHA 4TW5A 4IW9A 1XWKA 4NHWA 3KMNA 4F0CA 3APOA 1SKSB 5ECOB 2L59A 3IK7A 2TIRA 5A4VA 2JSYA 2WGRA 4KCAA 4RI6A 1Z6NA 2LTKA 2H1GA 2PN8A 2C8UA 3UOMA 4WXTA 4EC0A 1TP9A 5B6NA 3ZTLA 3GSTA 1M2DA 5ID2A 1MDJA 2BJXA 2YWNA 1K0CA 1CQHA 5C04A 3HCZA 3MWHA 3KH7A 4Z7XA 1LU4A 3E9JB 1PGTA 2YANA 1XWBA 3AY8A 2RUFA 2EIQA 4I8BA 5G1LA 3UL3A 4HEA2 2AUVA 2PGTA 3GL3A 2P0GA 1GL8A 2I1UA 4IQAA 4QL9A 1RQMA 3CTGA 2MMZA 1K3OA 1GRXA 1TRVA 3HYPA 3BD2A 3KD0A 1V9WA 4JRRA 4XRDA 1I5GA 1F3AA 4WF5A 3WT1A 1TRWA 4FYUA 5EVOA 3LYKA 1XWGA 2YJ7A 1JLWA 1BJXA 4ML1A 1BX9A 2H30A 1TK8B 1ZMAA 2H66A 2H19A 1TJDA 2I81A 3OR5A 3LFLA 2HLSA 2WCIA 4ZBDA 4BWQA 2CVKA 3KIJA 4MZBA 5AIXA 1GLQA 2LRTA 5CRWA 1R5PA 3KCMA 3QR6A 4HS1A 2V32A 1TW9A 5D73A 3TKSE 4O7HA 2JZTA 3CSIA 5B7CA 1WRYA 2GDRA 1V98A 3IAM2 3A3TA 5ECMB 4Q5RA 2YZUA 4TXOA 1AIUA 3FEUA 4DVCA 5FHIA 1WWJA 2YNXA 4IELA 1TRUA 2M72A 3D6IA 2GQKA 2IN3A 3CTFA 2PVOC 3Q74A 1WJKA 3KM6A 2X64A 4GRFA 4JE1A 1T4YA 1ZOFA 3KXOA 1SJIA 3IK9A 1TDIA 4KX4A 3F0IA 4POBA 3WGXA 4ZL9A 4JEDA 3HVSA 4MP4A 1IYIA 1K0AA 1YF0A 2Z9SA 3IV4A 1DUGA 4POLA 2E2GA 3ZVJD 3CYNA 3DGQA 3LXTA 4EKZA 4EO3A 2FWFA 4WBRD 1T00A 3C1SA 4LMWA 1ABAA 4V1Ap 2AYTA 4L8EA 4N30A 3F63A 4F0BA 3FRCA 1EP7A 5IOXA 4LLRA 2AB6A 5IIZA 2HZEA 3UBLA 1A0FA 1VF3A 3CXGA 2H72A 4BVYA 2PERA 2KP1A 2F3MA 5DBQA 1WP0A 3DD3A 5HQPA 2F51A 1OC3A 4GCIA 1XW6A 2KUCA 3HVVA 5CO3A 3GH6A 2VCZA 1TI3A 5DQYA 3PH9A 3VPTA 1PD21 1K0OA 4AGSA 2LKUA 2RM6A 1SU9A 2ON7A 2KHPA 4ID0A 1A8LA 1DE1A 2REMA 4MF6A 4K0NA 2HRFA 2EIRA 5DDLA 5HFGA 5LNKe 3GURA 4K1FA 1PQNA 2L4CA 1PMTA 3IXRA 3A2XA 1QQ2A 1GUMA 4WR4A 1PL2A 1WE0A 4PQ1A 3GMFA 4K8MA 3ZFLA 4PQIA 1HNCA 3ZZXA 1NHYA 2H0HA 4TXVA 2L6CA 3CRTA 3LORA 4PX1A 3HHVA 3F3RA 2FWHA 2HSYA 4E8EA 2HYXA 3UARA 1U3IA 2P5RA 3DEXA 3VWVA 3ZMLA 5DQSA 2ON5A 1K3LA 3UEMA 3GFKA 1EEMA 2L4QA 1RK4A 1IYHA 1B9XC 2V1MA 1T7PB 2JZRA 3IDVA 1AXDA 1MEKA 3WGEA 3LJRA 3GKXA 3CSJA 3DMLA 1EEJA 3WT2A 4FYBA 1G6WA 3IE3A 2VL2C 2AJQB 4BA7A 1R4WA 3GRXA 1Z7PA 9GSSA 1X9SB 4K7OA 1SL1B 1ILOA 4PQHA 4MJBA 3ZYWA 1TK5B 1M0UA 3MAKA 2AAWA 2CA8A 4V2NA 1OKTA 4HU9A 3VPQA 2VOCA 2IPAA 2DMLA 5HR0A 4HUAA 1V57A 3IRAA 1C72A 4MJCA 5CREA 2PUKC 4MCUA 4ZL7A 5A4UA 4JU5A 3E0UA 2JU5A 3R2QA 1EV9A 2C1YA 2MMOA 4LL4B 1VRSD 4IN0A 1Y25A 2MMNA 5LCZA 2IIYA 4FYCA 2XBQA 1UA5A 3BOAA 2HI7A 1MD4A 2ZNMA 5D9VA 3QFBC 3WGDA 1U3AA 2YWMA 2B1KA 1O6JA 1H4OA 1JLVA 4XRAA 3APQA 1Z9HA 2L5OA 2VLTA 3ZIVA 1SL0B 4JR6A 5ECPB 3H1NA 4ZILA 3W6GA 2NPBA 2X8CA 4NPBA 4MZCA 4ECJA 5HFIA 2CVDA 3HA9A 1JZRA 3L9UA 3G7YA 1FG4A 4K2DA 2GZZA 3M1GA 1GUHA 3F4RA 20GSA 3QDNA 3GKNA 1B48A 1T1VA 18GSA 4IVFA 3UBKA 5F06A 1XZOA 4HZ2A 2NTOA 5JCWA 4AJ8A 2KP2A 3GUSA 1T3BA 5LD0A 3C71A 2FWEA 2QSIA 2VIMA 2B7KA 4BVXA 1GSQA 2C0FA 2OBIA 2FHEA 3F8UA 4NAXA 2EIOA 4DSSB 4OO5A 2K8VA 2DBCA 2WB9A 3I9V2 3FZ9A 1PKZA 4AF2A 5J41A 1JZDA 3BJ5A 2OJLA 3L78A 2N5FA 2HE3A 4K0GA 2RIIA 4HQSA 1OE7A 1M9AA 3D0ZA 4IQ1A 2VUPA 5J9CA 2O85A 4MJAA 3DKSA 1YJ6A 3IBHA 3TJFA 2CX3A 4GTUA 2VL2A 2XPDA 4L5OA 5CRHA 5G5FA 2ZCTA 1ERWA 4IP6A 6GSWA 1BAYA 5ABRA 7GSSA 1SYRA 2X8HA 1KEBA 3GKKA 2CZ2A 3CMIA 4POKA 1BQ7A 1EV4A 5JCGA 2IMKA 5F8BA 1GULA 5F05A 3UJ1A 4YAPA 1PL1A 4TR1B 1T8EB 3IPZA 3EVIA 3HD5A 2I3YA 6GSYA 1FVJA 4TXOB 1FVKA 3GKMA 1OC8A 2LRNA 4J56E 2R4VA 3GA4A 3VWXA 3U5RE 5E4WA 1YQ1A 2YWIA 4N0ZA 3EU4A 4XHMA 4OMVA 3I6AA 1A23A 1PSQA 4IHUA 1GSFA 2GTUA 2FLSA 3Q19A 4JR4A 1GNWA 3ISOA 4L0UA 3VI5A 5DAKB 3LXZA 5FWGA 4K6XA 2X99A 4YAVA 2MBSA 1BG5A 2H6ZA 2JZSA 3GSSA 4ISDA 1B9YC 3TKSC 2IMIA 2FGXA 4BL7A 4IJIA 4WBJA 1MDIA 5G31A 4EF0A 1PRXA 1F2EA 4FIWA 1X5CA 4QL7A 4HJ2A 4AJ7A 2HZEB 4MMMA 4GLTA 1E6BA 2JSZA 1XXUA 2H1AA 5CP1A 3M3MA 3BBYA 4RQXA 3MSZA 14GSA 2OKAA 1X9WB 3FK8A 3HDCA 2O89A 1QFNA 1GNEA 1J0FA 4N11A 3FKFA 2A2SA 3GTUA 1HD2A 2NVLA 1A24A 1M99A 5ECHB 4ACSA 5ECLB 2L57A 3IC4A 4KE3A 5KN2A 1AAZA 2BMXA 2NDOA 1G7OA 2M80A 1SK1A 3KP8A 1FHEA 4MF7A 4O5RA 2GSQA 5DALA 3DVXA 3KMOA 4XTSA 5AISA 5JWQB 3VWUA 1GTUA 3EURA 2LEGA 2HSHA 3NZNA 5GZZB 1EGOA 1ZGNA 3EWLA 1MTCA 3MNGA 3G9BA 2VL9A 1M2AA 4G2EA 1GTAA 4HQZA 2F8FA 3KGKA 3IA1A 4PXOA 5J4UA 1XOAA 1GTIA 4ILFA 4LL1B 5HR1A 4EDZA 1SK0A 3DVWA 4GQFA 4EDYA 3NIVA 3UVHA 2VCWA 5FT3A 3L9VA 2GSRA 3QAGA 5ECKB 5DCHA 4E8HA 5ENUA 3GHAA 2YV9A 5H5QA 2LJKA 4IBPA 2IFQB 2LUSA 3C8EA 1URMA 3HZ4A 3I69A 3TRQA 2H6XA 2G2QA 5DVBA 3RDWA 1I9DA 2C3QA 2B1LA 4Q5FA 5D9WA 5G30A 4ECCA 4GF0A 1EWXA 1Q98A 4GSNA 5ECIB 3TKSA 4F82A 3M9KA 4HZ4A 2B6MA 6GSXA 1PN9A 2G0FA 2DJ2A 3TOTA 2WS2A 1OVNA 3FZ4A 3LYPA 4ZB9A 3IOSA 5KEJA 1SJ6A 4MH3A 1JZOA 2OE1A 4TN8A 3H8QA 4O92A 4DEJA 4V2MA 1UN2A 4NV5A 2KOKA 4XS4B 1M7TA 3HVXA 1UC7A 2N5BA 3ZL5A 4D73B 3ED3A 4EXJA 3W8SA 2CQ9A 3P90A 5GAND 3TJGA 3TDGA 1EGRA 2RUEA 1G6YA 5CRGA 2B5XA 5GAPD 3EE2A 3APSA 3RHCA 4YQVA 4XS6A 5INYA 2HNLA 1G0TA 1ACVA 1TK0B 5ECSA 1K3YA 2C0DA 2HXKA 4TRXA 1M9BA 3J7Yk 3WYWA 3L4NA 1FO5A 3FY7A 2VD1A 5G1KA 1K0DA 4WF4A 1OYJA 3ERWA 4BWSA 2YWOA 2GQMA 2GSTA 4Q5QA 2MMAA 3UIWA 3FW2A 2PU9C 2GSSA 1GSUA 1O8WA 3ZITA 4G10A 1GP1A 4TKYA 3DIEA 3GL5A 4NXIA 1GLPA 1A8YA 3JCML 2CZ3A 2YN1A 3FR6A 4CW9A 4PGTA 1AUCA 1XW5A 4OCFA 1W89A 2HFDA 1ERTA 4EE0A 1SKRB 3TUEA 4OWYA 4IP1A 2P5QA 2IWTA 2WDUA 1DSBA 1XWCA 22GSA 3EMXA 2QGVA 3A2VA 3GV1A 3GYKA 1B8XA 1K0NA 2L5LA 5KN1A 10GSA 1YKCA 2H76A 2PBJA 3S9FA 3TKQA 3ZVJA 2LQOA 2H6YA 2VCXA 1QGVA 5AIVA 2DJKA 4J2FA 2VAFA 3RBTA 2PMTA 3LSZA 1NW2A 3GNJA 2C3NA 3O76A 3VLNA 2DJ0A 4MABA 1F9MA 4OFMA 4K7NA 2A2RA 1X9MB 5IPGA 3A5WA 4XCSA 1UVZA 1BEDA 1XVQA 3ME8A 3PR8A 2I4AA 2V2GA 3GIXA 2WULA 1U6TA 2VCQA 3ZFBA 3UVTA 4WKWA 1XFLA 3KTBA 2DLXA 5F07A 1BYEA 3H79A 5IOWA 4MF5A 5J5NA 4I97A 2LV3A 1SL2B 4IJ3A 3TCOA 5KN0A 5ID2B 3RPNA 3KEBA 1FOVA 11GSA 2VD0A 3J7Yb 2WFCA 4RUVA 3SWLA 2H1DA 2TRXA 2VO4A 3F3QA 4JZQA 4KB3A 3M8NA 1S3DA 4ML6A 1FAAA 2ZUPA 5JWOB 2H75A 1DBYA 2GVPA 4OD7A 4N10A 2R5GA 2H0GA 5B8BA 1E2YA 17GSA 3PINA 2OA7A 4PURA 1PX6A 1TU7A 4KDYA 2F8AA 2HZFA 2K8SA 4TVEA 1PX7A 2K6VA 2E2MA 1FW1A 2GZYA 2YP6A 1W4VA 3TRPA 12GSA 3VURA 1SKWB 1TU8A 3GTUB 1R7HA 2HRNA 6GSUA 5H5SA 3Q6OA 6GSVA 2FNOA 4L5LA 3TOUA 1K0MA 3WD6A 2TRCP 3TJBA 4LMVA 4NMUA 5D93A 1O8XA 1O85A 4F9ZA 1ZL9A 2MZCA 1FB6A 3O6TA 3P7XA 2LJRA 2R2JA 3FZ5A 4G19A 2DSAA 2H70A 1H75A 5ELGA 3ZLPA 1MD3A 4OFNA 2DJJA 2DC5A 1THXA 1OE8A 2PVQA 4GWRA 4X0XA 3M9JA 1TXXA 3KH9A 5IPHA 4HI7A 2OACA 4GQCA 3D22A 4GSSA 1FB0A 3QFAC 2YZHA 1ML6A 1YKAA 1O73A 2IMEA 1A2MA 4XS1A 2RLIA 1WOUA 2IMDA 1OC9A 4P3YB 5D9XA 3ERFA 2L6DA 2GLRA 3IHQA 4V2LA 1GH2A 2ES7A 2PWJA 2IJYA 3TKRA 3W8JA 1F3BA 2C80A 5DJMA 4CDOA 1VF2A 3ME7A 4YQUA 1KBNA 2KLXA 3CRUA 1GSEA 2V41A 1LJRA 2XBIA 3PGTA 1Y6EA 5IMZA 4TOPA 16GSA 3F6FA 3Q18A 4RI7A 1S3AA 2H0IA 3CBUA 5L71A 3TB2A 4NV2A 5GSTA 2AHEA 3QAVA 3G7IA 3QAWA 4MPFA 5B6MA 1EZKA 3KTLA 1XOBA 3SBCA 2J23A 4FH8A 3LG6A 2OE3A 4JBBA 2JL4A 2OBKA 1N8JA 3P8WA 5JWRB 1YY7A 4K9ZA 1QK8A 5IMAA 2K18A 1KNGA 1SYXA 5D8IA 13GSA 2GT6A 2J9HA 1GTBA 1SENA 2VLVA 4MA9A 3N9JA 1XBSA 1O7UA 1YF1A 2C4JA 1AQVA 4DSSA 4DSQA 5A5KA 2LNSA 3LWAA 1AC1A 5COHA 1A2LA 1VF1A 2HT9A 5HR3A 6GSSA 3D21A 3LGCA 2YCDA 4N0VA 3I43A 5D96A 3TJJA 3HJPA 1MDKA 2C0GA 4F2IA 1WIKA 4KAEA 4XIHA 2K9FA 4PNFA 1YDKA 4Q5NA 4MDCA 5CAXA 4I2UA 2FUG2 3A2WA 4WEYA 3FR3A 1KTEA 2X8GA 3V1WA 3N5OA 1Z6MA 1F37A 4ZIJA 4KCEA 5AGYA 3ZRDA 2A4VA 4TR1A 2VCTA 4HDEA 1ON4A 4MPGA 4GSTA 1XPVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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