3WGXA

Crystal structure of erp46 trx2 in a complex with prx4 c-term
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
SHMGLYELSASNFELHVAQGDHFIKFFAPWCGHAKALAPTWEQLALGLEHSETVKIGKVDCTQHYELCSGNQVRGYPTLLWFRDGKKVDQYKGKRDLESLREYVESQLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Radically different thioredoxin domain arrangement of ERp46, an efficient disulfide bond introducer of the mammalian PDI family
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 5
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
total genus 30
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wgxA00
2X8GA 1V40A 3D5JA 5G31A 3HY2A 2LUSA 1SL0B 2PGTA 2K6VA 5EVOA 1PMTA 2LRTA 2CT6A 1OAZA 4Q5FA 5IO2A 5H5QA 2H0HA 2MBTA 4N10A 4AJ7A 1EEJA 2TRCP 5GSSA 5FT3A 3N5OA 3HZ4A 3AY8A 5IIZA 2LJKA 5G5EA 1AAZA 5F05A 2K18A 1OKDA 4NMUA 5C00A 2PBJA 5ECIB 3G9BA 4K0GA 1AW9A 1T4ZA 4KNDA 3W8SA 1THXA 3I43A 5B6NA 4KA0A 2YZUA 3IRAA 2RLIA 3UBLA 4WBRD 3US3A 4GSNA 1JZOA 3KZQA 4OD7A 3WD6A 1MEKA 3CRUA 4KDYA 3LXZA 2VCZA 2OBIA 1JZWA 4IGJA 1NHOA 2IMDA 3CSHA 5HR3A 3DD3A 4ML6A 3GSTA 1X5DA 2LNSA 1I9DA 1UN2A 2HI7A 3GSSA 2A2SA 1EZKA 4MABA 3ZYWA 4MF7A 4O92A 2DJ1A 3KTBA 4I6XA 4TRXA 1RK4A 2KOKA 1M2AA 3EYTA 2H73A 3M0FA 4ZBBA 2I1UA 4L5OA 1GRXA 1DSBA 2H71A 3IK7A 3BCIA 2C3NA 5D9TA 1PKZA 1QK8A 3IC4A 4K9ZA 2R3XA 5JCGA 3P90A 6GSWA 1K0BA 2B7KA 4IP1A 1SJZA 5A4VA 2ZNMA 1XWGA 1B9XC 4ZB9A 2J9HA 4KUNA 1GLPA 3TOUA 2KP1A 2M80A 2H1GA 1AQVA 2OBKA 1FW1A 3O76A 2VIMA 4D73B 3K8NA 3GFKA 4BWSA 2Z9SA 1THOA 5IOXA 4IW9A 3VLNA 2NBSA 1KEBA 1WPIA 1X0RA 1HD2A 2IPAA 1NM3A 1PD21 5GAND 4KDUA 3HYPA 5J9BA 4ID0A 2LRNA 3CYNA 1E2YA 4LL1B 2GSRA 2N5FA 4I2UA 1TK8B 1BJXA 1TRWA 1T4YA 5CRHA 16GSA 3UL3A 4ULXA 1O8WA 3VWUA 4MA9A 3GRXA 5COHA 4ZB6A 1T1VA 1U87A 1PA3A 3LYKA 3RBTA 4D73A 5ECMB 1XWBA 1DUGA 5HFIA 2AAWA 5HQPA 3H79A 3KH9A 4MJEA 1FG4A 5C04A 2OKAA 5J4UA 2EIRA 2H01A 2VL3A 4WKWA 1EEMA 1GUKA 3ZVJA 1Z7PA 4NXIA 2YWMA 1VF4A 4XRDA 3UBKA 4POLA 1HNBA 3TRPA 2QSIA 1XW6A 2DC5A 3PINA 5J5NA 3HJMA 4QL7A 3L9SA 4MJCA 3V1WA 1KNGA 1YDKA 1F37A 1USBA 5L71A 1A2MA 3TKSE 2DBCA 1TDIA 2JACA 3MNGA 4G19A 4HUAA 1QQ2A 2FA8A 2WFCA 2B6MA 4HOJA 3IAM2 4OFTA 3J7Yb 5CYYA 4BA7A 1BAYA 5ECQB 1HNAA 2O87A 4J56E 1XPVA 2H1DA 2VAFA 3GV1A 5GAPD 2H75A 2HYXA 10GSA 11GSA 1QUWA 1HYUA 1MDIA 2ON7A 4GLTA 4QL9A 4HQSA 3VPQA 4TR1B 5HR0A 5HFGA 4YQMA 4KE3A 3E0UA 3QFAC 3A5WA 4MJBA 1PN9A 3VWWA 1DE1A 1MTCA 4J2FA 1OYJA 2FA4A 3ME7A 1LJRA 3EMXA 4L0WA 5ID2A 1MD3A 4XS4B 4KSMA 3RHBA 1FOVA 4N11A 5G5FA 1Z6NA 5ECHB 4K1FA 5GZZB 2HRNA 2E7PA 4EO3A 1G6YA 4RI6A 5ECRB 4ZB8A 2V6KA 4EKZA 3A2VA 2HRFA 3EWLA 5KN1A 2NTOA 3CMIA 3KGKA 4Q5RA 2DJ2A 3M9JA 3TKQA 3HZ8A 4X0XA 4NV2A 4XS4A 3VURA 4MLYA 2AUVA 1TJDA 4PQ1A 2MBSA 3MAKA 1OVNA 4FYCA 5DDLA 2XBIA 1O85A 5EL8A 3WGEA 3GYKA 6GSTA 4IELA 3UIWA 4WR4A 2L6DA 2V2GA 3LWAA 1F3AA 3QFBC 3VPTA 1S3CA 4XTSA 2VCTA 1LU4A 5CAXA 5G1LA 3G7IA 3NZNA 2H0IA 2H70A 2OE1A 2CV4A 2GGTA 2H6XA 5D8IA 4WF4A 1FB0A 2VO4A 5B8BA 4Q5QA 4JR4A 2R37A 3GL3A 1SD8A 3IBHA 3L0HA 2IMEA 4BWQA 4TKYA 3EINA 1W4VA 4YH2A 3TB2A 3TRXA 3FW2A 5DAKB 5F0GA 4WF5A 4LA1A 3HJPA 5H5RA 2V6OA 5AIVA 1K0DA 4HQZA 3TKPA 2FWFA 1F6MC 2VCVA 3QMXA 4HS1A 5CO3A 1TK0B 2L59A 3NOFA 4HJ2A 3G7YA 3GKNA 1OC3A 4YAVA 2MYGA 2R2JA 3DMLA 3UEMA 1AC1A 3DWVA 1ERUA 1OC8A 5CNWA 1VF2A 1BX9A 4IKHA 1OC9B 1WOUA 5ECLB 2C0DA 4GSTA 3QR6A 3TKRA 4PNGA 4F0CA 4XHMA 5KN3A 4IQAA 5DJLA 5J41A 1F3BA 1JHBA 4MZBA 1GSYA 2VCXA 2N5BA 2VD1A 1B4PA 1XXUA 2H1BA 2R4VA 3L9VA 1MD4A 1TKDB 22GSA 2GDRA 4XS6A 1YF0A 3G7JA 1TRVA 2B7JA 3FRCA 3DGQA 5EY6A 1BG5A 4I5QA 2B3SA 1VF1A 2KLXA 4HJMA 3LORA 1SK0A 1UA5A 3A3TA 4OCFA 4GCIA 3MWHA 1NHYA 2IL3A 1Y25A 3ED3A 2OE0A 3GX8A 5ECKB 2AYTA 1T00A 3QAWA 2F51A 3EMPA 1G6WA 1XFLA 2P0GA 1I5GA 2XC2A 1EP8A 1M9BA 2HZFA 2FLSA 1GH2A 2GSQA 3P7XA 1PL2A 2WZ9A 1G7OA 3D4TA 4BVYA 4RQRA 3LG6A 4E8EA 9GSSA 2H8LA 3F6FA 3UVHA 3C71A 2X8CA 4FO5A 4V2MA 1R4WA 4ZL7A 2HSYA 4G10A 2C80A 3MSZA 3R2QA 3GKMA 3BCKA 1A8YA 3Q74A 2WDUA 4V1Ap 2AB6A 1PQNA 2B5EA 2J23A 2I4AA 1SYRA 5AGYA 2CZ3A 3KM6A 2C3QA 1ZMAA 5CP1A 1LBKA 5G30A 5B6MA 2O85A 4TR3A 4EL1A 4HEA2 4YQUA 1FAAA 2LSTA 2OADA 2YWIA 3ZIVA 4NHZA 4DEJA 2HNLA 1DE2A 4JU5A 3F3RA 2FNOA 4OMVA 2FWGA 2GTUA 3IXRA 1A24A 4K2DA 4IJIA 3KMNA 4LL4B 3HDCA 4HDEA 2O8VB 3ZREA 5IMAA 2LQOA 3HHVA 1O7UA 2DJJA 1H4OA 1C72A 1GNWA 5DALB 1R5AA 2JSZA 1YKAA 4K8MA 2H66A 2GQKA 3Q18A 4POBA 3ME8A 5D9WA 2HE3A 2RUFA 3KD0A 2PVOC 3QCPA 3FZ9A 3ZMKA 2GT6A 1NSWA 2P5RA 3C8EA 5E59A 4OFMA 4EE0A 5D93A 3TJGA 2QGVA 3CSJA 3W8JA 1IYHA 3ERWA 1UC7A 1URMA 1ACVA 3GURA 3IPZA 1WJKA 2R5GA 1E6BA 3HA9A 4V2LA 4Z7XA 2B1LA 5DALA 5A4WA 5IMFA 1EWXA 4K6XA 3L4NA 4OCEA 2ON5A 2VL9A 2PMTA 1YEPA 1H75A 3UJ1A 3UVTA 2VL2A 2DIZA 2H6ZA 3DVWA 4X43A 1JLVA 1K0MA 1U6TA 2C3TA 2ZUPA 1EV4A 1UVZA 4NAXA 1FVJA 5AN1A 3KP8A 1X9WB 4KGIA 2R6KA 3MDKA 1OE7A 4PUAA 2O89A 3ISOA 2CVKA 1ML6A 2YP6A 4FYUA 1AUCA 4G2EA 1XVWA 1QXHA 4GRFA 2V41A 1KBNA 2G2QA 3QAGA 2DJKA 4HZ4A 1FVKA 12GSA 2YPMA 4F82A 3RPPA 4ZBAA 5D9XA 4MJAA 1GNEA 2FY6A 4KCAA 2YOIA 3RPNA 4AJ6A 4BPYA 2V32A 3ZTLA 4ZILA 5EPFA 1V58A 1GTAA 5HR2A 3H8QA 4KDXA 5ECSA 2XPDA 2LEGA 4MPFA 1SENA 3ZZXA 2B5YA 1YY7A 4NHWA 3KXOA 2FD3A 1ST9A 2PWJA 3A2WA 2RIIA 1GSUA 1U88A 4G9HA 4GTUA 4Q5NA 2HZEB 1GWCA 1A8LA 2VLVA 1SK2A 5D96A 3TKSA 5ID2B 1SKSB 3U5RE 4K0NA 1R5PA 3FR3A 3FY7A 3FEUA 1PX6A 2D2ZA 3O6TA 3TJBA 4GWRA 3EVIA 4IP6A 2LJAA 2CAIA 1MDKA 1XW5A 2YJ7A 1ON4A 3D22A 1TW9A 3APSA 3A2XA 1TRUA 3TCOA 2YN1A 2HZEA 4DSSB 1SK1A 5CRDA 1GSSA 4YAPA 2WCIA 3ERFA 3WGXA 3KCMA 4DSQA 3F8UA 1Q4JA 3O3TA 2GSTA 4NWYA 4BL7A 1U3IA 3TJFA 3N9JA 4MF5A 2CAQA 4IHUA 1FB6A 3D4MA 3IAS2 4L0UA 4AGSA 1DBYA 1GSQA 1A0FA 3UAPA 1MDJA 3PR8A 3NIVA 4XS1A 3M9KA 1GUHA 2O7KA 4OO5A 1ABAA 3JCML 4PQHA 2I81A 4PURA 3IE3A 3C73A 4DSSA 2GSSA 3TUEA 2F8FA 2LQQA 4I2TA 1K0NA 3CXGA 1ZYQB 1M2BA 1K0AA 2PPTA 4IQ1A 2C8UA 3DVXA 3IR4A 2DIYA 3BOAA 5DQSA 3IOSA 2LTKA 4RUVA 1YKCA 1F9MA 3F3QA 3EE2A 4KB3A 2AHEA 4I8BA 3IK9A 4E8HA 4JRRA 1GLQA 4MZCA 3LSZA 3S9FA 3WT2A 5HR1A 2DJ0A 1Z3EA 1JZDA 1Z7RA 4HZ2A 3GHAA 4F2IA 2FGXA 1GUMA 2IN3A 3C7MA 2OJLA 3L9UA 1TRSA 4FH8A 4MH2A 6GSUA 2PUKC 5IMDA 5D9VA 2MMNA 4NPBA 3FZ5A 3LYPA 4ZL8A 5IMZA 4IN0A 1EOGA 3DXBA 2CVBA 3QD9A 2E2GA 1ZL9A 4HI7A 2RM5A 2FUG2 5A4UA 1PGTA 5F8BA 5F07A 2TRXA 1O81A 2L5OA 4FIWA 2YZHA 3DIEA 1WIKA 5G2ZA 4EF0A 2H74A 3E9JB 2IJYA 4ECJA 3J7Yk 2P31A 4MCUA 3ZLPA 3TGZA 3TJJA 4P3YB 4HU9A 3F6DA 4AJ8A 4LMVA 2C0EA 3ERGA 5ELAA 3CRTA 1M99A 4O5RA 3KEBA 3GKXA 2YNXA 2V1MA 3TKSC 3HD5A 5AIXA 1S3DA 2LV3A 3KIJA 5J3RA 2HSHA 4IBPA 2YJHA 3TJKA 2GZPA 2PN8A 3IA1A 5LNKe 1SKRB 3C1SA 3D6IA 2CX4A 2JZRA 4O7HA 1GP1A 4O32A 1GTBA 4ML1A 2P5QA 3HVXA 5H5SA 4EXJA 1QFNA 2LJRA 4WXTA 3HKRA 2A4VA 2EC4A 4ISDA 3HJOA 1X5EA 4V2NA 4PUFC 4F0BA 3Q6OA 1Z6MA 5IM9A 19GSA 2E0QA 6GSSA 4EUYA 3GTUA 1EGRA 3ZFLA 2VLTA 1OE8A 1R26A 5AISA 3DEXA 2GZYA 1EOHA 4POMA 5ELGA 2VM2A 2KP2A 5DJMA 4PGTA 4IVFA 1TI1A 1K0OA 4F9ZA 3GIXA 4LLRA 3VWXA 4ECBA 1TOFA 4HU7A 4MMMA 3VK9A 3APQA 4PNFA 4ECIA 1T3BA 1O73A 3GMFA 3BJ5A 4CW9A 4N0VA 4CDOA 1A2JA 2DMLA 3QPMA 3LGCA 6GSYA 2FCHA 2IIYA 4XCSA 2WS2A 3F4SA 3VWVA 1GL8A 1SL1B 5ABRA 2X99A 1AQXA 1XWKA 5IO0A 1YF1A 1K3LA 2L6CA 4N0ZA 4ZL9A 2B1KA 3GL5A 2BMXA 3ZITA 4K7NA 4TR0A 1YJ6A 2H6YA 3M8NA 3VI7A 2VLUA 1XCCA 2GLRA 5CRGA 3LQ7A 1XOBA 7GSSA 4EDZA 3KMOA 4QQ7A 6GSXA 2GZZA 4KCEA 2M46A 1M2DA 1Y6EA 4MDCA 1ZOFA 1RW1A 1NW2A 4EC0A 1J9BA 3F63A 1W89A 2N5AA 1ZYEA 2KUCA 4GQCA 1JLWA 2L5LA 1K3YA 3CSIA 5GSTA 2FWEA 2QKEA 1X5CA 2K8VA 5LD0A 2L4CA 3PH9A 2X64A 3FK8A 4MH3A 4WEYA 3QDNA 2WULA 1TU7A 1BYEA 1AIUA 3P8WA 4DSRA 2MMOA 1ZCPA 3ZRDA 2L57A 2B5XA 2JZTA 3IV4A 3H1NA 2L4QA 1G7EA 2K8SA 1WWJA 13GSA 1GULA 3GX0A 4TXOB 2VOCA 4V1Ag 4OO4A 5JCUA 1PL1A 2WJUA 1OKTA 5JCWA 5DCGA 4ZIJA 3EC3A 5INYA 2WB9A 3ZIJA 2GS3A 3DYRA 2HT9A 3W6GA 2CVDA 1SJ6A 4BVXA 1TTZA 3PGTA 1U3AA 3UARA 2GVPA 1ZZYA 3CBUA 3KJYA 3L78A 2FWHA 2NPBA 2H1AA 3TRQA 5IPHA 2NVLA 5CREA 4NV5A 1QGVA 4WR5A 1ILOA 4KAEA 4TXOA 3OR5A 1M7TA 2LNTA 2I9HA 1SYXA 3KH7A 3CTGA 2H19A 2A2RA 3FHKA 4MZWA 3EURA 2IFQB 3ZFBA 5D73A 2G0FA 2LS5A 4KH7A 3U6VA 3WGDA 4RQXA 5ENUA 4IJ3A 4JZQA 2E2MA 2H30A 5J9CA 4TXVA 1PKWA 1J08A 1V57A 3GA4A 3FR9A 2ES7A 4KX4A 3HVSA 4J57E 5IOWA 1PX7A 1SKWB 3VI5A 2OACA 2OE3A 2XHFA 4GQFA 1PSQA 3QAVA 3I9V2 2C0FA 2IFQA 1X9MB 3CTFA 2AV4A 3FR6A 5JWOB 5KN0A 1ERWA 4GSSA 3SBCA 5KN2A 1HQOA 3GUSA 3C1RA 4TN8A 2VCQA 1WRYA 3Q19A 1IYIA 5IMCA 3BD2A 1XBSA 2F9SA 1JFUA 3GNJA 2F8AA 3F4RA 2YV7A 1GTUA 2JSYA 2M72A 3D0ZA 2AJQB 2MMZA 2RM6A 4OFNA 2IMFA 1A23A 4KW6A 2PU9C 1B48A 2LKUA 1GSDA 5CRWA 1CQHA 2CQ9A 4JBBA 5IMVA 2YANA 2MMAA 4PXOA 2DMMA 1BQ7A 1G0TA 4GF0A 4X1UA 1B4QA 2HLSA 5ECPB 3P2AA 1WE0A 2IMKA 1V98A 4WBJA 2LRCA 4CHSA 1Q98A 4RI7A 2HFDA 3EU3A 2F3MA 1GSFA 2PERA 3GKKA 1HNCA 4K7IA 3FZ4A 5DBQA 5JWQB 3ZL5A 3KTLA 2C4JA 2CX3A 3DRNA 1WP0A 1B8XA 3WT1A 2REMA 1XWCA 3KP9A 1SD9A 2CZ2A 3I6AA 1V2AA 5A5KA 2YWOA 1FHEA 4OWYA 4PX1A 4ECCA 1ZGNA 2HXKA 17GSA 2IWTA 4K7OA 2GT5A 2YCDA 3D21A 5LCZA 2GQMA 1T8EB 3WYWA 3FZAA 4KSOA 3RHCA 5KEJA 1ERVA 1XIYA 4I97A 2JADA 2H72A 1RQMA 1BEDA 2C1YA 5DVBA 4POKA 1YQ1A 18GSA 1WMJA 5FHIA 2BTOT 4JR6A 1AQWA 2K9FA 4L5LA 5JWRB 4PQIA 3SWLA 2WRTA 3ZVJD 4TW5A 4MPGA 1SU9A 4TR1A 5E4WA 1KTEA 2DJ3A 5DQYA 3E3EA 2BJXA 2PVQA 2VL2C 4H86A 4AF2A 2EIQA 2XPEA 1N8JA 2IMIA 2X8HA 2VUPA 2C0GA 4DVCA 2I3YA 1XZOA 1S3AA 1Z9HA 4ZBDA 4LMWA 5ECNB 2QC7A 3FKFA 2OA7A 3H93A 1M0UA 1TXXA 4ACSA 4L8EA 4EVMA 2JU5A 1R7HA 3QOUA 1TU8A 5B7CA 3HCZA 3GH6A 4XIHA 3APOA 4TR4A 1AXDA 4F03A 5FWGA 4N30A 2VD0A 3HVVA 1PRXA 4IS0A 3DKSA 1K3OA 4MK3A 1JZRA 3H4KA 1EP7A 3F9UA 3HXSA 3RDWA 1SL2B 3VFIA 2VM1A 5IQYA 1X9SB 4MF6A 4ILFA 1EV9A 3F4TA 1M9AA 4FYBA 3LFLA 1QMVA 1N2AA 1XVQA 1TI3A 1SJIA 1O6JA 1A0RP 1YZXA 4YQVA 1EGOA 5HFKA 3LEFA 2CA8A 4JEDA 3BBYA 1GSEA 1TK5B 1FO5A 14GSA 3IHQA 2FHEA 5IPGA 4ZXGA 1B9YC 1XWAA 4GXZA 4XRAA 3GH9A 6GSVA 3GTUB 2GQLA 5F06A 3TDGA 1TP9A 3RAZA 1O8XA 1T7PB 5B8AA 2ZCTA 3M1GA 2YWNA 2VCWA 1XOAA 3LXTA 5DCHA 4WETA 1V9WA 2KHPA 5DAKA 3F0IA 3FYGA 3IDVA 1VF3A 1Z5YE 3I69A 3EU4A 2ALBA 1J0FA 2EIOA 3M3MA 4MP4A 2YV9A 2XBQA 2DLXA 3GN3A 1YEXA 2H76A 2JZSA 2H0GA 4JE1A 4TVEA 1ERTA 8GSSA 3ZMLA 1VGLA 2MZCA 5G1KA 2JL4A 1A2LA 1F2EA 20GSA 2WGRA 1K0CA 2NDOA 5ECOB 3TOTA 3UOMA 4EDYA 2RUEA 3LJRA 4TOPA 2TIRA 1XW9A 1CQGA 1OC9A 2DSAA 1GTIA 1VRSD 3UMAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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