3WGXA

Crystal structure of erp46 trx2 in a complex with prx4 c-term
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
b'SHMGLYELSASNFELHVAQGDHFIKFFAPWCGHAKALAPTWEQLALGLEHSETVKIGKVDCTQHYELCSGNQVRGYPTLLWFRDGKKVDQYKGKRDLESLREYVESQLQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Radically different thioredoxin domain arrangement of ERp46, an efficient disulfide bond introducer of the mammalian PDI family
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 5
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase
total genus 30
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wgxA00
1YF0A 4DSSA 1UVZA 1K0DA 1GH2A 3PH9A 1PD21 4AJ6A 4TR0A 3IPZA 3TOTA 5JCUA 2PVQA 3UARA 2ALBA 2QSIA 2FD3A 3G9BA 4ZBAA 4AJ8A 1V98A 5HR3A 1EP7A 3TRQA 2H75A 1N2AA 3UVTA 5AIVA 6GSYA 2VCWA 2CZ2A 1K0OA 4F03A 1A8YA 2HI7A 1V57A 4DEJA 5KN1A 3CBUA 1B48A 1NHOA 2PU9C 3GFKA 3E0UA 1QXHA 1EGOA 1TRVA 4X0XA 1O81A 1G7EA 2KP2A 1G7OA 3WGDA 3N5OA 2QC7A 1Z9HA 3KP8A 3FR9A 1PA3A 5CNWA 5G1KA 1U3IA 1OE7A 4ZXGA 2H76A 2H6XA 3WYWA 4XS4A 4ACSA 1EV9A 3UAPA 2OACA 2WJUA 2H70A 3ZITA 2OE1A 3HXSA 2G2QA 2JL4A 1TK5B 2X99A 4MJAA 3F3RA 1B4PA 2CV4A 5B6NA 5IMAA 4LMWA 5J9BA 1ON4A 3IRAA 3KD0A 1OVNA 4G19A 2P5QA 2HFDA 4K0GA 3GYKA 2CVKA 18GSA 4XIHA 2WCIA 1AAZA 4MCUA 3LEFA 5ECQB 3RAZA 2L57A 1TI3A 3FKFA 3J7Yk 5D9WA 1XW6A 1B4QA 1TU7A 3MAKA 3GX0A 1GSUA 1X5EA 4K7IA 1XWCA 1SK1A 1O8XA 2C3QA 4DVCA 16GSA 5HR0A 5IO2A 1M0UA 2LRCA 1TKDB 5IPHA 4MJBA 3CSIA 1M2BA 1B8XA 2HXKA 3HA9A 2R37A 3CXGA 5HR1A 2PUKC 1TK8B 3IXRA 4IS0A 1K0AA 2CVDA 2YV9A 3KH9A 1SJIA 1OAZA 2VL9A 1FO5A 4IQ1A 3LFLA 3KIJA 5ID2A 1SJ6A 3FK8A 2X8CA 1GSSA 3DXBA 1T00A 1HNAA 1T1VA 2REMA 3TJJA 3KMNA 2ZUPA 3F4SA 2K9FA 3KGKA 2PVOC 5F0GA 3ED3A 5B6MA 3C73A 2PBJA 3TUEA 1KEBA 4WF5A 2O8VB 1R26A 2LJRA 5KN0A 4JR4A 1PGTA 2IJYA 3D5JA 4EF0A 3O3TA 3GTUA 4PUAA 3BJ5A 4Q5QA 4IQAA 4TN8A 5FWGA 4DSRA 3VWUA 1S3AA 5CRGA 1NSWA 4ZIJA 4MPGA 4WBRD 2K8VA 3P7XA 4IVFA 4I2TA 1V40A 3C8EA 3HZ8A 2YANA 4IGJA 1XFLA 14GSA 1X9WB 2NBSA 2B5YA 1G6YA 5FT3A 3G7JA 1U3AA 3FY7A 4X43A 3DGQA 5H5RA 4L5LA 1TTZA 3GTUB 2TIRA 3FZAA 1M2AA 1K0CA 4EUYA 4GQCA 4IBPA 1Z7PA 1FB6A 1AQXA 3M9JA 5CP1A 3KCMA 3FZ4A 3UVHA 1E2YA 1AQVA 3HCZA 4AJ7A 2CX4A 3TJKA 4ULXA 4DSQA 3DYRA 2D2ZA 2BJXA 1K3YA 3GA4A 5LD0A 4Q5FA 1KTEA 2H1DA 1GTAA 4GSSA 3ZMLA 2JADA 3HD5A 2IWTA 3W8SA 4ECCA 1YKCA 1F6MC 2PN8A 4NV5A 7GSSA 5IPGA 3QCPA 3HVSA 3GKXA 3L9SA 5IO0A 4QQ7A 2YCDA 4G9HA 3IC4A 2R5GA 1GLPA 1XW9A 3RPNA 3CTGA 3K8NA 4EDYA 1V58A 2OKAA 3V1WA 2NTOA 2PMTA 2V2GA 2PERA 5G31A 3VLNA 2GSQA 1G6WA 3D0ZA 3H93A 1RW1A 1EEMA 11GSA 4PQHA 4N10A 3VWXA 1WRYA 2L5LA 1U88A 2I4AA 4K1FA 3NZNA 3UBKA 4JEDA 1M2DA 1F3BA 2LKUA 6GSVA 5DBQA 2C3TA 2M46A 8GSSA 4MP4A 4XRDA 5KEJA 2CZ3A 4OCFA 2GVPA 2KHPA 4MJEA 1GTUA 3TRXA 1O7UA 1M7TA 4ISDA 2HSHA 1YZXA 1WOUA 5IOXA 3P90A 4TR1B 4MK3A 2OBIA 2A2SA 1OE8A 4KAEA 1YF1A 1A23A 3UIWA 5JWQB 2HYXA 5B8AA 5DQSA 3GKMA 1F9MA 3CSHA 1BAYA 4MF5A 4K2DA 1EV4A 3BOAA 2VCTA 1ERWA 1XXUA 2YJ7A 1BQ7A 5G5EA 1T3BA 4IN0A 2GLRA 4NV2A 1XCCA 4RQXA 5D9XA 1WMJA 3CRTA 1JFUA 3MDKA 2YWNA 3GKNA 3FRCA 3H79A 4F9ZA 5HFIA 2DLXA 5IOWA 4GXZA 2LQQA 2DJ0A 3ZVJA 5GSTA 3FYGA 3D22A 3KTBA 4HU9A 1W4VA 3GSSA 2LS5A 4V1Ag 3M1GA 1PSQA 2AYTA 3C7MA 5IMVA 2O7KA 5F06A 1B9YC 1Q98A 3C1SA 17GSA 4MDCA 2ON7A 1AUCA 2H30A 2K8SA 3HZ4A 5G5FA 2WULA 1TU8A 5HFKA 5A4WA 2NVLA 2DJJA 4TXVA 2OBKA 4WKWA 2FWFA 1EZKA 3IAS2 2O85A 3FZ5A 1SKRB 1S3CA 4E8HA 3EMPA 2CQ9A 3WT2A 3LSZA 5F8BA 1SD8A 3GV1A 2EIOA 2H72A 3QDNA 5D73A 1S3DA 3A2VA 1QQ2A 3HKRA 3BCIA 3ZLPA 2E2MA 1GLQA 5JCGA 5C04A 3ZRDA 2F3MA 4NPBA 2L59A 1Z7RA 1R5PA 1FVKA 2GSSA 3DEXA 5IMFA 1WIKA 4ILFA 1X5CA 2A2RA 3EVIA 1YKAA 4KCAA 2IFQB 1SU9A 4KSOA 5AN1A 1OKDA 2FWGA 3A3TA 5D8IA 4JE1A 3VWWA 1TRSA 3RDWA 2CA8A 3ERFA 2OA7A 2HZFA 1YJ6A 1FOVA 3JCML 3GX8A 3A2WA 4ML1A 3CYNA 2LV3A 2GT5A 2XHFA 1XW5A 4EDZA 2RUFA 1C72A 2GZPA 2HRNA 4G10A 3ZIVA 4ECBA 4WR4A 3A5WA 4OWYA 4N11A 4MMMA 1GRXA 1K0NA 2G0FA 4PNFA 1YY7A 5AGYA 2XC2A 3KJYA 3J7Yb 2HLSA 2NPBA 3DVXA 1FHEA 1MDJA 2VD0A 3CRUA 3C1RA 1PQNA 4LMVA 5HQPA 5CYYA 4DSSB 2R2JA 4I97A 1R7HA 1FB0A 3KEBA 3IHQA 1OYJA 2FWHA 4F0BA 2XPEA 2V41A 5IMCA 4XTSA 1RQMA 5ECKB 3FEUA 4EC0A 2YN1A 3DMLA 1QUWA 3NOFA 2E0QA 4KE3A 4NAXA 1JHBA 3LYKA 5DJLA 2YPMA 2AAWA 3GH9A 3O76A 5CREA 1AW9A 5DALA 4BWQA 2GZYA 4KX4A 2LNSA 1GNEA 3ME8A 1M9AA 3APOA 2DC5A 4WXTA 1H4OA 1SKSB 2H8LA 2VOCA 1NHYA 3KZQA 4YQVA 2CX3A 1DE1A 2LRNA 4XS4B 4JR6A 2AJQB 2GTUA 1F37A 5ECOB 3UMAA 3ZFLA 3A2XA 4EO3A 4BA7A 4YH2A 1GTBA 1ZGNA 3UJ1A 1AQWA 1ZYQB 1TP9A 3CSJA 4OFMA 2VL3A 1PX7A 5DALB 2YWIA 2RUEA 2B6MA 2N5BA 4RI6A 2VAFA 4GRFA 1GUKA 4ZBDA 3I43A 2L4CA 1XWKA 4POKA 10GSA 4FO5A 3P2AA 5E4WA 4X1UA 3CMIA 4KUNA 5IIZA 3QAWA 1NW2A 2JZTA 3LWAA 5HR2A 5G2ZA 4RI7A 2FY6A 4IKHA 1T4YA 3IE3A 2DIYA 4OCEA 5CRDA 4V2LA 1SJZA 4ECIA 1ACVA 2LJAA 3LJRA 5GZZB 2VL2A 1SL2B 1EP8A 2R3XA 3Q74A 3GIXA 5HFGA 3LXZA 4LLRA 3OR5A 1N8JA 1YEXA 2DJKA 4OFTA 20GSA 3HJPA 2PGTA 3E3EA 3TOUA 4AGSA 4KB3A 1XOBA 4HZ2A 2HZEA 1U6TA 5ID2B 2JZRA 5DCHA 3KH7A 1ZCPA 2KP1A 3RHCA 1FAAA 4N0VA 3W6GA 5ELGA 2E7PA 1PMTA 1GUMA 4GQFA 4I2UA 3DIEA 2M80A 2V1MA 4D73A 5B7CA 3FW2A 5LNKe 1GSDA 2IN3A 3E9JB 2OE3A 2C0DA 1GSQA 2MZCA 5IMDA 4IP1A 1FVJA 3BD2A 2FWEA 4POLA 2HZEB 4NWYA 2K6VA 4RUVA 5F05A 4XS6A 4EKZA 4ZL9A 3KM6A 3TKSC 2N5AA 2XBQA 2DJ3A 2VL2C 3D6IA 4QL7A 4O7HA 1GP1A 1T4ZA 4BL7A 4PURA 3EU3A 1K0BA 2VCQA 4POMA 4JRRA 5C00A 2QGVA 3KMOA 4MZBA 5H5SA 3S9FA 5INYA 3QFBC 2DJ2A 1THXA 3HDCA 3VWVA 4ZB6A 4J57E 4HQSA 1XWGA 1UN2A 4KCEA 2GS3A 3GMFA 4K8MA 2FLSA 3EURA 3LORA 4FH8A 1EOHA 6GSWA 1A2MA 4PXOA 2HNLA 3QD9A 5IMZA 4L8EA 1J0FA 5DQYA 2AV4A 2HRFA 4FYUA 4HQZA 2VCVA 3H8QA 3UEMA 3BBYA 5J9CA 4CW9A 3LQ7A 3LG6A 4V1Ap 2H1AA 2C0EA 1VGLA 2OADA 1WP0A 5AIXA 1SYXA 1AXDA 4GLTA 2VD1A 1IYIA 3W8JA 5ECNB 3M0FA 4JBBA 4E8EA 1JZOA 3TB2A 1GL8A 2B1KA 3PR8A 1OKTA 5J5NA 2VUPA 5GAND 3H4KA 3TKPA 3F4RA 3ISOA 1BEDA 1MD4A 1OC3A 4V2MA 1KNGA 3ERWA 3SBCA 4XHMA 2B1LA 4FYBA 2XBIA 3ZIJA 1GTIA 1ILOA 3GNJA 3WGEA 1OC9A 5ELAA 2GZZA 3TJGA 4IHUA 4PNGA 4EL1A 3QAGA 4FIWA 4HI7A 3F6FA 3LYPA 1TOFA 3Q18A 2HT9A 5KN3A 2JSYA 5EL8A 2P5RA 5J4UA 2V6KA 3M3MA 4I5QA 3FR3A 1ABAA 1XBSA 4HOJA 3TJBA 2OJLA 1ZOFA 2GQMA 1NM3A 1K3LA 2B5EA 3TRPA 5L71A 4IELA 2IPAA 2LTKA 4NMUA 4ZBBA 5ECHB 4HJ2A 2YOIA 3LXTA 4O5RA 2I3YA 2GT6A 3L9VA 2H6ZA 3TDGA 1MEKA 5J41A 4OD7A 1SL0B 4MPFA 2H71A 3DKSA 4OFNA 3MSZA 3IR4A 1XIYA 2HE3A 5CAXA 4NHWA 2BMXA 1X9SB 4CDOA 4MH3A 3TGZA 1VF2A 2CT6A 1LBKA 2C0GA 2ZCTA 1HNCA 4NHZA 1ERUA 1K0MA 1MDIA 2WRTA 4GTUA 4TVEA 3R2QA 5ECMB 2L4QA 3ZREA 1J9BA 3EYTA 3EINA 3BCKA 1TI1A 5IQYA 1QGVA 1BJXA 1GNWA 1FW1A 2L5OA 2C1YA 2DBCA 2RM5A 3MWHA 2A4VA 1ZL9A 6GSTA 3IDVA 4XRAA 4K9ZA 1PKZA 5A4VA 2LEGA 2JSZA 1AIUA 2V6OA 2TRCP 1DBYA 4G2EA 4KA0A 3IK7A 4KDUA 1T8EB 2MMZA 4I8BA 2RIIA 5A5KA 2YZUA 5EVOA 1TW9A 4GWRA 5COHA 2PPTA 3U6VA 3F3QA 2YZHA 3Q19A 2C8UA 4BVXA 3RPPA 3GHAA 5LCZA 1JLWA 4HJMA 1UC7A 5J3RA 3H1NA 3TKRA 4YQMA 1LJRA 1SENA 3I6AA 3F8UA 3WT1A 3EE2A 2VLTA 2C80A 1O73A 2DIZA 4YAPA 4ID0A 19GSA 4ECJA 5KN2A 3O6TA 3RBTA 3IA1A 1A8LA 1R4WA 2L6DA 1M99A 3D4MA 4IJ3A 12GSA 2LRTA 4K6XA 3MNGA 3DD3A 3ERGA 5DCGA 2H1GA 1AC1A 2I81A 2BTOT 3KP9A 2R4VA 1ZYEA 1EGRA 4KH7A 2CAIA 2WZ9A 6GSSA 4YQUA 2VO4A 4L5OA 4OO4A 5D93A 1X5DA 3GUSA 2VLUA 4FYCA 1YEPA 3SWLA 3VK9A 2P0GA 1HYUA 4HUAA 1JZRA 1W89A 2O87A 4TR4A 1TXXA 2E2GA 9GSSA 2VIMA 2DMMA 2MBTA 4KSMA 2IMFA 3VFIA 1X0RA 1ERTA 1EWXA 3QOUA 1V9WA 3GSTA 4KGIA 1XWAA 4L0WA 3TKSE 1BYEA 5E59A 2WS2A 3HHVA 2MYGA 1XVQA 2JU5A 3M9KA 3VI7A 1O6JA 1GSYA 2I9HA 3US3A 1CQGA 3KTLA 1URMA 1YDKA 1PX6A 2H0IA 2KUCA 2YJHA 1MTCA 1YQ1A 3HVXA 2FCHA 4ZB9A 1QK8A 3DRNA 2FA8A 4HU7A 3NIVA 1K3OA 1O85A 3IOSA 6GSUA 2H6YA 2MBSA 2IMEA 2VM2A 2RLIA 4PX1A 1Y25A 5D96A 4TW5A 2RM6A 4J2FA 2H73A 22GSA 4TRXA 5CRWA 2TRXA 1E6BA 2FUG2 2N5FA 3I69A 2IMIA 4MABA 3EMXA 3APQA 2GQLA 4I6XA 1SD9A 5EY6A 4MJCA 1ERVA 2PWJA 2VCXA 3GRXA 2H66A 1GWCA 1QMVA 5ECIB 4MZWA 4GSTA 4BWSA 5H5QA 3TKSA 4O92A 1A0RP 2KOKA 4XS1A 3VPTA 2MMAA 1U87A 3QFAC 5G1LA 1Q4JA 5CRHA 5ECLB 2HSYA 1XWBA 4YAVA 2F8FA 1VF4A 1IYHA 3ZFBA 4HS1A 1ZZYA 3PINA 4KDXA 1ML6A 3QR6A 1SK0A 4F2IA 4RQRA 2OE0A 5DJMA 4N30A 2YNXA 4NXIA 4J56E 1PN9A 2EIRA 3APSA 3EC3A 1VRSD 3ZYWA 5JCWA 1XOAA 5ECSA 3ZL5A 1TDIA 3ME7A 3F4TA 3C71A 3IK9A 2C3NA 3TCOA 3L9UA 4ZL8A 3F63A 5JWRB 3VPQA 1FG4A 1EOGA 3F9UA 2L6CA 4K7NA 1B9XC 3F6DA 1F3AA 3GL3A 3QMXA 4TXOA 5EPFA 1Z5YE 1TK0B 2LQOA 3HYPA 1Z6MA 5DVBA 4TOPA 4GF0A 3G7IA 1XZOA 3VURA 3L4NA 3TKQA 2M72A 2P31A 2ON5A 3L0HA 3WD6A 5DAKA 2AHEA 3UBLA 2H1BA 2YP6A 1M9BA 4D73B 3M8NA 5GAPD 2FGXA 2GGTA 2VLVA 4TXOB 1Z3EA 3I9V2 2JACA 5JWOB 1CQHA 2YWOA 3D4TA 2ZNMA 4K0NA 4LL4B 2GSRA 2H74A 1GUHA 2AB6A 1X9MB 4OMVA 2JZSA 3WGXA 3Q6OA 5B8BA 5ECRB 4OO5A 2O89A 1MDKA 2MMOA 2MMNA 5DAKB 2B7KA 4PUFC 2GDRA 1UA5A 1I5GA 4WBJA 4MA9A 1F2EA 2F51A 4ZB8A 2K18A 5ABRA 4IP6A 4BVYA 3GURA 4MF6A 4PQIA 2GQKA 2EC4A 5CO3A 4IJIA 4MZCA 5G30A 5GSSA 2WGRA 1TJDA 4KDYA 4O32A 2X8HA 4F82A 1PKWA 2XPDA 3N9JA 1R5AA 4L0UA 5ENUA 3LGCA 4HEA2 1T7PB 4N0ZA 1WPIA 2FNOA 2C4JA 4CHSA 2B7JA 5D9TA 3ZZXA 2H0GA 2R6KA 4TKYA 4TR1A 5D9VA 3HJMA 3FZ9A 3CTFA 3P8WA 2F9SA 1PRXA 4QL9A 1SL1B 1I9DA 3KXOA 1JLVA 3HJOA 1ST9A 13GSA 3IAM2 1V2AA 1PL2A 4KW6A 3QAVA 2IIYA 1HQOA 4MH2A 1QFNA 2NDOA 2WDUA 2B3SA 5AISA 5FHIA 2LNTA 3GKKA 5F07A 1WE0A 4WR5A 2B5XA 1BX9A 1GSFA 3AY8A 3HY2A 2J23A 2C0FA 3FHKA 2F8AA 3GN3A 1JZDA 3EU4A 4WEYA 1TRWA 4GCIA 4P3YB 2QKEA 3ZVJD 1VF3A 3IBHA 4V2NA 1USBA 3VI5A 2GSTA 3RHBA 1OC9B 2KLXA 2DMLA 2LJKA 2Z9SA 1WJKA 1DSBA 4XCSA 4BPYA 1H75A 1Y6EA 1A24A 4JU5A 2ES7A 4AF2A 4MF7A 1PL1A 3GH6A 2FA4A 4K7OA 4ZL7A 1LU4A 1J08A 3FR6A 1WWJA 3DVWA 1SYRA 2X8GA 2VM1A 3F0IA 1ZMAA 4H86A 1KBNA 4Z7XA 1G0TA 4Q5RA 2FHEA 3GL5A 1EEJA 2I1UA 1TRUA 1SKWB 4HZ4A 4WF4A 2CAQA 1VF1A 2DJ1A 1O8WA 2H01A 4PQ1A 3HVVA 4PGTA 2WFCA 2AUVA 3U5RE 3G7YA 1DUGA 4EXJA 3ZTLA 1A2LA 6GSXA 2LUSA 1GULA 2V32A 1OC8A 1HD2A 4WETA 2X64A 1JZWA 4EE0A 4HDEA 4ZILA 1DE2A 4MLYA 1SK2A 2IMDA 5ECPB 2H0HA 4LL1B 5IM9A 1THOA 1RK4A 4GSNA 3DWVA 4JZQA 4EVMA 4TR3A 1A2JA 3PGTA 2IFQA 3UL3A 3IV4A 4F0CA 3UOMA 2YV7A 1GSEA 2H19A 4POBA 2CVBA 2J9HA 1HNBA 3EWLA 2IL3A 3D21A 2DSAA 3L78A 4LA1A 4Q5NA 3TJFA 3ZMKA 2YWMA 2WB9A 1Z6NA 2IMKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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