3WL2A

Monoclinic lysozyme at 0.96 a resolution
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Evaluation of Rigaku XtaLAB P200
rcsb
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3wl2A00
1TAYA 1KXYA 4LZTA 3ULRA 1LJNA 4M6DA 1LMCA 4Z46A 1IO5A 1TBYA 2Z37A 2BQEA 3P65A 4OWEA 3CSQA 5HMJA 4B4JA 5KJ9A 5KXWA 2LYMA 1GFGA 194LA 1B7SA 2MEHA 1GFUA 2VB1A 4LYZA 4RLNA 1GEZA 4O34A 2HEDA 1NKHA 1CJ6A 1WTMA 1LHIA 3BKHA 4UWVA 5LVIA 3WU8A 4B1AA 2Z12A 1IWTA 1D0MA 1HEMA 2DQEY 5J7CA 3RZ4A 1I20A 1LHKA 4B49A 4B4EA 1C45A 4MCKA 4GN5C 1YILA 3ATNA 1DXJA 1FLWA 4RDSA 5HNCA 5KY1A 1B7LA 5LVGA 3QY4A 4Z3MA 1QTKA 1JHLA 4ETCA 4W96A 1IC5Y 1DPXA 1OUEA 1GBSA 2H5ZA 3P4ZA 1LKSA 1GF6A 4N9RA 4UWUA 1GB3A 1JKDA 3TMWA 4LYTA 2DQJY 1LJIA 2IHLA 4TSBA 4YENA 1V7TA 4ETEA 5ILCA 1A2YC 1LZEA 1JKBA 5LVJA 3CT5A 1G7HC 5E4PA 1QIOA 3WUNA 1XGTC 3AYQA 2FBBA 5LXWA 1SQ2L 1GD6A 2ZIJA 4BS7A 1D9UA 4NGJA 3A6BY 8LYZA 2W1LA 4LGKA 5LINA 5I4YA 4R6CA 1LZ4A 1HNLA 3TXGA 5DN4A 4NHPA 2Z2FA 1IC4Y 3WVYA 5DLAA 4PHIA 3D9AC 1IWYA 1QDTA 3LN2A 1LZAA 1IY4A 1BB6A 4PGJB 1F6SA 2W1YA 1HERA 1RCMA 1JEFA 2IFFY 4WM6A 5JENB 1XEIA 4HPIA 1NBZC 1B7MA 1NWGA 1GPQC 1HMLA 2Y8PA 1GE0A 1B7NA 2DQIY 3CT0A 1YANA 2D91A 1YAOA 1QSAA 5A3EA 5D5FA 4TUNA 1WQNA 1GF4A 4IJ4A 2LZ2A 5M1YA 1HFZA 3EBAB 4WM3A 1F0WA 4GCBA 4MSTA 134LA 4CFPA 5LYZA 2I25L 4J7VA 4B0DA 5KKIA 4LFXA 1DQJC 1DI3A 4QY9A 4NGLA 5C6IA 5I4XA 2H9KA 1GB0A 2XBRA 1AT5A 2MEDA 1LMPA 3A8ZA 1LSPA 5LA5A 1HMKA 1BWJA 1GDXA 1OQMA 2BQJA 3AGGG 1OP9B 4OWBA 3T36A 7LYZA 1LJKA 1LSCA 1B5WA 2XTHA 2Z2EA 3SP3A 4H9IA 5FSTA 1CKCA 5KKJA 4ZFPA 1LSDA 3AJNA 1IR9A 1UIFA 2ZIKA 4DT3A 3IWRA 5IELA 4LFPA 3HBEX 1BB5A 1LMNA 1OUAA 4ANRA 5EBHA 5FHWA 2RSCA 1OUFA 2EKSC 4KXIA 1LSEA 4G4HA 2LHMA 1IOTA 3WW5A 1HEWA 1LKRA 1NHEA 1JTTL 4ET8A 1DKJA 1YAQA 2FYCA 1GDWA 2N5ZA 1ZVYB 2BAAA 2BQCA 1RE2A 1C7PA 4OOTA 1SLYA 4OWHA 1KIQC 3WUAA 1HFXA 2HEEA 3B0IA 4NGYA 3RW8A 1HEQA 2BQHA 1F10A 2F2NA 4TX7A 1IR7A 1LOZA 4NFVA 1LZ5A 4A7DA 1C46A 1GFKA 1QTEA 3CSRA 3LHMA 135LA 4WM1A 4N1CC 3RU5A 2D4JA 5E9RA 1LZTA 2EPEA 4GCDA 4RW2A 5F9XA 5KXMA 1UA6Y 5II3A 4D9ZA 3OJPA 1GAZA 1VDTA 1CKFA 2H9JA 3IJUA 4HSFA 4WO6A 5L3IA 5APCA 3CQLA 1BGIA 4TWSA 1JPOA 1ZMYL 4LT0A 1ZVHL 3EO5A 4LT2A 4NGOA 4C5FA 4IASA 2X0AA 3N9EA 4HJYA 3LYZA 1XFPL 3KAMA 4XJBA 1FDLY 1RJCB 3AGHA 5HMVA 4NHIA 3A92A 4N8ZA 5DM9A 4OOOA 5KXPA 1UBZA 1T6VL 4IATA 1LZCA 5F81A 1BWIA 4WL7A 2CJLA 1KIPC 1LSBA 2BQGA 2XJWA 4HTNA 1WQPA 4HP0A 3TXHA 5KXRA 1IOSA 3W6FA 3WPKA 4XJGA 4DDCA 1B5XA 1B5YA 1LZGA 2D4KA 1VEDA 5APDA 1B9OA 1OUDA 1XGQC 3W3EA 5I5QA 2NWDX 1FKQA 1GF8A 1LJ4A 1LZYA 2BLYA 2MEAA 4J0LA 4XJIA 4GLAA 1LPIA 5IDDA 1B5UA 3A3RX 4NWEA 5HLLA 1CJ9A 1TEWA 1JSEA 4NHSA 5I53A 2BQBA 1XEKA 2HECA 1IWVA 3K3TA 1LSAA 3TMUA 5APFA 1LAAA 4H8YA 3TXBA 3ATOA 1IP1A 1AT6A 1GBOA 3E3DA 1WQMA 4NGWA 4PJ2C 3A34A 5F16A 2CGIA 1WTNA 2B5ZA 2HUBA 4R0FA 1IX0A 3LZ2A 2DQCY 4RW1A 4DD1A 4XENA 1VATA 5F14A 1JWRA 1CNSA 1GBXA 1GB8A 4QEQA 1P2CC 1GF7A 3HBDA 1RI8B 4DYGA 3MGWA 5LA8A 3A91A 3ZEKA 1OUHA 5A3ZA 3WXTA 1GF3A 1GE2A 3RT5X 1GE4A 2YDGA 1DKKA 4DWXA 2DBTA 1OUJA 3A96A 5LIOA 1NDMC 1DI4A 5KXLA 4GCCA 5APEA 3N9AA 2MEFA 4UWNA 2CDSA 1HSWA 4ET9A 4Z41A 5KXXA 4TTDA 4QGZA 1UUZC 4GCFA 3B0KA 193LA 1YL0X 1DPWA 1FLYA 2YBMA 4N1EI 1GFHA 3WUMA 1JJ0A 1KXWA 1VDQA 3WPJA 3B0OA 5LAGA 4II8A 1E8LA 4DD0A 1GBYA 5HQ1A 1HSXA 4AXTA 2BQFA 4HV2A 5LYTA 1QUTA 1REYA 1IP3A 2YBNA 3AW6A 4HJVA 5F9UA 2BQAA 1JISA 2MECA 1LSYA 2F30A 2YBIA 3G3AB 1IVMA 4NGVA 1GFVA 3J4GA 4OWCA 3WVXA 3WYHA 2ZNWY 1B0DA 1GE1A 4NY5A 2EIZC 3EXDA 3P64A 1W6ZA 2LZTA 2FYDA 2BQDA 4J1AA 4PPOA 4NGKA 3W6BA 1JIYA 2I6ZA 4B4IA 3P66A 3WU9A 3QNGA 1J1OY 5KXSA 1UIBA 2HTXA 4NIJA 2BPUA 1UCOA 2G4QA 3P68A 2DQAA 1IP4A 3GXRA 1WQQA 5C6LA 4WG7A 4TSCA 2DQHY 3ZVQA 2D6BA 5FELA 6LYZA 1IC7Y 5L3HA 2BQMA 1YAPA 1TCYA 2YBHA 4NWHA 3D3DA 1G7JC 4WLYA 1W08A 5KXNA 1IORA 3N9CA 1CJ7A 1GFTA 5B05A 1BB3A 4H9EA 1CJ8A 3GXKA 1FLUA 4WOAA 2ZWBA 5LVKA 1IP5A 4WM2A 5B1FA 4M4OA 4DDBA 1LJ3A 2F4AA 3WU7A 1JTPL 5KXZA 1NF5A 4U3XB 4CHXA 1LSGA 4NGIA 5FEKA 5FDJA 4DD7A 4ETAA 1OUCA 1GB6A 1HEPA 1LYSA 4YOPA 4KL7A 1REZA 3W6CA 4WG1A 4NSIA 4H91A 3AGIA 5KXTA 4NG8A 2BQLA 3TMVA 2MEEA 1HENA 3A67Y 1CKGA 6LYTA 3TMXA 1B2KA 1C43A 1GAYA 1HF4A 2W1MA 2YVBA 4YM8A 1JSFA 4YF2A 1T3PA 3WPLA 1GEVA 3TXJA 1NDGC 4KPMA 1BWHA 4BAPA 1GBZA 1G7IC 1LJHA 3J6KA 1LMTA 1LZBA 3W6EA 1CKHA 1VFBC 3WMKA 2C8OA 1J1PY 1ALCA 1LZNA 3AW7A 1IP6A 2HU1A 3TXFA 5FCPA 4LT3A 3ZVQB 9LYZA 1IWZA 1GB2A 1QUSA 4H9HA 1JJ1A 4DD2A 4NSGA 4J1BA 5I4WA 5KXYA 4WLXA 4LYBA 2MEBA 1B7QA 1G7LC 2BQOA 132LA 3HFMY 5DN5A 2DQDY 1GF5A 2LYZA 4MR1A 3AZ4A 4G4BA 3AB6A 1LYYA 3CSZA 1B5ZA 4NG1A 5T3FA 1LZ6A 3WXUA 3LZTA 3AZ6A 4NGZA 3CB7A 4C3WA 1HFYA 1EQEA 1XGRC 2EQLA 3A93A 4GN4A 2DQGY 3CT1A 1UIAA 5KXKA 154LA 1JKCA 1LYOA 4H92A 1IWUA 1GF9A 1LJJA 4WLDA 5C6JA 4WLTA 4HJZA 5IHGA 1YAMA 4L41A 1REXA 3M18B 1JTOL 4PRQA 1GXXA 5HNLA 5LAFA 1LCNA 2G4PA 4ML7A 1EL1A 1YQVY 4AGAA 4EMNA 4N5RA 2WARA 1WQRA 1LSNA 2W1XA 3EMSA 4KT3A 4XJHA 4ZIXA 1JITA 1ZV5L 153LA 1UIDA 4H94A 1GFAA 4H93A 1OUGA 5B06A 3VWOA 1FKVA 1GB9A 1B7RA 1HHLA 2BQIA 4NSJA 1JJ3A 1Z55A 1YL1X 1IR8A 5DL9A 4HV1A 1LMQA 4N0JA 5LYMA 2Z39A 1EQ4A 4HPEA 2XBSA 1B5VA 4OWAA 3OK0A 1IP2A 1PZYA 1D6QA 3RNXA 2CWIA 4FDYA 1YIKA 4XADA 1LSMA 1LJGA 1VAUA 3W6AA 1BVKC 2HEFA 5LVHA 1IP7A 3FI7A 1C08C 1I1ZA 4CFOA 4G49A 1BB7A 1HEOA 1AZFA 4H9FA 1LZ1A 1GHLA 208LA 4ETBA 1JUGA 1I56A 1PS5A 4OW1A 4NEBA 3LYTA 5KXOA 2MEIA 1H87A 4GCEA 4H9BA 4XJFA 4ETDA 1UICA 2YBLA 4LYCA 1HELA 4ZEEA 1IIZA 1GE3A 3AZ5A 4H9CA 1AM7A 4YEOA 3A94A 4I0CA 5B07A 3M3UA 3G3BB 1LHHA 207LA 4DD3A 1NBYC 1A4VA 2AUBA 2HEAA 4NHQA 4DC4A 5I54A 2Z18A 1HC0A 3A95A 1LZDA 2D4IA 2YSSC 4EOFA 4XYYA 1FBIX 1LTMA 4YEMA 1CKDA 3B72A 1IWXA 1H6MA 1NMMA 1LZSA 3A90A 5D5CA 1BB4A 1QQYA 4QDNA 4P2EA 4H1PA 4GLVA 1LHJA 4X3BA 4XN6A 2LYOA 4WM5A 1G7MC 2BQNA 4WM4A 1INUA 4WO9A 4WL6A 3TXIA 1FLQA 2F4GA 2ZYCA 4NSHA 1LMOA 3B6LA 1GBWA 4E3UA 5AMYA 3IJVA 5L9JA 1C10A 2ZILA 1IWWA 1REMA 1XEJA 3A6CY 2C8PA 1FN5A 2BQKA 4H9AA 2G4NA 1IOQA 1B7PA 1UIEA 3WL2A 1DZBX 1XSFA 1BHZA 1IOCA 1D0KA 1QSWA 2Q0MX 3BKVA 2DQFC 1GFRA 4PRUA 1MLCE 4XJDA 2ZNXY 5B1GA 2MEGA 1LHMA 4NHTA 4BAFA 1YKZX 1LSZA 1N4FA 1OUBA 1UACY 1UIHA 2YBJA 2ZQ4A 1F6RA 1GB7A 1D6PA 1TDYA 2Z38A 4G9SA 4WMGA 2A7FA 4CJ2A 1D0LA 4W94A 4RLMA 3WULA 1LJEA 4H8ZA 5B59A 2Z19A 1LSFA 1VDPA 1KXXA 1WVVA 1LHLA 1LZ9A 1XGPC 4I8SA 2BLXA 2I26L 1EQ5A 3QE8A 2A7DA 4HTKA 1GXV2 1LZ8A 4GN3A 4DD9A 4LYOA 2GV0A 4FJRA 1IEEA 3LYMA 3TXEA 4CGEA 1BQLY 2HU3A 1LYZA 3W6DA 4BADA 3FE0A 1LZRA 4HTQA 3A3QA 3WW6A 1WVUA 4DDAA 5K7OA 4G4CA 1JKAA 3AZ7A 3WH1A 4H8XA 1B7OA 4Z98A 1BVXA 1GFJA 1YKXX 2ZQ3A 1AKIA 2DKVA 1GF0A 2ZYPA 1GB5A 1GFEA 4H90A 1XGUC 1J1XY 1UIGA 1MELL 2PC2A 1RFPA 5ILFA 4LYMA 1KIRC 1VDSA 1LJFA 1YKYX 1YROA 1NQIA 4LT1A 3T6UA 3TXDA 1GWDA 1WQOA 1LMAA 3F6ZA 2FBDA 133LA 1DI5A 1UC0A 1V7SA 1O23A 3LYOA 3TXKA 3HBHA 1QDRA 2HEBA 1IY3A 1OUIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L59A 1L21A 4ARLA 1LMCA 4Z46A 1TBYA 2B70A 3P65A 5KJ9A 5KXWA 2LYMA 194LA 4LYZA 1GEZA 4UWVA 3WU8A 3BKHA 4B1AA 1L70A 1L98A 1HEMA 3SB8A 4B49A 109LA 4I7MA 5HNCA 4RDSA 1B7LA 210LA 1QTKA 2F32A 1DPXA 3HT7A 4ETEA 2RB2X 3F8VA 1PQDA 3CT5A 5E4PA 1QIOA 3NY8A 3WUNA 196LA 1XGTC 1SQ2L 4NGJA 2W1LA 4LGKA 1C63A 1IC4Y 232LA 1IWYA 125LA 4PGJB 1L38A 1F6SA 1CX6A 1QTVA 1JEFA 1PQOA 5JENB 4ARMB 1D2YA 4HPIA 4W53A 1NWGA 1HMLA 206LA 1YANA 1QSAA 4TUNA 4IJ4A 3EBAB 1L20A 4GCBA 4MSTA 134LA 5LYZA 4B0DA 4LFXA 1C6JA 1DQJC 2H9KA 1GB0A 235LA 2MEDA 3DN8A 2BQJA 3SP3A 4ZPUA 4H9IA 5FSTA 1CKCA 4EXMA 1IR9A 2ZIKA 3IWRA 4ANRA 1L76A 1JTTL 2FYCA 2N5ZA 4E97A 1C7PA 168LA 1KIQC 3B0IA 4NGYA 1HEQA 1L81A 2BQHA 145LA 4TX7A 1D2WA 1QTEA 1SX2A 2D4JA 4GCDA 1CKFA 1LPYA 2H9JA 4HSFA 120LA 1BGIA 1JPOA 1ZMYL 3EO5A 1P37A 4W55A 3LYZA 2Q9DA 4N8ZA 5KXPA 1UBZA 1T6VL 4IATA 1LZCA 1QUOA 2BQGA 239LA 5KXRA 1IOSA 1L40A 201LA 3JR6A 1XGQC 1L85A 1QT3A 2BLYA 2MEAA 1CU3A 4GLAA 1B5UA 1JSEA 2OU0X 2BQBA 1LSAA 3TXBA 3ATOA 3E3DA 3A34A 260LA 215LA 2O4WA 1VATA 4XENA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1TAY A;  1KXY A;  4LZT A;  3ULR A;  1LJN A;  4M6D A;  1LMC A;  4Z46 A;  1IO5 A;  1TBY A;  2Z37 A;  2BQE A;  3P65 A;  4OWE A;  3CSQ A;  5HMJ A;  4B4J A;  5KJ9 A;  5KXW A;  2LYM A;  1GFG A;  194L A;  1B7S A;  2MEH A;  1GFU A;  2VB1 A;  4LYZ A;  4RLN A;  1GEZ A;  4O34 A;  2HED A;  1NKH A;  1CJ6 A;  1WTM A;  1LHI A;  3BKH A;  4UWV A;  5LVI A;  3WU8 A;  4B1A A;  2Z12 A;  1IWT A;  1D0M A;  1HEM A;  2DQE Y;  5J7C A;  3RZ4 A;  1I20 A;  1LHK A;  4B49 A;  4B4E A;  1C45 A;  4MCK A;  4GN5 C;  1YIL A;  3ATN A;  1DXJ A;  1FLW A;  4RDS A;  5HNC A;  5KY1 A;  1B7L A;  5LVG A;  3QY4 A;  4Z3M A;  1QTK A;  1JHL A;  4ETC A;  4W96 A;  1IC5 Y;  1DPX A;  1OUE A;  1GBS A;  2H5Z A;  3P4Z A;  1LKS A;  1GF6 A;  4N9R A;  4UWU A;  1GB3 A;  1JKD A;  3TMW A;  4LYT A;  2DQJ Y;  1LJI A;  2IHL A;  4TSB A;  4YEN A;  1V7T A;  4ETE A;  5ILC A;  1A2Y C;  1LZE A;  1JKB A;  5LVJ A;  3CT5 A;  1G7H C;  5E4P A;  1QIO A;  3WUN A;  1XGT C;  3AYQ A;  2FBB A;  5LXW A;  1SQ2 L;  1GD6 A;  2ZIJ A;  4BS7 A;  1D9U A;  4NGJ A;  3A6B Y;  8LYZ A; 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 2ZIL A;  1IWW A;  1REM A;  1XEJ A;  3A6C Y;  2C8P A;  1FN5 A;  2BQK A;  4H9A A;  2G4N A;  1IOQ A;  1B7P A;  1UIE A;  3WL2 A;  1DZB X;  1XSF A;  1BHZ A;  1IOC A;  1D0K A;  1QSW A;  2Q0M X;  3BKV A;  2DQF C;  1GFR A;  4PRU A;  1MLC E;  4XJD A;  2ZNX Y;  5B1G A;  2MEG A;  1LHM A;  4NHT A;  4BAF A;  1YKZ X;  1LSZ A;  1N4F A;  1OUB A;  1UAC Y;  1UIH A;  2YBJ A;  2ZQ4 A;  1F6R A;  1GB7 A;  1D6P A;  1TDY A;  2Z38 A;  4G9S A;  4WMG A;  2A7F A;  4CJ2 A;  1D0L A;  4W94 A;  4RLM A;  3WUL A;  1LJE A;  4H8Z A;  5B59 A;  2Z19 A;  1LSF A;  1VDP A;  1KXX A;  1WVV A;  1LHL A;  1LZ9 A;  1XGP C;  4I8S A;  2BLX A;  2I26 L;  1EQ5 A;  3QE8 A;  2A7D A;  4HTK A;  1GXV 2;  1LZ8 A;  4GN3 A;  4DD9 A;  4LYO A;  2GV0 A;  4FJR A;  1IEE A;  3LYM A;  3TXE A;  4CGE A;  1BQL Y;  2HU3 A;  1LYZ A;  3W6D A;  4BAD A;  3FE0 A;  1LZR A;  4HTQ A;  3A3Q A;  3WW6 A;  1WVU A;  4DDA A;  5K7O A;  4G4C A;  1JKA A;  3AZ7 A;  3WH1 A;  4H8X A;  1B7O A;  4Z98 A;  1BVX A;  1GFJ A;  1YKX X;  2ZQ3 A;  1AKI A;  2DKV A;  1GF0 A;  2ZYP A;  1GB5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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