3WU7A

Spatiotemporal development of soaked protein crystal; derivative 250 sec
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Spatiotemporal development of soaked protein crystal
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3wu7A00
4NGWA 3MGWA 1JJ1A 4B0DA 1LZCA 1LZ8A 1UA6Y 4NWEA 4WM6A 1NQIA 3E3DA 3AZ4A 4H9IA 1INUA 4WLXA 4B49A 4DD3A 2AUBA 1LMPA 4Z46A 3QY4A 5J7CA 1LHJA 3AGIA 1GAZA 1AT6A 1REXA 5IDDA 4C3WA 1QDRA 1VFBC 1YROA 2DQDY 2DQJY 1RE2A 2DQIY 4NSGA 5IHGA 2LZTA 1TAYA 2DQGY 5L9JA 1TEWA 1UBZA 4GCFA 4WG7A 4GN3A 3ZVQB 5A3ZA 2ZQ4A 1YL0X 3RNXA 1GWDA 2G4NA 4XN6A 2YSSC 207LA 3CT1A 1HENA 3WULA 2Z2FA 1BGIA 2HEFA 3IJVA 2MEIA 5II3A 4LYCA 1UIDA 4LYMA 1B5YA 3TXFA 1XGPC 3EO5A 1LSPA 4HJZA 1WVVA 1LZGA 2Z37A 1C46A 1YANA 194LA 1WQMA 5LAGA 4KL7A 4H92A 3W6AA 1LSMA 1HEOA 2F2NA 4H1PA 1GXV2 2Z2EA 4CHXA 1MLCE 4NGIA 1CKGA 1IWWA 3EMSA 5T3FA 1HEQA 2EKSC 4EMNA 4NHSA 4E3UA 1B7NA 7LYZA 4NIJA 1LTMA 4IJ4A 4WM4A 4N1CC 1DI3A 2YBIA 1GE2A 3QNGA 4Z98A 5FCPA 3N9EA 1I56A 1WQPA 4NGLA 5I4XA 4CFOA 2EQLA 4HSFA 1WQRA 3WYHA 1GBSA 1GFTA 2C8PA 4B4EA 3VWOA 1GFGA 3A95A 1UUZC 2Z12A 3F6ZA 3J4GA 3W3EA 1LZBA 5KKIA 5F81A 1EQEA 2XTHA 5KXKA 134LA 1JIYA 4KT3A 4NHQA 4W96A 1EQ4A 1LKSA 1B5WA 1IVMA 2W1YA 4J1BA 4HPIA 5KXSA 5B1FA 2BPUA 1YKXX 2FYDA 1BVXA 2Y8PA 2Q0MX 5KXNA 2ZNXY 3WL2A 1TCYA 1IOTA 1JHLA 1HMLA 1NMMA 2X0AA 1HSWA 4WLYA 1CJ9A 1NDGC 5I53A 1NKHA 1C43A 2EPEA 5LXWA 1AT5A 4LZTA 1IR9A 5F9UA 5F9XA 3HBDA 4GCDA 5DN4A 1GBZA 1LSYA 1D0MA 1KXWA 1QIOA 1QTEA 1TBYA 1H6MA 3K3TA 4GLAA 1LHMA 2DQCY 1OUDA 4WOAA 8LYZA 4B4JA 1JTOL 1JTTL 2BQJA 1GB2A 1H87A 1HEPA 1IP3A 2ZYPA 5LA8A 1GBXA 1IORA 4LYOA 1D0LA 4N8ZA 4I8SA 3QE8A 1OUJA 2HEEA 4NSIA 208LA 3T6UA 4H90A 2BQFA 2YBJA 3ATNA 4YM8A 4PHIA 1LMNA 2RSCA 1LZSA 1G7JC 4IATA 2LHMA 1LCNA 2BQEA 2D6BA 1CKFA 1LMOA 1HFXA 1B5ZA 1IP7A 1REZA 5M1YA 5IELA 1A4VA 1GB5A 2ZIKA 1GFVA 4NGZA 4PRQA 4MR1A 3TMVA 1LAAA 1LZEA 5F16A 1QSWA 1IP2A 1GF5A 1VAUA 3P66A 2PC2A 1VEDA 1WQQA 4PPOA 5LVHA 1LYOA 2C8OA 2HECA 1LZYA 4LT2A 1LPIA 1DKJA 4PRUA 1DQJC 5KXMA 2MEAA 1HERA 4XJIA 1CJ8A 1LZ5A 1NWGA 4NGKA 5DL9A 3AW7A 1E8LA 2DQEY 4N0JA 4OWBA 2FBBA 3OJPA 4BAPA 4LYZA 4N9RA 1F0WA 4HJVA 1JITA 1GBWA 4H8XA 5APEA 3WU8A 1P2CC 1BB6A 1LMTA 4C5FA 3B0OA 2MEFA 193LA 3W6CA 4ZIXA 1YIKA 2HUBA 4XJGA 5KJ9A 5DLAA 1JUGA 5KXOA 4Z41A 3A94A 4BAFA 4CJ2A 4RLNA 1LJIA 4CGEA 1GFEA 1BVKC 3D9AC 1RJCB 4NY5A 4DD9A 1XEKA 1FBIX 2WARA 1BQLY 1F10A 1GF3A 1NF5A 3HFMY 5KXYA 4DWXA 4L41A 3LHMA 2MEDA 4NSJA 4TX7A 3RW8A 3ZVQA 1QDTA 1UACY 5B07A 1IR8A 3M18B 4BADA 1LMQA 1HEWA 2VB1A 1RFPA 1GBOA 4H9AA 1LJ3A 3M3UA 1UIGA 2MEHA 2W1LA 5LVGA 4N1EI 3B0KA 4XJBA 5LYTA 1XEIA 135LA 1T3PA 1DI5A 3A34A 3GXKA 3WU9A 1F6RA 3LYZA 1A2YC 3LZTA 1HELA 4H8YA 1YKYX 1GFHA 4QDNA 1D6QA 1BB7A 1HHLA 4R0FA 4ET9A 2BQOA 1LZTA 5C6IA 1UIBA 4UWVA 1PZYA 1LZNA 3AB6A 4H9HA 4HTQA 4NHTA 1YAQA 2BQIA 1W6ZA 1REMA 1AM7A 1GPQC 1LSNA 1GE4A 2BQHA 4WL7A 2HU3A 3WW6A 4BS7A 1GF0A 1LYYA 3P4ZA 2IFFY 5I5QA 1KXYA 1GXXA 3A93A 1LHKA 5HMJA 3AJNA 5LAFA 1LSAA 4ANRA 2DQAA 4DDBA 4LFPA 3AZ7A 4YF2A 1YAMA 1IC4Y 3AW6A 1B7MA 1ZMYL 3OK0A 4G4BA 1NBYC 1DKKA 2I25L 4UWUA 1JKBA 5KXZA 1GEVA 1D9UA 1FLWA 3A90A 5FSTA 2MECA 1WVUA 1PS5A 1YILA 4LFXA 3WU7A 2BLXA 1OUHA 3A67Y 3J6KA 5B06A 1DXJA 1IWYA 3TXBA 4DC4A 2N5ZA 1IY4A 1VDQA 1B7OA 4WM3A 5KXPA 3ZEKA 4D9ZA 4HPEA 1LZ9A 5B05A 1GFUA 1IX0A 2FYCA 4WM5A 1KIPC 4NGVA 4LT0A 3WPLA 2Z18A 4OW1A 2EIZC 5LYMA 1LJNA 5LINA 1IOQA 3HBEX 3TMWA 2DKVA 4XJDA 1I1ZA 3CT0A 5E9RA 3TXJA 3AZ6A 3W6BA 4RW1A 9LYZA 1LZRA 2CDSA 1LJGA 3WUAA 3WPJA 1NDMC 4G9SA 1HNLA 2HU1A 1C7PA 3GXRA 5KXRA 1GFKA 4H9FA 5JENB 3W6EA 1LSEA 1IP4A 5LVKA 1FLQA 1FKQA 1GHLA 4TSCA 2F30A 4W94A 3KAMA 3LZ2A 5HNLA 1FLYA 4ZFPA 1GB8A 2YBNA 4H9BA 4WO6A 2BQLA 1B2KA 1IWUA 4NEBA 5APDA 4ET8A 3WUNA 1UICA 2ZQ3A 2BQCA 1GAYA 1WQOA 4M4OA 3BKVA 2D4JA 2BLYA 1O23A 1CKDA 3TXDA 1GD6A 3AZ5A 1D0KA 4GCCA 2YBLA 1IC7Y 1J1XY 2CGIA 4PJ2C 5FEKA 3A92A 1HF4A 1CNSA 2BAAA 1GB9A 1LSCA 1LSGA 1IEEA 1W08A 1QUSA 2XBRA 1RI8B 2A7FA 2G4PA 1LZAA 4B1AA 1OUEA 2BQAA 3ATOA 3EXDA 5C6LA 154LA 4H94A 133LA 3A3RX 3A3QA 4NGOA 4QY9A 3FI7A 4TSBA 4NGJA 1EQ5A 1UIEA 2G4QA 3WUMA 5FELA 4DD2A 1LZ4A 3BKHA 4GCEA 3WVYA 5KXLA 1JJ3A 3P65A 4OOOA 1JWRA 4YEOA 3AGGG 5D5CA 2DQFC 3TXIA 3RZ4A 2MEGA 3LYMA 3WPKA 4XJFA 1DPWA 4QGZA 2I26L 1UC0A 1V7TA 1LHIA 4EOFA 1IR7A 1UIAA 3IJUA 4ETAA 5L3IA 1YKZX 4TTDA 5APFA 2NWDX 4DDCA 4GN4A 1AKIA 1B7PA 1FN5A 3T36A 1XGQC 3TMUA 5ILCA 1CJ7A 1GE1A 4ML7A 3WXUA 1IWXA 1IOSA 5AMYA 5KY1A 2BQGA 2IHLA 4I0CA 3TXHA 3ULRA 1DZBX 4XYYA 3SP3A 3EBAB 3IWRA 3TMXA 1HEMA 2HTXA 3N9AA 3P68A 4NSHA 1IWVA 1J1OY 1XSFA 2D4IA 4J7VA 3AYQA 4OOTA 3A91A 3W6DA 3LN2A 1KIRC 1XGRC 1MELL 1GE0A 1IC5Y 1LJEA 1V7SA 5HNCA 3A8ZA 2H9KA 2Z39A 1WTMA 1KIQC 5KXTA 1QSAA 4IASA 4DDAA 1BHZA 1GF9A 1IP6A 1LJHA 1I20A 1WQNA 3G3BB 5L3HA 132LA 1LJKA 2D4KA 1IP1A 1VATA 1OUBA 5K7OA 1NHEA 5I54A 4RW2A 1IO5A 2LYZA 4ETBA 1LSFA 2DQHY 4G49A 5HQ1A 2A7DA 1Z55A 1OQMA 1JEFA 5I4YA 1GE3A 6LYZA 5KXWA 1GF4A 2BQMA 2F4AA 3WMKA 4DD1A 1KXXA 1B7LA 5F14A 3B6LA 4PGJB 1EL1A 4RDSA 4H91A 2LYMA 3D3DA 1JSEA 3CQLA 4NHIA 4DD0A 1UCOA 4MCKA 5B1GA 1JISA 1T6VL 4WM1A 3P64A 4B4IA 4AGAA 1JPOA 1LHHA 1HFYA 2ZIJA 2DBTA 4WLDA 1FKVA 4GN5C 1IOCA 1HSXA 3AGHA 1GF8A 5A3EA 1LOZA 4AXTA 1BWIA 1REYA 2MEBA 4WO9A 5HLLA 3FE0A 4DYGA 3W6FA 4G4CA 5KKJA 1LSZA 1HC0A 4NG8A 4OWHA 1C10A 3G3AB 5LVIA 153LA 2ZWBA 4N5RA 4H8ZA 1GB3A 2YDGA 1IWZA 1GBYA 1OP9B 1OUCA 3A6BY 4NWHA 1XGUC 4WLTA 1GB6A 3B0IA 4GLVA 4HTKA 5LIOA 2BQDA 1LHLA 1YAPA 2FBDA 2XBSA 3WH1A 4QEQA 4GCBA 1OUIA 1GB7A 4NG1A 4M6DA 4ETDA 1LZ1A 1FLUA 1G7IC 1QTKA 4LYBA 1IP5A 4XADA 5FHWA 1LMAA 5DN5A 6LYTA 4H9EA 1LJJA 2B5ZA 2LYOA 1OUGA 2BQKA 4H93A 1LKRA 4LYTA 4A7DA 4ZEEA 1XEJA 1G7HC 3A96A 4HJYA 4NGYA 2ZNWY 1GEZA 1G7MC 1B9OA 1JKDA 1GB0A 1ZVHL 3TXEA 4HP0A 1J1PY 1IY3A 1JKAA 1B0DA 2H5ZA 1G7LC 2W1XA 4OWCA 3RT5X 1DPXA 4LGKA 1LSBA 1CKCA 1C45A 3CT5A 5LYZA 1VDTA 1GF6A 2W1MA 4O34A 1JJ0A 3WW5A 1D6PA 1HFZA 3CB7A 4LT1A 2HEAA 4FJRA 1RCMA 4WM2A 3RU5A 1OUFA 2CJLA 4DT3A 1BWJA 1LJFA 2Z19A 4OWEA 1JTPL 4J0LA 4CFPA 1BWHA 4YOPA 1GF7A 2HEBA 3N9CA 4NFVA 1ZVYB 5LVJA 1XGTC 1CKHA 4WL6A 1GDXA 1JSFA 2F4GA 2I6ZA 1YQVY 1QQYA 3A6CY 1LJ4A 2HEDA 5KXXA 1LZ6A 4TWSA 1DI4A 4KXIA 1TDYA 1BB3A 1BB4A 1N4FA 2YBMA 4UWNA 3TXGA 4HTNA 2ZILA 4MSTA 4J1AA 1QUTA 3WVXA 1C08C 2MEEA 5ILFA 4HV2A 4XJHA 1GDWA 1LMCA 1LYZA 1NBZC 5C6JA 1LYSA 1IWTA 5D5FA 3TXKA 2BQBA 1IIZA 1ALCA 1F6SA 4HV1A 5HMVA 5I4WA 1LSDA 1VDPA 2CWIA 1SLYA 4ETCA 3CSQA 1UIHA 1XFPL 2YBHA 3B72A 1JKCA 2XJWA 1VDSA 4YEMA 4LT3A 1BB5A 4WG1A 1GFAA 2Z38A 4XENA 3CSRA 4X3BA 4DD7A 1YAOA 5E4PA 2ZYCA 4G4HA 3HBHA 1B5UA 4H9CA 5DM9A 1YL1X 1CJ6A 1LZDA 4ETEA 5EBHA 4Z3MA 1OUAA 4RLMA 2GV0A 4U3XB 5FDJA 1B7QA 1B7SA 2H9JA 2BQNA 4P2EA 1GFJA 4NHPA 4II8A 2D91A 1AZFA 2LZ2A 1FDLY 1B7RA 3CSZA 4FDYA 1ZV5L 5APCA 1UIFA 3LYOA 1GFRA 4KPMA 1SQ2L 3LYTA 4WMGA 3WXTA 2YVBA 1WTNA 4OWAA 4YENA 1B5VA 5B59A 5LA5A 4R6CA 4TUNA 1B5XA 1HMKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SX2A 3MGWA 4YXAC 1LZCA 4NWEA 1UA6Y 4WM6A 1NQIA 187LA 4W54A 4B49A 1LHJA 2DQDY 3HUQA 2B6TA 1EPYA 2DQIY 3GULA 1G07A 2DQGY 1L03A 5L9JA 2OU0X 4GCFA 4WG7A 4GN3A 5A3ZA 1YL0X 145LA 3RNXA 147LA 3CT1A 2F32A 1BGIA 2Z2FA 2B6WA 1L76A 1UIDA 1B5YA 4HJZA 1G1VA 1WVVA 4W53A 4EPIA 2Z37A 1WQMA 5LAGA 4KL7A 3HWLA 1G0LA 3W6AA 4H1PA 2RBQA 4EMNA 4NHSA 4N1CC 1GE2A 4Z98A 129LA 4HSFA 3WYHA 2B73A 1UUZC 3F6ZA 3J4GA 1LZBA 5F81A 5KXKA 3GUOA 2W1YA 5KXSA 5B1FA 2FYDA 2Q0MX 1L15A 2ZNXY 3WL2A 1IOTA 2X0AA 4WLYA 5I53A 1NDGC 1JTNA 1L19A 2EPEA 5F9UA 5DN4A 4K5YA 1D0MA 1QIOA 1L12A 1JTTL 5LA8A 4LYOA 1D0LA 3QE8A 2HEEA 1C6IA 1CV0A 4H90A 2YBJA 3C82A 4I7NA 4PHIA 2BQEA 236LA 2D6BA 156LA 1LMOA 5IELA 2IGCA 3CDOA 1QSWA 1L89A 1VEDA 1DKJA 216LA 1NWGA 3HDFA 2QB0B 3OJPA 3SB6A 5APEA 1DYAA 1L02A 3B0OA 5DLAA 3HH5A 170LA 1BVKC 2WARA 1C6NA 3HFMY 4NSJA 3RW8A 1DYGA 1IR8A 1LMQA 1HEWA 4H9AA 5LVGA 2OE9X 4XJBA 5LYTA 1DI5A 130LA 4AQNA 3LZTA 1CVKA 4QDNA 1YKYX 125LA 3SB9A 1BB7A 186LA 4UWVA 1YAQA 3DN6A 1G0KA 1KY0A 1P7SA 1KNIA 4WL7A 4BS7A 1LYYA 2Q9EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4NGW A;  3MGW A;  1JJ1 A;  4B0D A;  1LZC A;  1LZ8 A;  1UA6 Y;  4NWE A;  4WM6 A;  1NQI A;  3E3D A;  3AZ4 A;  4H9I A;  1INU A;  4WLX A;  4B49 A;  4DD3 A;  2AUB A;  1LMP A;  4Z46 A;  3QY4 A;  5J7C A;  1LHJ A;  3AGI A;  1GAZ A;  1AT6 A;  1REX A;  5IDD A;  4C3W A;  1QDR A;  1VFB C;  1YRO A;  2DQD Y;  2DQJ Y;  1RE2 A;  2DQI Y;  4NSG A;  5IHG A;  2LZT A;  1TAY A;  2DQG Y;  5L9J A;  1TEW A;  1UBZ A;  4GCF A;  4WG7 A;  4GN3 A;  3ZVQ B;  5A3Z A;  2ZQ4 A;  1YL0 X;  3RNX A;  1GWD A;  2G4N A;  4XN6 A;  2YSS C;  207L A;  3CT1 A;  1HEN A;  3WUL A;  2Z2F A;  1BGI A;  2HEF A;  3IJV A;  2MEI A;  5II3 A;  4LYC A;  1UID A;  4LYM A;  1B5Y A;  3TXF A;  1XGP C;  3EO5 A;  1LSP A;  4HJZ A;  1WVV A;  1LZG A;  2Z37 A;  1C46 A;  1YAN A;  194L A;  1WQM A;  5LAG A;  4KL7 A;  4H92 A;  3W6A A;  1LSM A;  1HEO A;  2F2N A;  4H1P A;  1GXV 2;  2Z2E A;  4CHX A;  1MLC E;  4NGI A;  1CKG A;  1IWW A;  3EMS A;  5T3F A;  1HEQ A;  2EKS C;  4EMN A;  4NHS A;  4E3U A;  1B7N A;  7LYZ A;  4NIJ A;  1LTM A;  4IJ4 A;  4WM4 A;  4N1C C;  1DI3 A; 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 3RU5 A;  1OUF A;  2CJL A;  4DT3 A;  1BWJ A;  1LJF A;  2Z19 A;  4OWE A;  1JTP L;  4J0L A;  4CFP A;  1BWH A;  4YOP A;  1GF7 A;  2HEB A;  3N9C A;  4NFV A;  1ZVY B;  5LVJ A;  1XGT C;  1CKH A;  4WL6 A;  1GDX A;  1JSF A;  2F4G A;  2I6Z A;  1YQV Y;  1QQY A;  3A6C Y;  1LJ4 A;  2HED A;  5KXX A;  1LZ6 A;  4TWS A;  1DI4 A;  4KXI A;  1TDY A;  1BB3 A;  1BB4 A;  1N4F A;  2YBM A;  4UWN A;  3TXG A;  4HTN A;  2ZIL A;  4MST A;  4J1A A;  1QUT A;  3WVX A;  1C08 C;  2MEE A;  5ILF A;  4HV2 A;  4XJH A;  1GDW A;  1LMC A;  1LYZ A;  1NBZ C;  5C6J A;  1LYS A;  1IWT A;  5D5F A;  3TXK A;  2BQB A;  1IIZ A;  1ALC A;  1F6S A;  4HV1 A;  5HMV A;  5I4W A;  1LSD A;  1VDP A;  2CWI A;  1SLY A;  4ETC A;  3CSQ A;  1UIH A;  1XFP L;  2YBH A;  3B72 A;  1JKC A;  2XJW A;  1VDS A;  4YEM A;  4LT3 A;  1BB5 A;  4WG1 A;  1GFA A;  2Z38 A;  4XEN A;  3CSR A;  4X3B A;  4DD7 A;  1YAO A;  5E4P A;  2ZYC A;  4G4H A;  3HBH A;  1B5U A;  4H9C A;  5DM9 A;  1YL1 X;  1CJ6 A;  1LZD A;  4ETE A;  5EBH A;  4Z3M A;  1OUA A;  4RLM A;  2GV0 A;  4U3X B;  5FDJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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