3WW6A

Crystal structure of hen egg white lysozyme mutant n46d/d52s
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRDTDGSTSYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Effect on catalysis by replacement of catalytic residue from hen egg white lysozyme to Venerupis philippinarum lysozyme
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ww6A00
1Z55A 5DLAA 1XEKA 3ZVQA 4WOAA 1D9UA 2W1XA 1LSYA 1OUDA 4LZTA 4NGZA 4UWUA 3A67Y 4J1AA 1HMLA 1CJ6A 5KXSA 4MR1A 5I4WA 2AUBA 1C45A 1UIFA 1QDRA 2HTXA 4NHPA 1AT5A 5LXWA 1XGRC 2IHLA 1A2YC 4B49A 1BWIA 4H93A 2Z39A 5F9UA 1XEJA 4P2EA 3T36A 1LZYA 4Z41A 4ETBA 1SQ2L 4DC4A 2BPUA 1YAPA 2HEDA 5DN4A 1LJFA 1GF9A 2Z19A 3IJVA 3KAMA 3M3UA 4TTDA 1BB6A 3P66A 2VB1A 4GN5C 1RE2A 2I25L 1LSCA 1GHLA 133LA 5F16A 4OWBA 1GFJA 4M4OA 2MEGA 2H9JA 4OWCA 1INUA 1LKRA 1FKQA 1BB7A 1VDSA 4GCBA 4HPIA 2ZNWY 1UC0A 1GE4A 2F4AA 1REXA 2LYOA 2DQCY 4N5RA 5HLLA 1NBYC 4H1PA 1ZVHL 1JTOL 3WW6A 1CKHA 4H8ZA 1UIAA 1LZGA 4LGKA 5HNLA 1B7RA 4NHTA 4LFPA 3RW8A 3WPJA 1VDTA 2LZ2A 4H90A 3WH1A 1B5XA 5APDA 1WQOA 1IOCA 4RW1A 4H9HA 4B4JA 4BAPA 4H9IA 1C08C 4I0CA 4A7DA 6LYTA 1B5VA 1IWUA 1GB6A 2HEFA 3TMUA 5B05A 1H87A 154LA 1EQEA 4NHIA 4YEOA 2BQNA 2Z37A 207LA 1LAAA 1B7NA 1JEFA 1G7LC 1UUZC 1WTNA 3CSQA 2CGIA 2RSCA 1F6SA 5KY1A 1EQ4A 1BWHA 1GFRA 2BQIA 3CSZA 1REMA 4HTNA 1QDTA 1NWGA 3EXDA 7LYZA 4NY5A 1XGUC 1XGQC 2W1MA 3B0IA 1IWTA 3TXJA 1KIQC 1B7QA 1NMMA 1I20A 4NGYA 3ATOA 1RI8B 4QEQA 5KXLA 1REYA 5LAFA 4WM1A 3B0KA 1LMPA 4TUNA 4YM8A 1QIOA 5KXKA 1FLYA 1OUBA 2HEAA 5C6IA 3LHMA 1B5UA 2BLXA 2MEIA 1YILA 1B5YA 1GE3A 2D4IA 4H9EA 1YIKA 1B0DA 1QUTA 1T3PA 1GF0A 3AGGG 5M1YA 1GBWA 4B4IA 4XJFA 2ZQ3A 3WYHA 4NHSA 5J7CA 3OK0A 4H94A 1LZBA 1F0WA 1G7IC 4PHIA 1IVMA 1OUCA 3IWRA 5C6LA 1E8LA 4NG8A 4D9ZA 1C10A 1HEWA 1WVVA 1GDWA 4G9SA 3QY4A 4NGKA 4OWEA 4PRUA 1CKCA 1JKDA 1GEZA 4RW2A 4XJGA 4CGEA 2HEEA 2BQAA 5LVIA 3TXFA 4ZEEA 2Z38A 3ATNA 4ETCA 2EKSC 4C5FA 1GAYA 5LINA 1DI3A 1IWZA 2DQAA 2LHMA 5L3IA 1NQIA 1LJKA 1XGTC 4H92A 1UIDA 1IEEA 2BQJA 3B0OA 4GLVA 4ML7A 1AM7A 1DXJA 1GB0A 1W6ZA 6LYZA 5LVJA 4DYGA 1GFUA 1PZYA 4HTQA 1GFAA 4L41A 4Z46A 1VDPA 4LT3A 1LZ1A 1G7HC 1LMAA 1GXXA 4Z98A 1GFVA 1AZFA 5LA5A 4PJ2C 3N9EA 4G4BA 1BQLY 2YBLA 4DDAA 5KXYA 3W6DA 2YBMA 2ZILA 1IR8A 1B5ZA 3QNGA 1H6MA 5F81A 1OUAA 3CB7A 1HNLA 4GLAA 4RDSA 4WM5A 5DM9A 4HV1A 4B4EA 3WMKA 1UIHA 1XSFA 1VFBC 4YF2A 3D3DA 1HFXA 1DI4A 4IASA 5HMJA 5KXPA 5T3FA 1IY4A 5KKIA 1FBIX 1GB7A 1GFHA 1LKSA 4OWAA 4ZFPA 3GXRA 3J4GA 1FLWA 4DWXA 2CDSA 8LYZA 1JISA 1LHMA 1DI5A 1GPQC 1JIYA 1OUEA 2I26L 3TXIA 1SLYA 3N9CA 2ZNXY 1HEMA 1HMKA 5FEKA 4PGJB 1HSXA 4ETDA 2HECA 2DQGY 1IC4Y 5KXRA 1HENA 4GCDA 4WO9A 3WL2A 1ZMYL 1GF5A 1IWVA 1KXYA 1LYSA 2BQFA 2DKVA 1LSNA 5L3HA 4B0DA 4CHXA 2F30A 2WARA 5C6JA 1IOSA 1HEPA 1C46A 2YBIA 2HEBA 2MEDA 3ULRA 3W6AA 3TXBA 1VATA 1C7PA 1MELL 4NSGA 4KXIA 4XJDA 1ALCA 1IORA 4PRQA 1UIEA 3HBEX 4J1BA 2BQMA 5B06A 4O34A 1LYOA 1YQVY 1GWDA 5F14A 4XN6A 3W6FA 3P68A 3LN2A 2FYDA 1GAZA 5KXXA 4RLNA 1IWWA 3IJUA 5LYMA 1D0KA 4ZIXA 2LZTA 4NSJA 1GFKA 5KXZA 1GF7A 1BWJA 1JTTL 4NSIA 1HSWA 1LZ8A 1LZ5A 2D6BA 4NGVA 1GBOA 2MEBA 4EOFA 1LSEA 2BQEA 3A8ZA 3AW6A 5DL9A 2Z18A 3P4ZA 5I4XA 5LYZA 1GEVA 1LPIA 3LZ2A 4AGAA 5KKJA 3WPKA 3TXDA 1LZ6A 3OJPA 5D5FA 2GV0A 4CFPA 1JTPL 4MCKA 4R6CA 4GCFA 1LSFA 1UBZA 4H9CA 4BADA 1A4VA 5ILFA 3HFMY 1YL1X 4WL7A 2PC2A 3AW7A 4NIJA 3VWOA 1WTMA 1CJ8A 1J1OY 4DD9A 5DN5A 1D6QA 2ZIKA 5K7OA 1GB5A 132LA 2YBNA 3LYZA 2F4GA 4WLDA 4N9RA 4ANRA 4GN3A 1DPXA 1HFZA 2MEAA 3TXKA 1BB3A 1TCYA 4HP0A 4J0LA 1V7SA 1YKZX 4HV2A 2FYCA 1LHIA 1JJ3A 1GE1A 1HELA 1LHLA 1QQYA 2C8OA 3W3EA 1GB3A 1HHLA 4KL7A 5KXTA 1GBYA 1JUGA 2A7FA 2DQEY 1PS5A 2D91A 1LMQA 1KIRC 3AGIA 5LAGA 1RCMA 1XEIA 1GD6A 1YL0X 1OQMA 1CKFA 193LA 1LSGA 1OUGA 3LZTA 5LVHA 4DT3A 1YANA 4H9FA 4IATA 3CQLA 1LMNA 1KIPC 1LSMA 1EQ5A 2BQCA 1LZSA 4BS7A 5JENB 4UWNA 1B7OA 1GF4A 4II8A 1YAOA 5E9RA 4TSBA 2ZWBA 1LHKA 3EO5A 4TX7A 3WVYA 4ET9A 2YDGA 2BQGA 4YENA 3FE0A 2BQDA 3QE8A 4C3WA 4W94A 1XGPC 2YBJA 2BQOA 5APEA 4LT1A 5II3A 4H9BA 5B1FA 1JKBA 3BKHA 1HFYA 4G4HA 2LYMA 4GCCA 4OOOA 4WMGA 5F9XA 1ZV5L 5FHWA 3A94A 2C8PA 1LZ9A 1FLUA 4WM3A 1YKYX 1OUJA 4QY9A 2BAAA 5FDJA 2EIZC 3HBHA 1IP7A 1KXXA 1QSAA 4UWVA 4NGWA 5I54A 2LYZA 3WU8A 1EL1A 5E4PA 1LHJA 5FSTA 1GB8A 2DQIY 4DD2A 1DPWA 1GDXA 1I1ZA 1LMOA 1QSWA 1LCNA 4J7VA 5A3ZA 1B5WA 3WUAA 1LYZA 4LT0A 1JKCA 4HJYA 3A6CY 1GFGA 5FCPA 4FDYA 1LJ4A 1TBYA 4XJHA 1FN5A 2ZYCA 2ZYPA 1IO5A 1N4FA 1VAUA 4LYBA 4WO6A 4X3BA 1LZNA 1UCOA 3TMWA 3RU5A 4U3XB 1RFPA 3AGHA 4LT2A 1LTMA 1B7MA 4RLMA 4TWSA 2X0AA 1TDYA 1ZVYB 5LVKA 4LYMA 4I8SA 1GFTA 4QGZA 1LZDA 3TMVA 1IP2A 3AZ7A 4G49A 2D4KA 1JJ0A 4CJ2A 4IJ4A 2G4NA 4W96A 4DDCA 1UACY 2EPEA 2MECA 2NWDX 4XENA 5LA8A 3G3AB 2EQLA 4H9AA 2MEEA 4N0JA 2HU1A 1IC7Y 5FELA 5KXOA 1G7MC 2I6ZA 3CT1A 1LJIA 1B2KA 2BLYA 1NDMC 1BB4A 1OUHA 3AZ5A 2HU3A 3FI7A 3G3BB 4N1CC 1GF8A 3RZ4A 1WQNA 2H5ZA 3WPLA 3A90A 5L9JA 1D6PA 4MSTA 1MLCE 1JPOA 1CJ7A 1AT6A 3AYQA 4NWEA 1LZRA 2H9KA 3LYTA 3B6LA 1RJCB 3W6BA 3AB6A 3GXKA 4WM2A 1DKKA 4NSHA 4XADA 3WUMA 5HNCA 1IP3A 1B7PA 5IHGA 1VEDA 4NWHA 1JSFA 1QUSA 3MGWA 4XJBA 1LJEA 1J1XY 3AZ6A 4H91A 3EMSA 4HJZA 4NGOA 4WLXA 4WG1A 3SP3A 1F10A 4R0FA 1OP9B 2Z2EA 3W6CA 2BQBA 1B7SA 4DD1A 1LSDA 1XFPL 5KXMA 4NFVA 2MEFA 1GFEA 1O23A 4B1AA 1LZEA 1QTKA 1HEQA 2G4QA 3RNXA 2ZQ4A 4H8XA 4NGLA 3WW5A 3WULA 3A93A 3WXTA 2BQLA 2YBHA 1HC0A 1T6VL 2DBTA 2MEHA 1DZBX 4E3UA 3WU7A 1JHLA 1DKJA 3P65A 2DQDY 1G7JC 4Z3MA 2FBDA 5KJ9A 3AJNA 9LYZA 1HF4A 1UIGA 2IFFY 1LHHA 1NHEA 1CJ9A 1JKAA 1FLQA 1LJHA 2DQJY 1JITA 2CJLA 4NEBA 5D5CA 1LJ3A 1WQPA 153LA 3EBAB 3LYOA 1IC5Y 1GBZA 4WL6A 4GN4A 1WQMA 3ZVQB 1LZ4A 1LSZA 1LYYA 1REZA 2A7DA 5I53A 1HEOA 1YAMA 1IP6A 3A92A 4QDNA 1GE0A 4TSCA 3A3QA 4WG7A 5IDDA 4LYZA 1JSEA 2Y8PA 1CKDA 4HSFA 4BAFA 5HMVA 2Q0MX 3N9AA 2ZIJA 1NF5A 3WUNA 3HBDA 1LJJA 1GBSA 5A3EA 4WLYA 5I4YA 3A96A 2D4JA 1JWRA 5KXWA 1BVXA 1C43A 3CT5A 1BGIA 1LMCA 1WVUA 5HQ1A 2XBSA 1LSBA 5EBHA 3ZEKA 4LYCA 2XTHA 4DD3A 1TAYA 1QTEA 5AMYA 1GB9A 1NBZC 1IWYA 3A95A 4PPOA 2DQFC 4H8YA 1AKIA 1GB2A 1JJ1A 4DDBA 1OUFA 4XJIA 1IOQA 4LYOA 1GF3A 1BVKC 1CKGA 1FDLY 2Z2FA 1IOTA 1GBXA 4LYTA 4OW1A 3RT5X 4EMNA 3WVXA 3BKVA 134LA 2DQHY 1B9OA 1VDQA 1YROA 3D9AC 3P64A 1BB5A 2Z12A 3T6UA 5ILCA 3A91A 3A3RX 5I5QA 4DD7A 4LFXA 5LVGA 5LYTA 1NDGC 1D0MA 4AXTA 3A6BY 3TMXA 1LJNA 2XJWA 4WLTA 1B7LA 2YSSC 5LIOA 2FBBA 4M6DA 3WXUA 3F6ZA 1GE2A 1TEWA 2XBRA 4HTKA 1UICA 1KXWA 1V7TA 194LA 1WQRA 2N5ZA 1LSPA 4HPEA 1IY3A 1UIBA 4YOPA 5IELA 4WM4A 1YAQA 1I56A 3J6KA 4NGJA 4NGIA 4XYYA 1LMTA 1IR9A 4ET8A 5APFA 3B72A 2W1LA 1CNSA 1IR7A 4OOTA 3TXGA 4HJVA 1IIZA 2W1YA 3K3TA 208LA 4FJRA 1F6RA 3CSRA 3AZ4A 1IP1A 2BQHA 5B1GA 2F2NA 2B5ZA 1IP5A 3M18B 4KPMA 135LA 2G4PA 5KXNA 4ETAA 1J1PY 1BHZA 1UA6Y 3TXHA 2BQKA 5B59A 1LJGA 1P2CC 4NG1A 4YEMA 4KT3A 3W6EA 1DQJC 1IX0A 1HERA 1LZAA 4WM6A 1FKVA 4ETEA 1NKHA 1LOZA 1LSAA 3A34A 5B07A 4DD0A 1LZTA 1IWXA 4NHQA 3E3DA 2HUBA 1WQQA 2CWIA 4N8ZA 5APCA 1YKXX 2YVBA 1D0LA 1GXV2 4G4CA 4OWHA 1W08A 3LYMA 3TXEA 4CFOA 4N1EI 1LZCA 1IP4A 1OUIA 1GF6A 3CT0A 4GCEA 3WU9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D2WA 1L01A 200LA 1L77A 1T8GA 5KXSA 5I4WA 1LPYA 1C45A 1UIFA 1QDRA 4NHPA 1AT5A 1QS9A 1LZYA 1SQ2L 220LA 1LJFA 1GF9A 2Z19A 3DN4A 1G0KA 1P37A 3M3UA 2VB1A 3C80A 1RE2A 1B6IA 1GHLA 4S0WA 3HDEA 1INUA 1LKRA 4GCBA 2ZNWY 119LA 1UC0A 2LYOA 120LA 1L65A 1ZVHL 1JTOL 1C62A 1KS3A 4H8ZA 3HTGA 1LZGA 5HNLA 1B7RA 1QTCA 2LZ2A 5APDA 4RW1A 4B4JA 3TMUA 2RBOA 4YEOA 1D2YA 1B7NA 1G7LC 1LAAA 3CSQA 1F6SA 1BWHA 3EXDA 4NY5A 2W1MA 3B0IA 1I20A 4QEQA 4WM1A 1G0LA 1LMPA 1QIOA 1OUBA 4LDOA 1B5UA 1YILA 205LA 1YIKA 5M1YA 3AGGG 4EKQA 3WYHA 3OK0A 1LZBA 1OUCA 3IWRA 1E8LA 4OWEA 1L91A 4CGEA 2HEEA 5LVIA 148LE 2EKSC 1TLAA 1L49A 111LA 1XGTC 4H92A 1L81A 1P36A 2RAZX 2OU8A 4HTQA 1L53A 2O4WA 4L41A 245LA 1VDPA 1P6YA 1L50A 1BQLY 2YBLA 3W6DA 1L56A 3QNGA 2HUMA 5DM9A 4ARLA 4YF2A 1OYUA 2B6XA 112LA 1C6MA 5HMJA 127LA 5T3FA 2OU0X 143LA 4ZFPA 3GXRA 1FLWA 4DWXA 3TXIA 1SLYA 156LA 2DQGY 209LA 1LYSA 1LSNA 3HT8A 2F30A 2WARA 1IOSA 3W6AA 3TXBA 1MELL 1ALCA 1IORA 1NHBA 4PRQA 3HBEX 4O34A 1YQVY 3G3WA 3P68A 1GAZA 4LDLA 4RLNA 1D0KA 1BWJA 1L69A 1L64A 3SB9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1Z55 A;  5DLA A;  1XEK A;  3ZVQ A;  4WOA A;  1D9U A;  2W1X A;  1LSY A;  1OUD A;  4LZT A;  4NGZ A;  4UWU A;  3A67 Y;  4J1A A;  1HML A;  1CJ6 A;  5KXS A;  4MR1 A;  5I4W A;  2AUB A;  1C45 A;  1UIF A;  1QDR A;  2HTX A;  4NHP A;  1AT5 A;  5LXW A;  1XGR C;  2IHL A;  1A2Y C;  4B49 A;  1BWI A;  4H93 A;  2Z39 A;  5F9U A;  1XEJ A;  4P2E A;  3T36 A;  1LZY A;  4Z41 A;  4ETB A;  1SQ2 L;  4DC4 A;  2BPU A;  1YAP A;  2HED A;  5DN4 A;  1LJF A;  1GF9 A;  2Z19 A;  3IJV A;  3KAM A;  3M3U A;  4TTD A;  1BB6 A;  3P66 A;  2VB1 A;  4GN5 C;  1RE2 A;  2I25 L;  1LSC A;  1GHL A;  133L A;  5F16 A;  4OWB A;  1GFJ A;  4M4O A;  2MEG A;  2H9J A;  4OWC A;  1INU A;  1LKR A;  1FKQ A;  1BB7 A;  1VDS A;  4GCB A;  4HPI A;  2ZNW Y;  1UC0 A;  1GE4 A;  2F4A A;  1REX A;  2LYO A;  2DQC Y;  4N5R A;  5HLL A;  1NBY C;  4H1P A;  1ZVH L;  1JTO L;  3WW6 A;  1CKH A;  4H8Z A;  1UIA A;  1LZG A;  4LGK A;  5HNL A;  1B7R A;  4NHT A;  4LFP A;  3RW8 A;  3WPJ A;  1VDT A;  2LZ2 A;  4H90 A;  3WH1 A;  1B5X A;  5APD A;  1WQO A;  1IOC A;  4RW1 A;  4H9H A; 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 2Z2F A;  1IOT A;  1GBX A;  4LYT A;  4OW1 A;  3RT5 X;  4EMN A;  3WVX A;  3BKV A;  134L A;  2DQH Y;  1B9O A;  1VDQ A;  1YRO A;  3D9A C;  3P64 A;  1BB5 A;  2Z12 A;  3T6U A;  5ILC A;  3A91 A;  3A3R X;  5I5Q A;  4DD7 A;  4LFX A;  5LVG A;  5LYT A;  1NDG C;  1D0M A;  4AXT A;  3A6B Y;  3TMX A;  1LJN A;  2XJW A;  4WLT A;  1B7L A;  2YSS C;  5LIO A;  2FBB A;  4M6D A;  3WXU A;  3F6Z A;  1GE2 A;  1TEW A;  2XBR A;  4HTK A;  1UIC A;  1KXW A;  1V7T A;  194L A;  1WQR A;  2N5Z A;  1LSP A;  4HPE A;  1IY3 A;  1UIB A;  4YOP A;  5IEL A;  4WM4 A;  1YAQ A;  1I56 A;  3J6K A;  4NGJ A;  4NGI A;  4XYY A;  1LMT A;  1IR9 A;  4ET8 A;  5APF A;  3B72 A;  2W1L A;  1CNS A;  1IR7 A;  4OOT A;  3TXG A;  4HJV A;  1IIZ A;  2W1Y A;  3K3T A;  208L A;  4FJR A;  1F6R A;  3CSR A;  3AZ4 A;  1IP1 A;  2BQH A;  5B1G A;  2F2N A;  2B5Z A;  1IP5 A;  3M18 B;  4KPM A;  135L A;  2G4P A;  5KXN A;  4ETA A;  1J1P Y;  1BHZ A;  1UA6 Y;  3TXH A;  2BQK A;  5B59 A;  1LJG A;  1P2C C;  4NG1 A;  4YEM A;  4KT3 A;  3W6E A;  1DQJ C;  1IX0 A;  1HER A;  1LZA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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