3WXJA

Crystal structure of trypanosoma brucei gambiense glycerol kinase in complex with glycerol 3-phosphate
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
513
structure length
513
Chain Sequence
FTMKYVGSIDQGTTSTRFIIFDERQRPVSVHQVPHTQHTPHPGWLEHDPMEIFRSACKCMSVAIAKLRQKDASFRKIEAIGITNQRETTVAWDRVTKEPLCYAPVWNDLRTYDITKKVTAELGGGDSMFASKITGLPVSTYFAAFKMRWMLENVPAVADACRRGTLCFGTIDTWLMYKLSGGKAFVTDVTNASRTFLMDLRTRKWSPELCEKLKIPMETLPEIRSNSELFGYVETDECGVAAALNERTPIMGSIGDQQSALFGNMCFEKGEAKNTYGTGCFLLMNVGEEARFSKHGLLSTVGFQVGRDGPCYYALEGAIACAGATVEWMRRNMNLFSHITECEKLARSVPGTQGIVFVPAFSGLLAPYWDPSARGTIVGMTLKTTRAHVIRAALQAIALQLNDVVGSMKRDAGLNLSSLRVDGGLSKNGLLMEIQASLLGVDILVPSMHETTALGAALCAGLAAGVWTSLEEVKAVSRRENSWKTVSPSGSAMEREAMIAEWREALKRTKWAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Molecular basis for the reverse reaction of African human trypanosomes glycerol kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei gambiense
molecule tags Transferase
total genus 158
structure length 513
sequence length 513
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2014-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxjA01
5AQKA 2H3GX 3ZETB 5ELZA 5BPLA 4BROA 1E4FT 4B9QA 3D2FA 4FWOA 3ULEB 2QWMA 4WQ5C 2ZGYA 4ISEA 3M3ZA 4H5NA 1NGHA 2E2NA 2A42A 3DXMB 3EZWA 4IWVA 3RSEA 3GOIA 1JCFA 2E2QA 4XEIA 3ZETA 1EQYA 2FSNA 4H5TA 1U6ZA 2V7YA 4EHUA 4CZGA 2GWKA 1HPMA 3HBTA 1NGFA 1HLUA 4BRFA 3FZKA 2QWRA 5F1XA 3EKSA 3L4IA 2YI1A 4LC9B 2AA4A 2P9SB 1TYQB 4WQ5A 1T6CA 2J4RA 1GLEG 5LJWA 4H03B 1X9JA 2VWBA 2PBDA 1C0GA 5BN9A 5BR9A 2GTDA 4GY2B 5EOYA 1MA9B 4DB3A 1ZXOA 2P9KB 3QMLA 4L3QA 4M63C 1QZ6A 4CBUA 1HKCA 4A2AA 3OHRA 4BC4A 3GBTA 3WEEA 3O4WA 4CBWA 2IVPA 4BQZA 3SLCA 1KXPA 5FPEA 4CZIA 3FGUA 3KVGA 4XH5A 4CJ7A 1ZC6A 1ATSA 2QWOA 1ATNA 3GE1A 4B1UB 4CI6A 5EY4A 2P9NB 2GELA 1KAXA 3UE5A 3VEXA 3EN9A 3EO3A 1YVNA 3WUHA 4FWMA 4BRHA 4BG8A 5I9EB 2HOEA 2Q1NA 1K8KA 3ID8A 3LM2A 4CZKA 4IZ9A 1HKBA 4FWPA 3CJCA 4H0PA 3FZMA 3FZFA 2VCPA 1BDGA 4H5WA 3FZHA 2P9LB 2V52B 4F9OA 3B8AX 4EIAA 3BF3A 3UKRA 3LDPA 5AQUA 4BRPA 3M1FA 4B1XB 4XH1A 1NBWA 5BRHA 4BRDA 1YXQA 2F9WA 4BREA 5AQFA 1XC3A 2CGLA 1NGBA 5KPTA 2ZGZA 3O80A 4AM6A 4CD3A 4FPAA 3VOVA 2QM1A 4FWRA 1LOTB 5AQPA 3H3OB 3ZX3A 3IDHA 1GLJO 3A8YA 3O6WA 5JLHA 1NGDA 5LJVA 2CH5A 2FF6A 4CZHA 4K41A 3CETA 2QW9A 1YUWA 3I33A 2P9UA 2YHWA 4H0XB 3H46O 4FL9A 1U2VB 2P9PA 3LDNA 4IXCA 5FPMA 3BF1A 4CZMA 2ZWHA 1J6ZA 5AZIA 4I6MB 4PL7A 2KHOA 1BU6O 3QFUA 1RFQA 1X3NA 4O5FA 3D2FB 4MLEA 4FPBA 2PAVA 3CJ7A 3UKUB 3VESA 1KAZA 3L6QA 3GG4A 3QB0A 2NZTA 3RSEB 3J8AA 4I6MA 5B8HA 3A5NC 2E1YA 4BRLA 2A6AA 2GEMA 3KHYA 1NGIA 2YHXA 3UKUA 4FWLA 1IG8A 3O1WA 1RGIA 4NO7A 1DEJA 5AQXA 5KQDA 2A5XA 4CZLA 4JD2A 3MN6A 3SK3A 3H3NO 3ZEUA 3TU5A 5F0XA 3WXKA 3FR0A 3WT0A 3VF6A 3D2EA 4BR5A 1HUXA 3BEXA 3I8BA 1JCGA 5JICA 1E4GT 1SQKA 4JAXA 1HJOA 3O8MA 4K43A 5JLFA 4QS9A 4IJAA 4BGAA 4CD1A 3ATVA 5CE3A 2Q0UA 1GLAG 3A5OC 3WEEB 4BRGA 1GLDG 2QWQA 4BC2A 2NRHA 2F9TA 2A40A 5FPDA 3GL1A 4MO5A 4B1WB 5ADXH 4KBOA 3QFPA 2YJEA 1D4XA 2W41A 4A62A 2IIRA 3IMXA 3VEVA 5E26A 3MK6A 3WXIA 3A5LC 1NGCA 1Q18A 4PKHA 2CGJA 4GNIA 5AQZA 4A2BA 3C7NA 3JXUA 1K8KB 2CGKA 4C23A 1QQOA 4BGBA 1MDUB 3UB5A 2QWLA 4E1JA 3FLCO 1G99A 2Q2RA 3ZX0A 2ASMA 3VF4A 4YDUC 3LM9A 3UKRB 3LL3A 1XUPO 4PKGA 3VENA 4FSVA 4M7YA 5ADXA 1NMDA 4JHDA 2E2OA 1NM1A 3CQXA 3W3DA 1C0FA 3ZX2A 2IVOA 3SMSA 5EVZA 4K42A 3R6MA 3G25A 3VGLA 2P9IB 1H1VA 1TUUA 3H45C 3TPQA 2GUPA 5AQVA 4RTFD 4YDUA 4HWIA 1NGAA 3M6GA 4RCHA 2FLOA 3O5BA 1CZAN 2QWNA 3LDOA 2GWJA 3IFRA 5BREA 2P9IA 5FPNA 2BUPA 2P9UB 4Z94A 5EXWA 1RDWX 3F9MA 1BG3A 3MCPA 4CZFA 2D1KA 2P9PB 3HM8A 4EFHA 3VF2A 4H0TB 4QS7A 5AQHA 5AZIB 5E84A 3CERA 2E1ZA 1NWKA 1MWKA 3ENHA 3SJHA 4BRQA 1BOTO 1QZ5A 3CJBA 2V7ZA 5KPZA 1IJJA 2E2PA 3KZBA 3WQUA 1YAGA 1XQSC 5BRFA 1T44A 3AY9A 2FSJA 2VYPA 1Z6RA 2FSKA 5AQQA 3VPZA 2Q36A 3ATUA 2A41A 1SZ2A 3CJ9A 4BRIA 4ISGA 2W40A 3IUCA 4JD2B 2Q0RA 5AZJA 4BVOA 2HMPA 3O08A 3ZEUB 3H6EA 4BR4A 5KQ8A 1GLLO 1NGEA 4CZJA 3D2EB 4AM7A 2ASPA 1BWFO 1QHAA 3HTVA 1ESVA 5AQGA 2YJFA 5AQYA 1ATRA 2BTFA 4XH4A 1QQMA 4FOIA 3DXKB 2I7NA 4JNEA 1BA0A 5AQIA 5KPRA 3MN7A 1BO5O 2FF3B 3R9PA 5AQOA 3U9DA 2E20A 4BR2A 2D0PA 1T6DA 1NLVA 3U9ZA 3AARA 2ASOA 2E8AA 3DXKA 1HKGA 4HTLA 4BR9A 4EHTA 1ZBSA 1QQNA 4EAHD 4BRCA 5AQTA 2QXLA 5AQNA 3ULEA 4BQLA 1SAZA 4CZEA 4QS8A 1V4TA 1X3MA 3DWLA 3L0QA 3C7NB 3MN5A 5AQSA 3DXMA 3LDLA 4H0OA 3EKUA 4WYBA 4NB4A 3GDQA 3SMPA 2WUSA 4DHYA 4BRAA 3S41A 2A3ZA 3FFKB 5BPMA 4BRNA 4BC3A 3BP8A 5EX5A 2ZF5O 3CJAA 5LY3A 3JS6A 4IJNA 2ITMA 4FWKA 1BUPA 3A0IX 4BVPA 1GLFO 4ISFA 3MDQA 2P9SA 1TYQA 3CIPA 4JHDB 5AFUH 4B1ZA 3QBXA 4PKIA 1LCUA 4BRMA 3VEOA 5F2RA 2D4WA 3DAWA 4JN4A 2YHYA 2QWPA 3H1VX 1V4SA 4BG9A 4J8FA 1WUAA 2Q97A 2YCHA 4FWNA 4PL8A 3VEWA 2P9KA 4BR0A 2OANA 2FXUA 5BRDA 1HX1A 3LDQA 1P8ZA 1OKJA 4FWQA 3ENOA 3WQTA 1DKGD 3AAPA 3CJ1A 5AQRA 4BC5A 2IVNA 4O8KA 5AFUA 5AQMA 4IO8A 3FE1A 5TKYA 3H1QA 3VEZA 2HF3A 1NGGA 2P9NA 4FOEA 1WOQA 4WQ4C 4B1VA 4DCHA 4B1YB 1Z05A 3P4IA 2E88A 5JMVA 1TUYA 1NGJA 3HSCA 3VGKA 3O1BA 1R59O 4RWTA 4K25A 1KAYA 3BUZB 5AQLA 2UYTA 3MN9A 1MWMA 3U8XA 4MLHA 3FZLA 1GLCG 5AQJA 2I7PA 2P9LA 3DJCA 2EWSA 4Y0WA 3EL2A 2V51B 4WQ4A 5AZJB 3MMVA 4BR7A 3U4LA 3R8EA 1S3XA 1DGKN 1Y64A 4H5VA 3VEYA 3QDKA 2DPNA 4A61A 5AR0A 3VETA 3WXJA 4MO4A 1BA1A 4H0VB 2AP1A 4H0YB 3W0LA 4CBXA 1JCEA 5AQWA 4M7XA 1GLBG 4FWSA 3AAQA 3A5MC 4BRKA 3D7EO 2CH6A 3CI5A 3HZ6A 3CQYA 4H5RA 4FO0A 3C0BA 2NLXA 3QBWA 3VERA 1S22A 4DQ8A 3WXLA 3HI0A 2D0OA 1U2VA 2Q31A 5BN8A 3QICA 2HF4A 3CHWA 3VGMA 5BPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BROA 2E6MA 3OBWA 2QWMA 3QEXA 4WQ5C 1KFDA 3OW2M 4H5NA 1NGHA 2E2NA 2HSTA 2OPPA 2IC3A 1NK4A 4FJGA 1JCFA 1QTMA 4GV9A 1EQYA 4H5TA 2G8HA 2V7YA 1LWCA 1NGFA 4BRFA 2QWRA 5C10A 2D0AA 3V9UA 4DQPA 5F1XA 2HMIA 3S3NA 3L4IA 2YI1A 3QLHA 2P9SB 1R0AA 2YX6A 3P39A 4BDZA 3ALYA 1GLEG 4H03B 4BE1A 1WSJA 2PBDA 1WSHA 4DB3A 2IAJA 2P9KB 1VSLA 4F4KA 1CXQA 1OH7A 4M63C 4KH4A 1WN7A 3B6PA 4Z4IA 3WEEA 3O4WA 3CD6N 4CBWA 3SLCA 3AVBA 3DM2A 5KRTA 4CJ7A 4XH5A 4WFBL 3KK7A 4X64K 1ATSA 4CI6A 3T3FA 4ZHRA 3H08A 3VA0A 4EP5A 2UXCK 1KAXA 2BGGA 1A5XA 1YVNA 5SWMA 3PX6A 4FWMA 4BRHA 1EX4A 3QERA 2Q1NA 2YKMA 3THWA 4ELVA 3LM2A 4CZKA 5C2DA 3CQ8A 4FWPA 3IKMA 4H0PA 4MFBA 4Y1CA 2OZSA 3SBTA 2P9LB 3O9RA 1VQPN 3UKRA 3BF3A 3TSQA 2KFNA 2Q3SA 3KIOA 4B1XB 4DF8A 3VQ8A 4DTJA 2CGLA 1NGBA 1OVQA 4CD3A 1ZBLA 1S9EA 3S3OA 3H3OB 3HPOA 3VN5A 3A8YA 4QCLA 2KKZA 4FCYA 2CH5A 2HHSA 4IDKA 1RCHA 1YUWA 4H0XB 3BF1A 3HM9A 4CZMA 2ZWHA 3VQ6A 2AJQA 1XNRK 1BU6O 2RF2A 4O5FA 1J53A 3D2FB 4CERA 3TAGA 1U47A 3VESA 3KD5E 4KHNA 3GG4A 4BE0A 3E9OA 4B9MA 2E1YA 2A6AA 4CF1A 1VHXA 1EETA 3QIPA 3F73A 5C25A 3KHYA 4F2SA 3UKUA 4FWLA 1WSGA 1IG8A 1KVCA 1B9FA 4NO7A 3HSTB 3LAMA 4CZLA 1B92A 3G71N 3RR7A 3SK3A 1B9DA 4DG1A 4CGDA 1L3SA 2ZJPL 3H3NO 1T3VA 4O0IA 3WXKA 3PX0A 4J2DA 4O4GA 3VF6A 4DFJA 1BIZA 3R1XA 1YJ9N 1HYZA 3EYZA 1P90A 3HL8A 1EP4A 3BEXA 3I8BA 3LZIA 4DTSA 3QO9A 4NYFA 2FBTA 4NCAA 3PLAA 4IJAA 4CD1A 2GV9A 2X78A 5M1OA 5FLXO 4BRGA 1GLDG 2QWQA 4KI4A 4BC2A 3QNNA 2A40A 2HNDA 1BISA 2RPIA 4KBOA 1VQLN 5LL6Z 2EHGA 3BZKA 3V81A 1LWEA 2IIRA 4B3SK 3VEVA 2HHHK 3NHGA 1T03A 2QKBA 5AQZA 1K8KB 2CGKA 1YHQN 2NRTA 1QQOA 4BGBA 2RHKA 3FLCO 2KLAA 1G99A 4W5NA 4M42A 3ZX0A 4DV5K 4B9NA 1ASVA 1NG9A 2OZMA 1XUPO 4FSVA 4M7YA 1U45A 1NMDA 4DU4A 5CR4A 3W3DA 4YOWA 4FZXC 1UA0A 4E7JA 3SMSA 1IKVA 5EVZA 3R6MA 2PYJA 3G25A 2P9IB 1H1VA 3VQPA 4JKHA 1Q9XA 4FJIA 3T69A 4HHTA 1YVUA 2GUPA 2WTUA 1A5VA 4RW8A 4RTFD 4HWIA 4YOXA 3AV9A 3O5BA 3LDOA 3ZT0A 5BREA 2O8FB 1JLEA 5FPNA 1N32K 2P9UB 1RDWX 4KHSA 3THVA 1BG3A 3MCPA 4CZFA 3VQ7A 1LW2A 2P9PB 4IFVA 1WB9A 4DWIA 1TL1A 3VF2A 3ZSZA 5AZIB 3CERA 5I42A 3ENHA 1MWKA 3SJHA 4BRQA 3DRPA 3O9UA 3NF6A 2HNZA 2E2PA 1YAGA 4E1NA 1XQSC 1T44A 2FSJA 1RDBA 3MEGA 2VYPA 2FSKA 3ATUA 5CYMA 4FJ9A 2FBVA 3VTHA 1SZ2A 4AHVA 4ISGA 4JD2B 5FRMA 2Q0RA 5AZJA 3OYKA 3H6EA 3C94A 1IBKK 2ASPA 3DLHA 1CLQA 1BWFO 3T1AA 1IH7A 1ESVA 4Z4HA 4KTWA 4JNEA 4FZYA 3MN7A 3OS0A 1DLOA 3R9PA 3DYAA 3U9ZA 1OH6A 3AVLA 3AARA 4MDBA 1HRHA 3G0ZA 3QESA 2UUCK 5AJ3K 3O9QA 1A5WA 3OS2A 4DS4A 4GKJK 3I55N 2O8EA 4HTLA 4BR9A 4ELUA 1QQNA 1O13A 4QAGA 5FDLA 4JK9A 5HP1A 4C8MA 5AQSA 2YNIA 4FM1A 3DLBA 3LDLA 4H0OA 4JK8A 3SMPA 2G8FA 4BRAA 3S41A 3VQ4A 3FFKB 4U67L 1W97L 4BRNA 2PFUA 1NJIO 1I3AA 3A0IX 4CIEA 4ISFA 5KRSA 2P9SA 4JHDB 3CIPA 4WE1A 4CJLA 2W42A 3K58A 4B1ZA 4IOAL 1L5UA 3VEOA 1Q82O 4CGHA 4IFEA 3E9LA 1HQUA 2YHYA 3H1VX 1IKXA 3AA3A 1FKPA 3J7ZO 1TKDA 4FWNA 1XHZA 1ILYA 2P9KA 4BR0A 1BHLA 4JKAA 4LF9K 2OANA 2KQ2A 3OJSA 5K14A 3WQTA 2G8KA 1RT2A 3MEEA 3FE1A 3H1QA 4W5RA 2HF3A 3ZSXA 4E89A 1NGGA 3TAFA 1ZBUA 4FOEA 4N5SA 1WOQA 4WQ4C 3PO4A 2O4GA 2BH1A 4B1YB 1Z05A 4DTMA 2KFZA 1RDDA 3U3GA 4FJLA 4M3ZA 2F96A 3K59A 2E88A 5GAGP 1TUYA 2QK9A 2Z1JA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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