3WXJA

Crystal structure of trypanosoma brucei gambiense glycerol kinase in complex with glycerol 3-phosphate
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
513
structure length
513
Chain Sequence
FTMKYVGSIDQGTTSTRFIIFDERQRPVSVHQVPHTQHTPHPGWLEHDPMEIFRSACKCMSVAIAKLRQKDASFRKIEAIGITNQRETTVAWDRVTKEPLCYAPVWNDLRTYDITKKVTAELGGGDSMFASKITGLPVSTYFAAFKMRWMLENVPAVADACRRGTLCFGTIDTWLMYKLSGGKAFVTDVTNASRTFLMDLRTRKWSPELCEKLKIPMETLPEIRSNSELFGYVETDECGVAAALNERTPIMGSIGDQQSALFGNMCFEKGEAKNTYGTGCFLLMNVGEEARFSKHGLLSTVGFQVGRDGPCYYALEGAIACAGATVEWMRRNMNLFSHITECEKLARSVPGTQGIVFVPAFSGLLAPYWDPSARGTIVGMTLKTTRAHVIRAALQAIALQLNDVVGSMKRDAGLNLSSLRVDGGLSKNGLLMEIQASLLGVDILVPSMHETTALGAALCAGLAAGVWTSLEEVKAVSRRENSWKTVSPSGSAMEREAMIAEWREALKRTKWAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Glycerol kinase
publication title Molecular basis for the reverse reaction of African human trypanosomes glycerol kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei gambiense
total genus 158
structure length 513
sequence length 513
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2014-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxjA01
3ZEUB 1QZ5A 2E88A 3GDQA 1MWMA 1HJOA 3HZ6A 3ULEB 1HPMA 3FZLA 5AFUH 4RCHA 3C0BA 2W41A 2V7ZA 4BROA 4FWSA 3GE1A 2V51B 4RTFD 2I7PA 1ATNA 5AQUA 1NGHA 3R8EA 4H5TA 4BVPA 3GBTA 4H0TB 1MWKA 2QWPA 4BRPA 1ZXOA 3U9DA 4H5NA 1NGBA 3LDPA 1GLCG 5AQYA 4Y0WA 4IJNA 2CGKA 3VGMA 3WXKA 1MDUB 4FOEA 2UYTA 3O5BA 4FO0A 1MA9B 2I7NA 5AQPA 2HOEA 3UE5A 4BG8A 4BRHA 4H03B 2QW9A 3H3OB 3MMVA 4H0VB 5AQKA 2FSKA 4BRCA 4DB3A 4K41A 4XEIA 3EO3A 3EKUA 3H1QA 4H5RA 3SMSA 2CGJA 2FF3B 3I8BA 1Q18A 4F9OA 4BG9A 4FWRA 3O8MA 4NO7A 1XUPO 3A0IX 3M1FA 1X3NA 1GLLO 3VETA 1NGIA 3ZETA 3VEWA 3B8AX 1DKGD 4PL7A 1V4TA 3U8XA 1WUAA 2GTDA 4L3QA 4H5WA 3HI0A 4CZHA 3ZX2A 2A42A 1LCUA 3QDKA 3W3DA 3EL2A 2A41A 1BA0A 2NLXA 1CZAN 1QHAA 2Q36A 5FPNA 4B1ZA 2E2QA 2QWQA 5I9EB 4WQ4A 2D4WA 2ZF5O 1KAZA 2YHYA 4BRDA 4PL8A 1GLEG 3GOIA 2HF4A 1SAZA 2CH6A 4QS7A 3ZETB 4YDUA 5KPTA 2A40A 2EWSA 1XC3A 1SQKA 1BU6O 3H45C 4CI6A 5B8HA 2P9IA 1Z05A 3CJ9A 2YCHA 5AQWA 3UKRA 1GLBG 2A3ZA 5AQTA 1X9JA 1WOQA 2E1YA 3O6WA 5AQHA 2ASOA 3O08A 5F2RA 3ZX0A 1QQMA 1YAGA 2YHWA 2NZTA 1G99A 4CZKA 1BOTO 2IVOA 3JXUA 4KBOA 3HBTA 3DJCA 5AQOA 2P9IB 3HSCA 1NGAA 4BRGA 2PAVA 3SJHA 4FPBA 3UKRB 4E1JA 5AQNA 4CZFA 2F9WA 4BR4A 4BR5A 1ATSA 3VENA 2Q1NA 2CGLA 3AAPA 4DHYA 3JS6A 4CZLA 3CJAA 3O80A 3CERA 1ATRA 5KQDA 3EN9A 4EHUA 4BRIA 2E2PA 2VCPA 4CBWA 5TKYA 3IMXA 4CZEA 4BR7A 3CI5A 3D2EA 4J8FA 3VPZA 4HTLA 4PKGA 5JLFA 1R59O 4IWVA 3MN5A 4EHTA 5EX5A 4WQ5C 4BR2A 5BPLA 3VEVA 1JCFA 1U2VA 3BUZB 3HTVA 3A5MC 2QWOA 2GUPA 4H0PA 3EZWA 4BC3A 4CD1A 3FE1A 3TU5A 1TYQA 1BDGA 3A5LC 4EAHD 3D2EB 3CJ1A 4M63C 3QMLA 5AFUA 4FWMA 3O1WA 2YI1A 3SK3A 4JHDA 1BG3A 2D1KA 1RGIA 5LJWA 3VEZA 5ELZA 4CZGA 3IFRA 2V52B 2YJEA 2YHXA 3J8AA 4HWIA 3VEOA 4A2AA 4BR0A 4CBXA 2VYPA 1U2VB 2GWKA 4I6MB 5LJVA 5AQJA 2YJFA 3H6EA 4DCHA 1T44A 4FWQA 3QBXA 3BF1A 3FLCO 2PBDA 3D7EO 5KQ8A 4NB4A 1TYQB 1XQSC 4XH1A 3FZHA 2CH5A 1BUPA 5BRHA 2F9TA 3VEXA 3FFKB 5BPMA 3WXLA 4JHDB 5EOYA 2IVNA 5BR9A 1D4XA 2J4RA 4H5VA 4BR9A 2BTFA 2E20A 3DAWA 5CE3A 3CETA 4BQLA 4FSVA 5BRFA 1NGFA 1TUYA 4BRKA 4LC9B 3MDQA 3WQUA 4K25A 5BN8A 4BC4A 5AZJA 3U4LA 4MLEA 3LDQA 1GLFO 3MK6A 1BA1A 3WEEA 3QB0A 4BC5A 3LL3A 5AQXA 2GWJA 2P9PA 3IDHA 1IG8A 4CJ7A 4JD2A 5AZJB 3R9PA 4BREA 1GLDG 1T6DA 4XH5A 4FWOA 3L4IA 1NBWA 2DPNA 3WEEB 2Q0RA 3M6GA 4M7XA 4O5FA 2P9PB 3W0LA 3D2FA 3FR0A 3QICA 4FOIA 1C0GA 3CIPA 5AQLA 1DEJA 1NGCA 1YUWA 3BF3A 2E2NA 3O4WA 1JCEA 4JD2B 1QQNA 2IVPA 4WYBA 3ZX3A 2ZGZA 3G25A 3ENHA 3VF6A 1BWFO 4BGAA 3L6QA 1P8ZA 3D2FB 3QFPA 3A5NC 4BVOA 1YXQA 2OANA 2D0OA 4M7YA 3QBWA 4CD3A 5AQIA 2HF3A 4IXCA 2V7YA 3WXIA 4B1YB 4GY2B 3WQTA 4CZMA 3VGLA 4EFHA 4B9QA 1E4FT 2ASMA 5AQVA 3IUCA 3WT0A 5ADXH 3ATUA 3CHWA 3UKUA 1JCGA 3MN7A 3FZFA 5AQMA 3A8YA 3TPQA 1SZ2A 4BRFA 5ADXA 3FGUA 5JMVA 3FZMA 2FF6A 4I6MA 4BRLA 5BRDA 3VOVA 1NWKA 3EKSA 5EVZA 5AQSA 1HKGA 2BUPA 1ZBSA 3LM9A 1C0FA 2Q97A 3I33A 3P4IA 4B1WB 3RSEA 3UKUB 3M3ZA 1HKBA 3C7NA 1NGDA 2WUSA 4A62A 3H46O 1IJJA 3LDOA 4QS8A 4IZ9A 4WQ4C 1QZ6A 4O8KA 3CJ7A 1S22A 2QWMA 4BGBA 1V4SA 5AQFA 3MN9A 4YDUC 5JLHA 2QXLA 1RDWX 3DXKB 1QQOA 2W40A 1HX1A 4MLHA 3DXMA 1ESVA 3RSEB 3VEYA 2QWRA 4A61A 3C7NB 4MO5A 3HM8A 4PKHA 2KHOA 3BP8A 2ITMA 4JAXA 1KAYA 5FPMA 1ZC6A 3OHRA 3SMPA 3VF2A 2P9KA 3MN6A 4AM7A 3BEXA 4B1VA 4JNEA 4A2BA 4PKIA 4FWNA 3VGKA 3CJCA 4BRNA 4BRAA 2QWLA 5JICA 1HUXA 3DXMB 3MCPA 4H0XB 4QS9A 5AQZA 4Z94A 3LDNA 4DQ8A 1EQYA 4RWTA 3L0QA 3LDLA 3ATVA 2FSNA 4GNIA 4BQZA 2P9KB 3KZBA 4JN4A 3CQYA 1Z6RA 4FWLA 2AA4A 2HMPA 4CBUA 1HLUA 2ZGYA 4WQ5A 2FXUA 2VWBA 4AM6A 1DGKN 2H3GX 1RFQA 4ISGA 2E8AA 3FZKA 5KPZA 5EY4A 1YVNA 2ZWHA 3AY9A 3UB5A 1U6ZA 5E84A 3VESA 5EXWA 2FLOA 4MO4A 2Q31A 4ISFA 3U9ZA 5AZIA 5KPRA 2P9LA 3VERA 5BPNA 2Q2RA 1NM1A 3AAQA 3H1VX 3KVGA 1HKCA 4FL9A 4FPAA 5AR0A 4C23A 4B1XB 5AQRA 2QWNA 2GEMA 3SLCA 1OKJA 2E2OA 3ID8A 3GG4A 3LM2A 3S41A 4CZJA 2P9NA 3QFUA 5AZIB 3H3NO 2P9LB 4H0OA 3F9MA 4H0YB 2IIRA 2A5XA 5FPDA 1NGJA 1NLVA 4K42A 3CQXA 1LOTB 5BN9A 3DWLA 1K8KA 3KHYA 5AQGA 4K43A 1NGEA 5F0XA 4B1UB 4ISEA 3AARA 1Y64A 2A6AA 3WXJA 4BRMA 5FPEA 3WUHA 5LY3A 1H1VA 2P9NB 2QM1A 2P9UA 4BC2A 3VF4A 1T6CA 1KAXA 3R6MA 4IO8A 2NRHA 2P9SA 4FWPA 3CJBA 1GLAG 5E26A 2D0PA 3ZEUA 3A5OC 1KXPA 1NGGA 5F1XA 3ULEA 1NMDA 1K8KB 1X3MA 2E1ZA 2GELA 4IJAA 2FSJA 3ENOA 1TUUA 3GL1A 3DXKA 3O1BA 1S3XA 4XH4A 5BREA 2ASPA 2P9UB 4CZIA 5AQQA 4FWKA 1GLJO 1E4GT 2AP1A 4EIAA 2P9SB 4BRQA 1BO5O 2Q0UA 1J6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZEUB 3TSPA 3HZ6A 3PO5A 1HPMA 3HVTA 4B9UA 3GE1A 1J5EK 3MWTA 4BVPA 3KLEA 2F7TA 4YHHK 1ZXOA 4DSEA 1NGBA 4FJNA 5J1EA 3DRPA 4IJNA 4C8OA 4J2EA 4JRQA 2HHHK 3O5BA 4KKOA 1VSEA 2HOEA 4BRHA 4X66K 2BE2A 3QIOA 4FM0A 2YNIA 1QE1A 4MFBA 1JXEA 3AGKA 1HNZK 2W6KA 2NUBA 1KTQA 4FW1A 4OPAA 4XEIA 3THWA 4Z4FA 1RT7A 2D0CA 4C8LA 1O1WA 1BL3A 2O8EB 1P90A 2FF3B 1Q18A 4I2PA 2IS3A 3OYMA 1NGIA 4HCBA 1I3AA 1QSLA 3ZETA 3CMEN 1RCHA 3AA2A 4AHVA 1WUAA 2GTDA 3V1RA 2G8WA 5DM7L 3ZX2A 2Z1HA 1S9EA 3ZSOA 1IH7A 1SL2A 1I39A 4KB0A 4CFCA 5I9EB 2D4WA 2VG6A 1KAZA 3K2PA 3VQ4A 1C0UA 3PY8A 3GOIA 2HF4A 1SAZA 5GINA 3BDPA 4FJHA 4KI4A 4DKWA 3HJFA 3F2KA 3MWPA 2YNFA 1HYZA 1SQKA 3AVAA 2P9IA 4FVUA 3CJ9A 3HM9A 3LP0A 3T3FA 3DOLA 5DMRA 1YAGA 2YHWA 3IKMA 2NZTA 4CZKA 2YX6A 4B9LA 3DJCA 2DTUA 1A5XA 4KRFA 1S1XA 4Y1CA 5AQNA 3CCJN 2F9WA 4BR4A 4BR5A 5J2MA 5SWMA 4CZLA 2UXDK 3O80A 5M1PA 1ATRA 3VQ5A 3EN9A 4EHUA 3K58A 4BRIA 4ZHRA 1SV5A 1J53A 1WSIA 3VPZA 3E01A 4JRPA 1HQUA 4WQ5C 3BUZB 4LSLA 3MCAB 4BC3A 3TU5A 3HK2A 3B6OA 3TTCA 2F4VK 4M63C 3K5NA 4FJLA 3O1WA 3PSIA 3T1HK 3THXA 5CYQA 3K0SA 1NOYA 4YFUA 4HWIA 1SL0A 4CBXA 4A2AA 2GWKA 4O0IA 2O8BB 2YJFA 1RTJA 4KH6A 4OPJA 1T44A 1Q7YO 3LANA 5C0YA 3QBXA 3BF1A 2PBDA 3D7EO 1L3VA 1J9AA 1TYQB 1XQSC 4XH1A 4CEDA 1RDCA 1WAJA 3KLGA 4CFBA 3VEXA 3CXCM 4CIEA 3TWHA 2OPQA 3TABA 4EP5A 1JLFA 4GKJK 4H5VA 2HHTA 4C1NI 3V81A 2E20A 3CETA 2O8DB 4FXDA 1TUYA 4BRKA 1NK9A 3MDQA 1CLQA 1U04A 5BN8A 4BC4A 4JI6K 3HSTB 4MLEA 4DR2K 1WNSA 4BC5A 3QB0A 4B9TA 2I5JA 4FLVA 5AQXA 4DSLA 1M90O 1ZBFA 3KWGA 1OVYA 4CECA 4DU1A 1IG8A 5CZ2A 4FJ5A 4CHNA 2FBYA 1YHQN 2HB5A 3J80O 1GLDG 1QSYA 3KKSA 4DQPA 4MQ3A 4R79A 3OYIA 4TSXA 1NBWA 4H4MA 3WEEB 1NG9A 2OZSA 4C1NK 2P9PB 3W0LA 3FR0A 3QICA 1FKPA 3OBYA 2IDOA 4FOIA 5AQLA 2HNDA 3DLLL 1YUWA 1JCEA 4JD2B 1QQNA 4Z4GA 3MEEA 4WYBA 3T7ZA 3OYCA 3NGIA 3ZX3A 2ZGZA 5FRMA 3VF6A 3OYDA 4OX9K 2OPPA 3AVIA 1TKXA 1QHTA 3RWUA 2OANA 4DF8A 3LWLA 4M7YA 4KHNA 2Z1IA 3QBWA 1N34K 4IXCA 4DSFA 4B1YB 4CZMA 3VGLA 3RMBA 2ASMA 5AQVA 3P39A 5ADXH 1JCGA 1N5YA 5AQMA 4G1QA 1ILYA 2JGUA 1HNIA 5BRDA 4LF9K 4HVJA 1NWKA 3KWIA 5AQSA 1HKGA 2BUPA 1CXUA 1ZBSA 3LM9A 4DV0K 4ZTJA 3QEIA 1QSSA 1S6QA 3PV8A 3M3ZA 3HL8A 1N36K 3C7NA 1TVRA 4A62A 3OYLA 1BI4B 3J7ZO 2P5OA 3TANA 4Q5VA 3DRRA 4IZ9A 4CEFA 3CJ7A 3M8SA 3HOSA 1S22A 2JLEA 3L2QA 4J2BA 1RT3A 1TAQA 3E1YA 2QWMA 2FBXA 5KI6A 2KFNA 4CJTA 3N4PA 1L3TA 3SUNA 4MLHA 2WBNA 3NE6A 2QWRA 1OH7A 4NXMK 3HM8A 4KREA 1KAYA 3O9TA 3SMPA 3OHRA 3QESA 1HYSA 5HOOA 3Q7BA 3I8DA 3F73A 3S3NA 4PKIA 5IT9O 4FWNA 4BDPA 4BRNA 3OYNA 3ULDA 5E41A 5JICA 5A2QO 3DXMB 4H0XB 3D0PA 1WSFA 3B6PA 4M3YA 3ATVA 4GNIA 3LDSA 3OYHA 4BQZA 2P9KB 3IAYA 1TKTA 2XHBA 1OVQA 4YY3K 1S1VA 3EZ5A 1Z6RA 3AA3A 4FWLA 3OS2A 1HLUA 1JKHA 3VQCA 1Q8IA 4NLCA 1DGKN 4DTNA 1KLNA 4KHWA 2OCEA 1WSHA 5KPZA 1IBMK 3CD6N 1CZBA 3E9OA 3LP3A 3UB5A 3ZT1A 4A59A 4CFAA 4CCHA 3KK2A 2PFUA 3PX6A 2FLOA 4LH4A 4MO4A 4JK9A 1LAVA 4LSNA 1UOCA 5BPNA 3AAQA 1HKCA 2UUBK 4C23A 3KK7A 2QWNA 3HPHA 4X62K 2X6NA 3SLCA 2HVHA 2NRZA 3ID8A 3OA9A 3QIPA 1NKBA 1RT2A 4NLBA 5AZIB 3MX2A 3KJVA 3H3NO 1TK8A 4LFCK 4O0JA 2D0AA 3THYB 1KVBA 5FPDA 4PWDA 3C6TA 2QI2A 4DQRA 1JXBA 2QTDA 4ISEA 3I55N 1Y64A 5FPEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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