3ZC5A

X-ray structure of c-met kinase in complex with inhibitor (s)-6-(1-(6- (1-methyl-1h-pyrazol-4-yl)-(1,2,4)triazolo(4,3-b)pyridazin-3-yl)ethyl) quinoline.
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
293
structure length
289
Chain Sequence
HIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Lessons from (S)-6-(1-(6-(1-Methyl-1H-Pyrazol-4-Yl)-[1,2, 4]Triazolo[4,3-B]Pyridazin-3-Yl)Ethyl)Quinoline (Pf-04254644), an Inhibitor of Receptor Tyrosine Kinase C-met with High Protein Kinase Selectivity But Broad Phosphodiesterase Family Inhibition Leading to Myocardial Degeneration in Rats.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEPATOCYTE GROWTH FACTOR RECEPTOR
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 91
structure length 289
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zc5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zc5A01
2IZTA 3BELA 3TTJA 3F5XA 4G6LA 1U4DA 3VUGA 2FO0A 3EQGA 5CT0A 4XV2A 4FKQA 5J95A 4E20A 1KOBA 1YXXA 1Q8UA 3ZFXA 3CXWA 4FEVA 4LM5A 4TKSA 4LOPA 3JS2A 3L8VA 1QL6A 3ZUTA 2EB2A 5LOHA 4U40A 3KCKA 3OTUA 4AOTA 5IDNA 5DFPA 2OZAB 2CNQA 2FB8A 4TTHB 5CU2A 2J5FA 3RHKA 4S34A 3IW5A 4DINA 5BX0A 2WMTA 5JKGA 4OTWA 2R3GA 2J7TA 4ZTQA 4ZTRA 2XIKA 4ANQA 2P33A 4MX9A 3W2SA 5KMKA 1F3MC 4XHKB 3RNYA 2GTMA 4FE2A 3QRKA 4QMYA 4D2SA 5IA5A 4XRJA 2BPMA 4YJSA 1W84A 1A48A 1OPKA 1PXNA 1G3NA 1XH7A 2RFNA 3D5UA 3JVSA 3LFDA 3GBZA 3PG3A 3FQSA 3QYZA 5CVGA 4FT7A 3O8UA 1G8AA 4X3FA 2XK4A 3FY0A 4FVPA 3KRWA 4AFJA 2OIQA 1YXUA 3E64A 3GVUA 3CLYA 3GQLA 1FVTA 5IQHA 1JPAA 2ZDUA 3LHJA 4JIAA 3IDCA 2OJJA 4IHPA 2BRMA 2YM6A 5I9XA 4U9AA 4AE6A 2RG6A 3SDJA 3VS7A 3G9NA 3DKOA 3C50A 3EQHA 2OXXA 4FTIA 3BIZA 3KQ7A 2J0IA 3FI3A 3PE2A 3QF9A 4O2ZA 4RJ6A 3KY2A 5EDPA 1W8CA 1UNLA 4FTKA 3R22A 3ZDUA 3T9TA 4NM0A 4FTLA 2HY81 4R3CA 5GNKA 4Z55A 3A8XA 3KB7A 2XS0A 3ORXA 3R9RA 2BIYA 4CFXA 3JY9A 4AT3A 2F7EE 4AZEA 4HVGA 4ZAUA 1WBTA 3COMA 4GK2A 4M8TA 2YIXA 5CAPA 4IB0A 2QOIA 2WMWA 3IK3A 4MNEA 4MK0A 4CRLA 4CZUA 2QO2A 5K5NA 4MWHA 2PK9A 1H1WA 2RFDA 2OICA 3MW1A 3VBTA 5E9EA 3B8QA 5H8BA 3NWWA 4C33A 5C9CA 3ZZEA 2F2UA 2VU3A 3VS5A 3OOMA 4TNBA 4RA5A 3S3IA 3THBA 4MF0A 4BDKA 1XBCA 2PMIA 2XVDA 3A4OX 4KA3A 4L3JA 3DBFA 3O8PA 1MRYA 3UO5A 3C4XA 4IAZA 5JK3A 3FQHA 4C62A 4QP3A 1OM1A 4YBJA 3FHRA 4G5PA 5CSWA 4EORA 2C47A 3UDBA 1IA9A 3PJ2A 4ERWA 3ZEWA 2ITXA 1UU9A 2IWIA 4ZY5A 4EEVA 3PYYA 4FTAA 5H8EA 5AV2A 2UW6A 3NUAA 4FTJA 2CSNA 2JIIA 2QOHA 3BQCA 4QMZA 1FVRA 4YHJA 4U6RA 3ZLWA 5EG3A 2WPAA 3T8OA 3A8WA 4DFZE 4HW7A 2PVFA 3G0EA 3Q53A 4MXCA 1JSTA 5DE2A 1Q62A 5LARA 5B7VA 4A07A 4E4LA 3BZ3A 3WIKA 3U8WA 5HX6A 3EL8A 4AFEA 1UKHA 3FUPA 1YOLA 5M4FA 2HWPA 3DS6A 4HZRA 1JOWB 5J1VA 3UE4A 4EJ7A 1R1WA 1XR1A 1K3AA 3O8TA 3BWFA 3ZBXA 2I0HA 3GCSA 4B7TA 3QKMA 4U5JA 2R3QA 1MQ4A 5A46A 2XK6A 3CGOA 3DY7A 3OCBA 1PY5A 3RINA 4ZJVA 1DI9A 4ALWA 4BDJA 4W8DA 3R04A 5K4JA 2O2UA 3TKUA 2HY0A 4X2KA 1UVRA 4FKTA 4ZSGA 3E93A 3EIDA 4BC6A 5BMMA 3QQLA 4A9TA 4MBJA 3GQIA 3L9MA 2C6OA 2HENA 3DU8A 4EH3A 3R71A 5L2QA 3ORNA 3HECA 5TR6A 4IM2A 2WB8A 3DZOA 4UB7A 3RTPA 1ZMWA 4ZZMA 5M44A 4ERKA 4FZFB 3C0GA 4JX7A 3BV2A 4GFMA 2BZHB 1ZOHA 5IQBA 1URWA 3OEFX 2XNGA 4NK9A 1JKTA 2F7XE 3D15A 1H8FA 1Y91A 3OBJA 5E8XA 1QPJA 3S1HA 4BZOA 4EUUA 4F9CA 1CTPE 3Q60A 4BDCA 4BRXA 3KK9A 1NVRA 3NW6A 4AZSA 3UOLA 4EYJA 4YTIA 4N57A 1SZMA 3JVRA 5BVNA 3LPBA 4KBKA 3QWJA 2ITOA 3TV4A 5DRBA 1M7NA 2H9VA 3QUEA 4YC6A 2XNBA 3ZS5A 3Q6UA 4IWOA 3QD4A 1P5EA 4O96A 3BYMA 3P79A 4HGLA 1JVPP 3R7EA 5GINE 3CY3A 4FYNA 3UG2A 4QNYA 1VR2A 2YA9A 3NDMA 3R6XA 4FNZA 5DEWA 1V1KA 4P7EA 4Q9SA 3ZLYA 5J7HA 3PWYA 4IVBA 2X2MA 4YO4A 3ZLSA 3KKVA 3OG7A 4P90A 5CLPA 3W1FA 4E5AX 3S0OA 5EQPA 3OXTA 4HPTE 4L7SA 4FV0A 4JT3A 4F65A 3AOXA 3QGWA 4F7NA 2OGVA 3PXZA 1PXLA 4CT2A 4BCIA 3RCJA 1PMVA 4QTEA 3AQVA 4R7HA 5HOAA 3VHEA 2VO0A 2Z8CA 4BCQA 4IX3A 3WE4A 5IA0A 1H0VA 3NNVA 3BWJA 3BU5A 3W18A 1H1RA 3NCZA 2OU7A 3PIYA 3QA0A 4IMYA 5IMXA 4C3RA 4D4RA 2WTCA 3O0GA 2UZTA 4M12A 4NJ3A 4AGDA 2J9MA 3QGYA 4EYMA 4NL0A 2X4FA 4JNWA 1PXKA 2G2FA 2W4KA 4OBPA 3KXXA 4ONAA 3I1AA 2QNJA 1GY3A 4UYAA 4ANSA 4RBLA 1PKGA 3GI3A 4LMNA 4CFVA 3QBNA 4D55A 1Z57A 2WNTA 3ENMA 4MH7A 4KIPA 4BGQA 1VYWA 2WEIA 3KRRA 4EOKA 4O0YA 5CEPA 3QD0A 3E87A 2R3NA 5HLWA 4LOQA 3F3WA 3NIZA 2C4GA 4APPA 3BEGA 5CF4A 5C8MA 3PSDA 4O0SA 5GJFA 4F9YA 1PMNA 2X6EA 4JI9A 4RVMA 3PTGA 3MYGA 4FKLA 1BI7A 3MESA 4HCVA 3ZXTA 4JXFA 2YCRA 4XYFA 3ZMMA 4KIKB 3G51A 4BL1A 2YCQA 4WSQA 4HJOA 2G01A 2WHBA 2VRXA 4FK3A 4ZJJA 2B52A 4CKRA 2J50A 3EJ1A 3QLGA 2PUPA 5JZJA 3Q2JA 3E92A 4ENXA 3FYKX 4MD9E 3FMNA 4O84A 4A9RA 4ALUA 4RJ3A 2EB3A 5D7AA 4O7TA 4XG4A 2C0IA 4LUEA 3FDNA 2C6DA 2CCHA 4RVLA 3TDVA 4LMUA 4IVCA 2XKCA 4FKPA 2VO7A 4FUXA 3H30A 4O91A 4F70A 3DXNA 4N4SA 4OLIA 4MKCA 4YMJA 3RJCA 3G90X 2BDWA 3GC9A 5LXMA 3NVKI 4HOKA 1PXPA 1TVOA 3QTZA 2WO6A 2JAMA 2XNMA 4R77A 4JLCA 1P4FA 1Q3DA 2H34A 4S31A 5FP5A 4J1RA 4LRMA 4WNKA 3MIAA 3VUKA 3QTRA 4UXQA 2QOFA 4ANBA 2CKQA 4APCA 5KKRB 3Q3BA 3RZFA 4I1ZA 3N4UA 5IA3A 5HE1A 5A3XA 4BTFA 5DNRA 2JLDA 4O7YA 5G6VA 3R8ZA 1K2PA 2YDIA 4YLKA 3DB8A 5AP2A 4CD0A 2NPQA 4DF3A 4XBUA 3FMLA 2I1MA 3C4WA 5CNNA 5A14A 3TZ9A 2JC6A 2YIWA 4NW5A 5CI6A 4KWPA 3LFCA 3OMVA 3VUTA 4FKGA 2GS2A 3E8DA 1CSNA 4UMRA 3D5WA 5KZ0A 3PY3A 3AGLA 3GEQA 2VAGA 5IKWA 3R9HA 3N4TA 3QXPA 1PHKA 5DH3A 4BGHA 5BNJA 3RAIA 4PPCA 4L67A 5A54A 3CP9A 3P4KA 2VGPA 4AF3A 2WTJA 3DOGA 3UODA 4GSBA 3II5A 2WTKC 4L45A 4F7LA 1RE8A 2IO6A 3A7HA 5AM7A 4CLJA 1OKZA 3K3IA 5ANJA 3PVBA 4AT5A 3MTFA 2IW6A 3SG8A 4IB3A 1Q4LA 5BVKA 4PPAA 3OTVA 5CEIA 3FI8A 1VZOA 3FE3A 4O27B 4XX9A 4W9XA 2BR1A 2E2BA 4L6QA 3SVVA 4FV5A 2W5BA 4J7BA 2PE2A 1GZKA 3IS5A 1Q41A 3JY0A 3ETAA 4F1TA 5I9VA 1S9IA 2QOQA 3UQFA 3L9PA 3ZOSA 2ITWA 5M07A 1OL7A 4IEBA 5HORA 3ORMA 3ROCA 3GB2A 5DG5A 3R28A 3KRLA 3N9XA 4AA0A 3VN9A 2Y0AA 3AGMA 4TYJA 1TQMA 2X7OA 3DT1A 4RQKA 5DBXA 3LCOA 3W16A 3HVCA 5HE2A 2IVSA 4E5BA 3UC3A 3N4VA 5EOLA 5ANGA 4JR7A 2QR8A 3KFAA 3OXIA 5M4IA 4RX7A 3RK5A 1CMKE 1KWPA 4K0YA 4O6EA 4M97A 2JIVA 1M2QA 4YTHA 3UG1A 1NVSA 2C6IA 2OF2A 3W32A 4QMNA 1TQIA 2F57A 4IDVA 3QYWA 3HNGA 3MB6A 4C34A 4G17A 4DFNA 5A6NA 3UIUA 5AMNA 2UZDA 2P4IA 5AFVA 3QKKA 5FEQA 2OZAA 3I5ZA 5ACBC 4LGDA 1B6CB 2C3KA 4HGEA 3RPSA 3V8WA 4FYOA 4L7FA 2CJMA 4WO5A 2GNFA 2VO6A 1IRKA 4UYNA 2R3OA 3LQ3A 3HYHA 5E8UA 3UZTA 1Q24A 3VRZA 4UWCA 4D9UA 4NKAA 2XBJA 1JKLA 4TWPA 2BRNA 2R5TA 4WBOA 2GPHA 3O17A 3KC3A 3WZKA 1KE5A 4FTNA 1YXTA 1YDSE 4CKJA 3FZTA 2W4JA 4J96A 4RJ5A 2RIOA 4K77A 2JKKA 3GU7A 3UIXA 4CNHA 3MB7A 4FSRA 3VUMA 5IA2A 4BDDA 4D4SA 4BWXA 3EKKA 4EBVA 4F4PA 4D9TA 3QHRA 2OJIA 2R0UA 4YZDA 2R3FA 4NKSA 5AR2A 2YCFA 5BUIA 4LGGA 3DK3A 4U42A 2VX1A 2Y9QA 4W4VA 2UZLA 5CS6A 4IAIA 2CLQA 3D4QA 3WOWA 4NCTC 1KUTA 2WMRA 4RIXB 2WTKB 3SD0A 4HCUA 3VS4A 1OIUA 5HLNA 4BI0A 2I0VA 4CFMA 2VV9A 5B2MA 3SGCA 4Y46A 4ZTSA 1YXVA 4I92A 4CFUA 3NVMB 5CSHA 3FC2A 5M09A 4BDFA 1M14A 2Q0BA 4JRVA 3M42A 4RQVA 3IGOA 5BVFA 1DAYA 2YHVA 3P78A 3F5GA 4HZSA 5CF6A 5BUJA 2G2IA 2GHMA 1PXJA 3CTHA 4EOIA 4I4FA 3WYXA 4FKJA 3SXRA 3FXZA 4CQGA 5DMZA 4BCGA 1Q5KA 5FXRA 3D2KA 4RFMA 2BRGA 3AT3A 3C0HA 2PVYA 2O5KA 5IEVA 4ZLOA 2IZRA 3IW4A 4EKKA 4D1ZA 1SVEA 4ZTMA 4NYEA 4P5QA 4FOBA 4EOQA 4D2TA 1OGUA 3BYOA 4PDPA 4RFYA 4ZIMA 4IZAA 4YPDA 3EQFA 4C36A 3R7GA 1REJA 3DKCA 2WTVA 3E63A 3MV5A 1A9UA 4PL3A 3LXLA 5A4LA 2F4JA 4F9WA 4BDAA 2GNLA 4DH8A 4I41A 3DZQA 5AA9A 2CGUA 2C69A 5AUUA 2PY3A 4Y5HA 4YP8A 2GNHA 4EHZA 3GCUA 4FMQA 3A99A 1CKJA 2WMVA 1Q3WA 3FQEA 1ZARA 3KF7A 4I0SA 4OR5A 3O51A 4IC7A 2QO9A 4FTOA 1YI4A 5E8WA 3T3UA 2QCSA 4BDGA 4DC2A 4USFA 2YLFA 3PDTA 4O0XA 5HNGA 3FPQA 4D28A 5IISA 5KMOA 2A4LA 3BHHA 4AQCA 4E6DA 5C1QB 3SAYA 4LV8A 4KB8A 3D7TA 5FDXA 5AR3A 3OWJA 4TY1A 2Z7QA 4EK5A 2AC5A 4C4HA 2XIXA 4EWQA 2RGPA 4H1JA 3L1SA 1Q8YA 2Z2WA 2ETKA 4CMTA 4FTUA 4KD1A 5JRQA 1KE8A 4M13A 4NU1A 4LGHA 4OGRA 4QYGA 5CXHA 2OJ9A 3D5VA 3AD5A 4C59A 4L3PA 3TNPC 2C3JA 3FMHA 4IDTA 1QPCA 5EI8A 4WHZA 2IVVA 4B0GA 3BRBA 2QG5A 5DGZA 4F63A 1UWHA 2G9XA 3QAME 3ZSHA 2R3LA 3FKLA 4NFNA 3JYAA 3DXQA 1OITA 2QVSE 5TE0A 3BLHA 1SNXA 4KIOA 5ACKA 4YO6A 5CSPA 4V0GB 1YI3A 4DTBA 1FGIA 2XM8A 3UO6A 5HD7A 1PXOA 1PYEA 4OW8A 4G1WA 5KHXA 2Z7SA 2B7AA 3ALOA 3BEAA 4G3DA 4J8NA 5CU4A 1IA8A 4K1BA 5D12A 4FG7A 3R9NA 3PVGA 2HYYA 3TKHA 3VBQA 3O23A 2OF4A 4X21A 2Z7LA 3BCEA 4FT5A 4O0TA 4I6BA 4JS8A 4BN1A 2JDOA 3RMFA 4AGUA 1OPLA 3VJNA 3CS9A 3L8SA 3A7FA 2IG7A 2PZRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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