3ZIJA

Crystal structure of the thioredoxin-like protein bc3987
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
76
structure length
76
Chain Sequence
MKKIEVYTQPDCPPCVIVKEFLKHNNVAYEEFDVKKDAAARNRLLYDYDSYSTPTVVIDGEVVAGFQIEKLQQLLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tuning of Thioredoxin Redox Properties by Intramolecular Hydrogen Bonds.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus cereus
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 24
structure length 76
sequence length 76
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zijA00
2KP2A 1R5AA 3G7IA 3LSZA 3CBUA 3KM6A 1OC3A 4AF2A 1R5PA 5ECSA 4MK3A 3D0ZA 1JZOA 3K8NA 2QGVA 2LQQA 2IMKA 4IQ1A 4PGTA 2K18A 4FYUA 4K1FA 4BL7A 1G0TA 4YQVA 3KEBA 3DD3A 2J23A 4NWYA 1B9XC 1TP9A 1XZOA 4L0WA 1RQMA 3GIXA 1TI3A 3G7YA 4YQUA 2EIQA 9GSSA 2ZCTA 1T3BA 2XHFA 4KSMA 1M9BA 3DMLA 3WYWA 3TKQA 4EDZA 5A4WA 2VCXA 4X43A 2YNXA 4IJ3A 1Z7RA 2DBCA 2JZTA 1PX7A 3LYKA 5JWRB 2V6KA 2VLTA 2H0IA 1UA5A 4K2DA 1WPIA 4GLTA 4IELA 5G5FA 2BJXA 2GZZA 3VLNA 1F37A 3N9JA 5CRGA 5IO0A 2YJ7A 3LYPA 3UL3A 2B5YA 2GSTA 4KB3A 2VOCA 4MZWA 4GTUA 13GSA 1C72A 4ZB8A 4K9ZA 2LUSA 5KN2A 4OO5A 5A4UA 4EDYA 4ZL7A 4WKWA 3WGXA 4ECJA 4JE1A 1UC7A 1W89A 3FZ9A 4H86A 3FZ5A 1AQXA 1EOHA 1AW9A 4EF0A 2VLVA 4CHSA 1F2EA 2RUFA 3G9BA 3TGZA 5CAXA 2WRTA 3VI5A 5E59A 3HVVA 1OC9A 1B4PA 4POBA 2A2SA 1SKRB 3BBYA 1VGLA 3GKXA 2LEGA 2B1LA 3QAGA 4LLRA 2YWMA 4Q5RA 3W8JA 4OCEA 2DSAA 4WBRD 2M46A 3GA4A 2PWJA 1GP1A 4XRDA 2FWFA 1U3AA 2F8AA 1IYIA 2H72A 4OMVA 3KP8A 3FY7A 1N2AA 4QQ7A 5ECKB 2JSZA 1SK2A 1AUCA 3D6IA 1SKSB 1KEBA 1JZWA 1BQ7A 3WGDA 1XVWA 3LJRA 1T4ZA 4MCUA 5HR1A 2P0GA 4POKA 5LNKe 3HJMA 1MDJA 5HFIA 1ON4A 6GSWA 1G7EA 1T4YA 3ME8A 4XS1A 3C8EA 2LRTA 5ECQB 4HDEA 4ECBA 5KN1A 2VIMA 2O85A 4IHUA 2B1KA 5H5SA 1F3BA 2C80A 4EXJA 2I9HA 1MEKA 2FD3A 3QR6A 3CSHA 4EKZA 1FVKA 5GSSA 1X9WB 1BG5A 4D73B 1SJZA 5IQYA 2VM1A 4JR6A 3IXRA 3F6DA 5DQYA 5J4UA 3GMFA 4OFMA 3H93A 4MABA 1WRYA 4N10A 3LEFA 4HEA2 3WD6A 2MMOA 1GNWA 1EZKA 3SBCA 6GSTA 5C00A 17GSA 3ED3A 4X1UA 4WR5A 4DSSB 5H5RA 4I2UA 4NAXA 3ZMKA 2ON5A 2L57A 12GSA 2M72A 5J41A 1THOA 1YF0A 1M2DA 1JZRA 4HU7A 1EEMA 2A4VA 4IJIA 4L5OA 1WJKA 1F3AA 4O92A 1GUHA 3VWWA 1NW2A 5DALA 1A23A 1S3DA 1QQ2A 3F4TA 3MWHA 2MBTA 4POLA 1UN2A 5KN3A 4LMWA 3U6VA 5ECLB 5ELAA 4RI6A 1QGVA 2ON7A 3L0HA 2GQMA 2K8VA 1AQVA 3QD9A 5J9CA 2X8HA 2KUCA 2N5BA 1Z6NA 2CVBA 4BA7A 2FWHA 1DBYA 5GAND 4XTSA 3FRCA 1R26A 5FWGA 3LWAA 1GRXA 4XCSA 3EC3A 2FWGA 3A3TA 1SD8A 1CQHA 1U6TA 3HYPA 3M1GA 4ML6A 2DJJA 3DXBA 3CXGA 1SJIA 5B6MA 1MD4A 1J08A 5IOWA 3HXSA 4ACSA 5IMDA 5ECRB 2H0GA 4K7NA 2WCIA 3GL3A 1GLQA 1YEXA 3HY2A 5HFGA 4GSTA 1XW6A 2F8FA 2IPAA 1YJ6A 4BWSA 1YEPA 4MZBA 2VO4A 2WJUA 4FIWA 3H79A 1FHEA 5F07A 1DE1A 4HJMA 4IS0A 3UAPA 4ZIJA 2YN1A 3UVTA 1TU8A 3IC4A 2J9HA 2LJAA 2GSRA 3F9UA 2F9SA 2E0QA 4OWYA 3L4NA 2OACA 4V2MA 3F4SA 1F9MA 5IIZA 1V57A 3HJOA 2C0DA 2DJ3A 5D9TA 4V1Ag 3UEMA 2GSQA 4PNFA 2HFDA 4J56E 4K8MA 2YJHA 2XBIA 3IR4A 3CTGA 4E8EA 1DUGA 5ECNB 1T00A 1V9WA 2F3MA 2HXKA 3IHQA 1TI1A 3QDNA 1EP7A 2O8VB 2VLUA 1UVZA 5CP1A 3QAVA 2IJYA 4TR4A 5DJLA 4GSSA 4ULXA 4V2NA 1GSQA 4KDXA 4J2FA 1Y6EA 1XOAA 3H1NA 4I8BA 3APQA 3IAS2 4PX1A 3KJYA 3BOAA 1HNBA 3CRTA 1SENA 4PQHA 10GSA 4TW5A 6GSSA 3TJBA 3HD5A 1BAYA 2C3NA 2P5QA 4WETA 4KSOA 16GSA 2VCZA 4GCIA 3L9VA 4D73A 1BEDA 2AV4A 4ZXGA 5IMVA 2H76A 3IRAA 3FK8A 5GSTA 1K0CA 2WB9A 3TJJA 2R37A 3HHVA 3C1RA 2C8UA 2PUKC 4AJ8A 5KN0A 2PBJA 4DSSA 4XS4B 4GWRA 22GSA 2VCQA 2VL3A 5D73A 2PU9C 1NHYA 2QKEA 1OC8A 4HQZA 6GSUA 3MAKA 1U87A 4NPBA 2H0HA 1RW1A 5DCHA 2JZRA 3RAZA 4TXOB 5IOXA 3GKMA 3TKSE 4L0UA 1OKDA 4O5RA 4GSNA 3J7Yk 2RM5A 2JL4A 2EIRA 2OADA 4BWQA 1FVJA 3AY8A 4ZB6A 3CYNA 2H01A 3PINA 3ZREA 2DJ1A 1E6BA 1O8XA 3ERGA 3SWLA 5LCZA 3MNGA 2WFCA 4AJ6A 4MF6A 2DIZA 2NDOA 1G7OA 5DQSA 4IGJA 3H8QA 4GXZA 2DMLA 5A4VA 1TK0B 2NPBA 2OE0A 1K0MA 3NZNA 4OFTA 1LJRA 4WF4A 2GDRA 3DEXA 1SYXA 1T8EB 4GRFA 1X9MB 5GZZB 4HS1A 2H74A 2WZ9A 4K7IA 4OFNA 1TOFA 1XWGA 1AIUA 2YV7A 3GFKA 4NV2A 4RUVA 5AN1A 2IMDA 3GYKA 4NHWA 5COHA 2V32A 2H66A 3TOTA 2B7JA 1A2LA 3F0IA 3I9V2 3A2VA 4P3YB 3KMNA 1X5CA 5IO2A 2B5XA 1PMTA 3UVHA 1BYEA 3L9SA 1ACVA 2K8SA 1SYRA 1O6JA 3EU4A 3GX0A 1EGRA 3FKFA 4F0CA 3FZ4A 5FHIA 2PPTA 3GH6A 3M9JA 2AB6A 3FEUA 1K0BA 4JR4A 1Z5YE 1M99A 2IIYA 5EL8A 4CW9A 2R4VA 4KE3A 2X64A 2D2ZA 1RK4A 2LSTA 5CREA 1X5EA 4NMUA 2QSIA 2L6DA 3RPPA 1M0UA 1A8YA 1XWKA 2GT6A 4V1Ap 3EYTA 3KP9A 1PQNA 2E7PA 3E0UA 2X99A 1ZYEA 4KCEA 3TCOA 5IM9A 3IE3A 2R3XA 2YPMA 3GUSA 1TRWA 4KGIA 1TTZA 2CT6A 1A2JA 1TJDA 1YDKA 4MDCA 3A2XA 2M80A 2LTKA 3ERWA 1WP0A 3GL5A 3P7XA 4FH8A 3F4RA 5ECOB 5HR2A 1SL1B 5G1LA 2L4CA 3QCPA 1Z3EA 1ZOFA 5IMAA 3EU3A 3KTBA 2JZSA 1TK5B 3CMIA 3EMXA 3EURA 4IBPA 4KA0A 1PKWA 3RDWA 2L5OA 2BMXA 2VAFA 2XPEA 2H19A 2KHPA 2C3TA 5D9VA 1HYUA 3O3TA 1THXA 5AIXA 3Q18A 2H1DA 4LL1B 1M9AA 2VL2C 1GH2A 1I5GA 1A2MA 5ECPB 1TRSA 1O73A 3APSA 5JWOB 2G0FA 2GT5A 1O81A 2LKUA 1ZZYA 4PQIA 1DSBA 2HLSA 2VL2A 4XS4A 1FW1A 2WS2A 1K0AA 1XW5A 2R2JA 2VD1A 1A8LA 4K0GA 1V58A 1JLWA 1SKWB 2HSHA 3EINA 3IOSA 1K3OA 1M2BA 4F82A 3KH7A 2TRXA 4TXOA 1BJXA 1LBKA 4I97A 3F3RA 3VWXA 5D93A 3CSIA 2AJQB 3VPQA 1SD9A 1IYHA 2GZYA 4OO4A 2ES7A 2DC5A 2KLXA 2CV4A 1YKCA 3M9KA 3GKKA 3O6TA 3QOUA 5DDLA 2MMZA 5CYYA 2H6XA 4K7OA 2CX3A 4POMA 7GSSA 2H6YA 4X0XA 4ZBDA 4ZL9A 2BTOT 2VUPA 3F3QA 1DE2A 4TRXA 3APOA 3GURA 4MA9A 4N30A 3CRUA 3P2AA 3GNJA 3GSTA 3C7MA 4HOJA 1XWCA 2PERA 2WGRA 2OE3A 2LRCA 1OKTA 2B5EA 2OKAA 2X8CA 3FW2A 1HQOA 1GTUA 2R6KA 3HZ8A 5HR3A 4N0ZA 1I9DA 2VD0A 3GV1A 2P5RA 2H1GA 3Q74A 5CRHA 3KZQA 5DCGA 4QL7A 2MBSA 3HZ4A 3UBKA 2IMEA 1ERUA 5D9XA 4PUAA 1XXUA 1Z9HA 1ZCPA 4XIHA 3IK7A 4ZILA 4DVCA 3EWLA 5G31A 5CRWA 3UBLA 3ZTLA 3V1WA 4L8EA 4HQSA 3R2QA 4V2LA 4OCFA 3KTLA 2I1UA 2LNSA 2RLIA 2PMTA 2C0FA 2XPDA 2FNOA 5JCWA 1MTCA 2IWTA 4FYCA 5DVBA 3U5RE 1OAZA 4ILFA 4EL1A 3KMOA 1BX9A 2IFQB 1F6MC 4K0NA 3M8NA 20GSA 5IPHA 4GF0A 4PNGA 3VWUA 4J57E 3HKRA 3ZLPA 5B7CA 3MSZA 1J9BA 4F0BA 1SK0A 3TRPA 4PXOA 3DRNA 3S9FA 2C0EA 3HA9A 1LU4A 3D22A 5DJMA 2AYTA 1N8JA 3D4TA 2WDUA 1ILOA 2I81A 3C1SA 5ENUA 2RM6A 1PRXA 1SU9A 3QFBC 5CNWA 2F51A 5B8AA 2YOIA 5CRDA 5FT3A 2CZ2A 1B48A 4IN0A 5IMCA 3LG6A 3VWVA 3TRXA 1U88A 3ZFBA 2GS3A 1WIKA 1A0FA 5B6NA 3DGQA 3D4MA 4XS6A 4G19A 3D21A 3F6FA 1JHBA 1XWBA 2XC2A 4G2EA 3UARA 1GULA 1HNAA 3ZITA 3NIVA 1GL8A 5ECHB 4EO3A 4G9HA 1TDIA 2RIIA 2GLRA 2YZHA 1SK1A 4ML1A 1A24A 4FO5A 4OD7A 5ELGA 1GSFA 3PR8A 3FR3A 2O89A 1TKDB 2B6MA 3TJKA 2L59A 1FO5A 2HE3A 1Q4JA 1YZXA 1VF3A 2YP6A 2PN8A 3FYGA 1ZMAA 3ZRDA 3TKSC 2MYGA 4JBBA 2GQLA 4EE0A 4DSRA 4O7HA 1B4QA 5AISA 2EIOA 2C3QA 2N5AA 3ZVJD 19GSA 4HI7A 3VURA 4WF5A 3GTUB 4MLYA 4ECIA 3TKSA 4KX4A 3LORA 1GNEA 5L71A 1XWAA 2V6OA 4Q5NA 5DBQA 3GH9A 3DYRA 4ZL8A 2LRNA 1FG4A 2V41A 3HJPA 1YQ1A 2RUEA 1VF2A 2H6ZA 4Q5QA 4MP4A 4TOPA 4DEJA 3BD2A 4KUNA 5ECIB 3G7JA 5ECMB 2FWEA 1O85A 1R7HA 4F03A 2AUVA 1PGTA 4MZCA 4EC0A 2G2QA 2PVOC 2V2GA 4KH7A 2OBKA 3IV4A 2KP1A 2QC7A 3M0FA 4ECCA 3TRQA 5E4WA 3RHCA 2YWIA 3RBTA 1W4VA 1XOBA 1QXHA 4CDOA 1GSUA 1V2AA 3J7Yb 4LA1A 2LJKA 3MDKA 2GVPA 3ZYWA 3LXTA 2MMAA 4WXTA 1ERWA 5IMZA 1CQGA 3TKPA 2LNTA 3C71A 4WBJA 1JLVA 2C0GA 4TR3A 3A2WA 1K0DA 1QMVA 5JCGA 2L5LA 1ML6A 4NXIA 1XIYA 1PX6A 2IFQA 2FLSA 3TB2A 3GX8A 3F8UA 1K0NA 3ISOA 5JCUA 1JFUA 2K6VA 1PA3A 2DJKA 2E2GA 1GLPA 4MJBA 1E2YA 2V1MA 2DIYA 3DIEA 18GSA 2CVKA 3VFIA 2HYXA 5ID2B 3LGCA 3ZIJA 3H4KA 5D96A 3ZMLA 5JWQB 2CAIA 5DALB 4RI7A 3BCIA 2H70A 2Z9SA 3F63A 5ABRA 2FHEA 4I2TA 3L9UA 2R5GA 1ZL9A 4MMMA 1XBSA 3JCML 2PGTA 4MJCA 3P90A 3FZAA 1HD2A 3L78A 3HVSA 3CSJA 1ERTA 3DWVA 1GSSA 1TW9A 4ZBBA 1FOVA 5F06A 3CTFA 3KD0A 3TOUA 1ST9A 5G1KA 2GZPA 4YQMA 1PN9A 4F9ZA 4JEDA 4N0VA 4O32A 1GTIA 2YCDA 4WEYA 3E3EA 4RQRA 2CAQA 3ZVJA 3DVXA 1NSWA 2HZEB 1V40A 11GSA 2OJLA 4AGSA 1KNGA 4YAVA 3VK9A 1EGOA 1EP8A 1GSEA 4YAPA 1R4WA 4MJEA 1FAAA 2HT9A 1TRVA 1XFLA 3UIWA 3UJ1A 3GRXA 2K9FA 4E8HA 14GSA 2JU5A 3WT2A 3IA1A 3RHBA 3GTUA 3EE2A 3HCZA 4IKHA 2H75A 3N5OA 4MPGA 1URMA 4PUFC 2H71A 3ERFA 3FR6A 1B8XA 2TRCP 2FUG2 6GSYA 3BJ5A 2I4AA 1PSQA 2HNLA 1EV4A 4ZB9A 1GUKA 2I3YA 1SL0B 1WWJA 4MF7A 2A2RA 1QK8A 2LQOA 4IP6A 5D8IA 3VPTA 1GSDA 2YANA 8GSSA 2VCVA 4XHMA 2CVDA 2B3SA 2DMMA 3M3MA 2VCTA 3EMPA 1S3AA 3LFLA 3TJFA 4TR1B 3RPNA 1PKZA 1AC1A 6GSVA 2XBQA 5G5EA 4KW6A 3KIJA 4JRRA 2H1BA 1B9YC 1SJ6A 1X0RA 5J5NA 1Y25A 2H30A 2L4QA 5J3RA 3QFAC 1VF1A 4Q5FA 4HJ2A 3LXZA 4TR0A 1MDKA 3KCMA 5IMFA 2IL3A 4MJAA 1KTEA 1HNCA 2CQ9A 2WULA 5H5QA 4EUYA 4MF5A 2H8LA 4PURA 1QUWA 1VF4A 4L5LA 5DAKB 2NVLA 4AJ7A 1X5DA 2MMNA 1ZYQB 3EVIA 1T1VA 2DJ0A 3IPZA 3QMXA 2NBSA 3US3A 3Q6OA 4RQXA 1PL2A 5EPFA 4JU5A 3VI7A 1T7PB 3WGEA 2OE1A 4KDYA 1ZGNA 2AAWA 1JZDA 2H1AA 2IN3A 4HZ4A 1GUMA 1H75A 3TKRA 1K3YA 3TUEA 2ZNMA 5ID2A 3OR5A 1TRUA 1AXDA 1GWCA 1MDIA 3KGKA 5J9BA 4HUAA 4TKYA 1A0RP 1K0OA 3IDVA 1TK8B 5KEJA 2HRNA 4QL9A 2JSYA 4TN8A 4FYBA 2GTUA 4MPFA 2O7KA 2ALBA 3ZFLA 3DKSA 1XCCA 5F05A 1Z6MA 1WOUA 3GSSA 4DSQA 4I5QA 2GQKA 5A5KA 1AQWA 2AHEA 3W8SA 5IPGA 4WR4A 3IAM2 1XW9A 2EC4A 1S3CA 3TDGA 5D9WA 2L6CA 4GQCA 1OE7A 2E2MA 2REMA 1GTBA 4YH2A 3E9JB 1EOGA 3I6AA 2GGTA 2HZEA 4BPYA 2C4JA 3KXOA 1GTAA 1OE8A 1USBA 1FB0A 2B7KA 2LV3A 3DVWA 2NTOA 1H4OA 2VCWA 3FHKA 5LD0A 4BVXA 1V98A 4TVEA 1YKAA 1YY7A 2LS5A 3ZL5A 4IQAA 4MH3A 1AAZA 4Z7XA 3PH9A 2C1YA 3FR9A 1PL1A 4K6XA 1YF1A 2FA8A 2YV9A 5F8BA 1K3LA 1FB6A 4GQFA 3IBHA 1EEJA 4HZ2A 3I69A 4HU9A 4KDUA 2OA7A 1G6WA 5C04A 2DLXA 2OBIA 1MD3A 3O76A 1O7UA 2YWNA 3ZIVA 3A5WA 2N5FA 2YWOA 4MH2A 1O8WA 1ABAA 4LMVA 5CO3A 1X9SB 2ZUPA 4IVFA 3KH9A 3GKNA 3D5JA 5B8BA 4G10A 1Z7PA 1WE0A 1WMJA 4KCAA 4TR1A 3UOMA 1J0FA 4KNDA 3HDCA 2FGXA 3TJGA 3W6GA 1G6YA 4PQ1A 5G2ZA 3QAWA 2KOKA 1OC9B 1Q98A 2GSSA 4ISDA 5HQPA 2CA8A 5AIVA 3P8WA 2IMFA 5EVOA 1XVQA 2TIRA 3ZZXA 2CZ3A 1OYJA 4NHZA 2FA4A 1QFNA 2YZUA 1KBNA 2CX4A 3UMAA 2H73A 3HVXA 4N11A 3PGTA 3I43A 1XPVA 2DJ2A 2IMIA 1EV9A 3BCKA 4TXVA 1M2AA 2HI7A 4I6XA 5DAKA 1SL2B 2HRFA 4JZQA 2VL9A 2HZFA 1NM3A 3ME7A 3Q19A 5EY6A 6GSXA 5F0GA 5G30A 3WT1A 5HR0A 2X8GA 1TXXA 2FY6A 3GN3A 1EWXA 4XRAA 4LL4B 1M7TA 2P31A 2PVQA 4IW9A 2MZCA 5INYA 3NOFA 2HSYA 1PD21 3GHAA 4BVYA 2FCHA 3IK9A 4NV5A 2VM2A 4ID0A 1TU7A 3QPMA 1VRSD 5GAPD 5AGYA 3C73A 4ZBAA 1ERVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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