3ZIJA

Crystal structure of the thioredoxin-like protein bc3987
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
76
structure length
76
Chain Sequence
MKKIEVYTQPDCPPCVIVKEFLKHNNVAYEEFDVKKDAAARNRLLYDYDSYSTPTVVIDGEVVAGFQIEKLQQLLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tuning of Thioredoxin Redox Properties by Intramolecular Hydrogen Bonds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
source organism Bacillus cereus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 24
structure length 76
sequence length 76
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zijA00
2OA7A 4FO5A 1EGOA 2V6OA 2EIQA 4TKYA 5G5FA 3DMLA 4K9ZA 2CA8A 4JR6A 4NAXA 1GSSA 3P90A 1PD21 3IAS2 1EV4A 2IIYA 2YJ7A 1J0FA 1A24A 1OC3A 3TDGA 1YJ6A 4BVYA 1K0MA 2R37A 3N9JA 1FHEA 2VCXA 3O76A 4ZBAA 3SBCA 4XRAA 1SYRA 4KNDA 3VPTA 4Z7XA 5IMCA 5GAND 4ZB9A 4KW6A 3TKPA 4GQFA 1SKSB 1TI1A 3VWUA 2P31A 3H8QA 4WEYA 3E9JB 1K3YA 1TP9A 2ALBA 4GQCA 1M7TA 2GDRA 5C04A 4GTUA 1VF4A 1VGLA 2LKUA 4EF0A 4ECCA 4LLRA 4DVCA 1BYEA 2C3QA 5FT3A 3CRUA 1AIUA 1K0OA 5CRDA 2H76A 4NPBA 2X8HA 1GL8A 1K0CA 4QL9A 4JU5A 1AC1A 1NHYA 3GIXA 4IP6A 2F8AA 3GFKA 4D73A 1E2YA 2IFQA 3GTUB 4MABA 1CQHA 2EIRA 2H1GA 1FAAA 2NTOA 2IMFA 1ZMAA 5ECMB 4LL1B 2TRXA 4QQ7A 2YWOA 1HYUA 1TTZA 1E6BA 4ZB6A 1JZWA 5DJLA 3RPPA 4OFTA 4HS1A 5KN3A 1XWGA 1M2DA 1G6WA 2MYGA 4NV5A 5IO0A 2B1LA 1KTEA 2IJYA 1B4PA 1TJDA 2YNXA 4DEJA 2ON7A 4MJBA 2B5XA 5LCZA 1TDIA 1J08A 2Z9SA 1ZYEA 4J56E 1HQOA 2IPAA 4MZBA 1TKDB 4ZILA 4ECBA 5ECNB 2F8FA 3CSHA 5DALA 2HI7A 3ZFLA 1MDKA 4ZBBA 2JSZA 3ME8A 4N0ZA 5B6NA 1K0NA 2P0GA 1FB0A 2JZTA 3EYTA 2KHPA 3FK8A 1ON4A 4IN0A 4CDOA 3DXBA 2HZFA 20GSA 5JCGA 3ZREA 2XBQA 1GH2A 2B5YA 2EC4A 1AQXA 3Q6OA 1PX7A 1V57A 4OWYA 4QL7A 1TOFA 3ZLPA 4YH2A 3GX8A 3KGKA 2C0DA 2I4AA 3V1WA 3QPMA 2YWMA 2K8VA 3TKSE 1F37A 4MA9A 4IGJA 3CSJA 2REMA 2JACA 2KUCA 3EC3A 5IOWA 2K6VA 1OKTA 2VD1A 5KN2A 1SK2A 2YV7A 3UL3A 3N5OA 1S3CA 4HQZA 2O87A 4V2LA 5H5SA 1O6JA 4MK3A 4BL7A 3ZIVA 5AGYA 4AJ7A 1VF2A 1SD9A 4KB3A 4KE3A 4D73B 1SD8A 4OMVA 2GQLA 4AJ6A 1JZRA 2PUKC 2V1MA 4HUAA 2CVDA 3LEFA 1V40A 3ZRDA 3CTFA 5ECOB 3HVXA 4EVMA 3ZMLA 1PKZA 4O92A 5EPFA 5F05A 1WRYA 2H30A 2LEGA 1MDJA 1A2JA 1K0AA 1PN9A 3VPQA 2GQKA 1FOVA 2VLTA 2HZEA 1BG5A 3F3RA 5DCGA 4ZL9A 1GSUA 1TRSA 4KDUA 1IYIA 4WETA 2YWNA 5INYA 1F3BA 4DSSA 2A2SA 5IMDA 3ZIJA 3U5RE 2E2GA 1EOGA 4XHMA 3WYWA 5DALB 4XIHA 1T7PB 3BBYA 4RQXA 3GURA 2VL9A 4OD7A 3KMOA 2FWGA 4TXOA 5D96A 4IJ3A 5JWOB 1M2AA 3KH9A 1A0FA 1LJRA 2YV9A 4G2EA 3TRXA 2RLIA 3CYNA 4FYBA 3BCKA 3HYPA 1G7EA 2HRNA 3C1RA 2LRCA 1A0RP 3GSTA 3RPNA 3UMAA 3TKQA 5DVBA 4IP1A 1Z6MA 3QR6A 2M80A 16GSA 2VCZA 1XIYA 1OYJA 1DBYA 4JBBA 3F0IA 2CAIA 7GSSA 5ID2A 5J3RA 3FZ5A 1W89A 1EEMA 2HRFA 2VCVA 5IOXA 3DRNA 4Q5QA 2DMMA 3EURA 4KCEA 3OR5A 4BPYA 1SK0A 2AB6A 3M8NA 1PQNA 3LFLA 1JLVA 4XCSA 2R5GA 1PL1A 1GNEA 2O89A 4GSTA 1PL2A 4V1Ap 2CT6A 4EC0A 3H4KA 3TJBA 4EXJA 2YPMA 3ED3A 2H6ZA 2H6YA 3UJ1A 2O8VB 1XPVA 5JCUA 3TKSA 1SYXA 4MJAA 1X9MB 4KUNA 2GSQA 3NZNA 3FZ9A 4DSQA 3FY7A 1X5EA 3TKRA 5JCWA 1FVKA 2H1AA 3LYKA 3F9UA 2QKEA 3PR8A 4PX1A 3CRTA 1MTCA 3ISOA 3G7YA 1VF1A 1ZL9A 5B8AA 1KBNA 3LJRA 5CRWA 2EIOA 4L8EA 1R5AA 5D93A 5H5QA 2MMAA 3DEXA 5LD0A 1X5CA 4HZ4A 22GSA 2XC2A 4O7HA 1V98A 2GSTA 1WIKA 2FA8A 4FYUA 5ELGA 2WZ9A 2PGTA 1GSDA 3HJOA 17GSA 3D4TA 5HR0A 3DWVA 3G7IA 1A2MA 3MSZA 1XOBA 3QCPA 2H8LA 3FEUA 1I9DA 2QC7A 4K6XA 3HZ4A 3KJYA 3EVIA 2H70A 2FUG2 3WT1A 1GP1A 4G10A 3BJ5A 1B8XA 6GSTA 1F9MA 4WF4A 1U87A 3H79A 4N30A 1O85A 2VL3A 3WT2A 4GWRA 1B9XC 2NDOA 3GH6A 3QAVA 1KEBA 5DDLA 5GSSA 3DGQA 3K8NA 4XS1A 3LQ7A 4Q5NA 2VM2A 2OADA 5G1LA 1THXA 2H6XA 3HCZA 5IO2A 3VI5A 3QD9A 1A23A 5DJMA 1M0UA 4AJ8A 4WBRD 1C72A 2L6CA 4JRRA 5J9CA 3H1NA 3VWVA 2GZYA 3P8WA 3RHCA 1UN2A 2FHEA 4OFNA 1USBA 4HEA2 1F2EA 5DBQA 3DKSA 3SWLA 3Q19A 2HSHA 3L4NA 4MF5A 3IXRA 4KDXA 4F82A 4V2MA 2AJQB 3L78A 4XTSA 1GTBA 2FWHA 5ECPB 1T4ZA 2LJKA 2L59A 1PKWA 4LA1A 1PX6A 4TR0A 1Z7RA 3GMFA 5EY6A 5DQYA 3Q18A 1B4QA 2AHEA 2LNSA 3DD3A 3HXSA 4BWQA 3LGCA 3J7Yk 1K0BA 3D5JA 3MDKA 3FW2A 2H1DA 3DVWA 1TXXA 5G1KA 2VL2A 4XS4B 3M0FA 3PGTA 4WF5A 4ML1A 2JL4A 1Z7PA 3HZ8A 3DYRA 1JZOA 3KP9A 4MP4A 1XOAA 4JEDA 4EKZA 1EEJA 2GS3A 4RI6A 3JCML 3WGDA 3TGZA 1O81A 2VOCA 3LXZA 2X99A 5F06A 2HFDA 1MD3A 5AIXA 5D9XA 2L4QA 2P5QA 3HHVA 3TB2A 1B48A 3UARA 11GSA 1ERVA 4JR4A 2A2RA 3TOUA 4POKA 3KZQA 2H0IA 3TKSC 2M46A 4KCAA 3LXTA 3KXOA 2OE1A 3VWXA 3KTLA 2FY6A 3D6IA 3I6AA 2H1BA 1ILOA 1H75A 2KLXA 2VCTA 5C00A 4YQVA 2XBIA 1M2BA 3FHKA 1U3IA 1XCCA 1XWCA 3TOTA 2YANA 1YDKA 4DSRA 1QMVA 4MLYA 6GSYA 3KEBA 3L9VA 1A8LA 1QK8A 4MPGA 3LORA 1TK8B 3MNGA 4GLTA 1BEDA 2E7PA 2I3YA 3FR6A 4CW9A 1EV9A 8GSSA 3FZ4A 1ERUA 2GSRA 4F03A 5ENUA 3HD5A 3HY2A 1SL2B 4NHWA 4ULXA 4V2NA 4KA0A 2V41A 4MPFA 2AV4A 4PURA 2YZUA 1ERWA 1R7HA 2L4CA 1VRSD 3W8JA 1MDIA 3R2QA 4K2DA 1SL0B 2PBJA 3KP8A 3HJMA 4FIWA 5FWGA 5G30A 4F9ZA 5CREA 2DJ1A 3CXGA 14GSA 2CV4A 4ID0A 1JHBA 1T00A 2N5AA 5IMAA 1EWXA 1YKAA 3TUEA 3GKMA 3F4TA 2GLRA 4OCFA 4J57E 2X8GA 1OKDA 2LUSA 4BA7A 2VD0A 3ERGA 4OCEA 2LS5A 4PNFA 2PERA 2PWJA 4F0BA 4BWSA 5G31A 3GUSA 3UBLA 2FNOA 1X0RA 3IDVA 4GF0A 4EDYA 2ON5A 5G2ZA 5CO3A 3KMNA 4LMVA 2WB9A 4PQHA 1AUCA 3APQA 1AQWA 4PGTA 1XZOA 2C80A 5EVOA 1X9WB 4GCIA 3UIWA 2L6DA 2IWTA 2X64A 4NMUA 3QFBC 1QQ2A 2WFCA 3G9BA 4PNGA 3BOAA 1SKRB 1AQVA 1K3OA 1U3AA 2CVBA 2AUVA 2QSIA 2VL2C 5CP1A 4WBJA 3GV1A 2IL3A 2FWFA 4POMA 2ZCTA 3M3MA 3F4SA 3KH7A 5IMVA 1MEKA 5D9TA 3J7Yb 2ZUPA 1DSBA 4ECJA 5IPHA 2DLXA 2KP1A 4CHSA 3IC4A 4X43A 5IMZA 5IMFA 4PQIA 3QAWA 3RAZA 1V58A 2DJ3A 1GTUA 2MBSA 3L9SA 1UVZA 2IMKA 2CX3A 1PA3A 2GT5A 2WJUA 1Y25A 4G9HA 1JLWA 2XPDA 2LJAA 3LG6A 1MD4A 3C71A 4NXIA 1YEXA 4WR4A 4NHZA 5A4UA 3IV4A 3M9JA 1OVNA 1SU9A 4N10A 3P7XA 1YEPA 4MDCA 4YAPA 5ECKB 1TI3A 6GSWA 4HI7A 4PQ1A 1WOUA 1SKWB 2H19A 6GSXA 2C0GA 1EP7A 5F07A 4TVEA 2CZ2A 1YF0A 1Q4JA 4YQUA 1UC7A 1XWBA 4I8BA 2VLVA 4LL4B 2X8CA 1QXHA 3M1GA 4XRDA 2CVKA 2C0EA 2CZ3A 2K8SA 5CAXA 4KGIA 3ZZXA 4MJEA 1M9BA 2FA4A 3Q74A 1GUMA 1T4YA 3US3A 3W6GA 3EU4A 2K9FA 4N0VA 3IPZA 1EGRA 3VK9A 4JE1A 2H71A 2IMIA 3HA9A 2YCDA 5D9WA 1TU7A 2VCWA 3O6TA 2OJLA 2DMLA 2P5RA 2PPTA 4ILFA 1OC9A 1ZZYA 2VLUA 4RQRA 3GSSA 1XW5A 2PU9C 2YP6A 1O8WA 1GSEA 4E8HA 5J9BA 4RI7A 2GVPA 5E59A 2BJXA 2DC5A 1Z6NA 4YQMA 1X5DA 3QDNA 1YKCA 2JZRA 3PH9A 4TOPA 4IHUA 2F9SA 3FZAA 2TRCP 5ECSA 4XS4A 3ZITA 4KH7A 1FVJA 1HNBA 1DE1A 2LNTA 4TXVA 2RUFA 3VI7A 2PVOC 3ERWA 3BCIA 5HFKA 3IOSA 5HR1A 1EP8A 2L5OA 1TK5B 3NOFA 3F6FA 4IKHA 3I43A 4FH8A 2H73A 3D4MA 2VAFA 3TRQA 5L71A 3O3TA 1EOHA 4H86A 2LJRA 1YZXA 3EINA 1GUKA 2BMXA 3IRAA 3CBUA 5EL8A 5JWRB 4WR5A 5A4VA 2WDUA 1OE8A 3IA1A 5HFIA 2F51A 5GAPD 2B6MA 4K0GA 4OFMA 1GNWA 4KSMA 4TR1B 4K7IA 1ERTA 2E2MA 2RIIA 1XVQA 4AGSA 2C0FA 4E8EA 4IS0A 2V6KA 1FW1A 3TJJA 5J4UA 5AN1A 4GXZA 1N8JA 2BTOT 4IQAA 1XFLA 2OBIA 4HDEA 3EMPA 4N11A 3QOUA 2CX4A 4L0WA 5CNWA 2FCHA 1T8EB 2VUPA 3A2XA 1ZOFA 2GZPA 1S3DA 4GSSA 4KX4A 3DVXA 1SJZA 1OC9B 1GTIA 5E4WA 1NW2A 1M99A 4P3YB 3C8EA 1BAYA 2MMOA 2CAQA 3A5WA 2DJJA 4MZWA 3UVHA 3L9UA 1M9AA 1T1VA 1SENA 2E0QA 1TRUA 1O7UA 3D0ZA 2VO4A 5DAKA 1V2AA 2H72A 5DCHA 3E0UA 1XVWA 4MZCA 1B9YC 2HLSA 3QMXA 2HT9A 2J23A 1A8YA 4BVXA 2C3NA 5CRGA 1Z9HA 1DUGA 5IIZA 2RUEA 1H4OA 5HR3A 2NVLA 2HE3A 3C73A 4XS6A 4POBA 3ZTLA 2ES7A 3CTGA 4L0UA 5AIVA 2IN3A 4X1UA 4EO3A 2QGVA 4POLA 4ISDA 5D9VA 2MMZA 4L5LA 2JADA 2OACA 4TRXA 1NHOA 1OE7A 5JWQB 4I5QA 3ERFA 3TJGA 1XXUA 1T3BA 4ZB8A 4EE0A 4KSOA 2XHFA 2WCIA 1XWKA 3GN3A 1UA5A 5KEJA 2R4VA 4I2TA 1PGTA 1U88A 2H0HA 2R6KA 2H01A 2C1YA 2I1UA 2XPEA 3QFAC 4JZQA 1TU8A 3DIEA 3APOA 2JZSA 5DQSA 5A5KA 5A4WA 4OO4A 2MMNA 4TN8A 4L5OA 2FLSA 3IBHA 2B3SA 1ABAA 4KDYA 1AXDA 2DIZA 1IYHA 4NWYA 2OBKA 4TW5A 6GSUA 3APSA 3FYGA 4RUVA 2B7KA 3EWLA 2D2ZA 1HNAA 1A2LA 1F6MC 1ZGNA 3D21A 4FYCA 3RHBA 2H66A 3VWWA 1XBSA 4GRFA 3IK7A 2VIMA 2I81A 3GRXA 3KIJA 3F3QA 3CMIA 4Q5RA 4IELA 2F3MA 5ECHB 1LBKA 1G6YA 5DAKB 1TW9A 12GSA 3G7JA 1WJKA 4X0XA 5CYYA 1VF3A 3LWAA 4MMMA 4ZXGA 1FG4A 3GX0A 2C4JA 3F8UA 2DJKA 1HD2A 3GL3A 1WMJA 4WXTA 2N5BA 1YF1A 1PRXA 3HKRA 2M72A 3A2WA 2YN1A 2LTKA 3ZMKA 3C7MA 4MF7A 2MZCA 1GSYA 2WS2A 1RQMA 4HOJA 1GSFA 1HNCA 2H0GA 4K7NA 5H5RA 2RM6A 2B1KA 4HJMA 4IW9A 3W8SA 2L5LA 1RW1A 2JSYA 3EMXA 4G19A 5FHIA 6GSSA 3UVTA 1TRWA 5HR2A 1JZDA 3M9KA 3I9V2 3ZYWA 2VM1A 3IHQA 3HVVA 1O73A 1TRVA 4K0NA 5ECIB 1O8XA 1I5GA 3F63A 4MF6A 1WPIA 2HNLA 1NSWA 1V9WA 1S3AA 3F6DA 4NV2A 1JFUA 1GLQA 1LU4A 5ELAA 2IMEA 2WULA 4Q5FA 1SL1B 3GL5A 4YAVA 2IFQB 3TJKA 3S9FA 5IQYA 2A4VA 1KNGA 2NBSA 4O5RA 3KD0A 1OC8A 3ME7A 2DBCA 3RDWA 1CQGA 4PUFC 2CQ9A 4K8MA 3H93A 3GKKA 5IM9A 4ECIA 4K7OA 2DJ2A 1EZKA 5HQPA 1NM3A 3UEMA 4I6XA 2LV3A 2WGRA 3L0HA 4K1FA 1WE0A 3HVSA 2TIRA 3P2AA 4ZL7A 4ACSA 1SJIA 1QGVA 4KAEA 2RM5A 5CRHA 5F0GA 2FD3A 5KN0A 4HQSA 1K0DA 2WRTA 3F4RA 1PMTA 2GSSA 1WWJA 3UOMA 2YWIA 2LQOA 4MJCA 2DIYA 4TR4A 4MH3A 5KN1A 1Y6EA 3AY8A 5LNKe 1ACVA 1GLPA 1WP0A 4ZBDA 1TK0B 1Q98A 3NIVA 1XW6A 5F8BA 4PXOA 2B5EA 2C8UA 2J9HA 1PSQA 6GSVA 2FWEA 4PUAA 4TR3A 3PINA 3GA4A 3TCOA 3EE2A 2YZHA 4HJ2A 3FR3A 1GULA 2GQMA 3CSIA 2YOIA 2HXKA 3FKFA 3LSZA 2AAWA 3TJFA 1GUHA 3KTBA 1FO5A 1J9BA 4WKWA 4IQ1A 3EU3A 3IR4A 3HJPA 3ZFBA 4EDZA 4OO5A 2L57A 1R4WA 2HSYA 2DSAA 2C3TA 4HU9A 3VFIA 4TR1A 5ABRA 1R26A 3GHAA 4IJIA 3VLNA 2H74A 3GNJA 5ECRB 1GSQA 1ML6A 3WGXA 1XWAA 13GSA 1SJ6A 10GSA 2K18A 1OAZA 2FGXA 4J2FA 5IPGA 2I9HA 5ECQB 3VURA 1W4VA 5ECLB 1G7OA 3IAM2 2LRNA 4I2UA 2O85A 1GRXA 3ZVJA 2O7KA 2GZZA 1Z5YE 2PMTA 2VCQA 2KP2A 2OE3A 5D8IA 1ZYQB 1U6TA 2OE0A 4IBPA 3I69A 4I97A 1F3AA 5GZZB 2YJHA 5AISA 1X9SB 2G0FA 1YY7A 2AYTA 4EL1A 1R5PA 2HZEB 3WGEA 2MBTA 3KCMA 4EUYA 1GWCA 1N2AA 1AAZA 5J41A 2LQQA 3TRPA 2R2JA 1BJXA 2N5FA 4DSSB 3MWHA 4ML6A 2G2QA 3MAKA 1G0TA 3UAPA 2PVQA 2HYXA 3HDCA 4MH2A 5G5EA 1GTAA 4V1Ag 3A2VA 3GKXA 1ZCPA 1RK4A 2NPBA 4LMWA 1BX9A 5COHA 2LRTA 4TXOB 2GT6A 4O32A 3ZL5A 1URMA 2ZNMA 3LYPA 1BQ7A 2DJ0A 1XW9A 3A3TA 1K3LA 3IK9A 3GH9A 3U6VA 18GSA 1YQ1A 2H75A 5GSTA 2GGTA 2PN8A 1SK1A 3FRCA 1Z3EA 1THOA 3E3EA 4HZ2A 4IVFA 2IMDA 2KOKA 4AF2A 3RBTA 5B8BA 5ID2B 4F2IA 2V2GA 2V32A 1QUWA 3D22A 2B7JA 1DE2A 3GYKA 3GTUA 4ZIJA 5D73A 3FR9A 3IE3A 1ST9A 4MCUA 2R3XA 4GSNA 2GTUA 4F0CA 1QFNA 3ZVJD 3GKNA 3QAGA 1AW9A 3WD6A 3KM6A 3BD2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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