3ZREA

Reduced thiol peroxidase (tpx) from yersinia pseudotuberculosis
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
b'TMTQTVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
source organism Yersinia pseudotuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 44
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zreA00
1URMA 1JZWA 5GAND 2YZUA 5ECQB 1K3LA 2N5FA 4K1FA 4DSSA 2A4VA 1IYHA 3P90A 1DUGA 1O85A 4IBPA 1AQVA 3F3QA 3N5OA 2HXKA 2VCVA 1GSYA 3NZNA 1DSBA 3GSSA 2C1YA 5DALB 2XHFA 3QAVA 4K0NA 4F82A 2F3MA 1X0RA 3APSA 3EMXA 4GQCA 4PNFA 3P8WA 1HD2A 2X8CA 1PRXA 2E7PA 1FVKA 3ZIJA 4RUVA 1S3CA 1FVJA 4ZXGA 5ECIB 1X5DA 1ERWA 4XRAA 1YZXA 1ILOA 1ABAA 2CA8A 2VL2A 4GF0A 3J7Yb 4MZBA 2YWMA 2P5RA 3IV4A 6GSYA 3W8SA 1FOVA 2FHEA 3GKKA 3SWLA 2V6OA 4I6XA 1VF2A 1J0FA 2H6ZA 4I2TA 1ZL9A 1EP8A 1V58A 3HXSA 4KDYA 1RQMA 5CNWA 4TVEA 1BAYA 3MAKA 4KNDA 1XW9A 4YH2A 2DIYA 4XS4B 5ELGA 1T00A 2ON7A 3DWVA 5CYYA 3FYGA 2H6XA 3ZRDA 4IQAA 2VUPA 3A2VA 3Q6OA 1MDKA 2GLRA 4ECJA 3LWAA 4LL4B 4BL7A 2JSYA 3IAS2 2YN1A 5AISA 3QR6A 4NHWA 4NPBA 3I9V2 4XIHA 1C72A 3L78A 1Z5YE 3GH6A 1DE2A 4POLA 5EY6A 3KJYA 1SK1A 1VF3A 2XC2A 2R6KA 5B6NA 3W6GA 1U88A 3I43A 3MDKA 3ZYWA 4ACSA 5DALA 2K9FA 2X64A 2ZUPA 2PBJA 1TW9A 2AJQB 1XWKA 1LJRA 2DJ2A 5HFGA 5CRWA 3IPZA 1GH2A 5DBQA 1O8WA 1B9XC 5D93A 4Z7XA 4AJ8A 2JL4A 2OBIA 2PVQA 5CP1A 2N5BA 2O8VB 4HU9A 3F4TA 4N0VA 4TRXA 3KMOA 3FR9A 1U87A 4NHZA 1CQHA 3DVWA 3V1WA 2LRTA 2H01A 1EEJA 5KEJA 1GSUA 3LORA 14GSA 1Z3EA 2MMOA 1DBYA 3KXOA 5FWGA 2FWFA 1GLPA 2EIOA 2I9HA 3HVXA 2EC4A 2YZHA 1SKRB 2DJ1A 2K8VA 4KX4A 1OKTA 2AV4A 2BTOT 4XS4A 4MJEA 3ZLPA 4PQ1A 3GN3A 3IE3A 4MABA 4Q5RA 2X99A 3KD0A 1ZYEA 1FW1A 2LRNA 4HI7A 1K0NA 2GSRA 1M9AA 2VLTA 3CBUA 3TJKA 3HZ4A 4JEDA 4IGJA 1K0AA 2H76A 5DQSA 1SYRA 2GGTA 4E8HA 4Q5NA 1K0CA 1QUWA 3A3TA 3HY2A 1FB0A 2NPBA 3VWVA 4LMWA 4HOJA 3CYNA 3WT2A 2ZCTA 4TOPA 1TRVA 1GUMA 1VF1A 2FLSA 3H1NA 5C00A 3EYTA 3TKQA 2BMXA 2K8SA 2G0FA 3D5JA 3US3A 2LJRA 1ZGNA 1ACVA 2C8UA 2IMDA 1K3YA 4HEA2 1JFUA 2B5YA 1GNWA 2WFCA 1XCCA 2C0FA 1PX7A 2VM1A 2B6MA 3C1SA 4L5LA 2RUFA 3ZL5A 4EXJA 2GSSA 4WF4A 2RIIA 3QCPA 3KTLA 1O81A 2FA4A 4D73A 2H0GA 4X43A 1WP0A 2AAWA 1X9SB 3I69A 2QSIA 5G5EA 1A23A 2X8GA 4YQVA 1FHEA 2R2JA 3UAPA 3FY7A 2CT6A 3N9JA 1TI1A 3GHAA 4MZCA 2GZYA 5A4VA 3FZAA 1TP9A 2XPDA 2XBQA 3LJRA 1TK5B 4TR0A 4N30A 1TKDB 3CTGA 3K8NA 4TXVA 2TRXA 5D96A 5IPHA 2HYXA 5JCWA 3TKSA 19GSA 2H30A 2KP1A 2XBIA 1A8YA 3QFAC 4WBJA 1O6JA 4HQSA 2VL2C 2DMLA 2WGRA 1A0FA 2E2GA 1GTUA 2YJ7A 4GSSA 3M0FA 2CVDA 1XOAA 4LLRA 3KH9A 4YQMA 3DKSA 1YF1A 2YNXA 5ENUA 4L0UA 4FYBA 3Q18A 6GSXA 2LQOA 4FH8A 3CMIA 2IIYA 1K0BA 3FK8A 2E0QA 1XVWA 3TUEA 3A2WA 2VD0A 2GS3A 5KN1A 3O6TA 2H73A 3CXGA 3HCZA 3FEUA 1PQNA 3ZZXA 4MLYA 4G10A 2CVBA 1ERTA 2OACA 2HI7A 1O7UA 1I9DA 2VL9A 5CREA 2WB9A 4JU5A 4EO3A 5ABRA 1PD21 4ZL9A 1GSFA 5AIVA 2CQ9A 1F37A 1XXUA 4IHUA 1TRUA 4IVFA 1Q4JA 1AXDA 1Z6MA 4O92A 1A2LA 4ZIJA 2HNLA 2L5OA 1WIKA 4ML6A 1WRYA 3F6FA 4MH2A 1T4YA 1Z9HA 3BBYA 3NIVA 1OKDA 4KB3A 1MEKA 5ECKB 4BVYA 4LMVA 2H75A 16GSA 4TR1B 3UBKA 1TDIA 1S3AA 2D2ZA 4PUAA 2I1UA 3IC4A 1SKSB 1YKAA 4PXOA 1EV9A 4PX1A 1FO5A 4F2IA 2LJKA 2GT6A 5J5NA 2VOCA 3KZQA 4MA9A 4TN8A 5GAPD 1SL1B 1GTIA 1OE8A 3P7XA 2OE0A 3GX0A 1PN9A 4MPFA 4EDZA 4NAXA 5ECHB 1LBKA 5HR2A 2HE3A 2IMFA 2YOIA 4XS6A 1JLVA 3APQA 4LL1B 1GSQA 3UBLA 1WE0A 2YWIA 3IA1A 3L0HA 3EMPA 2DSAA 5G5FA 2MBTA 3GUSA 4MCUA 1CQGA 1SL2B 5JWOB 1VGLA 4K7OA 2WZ9A 4V2LA 3L4NA 2IMKA 4G9HA 5A4UA 3HJOA 1QFNA 2IWTA 5FHIA 4K2DA 2DC5A 4HS1A 1EEMA 1EWXA 3QMXA 3BD2A 1B4QA 4XTSA 1GUHA 22GSA 3VLNA 4OFNA 5G1LA 4QL9A 3FRCA 4TXOA 3GNJA 4PGTA 4JZQA 4DSQA 2JZTA 5D73A 4MDCA 1V98A 4ZBBA 2AHEA 3EU4A 4DEJA 2A2SA 5IOXA 2YWNA 2H66A 5DVBA 3TOUA 5IPGA 1ERVA 1KTEA 3ZMKA 2DJKA 3DYRA 2FNOA 1YDKA 4EVMA 4IN0A 4NWYA 3RHCA 5ID2A 3GKNA 3ERFA 2ALBA 2RM5A 1JZOA 1O73A 1Y25A 2B3SA 3HD5A 2H0IA 1NW2A 4I8BA 4N10A 2P31A 2B1KA 4KE3A 3GX8A 2YP6A 4K6XA 5F0GA 3J7Yk 5CRHA 2P5QA 2JU5A 2CZ3A 1V40A 1BX9A 1TK0B 1R26A 3KEBA 3ZFBA 1XWCA 3DIEA 2M80A 4GSTA 3EURA 3LG6A 4HU7A 2HT9A 2LUSA 4IP6A 3EVIA 5DJMA 1XOBA 2H6YA 2J23A 2YV7A 2DMMA 1XW5A 2K18A 2GDRA 1LU4A 4NXIA 2IFQB 4PQHA 4V1Ap 2IPAA 3L9VA 1I5GA 4X1UA 1H4OA 2VLUA 5COHA 1BYEA 3EU3A 2L5LA 2C3TA 3H79A 3H8QA 1ZYQB 1TRSA 3PINA 3F4RA 1SU9A 4GLTA 3TKSC 3G7YA 4J57E 3GL5A 4MMMA 4OFMA 1E2YA 5DCHA 2FA8A 3UEMA 2B5EA 3ZREA 1PGTA 2NDOA 4V2NA 1AQWA 1WOUA 4G19A 3TKPA 4WKWA 4KDXA 4IELA 4MJCA 4F0CA 4HJMA 2VCQA 4ZL7A 1GWCA 1QMVA 3QOUA 2ON5A 2L59A 3CSIA 2KUCA 4K7IA 1GL8A 2L4CA 5LCZA 4KCEA 5HFKA 1U3IA 2GQLA 2GT5A 4OCFA 4P3YB 1A8LA 2GZPA 3DRNA 5D9VA 2AYTA 3WT1A 5GZZB 1M0UA 1N8JA 3HZ8A 1G0TA 2KLXA 4DSRA 1ZCPA 1MD4A 3ZVJD 3HJPA 1WJKA 4CHSA 5DCGA 3HA9A 1ON4A 1SJIA 3ME8A 4CW9A 1GSDA 1A0RP 1X5EA 5GSTA 4Q5FA 3GIXA 4RQXA 3ED3A 3DVXA 3HVVA 2OA7A 18GSA 2BJXA 5ECMB 4EKZA 1TRWA 4IW9A 1SD8A 2ES7A 5ECPB 4K9ZA 2LSTA 3KM6A 1K0MA 3U5RE 4ZILA 1KNGA 5B8BA 5E4WA 3FW2A 4O7HA 13GSA 1PSQA 2DLXA 2H0HA 3H4KA 4HQZA 3TJBA 1G6WA 4I2UA 1THXA 1MDJA 1XWGA 5EVOA 4OMVA 2IL3A 1G6YA 4MH3A 3EWLA 3VWWA 3ZIVA 3LGCA 5EL8A 5LNKe 2LTKA 2V6KA 2YJHA 5IQYA 1YEPA 1OC3A 2NTOA 1W4VA 2TRCP 4EL1A 5KN2A 1RW1A 4H86A 3GFKA 3JCML 5B6MA 3GKXA 4ZB9A 2WULA 1TU8A 3ERGA 5IMCA 1J08A 4MF6A 5DAKB 3FZ9A 2B1LA 2H1BA 10GSA 1O8XA 1EOHA 3RAZA 2JACA 2MYGA 2CX3A 1BQ7A 4TW5A 1WMJA 3MNGA 2V2GA 3ZITA 2H74A 1XZOA 2R5GA 1AUCA 3TRQA 3UVTA 4BVXA 4NMUA 4JR6A 3TRXA 3D22A 4ISDA 4XCSA 1OYJA 3KGKA 2DJJA 1SL0B 2HZEB 5CO3A 3TCOA 3TJFA 1SJ6A 2C80A 3M9JA 5D8IA 3GTUB 3F63A 4MJAA 3BCIA 4WR4A 2C0DA 4F9ZA 5JWRB 1FG4A 2C4JA 5J41A 1TTZA 1PKWA 2R3XA 11GSA 1T7PB 1WPIA 2FY6A 3SBCA 1ST9A 4IJIA 3ZMLA 1NSWA 1GSSA 1YJ6A 3KIJA 1BG5A 4EE0A 1Q98A 1E6BA 3IDVA 2PUKC 2O85A 4KCAA 1SK0A 4L0WA 4ZL8A 4PNGA 2IN3A 2M46A 3I6AA 3WD6A 2YWOA 5DJLA 2CVKA 1JLWA 2CAIA 1T4ZA 2VLVA 2LS5A 4V1Ag 3LXTA 2E2MA 3GYKA 2HLSA 5KN0A 2MMZA 2C0EA 4IJ3A 3FR3A 2DJ3A 1XBSA 1A2JA 4JE1A 4ML1A 4GSNA 4GRFA 4DVCA 5DAKA 3EE2A 1OE7A 1YY7A 5CAXA 1DE1A 4OWYA 1SENA 2FD3A 2HSHA 2JZSA 2PU9C 2KHPA 3Q74A 2F8FA 5HQPA 1OC9B 5B8AA 3Q19A 3RPNA 5ELAA 2FWGA 4JRRA 4EUYA 4GXZA 3D6IA 1YQ1A 2DBCA 1B4PA 2XPEA 2GQKA 4QL7A 1IYIA 1GP1A 2YV9A 4MZWA 3IRAA 2REMA 3BJ5A 5AIXA 2J9HA 3A2XA 5C04A 2RUEA 2EIQA 1TJDA 2FWHA 1X9WB 4Q5QA 4RI6A 1F3BA 5JWQB 3M3MA 3FKFA 1XFLA 3E3EA 4AJ6A 1W89A 1F6MC 3QDNA 4HUAA 3VWUA 5ECSA 1PKZA 2KOKA 3LFLA 1V9WA 1SJZA 4ECIA 4BWQA 2V32A 1UN2A 1M99A 2LNTA 3TKSE 1AAZA 4I5QA 4IP1A 3CRTA 17GSA 4E8EA 2PWJA 3QAWA 2QGVA 9GSSA 2AB6A 3PR8A 3D21A 1XW6A 2GVPA 6GSWA 4POBA 2Z9SA 1F3AA 1XWAA 4GTUA 2VCWA 4TR4A 2CV4A 2H1AA 3VWXA 5IMFA 2HRFA 4PURA 2F9SA 5G1KA 4O5RA 2X8HA 3D0ZA 5LD0A 3KTBA 2YCDA 20GSA 1NHOA 1H75A 2WDUA 1M2BA 5IMZA 3C7MA 3GA4A 3A5WA 2G2QA 3WGEA 5D9XA 1A2MA 1VF4A 3DGQA 1ML6A 4GQFA 2OADA 3QAGA 2RM6A 3LXZA 1MTCA 5IOWA 3D4MA 1USBA 2GQMA 5F07A 1SK2A 4FYCA 2K6VA 4ILFA 1EZKA 3DEXA 3TOTA 4TR1A 1J9BA 4FIWA 3NOFA 4OD7A 2MBSA 2FWEA 3VI5A 1UA5A 2LV3A 4WR5A 3KH7A 1M9BA 1QK8A 5IIZA 1NM3A 3F8UA 4I97A 2KP2A 3HDCA 1PMTA 2C3NA 5ECNB 2WJUA 4OFTA 5DDLA 1KBNA 4OCEA 3GKMA 2VAFA 3DD3A 1GNEA 2IMIA 3VI7A 4BWSA 2OE3A 2LKUA 4L5OA 1TK8B 2JSZA 4KDUA 5JCUA 3RPPA 1G7EA 2GTUA 2VCXA 5F06A 3WGDA 1EGOA 1EGRA 4G2EA 3C73A 4K0GA 1V2AA 1TU7A 2PVOC 3F3RA 3M8NA 2VO4A 4ZB8A 2LEGA 3W8JA 3VK9A 2VIMA 3QPMA 5L71A 5IMAA 3TGZA 3IBHA 1M2AA 2AUVA 1GULA 2OJLA 1ZMAA 3APOA 3C71A 3GURA 4F03A 2DIZA 4XRDA 3GV1A 4HZ4A 1QXHA 2CX4A 2M72A 2L6DA 1R5PA 1OC8A 5F05A 4J2FA 2RLIA 7GSSA 3HVSA 3O76A 2H71A 4KH7A 1NHYA 3P2AA 4NV2A 1T1VA 2HZFA 3AY8A 4IQ1A 3G9BA 1SD9A 2H1GA 1THOA 2V1MA 2CZ2A 4WXTA 3ERWA 4X0XA 5J9BA 4FO5A 5J4UA 4RI7A 4OO4A 5ECRB 1X9MB 2FCHA 3MSZA 3MWHA 4K7NA 5JCGA 4V2MA 4CDOA 2I3YA 1FB6A 3CRUA 4XHMA 5GSSA 4GWRA 4POMA 2VCZA 4IS0A 1Z6NA 2R4VA 4ZBAA 1BEDA 4POKA 3TDGA 2WCIA 1GUKA 2QKEA 2IMEA 4PUFC 3WGXA 1UVZA 2YPMA 5H5RA 2IFQA 3G7JA 1U3AA 3FZ5A 2MMNA 4D73B 4HJ2A 5HFIA 2PN8A 3IR4A 1M7TA 2A2RA 1OAZA 1JHBA 4PQIA 6GSTA 5AN1A 1BJXA 4F0BA 3O3TA 1R4WA 3RDWA 2FGXA 3QFBC 3L9UA 1KEBA 1XWBA 2R37A 3F6DA 1JZDA 2VCTA 3ME7A 5ECOB 1VRSD 4N0ZA 2HRNA 3IK7A 2F51A 3CSHA 2LJAA 1T8EB 1M2DA 2JZRA 2H72A 3VPQA 3GL3A 1HNBA 3LYKA 4IKHA 1YKCA 3TKRA 3L9SA 2C3QA 1N2AA 2MZCA 2N5AA 1T3BA 3F0IA 4ECCA 4EC0A 2OKAA 2GSQA 3UIWA 5HR3A 1HNCA 5HR0A 4K8MA 1V57A 3E0UA 1QQ2A 1WWJA 8GSSA 2GZZA 12GSA 5IM9A 3GH9A 4YAPA 1K3OA 2C0GA 3G7IA 1G7OA 6GSUA 6GSVA 2V41A 5IO0A 4ZB6A 5H5SA 1PX6A 5F8BA 3U6VA 2H8LA 5CRDA 2P0GA 2I81A 1FAAA 1K0OA 4O32A 1AQXA 2NVLA 3RBTA 4KGIA 3VPTA 1F9MA 1HYUA 3IXRA 3PH9A 3HKRA 1R5AA 4WETA 3IAM2 4MPGA 4MF5A 3DXBA 2YANA 3LSZA 1ZOFA 4MK3A 1HNAA 4LA1A 4KSOA 2LNSA 2H19A 4JR4A 3GSTA 1B48A 2O89A 3OR5A 1GRXA 1AW9A 1TI3A 2OBKA 4ULXA 4GCIA 1EOGA 2O7KA 5G30A 2I4AA 2B7KA 4KA0A 5DQYA 3GRXA 4MJBA 1A24A 4ID0A 1JZRA 1XIYA 2GSTA 1GSEA 2F8AA 5E59A 3HYPA 4OO5A 2OE1A 4BPYA 1EP7A 5ECLB 4KW6A 3BOAA 4QQ7A 4L8EA 4RQRA 5A4WA 1MD3A 4BA7A 1ERUA 3QD9A 3F4SA 1TXXA 3UOMA 1SKWB 1HQOA 4MP4A 3ZFLA 4J56E 1X5CA 4ECBA 4AJ7A 4WF5A 2NBSA 4HDEA 4WEYA 1QGVA 3FR6A 1K0DA 3CTFA 6GSSA 3EC3A 1YEXA 4EF0A 3KP9A 5IMVA 5IMDA 3KP8A 4FYUA 5A5KA 5FT3A 1GTBA 3EINA 1AIUA 2HZEA 5J3RA 3FHKA 1Z7PA 2VL3A 2L6CA 3GTUA 1ZZYA 2O87A 3E9JB 3ZTLA 3GMFA 4TXOB 3LQ7A 4XS1A 2EIRA 2LQQA 3VFIA 1EV4A 3C8EA 3S9FA 3UVHA 5H5QA 2TIRA 1B9YC 5AGYA 1TOFA 3LYPA 1GTAA 4MF7A 3H93A 1PL1A 1R7HA 4YAVA 3ZVJA 2FUG2 4WBRD 2VD1A 2MMAA 4DSSB 3M9KA 5KN3A 2L4QA 3DMLA 3UMAA 4TKYA 1Z7RA 5ID2B 3UL3A 5CRGA 2B5XA 3TJGA 3IK9A 1RK4A 2B7JA 2HSYA 2LRCA 1U6TA 5IO2A 4EDYA 3LEFA 5HR1A 4YQUA 2PPTA 4KUNA 1UC7A 5G31A 3UARA 1PA3A 1XVQA 3F9UA 3VURA 3WYWA 4TR3A 1SYXA 5D9TA 4ZBDA 3D4TA 3TRPA 2PGTA 3M1GA 2ZNMA 5B7CA 4AF2A 2IJYA 5G2ZA 1GLQA 1Y6EA 4HZ2A 3HJMA 5EPFA 3IHQA 3UJ1A 2H70A 1OVNA 4N11A 1AC1A 1B8XA 2VM2A 5D9WA 1S3DA 1OC9A 2H1DA 3CSJA 3HHVA 2CAQA 1F2EA 1MDIA 3IOSA 3ISOA 1YF0A 2DJ0A 3C1RA 3FZ4A 4KSMA 5INYA 3TJJA 2WRTA 4NV5A 3R2QA 4JBBA 1XPVA 2L57A 5J9CA 3KMNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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