3ZREA

Reduced thiol peroxidase (tpx) from yersinia pseudotuberculosis
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
TMTQTVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pseudotuberculosis
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
total genus 44
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zreA00
3ME7A 3ZLPA 4I2TA 4RQXA 3TKPA 1R4WA 4CHSA 3EURA 2E0QA 4IJ3A 2WZ9A 1GSSA 2JSYA 3SBCA 3UARA 1F2EA 1XWKA 3TDGA 3U5RE 3G7IA 4V2MA 1K0MA 2AAWA 3HY2A 3GYKA 1B48A 2P0GA 3DVXA 3VPQA 3EU3A 5ENUA 1AUCA 2LQOA 2GLRA 2PBJA 3FZAA 5DALA 2VM1A 3GMFA 1RK4A 5G31A 3E9JB 3L9SA 4POKA 2PPTA 4ZB9A 19GSA 3ZFBA 3U6VA 2X8CA 1XWGA 4IVFA 2LNTA 4PX1A 2HNLA 4FO5A 1ZOFA 3GURA 4MJCA 3UBLA 4TXOA 1ACVA 3UAPA 5ECRB 5JCGA 1TI1A 22GSA 1J9BA 5D9VA 5KN0A 4GQFA 2LRTA 2MBTA 3GN3A 3TKRA 3C1RA 4HUAA 3VWVA 5B8BA 5E59A 7GSSA 4EE0A 3TJJA 4I2UA 1ERUA 3UJ1A 4HS1A 1FB6A 2ZCTA 3O6TA 3EMXA 3NZNA 4EUYA 1BEDA 2B7JA 1EOGA 2OE1A 2YWIA 5C00A 2PMTA 2H01A 2LJRA 1SENA 3P90A 1M2AA 3GL3A 2RUEA 1JHBA 1A2LA 5DAKB 1TXXA 4HJ2A 2XBIA 3LWAA 1QGVA 4XS4B 4KCAA 5B7CA 3H93A 2MZCA 2H19A 3Q6OA 2FA4A 4KUNA 5DCGA 4DSQA 4I5QA 2DJ2A 1PMTA 4MF5A 3DD3A 1A24A 2QSIA 5GAPD 1G6WA 8GSSA 2NTOA 4P3YB 1F9MA 3GKKA 4IJIA 2VCVA 1A0FA 1ZCPA 4EVMA 3O76A 2JSZA 5J5NA 3EINA 1GULA 1TP9A 3KP9A 4YQVA 1GTIA 4CW9A 3LXZA 3HVXA 1GNWA 2V6OA 1O6JA 4LLRA 3IE3A 4D73A 5J4UA 1AQWA 3F3QA 4YH2A 1U3IA 2H6XA 2R6KA 3IDVA 1QK8A 4HQZA 3DIEA 2IJYA 4TR1A 5HR2A 4BA7A 2G0FA 5ECMB 3GX0A 3FR3A 4Q5QA 3FY7A 2C80A 4LA1A 4MABA 4J2FA 1VF3A 3G7JA 3RPNA 1EWXA 2I4AA 1V58A 3IA1A 1OKTA 2YPMA 2DJ3A 2WGRA 4RI7A 4DVCA 2XC2A 1J08A 2L6DA 4PGTA 1OVNA 2FWGA 3TKSC 2H70A 4KAEA 1O81A 4BVXA 3RBTA 3QCPA 3LJRA 1SJIA 4ECBA 1JZRA 1JZWA 2GSSA 5CRWA 3GIXA 1OC8A 1PKZA 2KUCA 3KD0A 2GZYA 1FOVA 4KDUA 1N2AA 4NPBA 2VUPA 2I81A 1V2AA 3HKRA 1F3BA 12GSA 5D9WA 2NDOA 6GSWA 1HYUA 3PR8A 1M9BA 1WWJA 2VCXA 3CSHA 3NOFA 1EEJA 4K0GA 1GWCA 3HDCA 5A5KA 2REMA 5EPFA 2P5QA 2CAIA 1THOA 4I6XA 1M7TA 2H1AA 2DLXA 2AB6A 1F37A 1ZL9A 3KMOA 1EGOA 1SU9A 3NIVA 2HRFA 1Z6NA 2LRNA 4O7HA 1TKDB 2LS5A 2LJKA 1U6TA 3LXTA 2BMXA 3FR9A 5G30A 4HI7A 2M46A 1KBNA 4KA0A 2LEGA 2PN8A 3UL3A 6GSUA 4BPYA 1AC1A 1FW1A 1GLPA 5CRDA 5JCWA 1HD2A 3LG6A 3C1SA 2B5XA 5IO2A 4ZBAA 1TK0B 1MDIA 1UA5A 2VD1A 1WRYA 4BL7A 3F8UA 1ML6A 1PQNA 1F6MC 2LUSA 4NHZA 1LJRA 4ZL7A 4HOJA 2P5RA 2ZUPA 1VRSD 5JWOB 4WEYA 3GKXA 14GSA 1W4VA 4KDXA 1URMA 1WIKA 3D6IA 3W8JA 1TI3A 3ED3A 3TJFA 1OC9A 1QXHA 2YNXA 2M72A 1TW9A 3GTUB 5FT3A 3UEMA 1TU8A 1SK1A 3F4TA 2WULA 5G5FA 2F8FA 4XS6A 3DYRA 4WBRD 2V6KA 3TJKA 4WR4A 1DSBA 4PXOA 6GSTA 5D9TA 1Z7PA 1G7OA 1BX9A 4QL9A 2GSQA 1OYJA 2MBSA 3IC4A 3UMAA 1Z7RA 1HNCA 11GSA 3KP8A 3KTLA 4O32A 1B9YC 1Z3EA 3VFIA 1DUGA 5IPHA 2H0IA 3CTFA 4IQAA 1AW9A 4OO5A 5JWQB 3IXRA 4ECIA 2YJHA 4Z7XA 2XPEA 9GSSA 1XBSA 3L9UA 1T00A 2YWNA 3ZITA 4PNFA 2JZSA 2OBKA 2WB9A 3HXSA 4MZWA 1USBA 5F0GA 3GV1A 3FZ5A 3F4RA 3TJGA 2EIQA 1GP1A 3TRPA 4J57E 2N5BA 1TRWA 4MJEA 2YOIA 1XW6A 2L4QA 1BG5A 2IN3A 2CT6A 3D22A 4I97A 5AGYA 1YZXA 2F9SA 1C72A 3IK7A 4IKHA 4KGIA 5IPGA 2NBSA 2IMKA 2XHFA 4KB3A 4N30A 2C1YA 3IPZA 2LSTA 4EO3A 2KP2A 2GVPA 2F3MA 4K7OA 2VAFA 4XS4A 3E0UA 2LKUA 3VK9A 5DJMA 3W8SA 4F2IA 1EGRA 4OFMA 3WGDA 3BCIA 1OE7A 3US3A 1RQMA 2KLXA 2GQKA 1OAZA 2JZTA 2NVLA 4HEA2 4YQMA 3ERFA 4KE3A 3TB2A 4PUFC 4ID0A 1TK5B 1GTUA 3HCZA 3FW2A 20GSA 4LL1B 4TW5A 1LBKA 4TRXA 4ZL8A 1R5PA 1G0TA 1JLWA 3KGKA 2V32A 1GRXA 2GT5A 1A2JA 2MYGA 4JBBA 1EP7A 2L4CA 2HZEB 2VM2A 1UC7A 3A2WA 3ZMKA 2LJAA 1XW9A 1PN9A 2GQLA 3KEBA 1PSQA 3L78A 1M99A 4WF4A 3VWXA 2RM5A 1TRVA 1ERTA 4HDEA 1WE0A 2IFQB 2H66A 3EMPA 2R2JA 2HSYA 4O5RA 3F3RA 3JCML 3C73A 2V41A 1GTBA 3L0HA 2XBQA 1PD21 1PX6A 1ST9A 1FAAA 5ECNB 5HFGA 4MJBA 2H71A 2VLVA 2YV9A 1NM3A 1VF4A 1OE8A 1TRSA 2YZUA 1A23A 1SK0A 3R2QA 5IOWA 3QAVA 3WGXA 3G7YA 1NHOA 3I69A 2J23A 4HU9A 1RW1A 2K8SA 3LYKA 3ZREA 2OA7A 3KCMA 5IQYA 4OMVA 4GSSA 4N0VA 2GT6A 2O87A 5CREA 3P2AA 3P8WA 4OO4A 3ZVJD 4G9HA 1YF1A 2ES7A 5EY6A 1VF1A 3DVWA 1G7EA 5F05A 1T1VA 1GSUA 2HFDA 3L4NA 2FWEA 4ZL9A 2HI7A 3G9BA 2E2MA 2VL2A 2O85A 2X8GA 3KZQA 2H73A 3D0ZA 4GCIA 2LNSA 4RQRA 3RDWA 4BWSA 4KDYA 2I9HA 2IMFA 5DJLA 2OKAA 1UVZA 3LFLA 1GH2A 4TKYA 4X43A 4YAPA 1XW5A 4EL1A 1VF2A 1M9AA 4LMWA 3I43A 3KIJA 1YQ1A 2MMZA 5FHIA 2HXKA 1U3AA 3A2VA 1PL1A 2Z9SA 2P31A 2H76A 2ON5A 2VD0A 3PH9A 1B9XC 1S3AA 1ZMAA 3M9JA 3ERGA 5AIVA 3DRNA 2CX3A 5LD0A 5IO0A 2A4VA 2MMAA 3MSZA 4EC0A 2B5EA 1X5EA 2ON7A 2V1MA 3TOUA 4K2DA 2FD3A 3BBYA 3M3MA 2B5YA 4OWYA 3KTBA 1X9WB 4WBJA 3DMLA 5INYA 3GL5A 2LRCA 1SL1B 3VPTA 5DQSA 3GSSA 1ON4A 4IW9A 3FYGA 2VLTA 3WT2A 3FKFA 3GTUA 5DVBA 1ILOA 1K0OA 5F8BA 4MCUA 3GUSA 2I1UA 2H74A 3F0IA 1V9WA 3QDNA 4IBPA 4G19A 4ZILA 1FVKA 1CQHA 2GS3A 1U87A 2GZPA 2H6YA 2N5AA 4GWRA 5JWRB 2LV3A 5E4WA 4HQSA 3MWHA 2C3TA 4JR4A 5J9CA 4O92A 4EDZA 2V2GA 2DJKA 2VL9A 1CQGA 3KH9A 5ECQB 1GNEA 2FHEA 3QR6A 2FLSA 3H4KA 4BWQA 5ABRA 5D93A 3LYPA 4JE1A 5A4WA 4NMUA 3DXBA 3WYWA 4N0ZA 5F06A 2DIYA 3GHAA 4F82A 2E2GA 4L5LA 4GRFA 3TGZA 1X5CA 2BJXA 4WF5A 1XWAA 1YJ6A 3UOMA 4PQIA 2GTUA 4KSOA 3GKMA 1EZKA 1FB0A 4KW6A 1XWBA 1O8XA 4F9ZA 1GSQA 2YJ7A 1B4QA 3RHCA 2DJ1A 1ZYEA 1BAYA 5HR3A 2YP6A 1M2DA 3GH6A 3QAWA 4GXZA 3P7XA 3IV4A 3D4TA 1K3YA 3VI7A 2FNOA 5KN3A 4IQ1A 1PRXA 3LEFA 1K0DA 1JLVA 4N10A 5J3RA 5G1KA 6GSXA 4NAXA 4K7NA 1EV9A 4ECCA 1SL2B 2K8VA 3BJ5A 1GSDA 2JL4A 4JR6A 4MDCA 3LSZA 3CSIA 3IOSA 5IOXA 4IS0A 4KH7A 4IP1A 4Q5NA 4V1Ap 5H5SA 2GGTA 4IP6A 4GLTA 1A0RP 2B7KA 2L6CA 1Q4JA 1WOUA 1GUKA 2VOCA 4TR0A 3IAM2 4JU5A 4RI6A 4K1FA 1BQ7A 3O3TA 4TVEA 5DQYA 3CRUA 4G2EA 1YY7A 1DBYA 1MDKA 2OE0A 2O89A 3FEUA 3KJYA 2HZEA 3A3TA 3QAGA 4Q5RA 2QC7A 3CTGA 2H1GA 5DBQA 1S3CA 2IMIA 3IK9A 2X99A 6GSSA 5KN2A 2X8HA 4XRDA 1O73A 4PUAA 4TR4A 1J0FA 3FZ9A 5DCHA 2IFQA 3DGQA 3GFKA 4WR5A 5KN1A 1PGTA 4PQHA 5LNKe 2WCIA 3FHKA 5IMZA 6GSYA 3ISOA 2WJUA 4MF6A 5GSTA 2B1LA 3GKNA 4KSMA 3FRCA 5ELGA 4YQUA 1GSEA 1SKSB 2YWMA 4FYBA 4AF2A 4LMVA 3QFAC 1SD8A 1FG4A 4NXIA 3SWLA 3MNGA 1O8WA 3CMIA 3D21A 5J9BA 3ZRDA 1YKAA 4EKZA 4MH3A 1EP8A 5KEJA 2DC5A 3M8NA 2B6MA 1ZZYA 3M9KA 4AGSA 4ZB6A 4MP4A 2KP1A 10GSA 3ERWA 3UBKA 4OFTA 1AQXA 4FIWA 3CBUA 1ERWA 3ZL5A 4FH8A 4TN8A 5HR1A 1EOHA 4MH2A 2VCQA 2HYXA 3OR5A 3F6DA 3FZ4A 4N11A 2CVBA 2H0GA 3F9UA 5D73A 5EVOA 3A5WA 3IBHA 1O85A 13GSA 2VL3A 3HJOA 3V1WA 5L71A 2EC4A 2LTKA 3LGCA 1ZGNA 1H75A 3LORA 5DAKA 3ZIJA 3VWUA 3F6FA 2FCHA 4ZXGA 3J7Yk 3M1GA 6GSVA 5LCZA 1TRUA 2B3SA 5J41A 3KH7A 5CAXA 3Q18A 1TDIA 1T7PB 3C7MA 4TXVA 1WMJA 1PX7A 1EV4A 3RPPA 4DSSB 3N9JA 1U88A 5ID2B 1K0NA 4ZBBA 2IMDA 1SKRB 3EVIA 4K0NA 4OD7A 5HFKA 1XVWA 1JZOA 3CYNA 2C8UA 2HE3A 1XIYA 1YEPA 2VLUA 3IAS2 1UN2A 5IMAA 5ECPB 1X9SB 2K18A 1FVJA 2HLSA 1BJXA 4MZBA 4H86A 1K0AA 2VL2C 5CYYA 4AJ7A 3HYPA 4MF7A 2R37A 1AQVA 1QQ2A 2GSRA 2N5FA 3QD9A 1TK8B 1GSYA 4MLYA 3IRAA 2MMOA 5H5RA 2IIYA 2J9HA 4K6XA 1KNGA 3KXOA 2A2RA 2HRNA 5JCUA 5G1LA 4ZIJA 1A8LA 3HJPA 3WT1A 2E7PA 2EIRA 4GTUA 1M2BA 1XZOA 2KOKA 4ZBDA 4GSTA 3VURA 1T4YA 1TOFA 1GUHA 1TTZA 3ZYWA 1N8JA 1ERVA 1SYRA 2X64A 4K9ZA 3A2XA 2H8LA 1NW2A 4TOPA 1Y6EA 1I9DA 1G6YA 4X0XA 4ACSA 3DKSA 1YEXA 5G2ZA 4ISDA 2H1BA 2A2SA 3FK8A 4XTSA 2VCZA 1SYXA 2FWFA 2ALBA 5C04A 5GZZB 2PUKC 4FYCA 4GSNA 4TR3A 3QMXA 3QFBC 1TU7A 2YWOA 5GAND 3PINA 3HD5A 1DE2A 2BTOT 4QL7A 5CO3A 2QKEA 1ABAA 2PVQA 1M0UA 4IGJA 3BOAA 5ELAA 3TRXA 3DEXA 1GL8A 5ECOB 1JFUA 2PU9C 3H8QA 1MD4A 2CQ9A 4ULXA 3EU4A 2B1KA 2OADA 4L0WA 3HHVA 3M0FA 2CA8A 1EEMA 3KMNA 1BYEA 3ZMLA 1K0CA 1VGLA 5HFIA 4ZB8A 4NV2A 4XHMA 3TKSE 5H5QA 2C3NA 2GQMA 2GSTA 2M80A 4AJ6A 1QMVA 2CZ3A 3ZFLA 1X5DA 5GSSA 4E8EA 2R4VA 1XXUA 2YANA 1HNBA 1SJ6A 1OC3A 1I5GA 2AUVA 4XS1A 4IHUA 4EDYA 3QPMA 1NHYA 2DBCA 2R5GA 3HZ4A 2WRTA 3MDKA 3BD2A 2CVDA 16GSA 3H1NA 2OE3A 3C8EA 3MAKA 2FGXA 5AISA 2F8AA 3F4SA 1O7UA 4L5OA 5IM9A 1XOAA 3APOA 2OACA 2DJ0A 2GZZA 1ZYQB 3ZZXA 2RM6A 2DJJA 4XRAA 4OCEA 2IMEA 4RUVA 5ECHB 2AV4A 1B4PA 1AXDA 1K3OA 4ECJA 1TJDA 3N5OA 3ZIVA 1Q98A 2AJQB 3E3EA 4MPFA 2RLIA 4HJMA 1JZDA 2YCDA 5D9XA 2VCWA 3HVSA 1IYHA 4FYUA 1MDJA 3TJBA 1H4OA 4ILFA 1QFNA 1YF0A 1KEBA 2WFCA 4ML1A 2IPAA 2C0DA 3J7Yb 2PERA 4DSRA 3D5JA 4MMMA 1Z5YE 3EWLA 3QOUA 18GSA 3UVTA 5COHA 5IMDA 4NWYA 3K8NA 3RHBA 3AY8A 5DALB 2VIMA 4NHWA 3BCKA 2AYTA 2VCTA 5ECLB 1XCCA 2H72A 17GSA 2H0HA 3IR4A 4J56E 4GF0A 1WPIA 1PL2A 2IL3A 4TXOB 4LL4B 2HT9A 4QQ7A 1X0RA 4WKWA 4WXTA 2C3QA 1PKWA 4EF0A 5ECIB 3I6AA 2RUFA 4Q5FA 2PVOC 4E8HA 2G2QA 2HZFA 2JZRA 2L59A 3I9V2 1R5AA 1DE1A 1Z6MA 4JEDA 3FR6A 2F51A 3EE2A 3C71A 5HQPA 1T3BA 5CNWA 2C0FA 4ML6A 1OKDA 3VI5A 2L5LA 4X1UA 1V40A 1HNAA 5AN1A 4L0UA 1A2MA 4PQ1A 2DMMA 1S3DA 5IMVA 2WDUA 1YKCA 3S9FA 2PWJA 2C4JA 4DSSA 3ZTLA 5ID2A 1SL0B 3Q19A 2DMLA 1XVQA 3HVVA 2K6VA 2TRXA 5B8AA 3KM6A 4KNDA 1YDKA 3F63A 3GSTA 5ECSA 1XPVA 2H1DA 5IIZA 2VO4A 2FWHA 2I3YA 5ECKB 3HZ8A 5F07A 2D2ZA 2QGVA 3TUEA 2LQQA 2L57A 3TKSA 5IMCA 5A4UA 4KCEA 2CAQA 5D8IA 4XCSA 4AJ8A 2CVKA 3RAZA 4KX4A 2CX4A 2TIRA 5B6MA 1W89A 1GLQA 1R26A 3UIWA 5CRGA 1T4ZA 3TCOA 1SK2A 4K7IA 4V2LA 1V57A 5D96A 3GA4A 1B8XA 2OJLA 4D73B 2JADA 1QUWA 4OCFA 1AAZA 1E6BA 5IMFA 4HU7A 1HQOA 3LQ7A 5CRHA 2DSAA 4JRRA 4POMA 4TR1B 4V2NA 2H6ZA 2JU5A 2MMNA 3TKQA 4DEJA 1THXA 3HJMA 4OFNA 4F0BA 4WETA 4MPGA 1NSWA 5AIXA 1K3LA 1XOBA 2JACA 2L5OA 2YV7A 1SKWB 1GSFA 1WP0A 3ZVJA 2WS2A 5DDLA 1V98A 1WJKA 2XPDA 1KTEA 3DWVA 4EXJA 3VLNA 2FUG2 1MD3A 4GQCA 2DIZA 4MJAA 4JZQA 1SD9A 2GDRA 4HZ2A 1T8EB 5G5EA 1SJZA 2KHPA 4I8BA 1IYIA 2K9FA 2C0GA 2FA8A 2YZHA 2TRCP 3GRXA 4CDOA 3CSJA 4IN0A 4YAVA 3PGTA 3APQA 2CZ2A 2EIOA 3D4MA 4K8MA 2AHEA 4F03A 1F3AA 2PGTA 3H79A 5EL8A 3Q74A 2YN1A 2CV4A 4PURA 3EYTA 2NPBA 2H30A 1K0BA 4POLA 1LU4A 3WD6A 5B6NA 4V1Ag 1XFLA 1Z9HA 3IHQA 1MEKA 5A4VA 4BVYA 2FY6A 3W6GA 4L8EA 1MTCA 4HZ4A 2HSHA 3CXGA 1AIUA 1R7HA 3VWWA 4MK3A 5CP1A 3APSA 2OBIA 3L9VA 4G10A 2H75A 5FWGA 2C0EA 3GX8A 4NV5A 1E2YA 2IWTA 4POBA 3WGEA 2ZNMA 2RIIA 3CRTA 2O8VB 1GTAA 1Y25A 2O7KA 3ME8A 1GUMA 1FHEA 1X9MB 3TRQA 3GNJA 4XIHA 1XWCA 4IELA 3EC3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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