3ZREA

Reduced thiol peroxidase (tpx) from yersinia pseudotuberculosis
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
TMTQTVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pseudotuberculosis
total genus 44
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zreA00
3ZIVA 1MEKA 5IO2A 5ELAA 1XW5A 1B8XA 5IIZA 5ENUA 3US3A 2H74A 2QGVA 1GUKA 1X5CA 3HCZA 3VI5A 5F8BA 1ZYQB 1O6JA 1TU7A 5CO3A 2B6MA 3GFKA 1EWXA 5A4WA 3V1WA 4HU7A 4J57E 2PGTA 1VF1A 3BBYA 3GKKA 1T7PB 1GTUA 4GSNA 3L4NA 2NBSA 2XPEA 3GHAA 3EINA 4WF5A 2C4JA 5IPHA 1EV4A 2JADA 3F8UA 5G31A 1TU8A 1XW6A 4POMA 1NW2A 4FH8A 1BEDA 5HR3A 2BTOT 3EMPA 4IW9A 1KBNA 5CRDA 2HE3A 5ECLB 2HRNA 5FWGA 3LXZA 1XVWA 3F9UA 3DYRA 4IP6A 2C0FA 5EPFA 4KX4A 3TKSE 4HEA2 1PKWA 2O7KA 4ECJA 1TRSA 2LRCA 1F2EA 1LJRA 4HS1A 2DIYA 2YWMA 5AIVA 3WGEA 3IR4A 1EP7A 2N5BA 4TXOA 4OMVA 4BPYA 3QCPA 3IV4A 2P31A 3D0ZA 1ZCPA 1N8JA 4FYBA 1K0CA 4WBJA 3MDKA 1R5AA 1F37A 2IJYA 2VLTA 3M1GA 2K18A 4DVCA 1X0RA 4POKA 2FNOA 4HZ4A 3MWHA 4JR6A 1TXXA 5F07A 3D22A 3DEXA 3GKNA 3ZVJA 4L0WA 1GTIA 4N0ZA 1MD3A 4IJIA 3DRNA 2TIRA 2VL3A 3TCOA 3RPPA 1T4YA 2R2JA 5DCHA 3CSJA 4XRDA 3CYNA 2RM5A 2P5QA 4V1Ag 1PSQA 4L5LA 5ID2B 2YCDA 1TKDB 4GQFA 2HFDA 1XIYA 5C00A 1S3AA 2X8GA 5A5KA 1PRXA 4BVXA 5ID2A 2VO4A 1PMTA 3W8JA 3ZMKA 1J9BA 2DBCA 2GZYA 5COHA 3CTGA 3UIWA 2JU5A 4GLTA 2MYGA 4MPFA 2X8HA 4KDUA 3KH9A 2VIMA 1UA5A 1G6WA 3F3RA 5DALB 3PR8A 2R4VA 3WGDA 1XWCA 1MDIA 3KTLA 3HZ4A 4MMMA 3TRPA 3DIEA 2V41A 2IMEA 1EV9A 2OBKA 3KIJA 2KP1A 1JZRA 2ON7A 1B4QA 5FT3A 1U3AA 3LJRA 4WF4A 5INYA 4HU9A 4NXIA 1LBKA 5ECQB 2C8UA 5G5FA 2C3TA 1VF2A 5J3RA 2OJLA 4WR5A 3JCML 18GSA 1FB0A 2C3NA 2DJ1A 5CP1A 3RHCA 4F0CA 1AQVA 2GSTA 1B48A 5DJMA 5B6NA 5J9CA 1B4PA 1PX7A 4CDOA 4PQ1A 5H5RA 2HYXA 4OFTA 4EDZA 3P90A 1G7EA 2HT9A 1GSUA 5IMAA 1EEJA 4EDYA 1TI3A 1YJ6A 2GSSA 2LTKA 1T8EB 6GSUA 2VCXA 1Q98A 1O8XA 5DBQA 1NSWA 2R5GA 1AXDA 4MLYA 2IPAA 2H0GA 1G7OA 5B6MA 1TK8B 5DDLA 2E0QA 2GS3A 1HNAA 1Z3EA 1ZL9A 1QMVA 2X8CA 4L8EA 2LQQA 4G19A 2IFQA 4ZIJA 3IAM2 5B8BA 4RQXA 3FR9A 3KJYA 4XCSA 1R7HA 2GLRA 1K3YA 2EIOA 1WWJA 3TJJA 3GKMA 2XC2A 3KH7A 3FZ5A 1JZWA 19GSA 3C7MA 3D21A 5IOWA 4YQVA 4TR4A 5H5QA 1T00A 2REMA 4O7HA 3WT1A 4NPBA 4POBA 1X9SB 1YF1A 2V6OA 1SK2A 2C0EA 1SJ6A 3R2QA 2C0DA 3RHBA 4E8HA 1TK0B 4I8BA 1GWCA 2HZEB 11GSA 5ELGA 5DAKB 4KCEA 4JRRA 5D8IA 3VWUA 4IJ3A 4MZCA 5HR1A 3DXBA 2XPDA 2HZEA 5AIXA 3HHVA 1R5PA 2V32A 4F2IA 3HJPA 3TKRA 2WS2A 4JBBA 4KNDA 2O89A 3GURA 1H4OA 3SWLA 2CVBA 3NZNA 5GAND 2XBIA 4X0XA 3UVTA 2QC7A 1CQHA 2JL4A 4PNGA 4Z7XA 3Q18A 1T3BA 2CVKA 5GSTA 3BOAA 1I9DA 4BWQA 3GX8A 2BMXA 1WRYA 4WKWA 5H5SA 4TW5A 4JR4A 3DKSA 1F3BA 3IK9A 5KN3A 2C80A 5D9VA 3UVHA 1EGRA 3UOMA 1TTZA 3ED3A 5HFGA 1Z7PA 1TI1A 5ABRA 5KN0A 1ERUA 3CRTA 3F6FA 1GSDA 3MSZA 1QUWA 4ZBBA 4TR1A 1JLVA 2A4VA 5CRHA 5HQPA 4V1Ap 1H75A 2GZPA 2DJJA 4ACSA 3ZL5A 1YY7A 1ML6A 2R37A 2L4CA 1JZDA 2H70A 2VL9A 2YZHA 2K9FA 1XWBA 1HNCA 2VAFA 5EY6A 3EE2A 2CVDA 4OCFA 1XVQA 4K9ZA 2I4AA 4IQAA 3Q6OA 4AF2A 3M0FA 4X1UA 4GCIA 5HR2A 6GSTA 4IN0A 1SL2B 4ML1A 5GSSA 2O8VB 4F9ZA 2IL3A 3CTFA 1UC7A 2HSHA 3UEMA 2F3MA 3H93A 2PUKC 3BCIA 4KAEA 4WETA 5IQYA 2WRTA 1PL2A 3HYPA 4BVYA 1TJDA 5DVBA 4PNFA 4X43A 1SD8A 1Z9HA 4O92A 4K2DA 1X5EA 1SL0B 1GP1A 5E59A 5J9BA 2LEGA 4ZB8A 3IRAA 4F03A 3EU4A 4G9HA 4DSQA 2YOIA 2LJAA 3KZQA 3F4RA 2EIQA 3LGCA 4TRXA 1S3CA 1TRVA 4PQHA 2QSIA 5AGYA 1EGOA 1J08A 2B7JA 1BX9A 5B7CA 3APSA 2HI7A 2IMKA 3W8SA 4MABA 5ECPB 4NV5A 3GYKA 4J56E 1I5GA 1WE0A 1M7TA 3C8EA 1R26A 2H0HA 1U88A 1GLPA 4QL9A 1M2AA 2R3XA 1URMA 3DMLA 4XS4B 2CAIA 4LA1A 3FR3A 3D4TA 4G10A 5D96A 1PKZA 3J7Yk 2A2RA 3M3MA 1X9MB 3F6DA 4IBPA 4XS4A 4OO4A 1W89A 2GQLA 2YPMA 2HNLA 2XBQA 6GSXA 5JCUA 4EXJA 1TK5B 4K7NA 3NOFA 2PMTA 4TVEA 3LG6A 2L4QA 1FO5A 2MMOA 5C04A 1AQWA 2JZTA 3FR6A 1THOA 4OO5A 4Q5NA 1V9WA 3UL3A 5AISA 3TJFA 1SJIA 2I9HA 3F63A 2X64A 4K1FA 2JACA 3GV1A 4K7OA 2L6DA 2GGTA 4GWRA 2OA7A 5ECNB 2ZNMA 1FHEA 2H73A 4TXOB 4MF7A 2AJQB 3BJ5A 1ZMAA 1EEMA 2LV3A 4L5OA 3GSTA 2H71A 4KDXA 3CSIA 2CV4A 1PQNA 1K3OA 3I9V2 3GMFA 2LSTA 1GLQA 4I2UA 1G0TA 3SBCA 1HNBA 3VPQA 1QGVA 2GT5A 4TKYA 2DJ0A 1K0DA 4WR4A 4ILFA 3IC4A 2MMNA 3TKSA 4YAPA 1A0FA 4MF5A 1F3AA 2LNSA 2J23A 3WGXA 2TRXA 3IE3A 3G7JA 3OR5A 5LNKe 4D73A 1TDIA 4ML6A 4ZBDA 2DJ2A 3G7YA 1SK0A 2IMIA 2O87A 4Q5RA 6GSVA 1SYXA 2C1YA 2IN3A 4LMVA 2PPTA 1PGTA 1YEPA 1A24A 4I97A 4F0BA 3ZTLA 1MDKA 2A2SA 1ABAA 2CT6A 1PL1A 2GT6A 3GH6A 5G1LA 2CA8A 2VCQA 4YQUA 5DQSA 4E8EA 2H01A 1USBA 3UBKA 3RDWA 2MBTA 3WYWA 3HXSA 3QAWA 4EC0A 2VM1A 2H6ZA 3VURA 4PX1A 4FYUA 2M80A 2GDRA 2WFCA 1BYEA 4KGIA 1QFNA 3FZ9A 1AW9A 4JU5A 4LL1B 4GSSA 2GZZA 3VWVA 2B5YA 5EVOA 1BJXA 3HY2A 2RIIA 2OADA 3GSSA 17GSA 2GTUA 2H75A 1M9AA 1U87A 3H1NA 2BJXA 2WZ9A 4TR0A 1AAZA 1O85A 4I2TA 5IOXA 3F4TA 4GSTA 2P0GA 2YWIA 2VL2C 4NWYA 2KUCA 4IELA 4XHMA 2B1KA 5G2ZA 3HD5A 5JCWA 2DLXA 3ZYWA 1ILOA 3TJGA 1O7UA 3F4SA 1HD2A 1VGLA 3LWAA 3QDNA 3TOUA 3I43A 1TRUA 4EUYA 3FHKA 1XPVA 4GTUA 2PWJA 2C3QA 1XOAA 4KE3A 3EURA 2D2ZA 3A2VA 2LKUA 1YEXA 5B8AA 3BD2A 4N11A 3UBLA 4NV2A 1WOUA 3O76A 2FA4A 3RAZA 2PU9C 4ZB6A 4WBRD 3A2WA 2ES7A 2XHFA 3UJ1A 1FG4A 1K0OA 3QFBC 2IFQB 2GVPA 2PBJA 1GSYA 5DQYA 4KDYA 1DUGA 1S3DA 5D93A 4CHSA 4DSSB 2F51A 2M72A 4MA9A 4NHWA 4MP4A 5ECOB 3VWWA 2AUVA 4AJ6A 2CAQA 2ON5A 5HFIA 2FGXA 2QKEA 2H19A 1A23A 1YKAA 4DSSA 1ERVA 2YANA 1R4WA 5IMDA 5F06A 4IS0A 1KEBA 4OFNA 3ME7A 3DVWA 1OE7A 2OE1A 3LSZA 2MZCA 3DWVA 1O73A 4HJ2A 4PGTA 2YJHA 2AV4A 1KNGA 3H79A 5ECKB 3W6GA 3ZMLA 4BWSA 3TJBA 3CXGA 2DSAA 2KOKA 3L9UA 1XW9A 1YKCA 1G6YA 3QPMA 5IMVA 1M9BA 2LUSA 4AGSA 5DJLA 3GRXA 1AUCA 4P3YB 3EVIA 3FYGA 1THXA 4PURA 1SKRB 2DIZA 3TUEA 3ZREA 3S9FA 2VL2A 3GUSA 3LXTA 4MZWA 1E2YA 3RBTA 3A2XA 1V57A 4G2EA 4JEDA 2M46A 4OWYA 2VLUA 1EOGA 4KH7A 3TB2A 4ECCA 3GL3A 4MJCA 3HVVA 3DGQA 1WJKA 4Q5QA 1FVKA 1ERTA 2LRNA 1FB6A 1GRXA 1JFUA 3L9VA 1ZYEA 5A4UA 1DBYA 4GF0A 3TKQA 3GX0A 3K8NA 2YZUA 2FD3A 1Q4JA 2V1MA 1OE8A 2YV9A 5F0GA 5J5NA 1A2LA 3PH9A 5JCGA 1QQ2A 4TR1B 1XFLA 4ID0A 1GNWA 3P7XA 1OKTA 2YJ7A 3O3TA 4NHZA 14GSA 4ECIA 2CZ2A 4EL1A 4FYCA 4J2FA 2KHPA 1M2BA 3MAKA 2L5OA 3TOTA 2WCIA 4MPGA 1GL8A 2L59A 1MDJA 2P5RA 1A2JA 3IHQA 4IQ1A 1QK8A 3ZFBA 5J4UA 4ZILA 3Q19A 4HJMA 2PN8A 3QMXA 4RUVA 4XTSA 4ZL9A 2CZ3A 4O5RA 1A8YA 3EU3A 1LU4A 2PVOC 3ZITA 1SU9A 3G9BA 5KN2A 3ZFLA 1F9MA 3H4KA 20GSA 2WDUA 3KTBA 1Z6MA 4V2NA 4TN8A 1OC9A 1GSEA 4ZBAA 4KCAA 1OC8A 3HKRA 5JWRB 2AHEA 3KD0A 2V2GA 1FVJA 4HQSA 1X5DA 3C1SA 3P2AA 4OFMA 5JWQB 2NTOA 2OE0A 3HDCA 2G2QA 6GSSA 3KCMA 4EKZA 4DSRA 3IDVA 2MBSA 4K8MA 4IHUA 1Y6EA 3N5OA 2RUFA 2IIYA 1EP8A 4ECBA 2DJKA 3U5RE 1GSSA 2OBIA 2IMDA 2GSQA 3LFLA 12GSA 3IOSA 3BCKA 5G5EA 2HXKA 2IWTA 3A3TA 4KA0A 5CNWA 1Z7RA 3J7Yb 1T4ZA 4K7IA 1A2MA 1BAYA 2FY6A 4ZL8A 3VK9A 2JZSA 4ULXA 1TW9A 5CREA 1HYUA 3APQA 5GZZB 1GSFA 3ZZXA 2CX4A 2E2GA 2JZRA 1BQ7A 1EZKA 5CYYA 2VCTA 3M8NA 1JLWA 1K3LA 1F6MC 2OKAA 2ZCTA 2HZFA 1OKDA 2VCZA 4MF6A 2CQ9A 4N0VA 3FY7A 4RI7A 1PN9A 2J9HA 4V2MA 1FAAA 2LJKA 2DJ3A 4XS1A 3QOUA 4AJ8A 3MNGA 3KP9A 1GTBA 1JHBA 2WULA 4IGJA 3U6VA 1ST9A 2YWOA 1SYRA 1A0RP 4EO3A 2N5AA 3ZLPA 5ECHB 3APOA 1DE1A 3E9JB 3E3EA 1PX6A 1GSQA 3RPNA 2I1UA 2DC5A 3QAVA 3GH9A 1W4VA 2PERA 16GSA 1N2AA 2HSYA 4YQMA 2WGRA 5AN1A 2EC4A 1DSBA 5A4VA 4MJEA 3GL5A 5GAPD 3GN3A 4K6XA 3PGTA 5ECIB 1T1VA 2VCVA 4KSOA 3HJMA 4JE1A 2FUG2 2K8SA 1GUHA 2DMLA 2L57A 2VM2A 1J0FA 4PQIA 1XOBA 1Y25A 3FKFA 2ALBA 4F82A 4MK3A 2H1BA 4HUAA 1WMJA 4D73B 3EYTA 1U3IA 5IMCA 1SK1A 2L6CA 3CSHA 1K0AA 22GSA 2H0IA 1A8LA 5KEJA 1ACVA 2H1GA 1MD4A 4EVMA 1QXHA 3QFAC 3KMNA 5EL8A 2AB6A 1PA3A 1ERWA 2GQMA 2R6KA 3E0UA 3EMXA 5HR0A 3FEUA 2H72A 2FWGA 3HZ8A 1B9XC 2OACA 4FO5A 4LMWA 3G7IA 2DMMA 3TKPA 3D4MA 5J41A 3F0IA 2KLXA 3ERGA 3KEBA 3KM6A 3ISOA 3ERWA 2K6VA 5IMFA 4KUNA 2YN1A 2H6XA 6GSYA 5CRGA 3WT2A 1AQXA 2B5EA 4OD7A 3P8WA 1NHYA 1XWKA 2RM6A 2B3SA 3HVSA 3ERFA 1TP9A 3O6TA 2F8FA 2CX3A 2V6KA 3C73A 4I5QA 1M0UA 2F9SA 5ECRB 1YQ1A 1VF3A 2K8VA 4MH3A 3LEFA 1FOVA 1ON4A 2I3YA 1IYHA 4YAVA 5D73A 2I81A 3I6AA 3UAPA 4MJBA 1GULA 1V58A 2VD0A 1SD9A 3TJKA 2VUPA 2WB9A 1RK4A 5ECMB 3H8QA 4XIHA 3IPZA 2VCWA 5DALA 4ZB9A 1O8WA 4NMUA 2ZUPA 1V2AA 3DVXA 2IMFA 1GH2A 2HRFA 1OAZA 5E4WA 3D6IA 3GIXA 4KSMA 1WP0A 4ZL7A 3IBHA 2H1AA 3QR6A 5D9TA 1OC3A 4Q5FA 3F3QA 2H66A 2YNXA 1C72A 4K0GA 3CBUA 4O32A 3TGZA 2JSYA 4IKHA 3A5WA 5F05A 2FWFA 4HZ2A 4ZXGA 3L9SA 1TOFA 3FK8A 4LLRA 5CAXA 4HI7A 4KW6A 1OYJA 1UVZA 1XZOA 1X9WB 2MMZA 3GNJA 2Z9SA 3C1RA 4V2LA 4BA7A 4OCEA 1B9YC 4HDEA 1CQGA 3VWXA 4KB3A 2RUEA 1NHOA 1M99A 3HVXA 3HA9A 4MZBA 1KTEA 3D5JA 3IK7A 1NM3A 4BL7A 5ECSA 2YWNA 4DEJA 2GSRA 3LYPA 3FZAA 4QL7A 6GSWA 3VI7A 3I69A 1UN2A 4PXOA 3C71A 5IMZA 2TRCP 2G0FA 4IP1A 1K0NA 2RLIA 2YP6A 3KMOA 2VD1A 3QAGA 3UARA 1DE2A 2JSZA 2N5FA 3KGKA 2AAWA 4YH2A 4GRFA 3CMIA 3FW2A 4CW9A 3FZ4A 1HQOA 1V40A 1WPIA 2AYTA 3UMAA 1YF0A 4QQ7A 4RQRA 8GSSA 2FWHA 3WD6A 2FLSA 4MDCA 3LYKA 4RI6A 1SJZA 9GSSA 4I6XA 13GSA 3IAS2 1AIUA 2LRTA 5D9XA 2LNTA 4MCUA 3GA4A 3AY8A 4PUAA 3LQ7A 1E6BA 4HOJA 4TXVA 4MH2A 2F8AA 3TDGA 4XRAA 5IO0A 5DAKA 2B5XA 1FW1A 4L0UA 3NIVA 1V98A 3VFIA 2B7KA 2H30A 3TRQA 3ME8A 10GSA 1MTCA 3ZRDA 1XXUA 1BG5A 3M9JA 3L0HA 1GNEA 1M2DA 2FHEA 5DCGA 3QD9A 1RW1A 4XS6A 5G1KA 2FA8A 2FCHA 4FIWA 4N10A 1YDKA 5G30A 4TOPA 3PINA 2HLSA 1AC1A 1PD21 4PUFC 5IM9A 5CRWA 5D9WA 5FHIA 4GQCA 4WXTA 1ZOFA 4N30A 3N9JA 2EIRA 1OC9B 5HFKA 4K0NA 2LJRA 1SKWB 2GQKA 2H8LA 1ZGNA 3IA1A 4GXZA 1K0MA 1EOHA 2E2MA 3VPTA 2PVQA 3LORA 2NPBA 3VLNA 7GSSA 5L71A 1OVNA 2O85A 3IXRA 2H76A 3M9KA 1RQMA 1U6TA 2C0GA 1XWGA 4JZQA 5LCZA 4POLA 4HQZA 3Q74A 4H86A 2E7PA 1SENA 5LD0A 4IVFA 1YZXA 2H6YA 2LS5A 3EC3A 3EWLA 3GTUB 2H1DA 4NAXA 1ZZYA 4EF0A 4EE0A 2L5LA 3ZIJA 3FRCA 1XBSA 1VF4A 4ISDA 3CRUA 5JWOB 3GTUA 4AJ7A 4TR3A 2B1LA 3L78A 2FWEA 1JZOA 1K0BA 1VRSD 2YV7A 2KP2A 1XCCA 2NVLA 3GKXA 1O81A 3ZVJD 1TRWA 3TKSC 1IYIA 1GUMA 2WJUA 2MMAA 4MJAA 3HJOA 1SL1B 3KP8A 2X99A 1Z6NA 2OE3A 5KN1A 2LQOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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