3ZSFA

Crystal structure of the l-cystine solute receptor of neisseria gonorrhoeae in the unliganded open conformation
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
GSLIERINNKGTVTVGTEGTYAPFTYHDKDGKLTGYDVEVTRAVAEKLGVKVEFKETQWDSMMAGLKAGRFDVVANQVGLTSPERQATFDKSEPYSWSGAVLVAHNDSNIKSIADIKGVKTAQSLTSNYGEKAKAAGAQLVPVDGLAQSLTLIEQKRADATLNDELAVLDYLKKNPNAGVKIVWSAPADEKVGSGLIVNKGNDEAVAKFSTAINELKADGTLKKLGEQFFGKDISVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Two Solute Receptors for L-Cystine and L-Cysteine, Respectively, of the Human Pathogen Neisseria Gonorrhoeae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC BINDING PROTEIN, AMINO ACID
source organism Neisseria gonorrhoeae
molecule tags Transport protein
total genus 76
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3zsfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3zsfA02
4OHNA 1N0TA 4NF6A 5LOMA 4R75A 2VOZA 1IUDA 4LATA 2ZYKA 1UIUA 2V3QA 3O6GA 3TMGA 4RPNA 5H8HB 4G68A 5I2KA 1FQDA 3O6HA 3Q28A 1LCFA 2R71A 2Z22A 2DVCA 4Q8RA 3P7IA 4OYVA 3N5LA 1A7LA 2I48A 4Z0IA 2BJJX 4MBPA 2YPNA 3GXAA 3V8XB 4GRKA 3K6WA 4AB6A 3TQLA 3TELA 1NH7A 2RINA 3CG3A 2GRVA 4PP0A 1H45A 3MVZA 1D4NA 2F78A 3K1NA 1PC3A 1QKBA 1POTA 2XXQA 4YB7A 4H65A 3S9LC 4PQJA 1MPDA 4MLQA 2ZYOA 2DSFA 3HHGA 2UYFA 2F7CA 1H76A 3V5AA 3R7XA 3N6UA 2AYSA 1MXXA 3VLVA 3TODA 3VE1B 1MY1A 1B7HA 4DXCA 1FQEA 3K6XA 1MY2A 5BUUA 3IJXB 1IXCA 1PBQA 3G3GA 3E13X 4ZZAA 3W9VA 1L5TA 3ECRA 2NXOA 3HPIA 3U93A 3H6TA 2DWHA 4JWXA 4JXIA 1LLSA 1H43A 4P11A 2FA7A 3C34A 1N76A 2QJEA 4YZZA 4GL0A 4TQUQ 2R9JA 2WKYA 3C4MA 2Z8DA 5DYHA 3U92A 1N84A 3U8QA 1AMFA 3CRBA 4KYEA 3SEVA 4IO7A 2Y7WA 4NF5B 1B1HA 2QL3A 2UXAA 3K2DA 3MZBA 1UIVA 3O97A 1A8FA 3VFJA 1AH5A 4WKMA 3TTKA 3H6VA 3IJOB 4OFOA 4KQPA 2DYXA 5I57A 3LSXA 3G3FA 1P1WA 2KLFA 2FNCA 1B7ZA 5I59A 3RY3A 5I58A 2XHDA 4H6DA 3KN8A 2UVJA 2XXRA 3SEWA 3UIFA 3K4UA 3O2AA 1B2HA 3MP8A 5TP9A 1N3WA 1LBCA 3SEUA 2XX7A 4Z7EA 1IQ7A 4NF4B 3ZKLA 3TDJA 4PETA 4BDLA 3IOVA 2PT2A 3IORA 5L9OA 2XX9A 1ZMGA 3IO4A 2H25A 3MZ1A 1Y4CA 1DSNA 4P0IA 3E3KA 2W7YA 3S4UA 3EPEA 3QAXA 2YLNA 1M5EA 3QK6A 1P1NA 1BIYA 1YAEA 1T0KA 3CFZA 1XHYA 3KGCA 3U94A 4EF2A 4U23A 1B52A 4X48A 1M5BA 1VSOA 3EN3A 3OO8A 1NNTA 3EHSA 3LSWA 1PEBA 1TFAA 4U1ZA 3LC8A 2OWSA 4GFRA 5I56B 3SEXA 4Q30B 1A8EA 4ZE9A 3VVDA 1MXYA 4OFLA 5H8HA 1B5IA 3UA8A 3OENA 4YKKA 2I0CA 3HV1A 4JSDA 1Y20A 1I6BA 2V3UA 3IL1B 3C36A 1N04A 3BFUA 4BDRA 2ZNSA 3B6WA 3LBSA 4EXKA 3RGYA 2Q9TA 3GZGA 2V25A 1Y3QA 3ONMA 4N6PA 1SW4A 3MP1A 1XOCA 5ITOA 4ZECA 3TPAA 3G3HA 3T93B 3KJTA 4IB2A 2Y7IA 1OQHA 3UP9A 1OVTA 2DE4A 4R9GA 3MW0A 3CG1A 1HSLA 3QXMA 1R6ZA 3QUFA 3N94A 1N7WA 1QVSA 3C35A 1NFTA 5B7DA 4ESWA 2CZLA 1FTJA 3PUYE 4EF1A 1MM6A 3O9PA 2VHAA 4RK9A 4UACA 1FQCA 4H8JA 4LP2B 5KCJB 1MS7A 3VVFA 1ZJLA 1QUIA 3RTWB 4TLMB 2ZXTA 4FAJA 1UQWA 4O3BA 1GGGA 4MLVA 3JZJA 1R1NA 3TTLA 4I62A 1MPBA 5EHSA 1WDNA 3C33A 5TPAA 2O7IA 1YPNA 2HCAA 3VV5A 2OJTA 3OELA 4BDNA 5IAIA 4IY5A 4F19A 4KD5A 4RY1A 3T9UA 1JQFA 1DPEA 4BDQA 1SVXB 1FTLA 2ZYNA 3FIRA 2X7QA 4OXVA 4U1OA 3PMXA 1VFEA 2OWTA 3FXQA 4P0GA 4NTLA 1DTZA 2P1SA 5DT6A 3FVGA 5JTYB 3Q27A 4H67A 4THIA 3KSJA 4OETA 4GVOA 1S50A 3T96B 1AL3A 1ANFA 4FECA 2Y84A 1O63A 5HM4B 1IITA 4MH5A 4QFNA 2H4IA 1LFHA 2GHAA 3MPKA 3K6UA 1NH8A 3L6GA 1MY0A 3KEIA 3C32A 5AA4A 1JETA 4JWOA 5H8NA 1USYH 4X9TA 3S2VA 3I5OA 2DE2A 1FQBA 1O7TA 4NWDA 2DVZA 1N3XA 5AA2A 3T9HB 3CSGA 4QFOA 4F1VA 4WEDA 1NNPA 4KCCA 4LONB 4LUBA 4NWCA 4U2RA 4F22A 2HFBA 2V93A 3T9VA 5CRYA 1QUJA 4YAHX 3QSLA 3LR1A 1LBBA 1WODA 2O68A 2I49A 4NF8B 4AQ4A 3TUSA 2QRYA 2H98A 5HBCA 1SW2A 1R9QA 2REJA 5I56A 3IX1A 3LUYA 3ODBA 4TOZA 3HCQA 4POXA 2XX8A 5ISUA 1Y1ZA 3MC2A 1MQIA 3LSFB 4F3PA 3MBPA 4ZEIA 5AA3A 1NNFA 4ZEDA 1MXWA 3CFXA 1B9JA 4JWYA 1OLAA 4RNSA 1XT8A 3VDFA 3KZGA 2I58A 5KDTA 3DLNA 5CC2A 1P1OA 4KYSA 3T22A 3K1PA 3O29A 1I6QA 3IOUA 4H5FA 2Z23A 4EXLA 4PFWA 1RYXA 1LAFE 4DXUA 4AB5A 4H1XA 1BLFA 1Y3PA 4ELQA 4HCWA 1H3DA 2QS4A 3MZ9A 3MAMA 3RQTA 1AIVA 4OENA 1MQDA 2ESNA 4ELRA 2OLBA 1POY1 3F11A 4UA8A 1P1QA 1MY4A 4F1YA 3Q25A 4F29A 5CBSA 4XKNA 1B3GA 3TCHA 5FHOA 2RCAA 1ELJA 1SW5A 3R6UA 4GL8A 4ZDMA 3IOTA 3TQWA 4IO4A 3PPNA 4IO3A 4JSOA 3A3UA 1LB9A 3SERA 1B0HA 2QS2A 2Z8EA 2XXPA 4BDOA 3FVOA 4U21A 2PBWA 2ONRA 3CR9A 3M3LA 3R26A 2AIXA 1B5JA 3OEMA 4WXJA 1MH4A 3KN7A 5FTIA 5J1DA 1D9VA 2DWJA 3OMBA 3BFTA 1BTJA 2QMWA 5H8QB 4QSCA 2GFEA 2XXIA 4X1BA 4FEBA 2X7PA 3PUVE 4OVJA 2HZKA 1XS5A 5DEXB 2H99A 4ECFA 3PPRA 1NL5A 4F2QA 2DP8A 1UTHB 4L17A 3W9WA 3EHTA 1B5HA 1ZTYA 3H6UA 3WAFA 3PPQA 3VXBA 5CBRA 3H3GA 2OCUA 1JNFA 3FASA 3FV2A 3KFMA 4OEUA 1B4HA 2YJPA 3ILTB 1US4A 3IOWA 4KI0E 5JEIA 1ZIUA 4YKPA 4FE8A 4MFIA 3G3JA 2XXUA 1J1NA 4BDMA 4GLIA 3H7MA 2ANJA 2I0BA 4QFLA 4RA1A 1Q35A 4ZE8A 3E4RA 1YCJA 2DS9A 2ONKE 1ATGA 1ZBMA 1PBPA 4C0RA 4ONYA 3JYRA 1LAGE 1MQGA 3UK4A 2Y7KA 1US5A 1MY3A 3TFLA 3PMWA 4XKQA 2PT1A 4EQ7A 2Y7PA 4HCYA 4GXSB 2AL4A 1P1UA 2CMOA 3PMVA 2VD3A 4IGTA 5A5XB 4N07A 4LZ7A 3CVGA 2Y7RA 4OWDA 5F1QA 4QF9A 2O69A 2ALUA 3B7DA 4IO6A 2RC9A 4G68B 5EHMA 5ICQA 4IO2A 2RC8A 3IAZA 4R72A 2G93A 3Q26A 1JVYA 3EF7A 2VD2A 1SYIA 1EZ9A 1B6HA 5CMMA 1B3LA 3MWBA 1HSEA 4Q0CA 2I6EA 1Q1KA 5FHMA 4LQ5A 1SI1A 4U22A 4PFUA 4NMYA 1SBPA 2H9BA 2ONSA 3ZKKA 1IXGA 2P0SA 1M5DA 1SD3A 3D4CA 1NMUA 4PFTA 4KPTA 4WEPA 3UN6A 1Y9UA 2NUVA 3K00A 4F18A 3FGSA 2RC7A 2O1LA 3PU5A 5I84A 1QKAA 2F97A 2F7AA 1LSTA 1LAXA 4GQOA 5H8FB 3TTMA 1B1XA 2NOOA 1B05A 4ZEBA 5M2VA 2XXYA 3RN8A 1FTOA 3RT8A 2LAOA 5H8SA 3KOTA 2DXRA 5CM6A 3CIJA 2D5WA 1NKXA 3G3IA 2F8DA 3PPPA 1MQJA 4G4PA 4GXAA 3TCFA 1RKMA 2P2AA 3S9EA 4PE5B 4R6YA 4R6HA 2QPQA 3MUQA 4KCDA 2RF1A 2B3BA 2XXHA 3SKPA 4R2FA 1AOVA 3THIA 3B6QA 3DP4A 4X1DA 5KZTA 4GWOA 4C1TA 4R2BA 1LAHE 4DZ1A 3TYHA 3PUXE 1I69A 2XXWA 2F5XA 2NVUB 4R73A 2XXXA 5L9SA 5IKBA 2F7BA 2REGA 1F9BA 1LGBC 3L6HA 4ISUA 1I6AA 2E1SA 2V84A 1FQFA 4M4GA 1CB6A 2R6GE 4EQBA 1MRPA 5I2NB 4JB7A 3C31A 3OSRA 5CMBA 1A99A 1EU8A 3JV9A 4LZ5A 1B3EA 4FJPA 4O3AA 1MXVA 4XIGQ 4NF5A 1YTVA 1VR5A 2IEEA 2UVHA 3U1OA 3VXCA 1SDXA 3RT6B 1JW5A 1FQAA 4GOTA 1JEUA 5I57B 3HSTA 4RPOA 1GTKA 3MVXA 1D9YA 1NNKA 1OQGA 4FATA 5I59B 3K1MA 5L8DA 4H5GA 2DQVA 4BLAA 2O1MA 3RTFB 4OERA 1D3KA 2OZZA 5CMCA 4LZ8A 1B51A 2PX1A 1M5CA 3FXRA 3MJNA 5TP9B 5EYFA 1B3HA 3A3CA 3VLWA 4F1UA 2VP1A 1VE4A 4NF4A 3MVYA 3OEKA 1B32A 4O3CA 2E0SA 2D21A 1O64A 4YU0A 4ESXA 4IY6A 4YB5A 5CI5A 5JK4A 3H4ZA 1PB8A 1ZLQA 2Q2AA 1Y3NA 5B70A 3SETA 4F3SA 4GIZA 2ABHA 4QRZA 3QYTA 1OIBA 4KFQA 2F34A 3BKIB 3VLUA 4I1DA 1XVYA 3OOAA 4LQ2A 3O28A 1ZKBA 4QSEA 2Q89A 4YMAA 3AXFA 4E0XA 1KWHA 5FTHA 4HTGA 3IR1A 2A5TB 4ZEFA 2FYIA 3K01A 3FVNA 1MXUA 4XKPA 3I3VA 3G3KA 4OTEA 1OMPA 3TTNA 2HAVA 4DCYA 4FORA 3EHUA 3OO7A 3HO7A 1MM7A 3FVKA 5K2XA 1LCTA 3T9XB 2Z8FA 5CMKA 3QIMA 1URSA 1EH3A 4OZ9A 3HN0A 1N7XA 3USDA 3KBRA 1IXIA 2B65A 4KHZE 2O84X 2XXTA 3K02A 1DPPA 2XXVA 1JW4A 3FATA 4FEDA 4EQ9A 1R9LA 3FZVA 1CE2A 4ZS9A 5DTBA 3SESA 1MQHA 3B6TA 4ZEKA 4GF8A 1QJMA 5H8FA 1MG1A 2GHBA 4G8NA 4DDDA 4E0WA 1GVCA 3FUZA 2NWJA 3RUMA 1QW0A 3SEYA 4ELOA 1H44A 5KCJA 4HW8A 4PFYA 3D4GA 3V89B 2DWIA 4F3GA 1MH3A 4TLLB 1HSJA 4Q5TA 3PPOA 4I8CA 5TPAB 4XXUA 5FHNA 3ZSFA 4QSDA 2HEUA 2O51A 4G77A 1RYOA 5AE4A 1ZU0A 2DWAA 4YKJA 1URGA 2G29A 2GH9A 4U4SA 4ELPA 2HXWA 3QUJA 1QULA 2THIA 4ZZEA 1XC1A 4OQOA 3FV1A 3RPWA 2ZYMA 1VFDA 5I2NA 4G8HA 3K6VA 1QUKA 5JTYA 3GLBA 1IEJA 3TKDA 3Q29A 3O66A 3I6VA 3PGFA 1B40A 2HQ0A 1Y1MA 4DXBA 3HHFA 4M1VA 4R6KA 4OESA 3CFLA 2XD3A 4DLDA 1DMBA 4EUOA 3KOSA 1IIWA 4XTCQ 4POWA 3MP6A 2UYEA 3OXNA 2OK2A 3S9MC 3OO6A 5AA4B 2X26A 1IXHA 5H8NB 3N6TA 2IA4A 1BKAA 2RCBA 3PUWE 1IZ1A 3W15C 5F7VA 4YB6A 4U4XA 1UTBB 3M8UA 5AA2B 1DTGA 3M3FA 1GV8A 1LFIA 3M3KA 3PUZE 1MXZA 2O6AA 4EDPA 2VGQA 2UVGA 2PYYA 1SI0A 2B3FA 5K2YA 4JBZA 3MPLA 2H5YA 4NF6B 3FJGA 3GBBA 4N13A 4NF8A 4RK2A 3ZS6A 4DCXA 4JDFA 1TT1A 3IB0A 1S9TA 5I2KB 4C1UA 3V83A 2QSXA 2F36A 2HAUA 4OMBA 3CSBA 1MDQA 2O7UA 4YICA 2PVUA 2A5TA 5HPQA 1B0LA 4IGRA 3S9NC 1Z7ME 4R74A 3DP6A 1EZPA 3LSLA 4F3BA 4I9DA 1MDP1 1LB8A 1FCKA 1B7UA 4G68C 3WAEA 5KDTB 3DM0A 1FW0A 1BP5A 3KG2A 3TAJA 2Q8JA 1JEVA 3H6WA 2QMXA 5DVIA 2DXYA 4KR5A 4RXLA 2A5SA 3OO9A 3TEPA 4QFKA 3SDFA 3IK6B 2F6GA 4RJZA 3OD7A 5DVJA 3CI8A 4QHQA 3G7WA 3OSQA 4F2OA 4IO5A 3MQ9A 1B3FA 5TU0A 4ND9A 4GD5A 4H8IA 3TTRA 1LFGA 3H06B 1DOTA 2XD2A 3MVWA 2ZNUA 2AL5A 4RYAA 3A09A 2QS3A 4QFPA 2QS1A 1B4ZA 1II5A 4NE4A 1SQYA 5ICTA 4LVQA 5L9MA 3T66A 1PDAA 2UVIA 2I3WA 3IO6A 3U72A 2I4CA 1A55A 1MPCA 1FTKA 2F6PA 1SW1A 1P99A 4DIGA 1PB9A 1OLCA 3KSXA 3DP8A 4H0WA 4OFJA 1Y4TA 4G2ZA 2F35A 1A40A 3VVEA 4K3FA 3K0VA 2M8CA 3ILUB 4F39A 3PV0E 1A54A 2PMSA 3EQ1A 2OBGA 2HZLA 3FD3A 5AA1A 5H8QA 1TFDA 3TCGA 1PB7A 4KYDA 1JW1A 2DE3A 2V3TA 4LA9A 5DEXA 5ITPA 1S7YA 3C9HA 1UTHA 3KJ7A 3KN3A 1TXFA 3UORA 4FIMA 2ZMBA 1B58A 2Q88A 3E9XA 1GR2A 4XKRA 3RLFE 1XVXA 2D3IA 3N26A 4HS7A 3UGWA 2ZNTA 5I58B 4DE8A 3PD8A 3TZAA 1WVJA 3H03A 2DOJA 3GBAA 2I3VA 5AA2D 4YKIA 3DELB 3FJ7A 4R9FA 3FXUA 2Q2CA 3IB2A 5BWJA 4G8MA 1USYE 5ELVA 1B46A 3IB1A 5DVFA 2I4BA 4MF3A 1EZOA 1FTMA 3FJMA 3O6IA 3PD9A 1UTBA 4NEDA 3RNNA 4OEVA 1TWYA 2RKMA 1OVBA 1M5FA 1SYHA 1Z7NE 3BBRA 1URDA 5A5XA 4F31B 1JVXA 4YMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OHNA 3RYDA 1N0TA 4NF6A 5LOMA 4R75A 2VOZA 1IUDA 4LATA 2ZYKA 1FJ9A 1UIUA 2V3QA 3O6GA 3TMGA 4RPNA 5H8HB 4G68A 1NV3A 5I2KA 1FQDA 3O6HA 3Q28A 1LCFA 2R71A 1RDXA 2Z22A 2DVCA 3MSTA 1Q9DA 2DDKA 4PFIA 4Q8RA 4MJOA 3P7IA 4OYVA 3N5LA 1A7LA 4MX6A 2I48A 4Z0IA 2BJJX 4MBPA 2YPNA 3GXAA 2F3BA 2FVZA 3V8XB 4GRKA 3K6WA 4MNCA 1FBCA 2WYPA 4AB6A 2CEYA 4N6DA 4NX1A 3TQLA 3TELA 4N6KA 1NH7A 3E78A 2RINA 3CG3A 2GRVA 1FRPA 4PP0A 1H45A 3MVZA 1D4NA 4GX6A 1G0HA 2F78A 1JP4A 1LBYA 3K1NA 1PC3A 5ET6A 1DCUA 4I3YA 1QKBA 1POTA 2XXQA 4YB7A 4H65A 3S9LC 2Q8MA 4PQJA 4OVQA 1MPDA 3MYUA 4MLQA 2ZYOA 4PE3A 2DSFA 3HHGA 2UYFA 2F7CA 1SPIA 1H76A 3V5AA 3R7XA 3N6UA 2AYSA 1MXXA 3VLVA 3TODA 4OA4A 3VE1B 1MY1A 1B7HA 4DXCA 1FQEA 3K6XA 1MY2A 5BUUA 5IZ3A 3U65A 3IJXB 1IXCA 1PBQA 5ET5A 3G3GA 1LBWA 3E13X 4ZZAA 3EKIA 3W9VA 1L5TA 3ECRA 2NXOA 3HPIA 3U93A 3H6TA 2DWHA 4JWXA 4JXIA 1LLSA 1H43A 4P11A 2FA7A 3C34A 1N76A 1XI6A 2QJEA 4YZZA 4GL0A 4TQUQ 2R9JA 2WKYA 3C4MA 2Z8DA 1FBGA 5DYHA 3U92A 2WEFA 1N84A 3U8QA 1AMFA 3CRBA 4KYEA 3SEVA 4IO7A 2Y7WA 4NF5B 1B1HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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