3ZSFA

Crystal structure of the l-cystine solute receptor of neisseria gonorrhoeae in the unliganded open conformation
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
GSLIERINNKGTVTVGTEGTYAPFTYHDKDGKLTGYDVEVTRAVAEKLGVKVEFKETQWDSMMAGLKAGRFDVVANQVGLTSPERQATFDKSEPYSWSGAVLVAHNDSNIKSIADIKGVKTAQSLTSNYGEKAKAAGAQLVPVDGLAQSLTLIEQKRADATLNDELAVLDYLKKNPNAGVKIVWSAPADEKVGSGLIVNKGNDEAVAKFSTAINELKADGTLKKLGEQFFGKDISVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Two Solute Receptors for L-Cystine and L-Cysteine, Respectively, of the Human Pathogen Neisseria Gonorrhoeae.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Neisseria gonorrhoeae
molecule keywords ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC BINDING PROTEIN, AMINO ACID
total genus 76
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3zsfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3zsfA02
1XC1A 4PFYA 2ZNUA 5FTIA 1JNFA 2DSFA 5FHOA 5KCJA 3EHTA 3VLVA 1FQBA 2A5SA 5HM4B 2FYIA 4KQPA 2Y7PA 2I49A 5TPAA 3E9XA 2VD3A 3OO7A 1LB8A 4WEPA 1EZOA 4EQ7A 1LFHA 5EHSA 1Y1MA 4TQUQ 1J1NA 1IXIA 4HW8A 1MS7A 4JWOA 2O1LA 2RKMA 3KSJA 4DDDA 4H5GA 4QSCA 4IY5A 1M5FA 4KR5A 3QXMA 4QFOA 3R6UA 3CSGA 4NF6B 3TYHA 5CI5A 5EYFA 2R9JA 1P1QA 2I58A 1Y9UA 1MQHA 1PC3A 3IB1A 3FV2A 1IITA 2Y7WA 3PMXA 1IXGA 5B70A 3C36A 4FORA 1OQHA 3EPEA 3K1NA 1QKBA 1P1UA 4RPOA 4C1UA 1B3GA 4KYSA 3SEXA 1ZU0A 3U1OA 4GXSB 2XXIA 3L6GA 3N5LA 3KJ7A 2DS9A 5J1DA 1TFDA 1FQAA 5ELVA 4THIA 1UTBA 2XXTA 2DE4A 2ONSA 3CFXA 1ZTYA 1MY3A 2H98A 5H8NB 3TCFA 3K00A 2AL4A 1EU8A 3WAFA 2QJEA 3TQLA 3TUSA 1URGA 3VV5A 1JEVA 4YAHX 2GH9A 1QW0A 3V89B 2OZZA 4IO6A 4G68B 3T9UA 3VXBA 2Z22A 4KFQA 1MDQA 4YZZA 3PV0E 1LGBC 3MZBA 4ONYA 5I84A 4R74A 4Q5TA 4ZDMA 3LSLA 4IY6A 4F22A 2I4CA 3VDFA 1USYE 3OEMA 1RYXA 2PYYA 1TWYA 3PUVE 3OOAA 1T0KA 3G3KA 2UXAA 1II5A 2F6GA 5A5XB 1MY4A 3GXAA 1I6AA 5LOMA 1DSNA 1MY0A 3I5OA 1BKAA 4DIGA 4OVJA 3TTLA 1DTGA 2HZKA 5L9SA 5FHMA 4K3FA 3JYRA 4OHNA 2UYFA 3H7MA 4TLMB 3A3CA 1Y1ZA 3KJTA 4ZEIA 3OSRA 2OLBA 4Q30B 4NWDA 3QIMA 2UVHA 3K6VA 2ZXTA 2I48A 3Q27A 3MVXA 3TCGA 2HAVA 5BUUA 2XXVA 3HV1A 3IB2A 4YU0A 1LLSA 5TP9B 3H06B 4RPNA 3E13X 5CMMA 4WEDA 1B0LA 2HAUA 2F35A 3OMBA 3TODA 2REGA 2RC9A 3S9MC 2D5WA 3IORA 3TDJA 2P2AA 3U93A 4F1UA 2FA7A 1H44A 1B3EA 4Z7EA 4LATA 3FVOA 3UA8A 4R72A 3SETA 2QS3A 3ZS6A 4R6YA 5JTYA 1NH7A 2DOJA 2F8DA 1US5A 1RYOA 4ISUA 4LQ5A 4BLAA 1H3DA 1B7ZA 4QHQA 2WKYA 4AQ4A 3TPAA 1TT1A 2R6GE 4R2FA 5BWJA 3PPOA 2NUVA 1XVYA 1YTVA 5AA4B 4OWDA 4QFNA 3FZVA 3S4UA 3E4RA 5DEXA 1EZ9A 4KCCA 3RGYA 3PU5A 3MBPA 5KZTA 1N7XA 3N94A 3MW0A 2VOZA 2XHDA 1S7YA 3MZ1A 5I2NA 3TEPA 3PPRA 2XX7A 1N7WA 4PETA 4IO4A 1B7HA 4HCWA 4N13A 1NNPA 5H8HB 1Y3PA 4G8MA 4ZE9A 3TFLA 3KZGA 1VFDA 4PFTA 3LBSA 3U92A 4H67A 2RCBA 3Q25A 3O6IA 2HFBA 3K0VA 4U21A 2V93A 3LSXA 4R9FA 4GVOA 1B40A 4M1VA 1GR2A 5ITPA 3TTKA 3QUJA 2XXXA 3RTWB 3FJGA 3RUMA 3C35A 1DPPA 4M4GA 4YKPA 2B3FA 3WAEA 4OZ9A 1FQCA 3H6TA 1XOCA 1FTMA 4E0XA 2H9BA 4DZ1A 3HO7A 3I6VA 2NXOA 3IK6B 3IB0A 1R1NA 2RC8A 4JBZA 1QKAA 3RN8A 5I59B 5H8FA 1AH5A 5CBSA 5H8QB 3O29A 3UIFA 3C4MA 3CRBA 3MVYA 4TOZA 2PT2A 1M5EA 2CMOA 3MUQA 1P1OA 4NF5B 1F9BA 1FTJA 4H1XA 4U1ZA 2F36A 4G68A 3GZGA 4BDNA 2OWTA 2F6PA 5IKBA 1IXCA 3HHFA 4F39A 3IOTA 1SD3A 3BKIB 4PE5B 1FQEA 4LONB 1FCKA 3HSTA 2XXYA 4ZZEA 1B1HA 5AA2A 1Y20A 1VFEA 3T22A 4R6KA 2ANJA 1MH3A 1VSOA 1L5TA 2VHAA 4C1TA 3SERA 3PD9A 4DCXA 4XIGQ 4OERA 1PBQA 4OQOA 4F3GA 1IXHA 1POY1 5I56A 2O51A 1MY2A 3CFLA 4F3PA 2O1MA 2YJPA 3MJNA 1TXFA 4YKKA 5KDTA 4GRKA 1JEUA 2QS4A 3HCQA 1O63A 4NF8A 2H5YA 3S9NC 2DXRA 1MDP1 1A7LA 3O6HA 4JSDA 3KN7A 2DYXA 4WKMA 4IO2A 4KPTA 1FQFA 3H3GA 3CI8A 3M3KA 2QSXA 4U22A 1TFAA 3TMGA 1YAEA 3S9EA 4NWCA 3ZSFA 3O2AA 3EF7A 1BIYA 3W9VA 4EQ9A 4F29A 1NMUA 3U8QA 1DMBA 1A8FA 1GV8A 3FJMA 2NVUB 5HPQA 2ESNA 4YMBA 4ZEDA 1LFGA 1URSA 1A99A 2KLFA 4XKRA 4IGRA 3TELA 5ICTA 3PUYE 4EF2A 3C34A 2H4IA 3VXCA 4LUBA 3HHGA 2Q9TA 5I58A 2DWJA 1UQWA 2IEEA 4U4SA 1LBBA 4QFLA 3UGWA 3O66A 1M5BA 1OVTA 3TTMA 4G8HA 4F2QA 1FQDA 1N3XA 3K1PA 2DE3A 4ND9A 2UVIA 1NL5A 1HSJA 3OENA 2PVUA 3R7XA 1KWHA 4PQJA 4YB5A 5TU0A 3MWBA 2XXRA 1PBPA 1WDNA 1JVYA 3ODBA 3K2DA 1IUDA 1A54A 4DXBA 3P7IA 4GWOA 3M3FA 4G77A 3SKPA 3MVWA 4XKPA 2QPQA 3QSLA 1IZ1A 2O7UA 5F7VA 4FIMA 3PPPA 1EZPA 4RY1A 3KSXA 4E0WA 3KG2A 3IO6A 2I6EA 3V83A 1GTKA 4ECFA 2ABHA 3H6VA 3G3FA 1H43A 4KHZE 4ZEBA 1B52A 1IEJA 4H8JA 1B46A 3BBRA 1A40A 4POXA 5H8HA 4OEUA 1B2HA 3EN3A 3USDA 4XXUA 2UVGA 2F7BA 3IOVA 5L9MA 5I57A 4R73A 1SI0A 3MP8A 1IIWA 3OELA 5CRYA 4FATA 3RT8A 2Z8FA 1EH3A 4N6PA 1NH8A 2Q2AA 4JXIA 4FEBA 3N26A 3L6HA 3DP4A 1MM6A 3F11A 3MQ9A 4KI0E 2XXHA 1B0HA 4N07A 1LCTA 2DVCA 3IJXB 4BDQA 2O84X 4TLLB 5IAIA 1UTHB 2R71A 4JDFA 5CM6A 3EHSA 4POWA 2PX1A 4KYEA 3K6UA 3UP9A 1S9TA 4P0GA 4DLDA 3FXRA 4BDLA 1ZLQA 3RNNA 1US4A 1VR5A 3DLNA 4F1VA 2I3WA 4ZS9A 5H8QA 3O9PA 1NNFA 3VVEA 1B5IA 4XTCQ 3QUFA 4G2ZA 2HZLA 1S50A 5I2KA 2O6AA 2X7QA 5DT6A 2XD2A 2O69A 1Q1KA 4LZ7A 1SQYA 5KCJB 5ISUA 1SW1A 2DWIA 3RTFB 4MFIA 4UACA 1POTA 5DVJA 4OFJA 1DOTA 3PD8A 4MF3A 1NNTA 1N0TA 1Y4TA 3TAJA 3FVKA 4LP2B 4BDRA 1FTKA 1B7UA 1PB8A 1MRPA 1XS5A 4GQOA 3FATA 3T66A 1MXZA 4BDMA 3MZ9A 4G4PA 3H6UA 1LBCA 2PBWA 4XKNA 5FHNA 4F18A 2A5TA 4U1OA 4OFLA 4FEDA 4MBPA 5DTBA 1B3HA 1I6BA 3E3KA 4IO5A 1I6QA 4MH5A 2QMXA 3JV9A 2ZYOA 3B6TA 1Y3QA 4PP0A 2Q88A 4U2RA 5CMKA 1B4HA 1BP5A 3ILTB 3K02A 2Y84A 2QRYA 4ELQA 3IOUA 3KGCA 1Y3NA 3DM0A 3GLBA 4QSEA 3T9VA 4PFWA 2ZMBA 3W15C 3B6QA 3CR9A 5DYHA 2QS1A 3Q28A 4YICA 2BJJX 2E0SA 3VLWA 3K6XA 1UTBB 1DPEA 1LB9A 2HCAA 4EUOA 5M2VA 3PUXE 4NF4B 1PEBA 3RPWA 3C9HA 4NF6A 4NEDA 2NOOA 3FJ7A 3RLFE 3I3VA 3MAMA 2OCUA 1OVBA 2F5XA 3FVNA 3FXQA 1R9QA 1QUKA 3QAXA 4FAJA 1MM7A 2XXQA 3OO8A 3N6TA 5DVIA 3Q26A 1P1NA 4ELOA 1MXYA 4P0IA 4O3BA 3PPQA 4I9DA 1LAXA 4HS7A 1SYHA 4I1DA 4PFUA 2ZYNA 4RK9A 3CVGA 2V84A 3A3UA 3H6WA 5CMCA 3CIJA 3FUZA 4RA1A 5AA1A 2PT1A 1JW5A 4IGTA 3SEUA 1BLFA 1WVJA 4GXAA 4JB7A 5H8NA 5CBRA 1N84A 4QRZA 4GFRA 4RJZA 3SEVA 2QL3A 3C31A 2LAOA 2F34A 5K2YA 5K2XA 3TKDA 3K4UA 1OLAA 4LVQA 4AB5A 5L9OA 1MXVA 4ZECA 1AL3A 3SDFA 4QFKA 3IO4A 3EHUA 1B1XA 3LR1A 3T93B 4EQBA 1USYH 4JWXA 3TQWA 4EDPA 2H25A 4GL8A 1MPDA 5A5XA 1IQ7A 1Q35A 3M3LA 1SDXA 4GOTA 4YB7A 3QK6A 3O97A 1HSEA 4F31B 5JTYB 3D4CA 2HQ0A 4MLVA 4NMYA 3ZKKA 3MP6A 1QVSA 4L17A 4I62A 1D9YA 1CB6A 4MLQA 4JWYA 1B51A 4O3CA 4R75A 4F1YA 2ALUA 5AE4A 2Z8DA 1SW5A 1B5JA 4U4XA 3UN6A 3C33A 1UIUA 4U23A 5TP9A 1P1WA 4XKQA 5F1QA 1MG1A 1MY1A 1LFIA 5JK4A 2F97A 4Z0IA 1A55A 4H6DA 4OFOA 4ZEKA 3RT6B 1B05A 3ZKLA 4DCYA 3K6WA 5DEXB 3FIRA 5H8SA 1MQGA 4FECA 3CG3A 3O6GA 1XVXA 2H99A 4GLIA 3A09A 3MVZA 3T9HB 1MXUA 4X1DA 1AOVA 4H0WA 4RXLA 1B4ZA 1PDAA 4OYVA 5I2NB 4ESXA 1RKMA 2UVJA 1QULA 4OESA 3ONMA 2QMWA 4X9TA 1JW1A 1LSTA 2Q89A 3TTNA 1LCFA 3TTRA 1ZKBA 2DWAA 5AA4A 3G7WA 1M5DA 3FV1A 4OETA 1H45A 1A8EA 3OO6A 2OJTA 4WXJA 2X7PA 3IAZA 4RYAA 4F19A 2GHAA 2DE2A 3G3HA 4H8IA 1HSLA 2Y7RA 3CSBA 2O68A 1YCJA 2XXWA 3MPKA 2CZLA 2G93A 1PB9A 1R9LA 1JVXA 2P1SA 4Q0CA 4FJPA 5CMBA 1ZBMA 3K1MA 1MPCA 1OLCA 3Q29A 5H8FB 3DP6A 1MQJA 3UK4A 4KD5A 1WODA 4NF4A 1N04A 4F2OA 2ONKE 2B65A 3PUZE 1LAFE 4YB6A 1R6ZA 3LUYA 3LSFB 4R2BA 3RY3A 4G68C 1JETA 1NNKA 3CG1A 4RNSA 5HBCA 3TZAA 3S2VA 4GIZA 4UA8A 4KCDA 4EXKA 2I0CA 1FW0A 1SW2A 2E1SA 5AA2B 3B7DA 5B7DA 2XD3A 3BFTA 3KFMA 3MC2A 1LAGE 4HCYA 3MP1A 2IA4A 3B6WA 3KEIA 5I59A 4IB2A 5I56B 1SW4A 4H5FA 4LZ8A 4QSDA 4I8CA 1JQFA 3G3JA 1QUIA 5EHMA 1D9VA 2AYSA 3N6UA 3KOSA 2X26A 3KN3A 5KDTB 2QS2A 1B32A 3KBRA 4NF8B 4H65A 2ZYKA 4NF5A 3FGSA 4RK2A 1MH4A 2REJA 2Z8EA 4FE8A 3VFJA 1MQIA 1I69A 1XT8A 3D4GA 1DTZA 3HN0A 1OIBA 5TPAB 2F78A 2V3TA 3OEKA 4QF9A 4ZEFA 5ICQA 1JW4A 3EQ1A 4HTGA 2Y7IA 4P11A 3T96B 3KN8A 1B3LA 2ZNSA 4G8NA 1Z7ME 3QYTA 4BDOA 1XHYA 4GF8A 3ECRA 2Z23A 3JZJA 3H4ZA 2P0SA 3LSWA 1OMPA 4X48A 3VVFA 3SEWA 4OENA 2RINA 3R26A 2ONRA 1ANFA 1QJMA 2ZNTA 2D21A 3V8XB 5I58B 3TCHA 2RC7A 1ATGA 2YPNA 1Y4CA 4ZZAA 1ELJA 5CC2A 4DE8A 2OK2A 1MQDA 2Y7KA 3C32A 2DP8A 5ITOA 1B58A 2DQVA 4OMBA 1B6HA 3DELB 3OD7A 4LA9A 3CFZA 2V25A 1D3KA 3THIA 2B3BA 5JEIA 3G3GA 3U72A 2V3QA 3IX1A 2XXUA 4NE4A 1UIVA 3PMWA 4YKJA 1PB7A 2Q2CA 2XXPA 2DXYA 3IL1B 4AB6A 4GL0A 4YKIA 4O3AA 4EXLA 3BFUA 4IO7A 1GGGA 3PPNA 1NFTA 2AL5A 3T9XB 1AIVA 2OWSA 3OXNA 4ESWA 1CE2A 1ZMGA 2XX9A 1N76A 1H76A 2D3IA 1BTJA 5AA3A 1FTOA 3GBAA 1MXWA 3ILUB 3VLUA 2VGQA 2RCAA 5I57B 1YPNA 1P99A 2YLNA 2O7IA 2DVZA 1ZJLA 3IR1A 2I0BA 3SEYA 2M8CA 1GVCA 3FVGA 2GHBA 1ZIUA 1SYIA 2GFEA 3PGFA 1SVXB 2XX8A 2VP1A 2PMSA 3O28A 3M8UA 4KYDA 3KOTA 1M5CA 2ZYMA 3H03A 4QFPA 4DXUA 1OQGA 1FTLA 4LZ5A 1MXXA 3K01A 4IO3A 1NKXA 4ELRA 3S9LC 4GD5A 4LQ2A 2OBGA 3G3IA 5FTHA 4DXCA 4R9GA 4ZE8A 2THIA 3RQTA 4EF1A 4JSOA 4OTEA 5I2KB 2Q8JA 3MPLA 1LAHE 2UYEA 2DWHA 3FASA 3U94A 1VE4A 2GRVA 4NTLA 5AA2D 2VD2A 3IOWA 1B3FA 3LC8A 4Q8RA 3IJOB 1QUJA 1AMFA 4C0RA 4OEVA 3FD3A 1Z7NE 1N3WA 1UTHA 2V3UA 3PUWE 3DP8A 4YMAA 1SI1A 1URDA 4F3BA 1D4NA 3UORA 3OO9A 4F3SA 4X1BA 2FNCA 4ELPA 3AXFA 2RF1A 1O64A 1SBPA 1MPBA 2F7CA 3VE1B 2F7AA 4OXVA 2G29A 2AIXA 3FXUA 2W7YA 4R6HA 2I4BA 1B5HA 3VVDA 2NWJA 2HEUA 3GBBA 3PMVA 3OSQA 2A5TB 2I3VA 5DVFA 3V5AA 2HXWA 1B9JA 5L8DA 3SESA 3W9WA 3HPIA 1O7TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XC1A 4PFYA 2ZNUA 5FTIA 1JNFA 2DSFA 5FHOA 5KCJA 3EHTA 3VLVA 1FQBA 2A5SA 5HM4B 2FYIA 4P8BA 4KQPA 4GBVA 2Y7PA 2I49A 2OWZA 5TPAA 3E9XA 2VD3A 3OO7A 1LB8A 4WEPA 1KZ8A 1EZOA 4EQ7A 1LFHA 5EHSA 1Y1MA 4TQUQ 1J1NA 1IXIA 2WX9A 4MAGA 4HW8A 2VPOA 1MS7A 4JWOA 2O1LA 2RKMA 3KSJA 4DDDA 4H5GA 4QSCA 4IY5A 2WBBA 1NI9A 1M5FA 1DK4A 4KR5A 3QXMA 4QFOA 3R6UA 3CSGA 4NF6B 3TYHA 5CI5A 5EYFA 3D1RA 4O8MA 2R9JA 1P1QA 2I58A 1Y9UA 1MQHA 1PC3A 3E79A 2R8TA 3IB1A 3FV2A 1IITA 1IMCA 1BK4A 2Y7WA 3PMXA 1IXGA 5B70A 4MNPA 3C36A 4FORA 1OQHA 3EPEA 3K1NA 1QKBA 1P1UA 4RPOA 4C1UA 2CEXA 1B3GA 4KYSA 3SEXA 1ZU0A 3U1OA 4GXSB 1CNQA 2XXIA 3L6GA 3N5LA 3KJ7A 2DS9A 5J1DA 1TFDA 1FQAA 5EQ7A 1FBFA 5ELVA 4THIA 1UTBA 2XXTA 2DE4A 2ONSA 3CFXA 1ZTYA 1MY3A 2H98A 2PCRA 5H8NB 3TCFA 3K00A 5ESYA 4DI4B 2AL4A 1EU8A 3WAFA 2QJEA 3IFAA 3TQLA 3TUSA 1URGA 3VV5A 1JEVA 4YAHX 4PF6A 2P3VA 2GH9A 1QW0A 3V89B 2QVRA 2OZZA 4IO6A 4G68B 3T9UA 1FPKA 3VXBA 2Z22A 4KFQA 1MDQA 4YZZA 3PV0E 4MX6A 1LGBC 3MZBA 4ONYA 5I84A 3IFCA 4HE0A 4R74A 4Q5TA 4ZDMA 4PDHA 3LSLA 4IY6A 4F22A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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