3ZVQA

Crystal structure of proteolyzed lysozyme
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
70
structure length
70
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Salt-Assisted Religation of Proteolyzed Glutathione-S-Transferase Follows Hofmeister Series.
pubmed rcsb
total genus 23
structure length 70
sequence length 70
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-07-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3zvqA00
3K3TA 1IP7A 2YBHA 3AZ6A 1TBYA 4H9EA 1LJGA 1GFRA 3AW6A 1IVMA 1BB7A 3W3EA 5KKIA 1GBXA 1B7LA 4L41A 1LZ1A 4TUNA 1PS5A 3W6EA 1OQMA 2Z39A 4NHTA 3OJPA 1XFPL 1YAPA 8LYZA 1I20A 3J6KA 5A3EA 1UACY 4H9FA 3ZEKA 3TMVA 1IC5Y 1LHMA 1IWWA 1LMNA 1SQ2L 2H5ZA 4WM4A 1EQ4A 1PZYA 1CKHA 1FKQA 2RSCA 1DI3A 5KXPA 1G7HC 4N9RA 1IP2A 1FN5A 1GXXA 2H9JA 1LSEA 1HFXA 2HECA 1VATA 1FKVA 1UIFA 4H90A 4WOAA 2DQJY 5ILCA 3FI7A 2ZNXY 2H9KA 4WG1A 4CGEA 4N8ZA 1IWTA 1WVUA 1QSWA 3A6CY 1RE2A 1JEFA 1GFUA 1NDMC 2Q0MX 154LA 2AUBA 1IOCA 1QTKA 4IATA 1LSCA 3WU8A 1YQVY 1OP9B 3T36A 4BADA 4NGIA 1RI8B 4J1BA 3TMWA 1LOZA 4XJHA 3W6BA 3WU9A 1LPIA 4TSCA 2Z2FA 5HNCA 4LT3A 4WO6A 3B0KA 4HTKA 1DZBX 4NWHA 1JWRA 1IP4A 1LHJA 4GCDA 4LYBA 1XEJA 1LMCA 4NSHA 4ETAA 4DD3A 2DQGY 5KY1A 1FBIX 2N5ZA 134LA 4PJ2C 4UWUA 5FEKA 1GBWA 2MEAA 3D3DA 2EIZC 4LT0A 1LHLA 4Z41A 2LYMA 4OWEA 1GB6A 1V7SA 2LZTA 2YBNA 1G7JC 4H8ZA 4XN6A 1GF6A 4GN3A 1BWHA 4NEBA 4NHSA 1GWDA 1BB3A 1YKXX 1IP5A 4HPIA 3FE0A 4QEQA 4ETCA 2XBRA 2IFFY 3CSQA 2Z18A 4H93A 5I54A 1LSMA 3B6LA 2LYOA 2MECA 4OWCA 1LJJA 1LMAA 4NSJA 4WM2A 1CKGA 1SLYA 3G3BB 4X3BA 1TAYA 5DM9A 5KXXA 3W6DA 3TXFA 4LT2A 5LYZA 2ZQ3A 2DQAA 3EXDA 1H6MA 1LZBA 6LYTA 2CWIA 4ETDA 1GFAA 2BQLA 4GN5C 4AGAA 2Z19A 4HV2A 1LJNA 1HNLA 1NWGA 2D91A 4C5FA 4BS7A 1KXYA 1IIZA 4ZFPA 2Z38A 1WQOA 1VEDA 2HEBA 5L3HA 1GDXA 4WLXA 5FSTA 4DD9A 5JENB 1YIKA 1GD6A 5F9XA 1JUGA 4ZEEA 4HPEA 3A6BY 4N1EI 1UUZC 2MEGA 3WH1A 153LA 2EQLA 2BQMA 3HBDA 3WXTA 1TCYA 5KXYA 3IJUA 4DC4A 1QUTA 5K7OA 1GB0A 2YDGA 4HJZA 1JJ3A 1ZV5L 3J4GA 4NSIA 1JSEA 2W1XA 3LN2A 1XGRC 1UIBA 1P2CC 4MSTA 5I5QA 4HJVA 4E3UA 4H92A 3P64A 1C10A 2EPEA 1LZEA 4P2EA 1ZVYB 3HBHA 3LHMA 2MEFA 4XJGA 1GBOA 1HEPA 1NBYC 3A96A 5LYTA 1ALCA 5FDJA 3BKHA 1C43A 3EO5A 4LYTA 1HHLA 1LZ5A 1UIEA 1W08A 2D4IA 1OUFA 2F2NA 3A8ZA 4OOOA 1BGIA 1GF5A 3TXJA 1GFJA 3WW6A 1LSNA 3A90A 1AT5A 1CKDA 3A67Y 1HC0A 1H87A 2GV0A 2HEFA 5A3ZA 3F6ZA 4UWVA 207LA 1J1PY 5DN5A 4DYGA 3QE8A 1LJ3A 5FCPA 4KL7A 1FLWA 1IR7A 1IOQA 1D0KA 1KXWA 1LJ4A 1UC0A 3ATOA 5KXOA 2CJLA 2DBTA 2LYZA 4PRQA 1EQ5A 5LXWA 1F0WA 4DD0A 3RNXA 4NGKA 1GFVA 5HQ1A 5KXMA 2D6BA 4YENA 2XBSA 5B1FA 4GCBA 4H91A 4NSGA 4BAPA 3A93A 1GXV2 4KPMA 4Z98A 1LHIA 5LIOA 4G49A 3AGGG 4DD2A 1LZ9A 1HMLA 4XJBA 1AKIA 1LZCA 1IP1A 1GFTA 4J7VA 3LYOA 2EKSC 3HFMY 4EOFA 5KKJA 1INUA 2BQDA 4DDAA 3WW5A 1LJKA 4G4CA 1LZ8A 1IOSA 4PGJB 3CT1A 5DN4A 1LAAA 194LA 1LZDA 1UA6Y 2BLYA 1CKFA 1HEOA 1NHEA 1OUGA 3HBEX 1VAUA 3WL2A 5DLAA 4Z46A 3KAMA 1IORA 1D6PA 1F6RA 3ULRA 1D0MA 4GCCA 2C8PA 3AYQA 5APEA 2MEEA 3TXEA 1NMMA 1KIRC 4NHQA 1B7MA 2I26L 2LHMA 4LZTA 1I56A 3TMUA 2MEHA 3RW8A 1IP6A 3ZVQA 1YAMA 4FDYA 2ZIKA 1QUSA 1CNSA 5LVKA 1HMKA 4B1AA 3TXHA 3LZTA 3W6FA 5E4PA 1BB5A 3QY4A 2BQFA 2DQIY 1DI5A 2NWDX 4DD7A 5LYMA 1GPQC 1RFPA 3LZ2A 1CKCA 1HF4A 3B72A 1FDLY 3WUMA 2FYCA 1CJ6A 2BQKA 4NG8A 1GE3A 1VDQA 4YEMA 5KXRA 1HEMA 2MEBA 3RU5A 4YEOA 3IWRA 2YBMA 4GLVA 4OWHA 3CT5A 1LZTA 5LA5A 4NGZA 5ILFA 3N9AA 4H9IA 3G3AB 4WMGA 5FHWA 1O23A 1OUIA 3N9CA 4CFPA 1LSAA 4I8SA 4HV1A 3WPKA 1G7IC 1HEWA 3N9EA 1HERA 1UCOA 4NFVA 4KXIA 2BQNA 5C6JA 1LZYA 4ET8A 1LSDA 4TWSA 1LSZA 1GB9A 4H8XA 1ZVHL 4B0DA 1LCNA 1IX0A 3P66A 1REZA 1GE0A 1VDSA 3AZ7A 4G9SA 2HU1A 3A3RX 3GXRA 4MR1A 5II3A 4B4EA 5B06A 1GE4A 3TXKA 1IOTA 2HEDA 1G7LC 5LAFA 1GEVA 2YBIA 3CSZA 2F4AA 4OWBA 1LMOA 1BQLY 1HENA 1V7TA 4TX7A 4GCEA 2BPUA 4LYCA 1T3PA 4XJDA 4G4BA 3LYTA 2BAAA 4NWEA 4KT3A 1BB6A 4DD1A 4D9ZA 1YILA 1BB4A 3CQLA 4NHPA 5KXTA 4XADA 1VFBC 3AGHA 4N5RA 5IHGA 3EBAB 4MCKA 3WVYA 5M1YA 5KXLA 1GBYA 2BQBA 5I4WA 2MEIA 2X0AA 1B5WA 4G4HA 4M4OA 1WTNA 2BQEA 3W6CA 4H1PA 5APCA 2LZ2A 1LSFA 1IR8A 1BHZA 4IJ4A 4WLTA 1JTTL 5FELA 3RT5X 1IO5A 1YAOA 2HU3A 3OK0A 3ATNA 1JISA 5L3IA 1YKYX 3CSRA 1NKHA 4HTQA 4GN4A 1FLQA 2ZQ4A 4C3WA 1IWVA 1DKJA 4NGWA 1GF9A 4TSBA 1BWJA 1B9OA 1XSFA 1YAQA 1BVKC 1MLCE 2BQAA 3WMKA 2FBDA 5C6IA 4Z3MA 1AM7A 1D6QA 1DKKA 1IWYA 4NGLA 5I53A 1B5XA 1QDTA 4HSFA 1OUBA 2Y8PA 1IEEA 3AZ4A 3WU7A 4CHXA 1J1XY 1JKCA 1OUHA 1LYOA 4B49A 2DKVA 1AT6A 1IY3A 1GF3A 2Z37A 4RW2A 5E9RA 4DT3A 1JIYA 1DPWA 2DQCY 4IASA 4I0CA 4OWAA 5AMYA 1GE2A 5B05A 2ZYCA 5APDA 4WM5A 1JITA 5LA8A 1UIHA 4AXTA 4O34A 1LKRA 5KJ9A 4DDCA 2DQEY 1C46A 3LYZA 4H9CA 2W1YA 2Z2EA 4N1CC 1LJFA 1WQRA 2YSSC 1OUDA 1LSGA 4RDSA 1XGTC 4LGKA 1IY4A 4U3XB 2G4PA 4H9HA 4NHIA 1XGQC 4W94A 3WUAA 3A95A 5F14A 5LVHA 1VDPA 4R0FA 4UWNA 3WXUA 2DQDY 2F4GA 1IP3A 4H94A 1JHLA 2DQFC 4ET9A 1F6SA 1YKZX 1FLUA 4RLNA 4PRUA 3SP3A 3VWOA 4A7DA 1JSFA 5I4XA 1NDGC 1GAYA 1REMA 2A7DA 3WPLA 4ZIXA 2D4JA 2I6ZA 3CT0A 4NG1A 4WL7A 1GBSA 2FYDA 1LYYA 5D5FA 1GFHA 1LYZA 5IDDA 3TXIA 4HJYA 1E8LA 1KXXA 1B7QA 2C8OA 1OUJA 1B7PA 1C45A 3EMSA 5LVIA 5B1GA 1LZAA 1EQEA 4BAFA 7LYZA 1LJHA 1B5UA 1LSYA 4WG7A 5F16A 1GB2A 2A7FA 1LKSA 4LYMA 1UIAA 1LHKA 4PHIA 3QNGA 1CJ9A 3B0IA 2FBBA 4LFPA 1LZ4A 5EBHA 4R6CA 1B7SA 3P4ZA 1REYA 1JKDA 1A2YC 2BQCA 4M6DA 3RZ4A 1UIDA 4N0JA 3WVXA 1WVVA 4GCFA 3P65A 5APFA 4YF2A 2ZWBA 1RJCB 3AGIA 3AW7A 1CJ7A 2B5ZA 3B0OA 1BWIA 1HFZA 1I1ZA 1OUCA 4HTNA 1TEWA 5DL9A 1GF0A 1QIOA 1JKAA 2BQGA 2VB1A 132LA 1T6VL 1B5ZA 4J1AA 5HMVA 1LMQA 2HUBA 3MGWA 1HEQA 4CJ2A 1B7RA 1LSBA 1B7NA 5LINA 1YROA 1G7MC 4DWXA 1IWZA 4EMNA 2Z12A 1QDRA 4WLDA 2YBJA 1XEIA 2XJWA 1TDYA 3A34A 1GBZA 4B4IA 1LZ6A 1GF8A 1LTMA 5LAGA 2YVBA 5IELA 4NIJA 1Z55A 4NGOA 3M18B 3A94A 1LJIA 1RCMA 4QDNA 4LFXA 4WL6A 1D0LA 4WM6A 1OUAA 1KIPC 1C7PA 4ETEA 1GFKA 1IC7Y 3GXKA 1UBZA 4WO9A 4II8A 1YL1X 3TMXA 2XTHA 1LZRA 4QY9A 1LHHA 5I4YA 4W96A 1D9UA 5F81A 2F30A 1CJ8A 1YANA 3IJVA 3CB7A 1LMPA 1QQYA 4J0LA 5KXKA 1QSAA 9LYZA 1JJ0A 4FJRA 2HEEA 2BQOA 1AZFA 1QTEA 5HNLA 1MELL 1GF7A 4OOTA 2I25L 2YBLA 3WUNA 3D9AC 2ZIJA 4XJIA 4WM1A 1B0DA 2G4NA 3E3DA 1YL0X 1WQMA 1B5YA 2D4KA 5KXSA 6LYZA 1JKBA 3A3QA 1GB3A 2ZNWY 4PPOA 2PC2A 4YM8A 3WYHA 5C6LA 1LZSA 3TXDA 4DDBA 5B07A 3TXBA 193LA 1NQIA 133LA 3BKVA 2HTXA 1XEKA 4LYZA 1N4FA 4ANRA 1FLYA 3TXGA 5HMJA 1VDTA 5T3FA 2ZILA 1NF5A 5KXNA 1WTMA 2WARA 3T6UA 4H8YA 4ML7A 1IWUA 1J1OY 2W1LA 2BQHA 1BVXA 4QGZA 1REXA 5KXZA 135LA 1LZNA 5LVGA 208LA 2CGIA 4NY5A 1HFYA 4H9AA 1F10A 1JJ1A 1GE1A 1B5VA 1KIQC 4HP0A 1DXJA 5D5CA 4ETBA 5F9UA 3A92A 1OUEA 2IHLA 2HEAA 3W6AA 3LYMA 3WULA 1A4VA 4OW1A 1LYSA 1GEZA 1XGPC 5L9JA 1WQNA 4B4JA 1IWXA 1B2KA 4CFOA 1LJEA 5KXWA 2ZYPA 1LSPA 1LZGA 4RW1A 1XGUC 4H9BA 3A91A 1GF4A 3AB6A 1ZMYL 1DQJC 1JPOA 4RLMA 1NBZC 1GB5A 4NGJA 1WQPA 1GB8A 1HSXA 1C08C 1HELA 3AJNA 1EL1A 1JTPL 1GFGA 1DPXA 4XJFA 1DI4A 3ZVQB 3P68A 4NGYA 5HLLA 4XYYA 4NGVA 5LVJA 2BLXA 1GFEA 1B7OA 1HSWA 1LMTA 2W1MA 1IC4Y 2MEDA 3M3UA 1GAZA 1WQQA 4XENA 3WPJA 4GLAA 1W6ZA 1UICA 2G4QA 3AZ5A 4LYOA 4WLYA 1GDWA 2CDSA 1IR9A 1GB7A 2BQIA 4WM3A 5J7CA 4LT1A 4YOPA 2BQJA 5B59A 1UIGA 1GHLA 4TTDA 1JTOL 2DQHY
chains in the Genus database with same CATH superfamily
221LA 2F2QA 1TBYA 3AZ6A 1IVMA 1L67A 1OQMA 1G06A 2Z39A 3OJPA 1XFPL 4NHTA 2OU9A 1UACY 1LHMA 262LA 1DI3A 2QARC 1G7HC 1LWKA 1L20A 2H9JA 1L80A 1HFXA 1VATA 2ZNXY 4CGEA 209LA 1QTBA 4N8ZA 1OWZA 4W55A 2AUBA 1QTKA 1G1WA 4BADA 1L0JA 3TMWA 4LT3A 4WO6A 2OE4X 3B0KA 1L09A 1LHJA 4LYBA 4ETAA 1L46A 5FEKA 1GBWA 2MEAA 4OWEA 2LZTA 1G7JC 4GN3A 212LA 4NEBA 1GWDA 1BB3A 4HPIA 2Z18A 4H93A 3B6LA 1L92A 4OWCA 214LA 4NSJA 1SLYA 1P2LA 1L38A 236LA 258LA 1C6FA 4ETDA 1GFAA 4GN5C 4AGAA 1L50A 1L97A 1NWGA 251LA 4ZFPA 4K5YA 2Z38A 1WQOA 1VEDA 3G3XA 4WLXA 3G3WA 4HPEA 3A6BY 1KY0A 1UUZC 3WH1A 2EQLA 3HBDA 1ZV5L 3J4GA 1L95A 1JSEA 1P2CC 4MSTA 4E3UA 4HJVA 1L60A 1LZEA 1HEPA 1LI2A 227LA 1C6AA 3EO5A 4LYTA 1D3NA 122LA 1LZ5A 165LA 1OUFA 1LSNA 4ARPA 1HC0A 2ANXA 3FA0A 3ATOA 143LA 5KXOA 2CJLA 2DBTA 4DD0A 5HQ1A 5KXMA 5B1FA 4NSGA 175LA 4G49A 1LZ9A 1HMLA 4XJBA 1AKIA 3NY8A 1IOSA 5DN4A 2BLYA 1JTNA 225LA 5APEA 3HTGA 2MEEA 1NMMA 2I26L 2MEHA 3C7ZA 3ZVQA 1D3JA 3HTBA 2ZIKA 1CNSA 1HMKA 158LA 2DQIY 1G0JA 4DD7A 4I7QA 3LZ2A 1OV5A 2FYCA 1CJ6A 2BQKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3K3T A;  1IP7 A;  2YBH A;  3AZ6 A;  1TBY A;  4H9E A;  1LJG A;  1GFR A;  3AW6 A;  1IVM A;  1BB7 A;  3W3E A;  5KKI A;  1GBX A;  1B7L A;  4L41 A;  1LZ1 A;  4TUN A;  1PS5 A;  3W6E A;  1OQM A;  2Z39 A;  4NHT A;  3OJP A;  1XFP L;  1YAP A;  8LYZ A;  1I20 A;  3J6K A;  5A3E A;  1UAC Y;  4H9F A;  3ZEK A;  3TMV A;  1IC5 Y;  1LHM A;  1IWW A;  1LMN A;  1SQ2 L;  2H5Z A;  4WM4 A;  1EQ4 A;  1PZY A;  1CKH A;  1FKQ A;  2RSC A;  1DI3 A;  5KXP A;  1G7H C;  4N9R A;  1IP2 A;  1FN5 A;  1GXX A;  2H9J A;  1LSE A;  1HFX A;  2HEC A;  1VAT A;  1FKV A;  1UIF A;  4H90 A;  4WOA A;  2DQJ Y;  5ILC A;  3FI7 A;  2ZNX Y;  2H9K A;  4WG1 A;  4CGE A;  4N8Z A;  1IWT A;  1WVU A;  1QSW A;  3A6C Y;  1RE2 A;  1JEF A;  1GFU A;  1NDM C;  2Q0M X;  154L A;  2AUB A;  1IOC A;  1QTK A;  4IAT A;  1LSC A;  3WU8 A;  1YQV Y;  1OP9 B;  3T36 A;  4BAD A;  4NGI A;  1RI8 B;  4J1B A;  3TMW A;  1LOZ A;  4XJH A;  3W6B A;  3WU9 A;  1LPI A;  4TSC A;  2Z2F A;  5HNC A;  4LT3 A;  4WO6 A;  3B0K A;  4HTK A;  1DZB X;  4NWH A;  1JWR A;  1IP4 A;  1LHJ A;  4GCD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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