3ZX7A

Complex of lysenin with phosphocholine
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
AEGYEQIEVDVVAVWKEGYVYENRGSTSVDQKITITKGMKNVNSETRTVTATHSIGSTISTGDAFEIGSVEVSYSHSHEESQVSMTETEVYESKVIEHTITIPPTSKFTRWQLNADVGGADIEYMYLIDEVTPIGGTQSIPQVITSRAKIIVGRQIILGKTEIRIKHAERKEYMTVVSRKSWPAATLGHSKLFKFVLYEDWGGFRIKTLNTMYSGYEYAYSSDQGGIYFDQGTDNPKQRWAINKSLPLRHGDVVTFMNKYFTRSGLCYDDGPATNVYCLDKREDKWILEVVGLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of Lysenin Reveal a Shared Evolutionary Origin for Pore-Forming Proteins and its Mode of Sphingomyelin Recognition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSENIN
molecule tags Toxin
source organism Eisenia fetida
total genus 57
structure length 296
sequence length 296
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.980 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3zx7A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3zx7A02
3WINC 4EB2B 4KEIA 5DUYA 3UJ4A 1DZCA 4II0A 4OW4A 3BTAA 3HN1A 3HSMA 1DFQA 4ZA3B 3AKIA 3PG0A 1XYFA 4I4XA 3H6RA 3RTJB 1S0BA 1BFGA 4LO2A 2J3PA 1S0LA 4KEJA 4QBCA 1K5UA 2BEAA 4ZGRB 3O4AA 3OGFA 4GAIA 1ILR1 3S8JA 1FWUA 3R4UA 3FFZA 5FZZA 1BA7A 1DFCA 2KKIA 3BAUA 1F31A 2ZQOA 4I6IA 4X37A 4QD2B 1ISVA 3RMYA 1V6VA 1RG8A 1JLXA 1W3GA 7I1BA 1ISXA 3BA4A 3PMEA 4I4QA 3BAGA 3F1RA 3K1XA 4GP0A 1MC9A 3O3QA 3OBTA 2E4MA 4A7YA 3SNVA 1WD3A 3CU1B 2UUSA 5BXSA 1BASA 5BQUA 4ZLBB 2F8XC 2E4MC 3AJ5A 3A07A 2FDBM 1VCLA 1NZKA 2P23A 3AH2A 3Q7YA 1DIWA 2VXRA 1WBAA 3BRFA 1OQLB 3CA6A 3VSFA 5BVPI 3F62B 4GAFA 4D0ZA 1UPSA 3FJJA 1EVTA 4F34A 3N7JA 1E0OA 2MIBA 3BAHA 4WBCA 4I37A 3RTIB 4Q9PA 3WMVA 1P63A 3FGMA 2KLLA 4I0YA 4H04A 1QXMA 2RQ9A 1Q1UA 4OWKA 4JKXB 3FJFA 3C9ZA 3BA7A 3E8LC 5FNWA 3S8KA 3B9UA 5FZUA 3NBNA 2Q3NB 4J2SA 3WMUA 4DCKC 3H6RB 4ZFWB 4OUJA 1HWPB 4A7ZA 2WRYA 4ZFUB 1PUUB 1W3AA 3ZXGA 2ERMA 2LIEA 3FJAA 3N0KA 4LO0A 3IM6A 2DRYA 3AKHA 5BP5A 4LO0C 1S0FA 2Y9GA 1DJSB 3JUTA 3MALA 3VT2A 5EG6C 1TFMB 1WBCA 2FFVA 3ZC8A 3ZX7A 3O49A 2MC2A 2D24A 3HOMA 2K4AB 4JAWA 5G00A 2Z49A 3FJEA 2M49A 1Q03A 4FGFA 3WO3A 3BX1C 2D20A 4I3NA 1QQLA 4JQ0A 2Y9FA 1M2TB 3CA4A 4LO3A 3UDAA 1S0EA 4TLPA 3RSJA 1JT4A 1L2HA 2GZBA 3FJBA 6I1BA 1R8NA 3FJ8A 3NJ5A 3JRRA 3VEQA 3HMYA 1QQKA 4QALA 1AFCA 4J23B 2VSAA 4LO1A 1IRPA 2VLCA 4P6AA 4HR6C 2NVHA 2RG9B 1T9FA 2IHOA 1S0CA 4L4IA 2D1ZA 4Q9GA 3BAVA 3Q7XA 4I4SA 4G6JA 3HBWA 4GP3A 3AH4A 1G82A 1TWMA 1ONKB 4OWLA 5D61A 4LO2C 4G1RA 3IIRA 3V0BB 8I1BA 1FMZA 1HIBA 2AXMA 4I4PA 4IY8A 3P53A 3OJMA 1XHBA 4ZKTB 4I1BA 3LTQA 1BLAA 3FJ9A 2Y9XE 4F83A 1JTCA 1Z2VA 1RMLA 3VUOA 2Q9XA 1FN0A 1AF9A 3OBRA 1EYLA 4EEEB 1SR4A 3N7KA 3BRGC 1TWEA 5BQUC 1G9BA 4P0JA 1S0GA 1AVWB 3I2XA 4I4YA 1SR4C 1HWMB 4OWJA 4HJJA 1I1EA 1KNMA 3BAQA 4Z8SB 2AFGA 1SZ6B 4I96A 3O4DA 3N7MA 3FUOA 1JLYA 2AAIB 2K43A 1DLLA 4Z9WB 2I1BA 2ZQNA 4USPA 4I4VA 3I2AA 1FQ9A 1Z0HA 4X39A 4IQPA 5EHAA 1CVSA 3ILAA 1XG6A 3PUBA 4GOYA 1I1BA 3IAGC 1YTOA 1AVUA 1TOOA 2F2FA 2KI6B 2NYYA 2FGFA 4I4OA 3P6IA 3BRDA 4ZFYB 3ZC9A 4X38A 3POKA 3PHZA 4P0LA 4CJMA 3D7WB 1HKNA 31BIA 3AJ6A 1YYNA 4DEPA 3NBEA 1N4KA 1K5VA 4OEGA 4IZEA 1W3FA 4G9MA 5BOWA 4I2SA 1NUNA 4ISQA 1IILA 5BP5C 2R9KB 2D23A 4YOLA 3CA1A 2DRZA 2QN4A 2HWAA 1V6UA 3CRHA 4QO3A 4G6MA 3HALA 4KBBA 4ZBVB 2BFHA 2D44A 4XFTA 1Q04A 3CRIA 3KMVA 3OJVA 1PUMB 3NBCA 4I7IA 4AN7B 1R8OA 5DSSB 4J2YA 3V0AA 5HPZA 4Q91A 4ENDA 1T4QA 5B2HA 4LO3C 4QC4A 4XFUA 2KI4A 1AVAC 4ISRA 3WO4A 3N7LA 1IT0A 1FV3A 1ISYA 1V6XA 3CA0A 2ET2A 5DZUA 4IHZA 3VT1A 4JP0A 1EPWA 4KC3A 2BEBA 5BXTA 4J2XA 4LO1C 4KEKA 2Z48A 3ZXDA 4L4HA 2X2TA 2D43A 1MD6A 1PZZA 4IYBA 3BB2A 4ZOTA 5BXPA 3OJ2A 4IZXA 4XFSA 2D7RA 1CE7B 5F8SA 3QYDA 2L5XA 1DQOA 1V6WA 3O4CA 3VT0A 2VSEA 4EKXB 4X3AA 1IJTA 5D63A 2HZ9A 2DREA 2NTDA 1PWAA 2FFUA 3T8SA 3Q7WA 3R4SA 3CRGA 3UD9A 2RSTA 3FJDA 3H6QA 1BFBA 4D8HA 1TTUA 3AH1A 4I8MA 5JLVA 5E24E 4PC4A 4DENA 1J0SA 3TC2A 1BARA 1FWVA 4I1EA 4IY9A 3UJ0A 3V0AB 1AXMA 3A22A 2VU9A 2VUAA 3FJKA 3VSZA 1FMMS 21BIA 2D22A 3I29B 4H9WA 2FO1A 3IM7A 2Y9WC 2ZR1B 4I4UA 3P6JA 1II4A 4JKQA 1S0DA 3UD7A 5JMCA 3NBDA 4QKRA 2HW9A 2NM1A 3BAOA 4LO7B 4OEFA 2D7IA 2MLLB 1G9DA 1DQGA 3AZVA 1RZOB 1ISWA 4I4RA 3O44A 3FJIA 1BLDA 1EV2A 1TIEA 3CAHA 1JY0A 5F90A 1HWOB 2XOAA 5F8WA 2QYIB 3W9TA 1D0HA 1FV2A 2F2FC 4G9NA 2LIQA 3A23A 1XZZA 1G9AA 1AVXB 1GGPB 3CA5A 3EF2A 5I1BA 4GOVA 5D62A 3CA3A 4LO8B 1Z4SA 3A21A 3IM5A 5GAQA 4EFPA 1BFCA 4EFQA 1YF8B 9ILBA 4IONA 3AKFA 4AN6A 1JQZA 2ESUA 1RY7A 1WD4A 1HCDA 3BA5A 4QBVA 2YUGA 3LLPA 3O4OA 3CQAA 1BFFA 2AQZA 3FUQA 1JT5A 4JRAA 3MPPG 1FGAA 1HWNB 2GO2A 3FJCA 2KH2A 4J2KA 5EC5A 3V0BA 1ITBA 2DS0A 3AZWA 2NP0A 3WO2A 1JT7A 1M16A 1PC8B 2NZ9A 1IRAX 4QD2C 3QR5A 3WA1A 3OGGA 4EFRA 4USOA 4JPZA 4FVVA 5BXRA 4D0TA 1TP0A 5F8YA 1G9CA 1YBIA 3O5WB 4HA2A 4XKIA 4LO7C 3V79C 3AKGA 5FZYA 1A8DA 1ABRB 3BADA 4OEEA 5FNXA 2P39A 3RMXA 1IHKA 2IWTB 2WBCA 4QKSA 2VXTI 4R6UB 1IOBA 1HCEA 1JT3A 3VWCA 41BIA 2X2SA 3H6SE 3O4BA 1ISZA 3FJHA 5DVHA 3UD8A 4A7KA 4P0KA 2K8RA 1DZDA 3WINA 1YXWA 2HWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KEIA 5APAA 2W87A 4FPFA 4CP2A 2HWD3 2YFUA 2B46X 4HK9A 5GJ6A 1DZCA 5KHJA 3M3OA 1XC6A 3U0ZA 2Y6FA 2QQKA 4GKXA 4QWNA 1O3RA 4DINB 1SFYA 1JMUB 1Z7S2 4CTEA 1N3OA 1XYFA 3O5SA 3AKIA 3ACLA 4I4XA 2XMLA 4LPLA 5C9AB 3RQ0A 3GALA 3A0NA 3KV4A 4G4FA 4A41A 4AVTA 1JYNA 1BFGA 4QXHA 4C0BA 4LO2A 2YV8A 5CZKA 2ZX0A 3WX5A 4YYOA 3O4AA 3OGFA 1ILR1 4HL0A 3S8JA 2GP5A 4C90A 5FZZA 1DFCA 4XZUG 2FZ1A 2JDNA 1GP6A 4R9AA 4LHNA 2ZGTA 4Q4Y2 4QMAA 4QXCA 4XUTA 4LOTA 3AJYA 4CXYA 1J84A 4JRLA 3ZYBA 1GSLA 1JLXA 1O8PA 5JSRA 3CJIB 1W3GA 1Q8QA 4AQ6A 3AKQA 1BEV3 4YW6A 4BCUA 2R6QA 3NJVA 1SLCA 4LLOA 5LATA 4A7YA 1KEXA 3SNVA 3A4UA 3MF6A 2CV6A 2FHRA 3IAPA 5LASA 4D7TA 2UUSA 2F8XC 1N1SA 1VMFA 2W52A 2RJ2A 2YDEA 2BGOA 3IB3A 4QPGB 2ZEYA 3B94A 3VBOA 3ZFFA 1EV13 2E32A 2W46A 1GV9A 3CF6E 3Q7YA 4M4RA 1FMD1 4ZZ8A 4FAHA 1R082 3LF7A 4HKOA 3ILNA 5BVPI 3IZOA 3K3OA 4H75A 1NKGA 2FDHA 3LE0A 2BJSA 3FJJA 1SHWB 4DXSA 3N7JA 5J37A 2Y34A 5CKMA 3EQEA 5FMDA 3SITA 1F2NA 2XJUA 3LD8A 4Y20A 4CDQB 3WEZA 4YM2A 4D7YA 2X5IB 4CDXB 3RZKA 2MIBA 5FYVA 1CWPA 1ULGA 3WMVA 1CGPA 2OXBA 1W6OB 2UYBA 4Q29A 3T30A 1QY4A 2R042 5A7WB 4CDWB 4XDPA 1C8M3 3C7GA 2KLLA 2A3WA 3CLPA 4MXVA 1YO8A 2W68A 2VZTA 1OC1A 2BZDA 4YSFA 5CKNA 4LHLA 3FJFA 1BLZA 1W39A 3NKTA 3VZLA 1OFSA 2YGLA 2E9QA 3NBNA 2ZEWA 2CAVA 3KV5A 3ACGA 1PNFA 4DIQA 4HKLA 5GZCA 3H6RB 1JZ7A 1SBFA 1YWKA 4M3CA 5IVFA 2VQ0A 3GYDA 2JB4A 5LB6A 3E1F1 3BKZA 1RVF2 1D4M2 5FJHA 2WFPA 3FBMA 2FDFA 3PJYA 4DUXA 1W3AA 2LIEA 2EF6A 4ASLA 3FJAA 1GR3A 4XDQA 4BLJA 2PHFA 1LTEA 1POQA 3H1YA 3M70A 1LGBA 2ARBA 1S0FA 3JUTA 3VT2A 5GZFA 1UXZA 3N9PA 4XQWA 3S7IA 4BJ0A 4P9LA 4RA0A 1NYWA 3MIHA 3GM8A 1J1TA 2XXZA 1AR91 1LOEA 1RUC3 3GCWA 4Q0UA 5AC91 2GN7A 3TEYA 1UF2C 1YQ5A 2MC2A 4JAWA 5G00A 1KJLA 3FJEA 2CL2A 2VCBA 2E7QA 5DDJ2 1POV1 3S5QA 3C3VA 2D20A 1QJY3 2ZGQA 1QQLA 2AREA 5IK4A 3U07A 4WM7B 4OHYA 2PN5A 5LBBA 2X05A 4JDMA 1QJX2 4L97A 3AZXA 3LKJA 4AFDA 3IDBB 2WSUA 1W9TA 1R1A3 3CQOA 3RSJA 1U5XA 4BQXA 6I1BA 5F8PA 3POEA 2GZBA 3OTFA 3RFRA 2VMGA 3KQRA 5BNOC 2HWE2 1OD5A 4KWLA 2PFWA 1BHGA 1W2AX 2J1VA 2UYAA 5FY1A 3V65A 4LHSA 5L9VA 4DXTA 4MUVA 2XJSA 2UY8A 2F6BA 2QQJA 1W8NA 5CADA 3LDKA 2BEOA 4LBOA 5HPOA 2VGDA 1REEA 1UZZA 3BPZA 4LE4A 1PVC1 4EWAA 2F4PA 2WNVC 4UW6A 5DAWA 1E5SA 1S0CA 2A73B 5FZOA 2DWRA 2JJ6A 1TFMB 5DABA 4Q9GA 1SMVA 1S2BA 4P9JA 1W05A 4XBLA 5ACA3 4I4SA 5HCBA 4OVEA 4CUCA 1WA4A 4XPVA 2CY6A 3MPBA 1I3HA 2DCKA 1UY4A 3WDXA 4OWLA 5D61A 4BHPA 4WV8A 4YZ1A 5LW9A 2XBO3 1NUKA 4G1RA 2YHJA 3IIRA 1TME2 2ZGMA 8I1BA 4CCNA 3RYPA 4AI1A 4I0BA 1RUD1 2QTWB 4C91A 5HCHA 1CAWB 4N53B 5FTTC 3B3QE 3N9OA 4DRVA 2WT2A 5FXZA 3VZMA 2DF7A 4ZKTB 3ME2A 5LRRA 4XF9A 2GH2A 5A1LA 3OJBA 1JTCA 1FPN1 4UBHA 5C4WC 3K4AA 4LKSA 4PQQA 1FN0A 1PIV3 2JENA 3C8XA 2VZUA 2QQIA 4Q4X1 2UU8A 3ZIWA 2BRTA 2OZ6A 1SR4A 4EEEB 3BRGC 3G6JB 3M7AA 5FY8A 2AEZA 1NCRA 1UD1A 2B9UA 2HEWF 3IMMA 1C1FA 1W0OA 4IETA 2RM21 4Q4V1 4RYDA 4XJWA 1SR4C 4I4YA 4GALA 3ETQA 1NCRC 4HN1A 2HWC2 4MLOA 4Y3OA 2P5BA 1I1EA 2AFGA 1HLCA 5FZ4A 4DY5A 3N7MA 2WL1A 1AXKA 2DCJA 4Y5TA 2E6VA 3GBFA 3CIHA 1DZQA 2PTMA 3KSCA 5DZGA 5HCFA 1NLSA 2PLV2 3E5UA 1E5RA 2K43A 3PHMA 1UU4A 4HVRA 4W6WA 3VDAA 4Z9WB 2I1BA 3ZSMA 2ZQNA 5FZMA 1VP6A 4I4VA 4QDRA 1AR72 3KWVA 4DXRA 1X50A 3T4HB 4QHOA 4X39A 2UWBA 4OZXA 2JX9A 4CCDA 5SV5A 4MXWB 2ETEA 3FJSA 2ZGSA 1ULOA 1MZ6A 2RE9A 3LEKA 4RS5A 3HJRA 4N90A 5F5IA 1AR81 4FFHA 1LOBA 4OUSA 4RS5C 4LBKA 1TOOA 4HONA 2KI6B 1NY72 2NYYA 2W1WA 1GNHA 5J98B 5CKQA 3P6IA 1FNYA 5B2GB 2RMU1 3WLUA 3J9SA 4ZFYB 2BDRA 4MG2A 1W9FA 5FYSA 3PHZA 4M3CE 4O9EA 4P0LA 1YHFA 2D98A 2CTVA 2WZPP 3D7WB 5I91A 3VL8A 1QOSA 1QOTA 2Q1ZB 2YC2A 4MSVA 1YYNA 4TTGA 3AJ6A 1RMU1 2KR2A 3NBEA 1REFA 5FZEA 1IOAA 1W28A 1S4CA 4GH4A 3VN4A 5FUIA 5JZGA 2Q5TA 3PUQA 1NUNA 4B7KA 3PVNA 4CXWA 2VD7A 1XJAA 1NZIA 1CX1A 4UFIA 5JZGC 5EJ1B 2OQ7A 3FL7A 3K4DA 3USUB 2R9KB 1JXNA 3DKWA 5BP5C 1WBFA 2D23A 1CQ9A 1GZWA 2R32A 2KA3A 3ILAA 2RS31 1WMEA 5HBAA 4YGDA 2J1SA 2HWAA 3WF2A 1LOAA 2VC9A 2IXHA 1H8TA 1AL21 4CEWA 2BNMA 1BQPA 1MS0A 3CKHA 5T3NA 2BFHA 4XFTA 3MW3A 4K3UA 4CEWC 3CRIA 1MPXA 3KMVA 1C8NA 1COV3 3VDCA 1VBC2 4I7IA 3H3ZA 1R8OA 4HFSA 5DSSB 3DKQA 3EO6A 1UNBA 5AVAA 1YC61 4CDUB 1DHKB 4F3JA 1NLRA 4P9WA 5I0RA 4OI0A 2EICA 1DDLA 5FYCA 4Q91A 4ZPIA 3AKPA 4LO3C 4XF1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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