The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
116
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sequence length |
372
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structure length |
372
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Chain Sequence |
MHSQVIAPGFEPVAELFGVFLEQDPDYSAQVAAYHRGVKVLDLSGGPHIRPDSVTGVFSCSKGMAGLVMALLVQDGELDLEAEVVKYWPEFGVEGKSSITVAQLLSHRAGLLGVEGGLTLHEVNNSELAAAKLAELPPLWKPGTAFGYHALTIGIFMEELCRRITGSTLQEVFEQRIRAVTGANFYLGLPESEESRFAQFRWAADPSWPWVDPASHFGLAANAAVGDILDLPNIREVRAAGLSSAAGVASAEGMARIYAAALTGLEGKSAMPPLLTEETIRTVSAEQVFGIDRVFGETGCFGTVFMKSHTRMPFGSYRAFGHDGASASLGFADPVYELGFGYVPQTAEPGGVGCRNFQLSSAVREVIAGFAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure Analysis of Esta from Arthrobacter Sp. Rue61A--an Insight Into Catalytic Promiscuity.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
ESTERASE A
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| source organism |
Arthrobacter nitroguajacolicus
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| molecule tags |
Hydrolase
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| total genus |
116
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| structure length |
372
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| sequence length |
372
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00144 | Beta-lactamase | Beta-lactamase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Beta-lactamase | Beta-lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3ZYT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OON A; 4OQI A; 5I94 A; 2RL3 A; 4R38 A; 5AVE A; 1LL9 A; 3PTE A; 1KOU A; 2JKF A; 2DNS A; 5E2G A; 4U0X A; 4QJG A; 3P98 A; 1O7E A; 3FV7 A; 3LO7 A; 5EM1 A; 1VET B; 5K5B A; 2V20 A; 1STZ A; 5KMW A; 2C5W B; 2HP9 A; 3DTM A; 4IBX A; 2V1A A; 1EI5 A; 3QP4 A; 3V50 A; 3HBR A; 3CJM A; 1PFL A; 2WAE A; 5EPH A; 4OLG A; 3VP0 A; 3G31 A; 1PI4 A; 5F1G A; 2XA7 S; 3IF6 B; 5M1A A; 3S7N A; 3WS1 A; 4KQO A; 3LIB A; 2A2L A; 1N9O A; 3ZVW A; 3EGD C; 1XPB A; 4S2N A; 2M7V A; 2Y2I A; 4GN2 A; 1RGZ A; 4CLC E; 3OZH A; 3D72 A; 3KYE A; 3IX3 A; 3M2J A; 1W7F A; 4EBL A; 1F9I A; 4MMN A; 4DJ3 A; 1RGY A; 1XFN A; 4BMW A; 2HGV A; 4IBR A; 5AQ9 A; 1HLU P; 3PBO A; 3S22 A; 5EOO A; 3PBR A; 4PM6 A; 1ZTU A; 2XD5 A; 3LEQ A; 4DDY A; 4DDS A; 2VK3 A; 3Q81 A; 4R3J A; 3SS3 A; 2OSU A; 3OOV A; 1G68 A; 1MKM A; 4PM5 A; 3EOI A; 3OCN A; 2WKE A; 4K91 A; 4RVA A; 3IH8 A; 2ZQD A; 2PAV P; 2J3T C; 3WS5 A; 3KSH A; 2BG1 A; 1BTL A; 3C30 A; 3QP2 A; 4KQD A; 1P9W A; 4HIA A; 4R23 A; 4O7D A; 2Q9M A; 3GQZ A; 4MLL A; 2V1Z A; 4CLC A; 2XFS A; 2VV6 A; 1XKZ A; 1ERQ A; 3IS2 B; 1Q2Q A; 1W63 Q; 4NXB A; 4DRT A; 1SZV A; 2H5S A; 3UPN A; 4R3B A; 4KZ8 A; 4FSF A; 2HDU A; 3Q7V B; 2Y8H A; 3G2Z A; 3NDE A; 4UQI M; 2WKI A; 4RX3 A; 3UY6 A; 2V0W A; 2LB5 A; 4B88 A; 2XRO A; 3PAG A; 3G34 A; 3KX0 X; 1ERO A; 3LR4 A; 3G30 A; 2WZX A; 1ES2 A; 3FYZ A; 2KOI A; 5E2F A; 2W3D A; 5TFQ A; 4Y5F A; 3GRJ A; 2OWH A; 4O0P A; 5G4Z A; 1NLZ A; 1YT4 A; 3IF5 A; 4PKY G; 2XQZ A; 3HJK A; 5FQI A; 3HLB A; 3UDI A; 4JPM A; 3CG5 A; 4R4R A; 1FCN A; 5EV0 A; 4GDB A; 1ZG4 A; 4Q0H A; 1IKI A; 3QNC A; 4ZBE A; 4E3I A; 3IH9 A; 1QME A; 1YQS A; 3H7W B; 3ZG9 B; 3HUN A; 4ARZ A; 3M6H A; 3EEA A; 5L2F A; 4C6Y A; 4NEE D; 4K08 A; 3ZCZ A; 5M19 A; 1QMF A; 4ETX A; 4HH3 A; 4JKT A; 4OQ0 A; 3DAV A; 5DTS A; 3HRE A; 3OBF A; 3MKF A; 3M2K A; 1KVL A; 5GLA A; 5CTN A; 2X71 A; 3T12 B; 5TR7 A; 1DP9 A; 3A3F A; 1SDN A; 4LEN A; 4M3K A; 4GHI B; 3E4O A; 1S66 L; 1VQQ A; 4Y2F A; 5EVI D; 3DTI A; 1I2S A; 4HH2 A; 1LI9 A; 4I3A A; 4RA7 A; 5LBR A; 5F1F A; 3CI6 A; 1KE3 A; 5HWV A; 4JXV A; 3WS0 A; 1XX2 A; 4WL9 A; 3FPW A; 3HJI A; 4X25 A; 1N9N A; 2QYB A; 1TDG A; 3MJQ A; 1T19 A; 1ZKJ A; 2RCX A; 2H0T A; 2Y2M A; 3PBS A; 4R1G A; 4M4X A; 1J9M A; 4LV0 A; 3B3X A; 1JTG A; 1U60 A; 3PAE A; 3QHY A; 4E3M A; 3BRM A; 4S2L A; 3BY9 A; 3ZG5 A; 5BOH A; 1ZC2 A; 1LLB A; 3HUO A; 2JKR M; 3IWO A; 2L0W A; 4GS9 A; 3BFD A; 1JTD A; 1V9Y A; 4DE0 A; 4GOG A; 4ESP A; 1H5X A; 3LY4 A; 3T1R A; 1H8Z A; 3CUE C; 3MQQ A; 3U4L P; 3DW0 A; 4EQI A; 3B42 A; 3LID A; 3H82 B; 5FDH A; 4EXO A; 2P7J A; 2JCH A; 3HLD A; 3BQ8 A; 4N9L A; 4P6Z S; 1K57 C; 2QPN A; 3GMW A; 1EWZ A; 1MKI A; 5DVA A; 2XRN A; 4LPZ A; 3E4Q A; 2Y2H A; 4GW9 A; 4R0Q A; 4CLC B; 4H6J A; 4EEP A; 3TG9 A; 1K25 A; 1EW0 A; 4GJ4 A; 5DF7 A; 3BY8 A; 5F82 A; 5KZH A; 3F1P A; 2ZC5 B; 1L0E A; 2E8J A; 4UHU A; 2JKR I; 3PHY A; 3MXQ A; 1BLS A; 2HPB A; 2Y59 A; 4OOM A; 3UB7 A; 2XDM A; 3CWF A; 1K4E A; 3BWL A; 2NUT C; 4GD8 A; 1OJG A; 4BBT A; 3N8L A; 4YOF A; 1ESU A; 3D4F A; 3NC8 A; 4EU0 A; 2JE5 A; 4CPK A; 1FR6 A; 4S2P A; 1YLY A; 5CGW A; 1VM1 A; 4PM7 A; 2Y2G A; 4S2K A; 4HEF A; 3H9W A; 4OKP A; 2Q9N A; 3V67 A; 2Y91 A; 4MBH A; 4PHT A; 2JBF A; 2HF6 A; 3VOL A; 5HWT A; 1M6K A; 1GSW A; 4NG2 A; 1YKD A; 2ZLY A; 1CK3 A; 2P04 A; 3C2W A; 5G4Y A; 5TGF A; 3BJN A; 1X0O A; 4DKI A; 4FH2 A; 2Y2Q A; 2G2W A; 5EVI C; 5CHU A; 3SH8 A; 1C3B A; 1K54 C; 3Q1F A; 3ICY A; 1DJC A; 4HJ3 A; 2XK1 A; 3KYZ A; 3IXG A; 1K38 A; 1YLP A; 1YLZ A; 3LFV A; 3L9K A; 1XP4 A; 1RCJ A; 2QHK A; 3LR3 A; 1LSX A; 5AJG A; 4DMZ A; 4EBN A; 4PPR A; 5AQA A; 3FG8 A; 1KGE A; 1MZU A; 3QP6 A; 2PBY A; 3A3D A; 4UEY A; 3LEZ A; 1KVM A; 1W63 M; 1ES4 A; 3HLF A; 3BEB A; 4OOL A; 3TW8 A; 5FQ9 A; 1OTI A; 3TE8 A; 3HUM A; 5CTM A; 2V0U A; 2HV1 A; 3ULF A; 1N9B A; 2C6W B; 3U2A A; 2ZQ8 A; 3ZVT A; 3ZG8 B; 2GJ3 A; 2P74 A; 3R7W A; 3N8S A; 1VEU A; 1FIK A; 2J7V A; 1TS0 A; 3VFF A; 2PYR A; 4ID4 A; 1LHY A; 2J3T D; 4ZJ3 A; 4G3V A; 3B47 A; 1K55 C; 2J3W A; 2R9X A; 5FI6 A; 5HAR A; 4GS9 B; 4WMC A; 4E3K A; 2BLS A; 3G2Y A; 4WUJ A; 1GA0 A; 3MSH A; 4MN6 A; 2W1R A; 3UE0 A; 1DJA A; 4Y0T A; 2Y2N A; 1FCM A; 3IF6 C; 1PZO A; 2EX2 A; 4R70 A; 5F6A A; 3K3D A; 3VOY A; 2O9B A; 3UE1 A; 2JHE A; 5CX7 A; 5F69 A; 4HBT A; 4KG6 A; 3VFH A; 5DFX A; 2Z2L B; 5CED A; 2XA7 M; 4LRZ E; 5GLC A; 2CMN A; 4RYE A; 4KUO A; 4Q0I A; 3DWK A; 4JXW A; 4H6J B; 1GSX A; 1BLC A; 2A24 A; 3BFE A; 1LSV A; 4HES A; 3F1N B; 5G18 A; 1P97 A; 2GDN A; 2OWJ A; 4LFU A; 2H28 A; 2PHY A; 1DRM A; 4GKU A; 1SKO A; 1Z6F A; 3MFX A; 3SS5 A; 1YMS A; 3S7O A; 1ONG A; 2WYX A; 2YKH A; 3ITA A; 3G32 A; 4MDZ A; 4WYY A; 3GR2 A; 2QMI A; 5EOE A; 1CQA A; 3O87 A; 5L10 A; 2OAQ 1; 4JXS A; 2Y2O A; 4KZ4 A; 3Q07 A; 4KQR A; 3T1Q B; 3IWQ A; 1DP6 A; 4JGO A; 3WRT A; 3SOI A; 3PR6 A; 1IEL A; 1OTB A; 1BLP A; 1XA1 A; 1ZG6 A; 2WGI A; 4C3Q A; 5L8M A; 3ZNT A; 4OVD A; 1TF1 A; 3UB9 A; 2VX8 A; 4EBP A; 1K6R A; 1TDL A; 4EUV A; 5L09 A; 2WGW A; 1XGJ A; 2ACG A; 2H10 A; 4G3K A; 1VHM A; 4UA6 A; 2EX8 A; 3BLM A; 1W8Q A; 3NUL A; 4DE3 A; 4JGQ A; 4QWO A; 3MKE A; 3A3E A; 1YLJ A; 4Q0J A; 2VGL S; 4L0L A; 1NZU A; 2L4R A; 4U3T A; 3RXW A; 3QP5 A; 3A0S A; 3P01 A; 4WF0 A; 5HD5 A; 5GL9 A; 1CEG A; 3RH8 B; 2V9A A; 1WE4 A; 5JYO A; 2B18 A; 4OLD A; 2ZM0 A; 4EQ1 A; 4QY6 A; 1XFQ A; 4KZ9 A; 4WLA A; 3T1X A; 1V9Z A; 2ZOI A; 1HTZ A; 4H8R A; 4OPR A; 4EER A; 4LRX C; 4L9E A; 2B95 A; 1LL5 A; 4WEJ A; 3QNB A; 3RJU A; 4IVI A; 4GD6 A; 3O5Y A; 4JF5 A; 5A90 A; 1PWC A; 4I5S A; 2J9O A; 3UN7 A; 5GHZ A; 3R7W B; 3PXP A; 3S4X A; 2Y2L A; 1IYQ A; 1J3W A; 2GNX A; 5CHM A; 4ETZ A; 4Y0O A; 5HWW A; 2UV0 E; 2AVX A; 5A92 A; 1VB6 A; 1XXM A; 2EX9 A; 5FL3 A; 4WEK A; 1CEF A; 5EE8 A; 2PD7 A; 2QJ5 A; 4X68 A; 4HBU A; 3FPV A; 5JYP A; 1MPL A; 4X1L A; 3T1S A; 2DMW A; 5DF9 A; 4FTX A; 4X1M A; 4NKP A; 2O9A A; 5F5Y A; 5IT5 A; 3GV9 A; 1BT5 A; 2ZC3 B; 4P6B A; 3M6B A; 1PNE A; 2E8I A; 2HDS A; 2WAF A; 5FDS A; 4NK3 A; 1S67 L; 4BD0 A; 3SZT A; 2W27 A; 4FH4 A; 3LI8 A; 5HPI A; 2EFU A; 2O9C A; 3HLW A; 4YWZ A; 1KGG A; 3CMZ A; 1LT0 A; 4JLF A; 2VV8 A; 3JYI A; 2PBD P; 3A0R A; 3IWI A; 2A24 B; 5FSR A; 3LIA A; 3ZNY A; 3JPU A; 5FAO A; 3ZFZ A; 1K57 A; 2HJE A; 3G4P A; 3T4S A; 3TRC A; 5GLB A; 3UE6 A; 2MJ6 A; 4KUK A; 4PM8 A; 3V5M A; 3EQU A; 1ERM A; 3PBT A; 2IWB A; 4EV4 A; 4EES A; 2D02 A; 2WKQ A; 1MY8 A; 3ZG7 B; 1XJ3 A; 2ZMV A; 2J8Y A; 1YAX A; 5EFW A; 3W4O A; 3NEC A; 4MN7 A; 3LY3 A; 3UB6 A; 2KX6 A; 4MCW A; 1ES5 A; 2IWC A; 2XSS A; 1M40 A; 1S4S A; 2QWS A; 4DXC A; 5A91 A; 3VSK A; 4UA7 A; 4HNB A; 2IA2 A; 4ZRR A; 2UWX A; 3UME A; 4OQG A; 3A3J A; 4F3L A; 2PDR A; 2Z6D A; 1S4R A; 2IWD A; 4X55 A; 4P6Z M; 4CLC C; 5HL1 A; 1JWP A; 2W3H A; 4WEL A; 4Y7P A; 4KEN B; 5GHX A; 3VOZ A; 2VJW A; 3IHB A; 4N1H A; 2GZA A; 2HP6 A; 3BFC A; 1AWI A; 1YMX A; 4JGR A; 2WGW B; 5E2E A; 1KE4 A; 2EXB A; 2OOL A; 4GCZ A; 4AFI A; 2NUP C; 1ACF A; 4B9O A; 4S2M A; 3WWX A; 4KZ7 A; 4BBU A; 3MS6 A; 1ALQ A; 4WM9 A; 1BYW A; 2V8F A; 3S7Q A; 4FUW A; 4MBK A; 1JVJ A; 4F94 A; 4BLM A; 1CI8 A; 1GCE A; 5EVI A; 1K54 A; 3KSF A; 4KZA A; 4FD8 A; 2G2U A; 4Y15 A; 1A0K A; 5TBM A; 4NXF A; 3ZQ5 A; 2GX5 A; 1G5U A; 2XD1 A; 2VKS A; 2FH5 A; 3UDX A; 5FAT A; 4KZ6 A; 4EW7 A; 4ZJ1 A; 1DJB A; 3MZF A; 2Y55 A; 1S6R A; 1FIL A; 3F1O A; 2P9V A; 4IVK A; 1TS6 A; 1Y28 A; 1MXO A; 3ZYT A; 2KDK A; 4E3L A; 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3MXR A; 3TJZ C; 3ISG A; 1PZP A; 1F5M A; 3E2K A; 4Z1W A; 4DXB A; 3IHA A; 1CI9 A; 3DTK A; 3BM6 A; 5J7E A; 3LR0 A; 2X02 A; 3L7H A; 1IKG A; 5CHJ A; 5A93 A; 3SW1 A; 1YPR A; 5EVL A; 3CAX A; 2INW A; 3LR5 A; 1FSY A; 5GLD A; 2QZ6 A; 5EVE A; 2ZQ7 A; 3GSG A; 3ZHH A; 1PI5 A; 3RXX A; 3T4O A; 3N6I A; 1WYB A; 4WN5 A; 1IYO A; 3DTE A; 1OJ5 A; 5HDD A; 3G6O A; 1D1J A; 3P09 A; 2K2N A; 3LIC A; 2XF3 A; 4E3J A; 5FA7 A; 1YLT A; 3CIT A; 2R78 A; 1PW1 A; 3FKV A; 4QB8 A; 3V3S A; 3BEC A; 1CF0 A; 1TVF A; 3ZG0 A; 2B02 A; 2WZZ A; 2ZD8 A; 3F1O B; 5FQQ A; 2P9V B; 2VGJ A; 1L2S A; 5CEB A; 1NRF A; 4HI4 A; 3E4P A; 3ZDJ A; 4L9F A; 2V1B A; 4KG2 A; 3IBR A; 3F1P B; 3HVF A; 3SH9 A; 2WKR A; 3GVB A; 4LCM A; 5CER A; 3VSL A; 3OC2 A; 3EEH A; 4QY5 A; 2VGL M; 4E6W A; 3P7N A; 5HZH A; 3NOT C; 4NXG A; 3Q82 A; 2VLG A; 2WK0 A; 4G3W A; 4JXG A; 2D01 A; 3G35 A; 4ZDX A; 1DP8 A; 3BW6 A; 5CRF A; 3LIF A; 4Y17 A; 4S2I A; 3C7V A; 3WS2 A; 1UGU A; 2XH9 A; 1N4O A; 4YNR A; 1OTA A; 4O01 A; 4N1X A; 1KE0 A; 4ZTK A; 4EUZ A; 1BUL A; 1WA9 A; 4S2O A; 4X53 A; 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