3A3H | Genus

Total Genus 117

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	117
sequence length	300
structure length	300
Chain Sequence	SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Snapshots along an enzymatic reaction coordinate: analysis of a retaining beta-glycoside hydrolase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDOGLUCANASE
molecule tags	Hydrolase
source organism	Bacillus agaradhaerens
total genus	117
structure length	300
sequence length	300
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1998-02-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3a3hA00

2XVNA 3NSNA 1RPKA 2F8QA 1HJUA 3OA5A 3RIKA 2DH3A 3BCFA 2PC8A 5CXPA 1B3YA 3OZPA 3ZSSA 3DYPA 3W81A 2YA0A 4MJ2A 5IHRA 1J0HA 4JFVA 4PMRA 4KH2A 4QP0A 1E1FA 3ZJ7A 1UWSA 1W3HA 1B9ZA 3QR3A 4QCEA 3TTSA 1UH2A 3A47A 3SUSA 4D6DA 1E0VA 3A6OA 1TA3B 1JFHA 1ODUA 5BXRA 2PBGA 1V6YA 1GONA 5A8MA 1BPLB 1QHPA 1EDTA 4ZXLA 3VIHA 1PZ3A 4TVUA 1UR4A 1GZJA 1B1YA 1XD1A 3VIGA 2CXGA 1W9XA 4IUGA 3SUVA 2GJXA 2DT1A 3OLGA 1V0LA 3U7BA 1DWJM 1OGGA 4B15A 4U3AA 2VCAA 3W37A 4ACZA 5I0DA 3DC0A 1F4AA 1HJSA 4WLCA 4DWSB 1UR2A 3WEZA 4PCSA 2ZOXA 2WHKA 3CUHA 2VTFA 5C8BB 3ARUA 2ZUNA 1BVNP 1V3HA 4GZEA 4EAMA 5HPOA 3T2OA 3VNZA 1UD5A 1E0WA 3TTOA 3WL0A 1H1NA 5E09A 4XB3A 4PMVA 1UKTA 5CZKA 3L4YA 3ARWA 4WJXA 1W2VA 4JL1A 2WHLA 3WD2A 5A8QA 4W84A 2A3CA 5FIPA 1CXLA 1V02A 1V3LA 3MUZ1 1FFRA 3AS2A 2UY3A 2ZE0A 1MFVA 1B3XA 1QNOA 3VIJA 1HJQA 7CGTA 4KRTA 1R7OA 2QHAA 1XSKA 5A6JA 4U5IA 3MSDA 5A2CA 4J27A 4W85A 1C8YA 3EMQA 3WF3A 2VJXA 3TOPA 4B9ZA 2AMGA 2J8GA 5I23A 3SIMA 4HU0A 2DSKA 1IZJA 3PTKA 1UD4A 3UCQA 1E6XM 3K8MA 5JBDA 1LF1A 1PZ2A 1RD6A 2W61A 2VZSA 1VAHA 4P8XA 1OT2A 3EBVA 3G6LA 1V08A 1JZ4A 2XTKA 2BXZA 2YA2A 2DSZA 2Y24A 4HP5A 3VIKA 3GBEA 4E4PA 1OWQA 3O9NA 2YIHA 1V3JA 2GUYA 4WIWA 2DGAA 3AOFA 2WLYA 5A6LA 2VR5A 3A4WA 4D6HA 2WC3A 4PYSA 4UOZA 1LLOA 4LGXA 1QI5A 2WMIA 1S46A 4UQAA 4AZHA 4H8VA 3SUTA 3NDYA 1CXKA 1L8NA 1NP2A 2C0HA 4X0VA 2PF0A 2OSYA 2YL6A 3T2PA 3IANA 3LPOA 1V0MA 1KBKA 2VNCA 2V5DA 2XGIA 1C8QA 3O2LA 1GOKA 1WP6A 5CLWA 3PBGA 1C91A 4P7LA 1W91A 4PTWA 1G9HA 2WC4A 4DUVA 2XHYA 1OGBA 4LYRA 3SCUA 1KGWA 3BCDA 1CGYA 1CIUA 5I5RA 5CSYA 4PMOA 1WZAA 1W3KA 2WNWA 5D9PA 1ZBVA 3VU2A 1WKYA 2W4XA 3GH7A 1ISWA 3A3HA 1AMYA 4DUWA 4PMDA 3CHFA 3WD3A 1VJZA 3VX1A 3AIUA 3OLIA 4CKQA 1UWIA 1LL6A 1BQCA 3ARXA 3FN9A 3N1AA 3WNPA 2A3AA 1KFWA 1H0IA 7TAAA 3FNDA 2CBJA 2Z1SA 2D23A 1NOUA 5ABFA 1TUXA 2ZUMA 4PMQA 4NSBA 2RGMA 3OG2A 1ZL1A 1JYWA 4YN5A 1JZ6A 1BYBA 4PSRA 2GJRA 1E9LA 2WSKA 1M04A 3CGTA 3WNOA 4CN6A 3AHVA 3VDCA 5M5DA 3TONA 3UESA 5I6SA 3CMGA 3M7SA 4FMVA 1DEDA 1HVQA 4F9JA 4FLQA 4AZBA 1BGGA 4FLSA 4L4OA 1NWSA 1U2YA 1D2KA 3HMCA 5FKYA 4MNLA 3PN8A 3W0KA 1BYDA 1CNVA 1Q6DA 4TTUA 3CUIA 5JBEA 2WAGA 4ATWA 4A4AA 1M01A 1GOQA 2UY2A 3GNRA 4U2YA 3CO4A 3JUGA 4PCTA 2CETA 4QLKA 1QNPA 5BCAA 3BAIA 2ZX9A 4U2ZA 4C7DA 5GNZA 3VIPA 3SUWA 1A3HA 1VF8A 1KR0A 3T0BA 1DP0A 4BQ4A 3K4AA 1UYQA 1WDSA 4E8DA 1UD6A 4CCCA 2NT1A 1Q4NX 1ZU8A 4TVCA 5A6SA 4OZOA 1L0PA 1E6NA 4UFLA 2YA1A 2WVTA 3MMDA 3FW6A 2WZHA 2XJ7A 1V6VA 1GOOA 3BAXA 3D5HA 1ECEA 1O7AA 3EMCA 4BQ2A 2QMJA 2WMHA 1CGUA 2J74A 4YHEA 3ARTA 4EKJA 3SUUA 3N17A 1PX8A 4JFTA 5M3WA 1X6NA 5E0CA 2CYGA 3MS8A 5D9NA 4MDPA 3PZ9A 3CBWA 4C7GA 2EXOA 2BHZA 2YL9A 1UH4A 1V3IA 5C70A 1K9DA 4RE4A 2J7CA 3CZEA 4W7WA 1W3LA 4U3CA 2D20A 3F5KA 4F8XA 2A3EA 5DFAA 1HN1A 1LWHA 1ODZA 3CHEA 3NSXA 3AZTA 4P7NA 3GH4A 4TX6A 3A4XA 1W2PA 3WH5A 3WF1A 4TX8A 2ZUSA 2VRJA 3WF0A 3K8LA 4W87A 3DECA 1ITCA 2YL5A 2ZIDA 2MANA 1GVYA 4ZFMA 3WELA 3BSHA 1KWKA 1ZBCA 4WSJA 3CHDA 3AXHA 4URIA 1X1NA 1TR1A 2O9RA 1JZ2A 1QOXA 1GW1A 4KWUA 2ZXQA 2D3NA 2OYKA 2ZX5A 4W88A 1FP9A 2WWCA 2CHOA 4D6EA 2BY2A 4D71A 2JIWA 4MAVA 3SCWA 1K9EA 1JDDA 1FHDA 5IXEA 3PZMA 1AVAA 3RM8A 3ZJ6A 1B0IA 4W89A 1V3MA 1K9FA 3BAJA 2VMFA 3AS3A 2Q8XA 1NP0A 1WZKA 2IXUA 4M29A 1HVXA 1CEOA 1UZ4A 2IXVA 4UFHA 3UG3A 2CBVA 2YJQA 2EPNA 1WDQA 3BXWA 1OSEA 3PZIA 3WF2A 1IV8A 2X2YA 2CITA 3WIJA 4AYSA 3NCOA 1A47A 3VINA 1GOWA 1H5VA 3AMGA 1UQZA 4NRSA 1BG9A 1JF6A 4MNJA 4EK7A 2G4FA 3KL0A 1E0XA 2OWXA 2WLZA 1CXIA 1OT1A 2XM1A 1D7FA 2WPGA 2J78A 1CTNA 3VIMA 3SCVA 1EHAA 1UWUA 4ML4A 3HJEA 3W53A 9CGTA 3OIHA 4AD3A 4J7RA 2CCRA 4HA4A 2BXYA 5EBAA 4WF7A 1UUQA 5BROA 3CZLA 4U33A 2XFRA 3POCA 3MUY1 3QOKA 4H7VA 3WBEA 3L2MA 1FH8A 1UD8A 2IUZA 2BNJA 2WMFA 3WDQA 3SCQA 3L4UA 3CZJA 1BFNA 1V3KA 3WKZA 1XH1A 1VRXA 4V2XA 3AIEA 5HPCA 2WW5A 1WB0A 2X0HA 3N13A 2VX6A 3BLPX 2XVKA 2OYLA 3VMNA 2DSUA 3THDA 4HOXA 5EB8A 3AS0A 3GZAA 4IPLA 1UR0A 4KMQA 3VGGA 1J0ZA 3WMCA 1OIMA 3AIRA 3LPGA 1J10A 1ESWA 3AZSA 4HZ8A 2VURA 3VILA 2G8ZA 3U5YA 4UFIA 2YLLA 1E4LA 3THCA 3J7HA 4HA3A 1ISXA 4B16A 5IDIA 5HNNA 4W8LA 1EQPA 1DTUA 4MB1A 1XH0A 4K68A 2DSVA 1C7TA 5CGTA 5DO8A 3ZM8A 3RM4A 2CESA 2WVUA 3GTNA 1E15A 1OB0A 4DM2A 1DWHM 2VO5A 2EBNA 3T0AA 1EH9A 1H11A 4OOZA 5CPQA 3MUIA 1EOMA 1QI4A 1GOIA 3W6LA 4ACYA 4JAWA 5A8NA 4J3TA 3SCRA 4J28A 3L4XA 1HKIA 4UQEA 2WB5A 1EA9C 3HU7A 2JFEX 3AMCA 4W7VA 1ZS2A 4J3WA 4BF7A 2XFFA 2XWDA 3KZSA 1FA2A 3L4ZA 1JFXA 3KL5A 5LYRA 3WFLA 4AD5A 2NW0A 3ZR5A 4PUEA 4HA1A 4F9DA 3ZMRA 3KEHA 5BXSA 4S3KA 3VD4A 1KBBA 3NUKA 2BVYA 3CZGA 4BS0A 3CLWA 2JE8A 1E6QM 5GNXA 4MPKA 2D22A 1UWTA 1YQ2A 1J9YA 2ZICA 5CSUA 1CENA 3M46A 1HIZA 3WH6A 2NT0A 2VZTA 4AEEA 3VMOA 4YHGA 1CGWA 3IAQA 1EO7A 2W66A 3WUEA 1R85A 3VD7A 5BXPA 3VIOA 4ZE4A 1CBGA 1V6XA 1J12A 3W6MA 1JAKA 3VO0A 5A6BA 1QHZA 2WVVB 2ZX8A 1JZ7A 3AISA 2WMKA 2CBUA 1GPFA 3ZJKA 4CVWA 3VDAA 4AZCA 3A4AA 1R86A 4F79A 4MB5A 3GNPA 3VKKA 4Z2IA 3AZRA 4YPJA 3PZGA 4M24A 4UQDA 5E70A 1HXJA 4UFJA 4GO8A 4M56A 2BHYA 1TVPA 2OWWA 1W1VA 1JYNA 5D8WA 3UG5A 5KZ6A 2ZXBA 1QI3A 4GQQA 2G3MA 3VD5A 2XG9A 4XZWA 3BMWA 4KGJA 2J62A 1GUVA 2VX4A 1MXGA 3GNOA 1AQ0A 3B8SA 1TA3A 4GI8A 1HJWA 3WQ6A 6CGTA 3K4DA 4P7OA 3OGSA 3UG4A 3SCSA 5JIPA 2ZXDA 1PIGA 4BZYA 5A69A 4CU7A 3VDBA 2UWFA 2VRQA 3RMEA 3AMDA 4LYQA 1OBAA 1G94A 2OWCA 4AD0A 4PUDA 3RM9A 2JEPA 4W5UA 4LYPA 1PBGA 1E70M 1MWOA 1QHOA 4DWSA 5LA0A 2BVDA 4M82A 5C71A 2ZXAA 3BH4A 4CVUA 3AI0A 1VBUA 3QHOA 1UR1A 3W82A 2VVNA 1CXFA 4RE3A 4H41A 4HU8A 4LX4A 4GO9A 3BC9A 4H2CA 2DEPA 1DWFM 1KGUA 1B3VA 1CYGA 2YDSA 4AY1A 1V03A 4JIEA 1IZKA 3WH8A 3EDDA 4W8AA 4AEFA 2FH6A 1HP5A 2CERA 4Y7EA 2VR4A 4CU6A 3WDJA 2W62A 4A3YA 2XFYA 1Y7VA 3ARZA 5HDRA 1V6WA 5BWFA 5M17A 3SURA 4UOQA 1CGXA 3AIVA 3SCPA 1E5NA 1EIBA 2EEXA 4J3XA 2ZUVA 3AHYA 2DIEA 4OBRA 1XC6A 2WHMA 1SR0A 4H04A 3KWXA 1BHGA 1E6PA 4S3JA 4HMDA 3WENA 2C7FA 2D3LA 2CKRA 1HJXA 3L2LA 7A3HA 1N82A 4W7UA 1VEPA 1JDCA 1BAGA 1KXQA 1QNRA 4N0RA 4UZUA 1GQIA 2A3HA 2E8ZA 2PWGA 4ZXOA 3N18A 4JFSA 2EPMX 4BQ5A 1GORA 1UD2A 1BVZA 3OB8A 1H49A 1U30A 2O9PA 4UQBA 2PI6A 3UR7A 3TA9A 1E55A 4Q22A 2QLYA 4Z2GA 3WNLA 1JXJA 3M07A 4GIAA 4PBGA 4UCFA 2F2HA 1UD3A 3IK2A 1C93A 1G0CA 1XGZA 3RJXA 1H41A 1JF5A 1BLIA 3WUBA 4W8BA 3T09A 1ZJAA 1US2A 1DHKA 4OIFA 3WL1A 2ZUWA 1UA7A 5A3HA 5A6MA 1UOKA 3QHNA 3ARYA 1CXEA 2E0PA 4WKHA 3I3DA 1LWJA 3W29A 1GHRA 2XUCA 3L4WA 3WSUA 1C90A 4Q7NA 1UR9A 3WH7A 5I77A 3ECQA 2OLHA 4X0NA 1KCLA 3LMYA 1E4NA 1QI0A 4P8UA 4PRWA 1XCXA 3CMJA 3B9EA 3MUAA 1W1PA 1UHVA 2BY0A 1QI2A 3RO8A 1F4HA 4A3HA 3NYDA 3N12A 4P7QA 1ZJBA 1CLXA 4FLRA 1HKJA 1QBAA 3IJ8A 5FL0A 1TFVA 1JGIA 1UQYA 1R7AA 1Q6GA 5I78A 1XCWA 3CHCA 1GNXA 1WNOA 2CKSA 2W91A 2X8RA 3K46A 3PTMA 3VM7A 3WMSA 2V3EA 2BV9A 2VCBA 4BA0A 3S2CA 2BY3A 1XYFA 3N15A 1JG9A 2AAAA 3UERA 5FL1A 5JUVA 1OD0A 3ARSA 2WMJA 2Z1KA 3CUJA 3F5LA 4MJ4A 1UWRA 2J8FA 3IAPA 2CPUA 2WM0A 3WDPP 1XV8A 3GH5A 1X6LA 5ECUA 1TVNA 3QHMA 3E1F1 4ZE5A 3VD9A 1CPUA 1H2JA 3PZVA 5BYWA 1EGZA 3NDZA 1U33A 5JBFA 4BCEA 1VENA 3VD3A 2VI0A 3AYSA 2VX5A 1W9PA 1JNDA 4CCDA 2E4TA 1SYTA 2PWDA 1MQRA 4MAZA 4M8UA 2PWHA 4F66A 2A3BA 4PSPA 4D1JA 3S6TA 3CZ8A 1W9UA 3AS1A 3CTTA 4GZJA 1EO5A 2J7HA 2CIPA 1I75A 2HISA 3VVGA 2QV4A 3MU7A 5EMYA 2NSXA 2QPSA 1G1YA 1EDQA 4H8UA 2QPUA 3F4VA 4KGLA 1Z32X 1C3FA 3PZNA 1SMDA 4GI9A 1CGTA 4P8VA 1ITXA 4DWSD 2VOTA 1HF6A 4AZGA 2GK1B 3ZO9A 4W86A 3I3EA 2XIBA 1VEOA 3WUFA 1HKKA 3BGAA 1M03A 3FXYA 1GHSA 4ATLA 2F61A 3WBAA 4QDMA 3UR8A 4HOZA 4TUFA 2J7GA 1HL9A 1C7SA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3RIL A;  4C7F A;  1XYZ A;  2DT3 A;  4OBS A;  1LG1 A;  5GQB A;  1PX4 A;  4UR9 A;  2XM2 A;  1J18 A;  1VEM A;  3VGB A;  4IPN B;  3NIY A;  3MO4 A;  2W67 A;  4PTV A;  1VFO A;  5DEZ A;  1V6U A;  2DPE A;  1VB9 A;  3VGF A;  1KXV A;  1E43 A;  4MTV A;  2FDM A;  4EAN A;  1HJV A;  1ZBK A;  4PEE A;  4H8H A;  3EDK A;  4IM4 A;  2EJ1 A;  4D6J A;  1TE1 A;  1VIW A;  2FHB A;  4AC1 X;  1EDG A;  3U7V A;  3F5J A;  5AY7 A;  5IFT A;  4RL3 A;  4R5E A;  2W92 A;  2VZO A;  1BF2 A;  5HXM A;  2FGZ A;  3VM5 A;  3EDJ A;  1CEC A;  5CQ1 A;  2BHU A;  3KE0 A;  3CH9 A;  3FAX A;  3BAW A;  5FCZ A;  1WCG A;  1E1E A;  4GXP A;  2Y2W A;  1BYC A;  2DH2 A;  3FY1 A;  4CCE A;  3EMZ A;  4V27 A;  1WZM A;  1E40 A;  3PZQ A;  2WC7 A;  4ZEN A;  3U57 A;  1JYV A;  1H0G A;  2VVS A;  4U5K A;  5GNY A;  2ZWZ A;  1B90 A;  3WH9 A;  1KXH A;  1E6S M;  3IJ7 A;  1MFU A;  5EFD A;  2VZU A;  1NOW A;  1JDA A;  3MAN A;  3TP4 A;  3WQ5 A;  4B3K A;  2O9T A;  3ARQ A;  4AWE A;  1B3W A;  4AW7 A;  2D1Z A;  4BQ3 A;  3AJ7 A;  5CJ5 A;  2WBK A;  3LPP A;  1DWG M;  2GK1 A;  5CG0 A;  2Y8K A;  1QW9 A;  1SFS A;  2V5C A;  6TAA A;  2JAL A;  3WMB A;  1KR1 A;  1WDR A;  1FHL A;  3W24 A;  3VMP A;  3DHU A;  1J0K A;  4PMU A;  1TMQ A;  2GSJ A;  2J79 A;  3OGR A;  4L4P A;  3HN3 A;  1KQY A;  3NSM A;  1RP9 A;  1KGX A;  2GJX B;  3SEP A;  4R27 A;  4W93 A;  5DMY A;  4UQ9 A;  3O6A A;  1EQC A;  4ACZ B;  4CD4 A;  2V38 A;  5M03 A;  4HPH A;  5AYB A;  3SCO A;  5KEZ A;  1JNE A;  2YBU A;  4XZB A;  4PMZ A;  1TZ7 A;  3QGV A;  2GFT A;  3CPU A;  4QLJ A;  4AXN A;  2E9B A;  2X09 A;  4AD1 A;  1P6W A;  4LPC A;  4P8W A;  3W38 A;  2UY5 A;  1RH9 A;  2BY1 A;  1YHT A;  1BSI A;  4CD6 A;  2ESC A;  1G01 A;  4AZC B;  3BAK A;  4OJY A;  1E71 M;  1JL8 A;  4XUY A;  3WDR A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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3A3HA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations