3AHY | Genus

Total Genus 187

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	187
sequence length	465
structure length	465
Chain Sequence	MLPKDFQWGFATAAYQIEGAVDQDGRGPSIWDTFCAQPGKIADGSSGVTACDSYNRTAEDIALLKSLGAKSYRFSISWSRIIPEGGRGDAVNQAGIDHYVKFVDDLLDAGITPFITLFHWDLPEGLHQRYGGLLNRTEFPLDFENYARVMFRALPKVRNWITFNEPLCSAIPGYGSGTFAPGRQSTSEPWTVGHNILVAHGRAVKAYRDDFKPASGDGQIGIVLNGDFTYPWDAADPADKEAAERRLEFFTAWFADPIYLGDYPASMRKQLGDRLPTFTPEERALVHGSNDFYGMNHYTSNYIRHRSSPASADDTVGNVDVLFTNKQGNCIGPETQSPWLRPCAAGFRDFLVWISKRYGYPPIYVTENGTSIKGESDLPKEKILEDDFRVKYYNEYIRAMVTAVELDGVNVKGYFAWSLMDNFEWADGYVTRFGVTYVDYENGQKRFPKKSAKSLKPLFDELIAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis pubmed doi rcsb
molecule tags	Hydrolase
source organism	Trichoderma reesei
molecule keywords	Beta-glucosidase
total genus	187
structure length	465
sequence length	465
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date	2010-05-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3ahyA00

4IPLA 2GVYA 1E15A 2C0HA 4GZEA 2AMGA 4QFUA 1KBKA 1W9PA 4B9ZA 1H2JA 5HBFA 4H8HA 4HPHA 4V27A 2C8NA 3ZIZA 3GH4A 1CTNA 4DUXA 2E9LA 3I3BA 5IFTA 3ZJKA 1V0NA 4PTVA 1FOBA 2FH8A 3W25A 2YLAA 1BQCA 4HU8A 3KZSA 5BXPA 2WKLA 2CBUA 5BCAA 1JZ4A 2D0HA 1CZ1A 1E3XA 2BNJA 4U33A 2GJXA 3W26A 3AXHA 4RE2A 4P8VA 2GDVA 3T0BA 2WWDA 1ISYA 2PWGA 1KCLA 1UD3A 2D23A 4WSKA 1FH9A 1KXVA 3OB8A 5JUVA 1J0KA 4HP5A 1PJ9A 1M04A 2XVLA 1XCWA 3K4DA 1CEOA 2DSVA 1BGAA 4DM1A 3AXXA 1VEPA 3AIBA 1ODUA 4F8XA 2ZXDA 3AIRA 1UR2A 4Q7NA 3WL0A 4MNKA 2DSUA 2XIIA 2E4TA 2AOSA 1NARA 5FL1A 2YOCA 3WNLA 4PMDA 1EHAA 4AD4A 4Z2LA 1PEZA 4AIUA 5GNXA 1R86A 1OIMA 1J9YA 1UR8A 2PI6A 4MAZA 5D8WA 4ZXLA 3W29A 1LG1A 1IT0A 5A3HA 1UH2A 3RDKA 3SCRA 2BV9A 3WD3A 4X0VA 3W37A 1B3WA 2G3IA 1KR1A 1SMAA 1XV8A 3WFZA 1WB0A 2D22A 2BXZA 4GI8A 3ZMRA 1JFXA 3AHVA 3F5JA 2F2HA 5AC4A 3VIHA 2PWFA 1W3LA 5F7UA 5CQ1A 3AMGA 5LYRA 1L8NA 4U5IA 3L2MA 3N13A 3ARRA 3WD4A 2J25A 1GVYA 1JAKA 1LG2A 3WBAA 4BQ5A 3WMBA 4QDMA 2D20A 1MXGA 4HOXA 3WIJA 1JD9A 2Y8VA 4MB5A 1D2KA 4M81A 2CETA 5HDRA 1EOKA 1KWGA 1I1WA 2WLYA 3CPUA 2WMGA 4LGXA 1QI4A 2JIWA 2WMHA 2ZUNA 2WW5A 3OG2A 5A8PA 3BAJA 1C8XA 4RE3A 3DYPA 1GPFA 4HZ7A 4HOWA 2E40A 1GQIA 3LPOA 4CN6A 3HJEA 3OGRA 3GXDA 1BTCA 4ZFMA 1H49A 4AZIA 1MVYA 2QPSA 1NOWA 1M01A 4JIEA 3EMZA 1MW0A 3O9NA 1GOQA 3CUFA 3VNYA 2XSAA 2FGZA 4AZCB 1HN1A 1BFNA 1E6SM 1RH9A 4FF5A 1TFVA 2J62A 3CGTA 5BROA 5I79A 1GOWA 2XPKA 1XGZA 1G94A 1AQHA 1NP0A 4UFKA 3A4WA 1NOFA 3CHCA 4C7GA 3SCOA 4W7UA 3VD5A 3FW6A 3L4XA 3VO0A 3WNOA 1YHTA 2W61A 3WBEA 5JBEA 2DH2A 3VPLA 1E72M 1HVQA 5HNNA 1M7XA 5AY7A 4E4PA 1ZBWA 1JYVA 1WO2A 3BLKA 3RCNA 2J7GA 1H4PA 4U2YA 3N15A 2ZICA 4IPNB 1UWIA 2OWCA 2FH6A 3ZOAA 3T0DA 2EPLX 1ISZA 4TUFA 4D1JA 2X05A 1XSJA 3QGVA 4MDPA 3VGEA 4PTXA 2FHFA 1HJQA 3WMSA 1QNSA 2J74A 3D5HA 3GXFA 1J10A 1BPLB 5E6YA 4M24A 1D7FA 3VNZA 3T08A 2J78A 4D6DA 1QI5A 3FY1A 4AZCA 1CWYA 2WNWA 1UA7A 3OLDA 4N42A 4R5EA 2V3DA 2YA1A 2VX5A 1WDPA 3BMVA 3WH5A 1G1YA 4PRWA 2UY2A 3EDFA 4QLJA 3PZGA 1E1FA 5I78A 1NP2A 1GHRA 4D6GA 1ESWA 4HZ6A 1ZBCA 3PBGA 3OLGA 3SUSA 2EPMX 1B0IA 4AD3A 2WMFA 1MW1A 1Q6CA 5A6AA 2QF8A 3AQUA 3VMNA 3VD3A 4P7NA 3U5YA 1CXKA 5KEZA 4HA3A 1B3XA 1GOOA 3QOKA 3NSXA 3VIKA 4P7RA 3N11A 2ZX9A 1V3JA 3DECA 3FAWA 1OGBA 4PMVA 4RL3A 3RJYA 2OWWA 2XVKA 3BCDA 2WC7A 4QCFA 1VAHA 5D9PA 1VF8A 2UY3A 4D6JA 4PUEA 1US2A 3IANA 1W1YA 3RM8A 3ALFA 1MWOA 6CGTA 1SR0A 1UYQA 2FDMA 1US3A 4E2OA 4CVWA 4JKLA 1K9FA 3RO8A 1QNPA 3MUAA 1VEOA 4UZSA 1JXJA 4D6CA 3I3EA 1HJUA 3VUPA 2PB1A 4NZCA 3RM4A 2WK2A 4X0NA 3POCA 5BRPA 1E0VA 2CBIA 4B16A 3RJXA 1C7TA 1RP9A 1XSKA 1HVXA 5IHRA 4C7DA 3POHA 1OB0A 3HMCA 2F61A 2XWDA 4TTUA 1JZ2A 3SCPA 2ZUUA 9CGTA 4W5ZA 5CGMA 4HOZA 1W1VA 3WDJA 1U2YA 3CZLA 1E6RA 2VRKA 1O6IA 3BSGA 3K46A 4HMEA 1H5VA 1J0ZA 2WMJA 2ZX7A 2J47A 2DGAA 1HKMA 1BYDA 2BHYA 2VCCA 1JDAA 2ZUMA 3GNOA 3EYPA 2IUZA 5GNYA 3B9EA 5BXSA 2IXUA 5D8ZA 3BC9A 4NRRA 4MTVA 1QNRA 1J18A 4D6HA 2WMKA 3CUJA 1E9LA 3FAXA 3N9KA 1M53A 4GZIA 3W82A 1LQ0A 2WLZA 1MW2A 2XM1A 5FIPA 2D3LA 2G4FA 4ACZB 2E9BA 1CLVA 3WDHA 1OM0A 1GOMA 3KL0A 4DWSC 3CHDA 3L4WA 1ECEA 2V5CA 3TA9A 3ZO9A 2WZEA 2XGIA 4Q22A 2HISA 4W8AA 4W86A 4XB3A 1A47A 4TVCA 1UKQA 1E6PA 4J7RA 4L4PA 1VBUA 1GCYA 1DP0A 3CH9A 3MMDA 1E0WA 5CSYA 1WE5A 3WY1A 3IJ8A 2WZHA 4NSBA 1UKSA 3PZ9A 4UNIA 1BAGA 5DT5A 1VFOA 1JZ8A 2Z1SA 5E6ZA 3W6MA 3II1A 1J11A 1OCQA 4YHEA 3MKKA 2O9TA 2O9OA 3NJ3A 1WNOA 1CPUA 4UTFA 8CGTA 2CEQA 1UR9A 2D0GA 2J77A 4W88A 3NYDA 1HP5A 4UQBA 1JZ5A 1XD1A 3THDA 2V38A 4FLSA 4LXFA 2G41A 1JNDA 4ACZA 3ARUA 1OIFA 3WQ6A 2WAGA 2G8ZA 3A6OA 5AYIA 1OGSA 1A3HA 2X8RA 3SCSA 5A6SA 1BG9A 5A6LA 4FMVA 1WKYA 4ML4A 1DWAM 5CJ5A 4Y7EA 1LJYA 4AXNA 2F8QA 3VIOA 3ZR6A 5A2BA 4U31A 2EPNA 1WP6A 4AZGA 3WQ8A 1RP8A 3L4ZA 5D9NA 1UWSA 4CUCA 1ITCA 1XYFA 2DSKA 5E70A 4CD7A 2CBJA 5E0FA 1JZ3A 3ZJ6A 5I23A 1ZL1A 2B31A 2WXDM 5LA0A 1H09A 4MADA 1VBRA 1E5JA 4FLQA 4D72A 3M07A 1C92A 2DH3A 2W67A 2VZUA 2WC4A 3MANA 1TE1A 2AAAA 3WUEA 2WWCA 3HU7A 1JYWA 2WC3A 3IAPA 3MV11 4LYRA 2CIPA 1MW3A 5EFDA 1X6NA 2XM2A 4PEEA 1W9UA 1H11A 1SFSA 4AD1A 3VILA 5A2AA 4TTGA 2BXYA 2VQUA 1E4MM 1V03A 4HTYA 3O2LA 3UG5A 2BFGA 2QHAA 1E1EA 2E8ZA 1BYBA 1GOIA 4P8XA 4WK9A 3NIYA 3U57A 4GO9A 2WYSA 4WF7A 4AIEA 3VD7A 1E56A 2XVGA 3ZJ7A 4M1RA 4OIFA 4AMCA 3KE0A 1PIGA 2D2OA 2CYGA 2XJ7A 2WSKA 4TXEA 3B9AA 3QHNA 4D6EA 1U30A 2VMFA 1EOMA 2ZUVA 1J0HA 3VMPA 1CGXA 1UD2A 5I6SA 4AIOA 3WUBA 3VIIA 4V28A 2EPOA 4X9YA 1E70M 3AIUA 4AISA 3AS2A 3AZTA 1M03A 3WD2A 1AVAA 1KGWA 4UQ9A 3PN8A 5A69A 4QAWA 1VFFA 5JIWA 5E09A 1EO5A 1QNOA 1DWJM 3N12A 1RD6A 4V2XA 1W2PA 1W1TA 2OSXA 3QHMA 2VZTA 3SCNA 1QI2A 1PZ2A 4L4OA 4AZ7A 1R87A 1MQRA 3DC0A 3PZMA 1W3HA 5BYWA 3CO4A 4BS0A 1JZ6A 1LLOA 2NT0A 2DT3A 3GH7A 3SIMA 2NSXA 4B3KA 2WHLA 5HXMA 2BVDA 2MANA 4OJYA 2CBVA 3GDBA 1UR4A 4JZ5A 3THCA 3L4VA 1UA3A 3L4TA 2OSYA 2WCGA 3WNPA 5A94A 3VD4A 1E73M 3IK2A 4TVDA 3WQ5A 3BCFA 2DT2A 1KGUA 3NSNA 3U5UA 1C90A 1MQPA 3GNRA 3EDEA 1QVBA 2VZSA 3VTRA 2YL9A 1C8QA 4Z2JA 5DF0A 5ECUA 4WIWA 2RGMA 3MMUA 3WH9A 3WF0A 3T0AA 4OKDA 5CPSA 1BHGA 2YBUA 3AIVA 2QMKA 2EBNA 3JUGA 2X0YA 3PTKA 4XZBA 4M29A 4CU8A 1DWIM 1V3LA 1CGYA 4F66A 3B9DA 1Q4NX 1XRVA 1JYXA 1JG9A 1P6WA 2ZWZA 3LMYA 3DHUA 3E1F1 2VL4A 3FNDA 2D0FA 5M17A 2Y24A 2ZX8A 5LA1A 3NDYA 1UKPA 2VJXA 4D71A 1UHVA 4AWEA 2A3AA 2E0PA 3W38A 4A4AA 3CHFA 5ABGA 1E6NA 1DWGM 3WF3A 2J7BA 3AS0A 4JFVA 3CTTA 3MUZ1 1CDGA 5D4YA 2BVTA 4JHZA 1VFUA 4JFWA 3PZQA 3W24A 2A3CA 1HJSA 1W9XA 2ZUWA 3PHAA 1C3FA 1PPIA 1UUQA 4KGLA 2GK1B 1VRXA 1QHOA 2A3EA 3AXIA 1V3HA 3ZSTA 2BVYA 4QLLA 4PMNA 1E6QM 3VGFA 4EKJA 2XFRA 3RM9A 4ZENA 2WBKA 3OZOA 1KB3A 5CLTA 4M80A 3W0KA 2XWEA 3GBDA 1CENA 3SUVA 2ZXQA 1UWQA 1GW1A 4LQ1A 1JF6A 2VZOA 3F5KA 4WLCA 1DWFM 2X2YA 3AHXA 4AYSA 2VUYA 2ZX6A 2VRQA 3WF1A 2A3HA 3MO4A 3CLWA 2Y8KA 1V6VA 2J7HA 1V08A 3BAXA 3NSMA 3A3HA 3ECQA 5A1AA 3I3DA 1TMQA 2YLLA 1I1XA 1GHSA 1E40A 2G3NA 2JALA 4KRUA 3VIMA 1OD0A 3CZEA 2W92A 4BCEA 2QLYA 4TX6A 3GH5A 3VMOA 1Y7VA 1J0JA 4NRSA 3T2OA 1G5AA 2ZXAA 3PZVA 3K8KA 2YBTA 3VKKA 3ARPA 1W9DM 2GK1A 4MNLA 3VGDA 2JIEA 2VC9A 5A8OA 1FHDA 1LL4A 2VZVA 4A3HA 3WKZA 1L0PA 5A8MA 5CGTA 4GINA 3WQWA 2JFEX 1O7AA 4JHOA 1NH6A 2ZIDA 2XTKA 1GQJA 3AJ7A 1DWHM 1WCGA 3AZRA 4OBSA 2VX6A 1JXKA 4PUDA 4MNMA 5DMYA 4PN2A 2V3GA 4P7LA 4W93A 1ZU8A 2J8GA 3W28A 4UQCA 4J28A 3VX1A 4A3YA 2WVSA 4JFSA 4TOQA 1NWSA 2GDUA 1B2YA 1V0MA 2DT0A 2UY5A 3A4AA 4MB4A 3UR7A 1VFMA 1EQCA 1HJVA 2EQDA 3MSGA 2J79A 3MUIA 1R8LA 1S46A 4ATDA 2WZIA 2VVNA 1BVNP 1UR1A 2X09A 3ARSA 1LWHA 5I0DA 2BS9A 1CECA 3NCOA 1FH7A 4B9YA 2Z1KA 1F4HA 3OLEA 1NQ6A 2YL8A 3B8SA 7A3HA 1CXFA 5EFFA 2WPGA 3AOFA 1KGXA 2XSBA 4W8LA 3PZUA 4E8DA 5HPOA 2ZE0A 1CNVA 3ARTA 4NF7A 2FGLA 2JF7A 1MQQA 2CKRA 4LX4A 4AZ6A 4WKAA 2ZXBA 3OGSA 3SCWA 4GQRA 2O9RA 5A8QA 1PX3A 4XX6A 3WNMA 3TTSA 1QI3A 3ALGA 1QBBA 4CD6A 3W4RA 3WN6A 1NWTA 2W63A 2CXGA 4W7VA 3BMWA 2EPKX 2VCAA 1N82A 4WKHA 1OT2A 3NDZA 3ARXA 1UQYA 1ISVA 4BQ4A 2W4XA 2E9MA 4CU6A 1BG4A 1EDGA 1QOXA 1G9HA 1B31A 1IZJA 3BSHA 1B90A 3WMCA 3FXYA 4BZYA 1PAMA 2XVPA 4U3AA 1H3GA 1B9ZA 2VRJA 3OZPA 2D1ZA 4H2CA 5D9MA 1UZ1A 4JFUA 3AIEA 2WHJA 1XCXA 3DYMA 2VX4A 1QHPA 2DSZA 3OLIA 2A3BA 3WENA 4RE4A 4DUVA 4N0RA 3TP4A 4PMXA 4HA1A 3FHAA 1KR0A 1E0XA 1V02E 2D24A 3L2LA 3AYSA 3F4VA 3SUWA 3UG4A 1V0KA 4KRTA 4TVUA 3UETA 4GZJA 2V5DA 1UWTA 5CPTA 1R85A 1B30A 3WUGA 3W53A 4J3XA 4OZOA 3WL1A 3WFLA 3GBEA 3UCQA 3PTQA 4EAMA 3SUUA 1J0IA 4C7FA 2DT1A 1CGUA 4JL2A 3VDHA 1GQKA 4E8CA 3ZM8A 2VI0A 5I2UA 1ZBVA 3PZOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3AHYA

Total Genus

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Chain Sequence

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