3AMCA

Crystal structures of thermotoga maritima cel5a, apo form and dimer/au
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNEPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGEFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSWAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Diverse substrate recognition mechanism revealed by Thermotoga maritima Cel5A structures in complex with cellotetraose, cellobiose and mannotriose
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 130
structure length 308
sequence length 308
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2010-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3amcA00
3UG3A 3ZJ8A 1JD9A 5A2AA 1AQMA 4PTWA 4IPNB 1W91A 3UETA 4CCEA 1MFUA 2VX4A 4UFHA 2JF7A 3WUEA 4BA0A 1V3KA 5FL1A 3ARTA 3ZIZA 2ZUNA 4DUXA 3CBWA 3W25A 3K8KA 1W1YA 3A3HA 1RP8A 1NQ6A 4PTVA 3W6MA 3CZKA 5A8NA 1V0MA 3ARPA 1WP6A 2WB5A 2RGLA 1ZU8A 4PSPA 2WC3A 3UG4A 1J18A 1WDPA 2A3CA 3HMCA 1CXEA 1M04A 3DYMA 1EXPA 5A6BA 4F66A 1KGUA 5I24A 4UR9A 1TA3A 1Z32X 2VT0A 2WNWA 3L2MA 2FHFA 5GPRA 2W5FA 1BTCA 1UD6A 4LYQA 1QI5A 1UD8A 3VVGA 1XV8A 1XCXA 1VENA 2FGLA 2G3JA 1HJWA 4M29A 2WKGA 4U5KA 4BQ3A 4C7FA 1OGSA 1E55A 4QCEA 3THDA 3LMYA 2V3DA 1H0IA 3BLKA 2EPOA 3VIFA 1UZ1A 2VZTA 2X8RA 3VGDA 5HXMA 1ZBWA 1MVYA 1V6UA 3MUZ1 2PWHA 2F61A 2Y2WA 4RE4A 3VD9A 1E3ZA 1X6NA 1XGZA 3WL1A 3W28A 1ZS2A 5HOSA 4Z2GA 4Q22A 4F79A 2D24A 3VDCA 4AD5A 3CZEA 5A95A 3W27A 4MAVA 5CGTA 4YPJA 3ARZA 3IAQA 2PWFA 3VX1A 2G3IA 1K9EA 4JCMA 1I75A 5BRQA 1ISVA 1ESWA 3W82A 1ISWA 1VFFA 3RM4A 4HZ6A 3OA5A 2G3NA 4HP5A 3UEQA 1UWRA 2CPUA 4GXPA 4YHGA 5CZKA 3BAIA 4H8VA 3SUWA 4UOJA 1LL7A 1W3LA 2RGMA 3CMJA 4HZ7A 4ZE5A 3HU7A 5CJ5A 6CGTA 1H4PA 2WSKA 5KZ6A 1JAEA 4PBGA 3FN9A 1Q6EA 1XSJA 2CIPA 3W53A 4J3WA 1V6WA 3VMPA 3KEHA 5D9MA 2ZE0A 3AZTA 3MUAA 5FKYA 3MMWA 1U2YA 1CXKA 3SCOA 3VINA 3CPUA 5ABFB 2DT1A 1ZJBA 1AMYA 2QF8A 4ATWA 4XUYA 1J10A 4DUVA 1JZ8A 2WHMA 1UR9A 2WCGA 3SCVA 1FH7A 1BLIA 4JL2A 1B90A 2VVNA 1W2VA 1JFXA 2FHCA 1JZ7A 3CUJA 1VFUA 4H8HA 4UTFA 1FFQA 3AIEA 3ZSSA 1JD7A 4ZXOA 5HPOA 2C8NA 4FLRA 4P7OA 1CXLA 3CZJA 4HTYA 2XGIA 2VVSA 3CUGA 2XHYA 2D3LA 2WBKA 2UY4A 2ZX8A 1WZMA 1NP2A 1WDSA 3N12A 3AMLA 4ACZB 1CXFA 2DPEA 1E0VA 3OZPA 1S46A 3U7VA 4EANA 1KR1A 4MJ2A 1B1YA 1V08A 3PBGA 3RDKA 2ZXAA 5AY7A 2CHOA 4QAWA 1G94A 3AIWA 1Q6CA 3BMVA 2BS9A 4W84A 4AY1A 4D72A 1ISXA 2HVMA 5DO8A 1LLOA 2ZIDA 1K9TA 4X0VA 5IFTA 1BYBA 1FP9A 2DGAA 2VI0A 1EH9A 1E9LA 3AZRA 5AYBA 1LL4A 4IISA 2J74A 3BAKA 3T2PA 1ECEA 1LF1A 3KL5A 1MQPA 2EPNA 4UQ9A 1GW1A 2WVVB 4TTUA 1UZ4A 3ZJ6A 5JBEA 1Y7VA 3PTMA 3VGHA 5TD4A 1E6NA 3AIRA 1ITXA 3A47A 2VCCA 3OGVA 1FHDA 1B3ZA 1HKMA 2WLYA 2Z1SA 2XVPA 4UQBA 2VQTA 4OOUA 4W85A 4D6FA 2JF6A 3ARSA 1VEPA 1V02A 2WHJA 5C71A 2WMKA 1UKSA 1NWSA 1XRVA 2E40A 5DT5A 2ZX5A 3CHFA 4ZFMA 2WAGA 4PEEA 3TTQA 1MFVA 5FD0A 3S2CA 3ZO9A 3EDJA 1DWGM 4AZ7A 3AXHA 3GYCA 3O9NA 5HDRA 4EKJA 1XYFA 1U33A 2WZHA 2ZX9A 3AIUA 2CBJA 2G8ZA 2WANA 2GJXA 2XJ7A 4GQRA 4H7VA 3EDFA 4W8BA 4Z2KA 5ABEA 3VGFA 1EOMA 1V3LA 3MMUA 3FNDA 5JBFA 3SCPA 4MTVA 1MQRA 4NRRA 4B16A 3PZTA 4M8UA 2VX7A 2D0HA 3D3AA 3S6TA 1TVPA 3ARQA 3CGTA 4P8WA 1VJSA 3SUVA 4PCTA 4DWSD 1NWTA 2VX5A 3W0KA 2JEPA 1JNDA 3A4AA 3L4UA 5IHRA 4CU8A 1JZ3A 3WH6A 1WNOA 5BWFA 1NWUA 4LX4A 1NOUA 2CYGA 4JIEA 4BQ2A 2ESCA 1C8XA 2WMFA 1TVNA 2YOCA 2CBVA 4M80A 1GPFA 3LPOA 3IJ7A 4GPNA 5I3DA 3VIPA 1MXDA 2AMGA 4GI6A 2ZUTA 1WO2A 4TXEA 3GNPA 1JZ4A 3AXIA 4Y7EA 5A8MA 4UCFA 1E6QM 1XH2A 3VM7A 1RP9A 4W87A 2OWCA 1JYWA 4ML4A 5C8BB 3WQ5A 3EBVA 2YJQA 1GVYA 5E0FA 4GIAA 1XH1A 3ARWA 4DWSB 4PSRA 2VCAA 4JKKA 4TVUA 4PMRA 3T08A 1CXIA 3N11A 1UQYA 1KGXA 1VBUA 4AEFA 3ZJ7A 3VKKA 3BAJA 3EDEA 3ZSTA 1JGIA 2CITA 4IUGA 1M7XA 2NW0A 1HJUA 3K8LA 5GNZA 4J3SA 5I6SA 5ABHA 3N17A 1H0GA 2OYMA 5BXRA 5M17A 4ZEPA 3VNYA 4DM2A 1HN1A 2W4XA 4OIFA 1PZ2A 1JI2A 1HIZA 5BXSA 2UY5A 3F4VA 4WKHA 3AHVA 3CHDA 1GOIA 4HU8A 4JFTA 2YDRA 4JFSA 1KXQA 2DH2A 1XCWA 2WC4A 3WDHA 2VL4A 1HJVA 2Y8KA 4ACYA 3SCUA 2ZUWA 3U5UA 1VFOA 3VDBA 5IDIA 2W61A 4A3YA 3ARVA 3VIIA 2XVNA 1UH3A 1I1XA 4U2YA 2ZWZA 5D4YA 1EA9C 2UY3A 1J01A 1QHZA 4GO9A 3VTRA 1IZKA 4AIEA 2XTKA 2CEQA 5A3HA 1O7AA 5GNYA 5BROA 1JZ5A 1BHGA 1WE5A 2Z1KA 1GVIA 1MW3A 2X0YA 5I77A 1FOBA 2G41A 2YA0A 2ZXQA 4LXFA 3W81A 1GONA 4CU6A 3WD3A 2NT1A 1UQZA 4OUEA 4J7RA 1UHVA 1EDGA 2J7EA 2X1IA 3AROA 4BQ4A 1EQCA 1TA3B 4QDMA 4CKQA 1SYTA 3GH4A 2VRJA 4AD4A 2WKLA 2ZX6A 1K9FA 3PZVA 4FK9A 1BG9A 2DH3A 5CLTA 5BXTA 1C3FA 2DSUA 2J77A 3AS1A 4J3TA 4HPHA 3B9AA 5CPQA 8CGTA 2E9BA 3ZT7A 3WF0A 3WF1A 4D6JA 5F7UA 5M03A 3L4TA 4M56A 4CN6A 1VEMA 3SCQA 1B3VA 2JE8A 3WF3A 1VBRA 2J7BA 5DF0A 4AYSA 3BSHA 1EHNA 3A4WA 3GH7A 4N42A 2YKKA 1E3XA 2VZUA 4KRUA 4UOQA 5AYIA 3GBEA 3RJXA 3GH5A 3W6LA 1EO7A 3VGGA 3CUIA 3PTQA 4LPCA 1W9BM 2A3BA 2A3EA 2BVYA 3MANA 4OJYA 4JKLA 1DP0A 2WMGA 1KBBA 5GQBA 1WB0A 2PI6A 2VR4A 2V3FA 4PYSA 4GI9A 1G1YA 1CWYA 2J8GA 4K68A 5E70A 4C7GA 3MMDA 4ZE4A 1J11A 5EBAA 4D6HA 4TVDA 3GM8A 1OINA 4UFMA 1J0KA 1SR0A 2CKRA 5I79A 3NDYA 1CGXA 4E8CA 1G0CA 3VOCA 2WMIA 3APGA 1BGAA 3FW6A 3OB8A 1ISYA 5CPSA 4PTMA 3K8MA 1OB0A 2GUYA 4AIUA 1AQHA 5I0DA 1ISZA 1PAMA 3WNNA 1OBAA 3FHAA 3VM5A 1RH9A 1XD0A 2B31A 4ATLA 4E4PA 3VIMA 1K9DA 3T0BA 1JXKA 3QHOA 1E56A 4URIA 2D20A 3AYSA 2CKSA 3WDJA 3AS0A 1TR1A 4B9ZA 1HXJA 5I2UA 1W2PA 3RILA 4AZIA 2BHYA 1BG4A 1LQ0A 1E1FA 1B9ZA 5CXPA 5E9AA 4U2ZA 1A3HA 4PUEA 2BNJA 1MQQA 4R5EA 2OSXA 2JALA 2OWXA 3A4XA 1GOKA 2DSZA 2YL5A 3WNOA 1UR0A 3WNKA 2XM1A 4UQEA 1DTUA 2VZVA 2XM2A 1UWQA 1B3YA 4YHEA 4MDOA 1B3WA 2QHAA 3ZJKA 1Q6FA 2CERA 1E6PA 3VMNA 1XC6A 1W32A 3WD1A 8A3HA 5CSUA 2E9MA 3AIVA 4XZBA 2GDVA 4S3KA 4AZHA 4QLKA 5E09A 1E15A 4NZCA 1M53A 5LA2A 3N1AA 3ZOAA 1C90A 1WPCA 4JKMA 4AZGA 1CBGA 1GOWA 1E6RA 4LYPA 1W3HA 1UUQA 5GNXA 4AW7A 1EGZA 3NYDA 1IT0A 1KR0A 1BYCA 4P8XA 4P7LA 4W88A 2WHLA 4XZWA 1NM9A 4H04A 2BVDA 2GFTA 3CHEA 3GZAA 3QOMA 5BYWA 1H3GA 1KCKA 5A6JA 2BY2A 4CD6A 3DHUA 2O92A 1JDCA 3WUBA 4UFIA 1V6YA 4LYRA 2O9RA 1OWQA 3ZT5A 2VO5A 4J3XA 3SIMA 2DEPA 3T2OA 4GZIA 2W63A 2IUZA 2A3AA 1UOKA 1J0HA 4KGJA 4LGXA 1H2JA 3U5YA 3AS3A 2EO7A 1UWTA 2VNCA 3VD3A 5BXPA 2QLYA 3J7HA 3RCNA 1QI2A 1GQLA 2QPSA 3MV01 3ZR5A 1B0IA 5A6AA 5LYRA 1Q4NX 2GJXB 3VIGA 1X6LA 1MW1A 4AISA 4UQDA 4OBRA 4AMCA 5IHSA 2FGZA 1BPLB 3W4RA 4PMVA 2WZEA 5M3WA 2OLHA 2WM0A 5EMYA 3TOPA 3VUPA 5CLWA 1HKJA 3SUSA 5CQ1A 3PZIA 3SCWA 7CGTA 5JIWA 1H49A 1QNRA 4PMYA 1CYGA 2EBNA 4J27A 4NF7A 5BCAA 1HT6A 3GTNA 4ZENA 5M5DA 2JIWA 2YL6A 1UR2A 3I3DA 4UFJA 3VD5A 1PZ3A 4MB1A 3WNLA 1HVQA 1F4AA 1JL8A 3EDKA 2WSPA 4HOWA 3MUY1 3O2LA 3WQ6A 2D1ZA 4CGTA 3CUHA 3NIYA 4AEEA 2J7CA 4D1JA 1J0YA 1JDAA 3WQ4A 1BQCA 2V3EA 3WMCA 3GXIA 4HOXA 4PMXA 3N13A 1DHKA 3AMDA 3WENA 4C7DA 1ZBKA 3VD7A 3POCA 3AHYA 1QHPA 3K4DA 1QI0A 4QLLA 1UKTA 1LL6A 4V27A 3L4XA 4W89A 1XYZA 3CUFA 4CVUA 1UKOA 2XVLA 2WYSA 1TFVA 3LPPA 4AD3A 1JYNA 4OOZA 1NOFA 1BF2A 1BVNP 1PPIA 5C70A 1GJWA 2J7GA 1OCQA 3I3EA 3WQWA 1PX3A 3WDIA 4DM1A 1X1NA 3SCSA 4HMCA 1UG6A 4P7NA 3VMOA 1OT2A 2BHZA 1UR4A 1H09A 1OD0A 3UERA 5A2CA 3DC0A 1UR8A 3WDRA 4PMQA 2WVTA 5ABGA 1V3IA 4PMDA 2YBTA 2VTFA 3BLPX 3A6OA 3QHNA 2FH8A 1UH2A 2ZUVA 1G5AA 2XIBA 2JEQA 3ALGA 4GO8A 1WCGA 4JFVA 1L0PA 1CGYA 5CG0A 4WIWA 3GXFA 3F5KA 3PZUA 1VEOA 2BY0A 1XSKA 2W67A 4J3VA 5IXEA 3JUGA 2WVSA 4F9DA 3T0DA 1F4HA 4B3KA 3WL0A 1FA2A 4D6GA 3WIJA 4TX8A 3WNPA 4TTGA 3M07A 2UY2A 3GNOA 1BGGA 3BAWA 1CECA 5EB8A 4P7QA 5I78A 4PN2A 9CGTA 4XV0A 1B31A 1QNSA 1UWIA 2O9PA 2WWCA 1JZ2A 1W9XA 1MW2A 1OGGA 2E3ZA 3BCDA 2BHUA 4AZCA 1QNOA 1XH0A 2DSKA 4B3LA 5D9OA 4D6IA 4BZYA 4Z2IA 1JF5A 3PZGA 1KXHA 5A8QA 3VX0A 4R27A 4FMVA 4W7WA 1NARA 5D9PA 3CHCA 1KFWA 2J75A 1VB9A 1B30A 1UD5A 3FAWA 1B3XA 1WDQA 2C7FA 4AZBA 2WCAA 1HNYA 2Y4SA 1MXGA 2D22A 4KH2A 2QPUA 2J4GA 2W66A 4N0RA 2WWDA 3THCA 4UZSA 1BAGA 2MANA 4MNJA 1V3HA 4WSJA 3WFZA 2BY3A 3MU7A 2V5CA 2Y5EA 2ZUSA 4D6CA 1OIMA 4W93A 4CD4A 3SCTA 1HVXA 2WXDM 3ZM8A 2V5DA 2W62A 2D0FA 3F5LA 3PZMA 4W7UA 3G6LA 3VO0A 1HF6A 2PC8A 3TONA 2F2HA 2EXOA 4U5IA 3IK2A 3WKZA 1W9UA 1J9YA 1O6IA 1CGUA 3CTTA 4ZXLA 2ZX7A 1FH9A 1EHAA 3RJYA 4CCCA 3L4VA 2E0PA 1GJUA 2CETA 4JHOA 5A6BD 1GHRA 1R86A 2Y24A 4AD0A 4M24A 3MO4A 1V0NA 4X0NA 3U7BA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3UG3 A;  3ZJ8 A;  1JD9 A;  5A2A A;  1AQM A;  4PTW A;  4IPN B;  1W91 A;  3UET A;  4CCE A;  1MFU A;  2VX4 A;  4UFH A;  2JF7 A;  3WUE A;  4BA0 A;  1V3K A;  5FL1 A;  3ART A;  3ZIZ A;  2ZUN A;  4DUX A;  3CBW A;  3W25 A;  3K8K A;  1W1Y A;  3A3H A;  1RP8 A;  1NQ6 A;  4PTV A;  3W6M A;  3CZK A;  5A8N A;  1V0M A;  3ARP A;  1WP6 A;  2WB5 A;  2RGL A;  1ZU8 A;  4PSP A;  2WC3 A;  3UG4 A;  1J18 A;  1WDP A;  2A3C A;  3HMC A;  1CXE A;  1M04 A;  3DYM A;  1EXP A;  5A6B A;  4F66 A;  1KGU A;  5I24 A;  4UR9 A;  1TA3 A;  1Z32 X;  2VT0 A;  2WNW A;  3L2M A;  2FHF A;  5GPR A;  2W5F A;  1BTC A;  1UD6 A;  4LYQ A;  1QI5 A;  1UD8 A;  3VVG A;  1XV8 A;  1XCX A;  1VEN A;  2FGL A;  2G3J A;  1HJW A;  4M29 A;  2WKG A;  4U5K A;  4BQ3 A;  4C7F A;  1OGS A;  1E55 A;  4QCE A;  3THD A;  3LMY A;  2V3D A;  1H0I A;  3BLK A;  2EPO A;  3VIF A;  1UZ1 A;  2VZT A;  2X8R A;  3VGD A;  5HXM A;  1ZBW A;  1MVY A;  1V6U A;  3MUZ 1;  2PWH A;  2F61 A;  2Y2W A;  4RE4 A;  3VD9 A;  1E3Z A;  1X6N A;  1XGZ A;  3WL1 A;  3W28 A;  1ZS2 A;  5HOS A;  4Z2G A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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