3AOFA

Crystal structures of thermotoga maritima cel5a in complex with mannotriose substrate
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNAPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGEFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSLAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Diverse substrate recognition mechanism revealed by Thermotoga maritima Cel5A structures in complex with cellotetraose, cellobiose and mannotriose
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 127
structure length 308
sequence length 308
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2010-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aofA00
4QP0A 2D24A 2BS9A 3UG3A 4KGLA 4PUEA 1H4PA 1JF6A 1WDQA 1CNVA 2AAAA 2CBUA 2G4FA 3CUJA 3QGVA 5M17A 1DHKA 3W25A 4CN6A 3IAPA 5HOSA 5IHRA 1VBUA 4W87A 3A6OA 4JFVA 2VO5A 4PTVA 2J75A 2D1ZA 3WF0A 1OIMA 4BF7A 1UR8A 3CHEA 1HNYA 3NYDA 4UQBA 2XWDA 4R27A 4AMCA 2DH2A 3PZVA 5AC4A 1AMYA 5DT5A 2VR5A 2OWXA 2Y5EA 3VX0A 2Y24A 1EH9A 2VRJA 4IM4A 4A4AA 3W37A 2ZUMA 3MSGA 5EMYA 3WDJA 1GOWA 4L4OA 5A6BA 5FIPA 3SCNA 3TTQA 2ZUUA 5C70A 1VEOA 3VDAA 3BCDA 1E4MM 3UR7A 4DWSC 3LPGA 3N12A 3SCTA 3AROA 2PWHA 1UH4A 1WKYA 5JBDA 4ZENA 4PTWA 1X1NA 1GQLA 2W91A 6TAAA 3ARQA 4AW7A 1KXQA 3A3HA 3I3DA 1C8XA 2DT0A 4PTMA 4H7VA 3DYOA 2VL4A 3AOFA 1V3LA 4MB1A 3O9NA 1QI2A 2ZXDA 3SUWA 3VIHA 1G9HA 3AJ7A 3RJXA 5M5DA 2O9RA 2XSAA 4B15A 4AXNA 1JAKA 2OSXA 4NRRA 3UG5A 3VM5A 3M6DA 4ZFMA 4PMRA 3CMGA 1XYFA 2ZX6A 3A4AA 3IJ7A 2WZHA 2W67A 3UETA 2X2YA 4P7NA 1U33A 1JD9A 1GORA 1MYRA 1PAMA 2GJPA 1JXJA 4WK9A 1PIGA 1OWQA 3W53A 4D6CA 3M46A 4AEEA 1HJWA 1WB0A 3UEQA 1V0KA 2BHYA 2XM2A 3VNZA 1CEOA 5FL1A 1E6XM 3AIWA 5ABEA 3VGBA 3RDKA 5FOOA 1GQJA 3TOPA 4ZXLA 3K8KA 1ITCA 1H41A 4D6IA 3OGSA 3W6LA 4GZJA 3VDCA 2ZE0A 3WL1A 4FLQA 1EGZA 2G41A 1Q6GA 1WNOA 2J8GA 3AIUA 3ZMRA 3MUY1 3MUZ1 1VJSA 4V2XA 1B3ZA 1CZ1A 2IUZA 4V28A 2NSXA 1LJYA 5I2UA 2A3CA 3MKKA 4CKQA 4JHOA 3WUEA 5LA1A 1JDAA 1BGAA 3ARTA 3N04A 4JKMA 1V3KA 4P8XA 3BGAA 1HT6A 3O2LA 2VJXA 2XUCA 1HJSA 1XSJA 2WB5A 2VVNA 2DDXA 1GOKA 3PZNA 2EPNA 4CN1A 1QVBA 2FHFA 3WEZA 4OKDA 5LA2A 4JIEA 5GQBA 1MW0A 1HJVA 4QCEA 2YIHA 4W84A 3E1F1 5GNZA 2QF8A 1VFFA 4QLJA 5GNXA 3VD5A 5A6BD 3WEMA 1TA3B 4NSBA 4AZCB 3T0AA 2D20A 3AZTA 1GQIA 1UD4A 1BG4A 1X6LA 2EPMX 3T0BA 3AQUA 4PMOA 2E0PA 4UTFA 3F4VA 4TOQA 4W7UA 2J7DA 3WL0A 1EQPA 2GJXA 2WHLA 4FLSA 2F2HA 4CVWA 4CD4A 1CTNA 4UCFA 3T08A 3S2CA 2Y8VA 2YL8A 2J79A 1E40A 2G3JA 1SR0A 2UY4A 1BVZA 1UZ4A 4CD7A 1V3IA 1PBGA 3THDA 1ZJBA 3GH4A 3SCVA 1RP8A 3GXFA 3WDQA 2WYSA 3GYCA 3WH8A 2DT2A 1MW1A 1JNEA 3MS8A 4NI3A 3CHFA 4WF7A 5A8QA 1GOQA 2ZUSA 1G0CA 1W9BM 4X0NA 3PZUA 2WVSA 4CN4A 4HA3A 1WCGA 3BCFA 1KR1A 5IDIA 1LQ0A 4CD5A 7TAAA 1KB3A 4HMDA 2A3AA 3WD1A 1GW1A 3VMOA 2BNJA 4B9YA 2DGAA 2UY2A 1ZU8A 3AHXA 1QHOA 1R7OA 4FLOA 1W3JA 1TMQA 2AOSA 1VRXA 4J3TA 3CZGA 1E72M 1UH2A 1C7SA 4MJ2A 2PC8A 1V0LA 2YA0A 3EDFA 1BAGA 3IAQA 2WVVB 2Z1KA 4J27A 4KWUA 2UWFA 1WE5A 2XFRA 3W82A 3QR3A 1TCMA 3O6AA 1JYWA 1KFWA 3SUUA 3UESA 2ZIDA 1I75A 3W28A 3RIKA 4R5EA 2E8YA 3WD0A 2A3EA 2WSPA 4NRSA 4AYSA 4CCDA 1M03A 4XX6A 4C7DA 2XTKA 2J77A 5FCZA 1CGVA 5CLWA 1JYXA 2CCRA 2ZXAA 1HF6A 3VMPA 2WK2A 3ARUA 2CBJA 2ZX9A 1E73M 4OUEA 1DWJM 4WJXA 1DWIM 3WDIA 2Q8XA 2XJ7A 1JD7A 4RE4A 4HZ6A 1NP0A 4IISA 1E0XA 5I24A 2WC7A 5BXSA 3KWXA 2DPEA 2J7BA 1E1EA 1K9TA 2CYGA 5I78A 4UR9A 6CGTA 1JFHA 1DTUA 1LF1A 4ZE4A 2YDQA 5KEZA 3WNNA 1O6IA 3FHAA 3SUVA 1O7AA 3MMWA 1L8NA 1MW2A 3ZJ7A 2VZOA 3OZOA 1F4HA 3RM8A 1NWUA 2V3EA 5A2CA 4YHEA 3K8MA 2V5DA 3CUFA 5CGTA 1ZB5A 3WH7A 2FGZA 4UNIA 3VDHA 1GHRA 1JZ2A 4UFLA 5C71A 2W63A 2XVLA 4QLLA 2XIBA 1XSKA 3L2LA 2VZVA 3VILA 3DC0A 3JUGA 1UOKA 3VOCA 2WHKA 9CGTA 3G6MA 1NARA 3AFBA 1KXHA 4AD2A 3IANA 4HZ7A 4MNJA 4DUVA 1UR0A 3VTRA 1SFSA 1G1YA 1PX3A 1CXIA 1VENA 3ALGA 4A3YA 1KXVA 4PSPA 1HKIA 3VVGA 4PN2A 5DO8A 4LYPA 4CU7A 3SCPA 3ECQA 3ZSSA 3CZJA 3T2PA 1AQHA 1ZBCA 3ZQ9A 1JI2A 4J28A 4UZUA 4EANA 4LYRA 1QBBA 5IHSA 4PMYA 4JAWA 3EMCA 4Z2HA 1H3GA 2QV4A 1V03A 1UKQA 4D6DA 2FH6A 1H0IA 3GTNA 4W89A 1CENA 1JF5A 4AD3A 2JEPA 3BAKA 4HA1A 3CH9A 1US2A 4W85A 5I3DA 3N17A 1UWIA 2WC3A 3U5UA 3BAJA 2XVNA 3OGRA 3RILA 4KRUA 4PMXA 1RP9A 4W86A 1LWHA 1OINA 5M3WA 1UR2A 1V0MA 2VC9A 3AICA 1XC6A 4GO9A 2X09A 1US3A 2WMIB 3S6TA 3LMYA 1E6RA 1XD1A 3W29A 4QDMA 4MAZA 2NW0A 1QPKA 3AIVA 3AI0A 4BCEA 3BLPX 3UERA 4EKJA 1JFXA 4M24A 3VKKA 3KL0A 3WNKA 3WEOA 1E4IA 2ZWYA 3EDJA 3AS2A 3T2QA 1CXFA 1W1YA 3VPLA 5ABHA 4TTGA 3N9KA 4AD5A 1JXKA 4FLRA 3VUPA 2WC4A 2WSKA 4L4PA 4D6GA 3WDPP 1E15A 1QI4A 3WMCA 3WD2A 1XH1A 3ARPA 4H8UA 1BG9A 4V27A 3SCWA 1W1VA 4K68A 4J3VA 1ISYA 1QI3A 3QOMA 1QNPA 2E4TA 1HVXA 2QHAA 3HJEA 4PEEA 4NF7A 1H11A 3N1AA 4ACZB 2X0HA 2W92A 4YN5A 1BHGA 5ABFB 1GONA 2VZUA 3BMWA 5BROA 1D7FA 1QW9A 3WD4A 1TA3A 1MQPA 2OLHA 2W61A 1ECEA 1NM9A 4PUDA 1H5VA 2VZTA 2W5FA 1UG6A 3L4ZA 1E0VA 4D6FA 3VD4A 2BY2A 3PZTA 2CESA 4PMVA 1R87A 4CU6A 1K9FA 1R7AA 4A3HA 2YL6A 2CHOA 1TVPA 3CGTA 1B1YA 1ZBWA 2BXYA 2ZICA 1OGSA 3ZJKA 1H49A 3U5YA 4Q7NA 5ABGA 2PB1A 4AZBA 3WF4A 2WKGA 2ZUWA 1HX0A 2GSJA 3B9AA 3BSGA 3WBEA 1NWSA 4JCLA 4MB4A 5GPRA 1VEMA 2GDUA 2ZXQA 5CPSA 1H09A 1BYCA 5I0DA 2WVTA 5BWFA 1R86A 4Z2GA 3WH9A 4LPCA 1GJWA 1VB9A 4QFUA 3TTOA 1ISVA 4W7VA 3WIJA 3VX1A 4CD8A 5CXPA 3WNOA 3FW6A 2XHYA 3GXIA 3PZOA 1XRVA 3EMQA 4B3KA 1UYQA 3WF3A 2D0HA 1W91A 3CUGA 1E9LA 3FN9A 4JKKA 1CDGA 4H41A 5M03A 2DIJA 1PZ2A 3VGDA 5CPTA 1R85A 4M81A 3VIJA 2PWDA 1E56A 1IZJA 2C0HA 1UR4A 1W3KA 1W2PA 1J12A 4D6HA 1LWJA 5FL0A 1QHZA 4EAMA 3VIOA 3BH4A 3KE0A 3K46A 1E55A 1DWFM 5AY7A 5CPQA 2O9OA 2XVKA 5AYBA 3OBAA 3VGGA 3AIEA 3UG4A 4JL2A 1FA2A 1V08A 1JNDA 1NWTA 1ODZA 2XVGA 4HPGA 1WZLA 3IK2A 4LYQA 2ZXBA 3PHAA 3T0DA 5I79A 2Z1SA 1CXLA 5A6SA 1PIFA 5BRQA 5BXRA 4E4PA 1NOUA 5EFFA 2WNWA 1C90A 5HPCA 1HP4A 1NOFA 1OGGA 2QMKA 2VTFA 3OG2A 1TVNA 2BFGA 4DWSD 1K9DA 8A3HA 4UQCA 3AIRA 5A2AA 2V3FA 4UOJA 1CBGA 1GOMA 5IXEA 1UD8A 1YQ2A 1JI1A 4ZXOA 2WZIA 3HU7A 3BLKA 1BFNA 1KQYA 3A4WA 4IUGA 1C7TA 1FHDA 3AZRA 5A6LA 1M7XA 3I3EA 3DECA 1FH7A 1UWSA 5A3HA 1W3LA 3M07A 4F79A 3SCRA 4U3CA 3SCUA 3VINA 5HXMA 4MPKA 1Q6FA 4HTYA 3WQ4A 4XZWA 3AHVA 4UFMA 1JGIA 1VJZA 1W32A 1NQ6A 2YA1A 1V6WA 3AHZA 1XD0A 2FHBA 5D9PA 3LPOA 4JHZA 3KZSA 2XGIA 4J3SA 1OIFA 1EO7A 4P7RA 4WKHA 1ISZA 4GINA 3ARXA 3FAWA 3ZJ6A 1V02E 3G6LA 2WANA 4CCEA 1E6ZA 3W81A 3EYPA 1WDSA 1MQQA 1HJQA 3PZQA 3W27A 1TFVA 1ZS2A 2CEQA 3CUHA 5A6KA 5BCAA 2CKRA 2D3NA 4D1IA 3CUIA 3AMKA 2WZEA 2E9MA 4QAWA 3FXYA 5A94A 3VD9A 3BAYA 1X6NA 3RM9A 2O9PA 1JIBA 1UQYA 4X9YA 3WENA 2W4XA 2J7HA 1J0HA 3CHCA 3VGFA 1B3YA 1K6AA 1CXEA 1M04A 4BQ3A 4W5ZA 1CGXA 4M82A 4YPJA 3ZT5A 1XYZA 4JFTA 1TG7A 3RJYA 3NJ3A 3SEPA 4HU0A 4TVCA 2MANA 1CLXA 4AWEA 1B3VA 4AZHA 3F5JA 5A8PA 1I1WA 1J0IA 2QPUA 4GIAA 1C3FA 2D2OA 3N11A 2FH8A 1UHVA 2VOTA 3W4RA 2E9BA 4LQ1A 1UD6A 5E09A 1E1FA 1FH9A 1CPUA 3WH6A 1KGXA 1V02A 1C92A 2VNCA 2EPLX 3APGA 5DMYA 4OJYA 4TXEA 3VD3A 3NSMA 1OD0A 5A8MA 3PZMA 2UY5A 1EQCA 2WWDA 2YLAA 1NOWA 3GH5A 2J7GA 2E40A 3ZR5A 5ABFA 4JFSA 3WFZA 1B90A 4UQDA 4BQ5A 3ARSA 3AZSA 1L0PA 3UR8A 2J8FA 1ZBKA 1C91A 1EOKA 1W9XA 2PBOA 1UKSA 3GXDA 4IPNB 1QNQA 1MW3A 1P6WA 1XV8A 4M8UA 1Q6CA 2VRQA 4UQAA 2ZOXA 4X0VA 2VX5A 1WPCA 1AQMA 4U31A 1W2VA 1OT2A 5I77A 3SUTA 4N0RA 1QBAA 5I23A 2NT1A 2WLZA 3MMDA 3W6MA 1JZ7A 1QNOA 1J0JA 1GUVA 2DSZA 2DT3A 3RCNA 3AHTA 1BYDA 2GUYA 3WD3A 1C8YA 3BAXA 4ATLA 4LX4A 2A3HA 3DYPA 2A3BA 4H2CA 2W66A 1D3CA 1AVAA 3EDEA 4D72A 1IZKA 1FP8A 1UWRA 2WMFA 3AHYA 4UZSA 3AYRA 2QLYA 3GNOA 4OBSA 2CETA 2IXVA 1DWGM 2V38A 1JZ6A 2ESCA 1A47A 5A1AA 2XM1A 1BYBA 2TAAA 1GVIA 1UD5A 1UR9A 1UUQA 1HIZA 1JZ3A 3ZO9A 5ECUA 3II1A 2DQXA 1CXKA 3PTMA 4B3LA 2J7EA 3AMLA 4KH2A 1B3WA 2VCAA 4QCFA 3NIYA 3SCSA 4U2ZA 2XGBA 1W3HA 3T09A 3SIMA 2WWCA 1G5AA 2WCAA 1TE1A 4W88A 5EB8A 2PWFA 1V0NA 3EDDA 4PBGA 1EXPA 1GCYA 2BY0A 2GJRA 1KBBA 7CGTA 3AMDA 1BLIA 2E3ZA 1J01A 1UQZA 3CLWA 1RPKA 3RPMA 4E2OA 1E3ZA 4RL3A 4KRTA 4PCSA 1KBKA 3WBAA 1VAHA 4IPLA 4MTVA 4CCCA 1GHSA 4OZOA 4CD6A 4D6JA 5E6ZA 3PZ9A 3WH5A 1HKMA 5BXPA 1XCXA 2CXGA 2VRKA 1RH9A 2GVYA 1M53A 1CWYA 4TX8A 4XV0A 2VMFA 5CSYA 1JYVA 2C8NA 4HOWA 4WSJA 1HXJA 3MMUA 1E4NA 3N13A 4GKLA 1XCWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4QP0 A;  2D24 A;  2BS9 A;  3UG3 A;  4KGL A;  4PUE A;  1H4P A;  1JF6 A;  1WDQ A;  1CNV A;  2AAA A;  2CBU A;  2G4F A;  3CUJ A;  3QGV A;  5M17 A;  1DHK A;  3W25 A;  4CN6 A;  3IAP A;  5HOS A;  5IHR A;  1VBU A;  4W87 A;  3A6O A;  4JFV A;  2VO5 A;  4PTV A;  2J75 A;  2D1Z A;  3WF0 A;  1OIM A;  4BF7 A;  1UR8 A;  3CHE A;  1HNY A;  3NYD A;  4UQB A;  2XWD A;  4R27 A;  4AMC A;  2DH2 A;  3PZV A;  5AC4 A;  1AMY A;  5DT5 A;  2VR5 A;  2OWX A;  2Y5E A;  3VX0 A;  2Y24 A;  1EH9 A;  2VRJ A;  4IM4 A;  4A4A A;  3W37 A;  2ZUM A;  3MSG A;  5EMY A;  3WDJ A;  1GOW A;  4L4O A;  5A6B A;  5FIP A;  3SCN A;  3TTQ A;  2ZUU A;  5C70 A;  1VEO A;  3VDA A;  3BCD A;  1E4M M;  3UR7 A;  4DWS C;  3LPG A;  3N12 A;  3SCT A;  3ARO A;  2PWH A;  1UH4 A;  1WKY A;  5JBD A;  4ZEN A;  4PTW A;  1X1N A;  1GQL A;  2W91 A;  6TAA A;  3ARQ A;  4AW7 A;  1KXQ A;  3A3H A;  3I3D A;  1C8X A;  2DT0 A;  4PTM A;  4H7V A;  3DYO A;  2VL4 A;  3AOF A;  1V3L A;  4MB1 A;  3O9N A;  1QI2 A;  2ZXD A;  3SUW A;  3VIH A;  1G9H A;  3AJ7 A;  3RJX A;  5M5D A;  2O9R A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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