3ATVA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-bound and mg ion-free state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atvA04
3P4IA 4FWOA 2E20A 3CJBA 2F9WA 1HKCA 3MN6A 5EOYA 4BQLA 4BRPA 5BRHA 1X9JA 2F9TA 3UKRA 2P9PB 4FWQA 3LM9A 3ZX3A 4FSVA 4BRMA 2BTFA 4ISEA 1BUPA 3SK3A 4BRKA 3ZX2A 1K8KA 2QWRA 5AQKA 2GWKA 1P8ZA 1NGIA 5AQXA 3D7EO 2FSJA 4GY2B 4BG8A 2P9NA 3H6EA 3EZWA 4RCHA 3GBTA 4AM7A 4CZIA 5EVZA 3GOIA 5BREA 3WQTA 1JCGA 4BC2A 2YCHA 4DCHA 3GE1A 4B1UB 3CJ7A 3RSEA 4B1ZA 3C7NB 3HSCA 3H1QA 2P9SB 5JLFA 1TYQB 1ESVA 1V4SA 2HF4A 3TPQA 3VOVA 5AZIB 3SLCA 3MK6A 2IIRA 4AM6A 5KQDA 1E4GT 1NGGA 5AQUA 3IMXA 5AQHA 3U9ZA 2FSNA 3A8YA 2P9IA 1NGHA 5TKYA 3AAQA 5AQIA 3EKUA 2ASOA 3R8EA 2GUPA 5LY3A 4M7YA 1U2VA 4MO4A 4H5NA 4H5RA 3LM2A 3VEXA 3DXKB 4JHDA 5BN8A 2E88A 3MMVA 4YDUC 1Z05A 3FZHA 4BGBA 5AR0A 3BF3A 3UKRB 1BA0A 3M6GA 3MDQA 4CZMA 1TUYA 3SMPA 3O4WA 2VYPA 5BN9A 1NGDA 3W0LA 1NGAA 3QFPA 1NMDA 2I7NA 3UE5A 2A5XA 1GLJO 1V4TA 3LDPA 4DB3A 1QHAA 5AQNA 2BUPA 2QWMA 3ENHA 2E1YA 3M3ZA 4FL9A 3FFKB 4CZLA 1C0FA 1Q18A 4CD3A 2P9NB 4BVOA 4XEIA 4A61A 2E2NA 5FPEA 2FF3B 3CIPA 4H0VB 4JAXA 5KPZA 2P9KA 3QDKA 1BO5O 1MWKA 3A5OC 5AQSA 3RSEB 2YJFA 4J8FA 4EFHA 1MA9B 4B9QA 4HTLA 3R9PA 5KPTA 2ZGYA 2GEMA 4DQ8A 4BG9A 3LDLA 3C0BA 5E84A 1J6ZA 1GLAG 5AQYA 4PL7A 4PL8A 3JS6A 4KBOA 1ATNA 3HM8A 4NB4A 4I6MA 3FGUA 2Q1NA 4CI6A 3WUHA 3G25A 4CZHA 2Q0UA 2CGKA 3CERA 4FO0A 4H0OA 1IG8A 4CZJA 1ZXOA 2ASPA 2YHWA 4FWMA 3UB5A 1U2VB 2GWJA 4BRHA 3BEXA 3S41A 1S3XA 2A3ZA 2NRHA 4B1YB 1DGKN 4JHDB 4BR7A 4WYBA 2V52B 5FPNA 2YJEA 5JMVA 3WQUA 4MLHA 3GG4A 1GLLO 5AQGA 2QWPA 2P9UA 4BGAA 5BPLA 2PAVA 2OANA 1NWKA 3VESA 4BVPA 4BR4A 3ZETA 3I8BA 1ZC6A 3U8XA 1NGEA 5ELZA 4B1XB 2E2PA 2Q2RA 3EKSA 1YAGA 5KQ8A 3U4LA 1G99A 3O6WA 3LDNA 1IJJA 1R59O 4M7XA 1GLFO 3ENOA 4FWSA 2VWBA 2P9KB 2P9LB 2CH5A 3O08A 3D2EA 5FPDA 1QQMA 1CZAN 4M63C 1E4FT 2ASMA 1EQYA 1KAXA 3EN9A 4RWTA 3AARA 3FZKA 3KVGA 4CZFA 3FZLA 2CGJA 3LL3A 3KHYA 4A62A 1QQOA 3H46O 5AQPA 5AQVA 2HOEA 4GNIA 1BG3A 3MN9A 4I6MB 4CD1A 3VEYA 1SQKA 3L0QA 3O5BA 3CETA 3DAWA 5F1XA 4O5FA 3WXKA 2A41A 2ZGZA 2QXLA 4CBXA 3J8AA 3A0IX 4FOIA 5EXWA 3H45C 1YUWA 2CGLA 1SZ2A 3KZBA 4BRNA 1YXQA 2A40A 4DHYA 3GL1A 3R6MA 4EAHD 3WT0A 3HI0A 3OHRA 2ITMA 1RGIA 3VETA 3D2FA 3FZMA 1MDUB 2P9UB 4A2AA 4H0TB 1K8KB 3H3OB 2QWOA 2FSKA 2ZWHA 4F9OA 4E1JA 5AQJA 4FWRA 3QFUA 2Q31A 4JD2A 3DJCA 4Z94A 1KAYA 4BRQA 3QMLA 5I9EB 2QWNA 3EL2A 3M1FA 1ATSA 2HMPA 3UKUA 4FWNA 1NLVA 5AQRA 1U6ZA 3O8MA 3FLCO 4H0XB 3VENA 1NGJA 4K25A 4CBWA 3D2EB 3DWLA 5E26A 1XQSC 3U9DA 4A2BA 2I7PA 2D1KA 4L3QA 3HZ6A 2E8AA 5B8HA 2Q0RA 1QZ6A 4LC9B 4BR2A 5AFUH 4CZGA 1GLCG 4XH1A 4BRLA 2FXUA 2P9IB 4CJ7A 1HKGA 5F2RA 1OKJA 5EX5A 3O1BA 4WQ4A 4B1VA 4BR9A 3GDQA 3MCPA 3CJ1A 5FPMA 4QS7A 4EIAA 5BRDA 2ZF5O 3I33A 4IXCA 3BUZB 4K42A 3VGLA 1HJOA 2J4RA 4BC3A 1LCUA 4PKGA 3WEEA 3WXLA 4K43A 4XH4A 1QQNA 1Z6RA 3CJAA 4H5WA 4ISGA 4WQ5A 4FWLA 3D2FB 3B8AX 4FPBA 4CZEA 1BA1A 3A5MC 3ULEA 4ISFA 2AP1A 4IZ9A 4IO8A 1DEJA 4JD2B 1H1VA 5BRFA 1GLEG 2IVOA 5LJWA 4BR5A 1WUAA 3DXMA 3VEVA 3ZEUA 3CI5A 3VEZA 4BR0A 3FE1A 1SAZA 3QBXA 2DPNA 4FPAA 1JCFA 1D4XA 1HKBA 2WUSA 4K41A 2Q36A 1C0GA 2YHXA 4NO7A 3UKUB 1LOTB 3H3NO 2FLOA 5AQZA 2A42A 4BQZA 4CZKA 4JNEA 2KHOA 2V7ZA 3AAPA 1YVNA 5ADXH 1BOTO 4HWIA 2NZTA 3CHWA 2GELA 3VF6A 1WOQA 5EY4A 4BRCA 4EHUA 5AZJA 5ADXA 3LDOA 1RDWX 4BRIA 3L6QA 1BDGA 2IVNA 3F9MA 4H0PA 1KXPA 3VEWA 4H0YB 5AQMA 3FR0A 2A6AA 2UYTA 2E1ZA 4MLEA 5BPMA 4BRAA 4WQ4C 1NGFA 2E2OA 5AQFA 1S22A 2QM1A 4BROA 3O80A 4H5TA 4FWPA 2QWQA 5F0XA 4EHTA 1XUPO 2QW9A 3WEEB 1T6CA 4IWVA 1BWFO 5AQTA 1HUXA 1HLUA 3QICA 1MWMA 2QWLA 4BREA 4O8KA 3IDHA 4MO5A 4BRDA 3HTVA 2GTDA 1X3MA 4WQ5C 1NGCA 2D4WA 3QB0A 3ZETB 2EWSA 3FZFA 3IFRA 3TU5A 1HX1A 4QS8A 3ULEB 4BRGA 3O1WA 2PBDA 4H5VA 1HPMA 3W3DA 5KPRA 1T44A 2D0OA 2P9PA 3SJHA 2VCPA 3CJCA 4B1WB 3AY9A 3DXMB 1X3NA 3ZEUB 1QZ5A 1RFQA 5AQQA 3HBTA 2W40A 3IUCA 4BC4A 4BC5A 1ATRA 5JICA 4H03B 3A5LC 3VGKA 5LJVA 3ATUA 4JN4A 2NLXA 3VF2A 1TUUA 4PKIA 3H1VX 4PKHA 5AQLA 2YHYA 3BF1A 4XH5A 5AQOA 1ZBSA 1T6DA 1Y64A 4BRFA 5AZJB 3MN7A 2IVPA 2P9LA 3CQXA 3ID8A 4IJAA 3VEOA 4IJNA 3C7NA 1JCEA 2YI1A 3QBWA 3JXUA 5AFUA 3BP8A 3ZX0A 2P9SA 1TYQA 1GLDG 3VGMA 3L4IA 2HF3A 2E2QA 4QS9A 5AZIA 3LDQA 5AQWA 2AA4A 2W41A 1DKGD 5BPNA 1BU6O 2V51B 2V7YA 3A5NC 3CQYA 4C23A 2D0PA 3VPZA 4Y0WA 2Q97A 3ATVA 2FF6A 2CH6A 1KAZA 3WXIA 5CE3A 3MN5A 5JLHA 3CJ9A 3WXJA 4FWKA 4FOEA 4CBUA 1NM1A 1XC3A 3VF4A 1NGBA 5BR9A 4RTFD 3DXKA 3VERA 1GLBG 1NBWA 3SMSA 3EO3A 2H3GX 4YDUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FW2A 3R3LA 4M3UA 3P31A 3HPGA 2YV0X 3K5OA 3ZX3A 1ZBUA 4FSVA 1S1UA 1Q9XA 1OMYA 3P83D 2BTFA 3QEVA 5M1OA 1D8YA 4FJ8A 2I5JA 4M3RA 1P00A 2E2FA 2IGIA 1P8ZA 2LT8A 1CZBA 3D7EO 4CK3A 4B08A 3H6EA 3GBTA 4CZIA 4C1NK 3ZT1A 5BREA 2YCHA 1RT7A 4FZYA 1FH3A 3MXIA 3O9SA 5KRSA 4M3XA 3H1QA 3LAMA 5JLFA 1D5AA 3VTIA 3QI7A 2HF4A 3VOVA 4JRQA 4ID5A 2O8FB 5AZIB 3MK6A 2PYLA 4AM6A 2E3FA 1LW2A 1QE1A 3QINA 3U9ZA 4GVMA 1SKRA 2BRZA 4GKKK 3R8EA 2GUPA 4A59A 1XNRK 2HBJA 4ICLA 3DXKB 3RTVA 5D3GA 4FM2A 1Z05A 2HNDA 4GVEA 2HMIA 4JI8K 1R0AA 4UADE 4HCCA 3FZHA 1PTXA 3I0SA 4DTJA 1TUYA 4FJIA 4YOXA 3O4WA 5KTQA 5BN9A 3CMEN 3D0PA 2XY6A 1NGAA 4CCHA 4YOYA 3THXA 4J2DA 3V4IA 2JDQD 4E7IA 3LDPA 4WF9L 2BUPA 2KTQA 4BDYA 3K58A 3AVJA 3FFKB 3PO5A 4R79A 4RW6A 4LF4K 4KRFA 1NMNA 3HXMA 1VRTA 4JAXA 1HR0K 2P9KA 1BO5O 1ZBFA 4FK2A 3ZT0A 3CPEA 1QSSA 2F96A 4DFJA 2B6AA 4FJ7A 4DSLA 1KVBA 2GEMA 4BG9A 2PZSA 4CJSA 4BWMA 3O3GA 1XWLA 1GLAG 3NF6A 5AQYA 5EU7A 4PL7A 3JS6A 5CR4A 1ATNA 1RDDA 5J2QA 4CF2A 2HHQA 3WUHA 4CZHA 4CEDA 2YNHA 2Q0UA 3KLEA 3DRPA 2YKNA 3EE9A 1P90A 2G8UA 1S1WA 4BRHA 2G8KA 1S3XA 4WYBA 4CGGA 4O55A 1UOCA 2YJEA 1BQNA 3MWTA 2D0CA 1JLFA 1LWFA 2PFUA 1FJGK 2QWPA 4HVJA 1WT7A 3BK3C 1Q7YO 1LAVA 2PAVA 2QK9A 1NWKA 2B4JA 3TTFA 1F21A 4BACA 3U3YA 2RE2A 3ZSQA 5ELZA 2E2PA 2Q2RA 5KQ8A 3U4LA 1Q86O 1JLEA 3O6WA 2NY8X 3LDNA 5HRRA 4I2PA 2KBKA 4DSFA 1QVFM 2P9KB 3ISNC 2O4IA 2P9LB 4CHPA 2OTLN 1BISA 2CH5A 3J7YP 4IO9L 4KO0A 3D2EA 2KZMA 1O13A 3J81O 2ITGA 3LP1A 4A5AA 3NMUA 2PY5A 4KYPA 4KV8A 4TSXA 1SN1A 1QTMA 4GV3A 2HBLA 5CY0A 3FFIA 3AA5X 3FZLA 4W5QA 1RDBA 2QI2A 3TSUA 3CCJN 1C1CA 5AQVA 1BG3A 5CYQA 1NJYA 2KKZA 3OA9A 4PY5A 2O8DA 4NXNK 2ZJRL 3C6UA 3O5BA 4FJKA 2VG6A 4OX9K 4FVUA 2B68A 1OH5A 4O5FA 3WXKA 4Y1CA 2A41A 3GKUA 2K35A 1BMRA 4HHTA 1VQ6N 4ILGB 3DLKA 4CFBA 4DV2K 3L4QA 2LR3A 2Z1IA 4CJEA 3H45C 1RT3A 2KFNA 3PSIA 1SZ2A 1JZAA 4B3OA 3ZCMA 1ITGA 3KK1A 4LF9K 4DHYA 4CVNE 1NK7A 4DFMA 3KJVA 3HI0A 3OHRA 1RGIA 4O4GA 3FZMA 1LWCA 2JGUA 3EE8A 5HP1A 2ZD1A 3F9KA 1WB9A 5KI6A 4DFKA 4B9MA 4CK2A 1MU2A 4KB1A 3DJCA 4BEBA 1KAYA 1BHLA 4BRQA 3HP9A 3QMLA 1C0TA 2QWNA 3G0ZA 4UY8O 3RRHA 2YIPA 3LPUA 3UKUA 3OYFA 4AHUA 3P39A 3O8MA 1WLJA 1C56A 1NGJA 2HBMA 3VENA 3D2EB 3CPWM 2IC3A 1XQSC 3U9DA 4L3QA 4M45A 3S5TA 4IG3A 2OCEA 4DUYK 4PUOA 4W5OA 4NYNA 3S3NA 4XH1A 2X78A 2P9IB 1XHZA 2O8DB 3VQPA 1HKGA 5F2RA 4CJRA 3EZ5A 2HNZA 2NRZA 1OH7A 1IKXA 3O1BA 3DLBA 3V9SA 5C12A 4CJFA 4C1NI 1NG9A 2MZ0A 3KP1A 5FPMA 1SL0A 4NLBA 4EIAA 1N34K 4CGHA 1XI1A 4IXCA 3BUZB 4LH4A 2O8BA 5C15A 4NCGA 1VSLA 4JS5A 1LCUA 2QKBA 1QVGM 4KAZA 4Q5VA 1Z6RA 1M90O 2UUBK 3L56A 3AVBA 2P5GA 3KLHA 4H5WA 2ATBA 4WQ5A 1YF5L 3KK3A 4CJ4A 3QEPA 4ISFA 4KB0A 4FYDA 5KRTA 4XJXA 3JSMA 1VQON 4IO8A 3DLHA 1H1VA 5C0YA 4CJVA 4BR0A 1U48A 1SAZA 3AO2A 2ITMA 1JCFA 2WUSA 3CD6N 1FKOA 4NO7A 3UKUB 2E5LK 4RW8A 4ZTJA 2FLOA 1I94K 4CZKA 4JV5K 3NBPA 4JS4A 1YHQN 1TKZA 4DG1A 3KD1E 3C95A 3M8SA 3VF6A 2GELA 3CCLN 1NK9A 5ADXA 1AYJA 3IRXA 4CEAA 4IG0A 3JAMO 3F9MA 2N66A 4H0PA 3SV3A 1YJWN 3VEWA 1T8EA 2BANA 5AQMA 2GUIA 3FR0A 1HNWK 4Q0BA 1DJTA 2WTUA 3SQ0A 5BPMA 2W42A 4HHFA 1NKEA 4DF4A 1CLQA 2QM1A 3MEDA 4E1NA 3SCXA 1Z25A 2QWQA 5F0XA 1HNVA 4FJNA 2VQFK 2O8BB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4FW2 A;  3R3L A;  4M3U A;  3P31 A;  3HPG A;  2YV0 X;  3K5O A;  3ZX3 A;  1ZBU A;  4FSV A;  1S1U A;  1Q9X A;  1OMY A;  3P83 D;  2BTF A;  3QEV A;  5M1O A;  1D8Y A;  4FJ8 A;  2I5J A;  4M3R A;  1P00 A;  2E2F A;  2IGI A;  1P8Z A;  2LT8 A;  1CZB A;  3D7E O;  4CK3 A;  4B08 A;  3H6E A;  3GBT A;  4CZI A;  4C1N K;  3ZT1 A;  5BRE A;  2YCH A;  1RT7 A;  4FZY A;  1FH3 A;  3MXI A;  3O9S A;  5KRS A;  4M3X A;  3H1Q A;  3LAM A;  5JLF A;  1D5A A;  3VTI A;  3QI7 A;  2HF4 A;  3VOV A;  4JRQ A;  4ID5 A;  2O8F B;  5AZI B;  3MK6 A;  2PYL A;  4AM6 A;  2E3F A;  1LW2 A;  1QE1 A;  3QIN A;  3U9Z A;  4GVM A;  1SKR A;  2BRZ A;  4GKK K;  3R8E A;  2GUP A;  4A59 A;  1XNR K;  2HBJ A;  4ICL A;  3DXK B;  3RTV A;  5D3G A;  4FM2 A;  1Z05 A;  2HND A;  4GVE A;  2HMI A;  4JI8 K;  1R0A A;  4UAD E;  4HCC A;  3FZH A;  1PTX A;  3I0S A;  4DTJ A;  1TUY A;  4FJI A;  4YOX A;  3O4W A;  5KTQ A;  5BN9 A;  3CME N;  3D0P A;  2XY6 A;  1NGA A;  4CCH A;  4YOY A;  3THX A;  4J2D A;  3V4I A;  2JDQ D;  4E7I A;  3LDP A;  4WF9 L;  2BUP A;  2KTQ A;  4BDY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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